3W2U | Genus

Total Genus 103

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	103
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-3-193 rcsb
source organism	Trypanosoma cruzi
total genus	103
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2012-12-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w2uA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w2uA01

1QWGA 3B04A 4GNJA 1X1ZA 4GXMA 3FIGA 3NQ8A 4YMZA 3W1PA 1GVFA 4JDBA 2ZRWA 3LXBA 3IIVA 1UB3A 2J9XA 1OVDA 2R8WA 3QQ1A 4DPPA 4UFMA 4JGDA 1KLYA 2HS6A 1THFD 5LNWA 2QDHA 1H7OA 4NJHA 3QSTA 2WQPA 5KITA 1JCYA 3T78A 1VHNA 1WBHA 2PURA 3NDOA 1BKSA 4Y96A 2O7SA 5D05A 3ATZA 4IXXA 1IIGA 3LCHA 1G7UA 3C0JA 1A50A 2B7OA 4O57A 2YSWA 4DPQA 3EX1A 2ZRZA 3N3MA 3HB9A 2FPVA 4NT0A 3CWNA 2WV8A 4RR4A 4WY0B 3QPYA 1W5PA 3A22A 5I3KA 2Y88A 3CC1A 2E6AA 1UBSA 2E68A 3C2OA 3PBUA 4A2SA 1PCKA 2X2GA 2YCEA 4LOCA 1S5VA 2VFIA 3M47A 4XBKA 4BF9A 3S42A 2RKXA 2B7NA 2RDUA 3PBYA 3U2OA 1RQHA 2G97A 1VC4A 3CLMA 3QMSA 4LC8A 4YCPA 3HQ1A 5HWMA 3I6RA 1F05A 3T44A 1I4NA 1UUMA 2CLKA 1OFDA 3HG3A 4UC5A 3OG3A 1SZFA 1TTIA 4CCDA 2NUYA 2V5LA 3H54A 4ONVA 5BRBA 1DVJA 5KTLA 2EAWA 4Y9AA 4N02A 3UWYA 3N2MA 3CU2A 1X7FA 2Z2UA 3R13A 4I7VA 5D2VA 2HS8A 2ZZ2A 2H3BA 3S5OA 1CI1A 4O11A 3M9YA 3S8HA 2EGZA 5LHFA 1EWDA 2Q3OA 2JGYA 5HUPA 4QNWA 4N4PA 3THAA 2EKCA 3RK8A 4ZZ9A 4JIPA 1ME9A 4GUIA 2FLIA 1KBIA 3P5YA 4G1KA 3HPXA 3W1LA 5DY2A 2Q3RA 5FF3A 3LBMA 4WUIA 2VFFA 1RV8A 2VENA 2Y7GA 3I7QA 1LP6A 3NL3A 2V0TA 4FEZA 4MZYA 1VYRA 1JQVA 1L6SA 4IOTA 4K7VA 3UWUA 3LB0A 3L65A 2NUXA 2NV2A 3Q94A 4GC4A 5KZEA 3RLUA 3EWUA 1J4EA 5D32A 1FY6A 3VI2A 4ADTA 4O13A 4O12A 4O4VA 4AHOA 2V30A 3B0VC 4NNCA 3TDFA 4XQ6A 3CM4A 4NNAA 3UNDA 3M43A 1TB3A 1W1ZA 1YTKA 3ABRA 1MEIA 2WJZA 3M7WA 1O5KA 3PVFA 5D04C 4CQ8A 1EIXA 2VKZG 3ABSA 1SW0A 1QMLA 2E77A 5CZTA 3PB2A 2Z0IA 1AW5A 3NQGA 1FDYA 4L4MA 2ZZ1A 2H8XA 4DO6A 3C6CA 3GIYA 1DQXA 2IQTA 4AXKA 1A5CA 2NX1A 3T7VA 1K8ZA 4XZ9A 1FDJA 1SPQA 4FNSA 