3VUOA

Crystal structure of nontoxic nonhemagglutinin subcomponent (ntnha) from clostridium botulinum serotype d strain 4947
Total Genus 330
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
330
sequence length
1196
structure length
1151
Chain Sequence
MDINDDLNINSPVDNKNVVIVRARKTNTFFKAFKVAPNIWVAPERYYGEPLDIAEEYKLDGGIYDSNFLSQDSERENFLQAIITLLKRINNTISGKQLLSLISTAIPFPYGYVGYRETNYIESQNNKNFYASNIVIFGPGSNIVENNVICYKKNDAENGMGTMAEILFQPLLTYKYNKFYIDPAMELTKCLIKSLYFLYGIKPSDDLVVPYRLRTELDNKQFSQLNIIDLLISGGVDLEFINTNPYWFTNSYFSNSIKMFEKYKNIYETEIEGNNAIGNDIKLRLKQKFQNSVQDIWNLNLNYFSKEFNSIIPDRFSNALKHFYRKQYYTMDYGDNYNINGFVNGQINTKLPLSDKNTNIISKPEKVVNLVNANNISLMKSNIYGDGLKGTTEDFYSTYKIPYNEESDNFPLNNISIEEVDSIPEIIDINPYKDNSDDLLFTQITSTTEEVITHTALPVNYLQAQIITNENFTLSSDFSKVVSSKDKSLVYSFLDNLMSYLETIKNDGPIDTDKKYYLWLKEVFKNYSFDINLTQEIDSSCGINEVVIWFGKALNILNTSNSFVEEYQNSGPISLISKKDNLSEPNIEIDDIPDSLLGLSFKDLNNKLYEIYSKNRVYFRKIYFNFLDQWWTEYYSQYFELICMAKQSILAQESVVKQIIQNKFTDLSKASIPPDTLKLIKETTEKTFIDLSNESQISMNRVDNFLNKASICVFVEDIYPKFISYMEKYINNINIKTREFIQRCTNINDNEKSILINSYTFKTIDFKFLNIQAIKNFFNSQVEQVMKEMLSPYQLLLFATRGPNSNIIEDISGKNTLIQYTESVELVYGVNGESLYLKSPNETVEFSNNFFTNGLTNNFTICFWLRFTGKDDDKTRLIGNKVNNCGWEIYFEDNGLVFEIIDSNGNQESVYLSNVINNNWYYISISVDRLKDQLLIFINDKNVANVSIEQILNIYSTNVISLVNKNNSIYVEELSVLDKPVASEEVIRNYFSYLDNSYIRDSSKSLLEYNKNYQLYNYVFPETSLYEVNDNNKSYLSLKNTDGINIPSVKFKLINIDESKGYVQKWDECIICVSDGTEKYLDISENNRIQLVSSKDNAKKITVNTDLFRPDCITFSYNDKYFSLSLRDGDYNWMICNNKVPKGAHLWILKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Toxin
molecule keywords NTNHA
publication title Small-angle X-ray scattering reveals structural dynamics of the botulinum neurotoxin associating protein, nontoxic nonhemagglutinin
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 330
structure length 1151
sequence length 1196
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
A PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3vuoA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3vuoA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3vuoA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3vuoA01
4IY8A 1N1SA 1DYKA 4LBMA 4YG3A 2KH2A 1AX2A 2JE7A 1QDCA 1LESA 2A6VA 1SR4C 5BP5A 2D6KA 2Y9XE 4YOLA 4XFSA 5GLZA 4I4VA 5FZYA 3CRIA 3KMVA 5BXRA 4FPGA 3H6SE 2TEPA 4Y20B 3GALA 2DURA 4WVWA 3BA4A 2R0FA 5HCAA 4PBPA 1Q1UA 1FYUA 5DSSB 4AGRA 1V6MA 2GMMA 1QMJA 2OUJA 3UJQA 3CNAA 4LO1A 1JT7A 4ASMB 3AYCA 3ZXEA 4GAIA 1CVNA 5L73A 4DRVA 4F83A 1OQ1A 2XHLA 1Z7HA 2YV8A 3CA4A 4PBOA 1Q8PA 4LBQD 1ENRA 2Y9WC 2Z49A 4Z8SB 1T4QA 1G7YA 4TZDA 2ZZJA 2D7RA 3ZYRA 3WG1A 2KI4A 4I0YA 1AVUA 4IY9A 2Q5TA 3BOOA 5BXSA 3C89A 1AVWB 2P37A 3RQ0A 5DUYA 4I4QA 4UW5A 3BA7A 2A5ZA 2YROA 3SNMA 2ZQNA 3A21A 1I1EA 2VW0A 1EV2A 1W3AA 5BOWA 3SITA 3QIZA 1MD6A 1SBEA 2W2DB 5JOWA 3VKNA 3BRFA 4QBCA 1ULGA 2DVFA 2YZ4A 4AGVA 1WBLA 1UN1A 2W08A 3VV1A 1BLAA 3NBEA 1XHBA 5HPZA 2ZMNA 3QIYA 3ENRA 3EF2A 1ULDA 4IZEA 2E7TA 3N7JA 4KEKA 1M16A 4QBVA 1QU0A 2GALA 3WDYA 4KTXA 4XYXA 3WVJA 4EB2B 4ATFA 3DGTA 5FNXA 4YZ2A 4J2KA 3AH1A 3AP7A 3AYEA 2JECA 2D20A 2CY6A 1BKZA 4HL0A 4Q26A 4YGEA 1PZZA 2I1BA 4D0ZA 3AK0A 1MZ6A 1ILR1 1T3AA 1YI7A 1W6MA 3HR9A 2WQZC 4XXAA 4Y1ZA 4YW5A 3ZXLA 1MS4A 3K1XA 1ABRB 2D1ZA 5CAZA 2RSTA 1AJOA 4YZ4A 1V6OA 2BFHA 3O4BA 4G1RA 1DQ6A 1AVXB 4II0A 1XG6A 2RQ9A 4DEPA 1IILA 2EXKA 5T50A 2QN0A 5FZUA 3MW4A 1WBFA 3FFZA 1W6NB 1F31A 3QW6A 3D5OA 4YW4A 1SACA 4G6JA 2EIGA 3AZYA 1Z2VA 2MIBA 2LTNA 1ONAA 3I2XA 4Y1VA 2P23A 2D3PA 3ZSKA 1NXD1 3HBWA 1Q8SA 3C2UA 2D6OX 1QNWA 3L2YA 3FJBA 1MS9A 3VUOA 3CA6A 4K20A 2R0HA 2HYKA 1XQNA 3M3CA 3WLUA 2D6LX 4M3CE 4LBQB 5BXPA 4QKSA 2A3XA 1RG8A 4R9CA 4J2XA 3M3QA 5E8AA 2Q9XA 3UJ0A 1GZWB 2EXJA 3ILFA 4Y24A 4P0KA 3KQRA 3M2MA 2L5XA 3FUQA 4Y1UA 3WHUA 4DFSA 3V64A 3AP4A 2ZGOA 4UW4A 3DSEA 2AAIB 3QW5A 1DFCA 4NOTA 2K4AB 3T2TA 3FGMA 