3UXDA

Designed protein ke59 r1 7/10h with dichlorobenzotriazole (dbt)
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
247
structure length
247
Chain Sequence
PRYLKGALKDVVQLSLRRPSLRASRQRPIISLRERILEFNKRNITAIIAVYKRKSPSGLDVERDPIEYAKFMERYAVGLVILTEEKYFNGSYEDLRKIASSVSIPILMWDFIVKESQIDDAYNLGADTVGLIVKILTERELESLLEYARSYGMEPAIVINDEEDLDIALRIGARIIIISSRDLETLEINKENQRKLISMIPSNVVKVAASGISERNEIEELRKLGVNAFEIGSSLMRNPEKIKELIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Kemp eliminase KE59 R1 7/10H
publication title Bridging the gaps in design methodologies by evolutionary optimization of the stability and proficiency of designed Kemp eliminase KE59.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 98
structure length 247
sequence length 247
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.-.-.-:
pdb deposition date 2011-12-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3uxdA00
3MHFA 2GQ8A 6ALDA 4OQVA 3U8GA 1W5OA 3W2UA 3SIZA 4NNCA 3IVTA 3B4UA 5DN1A 4XBKA 5F2MA 3TXVA 1NVMA 3CEPA 3GR8A 2DP3A 2B4GA 4TX9A 5C55A 1WBJA 1CW2A 3LHTA 2G95A 3UNDA 2Y7DA 2FFCA 4CCEA 3G22A 3T4CA 1SU5A 3RLUA 2CLFA 3G1HA 2W0UA 3W1AA 3W84A 2JGYA 3O16A 1VH7A 3MW7A 4WJEA 2X1TA 3H54A 3SI9A 3GR7A 3P82A 5F2IA 3RMJA 2QDGA 3I7SA 4PH6A 3HJZA 1WOAA 3QSRA 1YDVA 2FDSA 2RDWA 2EPHA 3HGJA 5D05A 1HUVA 5AB3A 3TFXA 1LOLA 2V9DA 3G1VA 1PS9A 3O15A 1Q6QA 4NNAA 4R53A 1X6UA 3W7QA 1TPVA 2TYSA 4JTLA 2A2IA 4LUJA 2WNQA 3HBLA 1LCOA 1GVQA 1DBTA 1G67A 1AL8A 1H60A 1TIMA 1OX6A 2ZRZA 1BWKA 2NZLA 4RK8A 3EX1A 3W7MA 3NXFA 4E2DA 1GTEA 4BF9A 1SFJA 1N7KA 4ALDA 2ZA3A 4WZHA 4JYEA 2X1RA 1A5AA 4I7WA 1C9DA 4UMCA 3TFCA 3F03K 1KM6A 3QM3A 5K7JA 5KZDA 4MY8A 1XBZA 2PE4A 3UZJA 1FDZA 1C8VA 2CLEA 3B8DA 4OBTA 2P1FA 3MJYA 1ALDA 5CGQA 3LHYA 3S0CA 2Y7GA 3C6CA 1KM1A 3G8RA 4LVGA 4BI7A 1H7XA 1TTPA 5G5IA 3DH7A 1QPRA 4ADUA 1NAL1 1JCNA 3T55A 4EWND 3M5VA 4HSOA 4YXGA 4JDYA 1UASA 3W6YA 3UWWA 3W7GA 4LS0A 1GWJA 3EWUA 3C2RA 4QJ1A 4RV8A 4D2JA 2ZRWA 2CW6A 5DXXA 5F2LA 1VLIA 2B7NA 3NL2A 5BOOA 2BSLA 2NUWA 1AL7A 3M7WA 4UTJA 3W7CA 3JRKA 4UTTC 4IMFA 3KVMA 5HJLA 