3W74 | Genus

Total Genus 105

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	105
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-4-139 rcsb
source organism	Trypanosoma cruzi
total genus	105
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2013-02-27

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w74A02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w74A01

4RX0A 3W7GA 1NSJA 3G1XA 1KW1A 3OG3A 4N9DA 2VOMA 4GUIA 4AHQA 1GVOA 5FEWA 1XUUA 6TIMA 3NQDA 1BEUA 4DO5A 3EKLA 4O0ZA 3NPXA 4O11A 3MBFA 3F4WA 4MZ1A 5BRBA 1SW0A 4XQ6A 5LNWA 2WQPA 3IIXA 4O1CA 1B4EA 2Q8ZA 4ZQMA 4IWWA 3B03A 3DKJA 4ZL1A 2VEIA 3TW6A 3W70A 1A5SA 4JYDA 3L5MA 2V5BA 1R30A 1I2RA 3IIPA 3NL2A 3NNTA 4UXDA 2VEMA 5IBXC 3NO5A 3HGJA 4FB7A 1VGAA 4XTDA 4PODA 4ONVA 1WX0A 4CNOA 5D2YA 2A5HA 3I7QA 1ZALA 4FEZA 5LGXA 3QH2A 3W86A 1H63A 4JTUA 4U28A 4C1KA 3EX2A 4RZ6A 5H2ZA 4AMAA 3PUDA 3TQKA 1O94A 1M7OA 3DXIA 2YFNA 3THQA 1SFJA 4BF9A 3NG3A 4WOZA 3SW6A 4AWSA 3W1QA 1C29A 2JKAA 1SO5A 1VCFA 4GJ1A 4BI7A 5I3FA 1Z44A 4O1AA 4Z1AA 1V5XA 4UFHA 2ZZ4A 1NEYA 1OABA 1ZAIA 1EA0A 1EEPA 5AYYA 3N9SA 4PH6A 2DZSA 1P1XA 1A5BA 2F7FA 1L6SA 2DZVA 3CEUA 4K38A 4S2CA 2VENA 3TA6A 3UWVA 3M0ZA 4IXHA 2I1OA 2X1RA 3QMSA 4I7VA 2FFCA 5F4SA 5EY5A 4MFDA 4FX7A 4HHPA 2VC6A 4MY8A 4IQLA 4O50A 3FEMA 3TKFA 1LYXA 2PRHA 4LRTA 4MLRA 3P7YA 2OMAA 5DELA 1JVNA 3E0IA 4UMAA 1R46A 3TMQA 3S9YA 1G4EA 1DJQA 1A53A 3A5VA 3LRMA 3BO9A 1MZHA 3L68A 3HO8A 4FXSA 4UTWA 3HIJA 3S5NA 2EHHA 2AAMA 3MHFA 1IF2A 2V30A 5GVJA 1EB3A 2PRMA 4IUOA 3OBKA 4FIQA 1GZGA 5KZEA 1KV8A 2B7NA 4OHQA 4FNQA 3HG3A 1VH7A 4ZVJA 4NXSA 1OYAA 2A7NA 4E0CA 5AYZA 4XZ9A 5D30A 5AHMA 2FQIA 3N34A 3IVSA 2C0AA 4N4QA 2R91A 4BI5A 1EP3A 3QM3A 4MIMA 4LU0A 1JCMP 3S1WA 4PFMA 2A0NA 3G1HA 5F4WA 2A7RA 1TV5A 4WQ6A 2C16A 2PCQA 3R13A 3TJXA 2QCGA 2QUUA 1XFBA 5C2XA 5HWMA 4MVAA 5AHLA 1VPXA 5G4WA 4AXKA 3AO0A 1VHNA 3W2JA 4O15A 3B0UX 3HG4A 2ABAA 1R2TA 5EA9A 1W3IA 5DXYA 2E1DA 3DFSA 3UPWA 4M7TA 4A2RA 