3UWU | Genus

Total Genus 89

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	89
sequence length	253
structure length	253
Chain Sequence	MRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHETDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETDEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEDQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Isomerase
molecule keywords	Triosephosphate isomerase
publication title	Crystal structures of triosephosphate isomerase from methicillin resistant Staphylococcus aureus MRSA252 provide structural insights into novel modes of ligand binding and unique conformations of catalytic loop pubmed doi rcsb
source organism	Staphylococcus aureus
total genus	89
structure length	253
sequence length	253
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date	2011-12-03

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00121	TIM	Triosephosphate isomerase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3uwuA00

3G1YA 1U83A 4IWWA 4YL2A 3LCFA 5EY5A 1NF7A 2Y7DA 3SIZA 3UY8A 5D32A 2WOQA 3VNDA 3NEVA 3VKJA 3TW6A 3W83A 5DELA 4RCXA 5I3HA 3THQA 4ADSA 2B7NA 1LZOA 5AHIA 4OU1A 5FEZA 1GOXA 4AXKA 3NQCA 4YLWA 1JRCA 1Q6RA 2VFIA 5FF0A 1TJPA 3M43A 5K7JA 1VGAA 2B4GA 4ZMGA 1Q6OA 5FF4A 4UTLA 3NZRA 3UZJA 3HJZA 5AN7A 1W56A 3H54A 4FIQA 1I2OA 3GVGA 4Q4KA 4MZ8A 1XFBA 4UTKA 2FLIA 3EXRA 5A5WA 1SSDA 4H6KA 4FEZA 2CLFA 3L65A 2QEZA 2OT0A 3HPZA 3OG3A 1VRDA 4IX2A 7TIMA 3GDTA 5K9CA 1MO0A 2DZSA 3DGRA 1H61A 1X1OA 3W7MA 3G22A 2PRHA 4JTKA 4MY8A 4XBSA 1KV8A 1VC4A 1VQTA 2VEPA 4O15A 4X22A 3C52A 3NR0A 4J9JA 2OMAA 2O7SA 4WXYA 5DN1A 3QMTA 3PM6A 2NWSA 4XWUA 2ZRXA 2FJKA 4ORMA 1AW5A 3LV6A 3DAQA 1X7FA 4Q32A 3W7OA 1W5NA 4QQ3A 1GYLA 4GUGA 1EP3A 3MI2A 4WX2A 5KZDA 3NM1A 4PEKA 1GVOA 1CI1A 4O1BA 3QFEA 3STCA 3TAOA 3W2LA 3TUUA 4MLJA 4U28A 4FNTA 5LNSA 3B05A 3QRHA 1VZWA 4A22A 1EUNA 3FS2A 1EA0A 