4UTWA 3LXCA 1YYAA 3O6DA 4JTKA 3ABOA 4XUGA 1XUZA 3ZWTA 5K9XA 3USBA 1QDSA 3BGJA 1YLVA 3O6YX 2JBMA 4BI6A 5K4ZA 3RFAA 3LRKA 4Y6GA 4UUIA 3P5YA 4CQ9A 1JCLA 2HS8A 4K7YA 2QR6A 3PR2A 3C56A 4AHOA 5KZMA 3S42A 2VFIA 1L6WA 3NQCA 1TV5A 4ZL1A 3ANYA 2VFEA 3BLIA 3C61A 1LRNA 4XWUA 4TR9A 2YCEA 3B04A 1K03A 1VCGA 3GAKA 3BARA 2E6FA 3MWAA 2PCQA 2FLIA 1KFCA 4ZQOA 3DHDA 3LDVA 4FO4A 1H63A 4MY1A 1TJPA 1Q6OA 2A7NA 3RLVA 4RR4A 3A23A 4JTIA 5DCDA 3CPRA 3KVLA 1VYRA 4S2BA 1EUNA 2YDAA 2A21A 2Q8ZA 2DZVA 1PL9A 2WO5A 3O63A 5K3VA 4MJMA 5C54A 3IGSA 5HR6A 3NA8A 1YPFA 4FNRA 3BW4A 5LNUA 1AW5A 3W86A 4BI5A 5MHBA 2CU0A 3QYQA 3C2FA 2QUVA 1WX0A 3IEBA 3QSTA 3PUOA 3BG5A 2NV1A 1SR9A 5D2YA 3BK0A 2ATMA 5DLCA 4GE8A 2B7QA 2ZZ3A 1RD5A 3PY2A 1WBHA 5DELA 5HWNA 4JY8A 5HNRA 3PF3A 1QO5A 3W7NA 3SGZA 3WJWA 2Y6ZA 2W6RA 2YFNA 4FNQA 3HG3A 1R30A 3DFSA 1H51A 4O1AA 4PFMA 3CT7A 4AXKA 1PHQA 1ICQA 5AYZA 5KITA 3KOFA 4HNTA 4Z1CA 3LM7A 5LNSA 1FDJA 3TUUA 1XXXA 4Z1AA 3PS7A 4Z0SA 4GUJA 5KSWA 1WV2A 2JKAA 5I3KA 5C2XA 1HO1A 1H1ZA 3R8RA 1D3HA 1TPDA 4ORIA 3NPWA 3UXAA 5L6UA 3EWBX 2BTMA 1VRDA 4KFNA 1V7YA 2GPTA 4NJHA 2UV8G 3CC1A 2NUYA 2WV8A 1W5QA 3NR0A 3NQDA 1PHWA 4UFLA 1GYLA 3P8IA 2CZFA 1OFDA 3W7OA 4MPQA 1ME7A 4B5NA 2VELA 4TO8A 1QR7A 2J6XA 3DZ1A 1EWEA 4GBUA 3UZ5A 3A24A 4MLJA 1FCQA 2Y89A 1W5MA 4FX7A 2YFOA 1ZAHA 3C2VA 3W7PA 3F1QA 3LTYA 2QCNA 3FLUA 3A9IA 1B57A 4JXCA 3HPZA 4LC8A 2V5LA 5CPNA 1MEWA 4OHQA 1A53A 3DFNA 2D73A 4NJGA 1P5BA 1LLWA 3NM3A 3TC6A 1VQTA 2QCMA 4NXKA 3UPWA 1WOBA 2TRSA 3C0JA 4FNSA 5K4XA 4HSNA 3PBWA 1VR6A 4QISA 5AOUA 3L5MA 3QW4B 4K7VA 4FB7A 3JR2A 4O13A 1I45A 2E1DA 1WXJA 1LBLA 1Q3NA 1TJRA 1OG0A 3Q94A 2YYUA 4X22A 3W1UA 4ZQRA 4MZYA 3L68A 4X2RA 3DENA 3C2OA 3W71A 3W83A 2E6DA 2R14A 5E0KA 3L2IA 2R91A 2FJKA 5CZ0A 3P84A 2Z1BA 3FJ6A 2C3ZA 3EX4A 4KWVA 1LBMA 4ZMGA 2GVGA 4QNWA 1O95A 1MSSA 3BGGA 2QJHA 5ABTA 4RXGA 3G8EA 5F1VA 4QIUA 1GPWA 1WA3A 4I7VA 1DVJA 2H90A 1F2JA 2ZYFA 3LRLA 3QF0A 4M19A 3LCLA 3SJ3A 3RK8A 3O05A 4PODA 4AWTA 2CZDA 4KKXA 5HWMA 5K2ZA 1YXYA 2I14A 2ATSA 1A50A 2IQTA 1VCVA 3G0XA 4KWWA 3WK2A 1P0KA 4POCA 1G7VA 2H3BA 3U2OA 1KBIA 4GUFA 