3W76 | Genus

Total Genus 103

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	103
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-4-189 rcsb
source organism	Trypanosoma cruzi
total genus	103
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2013-02-27

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w76A02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w76A01

4FNUA 2NX1A 4FNSA 1KFEA 4GWEA 5D38A 3O05A 4BI5A 4Y9AA 3QC3A 3GKFA 4P2VA 1GYNA 1RQBA 4O18A 2BXVA 3TFXA 1YYAA 5I3IA 2XN2A 3DBPA 5FF0A 2YX0A 5DY3A 2X30A 3MHGA 3W76A 3M0ZA 1W54A 3DXIA 3TQ0A 4QSHA 1TO3A 4Y90A 4ADUA 3IGXA 1PL9A 4UTHA 4ZQNA 2DZTA 1GTHA 3BO9A 4GC4A 3VE9A 1TPDA 3L67A 3QYQA 4JGDA 2JKAA 2WNNA 4EWND 3RF9A 4ZVJA 5K7JA 1P5BA 5D30A 1EX5A 1K8ZA 1R46A 2X2GA 1W5QA 5TQLA 1FX6A 3W85A 1HL2A 1HUVA 1E51A 3O07A 3W73A 2E1DA 4X9SA 4M6QA 2ZZ1A 2PRMA 2WSYA 3KRZA 4O13A 2IQTA 3SJ3A 3T4CA 1ICPA 4I7VA 5I3FA 1UUMA 3C56A 2CZFA 1GQNA 5KZMA 1TB3A 1KFBA 3QW4B 3ELFA 1JUEA 1OF6A 1ZAIA 3JS3A 3W2LA 1SZGA 1CI1A 1GG1A 3P82A 4R34A 3EEGA 3N3MA 4HN4A 4HNUA 4ORMA 1B4EA 1XUUA 3S8HA 4UNLA 1KLZA 3DKLA 1EB3A 1FBAA 2B7QA 2RKXA 4JTFA 2EAWA 2ZRYA 4DF1A 2WKJA 3G22A 4JX6A 4E2BA 4RCXA 3WJWA 1H7OA 1CX9A 3HGSA 2DZXA 3S5NA 3E02A 1KM3A 5IBXA 3W6YA 1SSGA 2YGYA 4AVFA 2WO5A 2B4GA 2PC4A 4FIQA 1PIIA 3U6WA 1WOBA 3CTLA 3HG5A 2CLLA 1EA0A 1XUZA 2GJLA 1TV8A 2H3DA 4KKXA 2HS6A 3PVFA 1OFRA 4LOCA 2QCCA 2NUWA 1H7NA 3A9IA 3QZEA 3UNDA 4O15A 4N9DA 3TSBA 1LLZA 2A7PA 2P10A 3L66A 1A5BA 1QMLA 4K8EA 1OFEA 3IV3A 4IMDA 4KFOA 3W7DA 4JYFA 1OG0A 3BGJA 5LNUA 1VHNA 1CW2A 4JTJA 4K38A 3LCWA 2ZZ5A 5HMSA 1H62A 1THFD 4JS3A 4C1LA 2X1TA 1AG1O 2FLIA 4R33A 2QUUA 1K02A 4UNKA 5D04C 2ZRUA 4WY0B 4FB7A 5FEPA 1JUKA 4QM1A 1NEYA 2DORA 4LVFA 1LRQA 3W2MA 1BEUA 1FWWA 1W3TA 2VELA 2W0UA 4JDYA 1KM4A 2RDUA 3I68A 4HSOA 4FNQA 3P81A 2Z6IA 2Y7EA 1Z48A 3RK8A 3OG3A 3DH7A 5HINA 4LNYA 4JR5A 4A3UA 1EEPA 4NT0A 2Y88A 5DXXA 4WUIA 4PL1A 2C19A 1Q6LA 1RR2A 4Q33A 3ZWSA 