3V0AB

2.7 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 377
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
377
sequence length
1194
structure length
1150
Chain Sequence
MNINDNLSINSPVDNKNVVVVRARKTDTVFKAFKVAPNIWVAPERYYGESLSIDEEYKVDGGIYDSNFLSQDSEKDKFLQAIITLLKRINSTNAGEKLLSLISTAIPFPYGYIGYRETNYLSSEDNKSFYASNIVIFGPGANIVENNTVFYKKEDAENGMGTMTEIWFQPFLTYKYDEFYIDPAIELIKCLIKSLYFLYGIKPSDDLVIPYRLRSELENIEYSQLNIVDLLVSGGIDPKFINTDPYWFTDNYFSNAKKVFEDHRNIYETEIEGNNAIGNDIKLRLKQKFRININDIWELNLNYFSKEFSIMMPDRFNNALKHFYRKQYYKIDYPENYSINGFVNGQINAQLSLSDRNQDIINKPEEIINLLNGNNVSLMRSNIYGDGLKSTVDDFYSNYKIPYNRADSSLDNVNIGVIDNIPEIIDVNPYKENCDKFSPVQKITSTREINTNIPWPINYLQAQNTNNEKFSLSSDFVEVVSSKDKSLVYSFLSNVMFYLDSIKDNSPIDTDKKYYLWLREIFRNYSFDITATQEINTNCGINKVVTWFGKALNILNTSDSFVEEFQNLGAISLINKKENLSMPIIESYEIPNDMLGLPLNDLNEKLFNIYSKNTAYFKKIYYNFLDQWWTQYYSQYFDLICMAKRSVLAQETLIKRIIQKKLSYLIGNSNISSDNLALMNLTTTNTLRDISNESQIAMNNVDSFLNNAAICVFESNIYPKFISFMEQCINNINIKTKEFIQKCTNINEDEKLQLINQNVFNSLDFEFLNIQNMKSLFSSETALLIKEETWPYELVLYAFKEPGNNVIGDASGKNTSIEYSKDIGLVYGINSDALYLNGSNQSISFSNDFFENGLTNSFSIYFWLRNLGKDTIKSKLIGSKEDNCGWEIYFQDTGLVFNMIDSNGNEKNIYLSDVSNNSWHYITISVDRLKEQLLIFIDDNLVANESIKEILNIYSSNIISLLSENNPSYIEGLTILNKPTTSQEVLSNYFEVLNNSYIRDSNEERLEYNKTYQLYNYVFSDKPICEVKQNNNIYLTINNTNNLNLQASKFKLLSINPNKQYVQKLDEVIISVLDNMEKYIDISEDNRLQLIDNKNNAKKMIISNDIFISNCLTLSYNGKYICLSMKDENHNWMICNNDMSKYLYLWSFKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
molecule keywords BoNT/A
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 377
structure length 1150
sequence length 1194
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
B PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
B PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0aB02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0aB03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0aB04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0aB01
