3W1UA

Structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with mii-3-111
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
publication title Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-3-111
rcsb
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 107
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2012-11-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 3w1uA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3w1uA01
1TPWA 2PRMA 1L2UA 1NSJA 4JGDA 1N8FA 1KM2A 2QUUA 5LKYA 1LOLA 1OFPA 4O15A 1KTCA 1FWWA 3G18A 3NAVA 3WK3A 2ZRXA 5HUPA 1EA0A 2NWSA 4JXCA 4K8HA 3W2UA 1RD5A 4ORMA 1LORA 1XBXA 3JRKA 1GYNA 2YR1A 3MO7A 5U7SA 1VJIA 5HNRA 3LXAA 4UFLA 3QFEA 2OJPA 4WY0B 4UTWC 3E9AA 1H7RA 1LOQA 3LRMA 4LUIA 1TPFA 5LHEA 1FXPA 2CZFA 1VS1A 3TW6A 1VYPX 2V8ZA 3LI1A 4LC8A 1SW0A 1SFLA 1PCKA 3L0KA 4UFMA 3P84A 5BMWA 5FF3A 3C6CA 5DCEA 4GBUA 2R91A 2QJIA 2C13A 1TREA 1X8FA 3VI2A 1YPIA 4O52A 1PCWA 1J4EA 5IM51 4LNYA 1PIIA 3EWYA 1TPUA 2CLIA 1SZNA 3RNDA 3N3MA 4BK9A 1NF7A 1JJKA 2QCGA 1AG1O 2QCLA 2W6RA 1Q6RA 6ALDA 1W0MA 4P2VA 1RQEA 1IXPA 1PVNA 2RDTA 3FKRA 1Z48A 4I7VA 1JQVA 4WD0A 5I3HA 3ZWSA 4WUIA 3Q58A 3L67A 1ALDA 1UBSA 4FNTA 3QF0A 4K39A 3HQ1A 4O53A 4HPXA 1DHPA 5DY2A 2OCZA 4UR8A 1KLZA 4W9TA 4FB7A 4YWIA 3ANYA 5K9CA 3UZ5A 3W76A 3GR7A 3TXVA 1WYIA 3SECA 1WV2A 4LT9A 4H4IA 3TA6A 4AF0A 1K8YA 1HFBA 4LVAA 3CHVA 1HL2A 2AAMA 2V81A 3CC1A 4MFDA 1TPVA 2JKEA 2QUTA 1YDNA 3NVTA 3DI0A 2X30A 2C19A 4TR9A 1I2RA 1EUNA 4A2SA 1WQ5A 4N4QA 2CLMA 3O6CA 3NZRA 4LRSA 1JCXA 4LU0A 3G1DA 2TSYA 1OFEA 2E1DA 3NQCA 2ZYFA 5K9DA 3EWZA 3MHUA 3QMRA 4TIMA 4JY9A 5T26A 5G2WA 3BW2A 2H8XA 1Z44A 5I3FA 1S3HA 1QNVA 3DHFA 3P8IA 4PH6A 2ZZ5A 1VYRA 4MZYA 3ZR4A 1W54A 1W3IA 3BVJA 2E6FA 3G1XA 3MHFA 4E0CA 4NNAA 3IV3A 5AC6A 5G4EA 1H7XA 3UY7A 5L9FA 1AW2A 2E5BA 4O11A 4NJGA 4QIUA 3W84A 3W85A 2Q3OA 3KVJA 3HG4A 3KFTA 4JYFA 1KM3A 5E0KA 1SO4A 3B0VC 3LCHA 4UTLA 2QCDB 5F2IA 3TUUA 5DBTA 1WOBA 1YTDA 1EUAA 3R5EA 4JYDA 4FXRA 