3VEOA

Crystal structure of the o-carbamoyltransferase tobz in complex with carbamoyl phosphate
Total Genus 198
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
198
sequence length
571
structure length
571
Chain Sequence
HMRVLGLNGWPRDFHDASAALLVDGRIAAFAEEERLTRKKHGYNTAPVQAAAFCLAQAGLTVDDLDAVAFGWDLPAMYRERLGGWPHSDSEALDILLPRDVFPRRTDPPLHFVQHHLAHAASAYYFSGEDRGAVLIVDGQGEEECVTLAHAEGGKITVLDTVPGAWSLGFFYEHVSEYTGLGGDNPGKLMGLAAHGTTVDETLSAFAFDSDGYRLNLIDPQARDPEDWDEYSVTERAWFAHLERIYRLPPNEFVRRYDPAKGRVVRDTRRDPYEYRDLAATAQAALERAVFGLADSVLARTGERTLFVAGGVGLNATMNGKLLTRSTVDKMFVPPVASDIGVSLGAAAAVAVELGDRIAPMGDTAAWGPEFSPDQVRAALDRTGLAYREPANLEREVAALIASGKVVGWAQGRGEVGPRALGQRSLLGSAHSPTMRDHINLRVKDREWWRPFAPSMLRSVSDQVLEVDADFPYMIMTTKVRAAYAERLPSVVHEDWSTRPQTVTEASNPRYHRMLTELGDLVGDPVCLNTSFNDRGEPIVSSPADALLTFSRLPIDALAVGPYLVTKDLRH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords O-carbamoyltransferase TobZ
publication title The O-Carbamoyltransferase TobZ Catalyzes an Ancient Enzymatic Reaction.
pubmed doi rcsb
source organism Streptoalloteichus tenebrarius
total genus 198
structure length 571
sequence length 571
ec nomenclature ec 6.1.2.2: Nebramycin 5' synthase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02543 Carbam_trans_N Carbamoyltransferase N-terminus
A PF16861 Carbam_trans_C Carbamoyltransferase C-terminus
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3veoA01
3.30.420.350 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3veoA02
3.90.870.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex DHBP synthase DHBP synthase 3veoA03
3LL3A 5BN9A 3CJ7A 3HI0A 4IO8A 4H5WA 4EFHA 1NGFA 3HZ6A 4YDUA 4MO4A 5AFUH 4B1XB 4B1ZA 3MN6A 1SAZA 2V7YA 3CHWA 5BPNA 3VOVA 2P9LB 4IZ9A 4J8FA 1GLBG 5AQOA 2YCHA 3UB5A 4H0XB 4FOIA 3FZMA 2V51B 4FWNA 4HWIA 4DQ8A 3EZWA 1OKJA 2BUPA 4XEIA 4FPAA 4BC4A 4FWPA 2KHOA 3WXKA 1YUWA 4BRGA 3FZFA 3I8BA 5KPTA 3M3ZA 1ZBSA 3FE1A 2GWJA 3DXMB 5F2RA 4E1JA 4JD2B 2NRHA 4BG8A 1K8KA 3EO3A 5KPRA 3G25A 4BR2A 3KZBA 4AM6A 2A41A 2E20A 3FFKB 4RWTA 4M7XA 1U6ZA 3A8YA 