3UWY | Genus

Total Genus 90

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	90
sequence length	261
structure length	261
Chain Sequence	HHHHHHGSMRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHETDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETDEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEDQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Isomerase
molecule keywords	Triosephosphate isomerase
publication title	Crystal structures of triosephosphate isomerase from methicillin resistant Staphylococcus aureus MRSA252 provide structural insights into novel modes of ligand binding and unique conformations of catalytic loop pubmed doi rcsb
source organism	Staphylococcus aureus
total genus	90
structure length	261
sequence length	261
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date	2011-12-03

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00121	TIM	Triosephosphate isomerase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3uwyA00

2A4AA 2ZQ0A 3NQDA 2NUYA 2ALDA 3OHIA 3LX9A 3WK3A 4DF1A 1DQWA 3DFOA 3LV6A 3THAA 2QDHA 2VKZG 3IIPA 1RR2A 5HR6A 4E2BA 5G5IA 2Q8LA 1KBJA 3P84A 1XC4A 2P10A 3LV5A 5E0KA 1EP3A 1NSJA 1JRCA 4FXRA 3LCGA 3MO7A 3O07A 2GJNA 1QMLA 5BMWA 2XFWA 3NQMA 5AC6A 4N9DA 3C2EA 4YLWA 2CU0A 1ICPA 1T96A 1KA9F 2CZDA 4K7YA 4UTJA 4PH6A 2ATMA 1A53A 1TCDA 3BGJA 3QJAA 3KX6A 1M5WA 4HSNA 1LOLA 3PF3A 4TMBA 1GVSA 3W88A 2GPTA 5LNSA 4FNSA 3A5VA 1VR6A 5KZMA 2QDGA 4LV9A 4BI5A 1XBVA 2NZLA 3TQVA 3VNDA 1D3GA 3CU2A 3OEXA 4JDYA 4B5NA 3MMTA 3O8AA 3V75A 1M6JA 4JS3A 1VLIA 1SFLA 4MIMA 3KVJA 3RNDA 4FX8A 4CLMA 1YPIA 3O05A 2JKEA 3TCEA 3LHUA 3LHYA 3W7GA 3HG5A 2D73A 1H50A 5E1QA 3S8HA 3HQ1A 1VGAA 3R12A 5AC8A 3LBMA 5CZ0A 3F1QA 1W37A 3W2KA 3OBKA 4N02A 2JGYA 4H4IA 4DXVA 3BPWA 3I6RA 2EPHA 5D30A 3S6DA 1OG0A 3IRDA 4FNRA 5KITA 5HINA 4R53A 1TRIA 2V2DA 3RF9A 1X8FA 2WKJA 3TIMA 1EPXA 3UWYA 4O28A 2GVLA 