1KM1A 4IMCA 3IV3A 5HUOA 4GUJA 1D3GA 4FNRA 3STCA 2ZA2A 1RVGA 2OT0A 3GXTA 2W6RA 1TPWA 1VCVA 3PAJA 3HGOA 1QMLA 1LOSA 1IXNA 1OFOA 3W7OA 4AF0A 4GUHA 4BI6A 1I2NA 3TK7A 1UUMA 4OGZA 1TRIA 5G1TA 2FPYA 1DL3A 4N6FA 2FDSA 1GTEA 5E93A 5FESA 1AW1A 3VCRA 1B57A 5D2XA 1LBFA 4UTKA 3TQ0A 2FPTA 4RK8A 3P8IA 5AFDA 3A21A 3W76A 3W1PA 1H62A 5EKYA 3W72A 2WPBA 1M5WA 5FF0A 4NZJA 1P0KA 4Y96A 3RK8A 2DP3A 2EF9A 1H1ZA 3I68A 1FCBA 1JUKA 3CEPA 4CQ9A 1EPXA 2HS8A 4WXYA 3T40A 1PCWA 2WNNA 1JCJA 4PCFA 3W73A 1I2OA 1LP6A 3TE9A 3W1TA 3BG9A 4LOCA 3VNDA 1A5AA 3LBMA 5CZSA 5HWJA 3HGSA 1FCUA 1F05A 1PIIA 3TXZA 1KFJA 1WOBA 1JUBA 1TRDA 4H6KA 2CWNA 3EWBX 1OX4A 5I3IA 3W7IA 3HPXA 5J5RA 2Y6ZA 2CLIA 1QOPA 2FB3A 4FNSA 4NNBA 4NJKA 6ALDA 4LC6A 4FX8A 3MI3A 4GUFA 5DN1A 3USBA 1X1ZA 4LWWA 2Y7FA 2TRSA 4MJZA 2QKFA 1YXYA 4Q4KA 3QQ1A 4HIBA 1JQXA 1MEHA 2DJLA 3ZR4A 4ORMA 1ZAJA 1PHQA 1XBXA 2W79A 3M41A 8TIMA 5LNUA 3GZ3A 1KBIA 1YPIA 2Y89A 1OX5A 3LV5A 1AW2A 1F6PA 3HMJG 5KITA 1PS9A 2ZZ6A 5D2TA 3W1RA 4NJJA 4A29A 1QPQA 2YZRA 4RZ5A 3C2OA 4LS1A 1K7XA 2GVJA 3LTPA 3ZWTA 2KZHA 3JR2A 3S5OA 3P81A 4WX2A 3SY5A 3UY7A 2QCHA 3TSBA 4LRSA 3W1LA 3FYOA 3INPA 4O28A 3OVQA 3TROA 1K8XA 4XBKA 2D73A 5F4XA 1CW2A 1O95A 2H3BA 5LNSA 1RQBA 1OF8A 4IJBA 3WK3A 1XXXA 4K8EA 4NJHA 5HR6A 1ZENA 1OX6A 3PC0A 1VLWA 1H61A 3UZJA 4O17A 3BW3A 1WDWA 4A21A 4Z1BA 3UNDA 2V5LA 4UFIA 1LTDA 2V81A 5EPDA 5LHEA 3CHVA 3PBUA 3AJXA 3C56A 5U7SA 5LZLA 3GKFA 4EWND 5D37A 4UTIA 4Q32A 1A50A 3FA5A 2FPVA 3UY8A 3TAKA 3W7CA 1H7WA 3MHGA 2QAFA 2OCZA 1GQNA 4HT3A 4AF0B 1HL2A 1Q6RA 3W1NA 3CQ0A 4R53A 3LHZA 2UV8G 2NUYA 4UUIA 3A9IA 3DBPA 3NL6A 3DI0A 4IOTA 3SECA 2QAPA 1P4CA 2ZYFA 4UTTC 3LHVA 3GYEA 3OEXA 1E51A 1TQXA 3QSRA 5KZDA 4HSOA 1KTCA 1CX9A 3B0VC 3H55A 1N55A 1H7RA 4AH7A 3H53A 4FF7A 1XL9A 1B3OA 1GVSA 1DQXA 1KM5A 5EMUA 4NNCA 1EP1A 4ADTA 1QPNA 3M44A 3RU6A 2BTMA 4UTHA 4OQVA 4UC5A 1G7VA 1XDMA 2CLMA 4XBSA 3EXSA 3L21A 4JTHA 1G4PA 1TTJA 1V7YA 3DI1A 3QF0A 4FO4A 2YPIA 1L2UA 2I14A 1KM3A 