3W0PA

Crystal structure of a thermostable mutant of aminoglycoside phosphotransferase aph(4)-ia (d198a), ternary complex with adp and hygromycin b
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
295
structure length
295
Chain Sequence
TSVEKFLIEKFGSVSDLMQLSEGEESRAFSFDVGGRGYVLRVNSCADGFYKDRYVYRHFASAALPIPEVLDIGEFSESLTYCISRRAQGVTLQDLPETELPAVLQPVAEVMDAIAAADLSQTSGFGPFGPQGIGQYTTWRDFICAIADPHVYHWQTVMDDTVSASVAQALDELMLWAEDCPEVRHLVHAAFGSNNVLTDNGRITAVIDWSEAMFGDPLYEVANIFFWRPWLACMEQQARYFERRHPELAGSPRLRAYMLRIGLDQLYQSLVDGNFDDAAWAQGRCDAIVRSGAGT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/antibiotic
molecule keywords Hygromycin-B 4-O-kinase
publication title Crystal structures of the ternary complex of APH(4)-Ia/Hph with hygromycin B and an ATP analog using a thermostable mutant.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 84
structure length 295
sequence length 295
ec nomenclature ec 2.7.1.163: Hygromycin B 4-O-kinase.
pdb deposition date 2012-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01636 APH Phosphotransferase enzyme family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.150 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3w0pA01
3.90.1200.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 3w0pA02
3LQ3A 3W0OA 1NW1A 5IQBA 4R7BA 4CG8A 4FEUA 5EQYA 3W0RA 4DE4A 3W0SA 3G15A 4PDYA 5IQGA 5IQAA 2CKOA 3Q2JA 5IQEA 3N4VA 1J7LA 4DFUA 2QG7A 3W0PA 2PUPA 5C4LA 5FUTA 4DFBA 2IG7A 1ND4A 5IQFA 4CG9A 4WZYA 5C4KA 5AFVA 2PUNA 3N4TA 3TDWA 2PPQA 4DT9A 5FTGA 4O7PA 5EQEA 3DXPA 3MESA 3ZM9A 2CKPA 3W0QA 4FEXA 4DTBA 5IQDA 3TM0A 3DXQA 1J7UA 4FEVA 3F2RA 4GKIA 2I7QA 3FEGA 3HAVA 2PULA 3FI8A 3SGCA 4DA5A 5IQHA 2OLCA 4GKHA 3JR1A 4FEWA 4U94A 4N57A 3ATSA 4DCAA 3SG9A 2PUIA 4DTAA 5BYLA 4H05A 1L8TA 2Q83A 2B0QA 3N4UA 4DBXA 3UZRA 3W0MA 4R78A 4BR3A 3TYKA 4O7OA 5IQCA 3C5IA 3HAMA 3SG8A 2CKQA 