3W1QA

Structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with nl-2
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
publication title Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with NL-2
rcsb
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 104
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2012-11-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 3w1qA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3w1qA01
3P5ZA 3KVMA 3TMQA 1QMLA 1K7FA 4K39A 2JKAA 1RQHA 3LLFA 2X1SA 3M0ZA 3ABOA 3W88A 3P5YA 4WD0A 1TPWA 1L9WA 1FCBA 1W54A 1G4SA 4RK8A 4ZQOA 2YSWA 2R91A 1OX4B 4X2RA 2E77A 3UWQA 2BWGA 2NXGA 1TPB1 2TYSA 1OX6A 3O63A 1WBJA 3G1DA 2VEKA 1LP6A 1WA3A 2QCHA 3GDMA 4NNCA 3KOFA 2QUVA 3MBFA 1GQNA 4RZ6A 3ABSA 7TIMA 4OV9A 1ZNNA 3HG4A 4RXGA 3A23A 4U28A 1OX4A 2FFCA 3IRDA 1VCVA 1OF8A 3L5MA 2Y61A 5EA9A 1X7FA 1S5WA 2CZDA 3S42A 5HWJA 1FWNA 1K8YA 2V0TA 1JULA 4KFOA 4RLIA 1P5BA 2YW4A 1LTDA 3GDTA 4E38A 4ADUA 1IGSA 1H5YA 2RH9A 2V2CA 3N9SA 3IGXA 4S2CA 5D2VA 4A2RA 3B0UX 2W6RA 4TU1A 1UCWA 3QW3A 4UC5A 2WSQA 4GUIA 4N6FA 4A3UA 3HPXA 1FXPA 3LBCA 2WQPA 3LHZA 4MY8A 4DO6A 3GLCA 2PRMA 3NL6A 3ZS4A 3GXTA 5F1UA 3TE9A 3S5YA 3NNTA 4CQAA 1FX6A 3M7WA 3DHFA 4HNTA 4Q4KA 2ZZ7A 2YYUA 5DXXA 3LXAA 4UTWC 2NUXA 2I1OA 4DQWA 1VRDA 4JTFA 1NVMA 4FIRA 5DBUA 2QR6A 3BW2A 4CCDA 1ADOA 1SQ7A 1A5BA 3TSMA 4AB4A 1S5VA 4O0ZA 2I14A 3M47A 4HNVA 4GUFA 4K36A 3KVLA 2CLIA 3C56A 4CNOA 3R89A 3CIWA 3DENA 4IUOA 1SPQA 1OFPA 2V9DA 3A9IA 1GEQA 5D05A 4O50A 1LZOA 3W2JA 1Q6LA 3PUDA 5LHFA 1VC4A 1SSDA 3B0PA 1L6SA 1GYLA 3NZRA 2WNQA 4QAIA 1KV8A 1PHQA 5I3FA 1ME7A 2XN1A 2DJXA 3TCEA 3W7LA 4WXYA 1J5TA 1GYNA 1KTCA 2QAPA 3G0XA 4MIMA 3L0NA 2Z0IA 3D0CA 3EWBX 1VJIA 3NQEA 5KZEA 3FYOA 4R33A 5AHNA 3U8GA 1MEWA 1KTNA 5DCDA 3EX2A 2VFDA 2GJLA 1K7XA 3KFTA 3CT7A 4NJGA 2WSRA 4FNPA 1JRCA 3A24A 3SGUA 1GTEA 3SZ8A 1H7OA 3C0JA 3CM4A 5EKYA 1KFLA 4FNQA 2ZRWA 1UUMA 4LVAA 3E96A 3GVGA 3BG3A 3HOJA 3LBMA 1SZEA 4PFMA 4PTNA 3DFPA 