3W70 | Genus

Total Genus 101

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	101
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-4-095 rcsb
source organism	Trypanosoma cruzi
total genus	101
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2013-02-27

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w70A02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w70A01

3HGRA 3HPXA 4HHPA 3S5OA 4IMFA 3IVUA 3W7IA 4RLIA 1TQJA 3IVTA 3C8FA 2G5WA 4CCEA 8TIMA 3DH7A 1F73A 3LERA 1NVMA 3Q94A 2VFFA 1EIXA 1MO0A 4OT7A 3R12A 4OV4A 1RZMA 1SSDA 1YYAA 2OJPA 3NPWA 1M6JA 4Q32A 1QFEA 3G1HA 3FA5A 3NYZA 3NPUA 4WOQA 4LTSA 1AL7A 2HS6A 4TMCA 4IUOA 3V1PA 4EOUA 2ZZ3A 4FO4A 1O5KA 3EWBX 4KWVA 5CSRA 1F6PA 3L9CA 1WQ5A 2XN2A 3A5VA 5D05A 2WSYA 2QCDA 1J5TA 5EA9A 1S5VA 3HB9A 5KZMA 6ALDA 5I3JA 1QR7A 3EX3A 1FX6A 4MUZA 5DELA 5G2WA 5U7SA 2YW4A 1JCMP 1H60A 2DZXA 5F1UA 3P8JA 4AH7A 2OZ0A 1PCWA 3W7RA 3MBDA 3FS2A 1TPFA 4UMCA 3I68A 3DU0A 2TSYA 4QIUA 5D2WA 4YWIA 1RQEA 2JKEA 3ABSA 5KZEA 3M5XA 4L4MA 3GYEA 2QUUA 1LBLA 2P10A 4DXVA 2CZEA 5FF4A 1BWLA 4JX6A 3UY7A 3UQNA 4JTKA 1SU5A 2Q8ZA 3P81A 5L6UA 3IGUA 2H3BA 1DHPA 2JKAA 3THAA 3NQEA 4S2BA 1LBMA 1UJPA 2VKZG 4O11A 5AYXA 1FWTA 3PSVA 4JDBA 3N19B 4FB7A 1B4KA 3M6YA 4O16A 1J4EA 4QAIA 5ABTA 3C2FA 4JTUA 1QPRA 3DAQA 1QO2A 4QITA 3S1UA 4K37A 2Z6IA 2ATMA 5LNSA 4PL1A 4MLJA 3P84A 3W1TA 3I7SA 2NXGA 5EKYA 3R13A 1LCOA 3NO5A 2A7NA 1GZGA 4UTIA 2CLIA 1S3HA 4N6FA 5C5YA 1RV8A 2CLLA 2QCHA 5F2GA 4WXYA 3WJZA 2VFHA 2GQAA 4ADSA 3VFLA 3JRKA 1AW1A 3N3MA 4DF1A 1FBAA 3OVRA 3P80A 2WNQA 1PIIA 1TPVA 1YTEA 1XBZA 3E96A 3MHUA 3O06A 1I4NA 2X1SA 1QNVA 1SPQA 1RD5A 2DP3A 4UXDA 1XDLA 3ZR4A 1K3UA 3GKFA 2QEZA 1LM1A 1XCFA 1GTHA 4UFHA 4A21A 2E6AA 1NAL1 1KFBA 1HG3A 3PUEA 5LHFA 3HGSA 1ZY9A 1X1ZA 3BG3A 3QMRA 4O18A 2C1HA 4JYFA 3RU6A 3NOEA 3PBUA 2OT0A 3W1XA 3MI3A 1RR2A 1EPXA 2YGYA 5AHMA 1OYBA 1VC4A 1M7PA 2Y89A 2LLEA 1NSJA 1OFOA 4ORMA 4OV9A 5BW6A 4CQAA 2OX1A 2B7QA 1JQVA 3NQCA 