3W1XA

Structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with mii-3-121
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
publication title Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-3-121.
rcsb
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 104
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2012-11-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 3w1xA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3w1xA01
3BV4A 2P10A 2WSYA 1EPXA 1OFDA 2AGKA 4MZ1A 1A5BA 1R2SA 1CI1A 1LLZA 3W7NA 3PR2A 5AC8A 4IMCA 2J24A 1VYSX 1VGAA 2OT0A 4HPXA 2ZZ7A 4PFMA 4ZQCA 2B7OA 1JCMP 3FYOA 1QO5A 2IQTA 2ZCGA 1DL3A 2C16A 4Y8FA 3NPWA 3O06A 5D2XA 4FNQA 4DF2A 4JN6A 1TPC1 4XTDA 4ZZ9A 4JX6A 7TIMA 1ME8A 2CFFA 3DGRA 3W7JA 1XDMA 5HJLA 3O1NA 3QPYA 4FXRA 3S9YA 1ZCOA 4YCOA 5K7JA 3W71A 1WXJA 1D9EA 2DZSA 4E2BA 2WKJA 1TV5A 2V5LA 4S2CA 5BNKA 3CEUA 3O63A 1MO0A 3DH7A 4GE8A 5HQEA 4LVGA 3B03A 3W2UA 1IGSA 1A50A 4N6FA 3NQAA 4NUWA 4GXMA 3TC7A 3LDVA 1I2OA 5DY2A 4NZFA 4ZQRA 1OX4B 2NLIA 4UTHA 1TREA 1TTJA 3P62A 1LRTA 1VH7A 3IGUA 4JX4A 1BWLA 3OVPA 2YW3A 5HUPA 2Z6JA 1T8XA 4W9TA 3NAVA 2J88A 4FO4A 4M7SA 4EWND 3TNOA 4AHPA 1TTIA 3C3NA 1M6JA 4G1KA 1OHLA 3IEBA 3CWNA 4FNRA 5L6UA 3KHJA 2D73A 2R14A 3LCWA 4HT3A 1F6PA 3SY5A 5LGZA 2F7FA 1XXXA 2CW6A 1TPUA 5HWMA 3LHVA 1N7KA 1RVGA 3ABQA 3NDOA 4K37A 3U6WA 5K2ZA 2NUYA 1OFBA 5BW6A 3KX6A 3R8RA 1RD5A 1SO3A 1IF2A 3L0GA 4OV4A 1KA9F 2DZUA 5AHFA 4IXHA 3GNNA 3C4UA 4Q32A 3W1UA 3LTPA 3MI6A 4K8EA 4HNVA 4AVFA 3G24A 4QAIA 4AWUA 1B4EA 1W3IA 3UZJA 1GTEA 4RK8A 1ZALA 3KRZA 2A1YA 4JY8A 5G2IA 1JR1A 1IXPA 3VNDA 3G18A 1K7FA 3A5FA 4UFKA 1YXDA 4WOZA 3TSMA 1LRQA 4MLRA 1S5TA 2DZXA 5DXXA 2GUUA 2Y70A 4DF1A 3P82A 2QF7A 2ISVA 1MEWA 1Z41A 4L4MA 3VCRA 1EWDA 3CT7A 3M5XA 5AHMA 4IUOA 4JEQA 3W7LA 1XI3A 5AYZA 1QPNA 2ZRYA 2TYSA 4N02A 3GX9A 5FF2A 3MHFA 3G1DA 5GVJA 5I3KA 4CLMA 1WBHA 4X3ZA 3N9RA 3Q58A 3BLIA 3N9SA 4KFPA 4O28A 5G1YA 3E02A 1KFBA 3A22A 4E0CA 4GWEA 3T78A 4PEKA 