3ATTA 3CSVA 2PU8A 4DT8A 3W0NA 4U98A 4EJ7A 3TDVA 2PYWA 4CGAA 4ORKA 1J7IA 4R77A 5IQIA 2BKKA 5EQPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4R3CA 3MA6A 3DJ6A 4BCKA 2YCFA 3DLZA 4R1YA 2F7ZE 1A48A 1XH9A 2XRWA 4WUAA 4BDKA 4F7LA 2UZBA 4G9CA 5JQ5A 4OGRA 3BX5A 3OWLA 5AUTA 2XCHA 4LUDA 4YBJA 3BU5A 1MQ4A 3DK7A 5CSXA 4A4XA 3UBDA 4JAJA 3BHVA 3F7ZA 4EEVA 4FKRA 2UW7A 4FV9A 4U45A 2XK6A 4PDYA 2CNUA 2O8YA 2YM6A 4YZBA 3VF8A 4IAZA 3GOKA 3G0EA 4I5HA 5DEYA 1J7LA 4QYEA 3QQHA 2NO3A 2WMXA 2P3GX 1AD5A 2HWPA 4IH8A 4KA3A 3K5VA 3CC6A 4CKIA 5JRQA 5D9HA 3DKOA 1P2AA 2FO0A 4W8EA 3TZMA 5HLNA 2JC6A 4USEA 5AMNA 5L2SA 2OW3A 4LUEA 4FTIA 1W8CA 3AC4A 4M0YA 3FL5A 3A61A 3OCGA 3NUPA 4AZTA 2R3FA 1ZYDA 4A4LA 4FT7A 2EU9A 2F7EE 1FQ1B 2VNWA 3NYVA 2JAMA 4RWKA 4AA0A 4NL0A 1UU8A 3FLZA 4KS8A 2X7OA 4NH1A 3R83A 4E4LA 4O96A 4RQVA 2BVAA 2OU7A 3OWKA 3BE9A 3Q96A 5DGZA 5DT4A 3UOKA 4TL0A 2PVJA 3PTGA 3ZRLA 3A7GA 3IG7A 4IBMA 3WARA 5CF6A 4GKIA 4ACGA 5HTBA 2C0IA 3CKXA 1GOLA 4YC6A 3U9CA 4MYGA 3PJCA 2J90A 4FSRA 4E6DA 5IH4A 2WIPA 2PZ5A 3KMUA 3ERKA 5JH6A 2O5KA 2R7IA 4RJ5A 5TF9A 3BV3A 4C33A 1OIRA 2WB8A 4YGAA 4EOQA 3EQCA 4EK5A 3ANQA 4RX7A 5DR2A 5HE3A 5EOBA 4AA4A 1CKPA 5HIBA 4APCA 1W83A 2YABA 3MH1A 2W1EA 4IM0A 2R3RA 3BHYA 3Q6UA 4FTNA 4HPTE 5T68A 1JKKA 3F3TA 3KU2A 4QYYA 3BLQA 4TYHA 3D5XA 2KULA 3BL9A 3UOJA 1OZ1A 1ZARA 4N0SA 5ETFA 2BRNA 2JKOA 4QMPA 3UNZA 4C0TA 3LW0A 2IWIA 4L45A 4GCJA 3FBVA 2FYSA 3NW7A 4NKAA 4YHFA 4EZ3A 4RX5A 2G9XA 4FG8A 4JX7A 1UU3A 4U98A 1PYEA 4EH4A 3PJ2A 4FC0A 3TEIA 2QR7A 5L3AA 4CGAA 3UNKA 2GNHA 4FE2A 4EQMA 5M51A 3FXWA 3NNUA 3M11A 4OT6A 1J7IA 4R77A 4FZFB 4EI4A 2Y6OA 5LJJA 2AC3A 2OK1A 2ITWA 2C47A 4QQJA 4V0GB 2G15A 2X4ZA 3U51A 3MH2A 3U55A 4IB1A 2GHMA 4I5MA 4WKQA 1XH7A 3VNTA 3O51A 4U42A 4D1XA 2PY3A 3I0OA 4EOKA 3OW4A 5LVPA 1Q3DA 2OZAA 3D7TB 1WFCA 4AW5A 4D4RA 2ERKA 3WF8A 5JGAA 2GFSA 3KXMA 4FEUA 5JK3A 2I0EA 4AW0A 2C30A 5A54A 