3VOVA

Crystal structure of rok hexokinase from thermus thermophilus
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
300
structure length
297
Chain Sequence
MKVVGLDLGGTKIAAGVFDGKRLLSKVVVPTPKEGGERVAEALAEAAERAEREAGVRGEAIGLGTPGPLDFRRGVIRNIPGVQDFPIRRILEEATGRPVFLENDANAAALAEHHLGAAQGEESSLYLTVSTGIGGGVVLGGRVLRGERGQGGELGHLTLLPGGPACGCGLEGCLEALAAGRALERDATYAFQRPVDTRELFRLFQAGDPKAERLVLQAARYVGIGLASLVKAFDPGVVVLGGGVALNAPEGYWEALLEAYRRYLQGWEAPPLRRARLGAEAGLLGAALTAYLEVKDG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Glucokinase
publication title Characterization and crystal structure of the thermophilic ROK hexokinase from Thermus thermophilus
pubmed doi rcsb
source organism Thermus thermophilus
total genus 95
structure length 297
sequence length 300
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2012-02-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vovA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3vovA02
4XH1A 3VGLA 3H6EA 4MO5A 4QS7A 5AQOA 3QDKA 3CERA 1HKBA 1XQSC 4IO8A 1ATRA 3TPQA 1V4SA 3VEXA 4AM7A 5KQ8A 1NLVA 4M63C 3U9DA 4BC4A 4FWOA 3QMLA 4AM6A 5BPNA 3WQUA 3A0IX 1DEJA 3D2FB 3KHYA 5EX5A 1BU6O 2FF3B 3O6WA 4CZLA 3CQYA 2Q1NA 3WQTA 3ZEUB 4EHUA 5AQLA 2GWJA 4MO4A 1QZ5A 2QWPA 4XEIA 4FWSA 4IXCA 1T6CA 1ZC6A 3FZFA 5E26A 1YAGA 2QWMA 1C0FA 1WOQA 3CJ1A 3W3DA 2ZGYA 3AY9A 3UKRB 5FPMA 5BRFA 5BN8A 2GTDA 4H5RA 2IVPA 3EN9A 1WUAA 4A2BA 1ATSA 5LJWA 2A41A 1SZ2A 2NZTA 3ID8A 3ZETA 4EIAA 1D4XA 4HTLA 1NBWA 4IJAA 2F9TA 1JCGA 1GLLO 2FXUA 2I7NA 3WXIA 4RWTA 1KAXA 3DXMB 3MCPA 1YUWA 2YJFA 3U4LA 3RSEA 3LDPA 1LCUA 3UKUB 5BPMA 3CETA 2ZWHA 4B1UB 3ATUA 4BR0A 3KZBA 4IZ9A 2VYPA 3GBTA 4NO7A 5AQHA 5AFUA 1NGCA 3H45C 1ZXOA 2E2QA 4BRGA 1U6ZA 3FLCO 3O4WA 2UYTA 3O5BA 5AQMA 3DAWA 1S3XA 4DQ8A 3CJAA 3LM9A 3M1FA 1QQMA 3CI5A 5CE3A 3VF4A 5AQUA 3L4IA 3GOIA 5JLHA 3VEYA 1NGDA 3FZMA 4H5NA 3OHRA 3EZWA 3VETA 3O1WA 3L6QA 4FWLA 4XH5A 3EL2A 1X3MA 4CZMA 1XUPO 