1O94A 2QUTA 2ZRUA 3DFPA 1NF0A 3L0KA 5D37A 4MJZA 2YDAA 1TTPA 2CLLA 3N19B 5HMSA 2NXHA 5D03A 2NX1A 2ZRVA 4OHQA 4BWLC 4MFEA 4EVZA 2I14A 3MP5A 1EUAA 3EX2A 3NL3A 4WZHA 4JICA 3NL5A 4C1LA 2V81A 3P60A 3T40A 4HN4A 1HG3A 2QCLA 4S1FA 1VQTA 3IVTA 1ME7A 3TROA 1LTDA 2QJHA 2VENA 4JTHA 3UPBA 1SZNA 4JDYA 2QAPA 3UZ5A 4PODA 1OFEA 1UUMA 2BTMA 4JTTA 5DXYA 3NNTA 3O15A 2VELA 3TCEA 2OCZA 2YCEA 1GEQA 4NNAA 3O16A 4FX6M 1O5XA 1VHNA 1ALDA 2G97A 3O05A 1TPVA 1PE1A 2VFIA 2QCMA 3EX4A 3KVJA 5H2ZA 3UWUA 3L5MA 1GOXA 4RLIA 4NXSA 4BWLA 3NG3A 4N9DA 4WY0A 3NQ8A 3MUXA 1P4CA 3EXTA 4AAJA 4GC4A 2NV1A 5E1QA 1FCUA 3W1QA 3BVJA 2ISWA 1H7OA 5LZLA 4IWWA 3EXSA 3GDRA 4M19A 3W83A 2VKZG 5F4WA 4UMAA 2Y62A 4E38A 3GNDA 3E49A 3P61A 1RPXA 3TR2A 3TUUA 2W6RA 3C6CA 2ZA2A 5CZTA 3W73A 4MZ8A 1FDZA 2V2DA 3W6YA 3LLFA 3E0IA 4LS1A 4XKYB 5KSWA 3SGZA 4NT0A 4WY0B 2YZRA 1SSDA 4JIQA 2A85A 2ZZ6A 4M7TA 1FBAA 1IXOA 4QITA 1FWSA 4M5PA 2NWSA 1GQNA 5CPNA 4I7WA 4MY9A 3GYEA 3TFXA 1G7VA 2GVJA 3EEGA 3DZ1A 3MP4A 1H63A 5AOUA 1IIGA 1KFLA 3N14A 5CZSA 1KM2A 4DO5A 4HSOA 4ONVA 4CCEA 2FQIA 3S42A 1VR6A 1K7EA 1QWGA 2QDHA 3LRMA 1H62A 2Y7DA 3T4CA 4GUIA 2V2CA 4TIMA 5HNRA 1FXQA 1FCQA 3PULA 2H90A 4LS0A 2JGYA 5G5IA 5I3GA 5AFDA 1X1OA 2OT1A 1SO6A 5FF4A 3S1XA 3TXVA 3W7DA 5LNRA 5DCBA 1F5ZA 3UPWA 1GT8A 4E2DA 3QM3A 5HINA 3UNDA 5KZMA 3UWVA 1MEHA 1F6KA 1OF6A 3PY2A 3PG9A 3R5EA 1SQ7A 1FXPA 1RV8A 3W87A 3MWAA 3B0VC 5EKYA 1KM6A 2C1HA 2AQWA 3WJYA 4AMAA 3P74A 3LI1A 3UWWA 1OFAA 5E93A 4UNKA 3CPRA 3SSJA 1SO5A 3H53A 1H1YA 3TSDA 1H7WA 4BK9A 3PF3A 3BW2A 4LNYA 2J6XA 3ZFHA 3NQEA 2QDGA 2Z2UA 5HR7A 1EP1A 1OYCA 1WAUA 3MI3A 1PHQA 1H61A 2GQAA 5CPMA 3U8GA 1KTBA 3OHIA 3HB9A 5C55A 4HHPA 1IXQA 1WX0A 3M6YA 3EWZA 1KTCA 1ICQA 4YCPA 5J5DA 2Y7FA 5I3FA 3M9YA 4O50A 3TMLA 4UTMA 1FDYA 4XBSA 4OWGA 2DORA 1OJXA 3ATYA 4ALDA 3LBCA 1OVDA 4HNTA 2ISSA 4OT7A 5G1TA 4UFJA 1LLWA 3PB2A 5F4XA 1SSGA 3W7PA 2ZDRA 4X2RA 3GKAA 2H3DA 3LRKA 3OBKA 1A5SA 1G67A 1WBJA 1LOQA 3ATZA 1GWJA 3EWBX 3N2MA 3ABRA 3N3MA 2CU0A 