2A0NA 1KFJA 1VYRA 3DI1A 4IMDA 3TW7A 5G5IA 3LBMA 5HWJA 3TSMA 3TMQA 1QFEA 3W2NA 2G95A 3N73A 2PRMA 1VHCA 3N14A 1K8YA 1JUEA 1ML1A 1N55A 4HPJA 4TU1A 4O0KA 1MZHA 2VOMA 5G1TA 1QNVA 4PL1A 1KLYA 3PUEA 3W9ZA 2E77A 1A5CA 4FNRA 5HUOA 3UZ5A 4ADUA 3BARA 1ZNNA 2A85A 1OX4A 4FXSA 4EF8A 3LM7A 2JGYA 3TAKA 2A1YA 2HMCA 3BW3A 2C14A 4GWEA 4M7TA 2J6XA 1KA9F 1K7XA 4HNNA 4ICNA 2PE4A 1IIGA 2CLEA 1WQ5A 2A6NA 4UTHA 5L6UA 2X1SA 3USBA 4D2JA 1H50A 2NUWA 5CPMA 2XN0A 5LZLA 2YYTA 5E93A 4RV8A 2CZDA 2QKFA 1TJRA 1A50A 4O52A 4YMZA 1WYIA 4ADTA 2Y7EA 3TK7A 3GDMA 1FCBA 5I3GA 3UPBA 3G1HA 1G4SA 1OX6A 2GJLA 3W7JA 3EXSA 3PBUA 4AWTA 1WBJA 4NJGA 4JDYA 4O13A 2X30A 4QISA 3C2EA 3GK0A 3YPIA 2FB3A 3LLDA 5F1UA 4LVGA 2GVGA 1DBTA 3TSDA 3NM3A 1YPIA 3OHIA 2D73A 4XQ6A 4PFMA 1VLWA 2QCLA 2RDTA 5CZTA 1Z48A 4NNAA 3P82A 1OF8A 1W31A 4TX9A 2FPTA 1F05A 5HQEA 3NXFA 1JVNA 3EWUA 1KM5A 3NQ7A 2E6AA 4NT0A 1BKSA 1UUMA 3QQ0A 2CLKA 2YYUA 3NO5A 1HFBA 5U4NA 3SGZA 2E5CA 2QJGA 3W7QA 4AHPA 1QPOA 1PHQA 3R89A 2F84A 1SU5A 2ATMA 3C2OA 3R5EA 2ZFAA 4LNYA 5FF3A 2BTMA 4N2YA 1D3HA 1HO1A 5TIMA 1XBYA 3O06A 4OV4A 2ZRVA 3C3NA 3CQ0A 1VPXA 3PSWA 5DY3A 1W5QA 4E0CA 2YFOA 2Z6IA 2J9YA 2QUUA 1TREA 1N7KA 1X8FA 4IPIA 4MJMA 4K37A 2B7OA 3ABSA 4UMCA 3W76A 2XFWA 3QPZA 4G1KA 1ZENA 1VCFA 3W1UA 4EF9A 3C4UA 3DI0A 3KAOA 3C6CA 5CGQA 3VCRA 4LVBA 5CZSA 2J9ZA 4N9DA 1QPRA 3UXDA 2EKCA 3KRZA 4QNEA 5K9XA 3TXZA 2RFGA 1A5SA 1LRNA 3HO8A 3LI1A 2ZCGA 5EA9A 4XTIA 1TV8A 5KTLA 3LOTA 4DF1A 2YCEA 5DBTA 1TRIA 3HGRA 1JUBA 1OVDA 4LT9A 5AFDA 3M41A 3W7HA 2VFEA 4PCFA 1S5VA 4HSOA 3TIMA 2I14A 4RZ5A 2C18A 3E9AA 1XKYA 1XDLA 1GVSA 2P0OA 3DBPA 1XXXA 2ZA3A 3STGA 4K7VA 4O4VA 1UJPA 3TNOA 1QMLA 3W87A 5TBOA 5KSWA 4UMBA 3KX6A 1I2NA 1K7FA 1CX9A 1C29A 1DKWA 3HB9A 2GVLA 1H63A 1OG0A 4DELA 4S2CA 1TPUA 3LRMA 3G1VA 1VJIA 3LHZA 1P4CA 3LHVA 3N2MA 4MY9A 1WXJA 1D9EA 4NU7A 3PUDA 3CLMA 5K4ZA 3IVSA 3BG9A 4TO8A 3EXTA 3S1VA 5C5YA 4CNPA 2DZVA 4POCA 1GZGA 