1ADOA 3E49A 2GVGA 4RXGA 2CLMA 3A24A 3W7HA 3FLUA 3S1WA 5HR7A 1OYCA 1F2JA 3LRLA 2J27A 4FIRA 4AWUA 2DP3A 4O1CA 2B7QA 5HJLA 5KINA 1G6CA 3N34A 2ISWA 3S5YA 1ONRA 3TC7A 3C6CA 3M47A 3ELFA 3WJWA 1R47A 4GBUA 4LUJA 4NZFA 3TAOA 3BK0A 2PCQA 5CSSA 3KAOA 4UCGA 2EF9A 1K03A 1EUAA 1OX4A 3G1YA 1TSIA 1IXQA 4LNYA 5FEXA 3PSVA 2NXGA 4GUHA 4O1DA 1W5PA 4M5PA 3MBFA 4EF8A 3PAJA 1KM4A 3W3OA 4JY9A 1W0MA 4JNMA 4IQLA 1TYGA 3FIGA 1LBLA 3NQGA 1OX5A 2VELA 3GNDA 3UD6A 5HUPA 1VCVA 5CGQA 5AOUA 2DZXA 4PA8A 2V5LA 4UR7A 4TMCA 1LP6A 1AG1O 1XKYA 1W56A 3D0CA 5F2GA 3KHJA 4GXMA 1TQJA 5CZJA 2EHHA 5G4EA 2BWGA 3TW6A 3EXRA 1HL2A 5LNRA 4N6FA 2YW3A 4WY0A 1WX0A 2HS6A 3KRUA 1WXJA 1SO4A 3QZEA 3QW4B 4TU1A 3YPIA 1H62A 4N9BA 4XKYA 1HO4A 3KOFA 2ZTKA 2QF7A 3NQEA 4NZJA 5KZDA 1GYLA 2I1OA 1TPUA 3Q2DA 3W1AA 2V9DA 3NA8A 3MI2A 1FY6A 4MLRA 3C2RA 3UY7A 3F03K 4RX0A 4UMCA 3FA5A 2Z2UA 4JTIA 4JGDA 1KM5A 3HIJA 2OJPA 3W86A 2C14A 4K37A 1JRBA 2YCEA 2UV8G 3UWQA 1H1YA 1OFDA 2Y61A 5AYZA 2E5DA 3EWWA 3M0ZA 1KTNA 2WOQA 5LNWA 5KZEA 3CB8A 3EWUA 5F2LA 4IPIA 2ABAA 3L5AA 3LOTA 3O06A 4JXCA 1S5TA 3ABQA 3CEPA 4MVAA 4LS1A 3FJLA 4C1LA 3GNNA 2V5BA 3TNOA 4PCFA 4JDBA 3PG8A 4JTSA 5TQLA 3UZ5A 1Q3NA 1KM3A 3NQFA 4UR8A 4MY8A 1B3OA 5D2WA 2GUUA 4BR1A 3NQVA 4K38A 1EP1A 1TTPA 2C15A 2Z0IA 3IGUA 1SFJA 2C16A 1OF6A 3DH7A 3PBWA 5DY3A 1J2WA 3P60A 2AGKA 4O4WA 4L4LA 2QUUA 1XCFA 4DF2A 1N55A 2VENA 3A21A 4LVDA 2F84A 4XZ9A 3PBYA 4R34A 4WX2A 4MZ8A 1JUKA 3PSWA 2EAWA 3ZWTA 1J4EA 5F4WA 5AHIA 4IX0A 2VFGA 4IXHA 2PRMA 1Q6LA 4Z1BA 3S5NA 3P8IA 1L6SA 3S5OA 3QMSA 3QW3A 5FF7A 5I3KA 2H3DA 4ICNA 4MYXA 3W7EA 3W2JA 1TPWA 4XUGA 3VE9A 3ZWSA 1V7YA 2EGZA 3FKRA 3GB6A 2WSQA 1GJPA 3M16A 4MLJA 1XBXA 4BI7A 1XBZA 4XWUA 1P5BA 4X3ZA 1H5YA 2ZA1A 3LRMA 4GUGA 4A21A 3PBVA 4M6VA 1VZWA 3ATZA 1GVQA 3HG4A 1LDCA 1KFBA 4DPPA 5J5DA 4EVZA 4XBKA 3CTLA 5H2ZA 2Q3OA 4RCXA 3LCIA 1QPRA 2TPSA 4UTHA 4K6AA 4NVTA 3N9RA 5AC7A 1VYSX 3C3NA 4RXFA 4FO4A 3HGOA 3VCRA 4ZQOA 4ORMA 