3VF6A

Glucokinase in complex with glucose and activator
Total Genus 177
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
177
sequence length
457
structure length
451
Chain Sequence
HHENLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGESVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase/transferase activator
molecule keywords Glucokinase
publication title Insights into Mechanism of Glucokinase Activation: OBSERVATION OF MULTIPLE DISTINCT PROTEIN CONFORMATIONS.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 177
structure length 451
sequence length 457
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2012-01-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vf6A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3vf6A01
2FLOA 5ADXH 2HF4A 5AQHA 1BA0A 1ZBSA 5ELZA 5KPRA 2GWJA 5KPTA 3UE5A 1NGIA 3CI5A 4BRHA 4CZHA 5AQIA 1Z6RA 2EWSA 3AARA 3SLCA 3QICA 2I7NA 4JD2A 3BUZB 3RSEB 4BR9A 4H0OA 2OANA 2P9SA 3MN5A 2J4RA 2VWBA 3VENA 1BUPA 4EIAA 1TYQB 2D4WA 4AM7A 1WUAA 5AQKA 1YAGA 3QFPA 2FF6A 3A8YA 5B8HA 1JCFA 4IJAA 1KAZA 3H3NO 2PBDA 3QMLA 3C7NB 2ASOA 3O80A 4DHYA 1GLCG 4JHDB 4QS7A 3CIPA 5EY4A 2Q97A 3DJCA 5TKYA 1P8ZA 4O5FA 1HKBA 3O6WA 5AQUA 4FWLA 3ZX2A 2A5XA 1X3NA 3ZETB 5EOYA 2V7YA 3LDLA 2E1ZA 1G99A 3O4WA 2FXUA 2F9TA 1NGGA 2CGJA 3O5BA 3ZX0A 2GELA 1GLBG 4BR4A 1NM1A 2AA4A 3L0QA 3FZKA 5JLFA 4A2BA 4XEIA 1NWKA 4RTFD 5BPMA 2YJFA 1XC3A 1NGJA 4RWTA 4DQ8A 2QXLA 4M63C 4CZMA 4BVOA 5JICA 3MN6A 4FWRA 5KQ8A 3WXKA 4MO5A 4FWPA 2HOEA 1GLFO 3M6GA 4JD2B 4Z94A 5AQXA 2P9SB 3UB5A 3SMPA 3CJ7A 4BRMA 4BR2A 1E4GT 2YHYA 1DEJA 3W0LA 2E2PA 4WQ4A 5EXWA 5ADXA 3SMSA 2VYPA 3VGLA 4JNEA 3CJBA 2GTDA 5AQZA 3H1VX 5FPMA 3WQUA 2FSJA 3BEXA 4BREA 3A5LC 3DWLA 4I6MA 2V51B 1BO5O 1OKJA 4MO4A 4PKHA 3UKRA 4EFHA 4CD3A 1EQYA 3JS6A 2ZWHA 3TU5A 3A5NC 3R9PA 3VF4A 3DXKA 2HMPA 2D1KA 5AQRA 2CGKA 3GE1A 2I7PA 3HBTA 5AQTA 1WOQA 4CZLA 3D2FA 3EKSA 3FGUA 2P9IA 1ATNA 2A6AA 2BTFA 4CBUA 1YXQA 2QWQA 4BVPA 4BRNA 1S22A 2IIRA 3G25A 3FE1A 1QHAA 1H1VA 1SAZA 2ZGYA 3WXJA 4C23A 4IO8A 1R59O 2P9KA 4FWOA 4ISFA 4IZ9A 2YCHA 3AAQA 