2NV2A 1SW0A 4JTEA 4NJKA 3S0CA 2Y85A 3L5LA 3NXFA 4FO4A 1XXXA 4LNYA 4MZ1A 3QPYA 2VFFA 3STEA 1W8SA 2R14A 3NVTA 4PL2A 5DY3A 2EGZA 5U4NA 1XDLA 1LYXA 3BGJA 3THQA 1JCLA 1KTBA 1GTHA 1VHCA 3DAQA 3DU0A 1DV7A 1GVQA 3LCIA 4NNAA 3PUEA 1KFEA 4O18A 1TTJA 3HGRA 4QQ3A 4AVFA 3G1YA 3W7CA 3Q94A 3Q2DA 5D33A 1KBIA 3AJXA 4MJMA 1TPDA 3QPZA 4Z1AA 1KA9F 4UFMA 3W7OA 3W7MA 2EPHA 3SW6A 1X8FA 3ANYA 3UZ5A 1SUXA 4AH7A 4NT0A 3HG3A 2YZRA 3W74A 2ZTKA 4GXMA 4I9AA 2W0UA 1OFQA 2J6XA 3GX9A 1LRQA 5K3VA 3EKLA 1T8XA 4LRSA 1VLWA 2Z1BA 3PR2A 3S1WA 3NPVA 1IIGA 1UJPA 3NQVA 3TW7A 2I9EA 3O8AA 2E6FA 3NQ6A 2C3ZA 2XN0A 3FOKA 3NOEA 3PBYA 1R2SA 3LTPA 2QCDB 4O19A 3W7IA 1GVOA 1H51A 4YXGA 2CFFA 2Y7EA 2CWNA 1X1OA 4Y96A 4O13A 5T26A 2BXVA 2GOUA 6ALDA 3LLDA 3CIXA 3VNDA 3QH2A 1W37A 5FI8A 4FEZA 3UPBA 3EWUA 2NUWA 4O1BA 3GXPA 2QCDA 2C14A 4IMCA 3ABRA 1K8XA 4BI6A 4PA8A 2PC4A 2RKXA 3W7EA 3BW4A 4IMGA 3OIXA 3EWYA 4GWEA 5HR6A 4NU7A 3HIJA 1LBLA 2ZA3A 3A5FA 4IXHA 3P81A 3W1UA 2RDUA 2ATMA 1JR1A 4O12A 4FIQA 3C2EA 5LNVA 2HTMA 4M7SA 1H61A 1W5MA 4UIOA 4GNJA 3MUXA 1QOPA 1QWGA 1SFJA 5CG7A 4JEQA 1LRTA 3MO7A 2XN2A 3G1AA 2WNZA 1SSGA 4KWVA 2YPIA 1WAUA 1SO3A 3A5VA 4FNTA 1MSSA 3B06A 2JGYA 3JS3A 3L68A 5HNRA 4LS1A 2OT0A 4NQ1A 3C6CA 1ZAJA 4NJHA 3IIXA 1KV5A 4ALDA 2FJKA 3H53A 1BEUA 3BG5A 1ZJIA 3B8DA 4OQVA 3W7NA 1BKSA 4K38A 1NEYA 1OYCA 4DF2A 2J9YA 3BW3A 3UY7A 3VFLA 4FXRA 2ALDA 3QYQA 2ZRXA 3PBWA 4EF9A 1UUOA 3INPA 4JIPA 4A22A 3NO5A 5HUOA 2JKEA 1OABA 3W23A 4HHPA 2NX9A 3CB8A 3LCXA 3NQAA 3UZJA 3P82A 4UFLA 4UFHA 3N9RA 4DBDA 4AXKA 3DFQA 4HSOA 4R7JA 1SR9A 2VEMA 2DZXA 4LUIA 2CZEA 3STFA 2Y62A 3G8EA 3MHGA 3LRKA 2BZNA 4JTKA 1GVRA 2ISSA 1GJPA 4JGDA 3ABQA 5K7JA 3BLFA 1O5KA 1F6KA 2Y89A 4RKAA 1XC4A 1TPEA 1V5XA 4H6KA 2Z6IA 1GG0A 2QJHA 4XTIA 2A7PA 3EEGA 3S1XA 1SZGA 2GQ8A 3FJ6A 5IM51 5CSSA 3M5YA 1DKWA 1Z41A 3MBDA 4N4PA 4DO4A 1XKYA 3MHFA 2X16A 3L21A 2QDGA 2ZZ3A 4MUZA 1BTMA 5EMUA 2A85A 3EWWA 1VQTA 5I3KA 1I45A 2NV1A 5IBXC 2ZA1A 3S1UA 3NEVA 1FUYA 4HNUA 3PSVA 1GWJA 