3V5GA

Crystal structure of human carbonic anhydrase ii in complex with the 4-sulfamido-benzenesulfonamide inhibitor
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Development of potent carbonic anhydrase inhibitors incorporating both sulfonamide and sulfamide groups.
pubmed doi rcsb
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2011-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3v5gA00
2F14A 5EZTX 3KOIA 3ZNCA 3R16A 4Q8XA 4KP5A 4XZ5A 3L14A 1CAIA 2Q1BA 3D92A 1BN4A 2Q1QA 4ITOA 4G0CA 5DSKA 3RG3A 4Q7VA 2WD2A 1FQNA 1ZGEA 4PXXA 1HEAA 3HLJA 5SZ6A 3S97A 4ZX0A 3MDZA 4QJOA 3JXFA 3RGEA 2W2JA 5FDIA 3RZ7A 1I8ZA 2FOSA 2ABEA 2WEGA 4Z1JA 2FNMA 3NB5A 3C7PA 2WEOA 3P3HA 4M2RA 1RAZA 1ZSAA 1OKMA 3MWOA 2NXTA 4CNWA 3M98A 3IEOA 3N4BA 3V3HB 2NWYA 3S8XA 4TWMA 4JSWA 1CVAA 1KOQA 1CRAA 1HUHA 2GD8A 1MOOA 4QK1A 4YXIA 3V3IB 2AX2A 3P3JA 4QK3A 4E49A 3IBIA 5FLQA 4WUQA 3SBHA 4HU1A 3FFPX 4K13A 1CCTA 1LZVA 4Q08A 1G52A 1DCAA 4E3HA 4YXUA 4CNRA 2NNSA 3D9ZA 1CNKA 1YO0A 4PZHA 3R17B 2NNVA 5JEGB 3PO6A 4RH2A 1TH9A 3V3FA 3DD0A 5G03A 4HF3A 3DVCA 3P4VA 4Q7SA 3Q31A 4KP8A 1CZMA 1KWQA 5BYIA 4Q7PA 4Q87A 4Z1NA 1H4NA 3S77B 1HEDA 1Y7WA 4K0ZA 3M04A 1DMXA 1YDBA 4KNJA 1TE3X 2POUA 5LMDA 3F7UA 2CBCA 3KNEA 4RIVA 2QOAA 4QIYA 1CAKA 2NNOA 1IF6A 4YWPA 5JG3B 3ML5A 5FNLA 2WEHA 1CVBA 1UGFA 4MDGA 1YDDA 1FSQA 1EOUA 1XPZA 4COQA 3V2JA 2EU3A 3M14A 3N0NA 3M5EA 4JSSA 4MLXA 4RIUA 3M2XA 3M1QA 4DZ9A 1BZMA 5DSJA 5FNJA 5DSPA 5J8ZA 5G0CA 1CNHA 2POWA 3KOKA 2Q38A 4WW6A 1G46A 3RZ8A 3OY0A 2NN7A 1BN3A 1TB0X 3MNJA 1KWRA 1I91A 2CA2A 1URTA 2X7TA 5EHVA 3HS4A 3IBNA 5BRUA 3D8WA 2EU2A 4HEZA 4PYXA 5SZ0A 1JD0A 1I90A 2FOVA 1CAHA 5DSOA 5EH7A 3OKUA 3M5TA 1CNJA 2NWOA 3DAZA 4QTLA 4ZAOA 4MLTA 4WW8A 2WEJA 4TWLA 3F4XA 1FSNA 1CNWA 5E2SA 4Q9YA 5BRWA 3V2MA 1V9EA 4HBAA 2HFWA 3M5SA 3KIGA 3D93A 4Q09A 2FNKA 1I9NA 3DVBA 3S72B 5G0BA 3RLDA 5IPZA 1CVEA 1I9PA 3DD8A 3M1WA 3OILA 3DVDA 3BETA 3LXEA 4FU5A 1G48A 3MNHA 3N2PA 3TMJA 2NWZA 3DCWA 1CIMA 3UYQA 5DSQA 2QO8A 3RYJB 1RJ6A 5CJFA 1KEQA 3W6HA 3M1JA 5FLOA 1CNCA 4IDRX 1CILA 4X5SA 4JSZA 3IGPA 4ZWYA 3KKXA 5DOGA 