3VEVA

Glucokinase in complex with an activator and glucose
Total Genus 180
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
180
sequence length
455
structure length
450
Chain Sequence
ENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase activator
molecule keywords Glucokinase
publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 180
structure length 450
sequence length 455
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vevA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3vevA01
2P9LA 1Q18A 3D2EA 3UKRB 1ZXOA 4BRAA 2CGKA 4BR5A 4DHYA 5FPEA 4K42A 3ZEUA 2Q2RA 3A5NC 3QBXA 3VENA 1BA1A 3WUHA 2OANA 4H0XB 4B1VA 1U6ZA 1RGIA 4FPBA 1X3NA 4BR0A 1NWKA 1LCUA 3IUCA 4CD3A 4A2AA 4O8KA 1GLFO 1JCFA 2HMPA 2QXLA 3MDQA 1NGGA 4BROA 4BRHA 2FSJA 2PAVA 2V7YA 1XC3A 5EOYA 1TYQB 3HI0A 4FL9A 2YI1A 3M3ZA 4FWLA 4H0TB 4XEIA 4CZKA 2A42A 5AZJB 1S3XA 2D0OA 3DAWA 5BRDA 1GLEG 1T6CA 4EHUA 2FSNA 3GG4A 3GBTA 3CJ1A 4FOIA 4KBOA 3H3OB 5AQTA 3RSEB 4IJAA 4FWKA 1MDUB 4CD1A 4JD2A 1SQKA 4BRDA 1EQYA 4H03B 5AQMA 3EKUA 4BREA 3AAQA 5KPZA 4BRKA 2A6AA 1QQOA 3ZX3A 2IIRA 2YHWA 5BRHA 3BF3A 1DEJA 4BRIA 5KPRA 2P9LB 4CZIA 1KXPA 3D2EB 2DPNA 2WUSA 3GL1A 3C7NA 4I6MA 4PKIA 2IVPA 1ATRA 1P8ZA 3WEEA 5LJVA 4EHTA 5AQPA 5CE3A 3ZEUB 1Z6RA 3LDOA 1HX1A 3ULEA 2ZF5O 1GLJO 2QW9A 4YDUA 3CJ7A 3VPZA 4L3QA 4FOEA 4BVOA 1MWKA 4WQ4A 4H5VA 4FWMA 4AM6A 3MN7A 1YAGA 1QQMA 3CJAA 2BUPA 4BRNA 5EX5A 4ISGA 4B1XB 5AQUA 5AFUH 2GEMA 2D1KA 1NGAA 4K25A 5AQGA 4BRMA 1C0FA 2V52B 3DXMA 3H1QA 3H3NO 4J8FA 4WQ4C 3IMXA 2D0PA 3BEXA 4K43A 4WYBA 5AFUA 4JD2B 3R9PA 1ATNA 3EO3A 2F9WA 4FSVA 5AQJA 4FWNA 2E8AA 3FE1A 1NGBA 4CI6A 1YUWA 1HPMA 5AQIA 2HOEA 3LDNA 2FSKA 3DXKA 1NBWA 3QDKA 4I6MB 3C7NB 3JXUA 5KPTA 3P4IA 4B1ZA 5JLHA 4QS8A 3WEEB 4QS7A 1SZ2A 3FZKA 4RTFD 4DQ8A 4C23A 3ULEB 1K8KA 1GLCG 4MLEA 1JCEA 1BWFO 3D2FA 3FZHA 1KAZA 1NGFA 3AARA 2W41A 2VWBA 3U8XA 5TKYA 3ZX0A 1BO5O 1XQSC 1KAXA 4H0YB 1BA0A 4BG9A 5BPMA 1RDWX 5AQLA 4BR7A 4CBUA 1S22A 5F2RA 2GTDA 2P9KA 5EY4A 2ASPA 4BC2A 3TU5A 4JAXA 4BR4A 