The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
|
sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
MQYKLILCGKTLKGETTTEAVDAATAECVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Immune system
|
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
|
| publication title |
High-resolution structure of a protein spin-label in a solvent-exposed beta-sheet and comparison with DEER spectroscopy.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Streptococcus sp. 'group g'
|
| total genus |
8
|
| structure length |
56
|
| sequence length |
56
|
| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2011-12-14 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3MP9 A; 1PGX A; 3V3X A; 2PTL A; 1MVK A; 2I2Y A; 2LHE A; 4WH4 A; 1YNT E; 2KWD A; 3GB1 A; 1IBX B; 1P7E A; 2JSV X; 3FIL A; 2JXT A; 1C9F A; 2I38 A; 4GLS C; 5BMH A; 1FD6 A; 1ZXH A; 1MHH E; 1XCQ L; 2ONQ A; 1UWX A; 1XCT L; 2LUM A; 1IGC A; 3UI3 A; 2EEL A; 5HG2 A; 4D2K A; 1K51 A; 2ZW0 A; 1F2R C; 1IBX A; 1MPE A; 2IGH A; 1JML A; 2LGI A; 5HFY A; 2PW9 A; 4IOI E; 2QSD A; 2PLP A; 5HI1 A; 1K50 A; 4KGS A; 2LHD A; 2KDM A; 5BMI A; 1PGB A; 1FCL A; 2RMM A; 2J53 A; 1KH0 A; 2N7J A; 4HKZ E; 1HZ5 A; 4IKG A; 1K53 A; 2JZP A; 1MI0 A; 5BMG A; 1Q10 A; 2N9K A; 2OED A; 4KGR A; 1HEZ E; 2N9L A; 1PGA A; 2J52 A; 2JWU A; 2ON8 A; 2QMT A; 4OZC A; 2KAC A; 1D4B A; 2NMQ A; 2KQ4 X; 1GB4 A; 1HZ6 A; 2ZW1 A; 1F2R I; 2K0P A; 2JU6 X; 4MAC A; 2RPV A; 1FCC C; 1XF5 L; 1EM7 A; 5HHD G; 2IGG A; 2KN4 A; 4KGT A; 1IGD A; 1MHX A; 3FIL B; 2GI9 A; 1QKZ A; 4OZA A; 1YMH E; 4OZB A; 1K52 A; 1P7F A; 1GB1 A; 2IGD A; 4HJG E; 5JXV A; 2GB1 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2R2O A; 4P1C C; 2YVC A; 2M17 A; 3ZRF A; 2O6V B; 2NBW B; 4DQO C; 2IO3 B; 2I2Y A; 3U52 E; 1KFY B; 1C77 A; 3EA6 A; 3GB1 A; 2L32 A; 2KMA A; 2MEK A; 4AOF A; 2WXO A; 2C5L C; 2JSV X; 1CJE A; 1FM0 D; 3T9L A; 2WXP A; 4WJP A; 3MC8 A; 2HD5 B; 2EEL A; 2YLM A; 5HG2 A; 2HTM E; 3DVN V; 3AE9 B; 3BII D; 2L3Z A; 4UDU C; 3AEF B; 1UBI A; 1YQB A; 