3S9YA 5CSRA 4MKNA 4EIVA 2A85A 1L6WA 2DP3A 4FX6M 3L5AA 1DQWA 3UWZA 4JNMA 4MYXA 1L6SA 4JEQA 3W07A 1C29A 4AAJA 2V82A 1MXSA 3W7IA 4MLRA 4RR4A 2TSYA 1VGAA 1QPOA 5F2GA 4NNAA 3IGSA 4TO8A 1KM2A 4CCCA 2OZ0A 5A8GA 4NQ1A 3WK2A 2BLEA 4HSNA 2ATSA 3SFKA 3EKLA 1FXPA 1M7PA 4AF0B 3HGOA 3IVTA 2GJNA 5KMYA 4JTTA 3QH2A 3LTSA 1LLWA 3NEVA 2V30A 1FCUA 3DI0A 4RXGA 2Y89A 3NA8A 4PH6A 5HUOA 3PULA 1DL3A 4YLWA 3YPIA 3QQ1A 1VR6A 1TYGA 3LX9A 2ZA1A 2FPYA 1ADOA 4A2SA 1GVQA 3R5EA 2J24A 4UTWA 2AGKA 4O19A 2WV8A 5D2YA 2YYUA 1FY6A 3MO7A 2LLEA 3M47A 3KVMA 4DBDA 1C8VA 3E9AA 3NNTA 1S5VA 2QEZA 2QCLA 4AHPA 2JGYA 2Q3RA 5I3GA 3M43A 1HFBA 1LYXA 3ZWTA 1OK4A 4CNNA 2JKEA 3VI2A 4XUGA 4NJGA 1DHPA 3TUUA 5DY2A 5FF2A 2YFOA 1W0MA 3G1HA 4UR7A 3I7SA 3KVKA 4XBSA 3HPSA 4XTDA 2E5DA 1GJPA 3LBCA 4E2DA 5H2ZA 2CFFA 3LCIA 2A1YA 3GVGA 4UFKA 4MPQA 4IXHA 2NZLA 3IVSA 4MIMA 3N2XA 3BG3A 4DF2A 4UCGA 2J27A 2A7RA 3W1UA 2TRSA 4ZQOA 4KWWA 4OV9A 1TCDA 3GR8A 2FTPA 3LCXA 1G4PA 4FEZA 4OE7A 5KINA 3LBMA 2Y85A 3L68A 1VH7A 2PURA 4R53A 2QAFA 2Y7GA 4Z0SA 1MEIA 4O17A 3L65A 6ALDA 4YXGA 4LVGA 4IOTA 3QPYA 2YXGA 5K9CA 2A6LA 3QSTA 2R91A 1SUXA 3WFAA 1DKWA 5DBUA 1ZALA 3UPWA 5G2IA 1W1ZA 1UJPA 1MEHA 3DFTA 1ICSA 5FI8A 5I3HA 2Z2UA 3S1VA 3G8EA 5TIMA 1IXQA 3KVJA 1GZGA 3BLEA 2E5BA 5ABTA 5HWMA 2ZRXA 4JYDA 4Z1CA 2CLIA 4LTSA 3C8FA 1DVJA 1OX4B 4UTTA 4ICNA 3PC0A 3QMSA 1WQ5A 4GUIA 1DORA 2X16A 1KTCA 4KFNA 3M6YA 5D2XA 1ZHAA 1SR9A 2DZVA 4LT9A 5EA9A 4ML9A 3TMLA 3TC7A 2DZPA 3WJZA 1OYAA 5F4WA 1K8XA 2XN0A 1ZFJA 1R2RA 2FPVA 3FYPA 5GVJA 4FF7A 3UPBA 3KOFA 1A50A 1JCJA 6TIMA 1DQXA 1X7FA 3MWAA 3IRDA 1YTDA 2ISWA 3OHIA 3H54A 3GNNA 4IXXA 5C2XA 3M5YA 1TPVA 4XKYA 1SZFA 3PF3A 3LCFA 2QJGA 2OT0A 4EF9A 1W5MA 4UFJA 4GFSA 1YDOA 2VFHA 4HPJA 3VE7A 3F1QA 2YDAA 3NQGA 3W1NA 4QAIA 1VJIA 1L9WA 4M5PA 1I45A 2Z1BA 2OJPA 3N19B 1WX0A 2ABBA 1TTQA 4HIBA 4K37A 3CPRA 1LOQA 4A29A 3T40A 3M9YA 3W3OA 2C16A 4NNCA 3CHVA 3CEUA 1WAUA 4GNJA 1O94A 3GK0A 1FCQA 4BWLA 4U4MA 1I8JA 4UMBA 5F1VA 