3UYQA

Hca 3
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
Knots found
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
AKEWGYASHNGPDHWHELFPNAKGENQSPIELHTKDIRHDPSLQPWSVSYDGGSAKTILNNGHTCRVVFDDTYDRSMLRGGPLPGPYRLRQFHLHWGSSDDHGSEHTVDGVKYAAELHLVHWNPKYNTFKEALKQRDGIAVIGIFLKIGHENGEFQIFLDALDKIKTKGKEAPFTKFDPSSLFPASRDYWTYQGSFTTPPCEECIVWLLLKEPMTVSSDQMAKLRSLLSSAENEPPVPLVSNWRPPQPINNRVVRASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 3
publication title Structural and kinetic analysis of proton shuttle residues in the active site of human carbonic anhydrase III.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 72
structure length 259
sequence length 259
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2011-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3uyqA00
2NNGA 4Q7PA 5JEGB 4WL4A 3DC3A 5EHEA 3M5EA 2POVA 1CCUA 1AM6A 4RUZA 3M2ZA 3V7XA 1G52A 4JS6A 1G6VA 1CRMA 5FNKA 3BL0A 4Q87A 5JEHB 3V2JA 3S73B 2NNSA 4Q6DA 5FDIA 4WUQA 3CYUA 1TTMA 1XPZA 5EOIA 3ZNCA 5SZ1A 1TG9A 4M2WA 5DSLA 4L5VA 1FSQA 1KOQA 1KWRA 3MNUA 5DSNA 4YWPA 1CNIA 2NXSA 1H9NA 2Q38A 4FU5A 3P55A 4YXOA 5FLRA 5FNLA 1FR4A 3RG3A 4YGLA 4QJOA 2WEOA 1DMXA 1HECA 4XIXA 3M14A 1G48A 4Q7WA 2NWPA 3M2YA 1CAOA 1RZBA 4XIWA 3CZVA 5J8ZA 3RJ7A 2CBDA 4HEZA 3DCSA 1CAKA 3DVDA 5FLOA 1FQRA 1CILA 4Q0LA 3N3JA 1I90A 3T84A 3N0NA 3RZ0B 3SBHA 2NXTA 1Z93A 2NWOA 1ZSCA 1ZSAA 3L14A 1CZMA 1MUAA 3DVCA 1G53A 3KONA 1ZH9A 2FMGA 1CIMA 4RH2A 2GD8A 1UGDA 3HKNA 3N4BA 4Q78A 3M1JA 3Q31A 4ITOA 4YX4A 3M1KA 4RIVA 3M1QA 2QP6A 3DA2A 4KAPA 2ILIA 4QJWA 4HBAA 4TWLA 4MDGA 1TH9A 5E2RA 1YO2A 4FVOA 2X7SA 5L6KA 1F2WA 1CVDA 3MNKA 4Q83A 2NWZA 1HCBA 1MOOA 4YGKA 4CQ0A 3U7CA 1IF5A 1CALA 3N2PA 4G7AA 5EHWA 3S9TA 4Y0JA 3T82A 1XQ0A 4L5UA 4MLTA 5CA2A 3T5ZA 1G3ZA 5JQTA 5EKJA 4K0SA 2HD6A 4C3TA 3NI5A 4Q7VA 3MNAA 5E2MA 1CAYA 3MHOA 4KUWA 3JXFA 4E3GA 5EH7A 1BN1A 2FW4A 1YO1A 5FNMA 1I9MA 2NNOA 4HEYA 1V9IC 5DSMA 5DSIA 3F8EA 5EHVA 1DCAA 4TWMA 5SZ6A 3V3HB 5DSOA 5JGTB 1BV3A 5DSRA 1BNTA 3DAZA 4FRCA 5BNLA 1DMYA 1CNJA 2FNMA 3D93A 3P5LA 5JQ0A 4K13A 4FL7A 1RAZA 2ZNCA 3D92A 4E5QA 1FQNA 4ZX1A 1Y7WA 1OKLA 1UGBA 1G45A 4HT0A 3U3AX 5AMGA 5JESB 4M2VA 4WW8A 4MLXA 4MDMA 2IT4A 4PQ7A 5SZ3A 3F7UA 4YYTA 