2VUAA 5DZGA 1LGBA 1ISVA 3AP7A 1PZ8A 4ZJXA 4QO3A 4Y22B 5BXTA 4FPKA 3DDBA 1RZOB 4MYEA 3D5OA 2ISEA 1FGAA 1DQ4A 2C9AA 1VIWB 2DVGA 3QW6A 2GO2A 2D6PA 2VXRA 5F8WA 1JLXA 3WCSA 4YFZA 3NJ5A 3MPPG 4FP2A 1MD6A 1AF9A 3H6QA 3N7KA 2GMPA 5IK4A 1SR4A 2BEAA 1VAVA 3NV4A 3IAGC 1CONA 4FP3A 3FJIA 5GLTA 1DZDA 5FRAA 3Q7XA 2F2FA 1DYKA 1DQ6A 5D62A 1F82A 1J0SA 3AJZA 3PG0A 2JKBA 4XJWA 4IY8A 3BRGC 4X38A 3GALA 5E24E 4XTMA 4X3AA 3BRFA 1W6PA 4HEVA 3O4CA 4Y1UA 3V65A 2DUPA 2VH9A 1SBEA 1S0DA 4L8QA 5DUUA 1HWMB 5GZDA 3AFKA 1BYHA 2A97A 3VKMA 1BLAA 3UD8A 2NVHA 2YY1A 4XFTA 2FHRA 2DTYA 1WCSA 2NMOA 1JQZA 2W52A 3GNEA 2WKKA 3ZX7A 5FZZA 1DLLA 2XB6C 3FJKA 1HKDA 3WDTA 2WRYA 5FZYA 4I6IA 2D6LX 1FV2A 3RMXA 3VKFC 2D6MA 3IN9A 1GZWA 1AXYA 2ISHA 1S1AA 1HCEA 4Y20A 3UJ4A 1K5VA 4ZFUB 3EF2A 3UD7A 2A6VA 4QKRA 1UZYA 3JU9A 1LHOA 1A3KA 1HQLA 3ZXLA 5T50A 3TB0A 1V6OA 3B9CA 4XDQA 3S8KA 2DUOA 4YZ1A 1UPSA 3NBDA 1UL9A 4KUFA 3FJJA 4ATFA 2W68A 4BLJA 4BMBA 1VCLA 2R1DA 3IMNA 2A5ZA 5JDBA 1MS9A 2UWCA 4PBOA 4XJAA 1KDKA 21BIA 1T4QA 1ONAA 3UL2A 2EIGA 5GJ6A 3IPVA 3O44A 4LBNA 4UW4A 4LBJA 4I2SA 4ZFYB 3AZZA 3PMEA 2DVAA 4WVWA 4P0KA 3POKA 1Z2VA 3UD9A 4AGVA 3WA1A 3FJAA 4EFQA 1YO8A 2XG3A 2EXKA 4PBPA 4M3CF 1BXHA 1LHUA 4XJ9A 2MLLB 1IS3A 2WQZC 3CA5A 3AYDA 3ZC8A 5GLWA 3USUA 4P9WA 4OEGA 2D7IA 2ZGLA 4BMEA 3BADA 3KM5A 5EWSA 2Y9GA 2W2DB 2E51A 3CNAA 3SLIA 2R49A 1DZCA 2E4MC 5HCAA 3D3XA 3V0AB 1A78A 3QW8A 4LO7B 3WMUA 4BM8A 4HL0A 2DRYA 1WW6A 1UN1A 1V6WA 3OYWB 4M3CE 3MEPA 2K4AB 4XKIA 3O0VA 5GZFA 1LU1A 2FMDA 3WHUA 1MS4A 1RITA 1AXZA 5BQNA 3BAOA 3AP5A 1LOAA 2EF6A 4Q8KA 1BASA 2Q9XA 4H9WA 1I1EA 3ATGA 2R0HA 3WG4A 3FJDA 3TAYA 3I29B 4YG0A 2D44A 1LODA 3A21A 4Q9GA 3ZVXA 3AYAA 2D3RA 4QALA 1Q1UA 3FUQA 3QIYA 2D24A 2CL2A 3RQ0A 2G7NA 1JN2P 1JLYA 3S8JA 1IKPA 3OYWA 2ZHMA 2EALA 