2JBMA 1PCKA 1ZNNA 4O8RA 4LC6A 2B7OA 1KV8A 4N6EA 3SECA 3E96A 1OHLA 2TPSA 3O6CA 1W3NA 1GEQA 1KM0A 3GZ3A 1ML1A 3W7NA 1KM6A 3R13A 3FEMA 1G4TA 2VFGA 3P7YA 4XTIA 4ADSA 3HGRA 1GVOA 2OX1A 1RV8A 3OVRA 1XBYA 1WXJA 3UWYA 5HR7A 4WY0A 3TXZA 4PEKA 1IXPA 1H1YA 1JULA 2B7NA 3C6CA 3W88A 3EXRA 2E6DA 3CEPA 4PC8A 5DELA 2JK2A 4Y8FA 4RV8A 3QMRA 4UTLA 3P80A 3RNDA 5AC7A 3E49A 5I3JA 3IIZA 2QDGA 3CIXA 1EWDA 3NQVA 1JR1A 2Y62A 3MI6A 1ZENA 4XWUA 1G7VA 2CLEA 2ZRZA 5MHBA 2QCMA 4FNPA 2ZQ0A 1VCFA 2VEMA 3A24A 5FF7A 1B4KA 1LBMA 5K9XA 4O54A 1YLVA 3MP4A 3G3MA 3RLVA 3GX9A 2P1FA 3W2UA 2DJXA 2E6YA 5LSMA 2TMDA 3QEZA 4WOZA 4O16A 1FDZA 3NAVA 1Z41A 4LV4A 1GWJA 1H50A 3EWBX 3BLFA 3MW7A 2H90A 5FEWA 4AMAA 2YCEA 1TPUA 5L9FA 1U83A 1ZAJA 2ISSA 1KA9F 4AF0A 3FJLA 4WY0F 5F2MA 3F03K 1AW2A 2C3ZA 3HGJA 2ZA2A 5HR6A 4FNRA 3UD6A 3EWXA 4OHQA 3E0IA 2Q3OA 3JR2A 3UQNA 3MMTA 3CB8A 4LUJA 1XFBA 3L5MA 3UZJA 5BOOA 4O53A 3W9ZA 1OJXA 1X6UA 4IMCA 3S1UA 4YWIA 1NSJA 4AHQA 1PHWA 3W7OA 4RX0A 3EX6A 5L6UA 2ZA3A 4K7VA 3WK3A 2H6RA 4M19A 4PTNA 3SW6A 5CZJA 4O57A 5AN7A 2RH9A 2VEKA 3WJYA 5EKYA 1KTNA 4YCPA 2F84A 1VPXA 2VENA 3G3DA 3NL2A 3INPA 5F1UA 5AYZA 3L0GA 4JY9A 3TQKA 1X1OA 1NFBA 3DGRA 4JX5A 3TX9A 1H63A 1YTKA 3PBVA 4N9BA 2GQ8A 4S1FA 4IX0A 1TPFA 1WBJA 2G96A 3MHFA 3HBLA 4UMCA 2YFNA 3EXTA 2Y7DA 4WD0A 5C54A 5D02A 3Q2DA 1GOXA 1W8SA 3M41A 3W83A 3A22A 4NUWA 2A2IA 4NXSA 1M7OA 1BWLA 5LHFA 3B8DA 4NU7A 1EUAA 3UY7A 2A0NA 4NZJA 2ZCGA 4NJIA 5G4WA 2V5LA 1H61A 1N55A 2QCEA 1OFQA 5K9DA 2CLHA 3NQ8A 4JTSA 3W2NA 1NVMA 2C18A 4FX8A 1AL7A 5K4ZA 1SPQA 1JRBA 3HG2A 3OEXA 1LZOA 2ZZ2A 4A2RA 3GAYA 2GVGA 1R2TA 4LVDA 2C15A 1EP3A 3I65A 4GUJA 1V7YA 3G1XA 3STGA 3Q94A 1VHCA 1W56A 3AJXA 3WK0A 3CT7A 1A53A 1OABA 1UASA 2FB3A 3THAA 4UR8A 1SSDA 2QCDA 1TTPA 5D2TA 3W86A 4M7SA 1PHQA 4N6FA 1F6KA 3LERA 3TAKA 3TK7A 3BV4A 2WQPA 1O5XA 4BK9A 3HPXA 1DBTA 5EPDA 8TIMA 1HO1A 3O1NA 1JCNA 1I2RA 4W9TA 3W2KA 3S42A 1KFKA 2R94A 5KZDA 3SZ8A 3SIZA 4BFAA 1PCWA 2GQAA 1DJNA 2NX3A 