3W1RA

Structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with mii-3-045a
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
publication title Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-3-045a
rcsb
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 108
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2012-11-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 3w1rA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3w1rA01
1K02A 3S5NA 4E2BA 2ZRZA 5HWNA 1TPEA 1ZAIA 5K2ZA 3ZS4A 3LM7A 1S3HA 3O15A 3W1XA 1SO3A 4MY9A 4BWLC 1Q45A 3FYOA 3TAKA 4FEZA 2WNZA 1ML1A 2Z6IA 3PULA 5FEXA 1A5CA 1IXOA 1JQXA 3W73A 5BNKA 1B57A 3FFSA 3HGRA 4JY8A 2P1FA 3LHVA 2RH9A 5G2WA 3LCHA 3QSRA 3MHUA 4ML9A 4U4MA 1I2QA 3S1UA 1TTJA 2H8XA 3BVJA 4M5PA 1Q6RA 3L0NA 2B4GA 3GAKA 5D2WA 1XCFA 3TJLA 2TPSA 3FJ6A 1ZNNA 4UTHA 3MBFA 1LBMA 1OYBA 3P80A 3OVRA 2W79A 5CPOA 3TXVA 4MLJA 2GJLA 4MZ8A 3OVQA 2GVLA 4LU0A 5K9CA 3N3MA 3H55A 4ICNA 2DP3A 1THFD 3TMQA 3QQ1A 4ONVA 3V1PA 3NA8A 5HMSA 5AHFA 3NQAA 3DH7A 4JD4A 3GAYA 3DFTA 4JR5A 2IQTA 4KFPA 5DCDA 5CG7A 4KKXA 4O1BA 2PRMA 4KWVA 5D32A 1YXYA 3FJLA 1F73A 1GVFA 3L9CA 4JTFA 3P8JA 5KTLA 3DXIA 1G7VA 4XUGA 2WOQA 3NO5A 4UUIA 3BW2A 5FF7A 1TPC1 4S2BA 4JX6A 2VEPA 4A2RA 4CCEA 1OFQA 2V2HA 5CSSA 1TRDA 1V7YA 1VLWA 3MYPA 4JDBA 4ZQCA 3NEVA 2UV8G 2ZZ1A 3QF0A 4UTIA 2C13A 3PY2A 3USBA 4ADTA 1CX9A 3Q58A 3C3NA 3QEZA 1VYPX 3P81A 5DCBA 1B4KA 2I14A 3G0UA 5FI8A 2CLIA 4CNOA 3OVPA 1XBZA 4X2RA 3T7VA 5LGZA 3C0JA 4MOZA 3EWUA 4O1CA 2HSAA 2GVGA 3B03A 3NQCA 1J5TA 3SIZA 2NWSA 4NQ1A 4IXHA 1LYXA 5G2IA 4NZJA 1A53A 3TC7A 5IM51 1P1XA 1V5XA 3W7OA 1W56A 3IEBA 5E93A 2EKCA 4RR4A 3W7QA 2CWNA 1LZOA 3O05A 1AMKA 2X2GA 1U5JA 1LCOA 2YX0A 3NZRA 4XKYB 2VC6A 1DKWA 1H51A 1R2TA 3GVGA 3KAOA 3TNOA 4IJBA 3W72A 4W9TA 3VE7A 3LCFA 3TW6A 1OVDA 4QQ3A 3TQKA 1XBXA 5AHLA 3TROA 2YXGA 3GXTA 4QM1A 4OHQA 3STEA 1QDSA 1WA3A 1YDVA 5SWUA 2YPIA 3QPYA 4NT0A 4E0CA 3L66A 1VYRA 3L5AA 5KMYA 3L2IA 2F84A 1KBIA 2FPTA 