4O0KA 3HGJA 4YMZA 1J2WA 3RLVA 2E68A 3LXCA 4X2RA 2CWNA 4WJEA 2JGYA 1P5BA 4K7VA 3UD6A 3NQFA 3NQ6A 4JS3A 2ZZ7A 1SQ7A 5HWMA 3GKAA 2CLEA 4P61A 5LGZA 1OVDA 4O15A 3KOFA 4O10A 5EY5A 1LROA 3PBYA 4LT9A 3CTLA 3W85A 3TX9A 3GNDA 3LRKA 1XUUA 4RR4A 1SO5A 4M6PA 1F7BA 1P0NA 2QJHA 1FWSA 4XZ9A 3BW4A 1BEUA 2OT1A 3LCIA 1FCUA 1SW3A 2QCFA 5D37A 3MYPA 3VCRA 1A5SA 2J6XA 4RZ6A 2W6RA 2C3ZA 1MEWA 3W23A 1K03A 3G1DA 3NPVA 3LV5A 1SO6A 2CFFA 1OX4B 4A2SA 1R46A 3G8EA 5D2XA 1O4UA 3H54A 3LHTA 4FX8A 2BLEA 4AWSA 3DHDA 3DHFA 5HQEA 4NQ1A 3W7CA 2QCNA 3G1FA 2I14A 2PRLA 1O5XA 1U5JA 3NQ7A 4I7WA 2Y6ZA 4MLRA 2QAFA 3GDMA 1R2TA 2H8XA 1VCFA 4UC5A 2VELA 1I8JA 3TQVA 5LGXA 4LC6A 1OF8A 4BR1A 4K8EA 3NZRA 2VEKA 1DJQA 2FDSA 4Q4KA 3G3DA 4EVZA 1TTIA 1QWGA 4H6KA 2NV1A 2C19A 5I3KA 4C1LA 3W72A 1WOBA 1KM4A 3CQ0A 3FLUA 1FDYA 4WXZA 3DBPA 3EWYA 3NG3A 2UV8G 4XQ6A 3NQ2A 3DGRA 1JUEA 1M7OA 3W70A 1W56A 1DL3A 2X1TA 2ZTJA 1D3GA 3N73A 4FF7A 2DZSA 3QW3A 3I7RA 1KW1A 3HQ1A 3W2NA 1NF7A 2FLIA 1SSGA 4IMCA 4CNOA 4LS2A 1P1XA 2CZDA 1ICPA 2V5LA 4N02A 1SO4A 4TMBA 5F2LA 1L6YA 3W7QA 3OBKA 4MYXA 2BWGA 3SR7A 1NF0A 2X30A 2JK2A 4JD4A 3UNDA 2WNNA 1RQHA 1V7YA 1ZAHA 1VPXA 3CU2A 3TFCA 3UWYA 2V81A 1QOPA 3S6DA 2ISWA 3MI6A 3S1XA 4ZVJA 5I3HA 4GUFA 3QSRA 3ZWTA 3A5FA 4JYDA 2VOMA 2A6NA 3ABQA 1IXNA 1OX4A 3C61A 3LHUA 3WFAA 4E2DA 1YTDA 4IX2A 1TTPA 3NDOA 4CQ9A 5L9FA 3TC7A 2E5BA 3PG9A 5CSSA 4UFKA 2V8ZA 2E6FA 1A5CA 4AB4A 1YPIA 2NWRA 1LP6A 1NEYA 3IGSA 1GVOA 4DO4A 1KTNA 2GQ9A 2NX9A 2CZFA 1CW2A 3NM1A 1G4EA 5CPOA 1QPNA 1ZAJA 2VENA 3QRHA 3W2UA 3PY2A 4LUJA 3W22A 3W7LA 4GXMA 3T7VA 4JTIA 2ZZ5A 4M6QA 2FPYA 4FNTA 4N4QA 3W1PA 3N14A 2FFCA 5K4ZA 3EWXA 3ATYA 4R33A 1RPXA 3M44A 5U4NA 1EX5A 2RDWA 6TIMA 2YYUA 3E02A 3TSDA 3GVGA 4LC8A 1R30A 1FCQA 2A2IA 4UR8A 3B8DA 2QR6A 1JCXA 4UNKA 3W1AA 3M43A 1IXPA 3ZWSA 1I2QA 2CZ5A 5D04C 3DFNA 4XKYB 3RLUA 4X9SA 2B7PA 5G4EA 3UWQA 2V0TA 2V2DA 1P0KA 2A21A 4JR5A 2TMDA 2CW6A 5F1VA 4NXSA 3O6YX 3BV4A 2J27A 3LCFA 3STCA 3W86A 4MPQA 