3J8AA 1SZ2A 2E88A 2VYPA 4B1UB 4CZHA 3ZEUB 2P9NB 4H03B 4BRAA 3TTCA 5AZJB 3VEWA 3ZX0A 3LDLA 5LY3A 2AA4A 2CGKA 2Q36A 4KBOA 2Q0RA 3BEXA 4C23A 2ZGYA 5AQTA 5JLFA 2ZF5O 4QS8A 1TYQB 3MN9A 5AQZA 2NZTA 3GOIA 3TSPA 1BO5O 3O8MA 4RTFD 2HOEA 3IMXA 4M63C 4ISFA 4BVOA 2NLXA 4Y0WA 4CBWA 1SQKA 4WQ5A 4BR4A 4GY2B 4BRDA 3WXLA 2QWMA 3CI5A 4F9OA 1HKGA 1NGDA 2P9SA 1V4TA 1KAYA 3VEVA 1E4GT 1NGJA 4HTLA 3B8AX 3LDQA 4A61A 1HX1A 3A5NC 3VENA 3O80A 5AZIA 1NGAA 2FF3B 4CD1A 3LM2A 4IWVA 2P9IB 4H5NA 2FSJA 4BR5A 1KAZA 2YI1A 3QFUA 4MLHA 5AR0A 3C7NA 2QWLA 4MLEA 3UKRA 3WXJA 4FWKA 3CQXA 4Z94A 3VEZA 3IUCA 3D7EO 5BPLA 3GBTA 2HMPA 4FOEA 4CZJA 1X3NA 3DXKA 1QQOA 3CJ9A 3ENHA 4M7YA 4EIAA 4PKGA 2P9KB 1R59O 3TSQA 4PKHA 1BA1A 3CIPA 3ATUA 3QFPA 4BRNA 4JHDB 1CZAN 3D2FA 4EHUA 3U9ZA 4RCHA 2E2OA 4PL7A 3KVGA 1NBWA 2DPNA 3WQUA 1T6DA 4CZLA 4B1WB 2E1ZA 4H0YB 4FWSA 3QDKA 4ISGA 3HM8A 3OHRA 1U2VB 3M1FA 5AQVA 3TTFA 1C0FA 2D1KA 1HLUA 1QQNA 1WUAA 3VGLA 1D4XA 2E2NA 2FSNA 2GEMA 2ASMA 3EKSA 4FWOA 4WYBA 4BRQA 4BGAA 3MMVA 5AQUA 3FGUA 3VGMA 4CZFA 5FPEA 1ATRA 4BRKA 5EX5A 2VWBA 1T6CA 4CZEA 3A5OC 4H0PA 4BQZA 1Z6RA 3AY9A 3MN7A 5AQQA 3FR0A 3CJBA 3VF6A 4XH4A 1XUPO 1QZ6A 3VGKA 2A42A 4BREA 3HSCA 4AM7A 1S3XA 3ZETB 3RSEA 3WEEB 2CGLA 5CE3A 4BROA 2P9PA 1C0GA 2GELA 2OANA 4H5TA 2YJFA 1QZ5A 3AAQA 3UKUB 4B9QA 1NGBA 1QHAA 2P9UB 1MA9B 4IJNA 3M6GA 3TPQA 2W41A 1YVNA 1BWFO 4BC5A 1NGIA 3S41A 5AFUA 2QM1A 3O4WA 1GLCG 4I6MB 3SMSA 1GLDG 3VEYA 5AQLA 4WQ4C 3TSUA 2A6AA 3L6QA 4FWMA 4XH1A 1Z05A 3QICA 2D0PA 2IVPA 3DJCA 2A5XA 3I33A 2Q2RA 3O5BA 4BG9A 4QS9A 5AQRA 3DAWA 3W0LA 3A0IX 1RFQA 5AQNA 5AQPA 4BRHA 4FWLA 4YDUC 5AQGA 4A62A 3EKUA 3F9MA 2ITMA 4H5VA 1LCUA 3A5LC 4CD3A 3P4IA 1S22A 3U4LA 3SMPA 4A2BA 2Q0UA 5ELZA 2QWOA 1E4FT 5LJVA 2Q97A 3SJHA 4H0OA 3QB0A 5AQWA 3CJAA 4O8KA 5BN8A 4BQLA 4MO5A 5I9EB 3LDNA 3WUHA 5E84A 5TKYA 4FL9A 1NMDA 3W3DA 5ADXH 2P9LA 3H3OB 4GNIA 3AARA 3BF3A 4ISEA 1HKBA 4DHYA 2Q31A 2CH6A 5AQYA 2YJEA 5BPMA 4FWQA 1NGEA 1K8KB 4BRPA 5EY4A 3ULEA 4JNEA 3H6EA 4CI6A 5JLHA 3MN5A 3FZLA 4NO7A 5AQMA 3U9DA 3ZX3A 3C0BA 3IDHA 3HTVA 1NWKA 5EXWA 3DXMA 