3PO0 A; 1V80 A; 4DXG A; 3DBL B; 4IDI A; 3ZYY X; 1VZ7 A; 4WWM A; 1LXD A; 2VRR B; 3QA8 A; 2I1K A; 1PGB A; 2MCN B; 3JSV B; 4NJ6 A; 1WJ4 A; 1EWY C; 2C60 A; 3AEE B; 1RFA A; 2BB5 A; 4JIO U; 4G0N B; 1Q10 A; 4MT5 A; 4EZK A; 2WDV B; 2AWT A; 3Q69 A; 3WA0 A; 3RMK C; 2BGF A; 2WXN A; 3Q3M C; 3AE4 B; 2KQ4 X; 3EFU A; 1TS5 A; 3MJ5 A; 3P42 A; 4IG7 B; 4P7I A; 3AU4 A; 3HM6 X; 1FRR A; 1NYR A; 2Y5P A; 2L76 A; 3L10 B; 4XZ4 A; 3WAN A; 2E3T A; 5H8Y E; 4KDI C; 3T3O A; 2TSS A; 1TT5 B; 4HDQ A; 2NS5 A; 4M01 A; 2ASQ A; 2L7R A; 1FPY A; 3PRZ A; 3LXF A; 1EF1 A; 4HDO A; 5FR6 A; 3L17 A; 3DVN U; 2HDE A; 4HVB A; 1IBX B; 2WXI A; 3IBE A; 2KJR A; 4YTP B; 4OW0 A; 3KUC B; 2WDT B; 2W55 A; 2LGD A; 1K8R B; 2BYF A; 1E8X A; 2RSU A; 2WU2 B; 1YJJ A; 4MGZ E; 1OTR B; 5IO9 A; 4BZA A; 2FCN A; 1WYG A; 5IN7 A; 2IBI B; 4A3P A; 3NS8 A; 3R3M A; 4XE0 A; 4WUR A; 1E10 A; 4M00 A; 3DQV A; 4HPP A; 5L83 A; 3V62 A; 2PIA A; 1J7B A; 5BMI A; 1WGR A; 2MWS B; 2G9H D; 1WJN A; 1S3S G; 1TZ1 A; 1HZ5 A; 3ABV B; 4JPS A; 1V8C A; 2SEB D; 2BTE A; 3L54 A; 2WLB A; 5CHV C; 2GBK A; 2EKI A; 2N9K A; 1L6U A; 4ARI A; 1QLB B; 1ZOY B; 3EGR A; 4W9I A; 2V0G A; 3PZD A; 2O6V D; 4OZC A; 1FXI A; 4A8X C; 3TEZ A; 1PQS A; 1WM2 A; 2O2V B; 2PMV A; 2L05 A; 4G50 A; 1QOA A; 1HTO A; 3VUW A; 3RD2 A; 3IAM 1; 3Q2A C; 5DPS A; 3ZNZ B; 1D6E C; 1SGH A; 3HK0 A; 2WXH A; 3H8H A; 2KQS A; 1FCC C; 1F9J A; 4AQ7 A; 1YD8 U; 1TGZ B; 2M8S A; 3H7P B; 3DBS A; 2K25 A; 1LQB A; 3BK1 A; 1RLF A; 3Q8B A; 5D7G A; 1ESF A; 2R2Q A; 3AEB B; 2MP2 B; 5JXV A; 3RZW C; 2ZPY A; 1MG8 A; 2D11 A; 2INP E; 4OVU A; 2M56 B; 2CJO A; 1VRA B; 1YIW A; 2LXC A; 4C4V B; 4FAD A; 4EKU A; 1TKY A; 4NPN A; 1AWD A; 4PS7 A; 3TEW A; 4ARC A; 3QQ8 B; 4HWI B; 4ANV A; 1XD3 B; 2ZEQ A; 3C0R B; 3HUI A; 1XQQ A; 3SFD B; 4NY0 A; 1WR6 E; 1V97 A; 3AM9 A; 4NJ7 A; 3PLU A; 4LJO B; 3RNC C; 3RUL A; 1ZKH A; 1OGW A; 2H89 B; 2K3U A; 4DHZ E; 2JF5 A; 1V1P A; 5FKA C; 2D2Q A; 1J7A A; 1V81 A; 3LYY A; 2ZPN A; 3ZVV A; 5LXI B; 2GMI C; 1L4D B; 5EE3 A; 1K53 A; 1WZ0 A; 2JYE A; 1ZPS A; 2JZP A; 3OAW A; 