1B3OA 4OBTA 3OG3A 3C2VA 4C1KA 5KZDA 2ALDA 3HGOA 4ZQOA 5LNUA 1QPOA 1DJNA 4O4VA 5HR6A 3TKFA 1YPFA 2WPBA 4GE8A 1GVSA 5TBOA 3L0NA 4EIVA 4WQ6A 1DVJA 4RV8A 3EX6A 3RNDA 1VLWA 1PV8A 2ZRYA 3LRLA 1EP3A 3UY8A 4I7VA 1EP1A 3KAOA 1GYNA 1KBIA 2CLMA 1QAPA 1IGSA 5FEPA 2VFGA 2YPIA 3P5ZA 2ZRXA 3I7QA 5KMYA 1KFCA 4BI5A 2PURA 1OG0A 4JNMA 3W74A 3CM4A 2X1UA 2C6QA 2QCDB 1GPWA 4HNNA 4IX0A 4ADTA 3C4UA 3NZ1A 1ZENA 1H63A 2WSRA 3SECA 5DY2A 3N9RA 3BGGA 2RFGA 1JR1A 3PWAA 3SSJA 2VFEA 4CQ8A 3LB0A 5HUOA 3OA3A 1ME9A 1X8FA 2NLIA 5AYZA 2NV2A 2Y85A 4TU1A 1I2PA 1W31A 2I1OA 3TV8A 2RHGA 3D0CA 3R8RA 3STFA 3GX9A 2CU0A 2HS8A 3O1NA 2Y7FA 4OQVA 5LNVA 3KX6A 4XTDA 3M9YA 4MIMA 4MY8A 1ZAIA 4CLMA 5CPMA 3PUOA 1HTIA 1LRQA 3PULA 4MY1A 3C56A 1WAUA 3VE9A 4UIOA 3BARA 3SIZA 4O50A 1TPB1 1TYGA 4QNEA 2A4AA 4JDYA 3VE7A 2O7QA 3R89A 1LLWA 1UB3A 1JVNA 2PCQA 4WX2A 4CNNA 4IOTA 4GUHA 5F2MA 4IXXA 4ZMGA 3G1YA 1YDNA 4DO5A 3TROA 4P2VA 3LXBA 3C2OA 3EKLA 3SFKA 1VHNA 3YPIA 1L6WA 3MYOA 4ZZ9A 3B06A 1YXYA 3HPZA 2R8WA 2V30A 5F4WA 1DV7A 4FEZA 4JTFA 5K4XA 4K36A 2CLFA 2OMAA 4YL2A 2VEMA 3TA6A 4UTWC 3K30A 3T40A 4A2RA 5SWUA 3H55A 1TO3A 1S5WA 2V2HA 5LSMA 4ZQNA 4BI7A 2ZZ1A 3EEGA 3WJSA 4AHOA 4O52A 2ZDRA 3DKJA 4EWND 5D2TA 3IIZA 4G1KA 2Y70A 1PHQA 1OFQA 3L5LA 1TTJA 2DZPA 5DCDA 3OIXA 1KM5A 3F4NA 3Q58A 1W8SA 4X22A 3E0IA 4A22A 4AF0A 3EX4A 3M47A 3NGJA 1TQXA 4JXCA 3MHGA 5IBXC 3DXIA 1LRNA 4IMEA 1YDVA 3L5AA 1OK4A 4JY8A 1LYXA 3KFTA 1LOLA 3ZFHA 3A24A 3F4WA 1VH7A 4PFMA 2OCZA 4QSHA 2PC4A 2YR1A 3QW4B 3ABRA 2WKJA 3LTYA 3RF9A 2Y88A 5KITA 4HPJA 3C0JA 2QCMA 4FXSA 3CC1A 3LBMA 4ALDA 4ICNA 1IF2A 1Q45A 1X7FA 3B0VC 1BKSA 4O17A 2G95A 1A50A 1GG1A 3A21A 3A9IA 1H7PA 4K8HA 4KKXA 4O12A 1W5OA 1KM6A 3HF3A 1OX6A 4FNQA 3DZ1A 1G4TA 1TPWA 4LVFA 2BTMA 2I9EA 3P67A 1L9WA 3L65A 4MJZA 4NJJA 3NL2A 1F6KA 3FIGA 3H53A 1X1OA 1N8FA 3O8AA 1XUZA 3TK7A 3EXTA 1W37A 1Q6LA 3ANYA 4IPIA 4Y6GA 2B7OA 3P7YA 4QQ3A 4Y9AA 1HUVA 3W2JA 3EKZA 1LBFA 3TMLA 3N9SA 3SJ3A 3IIVA 1H7OA 2JGQA 