3I7RA 4JIPA 5K7JA 1ME9A 1RPXA 1TIMA 4XBKA 2AQWA 4OU1A 4UUIA 1EX5A 3QMSA 5FF2A 1VPXA 2H6RA 4JTKA 3N14A 2JGYA 2C6QA 4OV4A 3UWQA 1YLVA 3I7QA 3OVPA 2A7RA 3S1UA 1GTHA 1PV8A 3W86A 3QJAA 4GNJA 1A5CA 3PB0A 1FY6A 1H7WA 5EKYA 1VHNA 5AYZA 4IX0A 3EKZA 1VCGA 1OX5A 4CCEA 2DJXA 3W2LA 4ADUA 1S5WA 1W37A 4O18A 1KFKA 2QR6A 3G0UA 3W1MA 3BLFA 2EF9A 3T7VA 4Z1DA 5KSWA 2ZZ2A 5C6MA 1Q45A 5FEZA 2WSYA 1I8JA 5CZJA 3EXTA 2VEPA 4HNVA 4IOTA 1LBFA 1KM5A 5F4SA 4MYAA 3L0NA 5FEWA 2FB3A 1HTIA 3KXQA 1O94A 4AXKA 2A4AA 3O63A 4O1AA 5C2XA 3QM3A 2WPBA 3BG5A 5KMYA 1LROA 1SFJA 1TRIA 3IIPA 2YYTA 1ICPA 1XUUA 2A21A 2ALDA 2TRSA 4DPQA 3PM6A 4AAJA 3HOJA 4N9BA 4BI6A 3ZS4A 1KW1A 1OFDA 4N6EA 1JCYA 2ZRZA 2ZA1A 3TJXA 5EYWA 2XN2A 1TQXA 3ATZA 4A2RA 5U4NA 4BF9A 2X16A 3NQVA 3C52A 2V2HA 4IUOA 2V5BA 4HT3A 3T55A 3LHVA 3WJWA 4O0ZA 4S2CA 4Y96A 3TSMA 5HUOA 3E96A 1LLWA 3UWZA 4N9CA 2G97A 3UQNA 4NX5A 3IEBA 2ATSA 3A9IA 4FO4A 3KVKA 3B0PA 2NXIA 3SSJA 3W1AA 4Y90A 3NQ2A 5D2XA 3EB2A 1THFD 4H3DA 4CQ8A 4FF7A 2R94A 2Y70A 4IX2A 1XFBA 3M6YA 3DFNA 5AHNA 3MP3A 1OABA 1HUVA 4I9AA 4MY8A 3B05A 5AC8A 5HULA 1L6YA 3LCGA 1F76A 1JULA 1LBMA 4A21A 1T99A 1ZAIA 3W75A 1FWRA 3I6RA 1SSDA 3R89A 1TYGA 3KRZA 1B9BA 4UIOA 3DU0A 1OFBA 1BKSA 1ME8A 4JDBA 3MW7A 1VRDA 3BARA 1SUXA 4N2YA 2FIQA 1IXOA 3LLFA 2GUUA 2O7QA 5D2WA 1FDYA 3L2IA 3N9RA 1YXCA 2HMCA 3NM3A 1FBAA 4DXVA 1XUZA 5F4WA 1QOPA 3STEA 3PULA 4JS3A 4K37A 4M6QA 2QCMA 2RKXA 3L5AA 4GXMA 3O16A 3NO5A 5FF7A 3NL6A 2PE4A 2RHGA 3F1QA 4RV8A 3KAOA 1LBLA 1VHCA 3NXFA 3EEGA 4O4VA 4UTIA 2YW3A 3FS2A 1GZGA 2PC4A 1VZWA 2VKZG 1TV7A 4RZ4A 3N34A 5C55A 4WZHA 3LHWA 1QPOA 4UMCA 3QW4B 4KWVA 3R8RA 3TH6A 4DF2A 4DQWA 3A21A 4U4MA 3INPA 1KM1A 2ZTKA 2GQAA 2VEMA 2NX9A 3I65A 1MEIA 1HO1A 3EX3A 5KZDA 1TPEA 4HNNA 1W5OA 2Q8ZA 4IGHA 4ONVA 1OFAA 4LUJA 1W3NA 1VCVA 4JTFA 4NNBA 4X22A 2UV8G 3KX6A 3W7IA 2H8ZA 3VKJA 3C0JA 3W88A 2DZXA 4CLMA 4QITA 2CLLA 3EX1A 4E2DA 4ZQCA 3KVMA 4UTKA 3C3NA 3W72A 4O1BA 3IGSA 1H60A 4JTEA 2E77A 3M5XA 1SO5A 3W3OA 3SR7A 