3V0BA

3.9 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 409
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
409
sequence length
1295
structure length
1280
Chain Sequence
MPFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNAGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHQLIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNAKTFLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRGILNDLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEAAEENISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSTTDKIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGAKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
molecule keywords BoNT/A
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 409
structure length 1280
sequence length 1295
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-12-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0bA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0bA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0bA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0bA01
3QLQA 3D7WB 3BTAA 2R9KB 3FJKA 1A3KA 1HIBA 1ULGA 2EXKA 2CTVA 2AXMA 4DENA 2ZQOA 3WUDA 2P34A 3JUUA 3ZXJA 4EFPA 1XG6A 5GAQA 1LHWA 4AVTA 3AJZA 4KBBA 4Q91A 3ATGA 1RZOB 1N3OA 1WLDA 4I30A 4ZA3B 3B9CA 3ZXLA 1APNA 1WW7A 3AZWA 4X39A 3JUTA 3WMUA 5GLVA 5IK5A 2AGSA 1LOEA 1ISVA 2K4AB 3WUCA 1CVSA 3S8KA 4QKRA 2ILPA 2YY1A 4ZFUB 1ZN3A 1VLNA 3SITA 2Y9XE 3M2MA 2AREA 4HR6C 3SNVA 8I1BA 4Q9GA 1G82A 3P6JA 4XJAA 4GA9A 3E8LC 1G86A 4ZJXA 1Q03A 1AX1A 4Q27A 1W3FA 4XKIA 1S0JA 3UD7A 5JOXA 4AGGA 4LO1C 3EF2A 3WMVA 3NJ5A 4YW4A 4Z8BA 4M3CA 1F82A 4I3NA 5DZFA 2MC2A 1LULA 4I6IA 4ZGRB 2ISEA 1XHBA 4I0YA 1K5UA 3VSFA 1LECA 1JT5A 2JECA 4IZEA 1HLCA 2OUJA 3IIRA 1QNYA 5JDBA 1PZ7A 2E6VA 4TYSA 2ARBA 4YZ4A 4OW4A 3ILAA 2G7QA 4XFUA 3ZSLA 1V6KA 3SH3A 2MIBA 2EF6A 2R1BA 4M3CB 1CPMA 2PHTA 4XTMA 5DVHA 1V6OA 3Q9OA 3IAGC 3O4BA 2BFHA 1AXZA 1W6NA 4D0ZA 2OUHA 3AP7A 4FPFA 4IY9A 3FJ8A 3T2TA 2DU0A 1SBFA 4GKYA 3QYDA 1EVTA 1ISYA 2FO1A 3OJMA 3WG3A 4YW2A 2Z48A 1SR4A 3AKGA 1GANA 2CWSA 1BFFA 5GZEA 3AYCA 2PHFA 4F83A 2AQZA 1CIWA 