5TIMA 3GR8A 1KBJA 1AMKA 3DKLA 1KM2A 3N9RA 4DO4A 1OX4B 1YPFA 2RDTA 5FF3A 3WK0A 4OBTA 1KFEA 1Q6QA 3W88A 3HBLA 4MLJA 4LUJA 1GVFA 2C1HA 4DF1A 3EKZA 5HNRA 4KKXA 2DZUA 3PR2A 4NUWA 4I9AA 3R2GA 2X1SA 4JTSA 4IXXA 3C8FA 3MI6A 3KRZA 1U83A 1WBHA 1FX6A 1YXDA 3YPIA 1LDCA 2GQ8A 1EX5A 3C61A 2WJZA 5CZJA 5E0KA 3M1ZA 4ADUA 1Z48A 2QJIA 3ABSA 3LRKA 4IMGA 5DCDA 2E5CA 4DF0A 2O7QA 5EYWA 1OVDA 4JY9A 4M6QA 5D05A 4MYXA 5G4EA 3IRDA 1LRNA 2H8ZA 4NVTA 1YLVA 3DFNA 2Y7EA 5D33A 3L2IA 3E02A 1JCLA 1MXSA 3KRUA 2YYTA 4JYEA 2QCEA 2C18A 3DH7A 2OJPA 2J9ZA 4FIRA 3WK1A 3Q2DA 3CM4A 5AC8A 2P1FA 1ZJIA 1TV7A 1YTKA 4O8RA 2E6DA 2ZA1A 1WXJA 3A5FA 3TFCA 3N2XA 1SO4A 2A4AA 1KM6A 1GWJA 3T78A 3W83A 3P5ZA 1J5TA 2JKEA 1EUAA 1SW7A 3LOTA 5I3KA 3CIWA 4KWVA 5K9DA 4AAJA 4UTMA 5ABTA 1VLIA 5HMSA 2TPSA 1H7NA 3FIGA 1LM1A 1JRCA 2PURA 3C0JA 1OFEA 3G1SA 3OA3A 5CZ0A 2E5DA 5BMXA 2QEZA 1FY6A 3ATYA 1W5MA 3QC3A 5T26A 2BLEA 1SO3A 3M16A 5FI8A 3NPVA 5D04C 2YX0A 5KINA 1SW3A 1KA9F 1XBYA 3QQ0A 1YYAA 5G2HA 5HR7A 2VELA 1W31A 2ZRZA 2FB2A 1UBSA 3CT7A 4JD4A 1LRTA 3BARA 4WOQA 1IXOA 5I3JA 1JR1A 1H5YA 1SSGA 2A1YA 4JXCA 2GQ9A 2VFIA 3HJZA 4I7UA 3BW2A 4AB4A 3W23A 4PC8A 1I2QA 3BG5A 4O10A 5HQEA 2H90A 1FWWA 2YCEA 1SZFA 5K2ZA 1QFEA 1YXCA 3R12A 4GRSA 3ABOA 4Y9AA 3OIXA 1KFKA 1TB3A 4GFSA 3BLFA 5F2IA 1SU5A 2YXGA 4FNTA 4JX5A 2EPHA 2JGQA 1ICPA 3L66A 3TXVA 1OFDA 1DVJA 4LUIA 3SIZA 2XN0A 1GTHA 4QSHA 3QMTA 1TPUA 1JQVA 1VC4A 1SQ7A 2Y7GA 3W74A 3TW7A 1KFLA 2X16A 4N9CA 2BWGA 5I3GA 1GG0A 1T99A 1NF0A 5TQLA 3W87A 1RQHA 3L65A 1XDLA 2J24A 2ISVA 3NGJA 1OF6A 2G5WA 5KTLA 5LNVA 1F5ZA 5D03A 3W84A 4O52A 4ICNA 3W1XA 3EB2A 4JTIA 2J9YA 4D2JA 3C52A 3NQCA 3GR7A 4M6VA 1PCKA 4OE7A 1H60A 1NF7A 4HSNA 1TV8A 3GNNA 3HGRA 3O05A 4NX5A 1JULA 1EWEA 5AC7A 4G1KA 1K03A 4OV9A 1SZGA 3QJAA 1GVQA 1Y0EA 3BLEA 3DGRA 4HNVA 1KM0A 5DBUA 3LERA 2R8WA 3LB0A 3STGA 3TFXA 1W3TA 1W54A 3PG8A 2Y70A 3NEVA 5D2VA 3DFOA 4JGDA 3VI2A 2X2GA 3WJSA 2E5BA 3EWZA 3L0KA 3TSMA 3CWOX 3LCGA 2A21A 5K9XA 