4GP0A 5T5OA 1I3HA 1JQZA 3POYA 4Q8LA 3ZXJA 4ZA3B 1PZ8A 1GLHA 2GO2A 1Z4SA 1LU2A 1ULCA 3R4SA 2DVGA 2A3WA 2DUOA 3U4XA 3V79C 5T5JA 1ISVA 1PUUB 2WRYA 1PZ7A 1GNHA 1G9AA 2R9KB 1TFMB 5EXOA 1HDKA 3WA1A 3AJYA 4JKQA 2D6NA 1N3OA 3LSDA 4YG0A 1QNYA 1UZYA 2F2FC 4H04A 5T55A 1HIBA 4GXLA 2PHWA 4FGFA 4XIOA 3O4CA 3AXEA 2QN4A 2FO1A 3NV1A 1W6PA 4XHBA 1W3GA 4OW4A 2FHRA 3H0OA 1QDOA 3ZSLA 3N3HA 4LO7B 5FNWA 3A23A 5JLVA 1GZCA 2DUPA 1WLCA 3MW2A 2AUYA 1YVGA 3BIWE 2YY1A 1BASA 4XZPA 2WSVA 1DHKB 2NTDA 3D6EA 1W6QB 1N4KA 3AH4A 2D24A 4XTMA 5GZEA 3Q7WA 1ZKWA 3VT2A 4GAFA 4P6AA 1X50A 1OQLB 1A8DA 3FJFA 1UL9A 2GNDA 1WW7A 4CJMA 4DENA 1HLCA 3NV4A 1YO8A 5DUVA 5SV8A 5F8YA 2NMOA 3P6JA 4UW3A 4JC1A 1DJSB 3IPVA 2OW4A 1IS5A 1CONA 3A0NA 3IM7A 4YGBA 5D61A 4K1YA 2M49A 2P3IA 1LHNA 1LGCA 4FQZA 1AF9A 3NBCA 4ZGRB 2ZGNA 1E1HA 5B2HA 1FATA 1JOJA 1BFCA 3CU1B 1KITA 4QKRA 4FPHA 1LULA 1S0JA 5BVPI 1LHUA 3OJBA 2CYFA 3ZXKA 9ILBA 1MS1A 2DTWA 1CPMA 1IOBA 1AZDA 1W6OB 4ZKTB 3M3OA 1SBFA 3LCPA 2H0BA 3N7KA 3ZSJA 4I4SA 4M3CB 3T1MA 4I96A 3C88A 1ULFA 5DZFA 2Y9FA 1CQ9A 2ERMA 1MACA 1JT4A 2ZHNA 4QC4A 1V6UA 1HQWA 3JUTA 2FMDA 2RG9B 2KKIA 4I1EA 1ZL5A 1V00A 4AVSA 5GZFA 1CPNA 1SLAA 2V5YA 1IT0A 4YFZA 5BQUC 5BQMB 1W3FA 2ZGSA 2VSAA 3HSMA 1IRAX 2B7YA 2A8AA 1DZQA 1BYHA 3LSEA 5GZDA 1SCSA 5EHAA 3P6IA 3WG3A 1HCDA 2JE9A 2UWCA 3V0BB 1SFYA 2KLLA 4J1LA 4MYEA 1WW4A 2AFGA 5D63A 1LEDA 2D23A 4I4PA 4X37A 3B69A 3FJAA 3BA5A 4BPZA 1Z78A 4WVVA 1XZZA 1ZM1A 5EC5A 3WINA 1G9CA 1CJPA 3QYDA 2XHLB 4A7YA 3FIIA 2IHOA 1W0PA 2A6XA 3OY8B 2AR6A 2HW9A 2E53A 3H6RB 4NO4A 2HWMA 3WUCA 1AX1A 4OWLA 5F5QA 2D44A 3AJ6A 1II4A 4JPZA 1IS3A 4YW1A 1C1FA 4BLJA 3VSZA 1N47A 1NZKA 1YIFA 4USPA 2XG3A 3H6QA 3FLTA 2ZMLA 4P0JA 5DG2A 1Y7BA 2UURA 1GV9A 1JT3A 3ASIA 1S0FA 1AXKA 3VT1A 3CQAA 1GANA 2G7KA 2A71A 4FOWA 2VUAA 1ISXA 1QXMA 3O4OA 1FV3A 1UX6A 3FLPA 4BM8A 1DQ4A 2ZGLA 4XBNA 4G6MA 2P3KA 1GBGA 3C9ZA 4G9NA 3NBDA 1GKBA 2IWTB 