3IEOA 3OKUA 5SZ5A 9CA2A 3S72B 3DCWA 3MMFA 4FVNA 1HVAA 4CNWA 5EH8A 1CINA 3S76A 3V3GB 1XEGA 3DD0A 4HF3A 3QYKA 1BNNA 1RZCA 5LMDA 3V2MA 1IF8A 2OSFA 2QO8A 3DV7A 4L5WA 3SAXA 1ZFQA 1TEQX 3ML5A 5SZ7A 1LG6A 3JXHC 3OYQA 5C8IA 2HFWA 1ZFKA 4QK2A 4IWZA 1RJ6A 3KLDB 5BRUA 3M3XA 5FLPA 1CVCA 1FSNA 2NN7A 3MHMA 3W6IA 4DZ9A 1HCAA 4KNJA 4IDRX 3S74B 5SZ0A 5HPJA 3K2FA 1UGGA 2NN1A 3M67A 4K0TA 3TVNX 3RYYA 3BL1A 3F7BA 3NJ9A 4MDLA 3HKTA 5EZTX 2VVBX 4XFWA 1Z9YA 4Z0QA 3R17B 3S75B 1LG5A 3K34A 4MTYA 1CRAA 4FPTA 4QJ0A 1HEBA 4QSJA 3P4VA 2WEJA 1RJ5A 3D8WA 4YXIA 1BN3A 3MHCA 2EU2A 3KIGA 4HT2A 3P5AA 4ZWXA 4RUYA 3IBLA 5DVXA 1BNUA 1RAYA 4CNXA 4DZ7A 4Q06A 5IPZA 1BNQA 2CBCA 3KOIA 4LHIA 4M2RA 3KNEA 3S71B 1HEDA 2AW1A 4JSZA 3JXGA 1IF4A 4Q09A 4QK3A 1CNGA 4E4AA 2X7TA 4ZWZA 2HNCA 3U47A 1YDCA 5DOHA 1TEUX 5EIJA 5DSQA 5G0CA 4R59A 2WD3A 4YHAA 1UGAA 2FNNA 2Q1BA 4QSBA 4KP5A 4QJMA 3TVOX 1G0EA 2NMXA 3RLDA 3S97A 2CABA 4QJXA 5JDVB 1CNCA 3UYQA 2F14A 4QIYA 5AMDA 5E2SA 2WEHA 4CNRA 1UGCA 5FL5A 3RYJB 4HEWA 4ZWYA 4Q90A 5EKMA 3F4XA 2CBAA 4ETQC 3ZP9A 4JSAA 3RYVB 1FR7A 4UOVA 1CVHA 3S8XA 3HKUA 4BCWA 5JG3B 1AVNA 3LXEA 3RZ5A 4YGNA 1ZE8A 3OILA 4Q99A 1H9QA 1DCBA 1JV0A 3HLJA 3P44A 2H15A 2FOUA 1ZNCA 1CNWA 4ZAOA 5SZ4A 4FIKA 1JD0A 2FNKA 4LU3A 4QSIA 4Q8YA 4CACA 1CAMA 2H4NA 2WEGA 1CAHA 3B1BA 1FLJA 1CVBA 8CA2A 3B4FA 1Z97A 4X5SA 1BZMA 1G1DA 3M2NA 3KKXA 2FMZA 1BNVA 4CNVA 1CANA 1ZGFA 5E5RA 1CAJA 1RZEA 4QIZA 3DBUA 1CNBA 4QSAA 4WW6A 7CA2A 1I9LA 5E5UA 3FW3A 4KP8A 4PXXA 2X7UA 4XE1A 1H4NA 1OQ5A 5DSPA 1ZSBA 3V3FA 3FE4A 4QEFA 5FLQA 3KWAA 2FOYA 2NXRA 4Q81A 1G0FA 4BF6A 1LZVA 5DOGA 1HEAA 3BETA 4ITPA 3KOKA 2WD2A 3CAJA 3CA2A 4HU1A 1I8ZA 3M98A 3DC9A 3OY0A 2FOQA 1OKMA 1FSRA 3RYZA 4KUYA 3PYKA 3IBUA 4QTLA 2HKKA 4Q7SA 4JSSA 1IF7A 3FFPX 4Q07A 3DCCA 3U45X 3KS3A 4E49A 2POUA 3M1WA 1CNXA 3NB5A 4PZHA 2EZ7A 3DVBA 3D9ZA 5AMLA 3DD8A 5JGSB 4WUPA 1URTA 4RFDA 4Q8XA 5DRSA 1CCTA 2Q1QA 4Q6EA 4RN4A 3T85A 2AX2A 4ILXA 4R5AA 4COQA 1CVEA 3MZCA 1BICA 12CAA 4E9OX 1CNHA 5JG5B 1I9PA 4N0XB 3EFTA 3C7PA 5FNJA 1T9NA 1XEVA 4JSWA 5BRVA 1G54A 3IBIA 1CAIA 2CA2A 1I9QA 3M04A 5FNIA 3RZ8A 3OIMA 2O4ZA 4KV0A 1G4JA 2HL4A 3M40A 3SBIA 3MNIA 1BN4A 3D0NA 3T5UA 3PJJA 2GEHA 3HKQA 3OYSA 3M96A 3IGPA 5BYIA 3W6HA 4CA2A 3RZ7A 3OKVA 