3EWZA 1P1XA 2KZHA 2ABBA 1JCNA 1WOBA 1F05A 4O14A 1DHPA 1YDOA 4O28A 1MXSA 4UCGA 3DXIA 1QCWA 1PHWA 3EX3A 3JRKA 1TRDA 4M19A 1WV2A 4I7WA 1QO2A 5FF7A 1ZENA 3WJWA 1R30A 5CZ0A 3DKLA 1FCUA 4QISA 3ATZA 2FB2A 2A0NA 5BMXA 4QIUA 2ZZ6A 5I3IA 3A22A 4MLRA 1A53A 1K3UA 2B0MA 3CPRA 5F2MA 5KZDA 1JRBA 4Z1CA 2HMCA 3L9CA 4ZZ9A 4ZL1A 2CLLA 3T40A 1TREA 2UV8G 3WJXA 3LCGA 2H8ZA 3TFCA 4FNUA 5BNKA 2J9XA 2V5BA 3SJ3A 4N02A 3FA5A 5F2GA 3VE9A 3AO0A 1THFD 1TQXA 4S1FA 4JTTA 1D3HA 3W76A 3E12A 2A7NA 1TO3A 4WXZA 3E0IA 3LXCA 2YCEA 4Q33A 1KFKA 1TSIA 3W70A 3VE7A 3NPWA 4HNNA 1VCGA 3NPXA 5D2XA 2ZRVA 5TQLA 1RZMA 5J5DA 3W2LA 2NUYA 3UPWA 1MZHA 2O7SA 2QJIA 1R2RA 4IJBA 1IF2A 2BX7A 4G1KA 3C52A 2VEPA 2C13A 3STCA 3LERA 2QJGA 4B5NA 2ZBTA 4OE7A 2WNNA 5D03A 4O57A 1Q6QA 4JYDA 3B03A 3FS2A 3GR7A 4K7YA 4JTJA 1ZALA 1T0OA 4GE8A 1YTEA 4KFPA 1IIHA 1D9EA 4NXSA 3W07A 1B9BA 3M43A 3NGJA 4X9SA 5HWNA 2ISVA 5DLCA 1OFDA 2B7PA 2VKZG 5HINA 4IXXA 1G4TA 2Q3OA 2V5LA 2QUUA 3SSJA 2TMDA 2PRLA 4Z1DA 4JX4A 1ICQA 2ABAA 1X6UA 3GNDA 3M16A 3QSRA 3R8RA 2P10A 3N73A 2QUTA 1OYAA 3BK0A 4CNNA 5FESA 3NM1A 1KFBA 4UMAA 2A6LA 4Y90A 3G1VA 3QSTA 4KKXA 2Z2UA 3USBA 1M5WA 4FB7A 2QF7A 1YDNA 3TKFA 1C9DA 4IOTA 3BARA 5D37A 2E6DA 3M5VA 4W9TA 5LHEA 4IWWA 3FFSA 4CLMA 3NA8A 3U6WA 3LHVA 4AEOA 4E2DA 5BMWA 2BTMA 1EB3A 3IVSA 3TV8A 4ZVJA 2CLFA 2Q8ZA 3NPUA 3PUOA 5G2HA 3ZWTA 2J9ZA 4JTIA 3GAKA 3QQ1A 1LRNA 3FJLA 1EIXA 2WV8A 3TA6A 1FBAA 3L67A 4H3DA 3P80A 1G69A 1WQ5A 2C15A 4ZQRA 5LNRA 1AL8A 4MPQA 4UXDA 5TIMA 2BSLA 3W1PA 2JBMA 4X22A 4ORMA 4N6EA 2VENA 5LGXA 3DI1A 2B7NA 4CQ9A 1YXDA 3HO8A 3C2VA 4JYEA 3DHDA 4NX5A 2R8WA 1E51A 3LV6A 1T99A 3NAVA 1LBMA 3TSBA 4MZYA 1QR7A 3VI2A 2OJPA 3HGOA 2OCZA 2P0OA 1SZFA 1OFAA 1YPFA 3UNDA 3O06A 3RNDA 1JUKA 1IXPA 3HB9A 4JY9A 1L6YA 2E5BA 3GYEA 2Q8LA 2PURA 3LRLA 3WJYA 1C29A 2FQIA 5IBXA 1HL2A 4LV9A 3RLVA 4GRSA 3TK7A 3QC3A 3PB0A 1H62A 2NLIA 3TIMA 3N2MA 3L66A 4RJEA 1SZNA 1LROA 5K9CA 2X1UA 4NNBA 1YPIA 3L0GA 3E9AA 1FCVA 1VZWA 4LTSA 5FEPA 3RFAA 3ZFHA 