1L6YA 2W0UA 3SIZA 1KTNA 4OU1A 2VEIA 2QJGA 3F1QA 1HFBA 3STGA 4A21A 3G1SA 2Z0IA 3ZR4A 2DJLA 3THQA 5DELA 4NVTA 4UR7A 4D2JA 4O8RA 4K7YA 3CLMA 2CZFA 3PBUA 3P81A 3TW7A 2YYTA 5LSMA 2F84A 3W76A 2FLIA 3OEXA 3HG5A 3CU2A 1DVJA 3LCLA 5LNVA 4LC6A 1G6CA 2BZNA 1K8XA 2I9EA 4UMBA 2GQ9A 3W7IA 2QAFA 3KFTA 2A7NA 2ZRWA 1VLIA 1Z48A 2X1SA 3GIYA 3UXAA 2XN1A 5DLCA 1N8FA 1TMHA 5D2TA 1TPDA 2TSYA 1MSSA 4UTUA 3BLFA 4LOCA 4TX9A 2CZ5A 4MYAA 3EXRA 1C29A 3M5YA 4IGHA 2J9YA 5D2VA 1XM3A 3CWOX 3RF9A 3C0JA 4AF0A 1YLVA 2E09A 5CGQA 4O1BA 4U28A 3TA6A 3TX9A 4AWTA 2NWRA 1JRBA 3TKFA 3CC1A 1FWWA 1W31A 3CIWA 2H3BA 4XTIA 3PBVA 3STFA 1LRNA 3RNDA 4CNOA 1S3HA 3P8JA 5I3HA 4BI6A 4AF0B 3UY8A 3PUOA 2A6NA 1W8SA 2ZTKA 3IIVA 5FEPA 2ZZ2A 3GAKA 4LVAA 1AL7A 3KXQA 5F1VA 2A6LA 4LWWA 1SW3A 3DAQA 3W75A 4ZVJA 2B4GA 2WSQA 3LOTA 2WOQA 4JTJA 3TW6A 2PE4A 3IIPA 4B5NA 3L9CA 1J4EA 1JUEA 3DHFA 5DBTA 4DO4A 1BEUA 3FEMA 1NVMA 3B05A 1LOLA 3GR8A 4IX0A 4GRSA 1F05A 2JGQA 4A2SA 5AHIA 2X2GA 1XBZA 2GVGA 2PRMA 4O1CA 1KLZA 1SFLA 3S8HA 3NVTA 3DENA 3PVFA 3BG5A 1A5CA 1NEYA 4RXGA 1Q6QA 2TPSA 2RH9A 3NQ2A 4PH6A 3VI2A 3IIZA 4H4IA 4UTWC 3FJLA 1XCFA 3G1AA 1B3OA 1KM0A 3C61A 3GB6A 5DCEA 3NXFA 5D09A 2A5HA 2C18A 3S5OA 3UQNA 1GVOA 2C6QA 3LTSA 1XBXA 4XQ6A 3B0UX 2E68A 4QNWA 5AC6A 2DJXA 1QAPA 3PB0A 3NZRA 2QKFA 4O14A 3NQGA 2RDUA 4CQ9A 3PC0A 5EBUA 1GVSA 4UTIA 2YR1A 3NPXA 1OK4A 4IOTA 1I45A 3IGXA 4CQ8A 4UTJA 1I8JA 5TBOA 4LUIA 4FHAA 4N9CA 3EX1A 3TK7A 3QSTA 2EHHA 5HR6A 4UTWA 3TE9A 3YPIA 3NQDA 3W1LA 4M6QA 1XKYA 5G4EA 4MY1A 3GDKA 4WJEA 2Y7GA 4Z1BA 4QNEA 2TMDA 3NYZA 3W84A 4DXVA 3G3DA 4XWUA 4PC8A 3W88A 2V82A 1J5TA 3HG2A 1TRIA 3L67A 1XC4A 5CG7A 3L0NA 4MJMA 1UCWA 4O54A 1D3HA 2OX1A 2VFEA 4JYDA 1TPB1 3WJSA 2ZQ0A 1DQXA 1JCJA 1YDVA 1K02A 3PUDA 5H91A 5BOOA 5F4SA 3FOKA 2PRLA 4LVBA 4LY8A 4AHOA 2QUVA 5CPOA 3LBMA 1SR9A 4RJEA 4JY9A 4AH7A 1DKWA 3I6RA 4KKXA 4XBKA 5F2IA 5KTLA 4FNTA 2Y63A 1JQVA 5KMYA 4N2YA 1WV2A 2VEKA 3CQ0A 5D32A 5C2XA 4MFDA 5D2WA 3W7OA 2H8ZA 2HS6A 1L9WA 1QPQA 