12CAA 5BNLA 1I9QA 5FLSA 1AZMA 5E5UA 3RYXB 4E3FA 3OKVA 3OYQA 4Y0JA 2CBDA 4E3GA 2CBAA 4RUXA 2ILIA 5CLUA 5A25A 5DSMA 1G0EA 5C8IA 2X7SA 4R59A 3MHMA 1TEUX 5A6HA 5DSLA 5JG5B 3VBDA 4Q99A 1LUGA 5JGTB 5FNGA 4FL7A 5AMDA 3W6IA 4ZWZA 3RYYA 3N3JA 4Q6EA 2WD3A 1UGGA 1G4JA 3RZ1B 3V7XA 1T9NA 2H4NA 2FMZA 5FNIA 5FL6A 5L3OA 4JS6A 3DC9A 5HPJA 1CCUA 4QIZA 3M3XA 4Z0QA 3SAPA 4KNNA 1RZEA 3MZCA 4HT0A 5BRVA 1YO1A 1HCBA 2FW4A 3P55A 1CNXA 4FPTA 1BNNA 2EZ7A 4QSBA 1FQRA 5EKJA 2FOUA 4YXOA 4WR7A 4N0XB 1CA3A 4Q7WA 4Z1EA 2FNNA 1AVNA 4QJ0A 3B1BA 2HD6A 1BICA 1XEVA 1IF7A 1XEGA 3HKUA 5SZ1A 5JQ0A 3MNIA 4G7AA 4R5AA 3M2NA 5EH8A 5FLRA 3T5UA 3RZ5A 4QJPA 4QJWA 3KS3A 1G3ZA 3CA2A 4K1QA 3DCCA 3DV7A 2NMXA 3U3AX 3MNUA 3TVOX 1HUGA 3K7KA 5DSIA 1CAZA 1V9IC 4Q90A 3HKNA 1CNGA 1TEQX 2FOYA 3KONA 1LG6A 1CAJA 3V5GA 1FLJA 1HCAA 1Z9YA 5FDCA 3S76A 1G0FA 2VVAX 3FE4A 5E2NA 5JESB 4RUYA 4E9OX 1XQ0A 3DBUA 1YO2A 4FVNA 1FQMA 1FR4A 5DVXA 4LHIA 1CNIA 4MO8A 5E28A 4XFWA 5JEPB 3MMFA 4Q0LA 2FMGA 3OIKA 4QSAA 3DC3A 4L5UA 1CANA 2NWPA 3CYUA 4Q6DA 1FQLA 4KUWA 1G6VA 3F8EA 2POVA 3MHLA 3KLDB 4HEYA 4CQ0A 5AMGA 1G1DA 3V3GB 3V3JA 2IT4A 4C3TA 3M67A 3MHIA 3UYNA 1CVCA 4GL1X 4CACA 1HECA 2CABA 3P58A 1CA2A 7CA2A 4RFCA 5DRSA 3IAIA 4Z1KA 2HKKA 4E5QA 1CVDA 1CAYA 3U7CA 4LP6A 4RN4A 3KWAA 4FVOA 4MDLA 3SBIA 3TVNX 2X7UA 2CBBA 1HEBA 1H9NA 1MUAA 4RFDA 2O4ZA 4CNVA 4QSJA 2GEHA 5CA2A 4XIWA 1BNMA 4KNMA 3RG4A 1UGCA 1CNYA 4Q49A 3M2YA 1BNQA 4ETQC 1TG3A 3S78B 5FLPA 3P44A 1BNVA 1G53A 2HOCA 3F7BA 1CINA 3S71B 2QP6A 5L6KA 3B4FA 1CVHA 1BNTA 5EOIA 5FNKA 1YDCA 2HL4A 1IF9A 1KOPA 3EFTA 3M40A 9CA2A 1BN1A 5SZ4A 1UGBA 3U45X 4KUYA 4QY3A 2FOQA 1YDAA 4FIKA 1BV3A 4YGLA 4L5VA 5E2MA 4QK2A 3IBLA 1DCBA 3CZVA 3IBUA 2H15A 3M96A 4BF1A 6CA2A 3S74B 5EHWA 1AM6A 4WUPA 2OSMA 5CACA 4UOVA 5E2RA 5DSRA 3NJ9A 3HKQA 4JSAA 5DOHA 3CAJA 1HVAA 4QSIA 4DZ7A 1RAYA 1ZE8A 3BL1A 5FNHA 4ZWIA 4ZWXA 4YGNA 4KNIA 5SZ2A 3SAXA 5JGSB 1IF5A 3MYQA 5EKHA 5FL5A 3M2ZA 5SZ3A 4Q06A 4YGFA 3T85A 5JDVB 2NXSA 3MHOA 3RYZA 2AW1A 3DCSA 3HKTA 3P5LA 4YGKA 5DSNA 3PJJA 1RZBA 4Q8ZA 2OSFA 4MTYA 4YHAA 1ZSBA 1BNUA 3PYKA 4E4AA 3ML2A 1CNBA 