2C19A 1TTPA 2B7OA 1TPWA 3GX9A 1LOLA 4ZVJA 4FXSA 1YPIA 5AHNA 1SSGA 3SW6A 4DO6A 4UFLA 2G95A 3TFXA 2Y7DA 4AWTA 4PCFA 5FF0A 4IMFA 3BO9A 2EGZA 4UR7A 3NQEA 4HNTA 2X1RA 2YW3A 2YYUA 3M5VA 3G1FA 3CTLA 2Q3RA 3DZ1A 3FIGA 1RVGA 1JCJA 5LHFA 2A6NA 3LB0A 3HF3A 1C29A 3PUEA 1P4CA 4TU1A 3EX1A 2CZFA 3C8FA 1TV5A 4A22A 4A3UA 2X1UA 3GIYA 3UWQA 3WJWA 2EAWA 4KWWA 1ZALA 4UTWA 2QJIA 1VGAA 4O15A 3LCXA 4POCA 3G8RA 4UC5A 5F4WA 3LXCA 4PC8A 1PIIA 3AJXA 3KFTA 2V0TA 1ONRA 5K4ZA 3OBKA 3G1SA 3HPXA 3EWZA 4AF0A 3LV6A 3LLFA 4O4VA 1GYNA 3W07A 1LLWA 3NQ7A 1GPWA 3LXBA 3KRUA 3ELFA 5K7JA 1H1YA 2RDTA 2ZYFA 3QYQA 4M6PA 4QSHA 5D2VA 3LHTA 3EKZA 5L9FA 3SR7A 3HMJG 4LS2A 2Y61A 3HB9A 1QPQA 4M7SA 3B8DA 3I6RA 3WK3A 4XKYA 3LX9A 3RLVA 2R14A 2QAPA 2YW4A 3LTPA 3M43A 4JYEA 1H1ZA 2CLFA 2CZEA 4JTKA 4Z1AA 1GG0A 1IIGA 3GR7A 3FS2A 1PVNA 3MWAA 2A85A 3F1QA 1OYCA 3MP4A 5J5RA 2CZDA 4Z1BA 5AFDA 1K03A 5LNSA 3FA5A 4FNQA 2BXVA 3ABQA 4HT3A 2NXHA 2YGYA 1OABA 1P0KA 2TRSA 5D02A 2JGQA 2RKXA 2B7NA 1SO4A 4PEKA 1WX0A 3MO7A 3W7PA 3TSDA 1J2WA 1DHPA 2GOUA 5H91A 2CZ5A 2ZZ7A 1ZAHA 4UCGA 3W1QA 4KFOA 5E0KA 3QSTA 1W31A 3C2RA 3NL2A 3HG3A 3LHYA 4TO8A 4JTJA 1GTEA 3S1VA 1W37A 1KLYA 1O94A 1R47A 3M6YA 4NXSA 3THAA 2CU0A 1SW3A 3TDFA 4UNLA 1ME8A 1LORA 3R2GA 4WXYA 3W7MA 5CPLA 3PSVA 4RZ4A 1LOSA 4UR8A 3GDRA 5CZSA 3LHZA 4XQ6A 5KINA 1FCUA 4U28A 1X1ZA 3O06A 2C6QA 4IUOA 2WO5A 1S5WA 3VFLA 3FKKA 2V81A 4UTWC 5K9DA 3KVLA 4IXXA 3W86A 4HNUA 3O16A 2QCCA 1DOSA 3FEMA 4Z08A 3GK0A 3GDTA 3RF9A 4OV9A 2QUUA 4UIOA 3MP5A 2NWRA 3DI1A 6ALDA 4RKAA 3A5VA 1LRQA 4GRSA 1EP2A 1RQEA 1KM6A 1W5PA 2PRHA 1QR7A 1A50A 3HPZA 3B06A 4LW7A 3G1VA 2C14A 2E6DA 4JIPA 2I9EA 4CCDA 2Z0IA 4UFJA 2A5HA 2WSYA 3NDOA 4DXVA 1MSSA 3C2VA 3T4CA 3N2MA 3KHJA 3THQA 4DQWA 3IRDA 3EX6A 1LRNA 5FF3A 2ATSA 3S0CA 1H7RA 4WY0B 3MI6A 1G7UA 1SSDA 3RFAA 1FBAA 5FEPA 1OFAA 3ZWTA 3HG2A 2Y7GA 1FY6A 1QCWA 4BF9A 2GQ9A 3VI2A 2YFNA 1JCXA 3HG5A 2AAMA 1VHNA 4LVFA 3CIWA 4WXZA 4MIMA 1ME9A 3KVMA 5CZ0A 2CLEA 3F4NA 2WNQA 3W2LA 4FXRA 