3OG3A 5LNVA 4HPJA 2NX1A 3PUDA 5HQEA 3LHTA 3TV8A 3NL6A 1OYAA 2RDTA 3G1DA 1WV2A 4O0ZA 4IMDA 1U83A 2BLEA 2A7PA 4AHPA 4ORIA 5K9CA 3W72A 3MP3A 1WAUA 2W6RA 2NX3A 4A29A 1JCXA 3DFTA 3SGZA 2CLFA 3BG3A 4WZHA 2YZRA 1EWDA 1OFOA 1FDJA 2X2GA 3IIOA 5D05A 4JD4A 2QJIA 4RZ6A 4ZMGA 3W1UA 3BLIA 2A7NA 5LZLA 1DOSA 1B9BA 4LTSA 4UMAA 1AL8A 4OHQA 4IX2A 3MJYA 2YPIA 4NJKA 1LZOA 4OQVA 2NUXA 2A6LA 3UZJA 3OVRA 3ATYA 2JK2A 1OFPA 1XDMA 3W7NA 3STFA 3GVGA 3LBCA 3BG9A 4ADSA 3TFCA 5AHFA 1X7FA 1EEPA 2BX7A 3ZR4A 2B7OA 5FF4A 2VEKA 1P1XA 4K8EA 3G18A 4O16A 1ME7A 4HNUA 4UNKA 1IIGA 2VEIA 1W5OA 3QSTA 3NQ7A 6ALDA 1OHLA 4GUFA 1W5MA 3PY2A 3KRSA 3NQ6A 3TQKA 3T7VA 1F05A 3QQ1A 5I3IA 3LI0A 2E6YA 1SUXA 3HG3A 2WV8A 3PS7A 2OT0A 4MY1A 4C1KA 3IGXA 3RK8A 5HNRA 2V2HA 4TR9A 1GVRA 3E12A 3G8EA 3NPXA 4IJBA 4PC8A 2Y70A 4AXKA 3L2IA 5BOOA 5F1VA 3T78A 3HGJA 4WY0F 1P4CA 3I68A 2O7QA 5FF3A 3SJ3A 2A2IA 3GAYA 1SPQA 1FWNA 3B0VC 2FDSA 4AHOA 1GVOA 5K9DA 1L6YA 5CPOA 4BF9A 1H7OA 1Q6QA 1ZCOA 2XN2A 2I14A 3W84A 3NL5A 4LRSA 5FEWA 1JCYA 4ADUA 1AW1A 5DELA 1VS1A 2QCHA 3LTPA 1OFAA 1TJPA 2FLIA 3EX2A 1YXDA 1GQNA 4E38A 5FF0A 3SFKA 2C6QA 2TMDA 4Z08A 5D2XA 4JX5A 4QJ1A 1ICSA 2V82A 5DXYA 3NYZA 1OFBA 2WNNA 1LROA 1OFRA 1QR7A 3PB2A 4JN6A 3LHVA 1K8YA 5DCBA 5I3FA 1R30A 3N19B 3QSRA 4LWWA 3O6DA 4AMAA 1R46A 1ZFJA 3OVPA 5HUOA 1FWRA 1MEWA 3R13A 3VFLA 2QAFA 2P1FA 4XTDA 1RZMA 5D2YA 3W2NA 3MYPA 1T99A 5FF2A 2H8XA 4LV4A 1DBTA 1A5CA 1TV7A 3GXNA 1Z42A 2CLHA 1JCMP 2DZWA 3TR2A 4RKAA 1VCGA 3U8GA 3MI6A 4WJEA 1FDYA 3G22A 4H3DA 2WSRA 3W7MA 1PHWA 1CX9A 4HNNA 3STGA 4GUIA 5D04C 1BWKA 5A8GA 4RZ5A 3O6CA 5K9XA 4UUIA 3LDVA 4RJEA 3WJYA 4Z1AA 2C0AA 4FB7A 1PV8A 4GFSA 5F1UA 5HMSA 2NV2A 4JTJA 2C1HA 1DVJA 3P5ZA 1A5AA 3WJZA 1KFLA 4NUWA 2HSAA 1TTQA 3L0NA 1JR1A 5TIMA 3TAKA 4RK8A 1MZHA 2NXIA 4UC5A 2ZRYA 1TJRA 3W74A 1RVGA 2E77A 3EWBX 8TIMA 4MFDA 5C6MA 4QNWA 2VFIA 4O15A 3T55A 4UTTC 4MZ1A 5HWMA 1QPQA 3NQCA 4AB4A 2ISSA 2C3ZA 2YFNA 3MP4A 