2IMAA 4YM2A 4QBCA 2ZHMA 5GALA 1W6NB 4TZDA 2GMMA 3AKFA 1VCLA 1T4QA 3V0BA 4YZ1A 3OYWA 1LHNA 2DVAA 3A07A 3N7KA 4WBCA 3UK9A 4ZBVB 1DZDA 5D62A 3OY8A 3FJCA 5JMCA 4K20A 1ENSA 4UW3A 2D22A 1JLYA 5HPZA 1YF8B 2P23A 1O4ZA 3AZZA 3P6IA 2VLCA 3NBCA 2GNBA 3NV2A 1BASA 1TEIA 4SLIA 1YO8A 4D8HA 1JQZA 2P3JA 3V0BB 3OYWB 3H0OA 4W65A 3DS9A 1BJQA 3RMXA 3INAA 2D20A 3UJOA 2YZ4A 1BFCA 2J3PA 1SLBA 3QW5A 1U0AA 4XHXA 2ZHNA 1GLHA 3T8SA 1Z0HA 4FPCA 4XJ8A 4ZXKA 3O12A 3ZXKA 5BQUC 2KKIA 2W2DA 3IM0A 1FNYA 2V73A 4DPNA 3C88A 3A22A 5DUXA 2FFUA 2DWRA 3AZYA 3IMNA 3OPZA 4FPGA 2D3PA 2R49A 4WZFA 2ZBJA 1GV9A 5BXTA 1FWVA 5DUVA 2D7IA 3WLUA 2GMEA 4F34A 1H9WA 3WHTA 1XYFA 5DZGA 2ZGUA 1G9BA 1DGLA 3B9UA 1J1TA 4I4XA 5FZYA 2CYFA 2JD4A 3BAOA 3B69A 2IWTB 3O4AA 1R1ZA 1UX6A 1C4RA 2DVBA 5CB7A 3OJ2A 4X38A 1BLAA 3SH5A 1ZA4A 1DYKA 1JHNA 3AP5A 5G00A 3B3QE 3FJEA 1MS1A 4IY8A 3O5WB 2JJ6A 3BOPA 2GALA 5KXBA 5GLWA 1ULDA 4FOYA 3BAVA 4I1EA 3CQAA 1UZYA 1NLSA 2QN0A 1IJTA 2A70A 3FIEA 4Q1PA 2Q9XA 2FHRA 3WVJA 1C1LA 1LODA 2DUOA 3FUQA 3ZX7A 4H55A 1DZCA 2AUYA 1ULCA 3ZC8A 2A5ZA 1CONA 2FFVA 1QOTA 4AN7B 3N7MA 4FP3A 3WZ1A 1BARA 2UWCA 2D6KA 1MS9A 1IOAA 4ENDA 4WVWA 2LIEA 5T5JA 1YVGA 3AZVA 1T3CA 2E4MC 1WCSA 4ISQA 1F5FA 1OQ1A 5H9PA 3SH4A 2Z42A 1XQNA 1ENRA 3MPPG 2AH2A 1LJ7A 4JKXB 2UUSA 1G9CA 3KM5A 3PUBA 1QGLA 2NVHA 4FVVA 3HN1A 1EPWA 3AP4A 1AJOA 2UWAA 9ILBA 1JTCA 5I1BA 3M3OA 3VUOA 1AVWB 5F8YA 1XZZA 2YV8A 4LO2A 1EYLA 4L4IA 3BB2A 1N47A 5CAZA 5E89A 1GNHA 1ONKB 3ZURA 1WLWA 4QD2B 3WINC 2JE7A 2AYHA 1LOAA 4LO8B 3AJYA 3FJ9A 3AK0A 3A0NA 4GWMA 2UURA 1WD3A 4YW5A 1LU1A 5BYNA 4XE9A 4Y1UA 3R4SA 2NM1A 5BQNA 1ZKWA 1TIEA 5EWSA 4I7IA 4XXAA 1IKQA 1AXKA 2WKKA 2G7KA 3CA3A 1V6LA 2VXRA 4Y26A 4JCKA 1LTEA 2A6XA 1IILA 2CY6A 3BA4A 1CESA 1WBLA 5T55A 3CA6A 3BOKA 1IS6A 1WW5A 2WNEA 1N1YA 2E51A 2DREA 4LBKA 21BIA 3W58A 1BLDA 5BOWA 1QQKA 3ENRA 1BA7A 5GZFA 2CL2A 4BLIA 3N36A 2P3KA 4ATFA 1P63A 1TWMA 3O4CA 2H0BA 2CWMA 1AFCA 1BFBA 41BIA 2K8RA 1W6PA 2IMBA 3H6RB 2GNMA 3VKOA 2D24A 1FV2A 2DURA 4YG0A 4IONA 1AX2A 5FRAA 2JKBA 3WCRA 1MS8A 1WW4A 1SLLA 3DEBA 4USPA 2PHXA 4YZ3A 5KXCA 1IS5A 1QXMA 4HL0A 3VSZA 1UMZA 2ZGSA 5DG1A 1HWPB 4PBPA 