1ONRA 2X1UA 3C2VA 3G0XA 2H8ZA 3BARA 3A23A 4QJ1A 1UBSA 2ZTKA 3OBKA 3I7RA 4OU1A 3RFAA 3D0CA 1QO2A 3N2MA 3V75A 4QIUA 4QISA 4G1KA 3GDLA 3SI9A 3T78A 5BMXA 1G7UA 1G6CA 3A5VA 4FNTA 1H7WA 3BGGA 2ZTJA 4FX7A 4E38A 1ZCOA 2BTMA 3MBDA 1XXXA 4ZQRA 1TJPA 1FXQA 3PBYA 2Z6JA 4MY8A 4O11A 2DZUA 1W5NA 1XI3A 3GDMA 4NNBA 4RZ6A 1XDLA 4LVBA 4AWUA 1WBHA 2C0AA 5K3VA 5D09A 1TQJA 4Z1DA 1TPC1 1DV7A 1ZAHA 3NQEA 5AYXA 3CWNA 3PWAA 5AHLA 4RXFA 3R8RA 1WYIA 1I2QA 4JD4A 3M5XA 1H51A 3F4WA 3WJSA 3HMJG 3WJXA 3W2JA 3LV6A 1D3HA 2XFWA 4O50A 1TMHA 4UTIA 5AHIA 3ZFHA 1VLWA 3G0UA 4UUIA 5LNSA 3GB6A 1YXDA 3FA5A 3C3NA 3G18A 1Q6QA 3CQ0A 3G1VA 3O6DA 5AC8A 3TQVA 1D3GA 4NJKA 1BKSA 2J6XA 4TR9A 4BI7A 4Q4KA 5DCEA 1EPXA 1VYSX 3A21A 4H6KA 2G5WA 1UUOA 3FJ6A 4OQVA 3S5YA 2RDWA 4PA8A 1TSIA 4UTUA 1T96A 3MJYA 2E6AA 4NJHA 2TYSA 1TREA 3QW3A 3NPWA 3W7EA 4PL2A 5G4EA 3KX6A 4K8HA 3OVQA 4JN6A 1OFBA 1Q45A 4NX0A 2CW6A 3W22A 4ZQCA 1JVNA 3HQ1A 1YXYA 1WA3A 1LP6A 2BWGA 3LTYA 4Z08A 5AHNA 3PB2A 3N73A 3W7RA 3B0PA 3MUXA 1LROA 4JY8A 5LKYA 4AH7A 1LRNA 5D03A 1JUBA 4CQ8A 5G1YA 4DXVA 3WK1A 5G1TA 4D2JA 1F74A 3ATZA 4LRTA 1YDNA 1K7FA 1ZJIA 2I9EA 2A5HA 4TU1A 3BPWA 3NL6A 1O4UA 3E12A 4TIMA 5TBOA 1RQEA 4DPQA 5LNWA 4Z1AA 1W5PA 1OFDA 3DU0A 4MJMA 1G67A 3HG3A 3NQ6A 1XKYA 3PY2A 4LC8A 3TDFA 4GUFA 2DU2A 5HQEA 3HPZA 2V5BA 1FDJA 3KHJA 3LHVA 3GKAA 5D2WA 3U8GA 4AB4A 1L2UA 1TQXA 4HNNA 3EWUA 2YZRA 1QAPA 1KW1A 2QAPA 4JIPA 3LV5A 5DBTA 5AOUA 2P0OA 1VS1A 3NG3A 3DHDA 4ONVA 3A5FA 1VRDA 1JCXA 1SO3A 2RFGA 3G1SA 1H5YA 1HG3A 1W37A 5D37A 3R89A 3NQAA 1F2JA 4Z1BA 4LW7A 3NO5A 4I9AA 3B04A 3KVLA 3NPXA 2ZZ3A 3EX1A 4CQAA 2NLIA 4Y6GA 3NPUA 2J9ZA 1KBIA 1GG0A 5G2WA 3SSJA 3PG8A 3NXFA 2C1HA 5C55A 2VFDA 4O1AA 3HO8A 3T7VA 3OA3A 3LM7A 4NJJA 3PSWA 3N14A 4WOQA 1G69A 4CQ9A 3BLIA 3HB9A 3NM1A 5FESA 5HULA 4MOZA 5HWJA 2HMCA 1J4EA 5D33A 3DFPA 1ICQA 3NVTA 5AC6A 4N02A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3W76A

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