4FWMA 3VEOA 4BQLA 3VENA 1HJOA 3O8MA 4K42A 4JNEA 4FOIA 1BO5O 3H3OB 4O5FA 2D0OA 2E20A 3ENOA 5BR9A 3AARA 3G25A 1TYQA 4BC5A 2Q36A 3SJHA 3FGUA 5KQDA 3SLCA 3VESA 4K41A 3U8XA 4Y0WA 3ZETB 2YCHA 1T6DA 3DXKA 5AZIA 5EVZA 4Z94A 2W41A 5KPRA 3RSEB 1MA9B 2P9NA 5FPEA 1Q18A 4BRCA 5BRDA 3VEVA 2P9SA 5AFUH 5EY4A 4BRKA 1BA1A 2D1KA 4QS9A 3P4IA 1ESVA 4ISGA 2YHYA 4EFHA 4FSVA 2VWBA 4CZKA 4H03B 1BG3A 3VF6A 3BF1A 3CQXA 3TU5A 2CGKA 5LJVA 5AQVA 1NGHA 1RFQA 2D4WA 1GLDG 1K8KB 3MN6A 1KAYA 2ASMA 3BP8A 4JAXA 4CJ7A 2E2PA 2P9LA 1BWFO 4B1XB 4A62A 2IVOA 4BC2A 4XH4A 2QWNA 1V4TA 4CZGA 5BPLA 2ASPA 2HOEA 3QB0A 2Q0UA 2QWRA 4BRIA 3S41A 5I9EB 5TKYA 4GNIA 1LOTB 4F9OA 2Q0RA 4IWVA 4H0OA 1TYQB 3H3NO 2A6AA 4WQ5C 3SK3A 1MWMA 3JS6A 2AP1A 3GL1A 4BRQA 1QQOA 4FWRA 4B1WB 4BR4A 1KXPA 1NM1A 3C0BA 2P9IB 1CZAN 5F1XA 4FPBA 1G99A 2A40A 2HF4A 5ADXA 2E1ZA 5AQQA 2Q97A 3DXKB 4WQ4C 3D7EO 5AZIB 3LM2A 3M3ZA 4CD1A 4RTFD 2P9NB 3BUZB 2FSKA 2PBDA 3BF3A 3HBTA 2CGJA 3O08A 4K43A 3R9PA 3QBXA 2P9SB 4PL7A 5AQIA 2V7YA 2CH5A 3LDOA 3VOVA 4B9QA 1J6ZA 3HM8A 4CI6A 3H1VX 5JLFA 2OANA 3IUCA 2GELA 2IVNA 3WEEA 1DGKN 2QWOA 1YVNA 4FWKA 5AQKA 3FFKB 3MMVA 5ELZA 3HI0A 4FL9A 2QWLA 1YXQA 2F9WA 2YHWA 2E2OA 1KAZA 4B1VA 3CJ9A 4FWPA 2P9LB 3IDHA 3IMXA 1K8KA 1S22A 4CZJA 2GUPA 3DJCA 1MWKA 4GY2B 4BR7A 2QWQA 3UE5A 4EAHD 1DKGD 5AQPA 4M7YA 1HUXA 4CBXA 2ZF5O 4CD3A 4FWNA 4CBWA 4BR5A 3HSCA 2E8AA 1IG8A 3VGMA 4H5WA 3VEZA 3GDQA 4BC3A 4IJNA 4LC9B 4ISFA 4H5TA 1QQNA 2E88A 3VF2A 3I33A 4BGAA 2HMPA 4YDUC 1ATNA 3H46O 3MN7A 3MN9A 4BRHA 5AQYA 5ADXH 1NMDA 2W40A 2EWSA 4PKHA 1U2VA 4BRNA 4BR2A 4M7XA 1NGEA 4BREA 2ASOA 2P9IA 1JCEA 1E4FT 4H5VA 4PKIA 3D2EA 4BRLA 1H1VA 2CGLA 5AQGA 1C0GA 2FSNA 1TUYA 2P9KA 1IJJA 3VPZA 3WXLA 4PL8A 2V52B 3QBWA 3WXKA 3ATVA 1NGGA 2NRHA 3WEEB 2H3GX 2YHXA 3FE1A 1X3NA 5BRHA 2FSJA 1QHAA 2QM1A 2A3ZA 3CIPA 3ULEA 3ZX0A 1GLAG 2GEMA 3VGKA 3CJ7A 1HPMA 2A5XA 3GE1A 2P9PA 4CZFA 4E1JA 3O80A 1GLEG 5AZJA 5BREA 3ZX3A 1BA0A 2QXLA 