2J9ZA 4OGZA 4K36A 1TMHA 1X1OA 3I7SA 4TU1A 3N2XA 4UNLA 1M7OA 4JTTA 4D2JA 3P5ZA 1IXOA 1D3GA 1L6WA 5BOOA 1XBXA 2V2DA 3WJSA 1VCGA 3L67A 3DI0A 3L0KA 1ONRA 3HGOA 3HPSA 1H51A 2YR1A 1AMKA 5FEZA 1XDLA 5FF7A 4RZ6A 2JKPA 3DI1A 4X22A 2B7QA 4MIMA 1L2UA 3FOKA 3SW6A 3C2VA 1Q6RA 1FDZA 1OFPA 4NX5A 3HG4A 1W5OA 3KFTA 5DXXA 3LRLA 1HUVA 4UTWC 3IRDA 4UMAA 4K38A 1JCMP 1K7EA 3LHWA 3ANYA 5F4SA 2JBMA 3P81A 3N14A 1VYPX 4MJZA 3HGJA 5F2LA 5HR6A 3NQAA 2FJKA 3S1UA 1IGSA 4ZQCA 2WO5A 4PA8A 3MBDA 4O15A 1Q3NA 1WYIA 1YDVA 3BW3A 2DZSA 3GB6A 3EXTA 4QM1A 3LI1A 1KFLA 1AW2A 2BZNA 3W7GA 5CPNA 1L6YA 1PHQA 4FHAA 1LROA 3EWBX 1Q6QA 3CEPA 4WQ6A 4X9SA 3TAOA 4BK9A 3C2EA 3N19B 1OK4A 1JUBA 4OE7A 4S2CA 3TMLA 3O1NA 4Q32A 4A29A 1HG3A 5DY3A 1DQWA 3M44A 2P0OA 3AJXA 3QC3A 2QUVA 1XM3A 2PCQA 5IBXC 4Z0SA 3FJ6A 3GX9A 5G5IA 4H4IA 2ZRXA 2C18A 3EWXA 1X6UA 1H7WA 2Y7DA 1N7KA 1EB3A 3NNTA 3P82A 1ZAHA 3M5ZA 4Z1DA 4R33A 4OU1A 4N9DA 4YWIA 4QJ1A 1H7NA 3PS7A 1JCLA 2DZTA 4UXDA 5LNVA 1IXPA 3MW7A 5I3JA 2VEKA 1IXQA 1YTDA 3MHGA 3NPXA 3QJAA 3O07A 2WKJA 3I65A 3TV8A 1FX6A 4Z1CA 2ZA2A 1C29A 5D2YA 4JYDA 3EB2A 1MEWA 2CZFA 3DHFA 4O18A 1YXCA 1G4TA 4OT7A 4O16A 3VNDA 1TPH1 1VJIA 4FF7A 3MUXA 3HG2A 3E02A 4YXGA 3SIZA 4PCFA 3JRKA 2QDGA 3MYOA 1OJXA 1JRBA 3MO7A 4FX7A 3IIZA 3NPVA 4GUJA 3QZEA 3L2IA 4Q4KA 1ICSA 3Q37A 1QOPA 3FKKA 2GVLA 3A21A 5GVJA 5HWJA 4TMCA 3DFSA 4PTNA 3GDTA 3ZWSA 1NFBA 4NJKA 4AB4A 2P1FA 2YZRA 1EUAA 4HNNA 4LUIA 4AEOA 3W6YA 1ZY9A 1S5WA 3MWAA 3W07A 3NQCA 5CSRA 4KKXA 4Z0JA 4UFJA 5HINA 3W9ZA 1NF0A 4YLWA 2I14A 5FEPA 1F6PA 2WNZA 1MZHA 4MYXA 3NQEA 4IMGA 4MVAA 4OV4A 3EKLA 4L4LA 3FS2A 3U6WA 3NPUA 3LXAA 5LKYA 3B05A 3ZFHA 4O14A 1Q6LA 5TQLA 1T0OA 3PAJA 3BV4A 3QSRA 5DBUA 1RQEA 4BWLC 2VEPA 3R5EA 2NV1A 2NLIA 1KM0A 1TSIA 3MHUA 2J27A 4JX4A 1TCDA 1TO3A 3VE7A 1NSJA 3T40A 3KHJA 4WY0A 2A7RA 3NM1A 1KFEA 4Y8FA 1ALDA 1FCVA 3O06A 5LNSA 4EWND 3B06A 3TK7A 4MZ8A 4IWWA 3TCEA 6ALDA 3I7RA 1ZAJA 3P74A 4JTHA 3W1MA 1P1XA 3AO0A 4ZVJA 3S1WA 2DZWA 