1R2TA 3T78A 4A3UA 1I4NA 4N4PA 3GB6A 1TO3A 4A21A 3L9CA 3MI6A 3GXPA 4MJZA 3W70A 3FYOA 3GDRA 3PSVA 4GUHA 3QW4B 2BSLA 1OX5A 4JTHA 1ONRA 1PHWA 1TPB1 2A7NA 3P80A 1DVJA 3PC0A 2NXIA 1QOPA 4Z1AA 3A24A 3OVQA 3KVLA 1SO3A 3BW4A 3O6YX 4S2BA 5CSSA 1ME9A 4LVAA 3M44A 3OVRA 3KVMA 2V2DA 5F1VA 4HKPA 4MLRA 5SWUA 1TMHA 4RX0A 5HINA 1V5XA 2CZ5A 1RQBA 3W1XA 3EEGA 2HSAA 3W6YA 1QR7A 3GXTA 3L0GA 1L9WA 2KZHA 4JX5A 4Y96A 3TQ0A 3IEBA 3BGGA 5LHEA 1RVGA 1KFBA 3NNTA 1G4PA 3NZ1A 3QYQA 1OFAA 1ZCOA 1W5PA 1H62A 3DKJA 3KVJA 1GTHA 1FUYA 4NUWA 4AWUA 1EP1A 3W85A 2GQ8A 3NQGA 2X1UA 1RPXA 3BLIA 1W0MA 4MVAA 2TPSA 4GBUA 3UWQA 3G1SA 2GQ9A 3EWYA 1XC4A 1AG1O 2I9EA 4JTUA 3N2XA 2EAWA 3F03K 2R91A 4I7UA 4M5PA 3W75A 2QCCA 2ZRWA 3T7VA 3PULA 3W1MA 4OHQA 2V0TA 4TMBA 3QC3A 6ALDA 4RJEA 5I3FA 1B9BA 2H90A 4HIBA 3TC7A 3GIYA 3MBFA 3F4NA 3EB2A 4HSNA 1VHNA 1XUZA 3EKZA 5D2YA 1EB3A 1GYNA 3S1XA 3UY7A 3I7SA 3WJSA 5EBUA 3GLCA 1B4KA 4JIPA 1P0NA 1Z42A 3W3OA 5AYYA 1WOAA 2FPVA 4MFDA 4O1DA 1RR2A 2RDUA 2F7FA 3ABOA 4LV9A 4WQ6A 1G69A 4RXGA 3FJ6A 3T40A 1QAPA 2QF7A 2WSRA 4BFAA 2WKJA 5HUPA 2QCEA 4IJBA 1LOSA 5DY2A 2FDSA 5FESA 1VH7A 1O95A 4Y8FA 5D37A 2VXNA 3DFSA 3Q94A 3LB0A 5BMWA 1KM0A 3V1PA 2CZFA 3UWWA 1G7VA 1SFJA 2Y88A 3QJAA 1ZHAA 4NXSA 2H3DA 3B06A 3S1UA 3L0KA 3W72A 4QAIA 2NXHA 4IX0A 1WBHA 3GAYA 5LNWA 3M47A 3DFPA 3HF3A 2Q3OA 3EWZA 2OZ0A 2QAPA 5HULA 5D2XA 2G96A 3L5AA 3ZR4A 4E2BA 2QJIA 4LC8A 1J5TA 3RU6A 3M16A 4L4MA 2V82A 3R2GA 1O94A 4X3ZA 3T44A 2QCHA 1LBFA 5D04C 1DV7A 4XZ9A 2FTPA 4DO5A 8TIMA 1GJPA 4UTJA 5F2GA 4ZQPA 3LCWA 4IQLA 4O14A 4X9SA 5FEXA 3DENA 4O12A 1JR1A 2C16A 3DH7A 3QM3A 4JYEA 1FWWA 4A2SA 2QJHA 1JCYA 4WD0A 5KZEA 3TXVA 4O53A 2YPIA 5ABTA 2V81A 2Q8LA 2ZZ5A 3NL6A 4Y9AA 4ALDA 1S3HA 4R7JA 3MP3A 3HG5A 4O11A 3VE7A 3TE9A 3W2MA 2C15A 1KV5A 1ADOA 3G0XA 4JS3A 3C8FA 3OA3A 4NJKA 1EUAA 3C2FA 3NQ6A 1ZAHA 3E49A 4UTWC 2Z0IA 3UWYA 1RV8A 4QJ1A 3O6DA 3SZ8A 4O8RA 2VEKA 1B57A 5HJLA 1GVRA 