3MI3A 1GJPA 1QCWA 3LCWA 3ABSA 4QNEA 1P5BA 3R12A 4QQ3A 1R30A 1XBVA 3QQ0A 3P67A 1GG0A 4AHPA 4OQVA 2R8WA 4D2JA 1K3UA 1FDJA 3W70A 3W6YA 3OG3A 3DZ1A 4Y8FA 1GVFA 1H7NA 3W7PA 3NQDA 5AHEA 3HO8A 2CLOA 2W0UA 3OBKA 4RX0A 3W7DA 3HG5A 3TE9A 4HSNA 1Q3NA 2QCCA 1M7OA 2Y7FA 3W1NA 5DY3A 4LV9A 3MI2A 5G4WA 4AHOA 2CZ5A 1VQTA 3A5FA 5LGZA 3PSVA 4K7VA 4NJJA 3G1FA 3R13A 2HTMA 3SFKA 2ZRVA 4BI5A 5I3KA 3PR2A 4YXGA 1K03A 3QRHA 5FESA 1KBJA 1K7XA 3AO0A 1V7YA 3W7EA 2WSRA 4JTSA 1DL3A 2C14A 5AOUA 3RLUA 4PFMA 3WJYA 5BMXA 1F6PA 1WBJA 1UCWA 4OE7A 1H1ZA 3GDKA 5AC7A 4UTMA 2V30A 3LRKA 2C15A 4BFAA 1Z42A 1OX4B 1Q6QA 2QCEA 4UFJA 5FEPA 4GUGA 3W2KA 3P8JA 5KINA 3FIGA 4I7UA 3S5ZA 2WSQA 4DF1A 5D09A 2C0AA 3HGRA 1ZY9A 3PC0A 1DQXA 5F2MA 4NJKA 4IXXA 2JKAA 1QPRA 2HS6A 4PCFA 5D30A 1PE1A 3F03K 1XDMA 3WK0A 2Y6ZA 4OWGA 3W7GA 4GRSA 1O60A 4WOZA 4A3UA 2YDAA 4AWUA 2V9DA 2JGQA 2CFFA 1LZOA 4LVGA 3VCRA 4CCDA 3DBPA 1G4PA 1TTIA 3FEMA 5CPNA 4FNQA 2VENA 3GVGA 4RK8A 1N55A 3E49A 3TFCA 1BWKA 4DO6A 3LB0A 3BK0A 3SZ8A 1RVGA 1T8XA 3N19B 3C2VA 2OX1A 4N02A 4NZFA 3RK8A 3GB6A 4O16A 2ISWA 4WX2A 1D3GA 1EWEA 4Z1CA 3S8HA 1LDCA 2CWNA 2CZEA 3VNDA 3BG9A 4N6FA 3FKKA 2J9XA 4DEFA 4S2BA 2J9ZA 2R14A 1GVRA 3HGOA 4GC4A 1B57A 1XI3A 1W5MA 3P5ZA 2DZWA 1F74A 3NA8A 4Y6GA 3DFTA 1JVNA 4IPJA 2Q8LA 3S42A 3GDTA 2V2DA 3KOFA 3L5MA 2I14A 4Y9AA 4Q4KA 1C8VA 3LM7A 1FWTA 4G1KA 1LM1A 2BSLA 1A5AA 2BZNA 4AHQA 1TPB1 1YYAA 4ORIA 4Z0SA 1A5BA 4UTTA 5AHIA 1IGSA 3QQ1A 1XCFA 4ZMGA 2KZHA 4YCPA 4RXFA 2GVLA 5G2IA 3D0CA 1RV8A 5D38A 4EF8A 1QWGA 2YFOA 4O54A 4XTIA 3T40A 2CLEA 5LNWA 4HHPA 4O28A 4C1KA 3MMTA 4DO4A 3MWAA 2F84A 3VE7A 4RZ6A 3LX9A 4N9DA 1XC4A 1IXQA 5CSSA 3OIXA 5AYYA 1JQXA 3TXZA 4CNOA 3F4WA 2ZRWA 4O10A 4DO5A 3TQ0A 1H61A 1LYXA 3B06A 1S5VA 1W5NA 3THAA 4O0KA 3TMQA 4JNMA 1LTDA 4LVBA 5AFDA 1EB3A 3LTPA 3GNDA 3ZFHA 1VYSX 3LCFA 5F4XA 4PC8A 3G1VA 1TMHA 2A0NA 1W5QA 4KFNA 1VLIA 4BWLA 1EIXA 3ABOA 4LS2A 1T0OA 3BGJA 1GEQA 1IXNA 3QYQA 2XN1A 2A6LA 4XZ9A 1P0NA 1DJQA 1QDSA 5EPDA 4GUIA 