4FPCA 1ISYA 8I1BA 2PHFA 4UW6A 5CNAA 2D6KA 4I0YA 1PWAA 5SV8A 2G4IA 2GDFA 3UDAA 1LU2A 2RHPA 1L2HA 2A3YA 2WT2A 5KXBA 3IM7A 2GMEA 1V6UA 4I4RA 1BFGA 2AUYA 1IJTA 1SLBA 2ZGNA 1W6MB 4TLPA 4U2AA 3SH5A 1YI7A 4YGDA 3O4AA 4BOWA 4Q27A 1CQ9A 3HR9A 1EYLA 1FWVA 1WUVA 3O3QA 3AZWA 2MIBA 3T2TA 4X37A 3O0XA 5D61A 1S0EA 4NOTA 3LLPA 4ISRA 1BARA 3WMVA 1IOAA 1MS8A 3MALA 1X50A 2A6WA 3VSFA 1WBCA 1FQ9A 4ZLBB 2ZGPA 5AVAA 3O12A 1PZZA 1XTGA 2AFGA 4AVTA 3C8AA 3BA5A 1HCDA 2FFVA 2ET2A 1ENSA 4OZXA 4AN6A 3HALA 3C9ZA 4LO0A 3WCRA 4Q1PA 3N35A 2KLLA 4YZ5A 3IKWA 1F31A 2VW0A 2WSUA 2UU8A 1TIEA 4KTXA 2K8RA 5T5LA 2X2TA 3UJOA 5FNXA 3WINC 3W9TA 2CWMA 4K1YA 3ZUSA 2GALA 5FZUA 4CRQA 2ZACA 1QOTA 2R0FA 4W65A 4LBQD 1AXMA 1Z7HA 4DQAA 4GKXA 5BXSA 3JUUA 1GKBA 3VT2A 3K3QB 1DFCA 3POYA 4R9BA 4FPYA 1E1HA 1FWUA 3AXEA 1DHKB 4I37A 1FX5A 1FYUA 2GN3A 2CTVA 1GYKA 2KM2A 4YLZA 3QLQA 1WLCA 1T3AA 1HDKA 5JOWA 4EL4A 3N3HA 2D3SA 5T5OA 5DG2A 1FAYA 2BFHA 4KS6A 3WO4A 1N1TA 3OY8A 3CA0A 1BA7A 3A0KA 1KJRA 3ZXEA 5CB7A 1MZ6A 1TWEA 3RTJB 2RQ9A 2AH2A 2DYCA 4YW2A 1XYFA 1PZ7A 4YW4A 2R1BA 2XHLB 2K43A 3WV6A 3AKFA 4ZFWB 1MC9A 2QN4A 2ZMKA 2IMCA 1BFFA 1W6QB 2ZA9A 1TOOA 5KXDA 3FGMA 5IK5A 1H9PA 5L73A 4IONA 3H6RA 2SLIA 1JXNA 5IK7A 2KH2A 3FUOA 2JE9A 3WINA 2IHOA 3H0OA 2KI6B 1W6NA 2OUHA 2ZMLA 2XHLA 3M2MA 2Q3NB 1LEDA 4XHXA 4H04A 1II4A 2B7YA 5JLVA 3AP9A 2ARXA 4YW3A 1CVSA 1G9BA 3WDYA 2D20A 1V6XA 4FOVA 3OBTA 4RL7A 3WOGA 3N36A 4XYXA 4G9NA 5CBLA 1G82A 3AH2A 1BKZA 5E8AA 1V6JA 2ZHKA 3M3CA 2GNTA 1VALA 4JRAA 1G9FA 1AFCA 1DQOA 2GNDA 3QJ0A 4OEEA 1S0BA 5HCFA 3D6EA 1IS4A 1SACA 1HLCA 3BAUA 4WZFA 5KXCA 3C8BA 4K20A 2CWSA 3IM0A 1SCSA 1QNWA 4IYBA 3FIEA 4XFSA 5GZCA 3BOPA 1IRAX 1GBGA 3SNVA 1SBDA 1W6PB 2R16A 4DFSA 2DWRA 1OQ1A 4I4VA 1EPWA 2Y9WC 1LGCA 1QGLA 1ZM1A 3F1RA 4FPEA 2P34A 3BB2A 3MW2A 3FJ8A 2IMBA 4G6JA 1JT7A 2AXMA 3ZXGA 1APNA 2D6OX 4Y24A 4XBLA 3T1MA 4XMAA 