4MOZA 3JR2A 1TSIA 4EIVA 1YLVA 4GRSA 1PIIA 4Y90A 2DP3A 4JGDA 3OIXA 3GKAA 1FWTA 1SZFA 3CIWA 2GVJA 4NVTA 4K39A 1DJQA 1K8XA 2VEIA 4GJ1A 2QUTA 1NAL1 3W1TA 2G5WA 4NJIA 5BW6A 5BRBA 4K8EA 4PODA 4DBDA 3A21A 3HGJA 1DOSA 5FI8A 3UQNA 4LVDA 3NPXA 5D09A 1VR6A 1F5ZA 2ISVA 2ZYFA 4FX6M 2WSYA 3BPWA 1TQJA 4CQAA 2X1RA 1PE1A 4LU0A 3C0JA 4LS2A 1JCNA 3WJZA 1H60A 3WK0A 3W74A 1SUXA 4OBTA 5E0KA 5EYWA 5K2ZA 4KFOA 4JTSA 1ZJIA 2PRLA 5FEWA 4LOCA 5D05A 1SQ7A 2H8ZA 4JTLA 4M19A 1UUOA 3NAVA 3BG5A 2E6FA 2C1HA 1IXQA 3EX4A 1I8JA 3GKFA 2HS6A 3I7QA 2A2IA 3W7IA 1TPEA 1FWNA 4L4LA 1OFBA 1J2WA 3GDLA 4NZFA 4IPJA 4O57A 1GT8A 3W07A 5CG7A 2W0UA 3CIXA 3I6RA 4AVFA 5E1QA 1W37A 1C8VA 4K8HA 3LTPA 1JQVA 4Z1DA 3LRKA 3S0CA 2C6QA 4LRTA 4K38A 3QSRA 3FOKA 1NFBA 3W1AA 1LBMA 2DZWA 3TJLA 5H91A 3CB8A 1H7WA 1JJKA 3FA5A 3S8HA 3E12A 3LCLA 4NX0A 1XI3A 4DQWA 4CNOA 4LS0A 2NX9A 3MI3A 3LHYA 3O8AA 4X2RA 5IBXC 4BR1A 3UPWA 4E38A 3HPSA 4MKNA 3NYZA 2E6YA 4UTWA 2WV8A 2ISSA 1BWLA 3JRKA 3NL5A 1KTBA 3QZEA 3Q37A 3IV3A 4QIUA 2Y62A 1DORA 1EEPA 3O6CA 2Y85A 1W3TA 3NQ2A 2YGYA 5AHEA 4ZQRA 4ZQCA 1WV2A 5KMYA 1L6WA 4FXRA 1LRTA 5C55A 4WUIA 3Q2DA 2PC4A 5F4WA 3HOJA 4Z0JA 4DPQA 2VFDA 3NQ8A 1M7PA 1AL8A 2JBMA 3F4WA 4PA8A 2YXGA 4K36A 4XTDA 3KRSA 1M5WA 3O63A 4NXKA 3SGUA 2CW6A 1FDZA 3DKLA 3LCIA 4UC5A 5C2XA 4OV9A 4EVZA 3FIGA 3O05A 3EX2A 1YYAA 1GG0A 1AL7A 1H7PA 3ABRA 2ALDA 4XBKA 2BXVA 4GUJA 4BK9A 1G4TA 4C1LA 1UB3A 1VYSX 3HMJG 3VE9A 1WOBA 4ZQNA 1OYBA 5AOUA 1XBXA 1TCDA 2R94A 1QPQA 3L0NA 5I3JA 3NOEA 1KM6A 4FNPA 2WJZA 1OFQA 1KM2A 2ZZ7A 2JKPA 3NQFA 3GYEA 3P84A 1NVMA 4NX5A 5AC8A 1Q45A 2E6DA 4O50A 5KINA 3HGSA 2VFHA 3ZWSA 3HGOA 4UFLA 1W8SA 1QOQA 1RZMA 4DEFA 1T96A 2H3BA 5LNVA 1SR9A 4K6AA 1AK5A 3WFAA 5K3VA 2B7QA 4FNSA 4EOUA 3EX3A 1I45A 3G8RA 1W3IA 1JCLA 3LCGA 1FQ0A 1FCVA 4MUZA 1FCQA 1TV5A 3PBYA 2R8WA 1P0KA 1O4UA 4FO4A 1LROA 4LUJA 4FX7A 5IBXA 1XCFA 2CLOA 3LCXA 2P10A 1KW1A 3CU2A 4NNBA 5CSRA 6TIMA 1TIMA 