4GC4A 3W23A 3IIXA 3G24A 7TIMA 2ZZ5A 4AWSA 1DKWA 4A3UA 2A85A 1R2TA 4LVFA 2FQIA 2ZDRA 4O57A 3IVUA 3QFEA 4ZVJA 4JYDA 1LCOA 5TBOA 5D09A 3A23A 5C55A 5DY2A 1NAL1 4M19A 4Q4KA 1QO5A 2YSWA 1WYIA 2TSYA 3LXBA 1F6PA 1THFD 4RR4A 3QM3A 2JKPA 2FJKA 4HSOA 3R8RA 3W07A 4FIQA 3CC1A 4ZL1A 1ZHAA 3QQ0A 3LCHA 1JVNA 4M6PA 1DJNA 3PG9A 1I2RA 3IIZA 1DORA 5GVJA 1TREA 1W5NA 3PUOA 3GX9A 3INPA 3VI2A 3LHWA 1OFQA 1JCLA 5G4WA 1A50A 1OJXA 1O95A 4KFNA 3TKFA 4JTHA 5DN1A 3EWZA 3HO8A 4RZ4A 1GWJA 1YXYA 4QISA 1W3IA 3W71A 3W2UA 3LCWA 3M43A 1MEHA 4Y96A 3AJXA 4JYEA 1S5VA 3LB0A 3DHDA 1H7XA 1OF8A 1R2SA 3W22A 4ZZ9A 2VOMA 4MPQA 2H3BA 4YXGA 1TIMA 3UWVA 1LBMA 1PCKA 4LS2A 1KM1A 2VEMA 3TROA 3EB2A 5EMUA 5AHMA 1PS9A 3FJ6A 2C18A 3G8RA 1XBYA 3BV4A 5FEPA 3SSJA 4K36A 3GZ3A 2ZZ4A 1VHNA 4GRSA 4OV9A 3GR7A 1GTEA 2QEZA 4LS0A 2OX1A 4UTLA 3B0UX 5DCEA 3E96A 5F4XA 1H7NA 3GDTA 4Z0SA 3TA6A 2GQ9A 3HGRA 3UQNA 4O17A 3QRHA 1BEUA 1UB3A 5CZTA 4OV4A 4P2VA 5EPDA 1H7WA 4LC8A 4MOZA 2Y62A 1GEQA 1VYRA 2ZRVA 4X9SA 3P67A 1VLWA 4TX9A 2YW4A 4K39A 3M5ZA 3NAVA 3W7OA 5KMYA 5AN7A 4DPQA 5IBXC 1H1ZA 4EIVA 3W1NA 3L65A 3W85A 2NV1A 1ZJIA 4I7VA 2YGYA 3H53A 3L5MA 3T44A 2DORA 3G0XA 3RLUA 1JCNA 4L4MA 3TMLA 2KZHA 3DFPA 4ZQNA 1RV8A 3TSDA 3PB0A 2E09A 2FTPA 1UUMA 3QH2A 3Q58A 2ZA2A 1H60A 2PURA 2WO5A 5BRBA 4QIUA 1IGSA 3STEA 2NX9A 4QAIA 1YXCA 5CSRA 5BMXA 3NR0A 1FBAA 1O4UA 1WQ5A 3LTSA 1PE1A 3WK1A 4AH7A 3S9YA 1XM3A 4O11A 4HHPA 3LLDA 5DBTA 3MI3A 3IV3A 3NQAA 2CLOA 1GZGA 1HUVA 5BW6A 3HF3A 1SQ7A 3P8JA 1FXPA 4Y90A 1FCVA 5U7SA 3UXAA 1Q6OA 3EXSA 3W73A 3BW4A 4DQWA 4N9EA 3HMJG 4UTTA 1G4SA 2ZCGA 2E1DA 3TE9A 5LHEA 3RFAA 3C2FA 1LRQA 1O5KA 1FDZA 4FNTA 3W75A 3ANYA 4O8RA 4O10A 1UCWA 5G2IA 1QWGA 4FNUA 2P0OA 1H7PA 2NXHA 2YR1A 5K3VA 1KV8A 1WOBA 5LGZA 4WXZA 3H55A 3FOKA 2Y85A 4O50A 1VYPX 3P81A 2QJHA 1DJQA 1LRTA 2QCMA 2C19A 4KWWA 2NUWA 3DFSA 1G7UA 1FUYA 1SO6A 2PRLA 3UWZA 4JTFA 3NG3A 1Y0EA 4UFIA 1EWEA 3ABOA 3FYOA 2QUTA 2XN0A 1VQTA 