4DHYA 4FOEA 4CZIA 3CJBA 3FR0A 3QFPA 4J8FA 1BOTO 1OKJA 3DWLA 3EKUA 4PKGA 3HTVA 3SMSA 4JHDA 2BTFA 4QS8A 5B8HA 4BROA 5F0XA 1SQKA 4B1YB 3J8AA 5BN9A 4HWIA 1HLUA 1U2VB 3U9ZA 4CZHA 3O1BA 5AQNA 5F2RA 3CHWA 5JMVA 3ZX2A 1HKCA 3BEXA 3C7NB 3EO3A 1EQYA 4MLEA 4H0XB 3LDLA 4JD2A 4BRPA 2AA4A 3D2EB 3FZKA 5KPZA 2DPNA 1NGBA 2KHOA 4BVOA 1HX1A 3A5OC 2WUSA 2P9UA 2J4RA 5AQXA 2P9KB 3QFUA 2GWKA 1P8ZA 3AAPA 1NGAA 4BRAA 3MK6A 3IFRA 4B1ZA 1RDWX 4ISEA 3MN5A 3EKSA 4BG8A 5AQTA 2E1YA 3JXUA 4I6MB 1QZ6A 3ENHA 4WQ5A 2YJEA 4H0TB 4H0VB 3ULEB 5KPTA 5AR0A 1BUPA 3H1QA 3GG4A 5JICA 3FZHA 2FF6A 5LY3A 2P9PB 4C23A 4H0YB 3HZ6A 2I7PA 3KVGA 3LDQA 5AZJB 5AQSA 1HKGA 4WQ4A 2FLOA 2PAVA 1GLFO 3LL3A 4JN4A 3R6MA 4L3QA 1Z05A 5AQWA 3VEWA 2ITMA 4BR9A 1NWKA 5AQZA 2YI1A 2D0PA 4FPAA 3VERA 4CZEA 1XC3A 3R8EA 4JHDB 4K25A 1R59O 1JCFA 4RCHA 4BQZA 4BRFA 1T44A 5E84A 3A5NC 1ZBSA 3AAQA 2NLXA 1MDUB 2HF3A 1NGIA 2QW9A 1RGIA 3CJCA 5AQFA 3SMPA 3WUHA 3UB5A 4JD2B 3D2FA 1NGJA 2CH6A 2IIRA 1NGFA 3I8BA 4DCHA 2Q31A 3C7NA 1Y64A 3ZEUA 5FPDA 2P9UB 5AQJA 2Q2RA 4BVPA 4BRDA 3F9MA 3FZLA 1GLJO 3A5MC 2E2NA 5EXWA 2ZGZA 4EHTA 4NB4A 4O8KA 3UKRA 3A8YA 3MDQA 4BGBA 3L0QA 2V7ZA 3W0LA 3WXJA 3QICA 1Z6RA 4DB3A 4YDUA 5EOYA 4CBUA 2VCPA 1SAZA 4A61A 4A2AA 4I6MA 1X9JA 2V51B 3WT0A 3M6GA 4BRMA 4KBOA 4WYBA 4MLHA 3A5LC 3B8AX 4H0PA 4FO0A 5FPNA 5AQRA 1TUUA 2BUPA 3LDNA 3DXMA 1E4GT 3UKUA 1BDGA 1GLCG 4BG9A 4FWQA 2A42A 1GLBG
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4MO5A 3DM2A 3ZT2A 1YJNN 1RT2A 2Q3SA 2BGGA 3QDKA 1B92A 3TARA 1HKBA 1XQSC 4U7BA 4DV3K 4DTJA 3RMAA 1ATRA 3E1YA 1NLVA 4JK7A 1RBRA 3F73A 3THXA 2PYJA 4AM6A 1BGXT 4PY5A 5BPNA 3WQUA 1KQSM 2VG7A 1DEJA 1KVBA 4CF1A 2FF3B 3O6WA 4R5PA 3QINA 2OZSA 1RT6A 3ZEUB 4EHUA 2GWJA 3SNNA 4JRQA 2QWPA 1T6CA 3FZFA 4DQQA 1YAGA 4NCBA 4NXMK 1O1WA 3CJ1A 3W3DA 4B3TK 2IOCA 3UKRB 1S5JA 5BRFA 1YTUA 4HCCA 4AF1A 2IVPA 1WUAA 2A41A 2X6SA 3PLAA 4FK2A 4JKGA 4IJAA 3LAMA 2F9TA 1JCGA 3SBTA 2FXUA 