5BN8A 3HSCA 2H3GX 2BUPA 2P9UA 3FR0A 3A5OC 4MLHA 3GL1A 4A62A 1V4SA 3ENHA 1RDWX 5LJWA 3O8MA 1D4XA 1HPMA 4XH4A 3ZX3A 4CZKA 1BDGA 1MA9B 5AQSA 5CE3A 5F2RA 4H0YB 4BQZA 1RGIA 3QBWA 4BR0A 5FPDA 1J6ZA 3U4LA 1KAXA 5BRHA 4B1XB 5AQGA 3CJ1A 4I6MB 2CH5A 4K25A 4FWMA 4ISGA 4BRFA 3ATVA 3UKRB 4FOEA 4BC2A 5LY3A 3GOIA 3WXIA 3U8XA 1T6CA 4CBXA 4CBWA 5AR0A 3DXKB 1JCGA 2NRHA 4YDUC 4BG9A 3MCPA 4FWNA 3EKUA 2QWPA 3FFKB 4CZEA 1NLVA 2QWLA 3QFUA 3D2FB 2P9IB 2ZGZA 1Z05A 1NMDA 4FWQA 1IJJA 4BRQA 4B9QA 3M3ZA 4FL9A 3VEVA 2PAVA 2P9NA 3HTVA 3OHRA 3QB0A 4CZJA 1X9JA 3MK6A 3U9DA 1SQKA 4FPBA 3MN7A 2AP1A 4A61A 2A42A 1C0FA 2P9KB 3L4IA 2E8AA 3SJHA 4CJ7A 4O8KA 2P9UB 4K41A 1HKCA 4FWSA 2CH6A 5FPNA 4WYBA 5I9EB 3VEZA 3QDKA 2Q36A 3LDOA 2IVPA 5AQNA 3VPZA 5AQYA 1GLLO 1TUUA 1ZC6A 4KBOA 5KQDA 4M7XA 2A3ZA 3A5MC 3H46O 4H03B 4K42A 3CQYA 4DCHA 1QZ5A 2E88A 4WQ5C 3VEYA 1HX1A 2E1YA 4QS8A 5LJVA 3D2EA 5AQJA 2QWRA 4H5NA 3W3DA 4XH1A 3VESA 1GLAG 5JMVA 1NGAA 3R8EA 4H0XB 3QBXA 3AAPA 5KPZA 1XUPO 1JCEA 5E26A 3M1FA 3O1WA 1IG8A 4H5RA 4BRGA 3IMXA 2ASPA 2W41A 5AQVA 3HZ6A 2E2OA 3WQTA 3ZEUA 3ATUA 5FPEA 2P9NB 4BRPA 5AZIA 3H1QA 4BRIA 3U9ZA 2ITMA 1C0GA 5AQWA 1BA1A 5E84A 3O1BA 2QWMA 1ATRA 3VETA 4FPAA 5BPLA 3SK3A 4AM6A 2FF3B 2FSNA 4H0TB 3CJCA 4FWKA 3VEXA 3TPQA 1BWFO 3GG4A 4BC4A 3J8AA 1YUWA 1KAYA 5AQMA 3B8AX 2QW9A 4M7YA 2DPNA 3P4IA 3BP8A 3UKUA 3ULEA 4LC9B 1U2VA 4PL7A 5AZJA 5BRFA 3KVGA 3H6EA 1ATSA 4H0PA 2ZF5O 5AQFA 1U6ZA 2A40A 1NGBA 2E2QA 1NGHA 1QQNA 4FOIA 3D2EB 3AY9A 3HM8A 3IDHA 4FSVA 4B1YB 2V52B 4XH5A 4CI6A 4NB4A 3CJ9A 3ID8A 4MLEA 4CZFA 5BR9A 4GNIA 3KHYA 2QM1A 5BN9A 5EX5A 3HI0A 3CJAA 2IVNA 3BF1A 1LOTB 1QQMA 3F9MA 3ZEUB 2D0OA 3EO3A 2VCPA 5JLHA 2YI1A 1LCUA 4GY2B 3S41A 1HLUA 4E1JA 2F9WA 1V4TA 2YJEA 5AZIB 3H45C 2NLXA 4HTLA 4EAHD 3FZHA 4H5VA 4EHTA 4HWIA 1K8KA 1T44A 1YVNA 4FO0A 4L3QA 5AFUA 3EN9A 3L6QA 4QS9A 3A0IX 4BRAA 2QWNA 3VEOA 2HF3A 1TUYA 3GDQA 1NGFA 1NBWA 3MMVA 3WT0A 3EZWA 1Y64A 2Q31A 4BR5A 4EHUA 3O08A 4PKIA 2Q0UA 4B1UB 3VF2A 2P9LA 1SZ2A 3UKUB 3ULEB 2UYTA 2E20A 1U2VB 3R6MA 5AZJB 2V7ZA 3CHWA 1NGDA 4B1ZA 1XQSC 4BC5A 1MWMA 4F9OA 4PL8A 4WQ4C 1Q18A 