3GG4A 2E8AA 4JD2A 1KAXA 5JMVA 2E2QA 2BTFA 1YXQA 3QBXA 3H3NO 1EQYA 4BRMA 3QMLA 5KPZA 2UYTA 4K42A 2FF6A 3FLCO 3R9PA 2QWPA 3ZEUA 3L0QA 2P9NA 2QWQA 4BC3A 4BVPA 1MWKA 2D4WA 5AZJA 5ADXA 3VF2A 4BR0A 1RGIA 1HUXA 1ZXOA 4FO0A 4B1YB 2IVOA 4K25A 1TYQA 4L3QA 4FWRA 1IJJA 1JCGA 3CETA 3TU5A 4WQ4A 4CBUA 1BUPA 2P9SB 4PL8A 3CQYA 2PAVA 3BUZB 4B1VA 3O6WA 1NM1A 5B8HA 3SLCA 3ZX2A 5KQ8A 3BP8A 4BR7A 4PKIA 2CH5A 4EHTA 5AZIB 5AQSA 1X9JA 3JXUA 4H0TB 3C7NB 3H45C 3VETA 3A5MC 3UKRB 4A2AA 1NGCA 4BRIA 4BRCA 4BC2A 1IG8A 2YHYA 1ATSA 4BRLA 4CZKA 1NLVA 4CJ7A 4CZIA 2QW9A 1BDGA 5AQXA 3ENOA 5AQJA 3GDQA 5BREA 4XH5A 1GLEG 3H1VX 3CERA 5E26A 3VEXA 3VERA 3DXKB 3QBWA 3ULEB 4O5FA 1XQSC 4CZGA 2P9IA 4IJAA 1MDUB 5EOYA 3TTDA 1JCEA 5BRHA 3D2FB 3JS6A 5F1XA 1Q18A 2GUPA 2GWKA 3EL2A 1P8ZA 3KHYA 3U8XA 3WXIA 4BR9A 1WOQA 2H3GX 5BRFA 1JCFA 1LOTB 2P9KA 4LC9B 3LDOA 1HPMA 2WUSA 1BOTO 1DGKN 1DKGD 4JHDA 5BRDA 3R6MA 5F0XA 5LJWA 3O1BA 1BG3A 3FZHA 1J6ZA 2Q1NA 1GLJO 5AQHA 4CZMA 1ZC6A 1XC3A 3R8EA 4IXCA 1NGHA 2W40A 2ZGZA 1U2VA 3VF4A 5AQIA 2FXUA 5AQKA 2IVNA 1T44A 3DWLA 1X3MA 3H1QA 1V4SA 3D2EA 3HBTA 3ID8A 5JICA 2F9WA 2I7NA 5KQDA 1Y64A 3H46O 1BU6O 2VCPA 2AP1A 3VTHA 4H0VB 3L4IA 2E2PA 5FPDA 1YAGA 1RDWX 3AAPA 3RSEB 3FZKA 4FSVA 3LDPA 3GE1A 3GL1A 3IFRA 1G99A 2P9PB 4K41A 2PBDA 4DCHA 2IIRA 4K43A 3MK6A 4BRFA 4JN4A 2FLOA 3CJ1A 2I7PA 2E1YA 2QWRA 3O08A 1GLAG 2F9TA 5BR9A 1TUUA 2V52B 1MWMA 3ZETA 2ZWHA 1H1VA 3WEEA 2A40A 4EAHD 1NGGA 2FSKA 1HJOA 3SK3A 1TUYA 1ESVA 3ATVA 2QXLA 3UKUA 4QS7A 4H5RA 1HKCA 2P9UA 2YHXA 3O1WA 4WQ5C 4FPBA 3VPZA 5FPNA 1QQMA 4CBXA 4DB3A 4I6MA 2CGJA 3CJCA 5EVZA 2J4RA 2YHWA 4BGBA 3MDQA 2ASPA 1KXPA 2GTDA 4JAXA 1DEJA 5FPMA 2HF3A 3LM9A 3EN9A 3VEOA 2HF4A 3WT0A 1ATNA 3WQTA 5AQFA 2A3ZA 1GLLO 2QWNA 3BF1A 1GLFO 2D0OA 2EWSA 2ASOA 1BA0A 4NB4A 3D2EB 3VESA 3MCPA 3UE5A 2V7ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1KC8O 3HI0A 4IO8A 3K58A 3HZ6A 3OYFA 2XHBA 4MO4A 3OYIA 1VQ5N 4FJ7A 4RW6A 5BPNA 3VQ8A 4ELUA 3PX4A 1O13A 3TARA 5H1SQ 1NK9A 3FZMA 2V51B 4FWNA 1CXUA 4GV9A 3V81A 1VSIA 4BDYA 4M3TA 1KVBA 4FWPA 4CVNE 1HJRA 2KHOA 