3FQSA 2FGIA 3R02A 5IQGA 2NPQA 4IIRA 4X2FA 5AAFA 4BI2A 2VUWA 4JNWA 2BILB 2G2HA 3OD6X 2BZHB 2BMCA 5DT0A 4K77A 3BV2A 5IDPA 5CVHA 4MNEA 5KMKA 3TUCA 2OI4X 4AGWA 5CU4A 3W16A 3Q52A 4IC8A 3V5JA 4CFWA 4U41A 2ZV9A 3R7IA 4A7CA 4GK2A 2C3LA 3ULZA 4F6WA 5EKOA 3QAME 1F3MC 4CMOA 1WVWA 4B8MA 3BYSA 4DH8A 3JY0A 4JJRA 2FSOX 3QRTA 1OL6A 3HECA 5CSVA 1JAMA 1Q61A 3FL4A 4JDKA 2R2PA 1IAJA 3LIJA 3GXLA 3QCYA 4QPSA 5E1EA 4Z7HA 4ZXTA 2ZV8A 4OTWA 1YDRE 4FK3A 4Z7GA 2BDWA 3UDBA 3ZBFA 4CFFA 4A06A 5DOSA 3O8PA 2XNMA 5D7AA 3GQIA 3MTLA 5EH0A 3S95A 4O7RA 2WOTA 3FJQE 1J7UA 3R1QA 2PVMA 1URCA 2C3IB 3F3UA 1CDKA 4I5CA 4QQ5A 4IZYA 1UVRA 3ODYX 3CP9A 3GCPA 3R7UA 3A7HA 4N4SA 4IAFA 3CE3A 3ZDUA 2H96A 3OZ6A 4IWPA 1XBBA 5HU9A 5LWNA 2VX0A 4DCEA 3TZ7A 4JR7A 4QMOA 3D2IA 4QMXA 3MGYA 2PUIA 3LFSA 4P5ZA 4O7TA 5EDRA 3VS6A 5AAEA 3KQ7A 3CD3A 2H6DA 3LAUA 2YIQA 5M06A 3V04A 5AADA 3ZZEA 2PE1A 2QCSA 1IASA 3GCSA 3QGYA 3VUMA 1ERKA 3L9PA 3UZRA 1KE8A 5J5SA 1OI9A 4L8MA 4XEYA 4EWQA 1Q8UA 3KF4A 1OKVA 4JR3A 4WNMA 5HNGA 1FINA 3B8RA 3D9VA 4ENXA 4KSQA 5D11A 2HW7A 1YDSE 3ZFYA 3R8PA 3UC4A 2JIUA 3HV6A 2WXVA 3KY2A 4KAOA 4R6VA 3PG3A 3CXWA 3S3IA 3C0GA 3CSVA 3ZDIA 4NM3A 3WZJA 2PU8A 4IB0A 2WMAA 3A99A 4CLJA 3S4QA 4BTJA 1YWRA 3ELJA 4X2NA 3TL8A 1XHAA 2YDJA 4AX8A 2HZ4A 2C69A 1H8FA 3LXNA 3AMAA 3UIXA 3L9LA 3WYXA 4JG7A 3P7BA 3FZ1A 4D2SA 3MFRA 1R39A 2J0KA 4O82A 1FMKA 3MY1A 3RPOA 4EH5A 4FIEA 4IDTA 2X7FA 3DAJA 4BZDA 1MRYA 3ZBXA 3W33A 4N70A 4RBLA 4QP1A 4XUFA 5L6WL 2RFNA 1WBWA 1ZMUA 3QLFA 3SW4A 2VTLA 3FMDA 5FBOA 4BDEA 2HAKA 2WQEA 3NUNA 5TT7A 5J1VA 1WZYA 3R0TA 4IFGA 5EQYA 1UWHA 4IAIA 4IE9A 4LQMA 4MKCA 4D9TA 3DZOA 4ZSGA 1JSTA 1OL5A 5KUPA 3OY3A 4BCGA 2BROA 4JBPA 3O7LB 5K4JA 5BMMA 1AGWA 1PRYA 2CMWA 2EXMA 4QEBA 3PXKA 4OT5A 1M14A 4IWQA 3EFKA 3PSCA 5K9IA 3UQCA 3VULA 4LMUA 3MY5A 5E8UA 3R2BA 2X7GA 4PL5A 4KINA 3R1NA 4NTTA 4ZOGA 2E9PA 4D4VA 2IZRA 5HLWA 5JGDA 1YOJA 2XIXA 4L68A 1JNKA 