1H61A 3PBWA 3S6DA 1DHPA 4JTIA 4ICNA 2C19A 3HIJA 2VEMA 3UZ5A 1R46A 1W31A 2NZLA 4DBEA 2F7FA 4X2RA 3FYOA 3SZ8A 3KX6A 3R89A 4AF0B 3MJYA 2V9DA 4QISA 2VFEA 1TTJA 1K8YA 4FO4A 4YL2A 3W7IA 4DBDA 4IJBA 4LVGA 2NWRA 3TW7A 1W5MA 2DJLA 4MPQA 3LCLA 3W70A 3DHDA 4EIVA 3B8DA 5C6MA 2ZA1A 1R2TA 2E6YA 5L6UA 1DJNA 1P4CA 3NGJA 5C54A 4OV9A 3W2JA 1WA3A 5CPLA 1ZFJA 4X3ZA 5DLCA 1M7PA 2A21A 4UMBA 2BXVA 3MI3A 4M7TA 2ZTJA 3P7YA 1SFJA 4NUWA 3Q58A 1RD5A 5D37A 1ICQA 3LV6A 5T26A 2QCEA 5AHIA 4GBUA 2OZ0A 3WK0A 3M1ZA 1H60A 3UY7A 2UV8G 4EF9A 3GKFA 2A1YA 1F2JA 1K02A 1P0NA 2ABBA 1G69A 2E1DA 3FJLA 4IMDA 5CGQA 3TC7A 1WBJA 2YFNA 4HIBA 5CZJA 2Y61A 4OBTA 1O4UA 1A5SA 2CZEA 2YW4A 4CNOA 3PUOA 4MY1A 3NQDA 3O05A 1GYLA 1KM2A 3W87A 5FF2A 1D3HA 4MY8A 1GZGA 2CU0A 3MYPA 1TPEA 3W7DA 4IUOA 4BI6A 3TFCA 4MJMA 4DQWA 4ZQNA 1KBJA 5FEXA 5CZ0A 3NZ1A 3G1VA 2ISVA 2OJPA 2Z6IA 3M6YA 4U28A 1CW2A 4IQLA 2CZDA 3W7OA 5G2HA 4GUFA 1C8VA 2Z6JA 3L21A 3GZ3A 1AL7A 1KW1A 4C1LA 3KVJA 1VPXA 3W76A 3UWVA 2J6XA 4PL1A 4JTFA 5U4NA 2QCDB 2TSYA 1WOBA 3DFPA 4CQAA 1O60A 4XUGA 1XBYA 1QOQA 5BW6A 1MEHA 4O19A 2FTPA 1FWSA 5AC7A 3MMTA 3TSMA 3GXNA 3PR2A 4QITA 4FX6M 2P10A 4JTJA 3P61A 4M7SA 1K03A 1XBVA 1FCQA 4NQ1A 4TR9A 4JY9A 2CZ5A 3L5AA 3GXPA 1W37A 6TIMA 4ZQOA 1R30A 3LTPA 5LZLA 1EEPA 4DF1A 1GG0A 2E6FA 1QPRA 2XN1A 3TJLA 2WNNA 3NYZA 3HOJA 2GVJA 2DORA 2QCCA 1R47A 3U8GA 4UTUA 1YXDA 3VE9A 4LUJA 4BR1A 3IGSA 3LLFA 2B4GA 1TPUA 4MZ1A 4JEQA 4CQ9A 1ZHAA 2GQAA 4I7UA 4POCA 1TTPA 5G2IA 4HPJA 1KM5A 2B7PA 5G2WA 1GVSA 3KVKA 1TPFA 1DJQA 4B5NA 1TREA 2NX3A 1XC4A 4FNRA 3BLEA 1BWLA 4RV8A 5KINA 3IVSA 4KWVA 1H7RA 1A53A 1OX4A 1KFKA 1FBAA 2WPBA 4HNVA 3DGRA 5TIMA 1SZEA 2YYUA 1YYAA 3SI9A 5D30A 1LRNA 5DCBA 1OFAA 4RJEA 2F84A 3NPWA 4HSNA 5AHFA 2QKFA 5F4XA 4XWUA 3CIXA 1YPFA 3CTLA 4JR5A 2DU2A 4EOUA 2Y85A 3QF0A 1NF7A 1TPWA 3KOFA 5AYZA 5LGXA 1Z44A 1YDOA 3H53A 2GQ8A 3TQ0A 5HR7A 1LORA 3O6YX 5K3VA 3INPA 2ZA3A 4MFEA 1GOXA 1N55A 2AGKA 1P0KA 4DXVA 1K8XA 4MYAA 4HSOA 4LTSA 3RMJA 