5LNUA 4JD4A 3LXBA 3LGEA 3NO5A 3NPVA 3T55A 3V75A 1OK6A 1B57A 1TTQA 3BO9A 2X16A 3S1VA 3GDMA 3WJWA 4X22A 2O7SA 3S1WA 3Q94A 5C6MA 3LERA 4DPPA 3ZS4A 1RQEA 2YX0A 4UXDA 3TAOA 1VS1A 5CPLA 3S5ZA 4WOQA 4UFMA 3BG9A 2H8XA 2QR6A 4QM1A 3HGOA 3OG3A 3NQVA 1K7XA 1DHPA 1KBIA 3OVQA 1RZMA 3SFKA 1OF8A 3DKJA 1ZAJA 1YDNA 3MBDA 1GVQA 2QCHA 1GVRA 1JCNA 2YYUA 4Y90A 3C2VA 3EX6A 2B7PA 2CLOA 3W74A 1A5AA 3HQ1A 4M6VA 3LCHA 3DKLA 1EP3A 3TU9A 1FWTA 4O0KA 4O1AA 5AYYA 1BKSA 4JDBA 3LHUA 4PL1A 4WQ6A 3EKLA 5A8GA 1F76A 3DFOA 3HO8A 4FX8A 4FNPA 3W7CA 1ZENA 3MO7A 3BARA 1SU5A 4MKNA 2YFNA 5D33A 5I3JA 3I65A 3G0UA 1H50A 3KOFA 3G1VA 1X6UA 4H6KA 4MZYA 2PRHA 1MXSA 2ZTJA 3BK0A 4RZ4A 1JVNA 3HMJG 4N4QA 3M5ZA 5T26A 3W2NA 2OJPA 1TPEA 1F73A 4UR8A 2JKPA 4FEZA 3M7WA 1X1ZA 1PIIA 4KWVA 3QF0A 1TO3A 5D05A 2ATSA 2E6DA 3LHYA 3QC3A 4K6AA 1ZY9A 1EB3A 4MIMA 5LHFA 4GUJA 2Y61A 4NXKA 5FF7A 2C3ZA 3G1HA 1C8VA 4O16A 3RFAA 2HMCA 3CEPA 2CLIA 4K36A 4YXGA 3W7KA 4WUIA 1VYRA 1L6SA 4O15A 3M1ZA 1W3NA 5K4XA 4J9JA 2FFCA 1SO4A 3PG8A 2BXVA 2Z6IA 2VFFA 1H1ZA 5D2YA 3LHWA 1D3GA 3I7QA 3MMTA 3K30A 4RZ5A 2J9ZA 2RKXA 3NQFA 4K8HA 3NPUA 4GUHA 3UYCA 3B04A 3SGUA 4QSHA 1ZAIA 4RX0A 5D30A 3QQ1A 1QDSA 3O6DA 2ZBTA 3IVUA 2WV8A 3LM7A 2E77A 3NZ1A 2R8WA 4ML9A 3R89A 4KFOA 3W72A 2R94A 3BGGA 3L65A 1EUNA 1YPFA 4QISA 1IIHA 1LBFA 3O6YX 3DFNA 1JUKA 4UIOA 2ZZ3A 4TMBA 1KM4A 4BF9A 5AHNA 3S6DA 3W7EA 1QOQA 1U83A 3P5ZA 1QFEA 1VCFA 2VC6A 4MY8A 4LV4A 3I7RA 5KZDA 1VRDA 1GPWA 3G1YA 1S5VA 3T44A 2NUWA 1KM3A 4YMZA 3QW4B 3IGSA 2VFHA 3W1XA 3SZ8A 1YPIA 2E6AA 3V1PA 1LCOA 3A21A 3LCIA 3EWWA 5HULA 1EA0A 2YPIA 3NQ6A 1WOBA 4EOUA 3KAOA 4FX7A 1G4PA 2ATMA 5D38A 4RV8A 2VOMA 5LGXA 3LB0A 4NNCA 1W54A 2CZDA 2X1TA 1DJQA 1Q6OA 1VJIA 4UTLA 2Q8ZA 5F2GA 3L5AA 1ML1A 4MUZA 1LOSA 4ZQPA 2R91A 3GAYA 4AHQA 3LXCA 3QJAA 3DXIA 5FEXA 1J2WA 1QNVA 1H60A 3Q37A 5A5WA 1CX9A 2V8ZA 1V5XA 1PCKA 1R2TA 2A21A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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