1H7PA 4HSOA 4P61A 1P5BA 4EF9A 1Q6LA 1WAUA 3F03K 4JGDA 1U83A 4GJ1A 3EWBX 4RXFA 3W1UA 3N73A 3MBDA 1PHQA 2X30A 1GZGA 3P62A 5HWJA 3RU6A 2ISSA 1GYLA 3TR2A 3TCEA 1MZHA 5DELA 1F5ZA 1W5OA 1O5KA 4IMGA 3WFAA 3L5MA 2ZRWA 1JVNA 1YTDA 3NL3A 1K8YA 2A0NA 1TJPA 1I2NA 1KM5A 1YTEA 4IQLA 4JYDA 4PA8A 2E09A 2FQIA 4LY8A 3TSMA 5AYZA 4O50A 4JTSA 3W1TA 3HO8A 3CWNA 3NOEA 4JIQA 4O53A 1K8XA 1G4TA 2QCDB 4QJ1A 3S6DA 4Q4KA 1KTCA 1TPH1 4JTHA 3GLCA 1VCGA 1DQXA 4LC8A 2E5BA 3M5YA 4O12A 4EWND 1SW0A 3BGGA 5G1TA 4TR9A 3Q2DA 4JTUA 3B0UX 3QPZA 3NPXA 2A7RA 3PSWA 1OFOA 1SZGA 1YTKA 3DFOA 1TPVA 3GDLA 4GUFA 1OF6A 1TRIA 3STCA 2JBMA 1VPXA 4WJEA 1GVRA 1H7XA 1W3IA 4H3DA 1MO0A 3QC3A 3B05A 3TKFA 2EPHA 2QUTA 3HGJA 1WOBA 3BG5A 4UMCA 1TPFA 2ZZ5A 4XWUA 1JCLA 1J4EA 4RXGA 3C56A 3EX4A 4FHAA 1K7FA 3WK0A 3W7LA 5LNWA 3SGUA 2J9YA 3UWZA 1OK4A 1QFEA 3G24A 4UTKA 4FNRA 1L2UA 1YADA 1VCVA 1G69A 3HIJA 1ALDA 2A2IA 3NPWA 3VE9A 1ICSA 1G4PA 2X1TA 3IGUA 4J9JA 3LHWA 4AHQA 3S8HA 3G3MA 4K37A 1WOAA 3W74A 4O52A 4IWWA 3DENA 2BTMA 3UWYA 1SO5A 1H7OA 4A2SA 1OK6A 2F7FA 4NXKA 4YXGA 2DZWA 5I3GA 2NX1A 1IXNA 1X6UA 2LLEA 1W5MA 1LP6A 2BSLA 1SUXA 3P5ZA 3KVJA 1FDZA 1AW1A 4JN6A 2HMCA 5D33A 3W84A 1EEPA 4MJZA 5L6UA 2Y6ZA 3JR2A 2YCEA 1BWKA 5HR7A 3GR8A 5AHMA 1TREA 3L68A 4RJEA 4O10A 5I3FA 1EUNA 2JGYA 1QOPA 1UBSA 3UWVA 2JKAA 1YDOA 2ZCGA 4UFMA 1IF2A 1I2PA 5CZJA 1LLZA 1RZMA 2H6RA 2QCNA 1QO2A 1I4NA 1TTQA 3DAQA 3NGJA 3BARA 7TIMA 2R8WA 1ZENA 3HOJA 2QCDA 4IX2A 3L5LA 4TX9A 4WZHA 1AL7A 3L65A 4BI5A 1JRCA 1G6CA 3W87A 3EXTA 2E6FA 4JX5A 4L4LA 1YDNA 1D3HA 3G22A 2NZLA 1W5QA 4AHOA 4UTJA 3PUDA 5KSWA 4AEOA 2QEZA 4WX2A 1XDLA 3KOFA 4NZFA 1AW2A 1VHCA 1WV2A 3BLFA 1LM1A 3SZ8A 2V8ZA 2JK2A 3DGRA 4ZQPA 3G18A 4WD0A 5U4NA 2V5LA 5EYWA 2QKFA 4YL2A 3BLEA 3DHFA 3GDMA 4ADSA 3G1YA 3FOKA 1QMLA 4XTIA 2BZNA 1QWGA 4AXKA 3LRMA 1B4EA 1TB3A 4HSNA 4NVTA 4JNMA 4K38A 3MHFA 3C52A 4NJGA 3PWAA 5C2XA 4Y6GA 3CIXA 3D0CA 3I7SA 4LWWA 3W7EA 3LDVA 3U6WA 5F2IA 1T0OA 2ZZ6A 1VRDA 2OZ0A 5HJLA 1UCWA 4P2VA 