4BRGA 3I8BA 5KPTA 1WSIA 1ZBSA 4K0KK 3LDSA 2NRHA 1FKOA 5JS2A 4E7LA 3EO3A 2WOMA 4OX9K 4AM6A 3C6UA 1U6ZA 3J8AA 3DRSA 4NCBA 5GINA 3K0SA 4BDZA 1JXEA 1RT2A 4C8KA 1S5JA 4CHYA 3VEWA 3LP3A 4LF5K 3KLEA 3ZX0A 3ZSXA 3QESA 3V6DA 4FZYA 1RCHA 2Q0RA 5K14A 3J7AP 2ZF5O 4E3SA 5CZ1A 3MN9A 4Q5VA 2NZTA 4RW4A 1Q9YA 3NHGA 1YJNN 4BVOA 4DV5K 3CCQN 3EYZA 3AJEA 2KFZA 4YNQA 1VQ4N 3E9PA 4BWJA 4Z4CA 3CI5A 4CJ4A 3OYLA 1QQCA 3J7YP 1NJYA 3MEGA 2W6LA 2ZM6K 1NJZA 2KLAA 2VWKA 3AA2A 2KKZA 1V4TA 4CESA 1E3MA 4CEOA 1TKZA 2OA8A 4A61A 1HX1A 3SZ2A 5J2PA 3QEIA 4CD1A 4FK2A 3DOLA 4IWVA 3LM2A 4A57A 4H5NA 2FSJA 3E9OA 4BR5A 3OW2M 1KRPA 2G8IA 3BY5A 4CJEA 2QWLA 2NRXA 3UKRA 1S9GA 4JI2K 4IFYA 3WXJA 1YI2N 1UOCA 2ATQA 4KHSA 4YORA 4BACA 1JL2A 1BIUA 3FFIA 4DWIA 1R59O 5FLXO 1TKXA 3ATUA 4CHZA 1VQNN 3QFPA 4YOTA 1K4IA 1CZAN 3D2FA 3U9ZA 1Y97A 1G58A 3KVGA 2DPNA 3WQUA 4CZLA 3HPHA 4ID1A 4ISGA 2DFFA 4JKCA 3K9KA 3TTFA 1ZBLA 1C0FA 4FZZA 4WE1A 4CK3A 4X66K 3ZSOA 4B9TA 1UWBA 2GEMA 5HRSA 4DKWA 4B3MK 2YHAA 3ZSYA 5AQUA 3L2RA 3FGUA 2O8CA 3VQEA 2OYQA 1YTAA 4BRKA 4LH4A 2VWBA 1A5WA 4H0PA 4I2PA 4CGGA 1Q9XA 3AY9A 2X6NA 2KW4A 4C8LA 1XUPO 2UXBK 4CHQA 2HHTA 1VSDA 4DR5K 4J2EA 2EX3A 4CIGA 3KD1E 1Q82O 2G8KA 4W5QA 3RSEA 4DFJA 2IOCA 1WAJA 1VHXA 2JWKA 2FBYA 2YNFA 3LP1A 4FVUA 4E1BA 4AHVA 4CFCA 5M1PA 1JLGA 4EP4A 4DR2K 4CGJA 1QHAA 2UUAK 4IJNA 4IOXA 3M6GA 4MFBA 1JXBA 1HNVA 1M1KO 3VQPA 5IWAK 2HHXA 1YJ9N 1MU2A 4I6MB 4DMNA 4B3TK 4DSIA 4GV6A 1VSLA 3AVJA 1XHXA 3L6QA 3LALA 4JKFA 4CJPA 4CHPA 4XIUA 3NGIA 1PVYA 4QS9A 5AQRA 5I3UA 2HNDA 3KK2A 3CFOA 4I14A 5DM6L 1BCOA 5AQPA 1XI1A 3CCEN 4WCEL 4LF7K 4I2QA 4DTPA 3LANA 3JAMO 3LP0A 1L5UA 1W7AA 4CJUA 3K9JA 4CJSA 3AO5A 3AVLA 3U4LA 4DTMA 3MAQA 1IBMK 4WFBL 4CJQA 5C2DA 1ASUA 5LJVA 3THXA 4DTNA 3CJAA 3I0SA 3MXMA 3MX5A 5BN8A 3MIOA 3V1RA 3IRXA 3LDNA 3DLBA 4O0IA 1VQKN 5TKYA 4FL9A 3OJUA 4DV1K 1JJ2M 3SBGA 1RTJA 1NMNA 3AARA 3ENBA 1HKBA 4DHYA 2CH6A 5AQYA 1F21A 2YJEA 5BPMA 4FWQA 1NGEA 5D3GA 3THYA 3ZT4A 1QHTA 1LAWA 1D8YA 1HQEA 3ULEA 4IDKA 3EE9A 4CI6A 5JLHA 3AVFA 3HOSA 4A59A 3TAGA 3U9DA 1SS6A 3G10A 3HTVA 3UIQA 3KIOA 