3WXIA 4RWTA 3MX5A 3HSTB 3L8BA 4Z4IA 3QNNA 4G1QA 3U4LA 1LCUA 5BPMA 4KRFA 1RTIA 4KREA 3KZBA 4IZ9A 2VYPA 4M3UA 4JKFA 4R79A 4Z4EA 4CK3A 4KHQA 3KK1A 3ZLJA 1A5VA 1NGCA 3PO5A 1YF5L 4CEAA 4DR3K 1HNXK 1FKOA 1U6ZA 3FLCO 4OPJA 2RHKA 1S1VA 1JLQA 5SZTA 3DAWA 1S3XA 4DQ8A 3HPGA 3V9WA 3C95A 3LM9A 3M1FA 1QQMA 5CE3A 3L4IA 1NGDA 3OHRA 3T69A 3NGZA 3N4QA 2NRRA 4GV6A 4LF4K 1X3MA 1XUPO 1S1UA 4FWMA 3VEOA 3NE6A 4DTSA 1HJOA 3O8MA 1IBLK 1Q86O 3I0RA 3P5JA 4C1NI 1BO5O 4KV8A 3T1AA 4O5FA 1FK9A 3ENOA 5BR9A 4E7IA 4BC5A 4IKFA 3THVA 3VQCA 3H08A 3FGUA 3SJHA 3PIPL 5KI6A 3E9OA 3VQDA 3LP1A 3U8XA 3PUFA 1CZ9A 2BH1A 1YJWN 2G8VA 5EVZA 3BDPA 4Z94A 4DFJA 1NJWA 4DSJA 1S6PA 2FBXA 5BRDA 3NF9A 2OPPA 4K0KK 1UWBA 3EE8A 2VWBA 4H03B 3VF6A 2Y1JA 1C1AA 2ZD1A 2D4WA 3MN6A 3HOSA 2ASMA 4GV3A 1D5AA 1RBTA 1SV5A 2XO7A 4B1XB 2DTUA 2BANA 2ATQA 4JKHA 1DTTA 2IVOA 3HRGA 2QWNA 3THWA 3L2UA 3ZSVA 1HYVA 3NDKA 3OYCA 3V6DA 3OS0A 5E41A 4FLTA 4YNQA 2A1RA 4DQSA 3U6FA 2HHUA 1RTHA 4XIUA 4J2DA 2Q0RA 3DOKA 4X64K 4FXDA 4DWIA 1WB9A 3H3NO 1TVRA 3KTQA 1MWMA 3CFOA 1M1KO 3QIOA 2AP1A 3GL1A 4BRQA 3OW2M 1VQ8N 1NM1A 3C0BA 1YJ9N 2HHXA 1C1CA 4FPBA 1G99A 2GBZA 4H8KA 2HF4A 5ADXA 3RWUA 3ZSZA 2Q97A 2QXFA 4ELTA 4RTFD 5GAHP 1TL3A 2BDPA 2FSKA 3AA5X 3SQ2A 4FJHA 3MCAB 3R9PA 4DV6K 1REVA 4DU1A 5JS2A 1VQKN 1RDBA 2CH5A 3LDOA 1J6ZA 1BCMA 4CI6A 2KW4A 4DUZK 1KVCA 2O8EB 1TV6A 1DGKN 1NG9A 1L3UA 3MMVA 2PZSA 3QESA 5DM7L 2IDOA 3C6HA 3OYAA 2E2OA 3J7YP 2XY6A 3AO2A 4FWPA 3V9UA 2P9LB 3IDHA 4DTRA 3VQ5A 1S22A 4M45A 1XMQK 4CJWA 4GY2B 3L2WA 3UE5A 3SUPA 4BR5A 3DLRA 3VGMA 3VEZA 4BC3A 3KLHA 3AVGA 3OYEA 2HHQA 4H5TA 1BI4B 1L3SA 4NLBA 3P83D 3VF2A 3B6PA 3ZT3A 1HNVA 1OH8A 4BRHA 5M1FA 2W40A 4FJNA 3DMJA 3TANA 3G6EN 1NKBA 3D2EA 1T7PA 5M1NA 4DU3A 3N4PA 4U67L 1RILA 2B5JA 3VMFB 3RRGA 3WXLA 4YOUA 3RR7A 5LMNK 2X74A 4DSLA 3JSMA 4CEFA 3WEEB 1N5YA 1X3NA 3SYZA 5C25A 1NK5A 4DKWA 2FSJA 1N36K 3SPZA 2O8CB 1K8AO 2QM1A 5J2PA 3SZ2A 4BDPA 2GEMA 3TSUA 2A5XA 