3Q37A 1EIXA 4MYAA 4CCCA 1GG0A 3N2MA 5HUPA 4YL2A 4KFOA 1A5SA 1U83A 3EX6A 1H5YA 5AYXA 1L2UA 3HGOA 3HQ1A 2V30A 2OZ0A 3DFOA 4U4MA 4MZ8A 5LZLA 3QMSA 1FUYA 4O8RA 2QDHA 1OFRA 4O57A 3L21A 1VHNA 3FOKA 3IIXA 4TMCA 1G4TA 4GXMA 1J2WA 3E0IA 3FEMA 1FDYA 1OK6A 2NLIA 3PBYA 4K37A 1KFKA 2V5BA 2FIQA 4OT7A 3EXTA 3M16A 5G2IA 1MEIA 4O10A 5HMSA 4IPIA 1P0NA 1EB3A 5KZEA 5I3HA 4NJJA 2VEKA 3LTPA 4LUIA 3UXDA 1OYBA 2NX9A 1LZOA 1JCYA 3SY5A 2NUXA 1IXOA 3W7EA 4FX8A 1IIHA 4A21A 4O14A 5TBOA 1ZNNA 5HR7A 4JTTA 1ZY9A 3DHFA 1LLZA 1GQNA 3QH2A 2VEPA 2NWRA 4K6AA 1OJXA 3SR7A 4FHAA 1ADOA 5T26A 2JK2A 3ABSA 1FCVA 1SO4A 1QCWA 1B4KA 4JNMA 3I6RA 3VI2A 2H8ZA 3F4WA 4O15A 2NV2A 5IM51 4IJBA 3VE7A 4DO5A 3NEVA 1TPC1 2CLLA 2J88A 3NL3A 3WJYA 3DI0A 3NL6A 2BXVA 5FI8A 3INPA 4JICA 1FWNA 1ZHAA 2C0AA 3EXSA 3GIYA 3M0ZA 2WSQA 2LLEA 3NQMA 4IGHA 3N9SA 2ABAA 2ZA2A 3N2XA 3N3MA 4O1CA 5G1TA 4ZZ9A 2ISWA 4XTIA 2GVLA 5HQEA 3G18A 2YYTA 5DBTA 3LCXA 4U28A 3MP4A 3T40A 5EL1A 1KTNA 3LBCA 4HPJA 3W70A 1Z48A 5E1QA 1KFEA 3W7DA 1KM3A 2DZSA 3TU9A 3NOEA 1FQ0A 4LWWA 2H8XA 1TV7A 1X1OA 2C6QA 4BR1A 4E0CA 3R89A 4UC5A 1U5JA 4HPXA 4FIRA 3WJSA 3W85A 8TIMA 4CNPA 3STCA 4UNLA 3UY8A 4MKNA 1PVNA 4TIMA 5K9CA 3NQ7A 1T8XA 1SW3A 3S1UA 3PUDA 1GVFA 4RZ5A 3OA3A 1WYIA 3THAA 3W07A 4EOUA 1FWTA 2AGKA 2ZZ4A 5J5DA 2ZDRA 4XTDA 2A85A 3KHJA 5AYYA 5DBUA 4HIBA 3NL5A 5L9FA 4YLWA 5CPLA 1K7FA 4E38A 3DFTA 1KV5A 4MIMA 3M6YA 3MYOA 4FXSA 3W23A 4K8EA 3S8HA 3NG3A 1TPWA 1VZWA 3NGJA 1TQXA 3L5LA 3TCEA 1O5KA 3C3NA 1W37A 3BG3A 2RFGA 3PBVA 4M6QA 4AH7A 3B05A 2HMCA 1F5ZA 3CM4A 2EGZA 3LHVA 4OGZA 4HN4A 7TIMA 3LTSA 3LCWA 4WY0F 1DJNA 1SW0A 2I1OA 4NUWA 4O12A 5I3IA 3L0GA 1I2NA 1OHLA 1TTQA 4I9AA 4NX0A 4MJZA 4O28A 4L4MA 1PIIA 3W2MA 4O50A 4O0ZA 2EHHA 1V5XA 4K36A 4RLIA 2RKXA 1YTKA 4O4VA 4O1DA 5EY5A 3UWVA 1GYNA 4WUIA 1AW2A 2YX0A 3FKRA 4NQ1A 4P2VA 3LRMA 2QAPA 1LM1A 4XBSA 1OFAA 2CZEA 4LRTA 3GDTA 4ML9A 1M5WA 1B9BA 3G0UA 3HPXA 1QOPA 3IVSA 4CQAA 2YR1A 1QPOA 3HF3A 1VGAA 3SZ8A 3CIWA 3W1TA 1G4PA 2FPVA 2DJXA 3NM1A 3ABQA 4RCXA 5G1YA 1ICSA 3LHUA 3PG9A 3LHZA 1XM3A 3WFAA 3PC0A 3KXQA 2DZXA 3P80A 1YTDA 4IPJA 3LCHA 