3UWZA

Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with glycerol-2-phosphate
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
SMRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHETDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETDEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEDQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Crystal structures of triosephosphate isomerase from methicillin resistant Staphylococcus aureus MRSA252 provide structural insights into novel modes of ligand binding and unique conformations of catalytic loop
pubmed doi rcsb
source organism Staphylococcus aureus
total genus 83
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2011-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3uwzA00
3RK8A 3LV6A 2BWGA 4KFPA 4NJHA 1OF8A 4HN4A 4S2BA 1I2NA 1VR6A 3EX4A 3W73A 3OVPA 1PHQA 4MIMA 3TCEA 3AJXA 3W6YA 3TFCA 1OYBA 2X16A 3IIZA 3M44A 1D9EA 1RV8A 1A5AA 2QCLA 3M7WA 3FLUA 1TTPA 4FEZA 3NQ6A 2C16A 4CQAA 2BZNA 3SSJA 3MP4A 4JIPA 3BW4A 2QJHA 1JJKA 1ONRA 3QW3A 3WK2A 3TXZA 1VLWA 4KWWA 5DCEA 4K37A 1TQXA 1RZMA 1EB3A 3DAQA 2VOMA 3RU6A 4Z1DA 2HS6A 5DLCA 2RKXA 4KFOA 3SJ3A 2WNZA 4AWSA 2Y7DA 3IVTA 3N34A 3MI3A 3HPSA 1KM2A 3HJZA 1T8XA 1L6YA 2QCGA 2NXGA 4LVDA 5L6UA 3OIXA 5EMUA 1EPXA 3H53A 5CZ0A 3M5VA 4JTEA 5EBUA 2P1FA 3NZRA 3UNDA 3C3NA 2B4GA 1O60A 2ZZ1A 5FF3A 3FKKA 3LCGA 4O15A 3UWZA 1D3HA 4MJZA 1GVRA 4OWGA 1W31A 3GR7A 1IXQA 3NO5A 3DZ1A 3L9CA 3UPBA 3EWXA 1TCDA 1H7PA 2VEIA 2X30A 3O8AA 1H7NA 3P61A 2DZSA 5FEXA 1YLVA 2OT1A 1LORA 2EHHA 5SWUA 4LVGA 2WOQA 4O19A 3MHFA 4WQ6A 2VEMA 1PCWA 4K7YA 1W5NA 1JR1A 3KRZA 2EPHA 1KFJA 1YXDA 1XKYA 5E93A 1EEPA 2KZHA 4NU7A 1R2RA 2RDWA 3V1PA 2H8XA 3IIPA 1UUMA 2YYUA 3DFTA 3G3DA 4BFAA 1ICSA 2QCNA 4JIQA 2V2DA 3RFAA 5T26A 2X2GA 4LT9A 1KM0A 1WYIA 1JCLA 1ZY9A 4FX8A 3W3OA 4LV4A 3VKJA 1YYAA 1FX6A 4X22A 1QPQA 1JUBA 3H54A 1LTDA 4JYFA 4DF2A 3PSVA 4AAJA 1V5XA 3S9YA 1GTEA 2P0OA 1FCVA 3CM4A 4D2JA 3IRDA 2TRSA 3W2MA 3QRHA 3R89A 3NDOA 4JTLA 1BKSA 4ZQNA 2EKCA 1XCFA 1TB3A 3W7IA 1O94A 