3MNJA 2CBEA 4MO8A 4YVYA 1EOUA 4E3HA 5FLTA 1CVAA 1RZDA 1FQLA 4RIUA 3K7KA 4YGJA 4QJPA 5DSKA 1TB0X 4K0ZA 1OKNA 3GZ0A 3TMJA 1CAZA 4YXUA 3V5GA 5FDCA 4BF1A 5G0BA 4KUVA 3P3JA 4N16A 4Z1JA 5E2NA 3T83A 1BCDA 4ZX0A 4E3DA 1CNYA 4KNNA 5EH5A 1CVFA 4WR7A 1V9EA 3MWOA 4K1QA 1LGDA 1UGEA 4PYXA 5A25A 3S78B 3RGEA 2HOCA 2POWA 3ML2A 4KNIA 2ABEA 3RG4A 2QOAA 4Z1KA 5CJFA 4QK1A 3S77B 4M2UA 6CA2A 5FL4A 4KNMA 1YDDA 3RZ1B 5CACA 2FOVA 4QY3A 4Q8ZA 2EU3A 1IF9A 3PO6A 5DSJA 2NNVA 4YGFA 4PYYA 3MNHA 3RYXB 1LUGA 4RFCA 3P3HA 1BNMA 1UGFA 1CA2A 1KEQA 4Q08A 2FOSA 5FNHA 1G4OA 1J9WA 1CCSA 5G03A 4E3FA 3V3IB 1YDAA 1TE3X 1G46A 4G0CA 3UYNA 1THKA 3MHIA 5E28A 4Q49A 4Q9YA 2VVAX 5SZ2A 1KOPA 1YO0A 1HUHA 1I9NA 5CLUA 1I91A 1YDBA 3EFIA 3R16A 5EKHA 4Z1EA 2CBBA 3P58A 5FLSA 5L3OA 4ZWIA 3OIKA 4XZ5A 1I9OA 3HS4A 3V3JA 1HUGA 4LP6A 1TG3A 1CA3A 1CNKA 3M2XA 1FQMA 2NWYA 2OSMA 3MHLA 5FL6A 1KWQA 1JCZA 1TBTX 4RUXA 5JEPB 4GL1X 5BRWA 3IAIA 2W2JA 3M5SA 3HFPA 4R5BA 3MDZA 1BNWA 5FNGA 3VBDA 3SAPA 1IF6A 1ZGEA 5G01A 1AZMA 3MYQA 5E2KA 4Z1NA 1A42A 3M5TA 5A6HA 3IBNA 1RZAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2NNG A;  4Q7P A;  5JEG B;  4WL4 A;  3DC3 A;  5EHE A;  3M5E A;  2POV A;  1CCU A;  1AM6 A;  4RUZ A;  3M2Z A;  3V7X A;  1G52 A;  4JS6 A;  1G6V A;  1CRM A;  5FNK A;  3BL0 A;  4Q87 A;  5JEH B;  3V2J A;  3S73 B;  2NNS A;  4Q6D A;  5FDI A;  4WUQ A;  3CYU A;  1TTM A;  1XPZ A;  5EOI A;  3ZNC A;  5SZ1 A;  1TG9 A;  4M2W A;  5DSL A;  4L5V A;  1FSQ A;  1KOQ A;  1KWR A;  3MNU A;  5DSN A;  4YWP A;  1CNI A;  2NXS A;  1H9N A;  2Q38 A;  4FU5 A;  3P55 A;  4YXO A;  5FLR A;  5FNL A;  1FR4 A;  3RG3 A;  4YGL A;  4QJO A;  2WEO A;  1DMX A;  1HEC A;  4XIX A;  3M14 A;  1G48 A;  4Q7W A;  2NWP A;  3M2Y A;  1CAO A;  1RZB A;  4XIW A;  3CZV A;  5J8Z A;  3RJ7 A;  2CBD A;  4HEZ A;  3DCS A;  1CAK A;  3DVD A;  5FLO A;  1FQR A;  1CIL A;  4Q0L A;  3N3J A;  1I90 A;  3T84 A;  3N0N A;  3RZ0 B;  3SBH A;  2NXT A;  1Z93 A;  2NWO A;  1ZSC A;  1ZSA A;  3L14 A;  1CZM A;  1MUA A;  3DVC A;  1G53 A;  3KON A;  1ZH9 A;  2FMG A;  1CIM A;  4RH2 A;  2GD8 A;  1UGD A;  3HKN A;  3N4B A;  4Q78 A;  3M1J A;  3Q31 A;  4ITO A;  4YX4 A;  3M1K A;  4RIV A; 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