2YCHA 5LY3A 3WXJA 3DXMB 3VGKA 3LM2A 3FR0A 2YHXA 3WXIA 3B8AX 5FPDA 3S41A 4CZJA 2Q97A 3FFKB 5AQXA 1YXQA 3VGMA 3EZWA 3OHRA 3D7EO 4RCHA 3WXKA 1NLVA 5E84A 2GUPA 2E2NA 2VYPA 3U9DA 3J8AA 1YVNA 3ATUA 3A0IX 4XH1A 4DB3A 5AQFA 3DXKB 2HF3A 3ATVA 3KHYA 3SJHA 4FWOA 4MO5A 3H6EA 3O08A 4IZ9A 3VF2A 2F9TA 5BR9A 2QWMA 3CJ9A 1TUYA 4CZHA 1K8KB 4H5NA 3O4WA 5E26A 2P9NA 4O5FA 3D2FB 1TUUA 3L6QA 3HBTA 2GELA 1OKJA 2E1YA 1QQNA 2ZGYA 1NM1A 3LDLA 4WQ5C 3VEVA 5B8HA 3KZBA 5BN8A 5BN9A 4BR2A 3CI5A 4PKHA 4AM7A 2Q1NA 2P9KB 4NO7A 1WUAA 1NGDA 3LDQA 4CZGA 4CBWA 1T44A 5BPNA 1Z05A 2ZGZA 3ZX2A 4FWQA 4JN4A 3O6WA 4XH5A 2CGLA 2E2OA 3WQTA 4M63C 4B1YB 1IG8A 2Q31A 2UYTA 3VETA 5AQNA 3LM9A 2D4WA 2VCPA 1X3MA 3MN5A 5AQOA 1KAYA 3ZETA 2YJEA 4IXCA 4CBXA 1NGCA 1BG3A 4M7XA 3MK6A 4FWRA 5I9EB 1V4SA 3SMSA 3C0BA 4EAHD 3HM8A 3R8EA 3BUZB 1GLLO 3FZMA 2CGJA 3WT0A 1DGKN 3CETA 5BRFA 2P9IA 3FZLA 4NB4A 5AQVA 5AQRA 1QZ5A 1SAZA 4Y0WA 3O8MA 4BGAA 4K41A 4PL7A 2P9NB 4CZFA 1J6ZA 3UE5A 4ISEA 1GLBG 4PKGA 4FWPA 1HUXA 5ELZA 4JNEA 1H1VA 4BRCA 1V4TA 3CIPA 3MCPA 2QWOA 5AQKA 4H0PA 4CZEA 3BF1A 2CH6A 2H3GX 3SK3A 4EIAA 2QWNA 1GLDG 2GWKA 1JCGA 3VF6A 3MN6A 4BC5A 3QBWA 4B1UB 3H46O 4EFHA 2PBDA 2A5XA 3CJCA 1NGJA 3FZFA 4BQZA 2E2QA 4H5TA 1E4FT 3SMPA 3A5MC 3MMVA 5AR0A 3BP8A 3VEYA 2A3ZA 3ZETB 4E1JA 5BREA 3CQYA 3I33A 1WOQA 1ZBSA 2AP1A 4B1WB 2V51B 3I8BA 5AQYA 4JHDA 4H5RA 3VOVA 4FO0A 2FLOA 3LL3A 5KQDA 2QWLA 5BPLA 4Z94A 3O80A 4GNIA 3VEWA 3W3DA 4M7YA 3HTVA 1HKCA 2QWQA 3EN9A 1D4XA 2W40A 2P9IB 3QMLA 5AQWA 1CZAN 3A5OC 2QWRA 2NRHA 2NZTA 4PL8A 1LOTB 3EKSA 4FWSA 4GY2B 2V7ZA 3FLCO 3GOIA 5AQSA 3R6MA 2P9SA 3CHWA 1T6DA 5FPNA 1ZC6A 4WQ5A 3W0LA 5LJWA 4BRPA 2FXUA 3DJCA 2E20A 3QB0A 3SLCA 4A62A 2P9PA 2J4RA 3FGUA 4BC3A 5AZIA 1U2VA 3MN9A 2ZWHA 2P9UA 2E1ZA 2A41A 3M6GA 3ENOA 3VGLA 3ENHA 3UKUA 3U9ZA 1HKGA 3VESA 1NGHA 3GE1A 2YJFA 4BC4A 2E2PA 4RWTA 3HZ6A 3A5LC 3QFUA 3UB5A 4A2BA 4JHDB 5JICA 5EVZA 3QFPA 4BVPA 3VEOA 3AAPA 3CERA 3O5BA 1DKGD 1E4GT 1BDGA 1GLAG 3U4LA 4BG8A 3G25A 1MWMA 1XUPO 4DCHA 4ISFA 1X9JA 4CJ7A 3EL2A 3IDHA 1BOTO 