1AW5A 2GUUA 3WFAA 3B0VC 3S1VA 3LHWA 1Q3NA 4LC8A 2W79A 2RDWA 4RX0A 3W83A 5AHFA 2ZFAA 3SECA 5C54A 1YYAA 1GT8A 1GZGA 3KXQA 4IMDA 3UYCA 3BLIA 1NFBA 3QEZA 5H2ZA 4WX2A 1FDYA 4FNSA 4RR4A 3NDOA 3HF3A 3VKJA 5KZMA 3DH7A 4AF0B 2NWRA 1XI3A 1KM6A 6TIMA 4UMBA 2YFNA 2NZLA 4CQ8A 4AWTA 2X2GA 3C2OA 3C2RA 1UBSA 3FKKA 1VR6A 4XBKA 5HJLA 1Z42A 1HFBA 3M44A 1A5AA 4RCXA 1H63A 5F4SA 4J9JA 4AF0A 4TMCA 3MJYA 3DI0A 4OBTA 2V82A 1FCQA 3SGZA 2EKCA 1WDWA 4XKYB 3LX9A 1G7VA 5CGQA 3PF3A 1CI1A 3B4UA 3UXAA 4UNLA 2VXNA 3TNOA 3SR7A 1OYBA 4DXVA 1PV8A 2WJZA 3PSWA 3I65A 3MI6A 4JTSA 1LLWA 3LV5A 3W1TA 3P8JA 3HG2A 2A5HA 3GDRA 4XKYA 3W86A 1RR2A 1OJXA 4ADSA 1SO4A 3N34A 4PCFA 5AYYA 3HBLA 2EAWA 1LBFA 2TRSA 3LHUA 3C61A 2ZDRA 3I6RA 2TSYA 1NF7A 3GXNA 1XUZA 5A8GA 1W3IA 3CC1A 3FKRA 1RQEA 4HSNA 2J24A 2CZ5A 1FDJA 1L6WA 2C18A 4BK9A 3TROA 2VFHA 1JUEA 2YDAA 4MZ8A 4JN6A 2J88A 3L65A 3OBKA 1W3NA 4JXCA 3NQ2A 3PWAA 3SIZA 4MY9A 5L9FA 5C55A 4YMZA 3W7GA 2HS8A 1AMKA 1KBJA 1ZY9A 1B57A 1KM3A 1TPVA 2Y6ZA 3UWVA 5AHIA 1VGAA 1O5XA 5BW6A 4NZFA 4QJ1A 4QNWA 1UASA 1W5QA 3HGJA 1JCXA 3W7KA 3LXBA 3W84A 3PG8A 4DELA 3R5EA 1NSJA 1DVJA 2DZUA 1TV7A 4MFEA 2CW6A 3PB2A 3ATYA 5CPOA 1PCWA 3WK2A 2XFWA 4IX0A 4JIQA 1DORA 4UFJA 4EVZA 1G67A 3QF0A 4MY1A 4O52A 1VHNA 1AL7A 4M5PA 1SW7A 1AG1O 1F6PA 1OVDA 3TC7A 2ZRZA 4N2YA 4LVFA 1AW2A 4UMCA 2DZSA 4I7VA 2CLOA 3O16A 3KVKA 4YWIA 1OFEA 1JCMP 4CNPA 8TIMA 3QM3A 4MOZA 2FTPA 1TV5A 4DBEA 1T96A 3T4CA 4JTLA 2QCEA 3R2GA 1VH7A 4HPXA 4QITA 1OX5A 3DFTA 1FXQA 2O7QA 4FX6M 4Y8FA 5D2WA 3TH6A 5BOOA 3BLEA 4HIBA 4GBUA 3W7DA 4NVTA 1N7KA 3OVQA 1LLZA 3N14A 2F7FA 4PEKA 2OZ0A 1BWKA 2ZZ1A 3LDVA 3P61A 2GVGA 3DFSA 3T78A 3TX9A 5HWMA 1OF6A 5SWUA 1O60A 4UTWA 4C1KA 2VFGA 1Z44A 4JTHA 2CLHA 1KM0A 3B04A 3EX1A 5J5RA 1WXJA 3TMLA 1ONRA 2QCLA 4QNEA 5C6MA 2F84A 2GJNA 2RFGA 5EYWA 5LGZA 4WQ6A 2EF9A 3P67A 2B7QA 1WBHA 3I68A 3P84A 2ATSA 3M9YA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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