5HESA 2VO3A 4TTHB 3MVHA 4YSJA 4OLIA 5M4CA 4O7PA 1KV1A 2X6DA 2CKPA 2R4BA 2IVUA 3LFFA 3OEZA 4AW2A 5J9ZA 4BBEA 4BTFA 2X2KA 2YM5A 5HU3A 2YIXA 3CGFA 4BZOA 3QD3A 3R6XA 4OR5A 4RT7A 4QTEA 4O0SA 3IW5A 2C6TA 3GCQA 3DDPA 3WF7A 4FNWA 3DV3A 2J5FA 2PUUA 4XNEA 3ZO3A 3AG9A 2I7QA 4TWPA 5A46A 2X2MA 3FEGA 1JOWB 3DU8A 4HJOA 5AP2A 5IEXA 2C68A 3FLSA 5EHOA 3IOPA 4MXAA 3Q60A 2ACXA 2VNYA 5BVEA 4Y72A 4M14A 1OMWA 3CKWA 3FI2A 4OTQA 1XMMA 5IISA 3FV8A 4BCQA 2R0IA 3L1SA 3KXGA 4TW9A 4G6NA 4ANBA 4U40A 3HMIA 4FZ6A 3SRVB 4AFEA 3CQUA 3PVGA 3UE4A 2QURA 3Q9ZA 1U5QA 4W8DA 3AKLA 3VS3A 3PDTA 4TYIA 3F66A 3IKAA 3C4CA 2W5HA 3CJGA 4Y85A 5AUYA 3FZPA 5DR9A 4E26A 2XIKA 2YEXA 4YURA 1FGKA 4D1ZA 4H36A 2IW9A 3TCPA 3IW6A 1UU9A 4I41A 3EN6A 2WKMA 3C9WA 3GFEA 3UZTA 4RIWB 4BF2A 5FGKA 4AW1A 1H1RA 3I79A 3LPBA 4J71A 2JAVA 3HAMA 1V0BA 2PSQA 5JSMA 4GG7A 3R7YA 2JKMA 1H28A 1A9UA 3R8ZA 3VRZA 4I6FA 1PYXA 1UNGA 2IW6A 2W17A 1Q3WA 3G9NA 5AUVA 5C8KA 5HLPA 3MY0A 4L3PA 4BJJB 2R3MA 3PUFC 3DTWA 4WA9A 1KE7A 2XF0A 4HCVA 3VC4A 3G0FA 4U5JA 4J53A 5AV1A 3KRRA 2C5OA 3W8LA 3OUNB 4ZAUA 4FV6A 1QPJA 2R5TA 1WVYA 5AP1A 3OOMA 1ZAOA 5AM7A 4FTRA 3MDYA 3DKGA 5HBHA 5I9VA 3VVHA 4BVUA 4H39A 1JSUA 4PTEA 3ZS5A 4RIYA 2YZLA 3LM0A 2G1TA 4LMNA 4IACA 4IANA 2VAGA 3THBA 2G2IA 4X0MA 3R7OA 3OT3A 4C36A 3PYYA 5LCJA 3PLSA 4E4MA 2VX3A 3ZEPA 1CM8A 4HOKA 4IVBA 4W4XA 5HNBA 2HZ0A 4R7IA 2WQBA 3VRYA 2BAQA 2ITUA 3HMMA 4FVRA 3VUDA 4BCOA 4FOBA 4CCUA 5M56A 3QGWA 4XV3A 5C1QB 5J9YA 4L7FA 3HLLA 3RINA 3FY2A 4NJ3A 1ZLTA 5J8IA 2NNWB 2CNQA 2VGOA 4BDJA 3AGLA 3Q9WA 5LMAA 3KVWA 3NVKI 3ZH8A 1PXMA 2ITTA 3IGGA 2X8IA 3P0MA 2VO6A 2PPQA 3ZHPC 3PY3A 1DM2A 2XB7A 2B9IA 3PE2A 5C27A 3R63A 4GK3A 2IW8A 3RPYA 3DGKA 4LOQA 3R2YA 4XMOA 4EH6A 4G9RA 3DJ7A 3QUEA 4F0GA 4WD5A 4MWHA 2EXCX 4C4EA 2OWBA 2R3PA 3UO5A 4MBIA 5HD4A 2HOGA 3KMMA 4O27B 3WE8A 2X4FA 4M69B 3VHKA 5KMLA 2W5BA 3MS9A 1W0XC 5AP0A 3HAVA 1NVQA 3QZIA 3QTRA 4AZWA 