4K1YA 3I2XA 1RITA 3VKFC 1TWEA 1ZM1A 4G9NA 3BADA 3FJIA 4AGVA 4P9WA 3D5OA 4XBNA 3RS6A 3ZSJA 4A7KA 1NZKA 2VXTI 4LBQD 1LCLA 4FQZA 5DUUA 4XMAA 1S0GA 1HKNA 1QOOA 2ZACA 3CAHA 3O0XA 5EG6C 4CJMA 5FZUA 1KDMA 3MALA 3AX4A 2Y9GA 1MS3A 5FREA 4HJJA 1QQLA 2EALA 3JRRA 3WDTA 1AJKA 4AN6A 3NV4A 4LBQA 2GNTA 1MVQA 1Q8VA 4J23B 3FJHA 3AJ5A 3ILFA 3QW8A 5L73A 4LO3A 1GYKA 4IQPA 1CVNA 1JYIA 3BWIA 1HWMB 1DQ1A 4FGFA 3BRFA 4I4UA 4R9DA 2I2SA 2P37A 3UJ0A 2GZBA 1Z78A 1NUNA 4U36A 1W3AA 4ZFYB 3T1MA 5HCBA 4LO7C 1ULFA 2VSEA 2K43A 1KDKA 3S8JA 2EXHA 3V79C 3AH2A 4LBQB 4EFQA 2NP0A 5DUWA 2IHOA 2QYIB 1YIFA 1DQOA 1JY0A 1S0FA 1PZ9A 3LTQA 4J2KA 4ZLBB 1UPSA 3O0WA 1A78A 2ET2A 5JOZA 4USOA 1CPNA 3HBWA 4UW6A 3QIXA 3I29B 4XXPA 5BQMA 4KEJA 1Q1UA 2NZ9A 1RIRA 2C5DA 2F2FA 4P0KA 5DSSB 7I1BA 3AXDA 4I1BA 5H9RA 3FFZA 1SLIA 4FPJA 5JLVA 1SLTA 5CA6A 3WCSA 1DFCA 1CQ9A 3TC2A 2KM2A 2NTDA 1MC9A 5BQMB 1OKQA 5AVAA 3BA5A 4Y24A 3A23A 4I8MA 3NV1A 2E7QA 2EXIA 5E88A 1SR4C 3QW7A 1DFQA 3QR5A 5EHAA 3C8BA 1QDCA 2X2TA 1IRPA 4XBLA 4YM0A 3ZUQA 3N7LA 3FGMA 2DTYA 2P3IA 3O4OA 1FWUA 1CR7A 3WNXA 2VW2A 3M3QA 2AENA 2ZGLA 3AKHA 4YZ2A 4II0A 4AGRA 2X2SA 6I1BA 1KJLA 3DUIA 3NF3A 4MYEA 3N0KA 1LHVA 4CRQA 1DQ2A 2WLQA 2RHPA 1I3HA 1HCEA 4YW1A 2ZR1B 1WD4A 3VKNA 5HCFA 4YM1A 3BIWE 3CA1A 3H6SE 2ZQNA 4ITCA 1Q04A 3KQRA 1S0EA 5DXDA 4I4VA 1FATA 2AR6A 1YRZA 2DU1A 2GN7A 1JW6A 3UJ4A 1DZQA 1X50A 3I2AA 1BFGA 1ISWA 1QOSA 1S0BA 4OEEA 2BEBA 1M2TB 4DEPA 4XJUA 2XHLA 1N1VA 3ZYPA 2ZGQA 2W39A 2A8AA 3VEQA 1DQ4A 1T9FA 1S1AA 3BRGC 3POWA 3AYEA 4GAFA 2HZ9A 3WDVA 4WVVA 4AVSA 1BKZA 3ZPYA 3W9TA 2WSVA 2ERFA 4QBVA 4BQ1A 2XHLB 1G7YA 2EIGA 1W6QB 2BEAA 2R16A 4YGCA 3VT0A 2W68A 4I4RA 1V6NA 1II4A 1Q8SA 3MW3A 3ZXDA 1PZ8A 1Z2VA 3B00A 1V6VA 1LGNA 1MS4A 3AZXA 3CRIA 1O4YA 5EYXA 3AJ6A 4FPYA 4YOLA 1I1EA 1W6MA 3BONA 1LOCA 1V6XA 3UD9A 4DS0A 2XG3A 2VW1A 3CA4A 4Q1RA 2DUPA 2F8XC 4JRAA 4ELCA 5FNXA 3FBYA 3WDWA 1CJPA 4IHZA 2Y9WC 3OGGA 4ASMB 1SCRA 1CN1A 1DQGA 2ENRA 3NBEA 1JN2P 1ITBA 2HYKA 3AXEA 3KMVA 3I4IA 3IN9A 3B01A 4R9CA 5BP5A 3N35A 2D6PA 1W6MB 1YXWA 4Q2FA 3W59A 2A6VA 5GZCA 4KUFA 1VAMA 3ZUSA 1R8OA 3Q7YA 4QD2C 5T54A 2BQPA 3K1XA 2DYCA 3BOOA 4R6UB 