1TV7A 1I2RA 1LP6A 2FB2A 3W22A 1SZNA 5HWNA 3IVTA 2V5BA 2E5DA 4PC8A 2NV2A 4HNUA 3P81A 2YW4A 2ZZ4A 1KTNA 4CCDA 1T0OA 2H6RA 3S5ZA 3C61A 3N3MA 5DBUA 2GPTA 2CFFA 1ZAJA 3UXAA 4YXGA 3PS7A 5AYXA 2GQAA 4BI7A 1G6CA 3N9RA 4YWIA 1R47A 4GXMA 3M5VA 2WNQA 3CPRA 4UFHA 2FQIA 1RD5A 1DHPA 4R53A 4GFSA 2NX1A 4OWGA 4N9EA 3EWBX 1S5WA 2WPBA 3QSTA 4DO4A 1SZGA 4HT3A 1R30A 4UR7A 2A4AA 1SZEA 2PCQA 2CLLA 3LCHA 3OEXA 2AGKA 1FWSA 2C3ZA 1R2SA 4O4WA 4O1AA 2AQWA 3CC1A 1O60A 4LC6A 3P7YA 3FFSA 2NLIA 4WZHA 3E96A 3PBWA 2TMDA 4IXXA 1A5AA 4NJHA 1T8XA 1H51A 2A6LA 3N9SA 3G3MA 1QO2A 3PF3A 4QM1A 4O54A 3QW3A 5FEPA 2EGZA 5IM51 2BWGA 3ZWTA 4LV4A 3P62A 4MZ1A 1FXPA 1X1ZA 2A7PA 2E5BA 1XM3A 4KKXA 5G2IA 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4N02A 4UFJA 5T26A 3TKFA 1H7RA 4ZQMA 5K9DA 1FDYA 4JIQA 3BLFA 2V9DA 2Y89A 5DCEA 3S6DA 4UTTC 2CLMA 3QPYA 2YZRA 3HBLA 2DU2A 5D38A 4MPQA 5KITA 2DJLA 5CPOA 1OK6A 3M5XA 1A53A 3PUOA 5D2VA 2EPHA 4CQ9A 1LM1A 4HPXA 3RF9A 1AW2A 1Q6LA 5CPNA 1Z44A 1F76A 3UD6A 3NG3A 4GC4A 2WQPA 3PAJA 4RLIA 4IMEA 1WDWA 3V75A 3IVUA 2VEMA 1C9DA 4ORIA 3NPWA 3GXNA 1FX6A 5I3IA 3TA6A 1L2UA 1TPH1 5I3KA 4GNJA 3LRLA 1UCWA 1UBSA 3VFLA 1W5MA 3W84A 3W7DA 3G24A 2Y70A 3C56A 3M7WA 5G2WA 3FEMA 4NQ1A 5G1YA 2WSQA 1IXPA 4Z1BA 5LSMA 3B4UA 4A29A 4LY8A 1XDMA 2YFNA 3CT7A 1T99A 3MW7A 5EL1A 3FYPA 3PB0A 4JEQA 4BWLA 5D02A 2RKXA 3TU9A 4AHQA 3A23A 1YXCA 1HL2A 3RLVA 4H3DA 5LKYA 1O5XA 2HTMA 4DBEA 5CZJA 4O10A 3QMRA 5CZ0A 3TH6A 5G4EA 4LS1A 1D3GA 4Y6GA 1GPWA 4WJEA 4JY9A 2R14A 2ZA2A 1EPXA 2A7RA 4HN4A 2VENA 5FF2A 2QDGA 1HUVA 2QDHA 3MWAA 3NQAA 1LCOA 1SW0A 3W71A 3LDVA 3DXIA 1BWKA 2ABAA 2ZZ3A 2JK2A 1XUUA 3MBDA 2IQTA 1PL9A 1YDVA 4UFMA 1GVQA 1TPWA 4JTTA 2BX7A 2QUVA 3IIXA 5D2TA 1HTIA 5CPLA 1YXYA 1PS9A 3I68A 1KTCA 1YDNA 1TTJA 4GE8A 1OFEA 3IIVA 3ATZA 4O16A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3UWUA

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