1GVRA 1BWLA 1H7XA 3HPZA 3GXPA 2I9EA 1GJPA 4Z08A 1PVNA 3B05A 1S5TA 3ZS4A 4AHPA 1ML1A 3N73A 1TPEA 4O1DA 2V2CA 3TU9A 4Y8FA 3LTSA 4ORIA 3SFKA 1QR7A 1O5XA 3QZEA 4IX0A 2CW6A 3P80A 3UWYA 3W7RA 2YDAA 2V2DA 1LRQA 3NXFA 3QW3A 3O8AA 4Q33A 3EXTA 5EL1A 3C4UA 3KVJA 1TREA 1F74A 4U4MA 3IVUA 4AVFA 3W2UA 5L9FA 2Q3OA 3LHTA 4EVZA 3MP4A 1F76A 3GNDA 3ZWSA 3CPRA 3W75A 3EWUA 3CLMA 4LV9A 3QSTA 4O13A 3QMRA 1DBTA 3G0SA 4B5NA 4JTKA 5C54A 1XUZA 2G97A 1BKSA 2J27A 2EGZA 4HKPA 3BK0A 1HG3A 1TO3A 2CU0A 1YDVA 3G1AA 3GDLA 3NAVA 4O53A 4L4LA 3G1VA 1VYRA 3HF3A 4LS2A 4O4WA 3DFPA 1CI1A 1KM4A 3DENA 4UFJA 2A6LA 3LCXA 2OT1A 2NWSA 3D0CA 1HFBA 5K7JA 4UR7A 1FWRA 1F6KA 1VQTA 5U4NA 1OK4A 3SJ3A 2RHGA 1W56A 5CPMA 2ZTKA 4GBUA 2VEPA 2ZQ0A 5IM51 1NAL1 2Z6JA 4O1BA 3W85A 3MP3A 3NQMA 4IMEA 3W7HA 3TC6A 3TAOA 2Z6IA 3MUXA 1TPFA 3MO7A 3GK0A 1JCYA 3EWYA 3M5YA 4I7WA 2QCFA 3LI0A 4O4VA 1LORA 1DHPA 2FLIA 1S3HA 4YXGA 3V75A 1VZWA 3NQGA 3IGUA 1VCGA 2CLFA 2E68A 3MYOA 1HO1A 4M7SA 3EWXA 4JTLA 2FTPA 3G1DA 5IBXA 1HUVA 3SGZA 3UXDA 3CIXA 4TMBA 5FF4A 2NV1A 2ATSA 3LXCA 2TMDA 4FX6M 2BSLA 3RLVA 1I2PA 2XFWA 4UMCA 1ME9A 4MFEA 3W6YA 1SR9A 3QPZA 3QPYA 3PUEA 1ADOA 4AWTA 1X7FA 4ADSA 1JCNA 2LLEA 4M5PA 1OFQA 3THAA 2QJHA 2C19A 3IVTA 1FUYA 4WD0A 3TV8A 4KFOA 2VEKA 4DF2A 3C6CA 1XKYA 5MHBA 1ZFJA 2RH9A 3IGXA 1LOLA 3E12A 3O06A 2WKJA 1QCWA 4O57A 4MZ8A 1AW5A 4GC4A 2G95A 1JRBA 1MSSA 3ABQA 4IMDA 3W2NA 4Z0SA 4GWEA 4K36A 4MKNA 5K9CA 2CZDA 1GYNA 2J9XA 2R94A 3TX9A 1XM3A 4LVAA 4ZQOA 3I7SA 2C13A 2E09A 2OX1A 1TTIA 1PL9A 3I7RA 2CZEA 3STEA 1W5NA 5AOUA 2HS6A 1JJKA 3KAOA 5C5YA 1ME8A 5CGQA 4BWLC 3HQ1A 5FF2A 2FIQA 4MZYA 3QYQA 1KTNA 3LLDA 3LRLA 3GDMA 3KRSA 3UQNA 1TPC1 4IPJA 4X22A 5D38A 2DORA 5CSRA 3LLFA 5KZMA 1QO5A 3U6WA 1WOAA 4R34A 2OZ0A 3M43A 3HOJA 5LKYA 1FQ0A 1NFBA 2QCDA 3GVGA 3LCFA 3G1YA 2C6QA 2HTMA 1KTBA 1TPVA 4YCOA 3PSWA 3OVPA 2GVGA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3W74A

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