4N4PA 1SO3A 4BFAA 1GYNA 3GR8A 2OZ0A 3P80A 3S5ZA 1QNVA 2H8ZA 3C4UA 2ZRUA 4OWGA 1S3HA 2QJGA 4HIBA 3UPWA 4JYFA 4IXXA 4NJGA 3TUUA 4O18A 5F4SA 3VKJA 4OT7A 3RMJA 2QR6A 3DXIA 3IVSA 1TPC1 1WA3A 3PWAA 4A2SA 2Z6JA 3L68A 2AQWA 3CEUA 5U4NA 3W1TA 1ZALA 3G1VA 3T40A 3G1AA 4GNJA 1ME9A 1KV5A 3TW7A 5EYWA 4JY8A 1W5QA 1W8SA 4BWLC 1IF2A 4QITA 3E02A 4H6KA 4FNPA 3EX6A 3B4UA 2V81A 3V1PA 1RQBA 1TV5A 3G1HA 3GYEA 4IMCA 2WSYA 5G2WA 3I65A 3FEMA 2O7SA 1F76A 1N7KA 3B06A 4W9TA 3USBA 2VC6A 1TTIA 4WD0A 1AK5A 5E93A 3M6YA 4JX6A 1H61A 1MEIA 5LHFA 4NT0A 4FF7A 3TX9A 3R2GA 5CKSA 2VEPA 3CPRA 1U5JA 3BVJA 1OK4A 5D32A 1W3TA 4KWVA 1I45A 4Z0JA 4HPXA 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5LNUA 3HPSA 1ALDA 3L0GA 3QYQA 3Q37A 2JGQA 1F6KA 1VHCA 4UFHA 1XI3A 4S2CA 3WJSA 3MHUA 2Y7GA 4BK9A 4LC6A 3SZ8A 3KXQA 2H90A 3LGEA 5CZSA 3GAKA 4DBEA 3HPXA 2JBMA 3C52A 4UNLA 1K8XA 1EX5A 2C13A 3W83A 1OX6A 1TB3A 5CPLA 2TRSA 2DJXA 4S2BA 3LTYA 2CLEA 3W7KA 1TV8A 3DBPA 3N9SA 3TDFA 3SW6A 1IXPA 4NNAA 1GT8A 3DFQA 4X2RA 2ZRXA 4YCOA 4XTIA 4RV8A 2CW6A 1GG1A 1HG3A 3UY8A 2QUVA 4BWLA 3RU6A 2RFGA 3NNTA 4EF9A 4HT3A 4MJMA 1ZENA 3CM4A 1QOPA 1W54A 2FPTA 2ZYFA 4BI6A 1MO0A 1TPH1 3FKKA 3CWNA 1EUNA 2J9ZA 3NO5A 1QFEA 3F4WA 4E2DA 3O15A 2DJLA 2R91A 3G3DA 1JCJA 5AYXA 3UYCA 2VFHA 5DBUA 2FB3A 3G1SA 4CCCA 3QMRA 3OIXA 1H7RA 2X1TA 2A7RA 3NGJA 3F4NA 3N14A 3CLMA 3O16A 3MHGA 3NPWA 3ABRA 5AB3A 2YDAA 4IPJA 4OU1A 2E5BA 3W7DA 3LCFA 4R33A 4WOZA 2ZFAA 2QCNA 3B0PA 2Y7EA 1UBSA 1SSGA 1XUUA 4NU7A 1QO2A 1G7VA 5D37A 5D03A 1LLWA 4M6QA 1QAPA 4OBTA 1YDOA 2V8ZA 2FPYA 2Q3RA 3SY5A 2E6DA 1NVMA 2ZZ2A 4QSHA 3P5YA 1E51A 5DCDA 3KVKA 2CLKA 3G1XA 2RDWA 4UTKA 1QCWA 4IGHA 4FX7A 5AFDA 1YDNA 5K4XA 2HTMA 4LVGA 5EL1A 5H91A 4O1BA 1GTHA 3HJZA 1L6WA 3IIVA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3UWYA

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Chord Diagram

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