4KTXA 1N3PA 3OBTA 4C1WA 2ZAAA 3Q7XA 1SACA 1MZ5A 5HCAA 4EEEB 3WOGA 1WBFA 1ZKXA 1T3AA 4LO2C 2NMOA 5IUQA 2JDZA 4PC4A 1QF3A 4GAIA 1LOBA 4RA0A 1LEMA 4YLZA 1Z7HA 1MR5A 3BX1C 3O44A 3O0VA 3RSJA 2DTWA 2ZHKA 3LSEA 1FNZA 1DBNA 2DV9A 4AWDA 3U4XA 4G6JA 3RMYA 4XDQA 2G4IA 1MD6A 1V6JA 1YBIA 5FNWA 4BOWA 4YFZA 4QC4A 4Y22A 3HOMA 1S0IA 2DS0A 5DG2A 1TP0A 2I1BA 4H9WA 3GALA 1JT3A 1MS0A 3ILNA 2PELA 3N7JA 2DRZA 5T52A 2R1DA 2ES3A 4XIOA 2RQ9A 3POSA 4L4HA 2VU9A 3UJQA 3ZXFA 4YZ5A 1C1FA 4IZXA 3O5SA 3V64A 1G9DA 1LOGA 3MW4A 3QIYA 3QW6A 3H6RA 3CA5A 2V5YA 1KITA 4Y22B 3SNMA 3CA0A 5B2HA 1JUIA 4I4SA 1G8WA 1Q8QA 1GBGA 2FGFA 3AP6A 1FX5A 2ZZJA 4Z8SB 3NV3A 1XTFA 1W0OA 2A6ZA 2ZGTA 5CBLA 1S0CA 4YW3A 2L5XA 4XMIA 4R9AA 5DZUA 3NBNA 1MZ6A 4BMEA 2OVUA 4Q9PA 4DCKC 3VKLA 3PMEA 2LTNA 3CRHA 1LU2A 1VALA 4OZXA 5IK4A 2D3RA 4FPKA 1PZZA 3M3EA 3DSEA 3AP9A 4BMBA 1VAVA 4I4PA 1E0OA 5LK5A 1YYNA 1KJRA 3VWCA 2A97A 2RSTA 4M3CF 4LBJA 1AVBA 4IYBA 2TEPA 5SV8A 3LLPA 3ZVXA 1JBCA 2AFGA 3IKWA 1HQWA 2ZGNA 3POKA 3RTIB 1BQPA 1H9PA 2R0HA 2ZGOA 4ATEA 1GZCA 2A7AA 4G9MA 4Q8LA 2A71A 2CNAA 5D63A 1PUMB 2QN4A 2G7NA 2C9AA 1MACA 4GP3A 4XIKA 3V0AB 1LESA 4UW5A 1DHKB 2G7PA 5GZDA 3I8TA 1LHUA 4YGEA 4ZOTA 3FJAA 4JQ0A 3AFKA 1LOFA 4XZPA 1L2HA 2HW9A 3CRGA 4I2SA 4PBOA 1ONAA 2D7RA 2D3SA 1LGCA 1OQLB 2ZMKA 2ZGKA 3MW2A 3RQ0A 4HA2A 2SBAA 5EXOA 1BXHA 4NOTA 1DQ5A 4LO3C 1IT0A 1QKQA 1OFSA 4EKXB 1LEDA 3ASIA 4LO0A 5F90A 3AH1A 5IT6A 1GZWB 2B7YA 2ZGPA 2A6YA 4Y1ZA 1WBCA 4Y20A 4XHBA 1FV3A 4XOGA 4XTPA 4Y1VA 5GJ6A 3UDAA 2Q5TA 5GLTA 3GNEA 4P0LA 1AXYA 4GKXA 5EC5A 5F9TA 5KXEA 3BAQA 2ISGA 5GM0A 2VH9A 2DVDA 4KEKA 3ZC9A 3WA1A 2GNDA 3C9ZA 1KNMA 3Q7WA 2ZMLA 1TOOA 3BAHA 3BRDA 4JAWA 2W08A 4M01A 3WDUA 4Y20B 1AX0A 2A3WA 1QNWA 4XJWA 2D7FA 1UAIA 2NN8A 3USUA 1AVUA 2F2FC 4OUJA 1YI7A 4FP2A 2XOAA 1UKGA 1ULEA 5EYYA 1NXD1 3RRDA 1N4KA 1PWAA 1CE7B 3WO4A 2A75A 5BXPA 3IM5A 4FOVA 4YG6A 4ZFWB 4LBMA 4EJ5A 1DIWA 2WSUA 1UN1A 3LCPA 4AVVA 3PJQA 2NYYA 2Y9FA 3F62B 4Q26A 4P9YA 1BZWA 2A6WA 3USUB 1DJSB 2ZKNA 1Q8OA 4G1RA 1HCDA 2GO2A 1QU0A 2NMNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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