2FUMA 4AGUA 2VV9A 3FLQA 4QMTA 1Y6AA 2ZMDA 4FKIA 3DNDA 1TQPA 3BHTA 2CNVA 4FEWA 4RC4A 4UB7A 4DCAA 4D9UA 4DTAA 3UO4A 4EL9A 3LFAA 4ANQA 3C4XA 3CY2A 3PUPA 3ZUUA 4OBOA 3TTIA 4BDAA 4BN1A 2B0QA 3PFQA 5HTCA 5CSWA 2ITZA 3UPZA 3BU6A 3OXTA 3LMHA 4FV3A 5CU3A 4MQ1A 3NEWA 5AM6A 3D14A 1DI9A 5H3QA 4I4EA 5HCZA 4AACA 4GJ3A 4MVFA 1G3NA 3POZA 2XKEA 4DEGA 3JY9A 1CKJA 4RC3A 4F7JA 2R3NA 5DI1A 4F1TA 4RVMA 3GU6A 4O7OA 4ITIA 4MBLA 2W06A 4F99A 3NIEA 2H8HA 2W05A 3H0YA 2ZAZA 2GNLA 5HQ0A 3DTCA 2IZSA 3NR9A 3EYGA 4K6ZA 3VS2A 4EOLA 2X39A 4U8ZA 4ZSJA 3E88A 4AUAA 3FZOA 4YLKA 5JRSA 4CT1A 5BV3A 3R1SA 1OBGA 4JX3A 3HRFA 3TIYA 3UDSA 3VUKA 3Q53A 1HCKA 4E7WA 3DQWA 4YLLA 3D2KA 3P9JA 3ZXTA 1H24A 5I0BA 5IMEA 1RW8A 3LFQA 3UVRA 3KK9A 2X81A 4WBBB 3VJOA 4M0ZA 4AZVA 4FT0A 5AUWA 5AV4A 2FSTX 2B9JA 5L8LA 1RJBA 5CU0A 4AXFA 2XANA 4E6AA 4FTAA 3NRMA 2JIIA 4PP9A 3BKBA 2I0VA 5CNNA 3H9OA 2ERZE 2PWLA 4FYOA 3UIMA 2Y0AA 3CS9A 4YJRA 1AQ1A 3PG1A 4RG0A 3IECA 3LCDA 3ZO1A 2UVYA 1WBTA 3NVMB 4RIXA 5L8KA 2CKOA 5IQEA 1XH4A 4FGBA 2GHGA 3TUBA 4KIOA 4LV8A 5CEOA 3VBWA 3NSZA 3HV5A 3JS2A 1E1XA 3QRIA 2BRBA 5BVWA 4BDHA 2WTWA 4YTCA 3T3VA 3RM6A 3OWPA 3UTOA 4IZAA 2ZOQA 3FMJA 1KOBA 3IO7A 2CGUA 4F08A 4C61A 3VIDA 4DYMA 3UPXA 2VZ6A 2GNJA 4DHFA 5KBRA 3P7AA 1Q41A 3IW7A 1XH8A 2PUNA 4NFNA 4C37A 3FKNA 4E4XA 4P90A 2PZIA 4XS2A 5CAOA 3NUAA 2XNGA 2QODA 3O23A 2YM7A 4UWCA 5H8BA 4EHVA 4TY1A 3G9LX 3QZFA 5HE2A 5CAUA 4DG0E 4DTBA 3BPRA 5DT3A 2BALA 3TM0A 4K11A 4UYAA 4O83A 4MF1A 3DXQA 3O5AA 5C01A 2WNTA 4FA2A 2UZVA 3BGZA 4F9WA 3EZVA 4J97A 4MWIA 4F9CA 2DWBA 1SM2A 3O2MA 3VO3A 3QTXA 3F6XA 5ANIA 4PRJA 3HNGA 4QYHA 5B2LA 4AXAA 3CY3A 2OO8X 2CPKE 2OLCA 4FIFA 5E4HA 2AEGA 1Q62A 5B7VA 4AT5A 3ET7A 2RFSA 5ANKA 4FT9A 3SG9A 5LVLA 5AWMA 5B2MA 4FL1A 3GCUA 1J1CA 2OF4A 2R0UA 4ZLZA 3GVUA 4EQCA 3CLYA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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