1IXNA 5EKYA 2CLOA 1Z42A 1YPIA 1G4EA 1BKSA 1W8SA 4M6PA 3NNTA 1SUXA 5H91A 5TQLA 4JEQA 4PC8A 3DKJA 3S5NA 1UJPA 3W1NA 4JYFA 3W3OA 3FYPA 2P0OA 2Y70A 3CEUA 4ZQNA 3SW6A 5EPDA 2B7PA 3CTLA 3TSMA 3W1RA 2XN1A 1XDMA 3BVJA 3O07A 1BTMA 3O8AA 3OEXA 5LHFA 3LERA 4JDBA 2BWGA 5E93A 3MI3A 3HGSA 1FX6A 4JGDA 2E6YA 4UFHA 4O11A 3W7HA 2A5HA 4PL1A 3P7YA 4PL2A 4JIPA 1VLWA 1UCWA 3TSDA 4H6KA 4HNUA 5F2GA 3W75A 2RDUA 4FNUA 2ZFAA 3I68A 1AMKA 2VKZG 1PCWA 3BLEA 1GT8A 3EX3A 4UMAA 2QJGA 3IRDA 3W74A 5FEPA 1YADA 2V2DA 2V2HA 1QFEA 3NVTA 1ZAJA 1TV8A 2QCFA 1LYXA 1OFBA 4DF2A 3HMJG 1TB3A 4GFSA 3JS3A 2V81A 4JTHA 1OX4A 5D09A 4Z0JA 4IQLA 1W54A 2Y7FA 3W87A 2WNNA 1CX9A 4O54A 4MYXA 1IIGA 4UTHA 5BW6A 2NWSA 1QMLA 3TQVA 1GJPA 1JR1A 1RR2A 4S1FA 2OT1A 2QUUA 1H7RA 2DZWA 2VC6A 1KM2A 4QAIA 4DBDA 3OVRA 3G1DA 1TSIA 3L67A 5FF2A 3L65A 1FY6A 3HG4A 3QZEA 2AQWA 3ATYA 1EX5A 1EP2A 4BFAA 4N9CA 1H7PA 3QW3A 3GYEA 1XL9A 5FF7A 3EB2A 4IWWA 2ALDA 2ZZ5A 5BNKA 3MBDA 1W56A 5G4WA 2XFWA 4AF0A 1IF2A 2R8WA 5AHNA 3MO7A 3HG5A 2EF9A 1QO2A 2VFGA 5D2XA 1PE1A 2ZZ6A 4LV9A 5CSSA 4PCFA 1RQBA 4O19A 2A1YA 1LBFA 3TX9A 5LKYA 2X1UA 1F73A 3T78A 4UFKA 3PBUA 4MVAA 1JVNA 1UBSA 1DKWA 1LOSA 3MBFA 3E12A 2GOUA 3OVPA 5D37A 1EPXA 1L9WA 3AO0A 2YPIA 3C52A 5HWJA 5KMYA 3K30A 1JCMP 2FQIA 3BO9A 3OBKA 1VYPX 2Z6IA 3IIZA 3NZ1A 4S2CA 4UTTA 3GKAA 3THQA 3DAQA 4GWEA 1M6JA 2DU2A 4GJ1A 3MYPA 3HG2A 3QQ1A 2VENA 5G2HA 4R34A 1WQ5A 1UUOA 2EAWA 1F76A 4QSHA 1W3TA 1DORA 1T96A 3UD6A 4UXDA 1ZFJA 1JUKA 3E96A 3R5EA 5DCEA 2GQAA 1W3IA 4MFEA 1WDWA 2JGQA 2X30A 1K8ZA 1TQJA 4UTLA 3I7QA 2ZBTA 3C2EA 2ISVA 3WK0A 4ZQPA 3CWNA 4NJIA 1OK4A 3T44A 3B0PA 4MUZA 1A5CA 1TPB1 3D0CA 3LHWA 4LU0A 4I7UA 2DZUA 1M7OA 5J5RA 3N9RA 5F4XA 1RZMA 3TA6A 5LSMA 2WSYA 5D02A 3V1PA 3PUEA 3P5ZA 1KM0A 2NX3A 3TJLA 2B0MA 4X9SA 3G0SA 1J5TA 5CZSA 3M43A 1MO0A 3S1VA 4JTGA 5F1UA 5AHEA 3GNNA 1KTCA 2QF7A 1XCFA 4BWLC 3G1FA 1GVOA 3QMRA 3TMLA 3W22A 3NAVA 4LS2A 3W72A 2KZHA 3WJZA 5CG7A 3W1MA 3GDLA 3MP3A 5DCBA 2QCDA 3N19B 1R2SA 3PAJA 2GVJA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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