4JTJA 1VS1A 4O1CA 4UTHA 3FKRA 1JCYA 1LBMA 1QWGA 3M5XA 1SR9A 1AL7A 1DQXA 4BI6A 3LXCA 1HUVA 3KOFA 1TREA 1SU5A 5F2LA 3RLVA 5CPMA 2W0UA 5LNRA 4UMBA 1LOLA 5K2ZA 2JGYA 1ICPA 3CEPA 4QITA 1X1ZA 5CSRA 1MO0A 1LRQA 1VQTA 4BWLC 1FWTA 2NWRA 4O10A 1G69A 3IIVA 5G4WA 2IQTA 4IMDA 4HPJA 4QNWA 3G0UA 5DELA 3G1VA 2RDTA 1H7WA 4DBEA 3A23A 1LBLA 4EF9A 4UFLA 1XDMA 2OT0A 1LZOA 3WFAA 3L66A 4OBTA 1NFBA 3KX6A 5D37A 1K8YA 1WBHA 4XKYB 3BW3A 3W86A 4ML9A 2A6LA 4JEQA 3LHUA 3BG3A 4ADTA 1I2PA 4UFIA 2V2HA 1MZHA 4H4IA 3PBUA 2FQIA 3IGSA 1B4EA 3RF9A 3NQFA 1TJRA 4FNTA 1PCKA 1QPNA 2Y6ZA 1OX6A 5D02A 2HSAA 3W7QA 4DELA 3T55A 4YWIA 3BGJA 1ZAIA 4WY0B 1OFAA 5HNRA 1F05A 3R2GA 1EP2A 1TRIA 4LNYA 3CQ0A 2ATMA 1YTEA 4NJJA 3N3MA 5K4ZA 2ZRYA 4MLJA 1F2JA 2G95A 3WJSA 1O95A 2QJGA 3LHZA 3PR2A 3G0SA 4LS1A 4JDYA 2Q3OA 2A7RA 1IXOA 5BRBA 5HWJA 3FYOA 3NR0A 3PUEA 4A2RA 2Y7FA 1SW7A 4MY9A 1FDYA 1WV2A 1GZGA 3LHVA 4O4VA 1O5XA 1KTBA 3M5YA 3MWAA 3TSDA 4S1FA 5D2XA 2E1DA 5HJLA 1GTHA 4K38A 1IXNA 3BARA 1L6SA 1LOQA 1OX4A 3S5NA 3W1LA 3BG5A 1KM3A 5D33A 3TUUA 5AYYA 4UTKA 3PVFA 2E68A 1AW1A 2A6NA 4IX2A 3INPA 3W1RA 4DEFA 3WK0A 1FWSA 2ZYFA 1OFPA 3GDKA 3NG3A 4MZ1A 4TMCA 5E0KA 4RXFA 4NJIA 4LS0A 1WA3A 4IWWA 1AW2A 2Z1BA 1KLZA 3GX9A 1XL9A 1EP3A 4U28A 5G1YA 3PSWA 4QAIA 2XN2A 5I3FA 3P7YA 3W1TA 4QM1A 1G4EA 4Z0JA 1K8ZA 3VE9A 1OYCA 2GVJA 4QQ3A 4PTNA 1TV8A 3PY2A 3ZR4A 3C52A 2QCDA 3C0JA 4AF0B 1K7EA 1SW3A 1WAUA 5FEWA 3LCLA 3LRLA 4O8RA 1NEYA 3NNTA 3THAA 4C1KA 1GVOA 2J24A 1CX9A 2BSLA 4MVAA 2ISSA 3B06A 5FESA 3B0VC 5HR7A 2A7PA 5DBTA 5HUOA 3RMJA 3QMSA 4GUGA 1FDJA 3STEA 4RX0A 2NZLA 2R14A 1U5JA 2C1HA 1YXYA 1AW5A 4MZ8A 1F76A 2OMAA 3I7QA 2WNQA 1LLWA 1PVNA 3QC3A 2GUUA 3TKFA 3WJXA 1I4NA 3S5YA 1R2SA 1HO1A 2H6RA 3NQ7A 2I9EA 4JXCA 1C8VA 3PBVA 1JCNA 3O15A 1KM1A 2DJLA 4RZ5A 2VENA 2JK2A 5LHFA 4TR9A 1XM3A 1HFBA 2R91A 3NPWA 1G67A 4I7WA 5C55A 3EB2A 1XUZA 3NYZA 2NV2A 3WJYA 1K03A 1QR7A 2ZRVA 5G5IA 1KV8A 2V81A 2WKJA 4N6FA 3LXBA 2E5DA 3CC1A 5HR6A 4LVAA 3M5ZA 1OFEA 3U6WA 4Z1AA 3P5ZA 3SIZA 3Q2DA 1T99A 4O54A 4K6AA 1WX0A 1TQJA 1N55A 1U83A 1GYNA 1W37A 