1ZGFA 4E3DA 2NNGA 5EIJA 2CBEA 1UGDA 5JEHB 4BF6A 4QJMA 1OKLA 1ZNCA 4KAPA 1LG5A 1IF8A 1OKNA 1ZFQA 3MNAA 3JXGA 1UGAA 3M1KA 3D0NA 4M2UA 1RJ5A 4YGJA 5AMLA 3S75B 1BNWA 3RZ0B 3T83A 1IF4A 1Z97A 3QYKA 1OQ5A 3P5AA 4FRCA 5FNMA 4ILXA 3OYSA 3U47A 3S73B 5G01A 3BL0A 4IWZA 4M2VA 5EH5A 1FSRA 1FR7A 1CAMA 4KUVA 4QJXA 1G54A 4KV0A 1CRMA 5SZ7A 4Q8YA 5EHEA 5FLTA 5E2KA 4MDMA 1I9MA 3FW3A 1H9QA 4XE1A 4K0TA 4ZX1A 1CAOA 1F2WA 2HNCA 3MHCA 4RUZA 4YVYA 5EKMA 3RJ7A 4YX4A 4Q83A 1CCSA 4HEWA 5FL4A 1ZSCA 5E5RA 1ZH9A 3K2FA 1DMYA 1G4OA 3HFPA 3NI5A 4QEFA 4R5BA 3T5ZA 1I9LA 4YYTA 1ZFKA 1RZAA 1I9OA 1UGEA 1A42A 3JXHC 3S9TA 3T84A 1CALA 4HT2A 4Q78A 8CA2A 1RZDA 1G45A 4Q07A 1THKA 1J9WA 3EFIA 1CVFA 1Z93A 4M2WA 3T82A 3GZ0A 1LGDA 4PQ7A 3MNKA 4WL4A 3RYVB 1TTMA 4K0SA 4PYYA 4CA2A 2NXRA 2ZNCA 2NN1A 4L5WA 3DA2A 4ITPA 2VVBX 5JQTA 5SZ5A 4BCWA 3ZP9A 1RZCA 4Q81A 1TG9A 3K34A 4XIXA 4LU3A 1JCZA 1TBTX 4N16A 1BCDA 1JV0A 3OIMA 4CNXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2F14 A;  5EZT X;  3KOI A;  3ZNC A;  3R16 A;  4Q8X A;  4KP5 A;  4XZ5 A;  3L14 A;  1CAI A;  2Q1B A;  3D92 A;  1BN4 A;  2Q1Q A;  4ITO A;  4G0C A;  5DSK A;  3RG3 A;  4Q7V A;  2WD2 A;  1FQN A;  1ZGE A;  4PXX A;  1HEA A;  3HLJ A;  5SZ6 A;  3S97 A;  4ZX0 A;  3MDZ A;  4QJO A;  3JXF A;  3RGE A;  2W2J A;  5FDI A;  3RZ7 A;  1I8Z A;  2FOS A;  2ABE A;  2WEG A;  4Z1J A;  2FNM A;  3NB5 A;  3C7P A;  2WEO A;  3P3H A;  4M2R A;  1RAZ A;  1ZSA A;  1OKM A;  3MWO A;  2NXT A;  4CNW A;  3M98 A;  3IEO A;  3N4B A;  3V3H B;  2NWY A;  3S8X A;  4TWM A;  4JSW A;  1CVA A;  1KOQ A;  1CRA A;  1HUH A;  2GD8 A;  1MOO A;  4QK1 A;  4YXI A;  3V3I B;  2AX2 A;  3P3J A;  4QK3 A;  4E49 A;  3IBI A;  5FLQ A;  4WUQ A;  3SBH A;  4HU1 A;  3FFP X;  4K13 A;  1CCT A;  1LZV A;  4Q08 A;  1G52 A;  1DCA A;  4E3H A;  4YXU A;  4CNR A;  2NNS A;  3D9Z A;  1CNK A;  1YO0 A;  4PZH A;  3R17 B;  2NNV A;  5JEG B;  3PO6 A;  4RH2 A;  1TH9 A;  3V3F A;  3DD0 A;  5G03 A;  4HF3 A;  3DVC A;  3P4V A;  4Q7S A;  3Q31 A;  4KP8 A;  1CZM A;  1KWQ A;  5BYI A;  4Q7P A; 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