1W5NA 4NXSA 5DCDA 1QFEA 3UYCA 5K9DA 3NZRA 3TXVA 5FI8A 3B4UA 3PC0A 4KFPA 1Z48A 3E12A 4JTKA 4N6EA 1X8FA 5DELA 4ZQRA 4JD4A 3KRSA 4Z1BA 3CQ0A 4LWWA 2XFWA 3M5XA 5AHLA 4GFSA 3H55A 4GE8A 2Y62A 1DV7A 4U4MA 2Y89A 2B0MA 7TIMA 3LXCA 1GJPA 3NL5A 4IPIA 4RXFA 3GAYA 5CSSA 1ME7A 1UJPA 4K6AA 4WD0A 1XDMA 3DU0A 1VZWA 3TMQA 3FA5A 3TROA 2X30A 4N9CA 4JTSA 1I45A 4S1FA 1G4EA 1TPB1 4UTMA 4MFDA 1W3TA 4YCOA 2DZVA 2KZHA 3GR8A 3W1RA 2CW6A 3KRZA 4IXHA 5LGZA 4A2RA 3PUDA 3ABQA 4O53A 4QIUA 2RHGA 3FYPA 1XL9A 1SO4A 3GKAA 4WOQA 2Y7FA 1SW7A 1TTQA 1OX6A 1B9BA 1MSSA 1ZAIA 1LRQA 4JNMA 5E0KA 4ZMGA 1I2NA 3HBLA 4H6KA 4LY8A 1RQBA 5KZMA 1H1YA 3DXIA 3LGEA 5G4WA 2WNQA 1I2RA 1TIMA 3P80A 4FXSA 1JCXA 4TIMA 3GDMA 1G6CA 1TV7A 4JYFA 2ZZ4A 1HL2A 5CPMA 4PL2A 4KWWA 2FDSA 8TIMA 3TU9A 3O6CA 1WXJA 1JCNA 1XXXA 2OT0A 4I7WA 2W79A 1VH7A 4LVBA 2GUUA 1K3UA 5MHBA 5DN1A 2BTMA 3P62A 4I9AA 1I2OA 4FX8A 5K9XA 3BARA 3S5YA 4P2VA 3A5FA 1SU5A 4UR8A 3STEA 2W6RA 1W54A 1O94A 3G3DA 5HWNA 3PBVA 5F4WA 3TR2A 1JCJA 4W9TA 1LZOA 3MI6A 1EP3A 3NQ7A 2ZZ5A 1LM1A 1GTHA 3LHYA 2GQ9A 1EPXA 2H90A 4UTTC 1ICPA 1GVQA 4NJIA 1OFEA 4ML9A 1KFJA 1W8SA 1S3HA 4C1KA 2BLEA 1VYSX 3M5YA 3CPRA 2G96A 4JYEA 3R8RA 2QUUA 1YXYA 4ZQPA 3TFXA 5EKYA 1LOSA 4HNTA 3P84A 4AHQA 4JN6A 3TSDA 5AHEA 4CNPA 3NQFA 2XN0A 3G18A 4LS0A 3O15A 2DJXA 2ISWA 3NO5A 4TX9A 5D09A 3W74A 4RXGA 2X16A 4CCEA 2C0AA 1XUUA 4QNEA 4K37A 2HTMA 2CFFA 4ADUA 3OHIA 4R53A 5I3FA 1F5ZA 4JTUA 1LYXA 3E96A 4JS3A 5FF0A 3HMJG 2V5BA 5J5RA 2ZZ3A 1KFCA 1NAL1 2C13A 1IF2A 3W2KA 3FEMA 2RDWA 3IEBA 3G24A 3PY2A 4ZL1A 1A5BA 1JUEA 3TX9A 5IBXA 2QR6A 3QFEA 5C2XA 2V82A 4UFHA 1AW1A 3SSJA 4KFOA 4RLIA 3S1XA 3MI2A 4E0CA 1UUOA 4NNBA 2JKEA 5U7SA 1F73A 2G95A 2YPIA 2ZRVA 3A9IA 4ZQMA 1OYCA 5LNUA 1VR6A 5G1YA 3G0XA 1C9DA 2A7NA 3IIOA 2CLMA 2ZYFA 1LLWA 3M41A 4M5PA 3L5MA 4N4QA 4UCGA 4MLRA 1HTIA 2X1RA 4FNPA 1VHCA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3W2UA

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