1C9DA 1C8VA 3O6YX 4IPJA 4FO4A 1EA0A 4LOCA 1KFLA 3H53A 3ABSA 1SQ7A 1DV7A 2DJLA 4E38A 2WSQA 2OT1A 3R12A 5CPMA 3IV3A 4JTGA 5FEZA 1FX6A 2FB3A 4LVAA 1AK5A 1PE1A 1LBLA 2A7NA 3NR0A 1KLZA 3NQMA 2BX7A 3MYOA 2O7SA 3UY8A 4YWIA 4LUJA 5AN7A 3QMSA 3IVSA 3ABRA 1G4SA 3PC0A 4K7YA 1IIHA 3G0SA 4R53A 2CLMA 3CM4A 1FWSA 1W54A 1ADOA 4MY1A 3N9RA 1TO3A 4HIBA 5J5DA 2E6AA 3STGA 1EB3A 2G5WA 3N2XA 4JXCA 3A9IA 1TIMA 4N9BA 2DZVA 1OFBA 1O4UA 1OX6A 3BGJA 3U8GA 3G3DA 3FLUA 1GVQA 3TSBA 3UNDA 4IMDA 3GNNA 3I65A 4ZQNA 3SSJA 1QOQA 5DY3A 4JX4A 2ZDRA 4RK8A 2VELA 1UJPA 4GFSA 3M9YA 3NQ8A 1NAL1 3TMLA 3IIPA 2E5CA 3OIXA 2YZRA 2E5DA 2V30A 1GTHA 2WNNA 1R2SA 1H63A 1JJKA 4TIMA 1FWWA 1D3GA 4NU7A 1L9WA 3TA6A 1Q6QA 1SZEA 3DFSA 3I68A 4NJIA 1DJQA 4WY0F 4O4WA 4ZQOA 3WJYA 3LBMA 2OMAA 2EF9A 3KRZA 5HQEA 3W7KA 1BKSA 5AYYA 3W2NA 1XM3A 2QCLA 3O07A 3N19B 1KFBA 1HTIA 3LCWA 2Y85A 1K7EA 2ZZ4A 3W1RA 1PS9A 4N9DA 4HNVA 3MP3A 1GVSA 1FDYA 1Y0EA 2J9ZA 2VEKA 1JUEA 5FF2A 4LT9A 4XTDA 3QZEA 1H7WA 5DCEA 3V75A 5HR6A 4ZMGA 5LHEA 3P7YA 4D2JA 1VS1A 1ZAJA 3CQ0A 2FJKA 4MLRA 2YSWA 2NXIA 4PFMA 3LXAA 2J88A 4O0ZA 3QW4B 4ZQRA 1IXPA 3C61A 4UFHA 3F4WA 2C15A 3R89A 1UUMA 1BTMA 3NM3A 4G1KA 2XN0A 1VH7A 2C18A 3NQVA 2KZHA 3QW3A 5EBUA 2QCGA 4DO4A 1FDJA 1FXPA 4WUIA 3LCGA 1HG3A 3UPWA 5F4SA 3ATYA 3NYZA 1W1ZA 1KM0A 1F6KA 1TPB1 1JUKA 3PM6A 3W22A 1JCNA 5D2XA 4BFAA 3LLDA 5K9XA 2RFGA 3O6CA 1JUBA 5LNVA 4NJJA 1R30A 4GC4A 3W3OA 2C3ZA 4LTSA 2R91A 3EB2A 1OX5A 5TQLA 3B04A 1PV8A 5KITA 2VOMA 2ZZ2A 3TH6A 1X8FA 5F2LA 2W0UA 2RDUA 3GNDA 3LTYA 4N4PA 1OFPA 1JCYA 2NX9A 3UZ5A 1ICQA 3W1MA 1W3TA 4OT7A 3TU9A 4X22A 5HUOA 5CPNA 2VFFA 2TYSA 3R8RA 4K7VA 4DBEA 3FYPA 3BW3A 4OU1A 4K6AA 1VJIA 3P5YA 2EHHA 4FNPA 2NUWA 3UQNA 3KRSA 1VYSX 3Q94A 1H5YA 2ZA3A 3P84A 1QNVA 1LROA 1KFJA 2OCZA 3C2EA 5EA9A 3E12A 3E96A 1KM4A 3MHGA 3NXFA 3LHUA 3LRKA 1PCWA 3RK8A 5HWMA 3W7JA 1L6SA 1KBJA 2C0AA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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