5EDS A; 2KTF A; 3EEC A; 2MLB A; 2JWU A; 3SD5 A; 1KJT A; 3RUI B; 1CK1 A; 2NBU A; 2KO3 A; 3KWL A; 3ZJV A; 1WZ3 A; 2DZI A; 3ML8 A; 3U7Z A; 1H4R A; 1XEE A; 3WAM A; 2XN9 C; 3OG5 A; 2DX5 B; 1DOX A; 3NZU A; 4EFO A; 5C1Z A; 1E8W A; 2MSE D; 3A33 B; 4ZRJ A; 2KOX A; 2IY1 B; 3A1Q A; 2GB1 A; 1B1Z A; 1DYQ A; 1MG4 A; 3U30 A; 4P1B C; 2DWQ A; 2WHI A; 2R61 A; 2CU1 A; 2WWZ A; 3QK0 A; 1GG3 A; 2C9W B; 3KYC D; 5AZG A; 3RPF C; 4TQ1 A; 3SFE B; 3SHQ A; 3FIL A; 1WYW B; 1WX7 A; 4MGY E; 2K6Q A; 3DBL I; 2KK8 A; 1ZXH A; 5IP4 D; 1MHH E; 1ZUD 2; 3A9K B; 5G2N A; 2WX0 A; 4XDD A; 2LEK A; 2O6V A; 2PVG C; 3SEB A; 2V3N A; 3RFZ B; 4RF1 A; 4KZC A; 1NBF C; 3ZXR A; 1I4H A; 2IGH A; 3VUY A; 4MSM B; 3OJ4 B; 1B9R A; 3AE5 B; 4ZYN A; 2DLB A; 4WIP A; 3DCG A; 2KMM A; 4M8N A; 3DHH C; 4XWW A; 3BK2 A; 1VJK A; 2XBB C; 3CMM B; 3Q14 C; 1C1Y B; 3I5J C; 1N6Z A; 1DOY A; 3B9J A; 1JAL A; 3ZXV A; 1VZ8 A; 4TV3 A; 4BKT A; 1WXM A; 4CHK A; 4IM3 A; 2OJW A; 4XC2 A; 2KHW B; 5G5G A; 1R4N B; 2WYQ A; 4A55 A; 1C78 A; 2IND C; 2L8J A; 3JSV A; 2GLS A; 1QZE A; 3DVG X; 5EE1 A; 2KMC A; 3JW0 X; 3DBH B; 3ZNG C; 4NAW B; 4MM3 B; 4K3B A; 2DEN B; 1YMH E; 1K52 A; 3M62 B; 4BBN F; 5H92 C; 1WM3 A; 1YN5 A; 2IZV B; 3RZF A; 1H8C A; 1MVK A; 2IYD B; 3RNA C; 2K39 A; 3W5V B; 1WJU A; 1ZP0 B; 3HVD A; 2LD9 A; 3ZNI D; 2JY6 A; 3ALB A; 2V4I B; 3BWU D; 1WE7 A; 4LLG M; 4PK1 A; 5JZE B; 4M8M A; 4KX6 B; 3CF6 E; 4B6W A; 3TCA A; 1AN8 A; 1C4C A; 1XLO A; 1SE3 A; 4IWQ A; 1IBX A; 3GZN B; 4JE3 B; 3PRE A; 2G4S A; 2ACZ B; 4RH6 A; 3U7D A; 2FCQ A; 1SE4 A; 2PLP A; 3MTN B; 2K5P A; 3AE3 B; 4K7U A; 4BAX A; 1ET6 A; 1I4G A; 2DZK A; 4S0R A; 1C76 A; 4TUU A; 3UIP B; 2D07 B; 5MPO A; 1J19 A; 3P4S B; 4IKG A; 1WR1 A; 2MW5 A; 1E7V A; 2KFJ A; 4DK5 A; 4W9G A; 1U4A A; 1TS2 A; 4E74 A; 2CHW A; 1UBQ A; 3PPA A; 3VTW A; 3X23 A; 1SBB B; 5LXH A; 1L2N A; 3GP7 A; 4LNO A; 1E9M A; 2AL3 A; 4FA6 A; 1FNV A; 4DDG D; 5DPR A; 3ML9 A; 2D10 A; 2J7Q B; 2QJL A; 4NAM A; 4KKI A; 5C3J B; 1FNU A; 5E6P A; 2A4Z A; 3C8Y A; 5DPT A; 2IO1 B; 3PZ7 A; 1FFU A; 1UD7 A; 3BYY B; 2QDF