2YFOA 1KFJA 4N9CA 4NZJA 1O60A 2A1YA 4O19A 1G7VA 4OWGA 1ZCOA 1DQWA 1FCBA 2A7PA 3PVFA 5AHIA 4UFIA 1H1ZA 1ICSA 4A3UA 1Q6QA 4Z0JA 2ZA3A 3EXSA 5D03A 3PM6A 3G24A 1A53A 1B57A 1W5NA 1ZALA 3UWUA 4O57A 2FJKA 4MFEA 2XN1A 3BG5A 3PBVA 3IV3A 3LTSA 3BPWA 4PCFA 2NXHA 3GNNA 3U2OA 4MZYA 2Y62A 4PL2A 3CWOX 2QDGA 1G6CA 3LOTA 4LW7A 4JYEA 3UPBA 4NJIA 1FQ0A 3STGA 2C0AA 4BI6A 2KZHA 3W2LA 3W75A 3STEA 3LCWA 4XBSA 1W0MA 4UMBA 5E1QA 3MJYA 2FPTA 2ZYFA 3CEPA 3S5YA 3KRUA 3OEXA 3QQ1A 3P82A 4Z1AA 4IGHA 2XN0A 4LVDA 1BWKA 3N2MA 1YXDA 3AO0A 4O28A 3WJYA 2X1RA 1U83A 4QM1A 4DEFA 1AMKA 3B05A 3B0PA 1Q3NA 4GNJA 1RVGA 2E6YA 4JEQA 1P4CA 4OU1A 5HULA 3M7WA 3QQ0A 3LV6A 4BK9A 3PBWA 5AHEA 4FIQA 5CG7A 4WD0A 2E1DA 5HINA 3L67A 2QCCA 4O1BA 4Z08A 4UMAA 1H51A 4NJGA 5H2ZA 1FXPA 1JUBA 3INPA 1DQXA 2DZUA 5DBUA 4RKAA 1KFKA 2CLKA 3L0GA 4BWLC 4GWEA 3BK0A 3W1UA 1KM1A 3CIWA 4JTLA 4UUIA 2A5HA 2YYTA 3MO7A 4ML9A 1G69A 4FX6M 4RZ4A 5LNWA 4TIMA 2YX0A 4NNCA 5AB3A 1EUAA 5I3IA 3O16A 1KTCA 3S1VA 3KVJA 3M41A 3NNTA 3KVMA 4E0CA 2PRHA 3O07A 3GR8A 4NJHA 3QC3A 5J5DA 1VYSX 3THQA 3NA8A 5K2ZA 5GVJA 3U8GA 5DCBA 1GVFA 3UWZA 3NQDA 3UZ5A 3Q2DA 2IQTA 4WY0A 2V5BA 2VFIA 4LS1A 1TRIA 5DN1A 5HWNA 4NNBA 1ML1A 3EWZA 1V5XA 3USBA 3WJXA 2QF7A 2ZZ4A 3W2MA 1F5ZA 4YXGA 4XUGA 2GPTA 4N9BA 1A5BA 3TAKA 3U6WA 3W7NA 2Q8LA 3UPWA 4O4WA 3L68A 2GVLA 3W2KA 3CB8A 3Q37A 3C3NA 3W7KA 2A85A 3JS3A 1LOQA 2DZWA 2NWSA 5K9XA 5KSWA 4DF2A 3TFXA 2JKPA 3FYPA 1PE1A 4ZL1A 3BLFA 1I45A 2VFDA 4GUJA 2ZQ0A 1XI3A 1D3HA 1EUNA 3HG3A 4RXGA 5G2IA 1AL8A 2X16A 4FHAA 7TIMA 4KFNA 3LRMA 1LTDA 3BLEA 5LNRA 5AHNA 5J5RA 3W71A 3BW2A 4AAJA 2QCGA 1TPEA 2YCEA 3NEVA 2TYSA 3LBCA 4BWLA 2NX1A 1K8ZA 3S5NA 5EPDA 1IXQA 1C29A 1THFD 2NXIA 5HUPA 1UASA 4MKNA 2YW3A 3ELFA 4ONVA 3LCXA 3HOJA 4Z1CA 1VJIA 5F4SA 3FEMA 5G1TA 1K7FA 3UXAA 3B04A 4AXKA 2G96A 2ISVA 1TV8A 1SFJA 5K9DA 1WA3A 1KFLA 4POCA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3W70A

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