4J8FA 3DXMA 3GBTA 1HJOA 5BRDA 5F1XA 1ZXOA 2IVOA 4IXCA 1BG3A 1MDUB 2P9PA 4YDUA 4IJNA 3WEEA 4JN4A 2E2NA 3MN9A 1CZAN 2YHWA 3CERA 4CZGA 3VF6A 4JAXA 1KXPA 3D7EO 3VEWA 1HKGA 4K43A 1X3MA 2GEMA 3DAWA 3IUCA 3VGKA 3I33A 5AQLA 2Q2RA 5AQQA 5AFUH 3FZMA 1E4FT 3KZBA 4H5WA 1RFQA 2A41A 2Q1NA 5F0XA 3CQXA 1T6DA 3LM2A 3LDNA 4CD1A 3FZLA 3LM9A 1K8KB 4BC3A 4NO7A 2GUPA 3LDQA 1BOTO 3H3OB 4BR7A 1ESVA 1BU6O 2WUSA 4B1WB 1S3XA 4BGBA 3RSEA 4BRKA 4BRLA 1GLJO 4Y0WA 3MDQA 4PKGA 3LDPA 5AQOA 4BG8A 1QZ6A 4CZIA 4A2AA 4BQLA 2P9LB 4B1VA 3IFRA 1TYQA 2CGLA 5BREA 5BPNA 3LL3A 4BROA 1HUXA 3CETA 2Q0RA 2KHOA 2FSKA 3ENOA 4WQ5A 3WUHA 4IWVA 1MWKA 3EL2A 4RCHA 3DXMB 4ISEA 1GLDG 4BGAA 2W40A 4DB3A 2YHXA 3C7NA 2QWOA 5AQPA 2NZTA 4JHDA 3FZFA 3VERA 2P9PB 4BRDA 2D0PA 3BF3A 3WEEB 4H5TA 3ZETA 1GLEG 4H0VB 2ASMA 3VGMA 3JXUA 5EVZA 1DKGD 1NGEA 2GWKA 3I8BA 3WXLA 3FLCO 1DGKN 1QQOA 4BRCA 1NGCA 3VOVA 3C0BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4XIUA 2HHUA 3L4QA 3M8PA 1BA0A 2VG6A 1NJZA 1KD1O 4JI8K 1QVFM 4IEIA 2GWJA 4CESA 2XO7A 1LWFA 2P1JA 3CI5A 1QE1A 2UUCK 4KI4A 1S5JA 3AARA 3OYCA 1LWCA 3QICA 2I7NA 4JD2A 2VQFK 3RSEB 4DSLA 4C8LA 2P9SA 4DSJA 2HVHA 3VENA 4Y1DA 5AQKA 3EE9A 3A8YA 3VTHA 4YOXA 4J2DA 1BIUA 1JCFA 2A1SA 5C10A 1KAZA 1Q9XA 1SS6A 2W6LA 3QMLA 3C7NB 3K0SA 3O80A 4DHYA 4F3OA 5C12A 1VQ8N 4CK3A 4FLTA 3R1XA 3DLGA 5TKYA 3ZX2A 5AQUA 2A5XA 3LP0A 3J81O 1X3NA 3ZETB 2Z1JA 5EOYA 3AA3A 3LDLA 3VQ6A 4CJ3A 3AV9A 1CXUA 4CGDA 3O5BA 3J80O 2OYQA 3AVGA 3JAMO 1NM1A 1G15A 3DLRA 2ZE2A 3AGKA 4HUFA 1VSLA 4OJRA 1YVUA 4OLBA 5M1QA 1NWKA 4DV6K 1M90O 3I0SA 4RTFD 2HBLA 1C1AA 2YJFA 4I7FA 4FZZA 4CZMA 4BVOA 5JICA 3MN6A 4FWRA 1U48A 3OYHA 4FWPA 1LAWA 1P90A 2B6AA 4JD2B 2P9SB 3F5TA 3CD6N 4DQRA 4LF5K 1EKEA 2KFZA 5M1PA 1I39A 4JKDA 4OPKA 4JI5K 2VYPA 3VGLA 4DTNA 5AQZA 3H1VX 2FSJA 1F21A 3BEXA 4CJPA 1YT3A 3DWLA 2V51B 1MU2A 3C95A 1BO5O 4EFHA 4CD3A 1I94K 1EQYA 4OGEA 3FFIA 4J2EA 3A5NC 1NK6A 3SV3A 4DSEA 4CFCA 3OYLA 2HNZA 2I7PA 1KC8O 1YJWN 1NJIO 1LWEA 4GKJK 1ATNA 3THXA 2A6AA 4LH4A 4DV5K 4CHQA 4DSFA 4K8ZA 3CM6A 2O4GA 1S22A 1SUQA 3G25A 1H1VA 1LW2A 5CZ1A 3KLIA 4ISFA 