3STGA 1JCNA 1JCMP 3NL2A 1GVQA 2J27A 1QPNA 1B4EA 4NU7A 3Q94A 4H6KA 1P0KA 2VFIA 5E93A 1OX6A 2FTPA 2GOUA 2VFGA 3TMLA 3C4UA 3LHYA 1SR9A 4XKYA 3A22A 3GZ3A 2Y62A 2VFEA 5CZ0A 1I2QA 1J5TA 1NVMA 3M43A 3GX9A 2ZZ6A 2FB2A 2GPTA 4M7TA 5D2YA 1Y0EA 3WK2A 4UMAA 4HN4A 4MOZA 3MJYA 1WAUA 5CKSA 2BXVA 1O4UA 1G6CA 3H54A 4LOCA 3W1UA 3TAKA 5EA9A 1TB3A 3DKJA 2B7PA 2X1SA 3MP5A 5FI8A 5A5WA 4UR7A 4MJZA 1OJXA 1WA3A 2YZRA 1OK4A 4OGZA 3P80A 3O1NA 3I7SA 2EKCA 1SQ7A 2NX1A 3W7JA 3G24A 3W71A 3TROA 2GQ8A 2PRLA 1MO0A 3S6DA 3DHDA 2Z6JA 4M19A 1KM6A 4CNNA 4IPIA 1AL8A 3IIZA 3C2EA 2V5LA 4FEZA 4GE8A 4EF9A 2FDSA 3WJZA 3C61A 1SU5A 2OZ0A 1OFRA 3QSTA 4O4WA 1UB3A 4ZQNA 3E12A 3FA5A 2QKFA 1FCQA 5I3GA 3L9CA 4LTSA 2EHHA 1CI1A 3EX2A 4O19A 5BOOA 3TAOA 2XN0A 1I2OA 2FQIA 3G0XA 2FPTA 2VFFA 1JUKA 4NNCA 2NV2A 4L4LA 3LTYA 4MUZA 1NFBA 2TMDA 3HPXA 3HIJA 4UFKA 2P1FA 2B0MA 3HB9A 3MI6A 1L6SA 1TV5A 1TJRA 4ZVJA 4AVFA 3RU6A 2FPYA 4M6VA 1E51A 1OX4A 5KZMA 2QCNA 2C18A 3HGJA 2GVGA 2NLIA 3P61A 1XBYA 3G1AA 4KWWA 2RDUA 3N2XA 1A50A 5DELA 2X1UA 1ME7A 2YXGA 1TV8A 1D9EA 4AEOA 3NPWA 4EIVA 1GPWA 3FYOA 3N73A 1PHQA 3SGUA 2G95A 4FHAA 1G67A 3M44A 3TDFA 1S5TA 1R2SA 4Q32A 4ZZ9A 4K38A 5DXXA 2V0TA 2Q3RA 3G0SA 3MHGA 5C5YA 4QAIA 4E2BA 1F05A 4RZ5A 1FDZA 4EOUA 3P60A 3WFAA 4KFOA 2CLHA 2V2CA 4WY0A 3EWUA 3VE9A 1DQWA 4I7WA 2Y7EA 5D2VA 1G4SA 5C54A 3LRLA 4O14A 2HS8A 2ABBA 1W31A 3T44A 3PBUA 3W1QA 7TIMA 3BPWA 1KTBA 3HF3A 3QC3A 4QNWA 4PODA 3WK1A 3W1XA 3RF9A 3PSWA 2FFCA 3A5VA 3NDOA 5G1YA 4MFEA 5H91A 2WO5A 1TPDA 1OYBA 1LCOA 2X2GA 3G22A 1O5KA 1SSGA 1DJNA 4O12A 1TO3A 5D33A 5K4ZA 3ZWTA 3V75A 3UNDA 1LRNA 4C1LA 1AL7A 1AMKA 3LCIA 2J88A 4YMZA 3DFPA 3NQAA 2WQPA 1SZGA 1IIHA 4P61A 3CB8A 1W3TA 2QAFA 1GYLA 3LHTA 1LLZA 4ML9A 1CW2A 4MZ1A 4R33A 4S1FA 4KFPA 4PTNA 1YXDA 3DENA 4NX0A 1OK6A 2DZTA 1H50A 3M5VA 4L4MA 5TBOA 1ZALA 3ABQA 3B0UX 2ZQ0A 4WXYA 1FCUA 2E68A 3GXTA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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