4IHZA 2UWAA 1JT5A 2NM1A 1AVUA 3RMYA 3ILFA 1LOFA 1SFYA 4QD2B 1FMMS 3B00A 4EB2B 1S0JA 3LSDA 2RSTA 1CIWA 4LO1A 2JJ6A 1IS6A 3W58A 5F9TA 2DVBA 3AKHA 5JOYA 1F9KA 4WV8A 3A07A 4LO2C 1RMLA 1GZWB 1WBFA 2G7PA 1D0HA 1QDOA 1R1ZA 4Y20B 4OWJA 2E7QA 2ZHNA 3AP6A 1S0GA 4OEFA 5B2HA 1UZZA 1C57A 3PVOA 2DUQA 1TWMA 4KBBA 5DVHA 2GN7A 2DURA 5LK5A 3OJBA 1MR5A 5BVPI 1SLLA 5KXEA 3QW7A 4XXPA 1MZ5A 4X39A 4DRRA 3LSEA 2WLQA 1C4RA 4ZKTB 2A8AA 1GZCA 2FFUA 4A7YA 3BONA 1AJOA 3IPVB 4GP0A 4QC4A 1XTFA 4I1EA 4AGRA 5BOWA 2AR6A 2ZGUA 5DUXA 4IZXA 1FATA 3BAHA 4DRVA 3NBCA 2DVDA 3NV1A 2D23A 4D8HA 5G00A 4ZGRB 4XHBA 4U36A 1SLCA 4XJUA 4BQ1A 3VT0A 4A7KA 4G9MA 3V79C 3USUB 3ZXKA 4FGFA 1HKNA 1G9DA 1DIWA 3DGTA 2JDZA 1ZKWA 1U0AA 4XBQA 1MS5A 3Q9OA 2VSEA 1SLIA 1N4KA 3O4BA 3R4SA 4JAWA 4I4PA 2ZGKA 3I4IA 3ENRA 4SLIA 4LO7C 3WO2A 3D7WB 2XOAA 1GICA 2Y9XE 2ZHLA 1QQKA 2DU0A 1RIRA 2YMZA 4YFWA 1WW4A 1RY7A 2D43A 2P3KA 1TEIA 4Y1ZA 4M00A 1R8NA 4FPOB 3AX4A 1LCLA 2GNMA 3BOOA 2WNEA 4M3CA 4QBCA 3M3OA 3ZURA 3WNXA 3Q7YA 1S0FA 1JYCA 3FJFA 3O4DA 3O0WA 1ITBA 3WG2A 1ENQA 4YGBA 2P39A 1ISXA 1O4ZA 1LTEA 1UX6A 5JOXA 4Q1RA 3DS9A 3KQRA 2QYIB 4GAIA 4XXAA 2PELA 2ZGSA 1N3OA 2ZBJA 5CAZA 4LBLA 3BA4A 3M1HA 2D7RA 2YROA 3NBEA 4ITCA 1WLDA 3JUTA 1S0IA 1JT3A 4JKXB 1V6NA 1LHWA 1BFBA 2I1BA 1CESA 3POSA 3H6SE 1DBNA 1YYNA 1AX0A 2P2KA 4LBOA 1CPMA 2DRZA 3APBA 4FPJA 2Z49A 4ELCA 2CY6A 4G6MA 3VSZA 4PCRA 4LO3C 2DV9A 5T52A 1LHNA 1YRZA 2GZBA 2PHTA 5JOZA 1JY0A 3QW5A 1W0PA 2A6XA 3PVNA 1PC8B 4IQPA 5BQMA 4UW3A 1W3AA 4QKSA 1Q8PA 1AX2A 1G9AA 3MW3A 3WLUA 3OJMA 5T5JA 3QR5A 4C1WA 9ILBA 4Z8SB 2ERMA 2P3IA 7I1BA 2ES3A 3QCWA 4CTEA 1DQ5A 1URXA 3VV1A 1I1BA 3P6IA 3BAGA 2E4MA 3AH4A 1VAMA 4K1ZA 1G9CA 3IM5A 4OWLA 3OPZA 2ETFA 2D22A 3WZ1A 5T54A 3F62B 3D4KA 1H30A 5IUQA 6I1BA 2NP0A 1KDMA 3AYCA 3N7JA 4Z9WB 4YG3A 2VXTI 1AVWB 1CE7B 3NV3A 2ILPA 3VUOA 1LOBA 3AJ6A 4D69A 3K1XA 4LBQA 1ZB7A 