2YCHA 3E01A 3HSCA 1NMNA 4MLHA 1Q7YO 1OH6A 3AGRA 3ENHA 3OJUA 5LJWA 4B9NA 1D4XA 2YNGA 3QEPA 4M3TA 4H0YB 2F8SA 3QBWA 4KHNA 3AO4A 3PSFA 4C8MA 5FPDA 5BRHA 1KAXA 4FM0A 4IEEA 3N4PA 3TAPA 4LF4K 3D45A 4K25A 2HBJA 3IKMA 4FWMA 4BRFA 4FOEA 2Y1IA 1T6CA 3K2PA 1CZBA 5AR0A 4BG9A 4CGIA 1KRPA 4DSKA 1NLVA 3RRGA 2DTUA 2VG7A 3KTQA 4FWQA 3THXB 4JKBA 4W5RA 3EYZA 2P9NA 3VTIA 2OTJN 2IS3A 1SQKA 4FPBA 4FLZA 4A61A 1K9MO 3RVCA 4CJVA 4DQSA 2D5RA 1S1UA 1NK8A 3CCQN 5I9EB 3VEZA 3QDKA 3THWA 3MX2A 2Q36A 3SYZA 3HPHA 3VPZA 2E4LA 1GLLO 1JLAA 3KD5E 1ZC6A 5KI6A 3NGIA 3OYFA 4DCHA 3CQYA 3U6FA 4DV1K 3VA0A 4YFUA 3D6RA 2E88A 4JI4K 4JK8A 3VQBA 5J2MA 1JLCA 4H5NA 2YHBA 1L3VA 3B6PA 5JMVA 1NGAA 3AVAA 3QESA 3SQ0A 3K5LA 4DV3K 1XUPO 2YNIA 1GOAA 3V4IA 3IMXA 3SBGA 1WNSA 3NBPA 1Z26A 2E2OA 4HTUA 3BZCA 3CMAN 4RW8A 5FPEA 1T7PA 1TKZA 2P9NB 4RW4A 3CCVN 3H1QA 3TAFA 1I3AA 1UOCA 2DY4A 5AQWA 1BCOA 1RBUA 4JLHA 1HYSA 2QWMA 1ATRA 2KZZA 4KI6A 1VQ5N 1RT5A 3MCAB 4EP5A 3L2QA 4H0TB 3VEXA 1QHTA 1TAQA 3ULDA 4O55A 3THWB 3TAQA 4BC4A 4NLCA 3CPEA 1KAYA 4CIFA 2QW9A 1WSEA 4DFMA 3P4IA 1WSJA 4PL7A 5AZJA 3KVGA 3HOTA 1TKDA 1L3UA 4O5BA 1QQNA 4PUOA 4FSVA 3AY9A 3C6AA 1FKOA 2IAJA 3VQDA 3HYFA 5GAEP 3ID8A 3D0PA 5JVHL 4MLEA 2HBMA 1RT4A 5BR9A 4GMJB 3KHYA 2QM1A 4JYAK 3PIOL 2D0AA 3F9MA 3EO3A 4NXNK 2IC3A 2B4JA 2YI1A 4DQIA 4YHHK 1HLUA 3O9UA 1E3MA 3E66A 3H45C 4FYDA 1REVA 2HNYA 3HT3A 1RDAA 1BGXT 1HJRA 2NRRA 2NNWA 4AHUA 4LF6K 3NF9A 4L3QA 3T69A 4QS9A 2KZMA 3E9PA 1TUYA 1BI4A 3MMVA 5J2NA 3HP6A 4BR5A 2HHQA 3V6DA 4AHSA 4LY7A 4PKIA 4B1UB 3OW2M 3LANA 3VF2A 2P9LA 1RT6A 1WSGA 2E20A 5AZJB 4AHRA 3IRXA 1NGDA 4B1ZA 4BC5A 4F9OA 4WQ4C 1HQUA 1Q18A 4J8FA 4E89A 3S3MA 4A5BA 3DXMA 1A5VA 4CJKA 1T05A 5BRDA 3ISNC 4WFAL 3CFRA 1TK5A 3HVRA 3O9RA 4MQ3A 3G0ZA 3HVTA 4IJNA 3TTCA 3WEEA 3OYGA 1SV5A 3ZT2A 4HUGA 2KTQA 3DOLA 2YHWA 1K73O 2WTUA 3HP9A 4FK2A 2QKKA 4LF9K 1NKEA 4CEAA 3OYDA 1RT3A 4OKKA 1X3MA 3SPYA 3IUCA 1VSMA 3V9UA 3I33A 2Q2RA 4JV5K 2PZSA 1E4FT 3KZBA 4IOCL 1VQON 4H5WA 3DI6A 1OVQA 4FW1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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