4DV7K 5K14A 3T19A 3O80A 2QEXN 5AZJA 5BREA 3NAEA 2F8SA 3ZX3A 3KIOA 4YORA 4FM2A 2O8DB 4DTNA 2P51A 3ZSWA 4B9UA 3QFPA 2W6KA 1VSKA 1OKJA 5HP1A 4Z0UA 4FZZA 4JHDA 4KHSA 4QS8A 5HBMA 1S9EA 4YFUA 1SQKA 4B1YB 3RTVA 4AH9A 3HXMA 3VQ8A 4O0JA 1U2VB 4JK9A 4CZHA 3VTHA 4W5OA 3O1BA 5AQNA 3IAYA 1T05A 3CHWA 3ZX2A 1HKCA 3BEXA 3C7NB 4IEIA 4JD2A 2WC9A 1P90A 3SAFA 1XWLA 3K5NA 2HNYA 1HX1A 2QI2A 4UY8O 4FCYA 4BRAA 2ZE2A 2P5GA 4B1ZA 3HJFA 5C42A 3KLEA 3KK7A 4CE9A 4DV2K 4TSXA 3J7ZO 3LALA 4CECA 5AQTA 4I6MB 4H0VB 4I2PA 4N5SA 1NKEA 4CEDA 2YNGA 3H1QA 1KLMA 2P9PB 4C23A 4EZ6A 1UOCA 3KVGA 3LDQA 2FLOA 2PAVA 1GLFO 1NOZA 1JLEA 4BR9A 2W42A 3HP6A 2KLAA 3ISNC 3O4NA 4CJVA 3TWHA 4K25A 4RCHA 4DV4K 1YI2N 4CCHA 4JLHA 3CFPA 5EU7A 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3GBTA 4CK1A 5AQHA 4PUOA 5IT9O 2DFHA 2E2QA 2NRZA 4BWMA 4BRGA 3O4WA 2UYTA 4O5BA 1J5OA 3O5BA 5AQMA 4IOCL 1I3AA 4ILHA 3CI5A 2BE2A 2D0BA 3EZWA 3VETA 3CM6A 4UQGA 4XH5A 4CZMA 5FLXO 2PYLA 4Y1CA 1GOBA 2DFEA 1WAJA 4K42A 5GIOA 4JNEA 4CFDA 3EEQA 3I8DA 1R0AA 3TABA 3G25A 1TYQA 2Z1IA 4DFMA 1U48A 3L2QA 3CCLN 3TAGA 1KD1O 2XY7A 1U04A 4IFEA 4OO1J 4YOTA 4MFBA 4X62K 4I7FA 3C6UA 5AZIA 1UA1A 2W41A 3NH0A 1EO1A 4RW4A 3RSEB 3LWLA 2P9NA 5FPEA 4IEEA 1Q18A 3AVJA 4FJMA 4KB1A 2IC3A 4N41A 2P9SA 5AFUH 4DSEA 1VRUA 4BRKA 4G9ZA 2D1KA 3TAFA 3P4IA 1ESVA 3K58A 4CZKA 3E9LA 1BG3A 3L2RA 1SL0A 4JYAK 1Q9XA 3HM9A 5CZ1A 2VG5A 4J2AA 3SUNA 4ZHRA 1NGHA 1RFQA 1VSFA 4KHUA 4HHTA 4CJ7A 1BWFO 4FJ9A 4YOWA 3VQEA 3AVNA 1WBDA 4IBNA 5BPLA 2HOEA 3QB0A 4GV9A 2Q0UA 1QVFM 1QHTA 1HPZA 3S41A 5CYMA 1KSPA 1T03A 2WONA 2X6NA 1LOTB 2WOMA 4F9OA 4OKKA 4WCEL 3T1HK 1IV0A 4IWVA 3HT3A 1SUQA 3U3YA 3SK3A 3LAKA 2JWLA 4CIGA 4FK4A 2F7TA 4DF8A 2QKBA 3Q7CA 4FWRA 4B1WB 4BR4A 4E0DA 1TK5A 1KXPA 2VGNA 1K6YA 1ZBHA 3O9TA 3DXKB 4WQ4C 3LM2A 3M3ZA 2KFZA 2PY5A 3BUZB 3RMCA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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