A; 4HPM B; 3E56 A; 4AWJ A; 1OQQ A; 3VDZ A; 3VR9 B; 2O2V A; 1WSP A; 2DHZ A; 1ZE3 D; 2JPH A; 1XT9 B; 5D3D A; 4US8 A; 1GC6 A; 1WF9 A; 1FFV A; 1L0X B; 1BML C; 1YNT E; 4WH4 A; 4KSL C; 3DHG C; 3KWV A; 5J17 A; 3H7P A; 1P7E A; 2PKO A; 1R4M B; 4IM2 A; 1HE8 A; 2AYO B; 4GLS C; 4W9D A; 2MP2 A; 2ONQ A; 2IO2 B; 3N30 A; 4C80 A; 4FJY A; 2LJ5 A; 4GMV A; 1K51 A; 1E90 A; 2W3R A; 3DBR B; 3KUD B; 1C4P A; 4FLH A; 2B3A A; 4C4V A; 1VD2 A; 3ZDT A; 2MQJ A; 4I6L B; 4RGO S; 2PEA A; 3AU5 A; 3N9Y C; 3QX1 A; 2WS3 B; 1K50 A; 1SXT A; 2KZR A; 2L83 A; 5CX3 A; 1S1Q B; 2KLC A; 1SSN A; 4FJV B; 2OHF A; 2N7J A; 3PRM B; 2MBO A; 3IT4 B; 4BKS D; 3NY5 A; 3HRD D; 1VDV A; 2EMS A; 3GE8 C; 1T6B X; 1TKG A; 1T3Q A; 1TS3 A; 3GE3 C; 4WAA A; 4BVU C; 2ZCB A; 4K3C A; 1NI2 A; 2W54 A; 3QC8 B; 3KVF B; 4DXF A; 1L0V B; 1PYW D; 1V9J A; 1ZGU B; 1UH6 A; 4MGI E; 3PV1 A; 4E3C A; 3DDC B; 2V3P A; 1ZW7 A; 2ZVN A; 1KF6 B; 3PS6 A; 4G11 A; 1Z2M A; 4MAC A; 2MJE A; 3I3T B; 3PLV A; 3ZDM C; 4AJY B; 1OEY J; 2ZZP B; 2J4X A; 1N62 A; 4GU2 A; 2KX3 A; 2VZK B; 1WE6 A; 3V61 A; 2W3S A; 4W9E A; 1YQ4 B; 3IVF A; 4USA A; 1PDX A; 3VTU A; 4WWP A; 3R2T A; 1V86 A; 2CU3 A; 1E8Y A; 2W9N A; 3V05 A; 1RWS A; 5J18 A; 3R7R A; 4RNA A; 4K7S A; 1RAX A; 1I4X A; 4EUT A; 3SR6 A; 3AI5 A; 2JWZ A; 4BBN C; 3AN1 A; 3UQB A; 2VH1 A; 1ET9 A; 1YJI A; 5HKH A; 3P4Q B; 1BT0 A; 4JL9 A; 4E71 A; 1UZX B; 4NZL B; 4HXD A; 3NUH B; 2H88 B; 1Y8R C; 2LJI A; 3Q8F A; 3V6E B; 4Q2J A; 4I6P A; 1E0Z A; 2PW9 A; 5HI1 A; 1F77 A; 1QF6 A; 3OLM D; 3APF A; 2KDM A; 1I4R A; 2WXJ A; 2FE8 A; 3A9K A; 2DZM A; 1RM6 C; 3B2F A; 1RYJ A; 1R4N I; 2JQR B; 4I6N B; 3NZS A; 2QIL A; 3PHW B; 2KWC A; 1QIL A; 2X38 A; 2XNA C; 1WXV A; 2J52 A; 4L2Y A; 5FR3 A; 1T5X D; 3M63 B; 3CSF A; 3QWZ B; 3DBH I; 3K9P B; 3FAH A; 3NG0 A; 4F8C B; 3VR8 B; 4BKG A; 1Q1O A; 1D3Z A; 2ZW1 A; 3AEA B; 4C00 A; 1GJZ A; 2K8B A; 1SB3 C; 1STE A; 2WXK A; 2JU6 X; 2L0F A; 3S2A A; 2BW2 A; 1DOI A; 3E9S A; 5I4D A; 5HHD G; 2WX1 A; 2IGG A; 3FC4 A; 2GRI A; 2FNJ B; 2BBC A; 4RM8 A; 3N1X C; 1FXT B; 4MEM A; 4LNF A; 