3WZ1A 2DTYA 3RG0A 1S0CA 5HCFA 2ESUA 2C5DA 4XKIA 3PVEA 3LTQA 1UAIA 1DLLA 1WW5A 4FPKA 1F5FA 3NBNA 1DZCA 1I1BA 3I4IA 1DQ1A 1WUVA 3VSFA 1AJKA 2AQZA 5IT6A 3FJJA 1V6XA 3O44A 1SLBA 4IONA 3AX4A 4LBOA 1VLNA 1FNYA 1P63A 3FJIA 3POKA 4KEJA 3NF3A 1IHKA 3W59A 4XJUA 1V6VA 4OZXA 4LBKA 2LALA 4I8MA 1Q56A 2C9AA 1ONKB 4KC3A 4FPYA 1Q8QA 1F9KA 2YXSA 3VKOA 5DUXA 4LBNA 3PHZA 5IK8A 3B9UA 2NYYA 2BEAA 4XE9A 4D69A 4EKXB 4ITCA 1GSLA 2FGFA 2Y9GA 3F1RA 2EAKA 2WSUA 4DRRA 4ZBVB 3O4AA 4I4RA 4BQ1A 1IJTA 3SH3A 5T5PA 1V6WA 4HANA 5GLVA 1JW6A 3USUA 4K1ZA 5BYNA 3UD7A 4Y20A 2YMZA 6I1BA 3R05A 4Q1RA 3HALA 2V73A 3QCWA 1W0OA 1BARA 5EYXA 4LO3A 4EJ5A 2UUSA 5JDBA 3RTJB 2E7QA 1NLSA 3CA3A 2CWMA 3AZZA 1ENQA 3T8SA 4EFPA 2JKBA 1AVAC 2ENRA 2DV9A 4FPJA 4ISRA 4OEEA 1KRIA 2ZKNA 3SLIA 4HJJA 5DUUA 1BFGA 3ZXFA 4XBLA 2VH9A 2HZ9A 3GNEA 4U36A 4I4UA 1PC8B 4YZ1A 1SCRA 1JYCA 1JYIA 2PHRA 1BZWA 1MC9A 1FV2A 3Q7XA 4FPEA 3BWIA 3F62B 2ARXA 4FPCA 1C57A 2I2SA 4JAWA 2VW1A 4FOYA 4GALA 4JP0A 4JKXB 1IOAA 1SR4A 1TP0A 1ZKXA 2D6MA 4XJAA 4Q91A 4EFRA 2D7FA 3K3QB 4SLIA 1LGNA 2AENA 4ENDA 2ARBA 3M1HA 1G9FA 2R49A 2GN3A 4FP2A 3HN1A 2W68A 5CBLA 5DZEA 1UZZA 4ELCA 4ATEA 4JQ0A 2P39A 3MALA 1TTUA 1N3PA 1DIWA 2ZABA 1Q8OA 4GKYA 4XXPA 3O5SA 5FREA 4XJZA 2FPQA 3RS6A 2BQPA 2AREA 2EXIA 4L4HA 4HEVA 4I4OA 2SLIA 5IK4A 3UJ4A 1JHNA 1SLTA 1W6PB 3IM0A 3N0KA 1JT5A 3IIRA 4LO7C 3BOPA 3VWCA 3FJDA 2ERFA 1LOBA 4RL7A 4ZFUB 5JVVA 2PHFA 4FVVA 1PUMB 4I30A 1SZ6B 1H30A 1HWMB 2WT0A 3N7LA 5H9QA 3ZXGA 4FPFA 4U2AA 5E24E 3WOGA 4R6UB 1XTGA 3OPZA 1KDKA 3CAHA 3IAGC 2VLCA 21BIA 4AN7B 1Q04A 3B9CA 2DVBA 1O4ZA 1HCEA 1LHVA 2P3JA 1CESA 1CE7B 2ISEA 2ZMKA 2ZGKA 4FOVA 1QF3A 3BTAA 3UK9A 2DS0A 4M00A 1W6NA 1IS4A 1ZA4A 2A75A 4I7IA 3OJMA 2G4IA 3A4UA 3MW3A 4BOWA 2ZR1B 1KJRA 4PQ9A 5GLWA 3PG0A 2ES3A 1Q8VA 3B00A 4F34A 4Q2FA 3OYWB 2G7QA 2LIQA 1WBAA 3NV3A 2PHXA 2FDBM 4OUJA 5KXEA 4LBQA 1KQRA 3PVNA 2XOAA 2ZGMA 4Y22A 1SLCA 2WT1A 