2PRMA 3W88A 4W9TA 4HSNA 2BTMA 4WJEA 1I2RA 3V75A 3FIGA 3P81A 1QPRA 3W7RA 1DQWA 1H7XA 2DZTA 2JKAA 5IBXC 1KFCA 3LLDA 4DO5A 3KVLA 1H51A 1W3IA 3T44A 3W1QA 3G1DA 1OG0A 4JYEA 2E6YA 2WQPA 2A5HA 3KAOA 3LDVA 3P5YA 3NVTA 4JICA 4UNLA 2V5LA 3HG2A 4YMZA 3DU0A 1TPB1 2FPVA 2I1OA 2ABBA 5U4NA 4A3UA 3DKJA 1F73A 3GAYA 5AFDA 3HGOA 3EEGA 2Y88A 1TSIA 3PUDA 3IV3A 1A5CA 3LGEA 4FIQA 2Y85A 4GUIA 2RFGA 4NT0A 5DN1A 4M6PA 3D0CA 3TQ0A 3N9RA 4YCPA 3TXVA 2J9YA 3U8GA 4ONVA 3MO7A 4FNSA 3TA6A 1ME8A 1YDNA 3F4WA 3W76A 3L21A 1LRTA 2QUUA 1EWDA 4I7UA 4ZQPA 4JS3A 1QNVA 1W3NA 1L2UA 2FPTA 1KFBA 2QCMA 1JULA 5AOUA 1OFQA 5KINA 4TU1A 4MLRA 2YW3A 5KZDA 2X1RA 3OG3A 1ZALA 3QEZA 2J9ZA 4O50A 3FEMA 1ME7A 3ELFA 3G1HA 3HO8A 3Q94A 3NOEA 3W7EA 2E6DA 4JY9A 4N2YA 1V7YA 3TROA 3MMTA 3W2NA 1PS9A 3W72A 2VFGA 1GOXA 2CU0A 5CG7A 3LI0A 4BR1A 1TPUA 3E49A 2HS8A 1Z48A 2OCZA 4PEKA 5AHEA 3THQA 4UTWC 3TJLA 1FY6A 4XTIA 4EOUA 2GQ9A 1FCBA 4DF0A 2CLHA 1XBVA 1OF6A 1XXXA 4MFDA 3I6RA 3BVJA 1F5ZA 3EWUA 3KRSA 1WDWA 2B7PA 5CZTA 3C2RA 3N19B 3GNNA 4Q33A 3DFNA 1VGAA 4EF8A 2J9XA 2GJNA 3MBFA 3QH2A 4DXVA 4X3ZA 3M1ZA 4KWVA 3EWYA 1SZGA 2YCEA 1VZWA 4GBUA 1LP6A 2PRLA 3G1XA 3NPUA 3W1NA 1K3UA 4A21A 2B7NA 2TPSA 3OHIA 2A21A 4IMCA 2YZRA 4JD4A 1XDLA 1Q45A 2H90A 5HWNA 2CLEA 3C2EA 4XTDA 1W3TA 2OZ0A 3UQNA 3H55A 4JTGA 2PURA 4OQVA 4ZQMA 3WK1A 3UXDA 3DBPA 5K4XA 3CIWA 3BW2A 1VJIA 1LDCA 2G97A 2O7QA 3HIJA 1VH7A 3GB6A 3TW6A 4DBDA 1SO4A 3EKLA 3TMQA 1GVQA 1N7KA 4XZ9A 1BWKA 1W1ZA 1GQNA 3IVUA 4ZZ9A 3TU9A 5TBOA 1KW1A 3O05A 4O13A 3FJ6A 1JCJA 3C8FA 2Q3RA 1H63A 4E0CA 4HNTA 3CT7A 5IM51 2H8ZA 4LUIA 2CZ5A 3LTPA 4UNKA 2YW4A 3T40A 1UCWA 4IPIA 1A5SA 3NL5A 4AWUA 4NUWA 2CLMA 4PL1A 1TJPA 4UFKA 5CSSA 5AHNA 4O52A 3LERA 4JX5A 3L0NA 1Q6LA 3G3MA 3IEBA 4RK8A 4O12A 4HIBA 5LNWA 1GG1A 2OX1A 3UWWA 2ZRXA 3I68A 4DO4A 3M6YA 4R53A 1FXQA 1YTDA 2CLFA 2C3ZA 4G1KA 3EX2A 3T7VA 3ZWTA 1O5KA 4E2BA 1EUNA 1TPH1 2YGYA 3CIXA 3QYQA 3A24A 5HWMA 3KVMA 2V9DA 3G1FA 4WD0A 5KTLA 5TQLA 2DZXA 1UJPA 1IF2A 3W22A 1TV5A 3KRUA 4RKAA 4YL2A 1SZEA 1D3GA 4QIUA 3GK0A 3GDLA 5FF0A 5AYXA 3IIXA 1N8FA 