3BZD B; 4YTM B; 1FNW A; 2REX A; 3ZGZ A; 2K8H A; 1G6J A; 1WFY A; 2JT4 B; 2BS3 B; 3L16 A; 4MM3 A; 4NAW A; 3NS1 A; 2MJ3 A; 3RNG C; 4JQW C; 4B0E A; 5IOI A; 2I38 A; 4BKS A; 1J8C A; 2BB6 A; 2NPT B; 1SE2 A; 2J0K A; 1UWX A; 4FJZ A; 4GN1 A; 3QCA A; 4BOS C; 2LVP A; 3T8M A; 3W2D A; 1GUA B; 1HA5 A; 2ZW0 A; 4DXA B; 1UF0 A; 3U2S C; 4DHZ B; 3ZTD A; 2NR2 A; 5KHQ A; 1UGJ A; 1F0Z A; 2CS4 A; 4PYU A; 1DGJ A; 3VVW B; 4XGA B; 3P4R B; 2BWE S; 2DAJ A; 2RMM A; 1QQR A; 4LJP B; 1FMA D; 1E7P B; 4FHK A; 2KLG A; 2VZK D; 4KZ0 A; 3QHT A; 4XYC A; 4CQN A; 3ZTC A; 1FXA A; 3PGE A; 4MJS B; 3URY A; 2M0A A; 4ZOH C; 4F7Z A; 1P9D U; 2ON8 A; 3AE6 B; 3C19 A; 4KDL B; 1JRO A; 1D4B A; 3BVG A; 4KVG B; 5C2T B; 1JRU A; 3PTF C; 3Q3J A; 1T0Y A; 1GB4 A; 3A4R A; 3I9V 1; 3WAL A; 1WJ6 A; 1HZ6 A; 3ZUN A; 2L1A A; 1WX9 A; 3N20 C; 4KGT A; 4YSY B; 3IAS 1; 2DNF A; 1XLN A; 1WXQ A; 4EOY A; 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3MFG A; 1T0Q C; 2WXR A; 2DYO A; 5BMH A; 3KLS X; 1KM7 A; 1FD6 A; 3DHI C; 4K7W A; 1N5X A; 4ANX A; 1UUP A; 1SIJ A; 4HRS A; 5T8I A; 3R8B A; 3VRB B; 3UI3 A; 4N58 A; 1OFF A; 3FKY A; 1I7H A; 4PS8 A; 1KLV A; 3TIX A; 2IDY A; 3RYT A; 1TTN A; 3UQA A; 3NRZ A; 1OQR A; 4IC7 B; 4LNN A; 3QAQ A; 2PE9 A; 2HTH A; 3Q8C A; 3Q8A A; 2V3S A; 2LGI A; 2Y5C A; 5AEK B; 1P98 A; 1C79 A; 1ZDV A; 1WIA A; 2EKE C; 2J53 A; 2LVQ A; 2V1Y A; 3Q6B A; 2RD0 A; 4TQ0 A; 2KNB A; 1TS4 A; 3GS2 A; 2DAF A; 5BMG A; 2WXQ A; 4B9K A; 1PGA A; 3TL5 A; 3Q8E A; 3PRP B; 3CST A; 2KJ6 A; 5BYQ A; 2KJH B; 2MJD A; 3KYD D; 1OEY A; 3UGB B; 2JX5 A; 2ZNV B; 4HK2 A; 5BO4 B; 4XWT A; 3VXW A; 4W9L A; 2WNM A; 3B0A A; 3PSE B; 3QIJ A; 4GDK B; 2DBY A; 4AP4 C; 1WGH A; 3NVW A; 1I42 A; 1YJ1 A; 2SAK A; 4TSS A; 4MH8 A; 2DYB A; 4DHJ B; 1AYF A; 3I63 C; 1TY2 A; 3DWG C; 2OOB B; 3LDZ E; 2PTL A; 4DDI D; 5AUI A; 2LRW A; 2KDB A; 2NTS A; 3N32 A; 3RCZ A; 1L6V A; 5GMV A; 3LJ3 A; 2L0T A; 2KTR B; 4K81 A; 4US9 A; 3AE1 B; 1GAQ B; 2LXA A; 4ANW A; 4URK A; 4YSZ B; 4ICV A; 3R66 C; 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