3L0QA 3O1WA 4BRLA 2ITMA 2ASOA 3VEZA 4BQLA 3DWLA 2P9SB 1MA9B 2QWPA 3KVGA 3L4IA 4BRQA 1QHAA 3WQUA 1BUPA 2HF4A 2Q36A 3IFRA 3VEXA 4BR9A 3UKRA 1C0GA 4A61A 5JMVA 2A40A 1HKBA 3O1BA 2P9PB 1BU6O 5AZIB 1ATSA 2CH5A 3JS6A 1U2VB 5AQHA 3VERA 4HWIA 2P9UB 4H0VB 4YDUC 3GDQA 5FPMA 3M1FA 2KHOA 5ADXH 3HSCA 4CZLA 4XH4A 4BRFA 4IO8A 2Q0RA 5EXWA 3UKUB 2YHYA 4QS9A 3CJBA 4BRGA 5KQ8A 3VF4A 2Q0UA 1G99A 4IWVA 3AY9A 3ID8A 3LDPA 4H0OA 3H1VX 5ADXA 1TYQA 1ESVA 2FF3B 2AA4A 2ASMA 3CQXA 2I7PA 4B9QA 1HJOA 5AZJA 2NLXA 5F0XA 1NGEA 1Y64A 3QICA 1RFQA 5JLFA 4MLHA 2BTFA 4FPAA 4IJNA 4LC9B 3F9MA 3WXLA 4F9OA 1NGIA 2QM1A 2EWSA 3TPQA 2FF6A 4BGBA 2E88A 1IJJA 3RSEA 2IVOA 5F1XA 1QZ6A 4HTLA 4MO4A 2IVNA 4H5WA 2GWJA 3H45C 5AQZA 1NMDA 2I7NA 4CZMA 1R59O 3A8YA 1HLUA 5AQQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JKAA 1RDBA 4CEOA 1RTHA 3IRXA 1Q18A 3I0SA 1J9AA 3D2EA 3UKRB 4CFDA 2Z1IA 1HNXK 2ZJQL 3OS0A 3OYKA 1EXQA 2HHXA 3D6RA 1VRUA 3G10A 1W97L 1BA1A 1WSGA 4H0XB 1U6ZA 4JKDA 3IUCA 3S3MA 4DR1K 3RMAA 1XNQK 4ZTJA 2WBNA 3OYDA 1QVGM 5CZ1A 2IDOA 1K73O 3DLRA 1TYQB 4FM0A 2YI1A 4H0TB 5AZJB 4OX9K 1VQ7N 3CM5A 3LPUA 3N4QA 4EHUA 2O8DA 2OZSA 2HBKA 4DV7K 3Q7BA 3L3UA 3QNNA 1NKBA 1EWRA 4FOIA 3NDKA 3H3OB 4K8ZA 4IJAA 1JLAA 4DSFA 4JD2A 4JI7K 3O9RA 3ZT1A 1L5UA 3AA5X 4BRDA 1EQYA 2G8KA 4KHPK 2A6AA 3ZX3A 2IIRA 3O9TA 2P9LB 4CZIA 1KXPA 3M8QA 1Z25A 3CPEA 3ZT3A 3ASMA 4EP5A 3WEEA 3ZEUB 1Z6RA 3LDOA 4F2RA 3ULEA 4AHTA 3NCIA 4BDYA 5IT9O 4DQRA 4CF1A 4DTMA 3AVCA 2OTLN 2O8CB 2YNFA 4WQ4A 4ID5A 4H5VA 3ZSWA 1YAGA 5CYQA 1P90A 3V9ZA 2DFFA 5EX5A 1K6YA 2GEMA 1NGAA 3VN5A 2V52B 4KHYA 3WNGA 3T1HK 2QTDA 4DUYK 4E7HA 3R9PA 1ATNA 3ULDA 3EO3A 1KVCA 4I2QA 3TANA 3HPOA 1HQEA 5LMUK 1NGBA 4JKBA 1NK6A 4F3TA 1YUWA 5HRPA 4J2AA 3QDKA 4I6MB 5KRSA 4FJMA 3JXUA 3F9KA 2JLEA 5JLHA 1J54A 4J2BA 2RKIA 3FZKA 1K8KA 2O4IA 3M8RA 2UXBK 2KW4A 2EHGA 2HHQA 3O4QA 4X62K 3VQQA 5TKYA 5D3GA 1XQSC 1NJYA 3OYEA 1BA0A 5BPMA 4FK4A 4DTJA 3G4SN 3RRGA 5EY4A 4DR5K 1S1UA 3T1AA 2P5OA 2ASPA 3K5OA 4DTXA 3O3HA 4B9MA 3LZJA 1NOZA 1T03A 3FR0A 2YHXA 