3DUIA 4DQAA 2A7AA 3KM5A 2DVDA 1GZWA 4W65A 5DVHA 4PCRA 2ZHKA 1HKDA 3RSJA 1GICA 4YM0A 5DUWA 5BQNA 3AYDA 1VALA 2OUHA 3POSA 1UKGA 4P9YA 5DXDA 4GKXA 1JLXA 3BAVA 2NM1A 5G00A 1BLDA 3VKFC 3BRDA 1LOEA 1ITBA 4Q1PA 5IK5A 4CTEA 1LOGA 2R1DA 4FOQA 3SH5A 1R8NA 5KXCA 4QD2B 3BAQA 41BIA 2HWAA 4Z8BA 3E8LC 2YUGA 1R8OA 3I8TA 1SBDA 1YXWA 4R9BA 2WT2A 3M3EA 4Q9PA 1AVBA 1LOCA 4EFQA 1MS8A 1S0DA 4GWNA 3I2AA 1PZ9A 1QQKA 2ZACA 4A7ZA 1TWEA 4LO1C 1BQPA 4XFUA 4JRAA 2IMBA 1UPSA 3BODA 4IQPA 3CRHA 4R9AA 1WD3A 3MEPA 3OGGA 1HWPB 2MC2A 3ILNA 2D43A 1YTOA 2GMEA 1KJLA 1ULEA 1DBNA 2BEBA 4P9XA 4Q27A 3ZVXA 2NVHA 1MVEA 3FJHA 5DZUA 1OFSA 2VW2A 4JCKA 4BMEA 1E0OA 2CL2A 1CVSA 1FN0A 1MS3A 5GALA 1M2TB 4ISQA 2NP0A 3O3QA 3LLPA 5AVAA 4CZSA 1KDMA 3O0XA 3ZPYA 5E89A 5EG6C 2VSEA 1URXA 1LEMA 1RMLA 4H9WA 4ZXKA 1QOOA 1N1TA 3QW7A 3ZUSA 4GP3A 4HA2A 2Z42A 4LBJA 1LCLA 1JXNA 3RMYA 3VKMA 2A70A 1JN2P 1C1LA 5CA6A 4DS0A 2GNTA 4OWJA 2DRZA 2F8XC 3DS9A 3BAOA 4I4XA 2NN8A 4J2YA 3RTIB 1BA7A 3UDAA 4XOGA 1A3KA 2DWRA 1S0IA 4ZFWB 2ZHMA 3O4DA 1LOAA 4OEGA 4QO3A 1LODA 1J1TA 1GZ9A 1FWUA 3S8KA 2F2FA 4DCKC 5GM0A 2JD4A 2NZ9A 2VU9A 1HKNA 2E4MC 4G9MA 1G9BA 3FLRA 4AWDA 3NWKA 5F8WA 1MS5A 1HWOB 4YZ3A 1JLYA 2EXHA 1AXYA 3N35A 3R4UA 1ZB7A 3V0AA 5H9PA 3AP6A 3AZWA 4R9DA 1W6OA 3AKHA 1AX0A 1DQGA 5LK5A 1V6LA 2A3YA 2ZHLA 1ZL6A 3VKLA 4AVTA 1DQ5A 5JOYA 4UW6A 2A6YA 1WD4A 4XIKA 4PC4A 4M3CA 3T1LA 4M3CF 3TC2A 3AJZA 2DUQA 3INAA 3C8BA 3WDTA 1FMZA 1LOFC 1WLDA 2AH2A 4FPOB 1OKQA 3AZVA 2A6WA 2XB6C 3IMNA 4EEEB 4YW2A 3QR5A 1Z0HA 4XDQA 4XFTA 5BQMA 4XILA 3TB0A 5E88A 3ZX7A 2CWSA 4WBCA 2A6ZA 3USUB 3AKIA 3B01A 1IKPA 3AYAA 1AXMA 3BAGA 1VCLA 3WDVA 4ZLBB 1FNZA 2WNEA 2NMNA 3P53A 1V6IA 3RRDA 3D3XA 5EWSA 3V0BA 1SLLA 1QGLA 3IKWA 1EYLA 3ILAA 2D6PA 4AGGA 4X39A 5JOXA 1G8WA 3AXDA 4L4IA 3FJKA 2EF6A 2GDFA 5GJ6A 5JOZA 4BLIA 2D3SA 3PJQA 2Q3NB 1BFBA 3OY8A 4KUFA 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