3MW7A 2JGQA 1QDSA 4UTWA 5K9DA 3BLFA 3S5OA 3P80A 4MY1A 2C18A 3NQGA 3GDRA 3QSRA 1KM4A 2LLEA 3N14A 2NXIA 4JTTA 3HG5A 2BLEA 1KFKA 4IX0A 3S1UA 4MYAA 1T0OA 4FO4A 2TYSA 1JUKA 1ZNNA 4O4WA 4Q4KA 4UTTC 3BO9A 3P60A 4Z1BA 4WZHA 3W85A 4IXXA 3TSBA 5J5RA 5I3HA 3G1AA 1CI1A 4UR8A 2V5BA 3TAOA 3FFSA 3UD6A 4N6EA 4O0KA 4O53A 3NM3A 1W8SA 3W1UA 4N9EA 1JCXA 2BX7A 4O57A 3L67A 1MEWA 1ZENA 3G0XA 3W7PA 4ADUA 1LBFA 1THFD 2ZZ3A 3CHVA 2QF7A 2O7SA 1RR2A 2V82A 2CLOA 2CZFA 3DXIA 5I3GA 2Y7GA 3Q37A 3MBDA 1YDVA 3EX6A 3B8DA 4JDBA 2ZFAA 1JQVA 1VYSX 1M5WA 3QZEA 4GFSA 3MI2A 1GEQA 2RH9A 5BMXA 1DOSA 1DL3A 5C5YA 3GVGA 4LVFA 3HPXA 3SZ8A 2DZVA 5A8GA 1EWEA 2VXNA 3NPVA 2DZPA 2GPTA 3NGJA 4GUJA 1F74A 1Q6OA 1DORA 4QJ1A 3PG9A 4UFHA 3R8RA 4GJ1A 4CQ9A 5DCDA 1P0NA 2ISWA 1QMLA 4K7VA 1G4PA 4CCEA 2J88A 1FDZA 3LHTA 1PV8A 4M5PA 4IXHA 3NQ8A 4FNUA 2WNNA 3E0IA 1SSGA 4AHPA 5C54A 3HBLA 4CNNA 2P10A 1WOBA 2G5WA 2ZBTA 2WSRA 3ZWSA 2VC6A 4JYDA 4QNEA 3P67A 4WOZA 5G4EA 4LU0A 1NF0A 5AC8A 5AB3A 2GQ8A 1P5BA 2XN0A 4O14A 3JS3A 3SI9A 2ZRZA 3TR2A 3USBA 3BV4A 3CWOX 4A29A 4B5NA 2E6AA 3BLIA 1H60A 1F6PA 3LRKA 3L0KA 5TIMA 2VFEA 2OJPA 2QCHA 4ADSA 3AO0A 1P1XA 4OT7A 3SFKA 3S0CA 1BTMA 4IGHA 2VFHA 2ZA3A 4DF1A 5LNUA 4JTKA 2NX9A 1SPQA 3GXPA 3W70A 3O6DA 3R5EA 1VLIA 4UFJA 3KFTA 2Z6JA 3STFA 3F03K 4FNQA 3YPIA 1IIHA 4IJBA 2D73A 4IQLA 1JUEA 5BOOA 4XKYA 1B4KA 7TIMA 1VCGA 1H1YA 3TC7A 1VCVA 4UMAA 2Y62A 1AG1O 3GDTA 4R34A 2ZQ0A 3QPZA 3SECA 4UTTA 3SY5A 3EXTA 2GOUA 4UR7A 1G7UA 3GKFA 1SFLA 5HINA 1OK6A 2B7QA 3WJZA 1QO5A 1LRNA 1DBTA 3HF3A 3L68A 3WJWA 4RZ6A 4O0ZA 3E02A 3F4NA 4WUIA 1TPVA 4WY0F 4GUFA 4WY0A 3S5ZA 2NUYA 3DENA 3HOJA 4IOTA 4TO8A 1M7PA 5C6MA 3HGSA 5KITA 2C0AA 3LCHA 1TMHA 1EUAA 3LI1A 2VFDA 2E6FA 3W7OA 2NLIA 4TX9A 3TDFA 1YPFA 3KHJA 4O1AA 4HSOA 2HTMA 1W5QA 3LHYA 2NX1A 1C29A 1UASA 1OYAA 3JR2A 5LNSA 5F2MA 2PE4A 1HO4A 4GE8A 3LXAA 1G4SA 1X8FA 4LUJA 1OX5A 4BWLA 1KV5A 4NQ1A 1JRCA 2PCQA 2VELA 3HG3A 2PC4A 3SGUA 3K30A 2Z6IA 2Z0IA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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