3QERA 4CJ5A 4FJ5A 1L3TA 1VAZA 1Y97A 3AVJA 3V1RA 3VGMA 3AVMA 3OHRA 2BE2A 2FBYA 3AGRA 1NLVA 3O3GA 3J8AA 4ZTFA 1WAFA 4CF8A 4XH1A 4DB3A 1C0UA 3K5LA 3AVKA 1T3VA 5AQFA 3SUQA 4DQPA 4Y1CA 3EEQA 5FROA 3ATVA 3KHYA 3SJHA 3PX4A 1I94K 3H6EA 4Y1DA 3O08A 3KIOA 4KH6A 3VF2A 1NNEA 2G8UA 2VG6A 1WLJA 4K8XA 3RMBA 2DFHA 3OS1A 3QEPA 1QQNA 1BHLA 3THXA 2UXDK 2GBZA 4PKHA 3EY1A 1BIZA 3CXCM 3DRSA 3DLKA 1S5JA 1WUAA 1NGDA 4Q5VA 1REVA 4CZGA 1T44A 1XMOK 1VSEA 4CJ4A 4FWQA 4GV3A 4XH5A 1EO1A 5J2PA 1RILA 2P51A 5FRMA 3PSIA 3THYA 2VCPA 4CF2A 5AQOA 3HL8A 1VK0A 2IS3A 3HO1A 3ZSXA 1CXUA 2OTJN 1HYVA 1RT3A 4CGIA 4EAHD 4IO9L 3R8EA 5KRTA 3G71N 2FBXA 1GLLO 4LF9K 1TAQA 5AQVA 5AQRA 3DLBA 3VQ5A 5C42A 3NFAA 3O8MA 3VQBA 4A59A 4AHSA 2QXFA 2P9NB 4ELUA 1GOCA 3SZ2A 4PKGA 3DRPA 1H1VA 3J81O 4DR4K 3VA0A 4DV1K 2OA8A 3CIPA 1YHQN 3AO2A 4H0PA 3JAMO 1HYZA 2H3GX 4NCBA 3VQ9A 4DU3A 4V19S 3QBWA 2LSNA 3H46O 4CHPA 2VWJA 4DS5A 3M5RA 4H5TA 2UXCK 3O4NA 1E4FT 5HP1A 4CJVA 4JI4K 2W6KA 4R79A 3OYGA 1IBLK 1CZ9A 1KCFA 5AR0A 4DQQA 3OYHA 1Q9XA 1S6QA 3I33A 1WOQA 1ZBSA 5DMRA 5AQYA 4JHDA 3HVTA 3LL3A 1FK9A 3NF6A 5BPLA 2XY7A 1FKOA 1BI4A 1Q81O 4M7YA 4F3OA 1X9WA 1YITN 2VG5A 1D4XA 5I3UA 2P9IB 3B6OA 3A5OC 1D8YA 1NKCA 4PL8A 1T05A 1TL1A 5C10A 2YHAA 3GOIA 3AVBA 3RMDA 2QKBA 2O8FA 1T6DA 1X9MA 5LJWA 3SCXA 1YF5L 5CY4A 2FXUA 3DJCA 5SWMA 3AVNA 3SLCA 4NYFA 1TKTA 4KB1A 3QLHA 2VG7A 3AGKA 4AHRA 1FXXA 2YNIA 4WFBL 1HNVA 3TAMA 4WFNL 3VESA 2O8BA 1ASWA 2YJFA 1VQ8N 4BC4A 3NF9A 2E2PA 4O5BA 4LF4K 4W5NA 1IBMK 3CERA 1DKGD 5C2DA 1BDGA 5CHIA 3KK1A 4FJ8A 2O8EA 4KO0A 4CK2A 1NK4A 1D5AA 3U4LA 1NU0A 1C0TA 4M45A 1LAVA 2BDPA 4ISFA 4Z4FA 3KTQA 5M1OA 3SPZA 3IDHA 1C1CA 3L0QA 4FLWA 4JKEA 4IKFA 3S9HA 5DK5A 2ITMA 3J7AP 3VEZA 4BQLA 3VA3A 3DWLA 1UA0A 1MA9B 2QWPA 3L4IA 3IFRA 3VEXA 1C0GA 1QS4A 3PUFA 2XY8A 4HWIA 1FJGK 2P9UB 1RT7A 4YDUC 4B9SA 3GDQA 4OKEA 3V9SA 1KQSM 3OBYA 4DV0K 4CZLA 4XH4A 4C8MA 3UKUB 2YHYA 1VQ4N 3ZSRA 4QS9A 3ENBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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