3P1GA 5JMVA 4QOZB 2BTFA 1DT9A 3QBXA 3CCUN 3H3NO 2E6MA 4LH5A 4OGCA 3OYEA 3B6OA 2UXCK 3L3VA 2UYTA 2QWPA 4IFVA 2F4VK 2QWQA 1SUQA 4C1NK 3IS9A 4KRFA 3NFAA 5JS1A 3LWLA 5HBMA 1RGIA 4BE2A 2QXFA 2DTUA 4CJTA 1JCGA 3ASMA 3H08A 3P5JA 4M3WA 5JVHL 2NRZA 2ZE2A 4LSNA 2ZJQL 4IOAL 1QVGM 1T7PA 1D9FA 3AVKA 4M3UA 2F8SA 4CGFA 4H0TB 4NXNK 1VSHA 3C7NB 1WAFA 3H45C 3VETA 4UQGA 4FW2A 4W5RA 2KFNA 1FK9A 4BC2A 1IG8A 4BRLA 4CJLA 4CJ7A 2QW9A 4DTXA 5AQJA 4XH5A 1GLEG 3H1VX 3CERA 3QBWA 3SV4A 1WNSA 1S72N 4AILC 1IEZA 4FJGA 4FCYA 1N6QA 4NXMK 1JCEA 5BRHA 4JS4A 3HYFA 4J2DA 5F1XA 2GWKA 1VQ9N 1P8ZA 4OKJA 1O1WA 1WOQA 1RTHA 2GX9A 1LOTB 2WUSA 1QVFM 1RBRA 4OJRA 4YOUA 2QA4N 3OYDA 3R6MA 1NU0A 3O1BA 4N47A 1J6ZA 3H07A 1ZC6A 1YITN 1K6YA 1REVA 3PSFA 2MX1A 3VF4A 3QLHA 1X3MA 3IAYA 3D2EA 1RTDA 3ID8A 4JI3K 4YOYA 1NK0A 2F9WA 2I7NA 1Y64A 2IAJA 3CC4N 2PZSA 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 5E84 A;  5IT9 O;  3W3D A;  3OYG A;  2P9L A;  3H3O B;  3JYT A;  1KVA A;  1OVY A;  1JLC A;  4JV5 K;  4JLH A;  4DLE A;  5C42 A;  3AVI A;  4L8R B;  4CF8 A;  1XWL A;  2KQ2 A;  5AQM A;  4FLZ A;  3C0B A;  4JI6 K;  2RIU A;  1HRU A;  2VGN A;  2RF2 A;  5EXW A;  5HL7 L;  3GG4 A;  4JD2 A;  4DFP A;  2E2Q A;  2WON A;  3G0Z A;  1ILY A;  3SQ1 A;  1EQY A;  1S1X A;  4BRM A;  1B9D A;  3VQB A;  1L3U A;  1JLB A;  5KPZ A;  4CEA A;  4K42 A;  3FLC O;  3R9P A;  4WF9 L;  4FLU A;  4KI4 A;  1MWK A;  2D4W A;  4H4O A;  1IBK K;  4IEE A;  1BQM A;  1HNX K;  1GOA A;  1IKV A;  5J2N A;  4GKJ K;  3ZT0 A;  2HBK A;  4WQ4 A;  3BUZ B;  3HRG A;  3NH0 A;  3RMC A;  3RMA A;  1VRU A;  4LSL A;  5KQ8 A;  4LF6 K;  1A5X A;  2CH5 A;  1I94 K;  4F3O A;  1RT4 A;  5AQS A;  2JLE A;  2YV0 X;  3ID6 A;  4JKH A;  3A5M C;  1ASV A;  3UKR B;  4BRC A;  3OY9 A;  4Y1C A;  1KLM A;  4CJF A;  4IG3 A;  4DV4 K;  1LWE A;  1BDG A;  1VQP N;  3NMU A;  3ENO A;  3S3M A;  5J1E A;  1DLO A;  3QO9 A;  5J2M A;  3A2F A;  5LMU K;  1XNR K;  2VG5 A;  4O5F A;  5KGX A;  4CZG A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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