4G1RA 4ISQA 1NUNA 1Z4SA 4KEJA 4XBNA 3FLRA 5DUWA 4FOWA 2A70A 3ZUQA 1A8DA 1AXKA 2JECA 4R9CA 1AX1A 3AKGA 1ENRA 5FNWA 1V6KA 1QNYA 4GOVA 5E89A 3HOMA 3OY8B 3WUCA 3N0KA 4DPNA 2AYHA 3M3EA 4LO3A 1ULCA 2WSVA 1DQ2A 3QIXA 1QU0A 4YW1A 3WO3A 3INAA 4AWDA 3HMYA 3UJ0A 4J1LA 5BXRA 3CRIA 1NZKA 3ZSLA 2C5DA 5GALA 1W0OA 5H9SA 5BQUC 1DGLA 1DZQA 3A0NA 4I4QA 1QQLA 1YIFA 3FJEA 4Q8LA 1LECA 3CA4A 3OBRA 4GALA 3CA6A 2V73A 2OW4A 5DZEA 3U4XA 3CA1A 3H6RB 2WJSA 4I96A 1MS0A 1WBLA 1EV2A 1KRIA 2GNBA 1JHNA 5GLUA 2A3XA 5DSSB 1LOEA 1W6NB 4I4OA 5T5PA 1YVGA 4M01A 3NF3A 1GSLA 1IILA 3PHZA 4AGGA 5BXPA 4J2SA 3FJBA 1HIBA 2EXIA 3ZSJA 2WBCA 4LO8B 1FV3A 3AKIA 2EXHA 3BAQA 1GANA 3CA3A 1FMZA 4D0ZA 1V6VA 1T9FA 2VLCA 4GAFA 3FIIA 3VKNA 1FNZA 3POWA 3ZYRA 1C1LA 3ILRA 1ZA4A 4Q9PA 2QN0A 2ZGMA 3AZVA 1HWPB 3BWIA 2D6NA 3IM6A 5HPZA 1ISWA 4Y1VA 2AENA 3SNMA 2EAKA 2F2FC 3LTQA 2PHUA 4JP0A 3WG1A 5E88A 1PZ9A 2VSAA 2AGSA 5I1BA 3BTAA 1Q56A 1BQPA 1BZWA 4EJ5A 3V0BA 2TEPA 3FLTA 3VKLA 5BQUA 4I4SA 2Z48A 3A23A 4GP3A 2HWAA 3O49A 2BQPA 2ESUA 1Q04A 1M16A 3FLPA 1KQRA 3WDUA 4ZA3B 2FGFA 1QOOA 3RS6A 3WDWA 2ERFA 1KJLA 2AQZA 3W59A 5CA6A 2ZR1B 3R05A 4PQ9A 3B3QE 1V00A 1IRPA 5IT6A 2NZ9A 4JPZA 1FNYA 3HSMA 1HWNB 1M2TB 4QBVA 3R4UA 2NYYA 4XIOA 3PVEA 3A22A 1SLAA 1DQ0A 4YZ3A 1UMZA 1B09A 3BAVA 1T3CA 1DFQA 1LHVA 3AJ5A 5GM0A 4YM1A 1S0LA 1ILR1 2LALA 4TZDA 4QD2C 4L4HA 1ISZA 4HJJA 4RA0A 1QKQA 1SBFA 3HN1A 4F34A 4USOA 1W6OA 2YV8A 3B01A 1N47A 1Y7BA 2M49A 3LCPA 3WDVA 3DSEA 4J2YA 5GLZA 5DUVA 4XTPA 2D7FA 3WHTA 1ZKXA 1O4YA 2CNAA 2ARBA 1OKQA 2YXSA 1WD4A 2DU1A 1FN0A 2HYKA 3A4UA 5EXOA 2G7QA 1ONKB 1ULGA 5DUYA 3ZPYA 4OWKA 5DXDA 4Y22A 2Z42A 4YZ4A 2WT1A 4IZEA 3M3QA 2A6YA 2JD4A 4JC1A 3RRDA 3RG0A 3VWCA 3AP4A 4Y26A 3BIWE 3ILNA 2OUJA 1F5FA 1R8OA 4YGEA 3BRDA 1JTCA 4PC4A 1QDCA 2E53A 4FVVA 4P0JA 3SH4A 31BIA 1IT0A 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