3W7G | Genus

Total Genus 108

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	108
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-5-013 rcsb
source organism	Trypanosoma cruzi
total genus	108
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2013-02-28

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w7gA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w7gA01

2PCQA 1BKSA 1DV7A 6TIMA 3K30A 4BI7A 4O50A 1KV5A 3NQGA 3VCRA 4YCPA 2PE4A 3DFPA 1OX5A 2ISWA 4BR1A 3W72A 2X1UA 4HIBA 3W2MA 1DQWA 2QUUA 2ZQ0A 4MIMA 2FB3A 2I9EA 4UIOA 1PCWA 1VR6A 4EF9A 4MLRA 3ABSA 1JVNA 4DPQA 5HNRA 3SJ3A 5HR6A 2QCLA 3O15A 1VGAA 4UMBA 3PBUA 4I9AA 1ADOA 5F4WA 3EKLA 3W1PA 3HF3A 4YXGA 1LRQA 3GDLA 5CPLA 1D9EA 4HNTA 3NQ7A 4IOTA 1DORA 3TAKA 1GOXA 4O18A 1JQVA 5HWNA 1LOQA 3W1MA 4M6QA 2EHHA 2B7QA 1T96A 5AHMA 1RQBA 1TV7A 3NR0A 4FX6M 2YFNA 3W1NA 2C1HA 3TUUA 1FX6A 2EAWA 4O28A 4X9SA 5A8GA 2XN2A 4HPXA 5E0KA 3RNDA 4M6VA 4AH7A 4R33A 3LV6A 3MI2A 1OK6A 4ZQCA 1SSGA 3QC3A 1ZENA 3EWXA 3FJ6A 2RDWA 3SW6A 3MI6A 4DF2A 2FPTA 1SO3A 3TC7A 3TCEA 1UBSA 1NAL1 1O4UA 4K38A 5EBUA 5AHNA 1LDCA 1GZGA 5AYYA 5CG7A 4LVFA 1DOSA 4MFEA 2ZRVA 3THQA 4RZ5A 1JRBA 3C2RA 4Y96A 1SQ7A 3TQVA 1YDNA 1PCKA 2VELA 5G1TA 1VHCA 4WJEA 5AB3A 3QF0A 5D2TA 3WK0A 4A2RA 4FXSA 1QPNA 1L2UA 1F05A 5HR7A 1KTNA 1A5SA 2H90A 4UFLA 3MUXA 2Q3RA 3KVKA 5K9XA 4LT9A 2JKAA 1H1ZA 5T26A 1YDVA 4Y9AA 5H2ZA 3STCA 1GQNA 2E5BA 1TIMA 3W87A 3HGOA 2E6DA 4XTDA 4DELA 5AYXA 1OFEA 2XFWA 5D2VA 4NZJA 4I7UA 1JQXA 1PV8A 1VS1A 3Q58A 1IIHA 4LV4A 1A5AA 2ZZ3A 2YFOA 1JUKA 5U4NA 2V81A 3L68A 5F4SA 4WX2A 5DCEA 1KBIA 1TPH1 5EL1A 3DFOA 4UFMA 1W5PA 4TMBA 4MYXA 5CPOA 3UYCA 5SWUA 3PBYA 3SECA 3S5YA 1TQJA 4JTJA 1TYGA 5AHIA 3W7HA 3O6CA 1OFAA 3G0UA 4KKXA 3UWWA 3ZWSA 5DY2A 3O6DA 3PY2A 2ZTJA 5FEWA 3S1WA 2NUYA 2Y62A 3M9YA 1SSDA 3M6YA 3WK2A 2QF7A 1JR1A 2QCDB 4PCFA 4ADUA 3NPXA 1YTEA 5LGXA 3HIJA 5FF2A 4K37A 2DP3A 1MO0A 1HL2A 4R7JA 2FTPA 1UJPA 1FWWA 4QISA 4Y8FA 1NSJA 4O54A 1OJXA 3T4CA 2CLLA 3W88A 3GKFA 4UTKA 3BG3A 3TQ0A 2Y89A 4AMAA 2YCEA 1GEQA 4ADTA 4C1KA 5LHFA 2DZSA 3GXPA 3IVTA 3W83A 4HNVA 3QW3A 1LM1A 3NEVA 1F6PA 3HPXA 2OMAA 4GJ1A 4HN4A 4LNYA 5BRBA 5DCBA 3UZ5A 5C6MA 5D33A 1FWRA 1FDJA 2QAFA 1C8VA 4JICA 3HBLA 3PBVA 1YXCA 2ZFAA 3SGUA 1JUBA 3BLIA 1VHNA 4FB7A 3ABRA 3GB6A 4X2RA 1O5XA 1RD5A 3WJZA 2PRLA 3W1LA 1LBLA 2Y7FA 3M5VA 4O8RA 4WXZA 1WOBA 1AL8A 1ICPA 3HO8A 1LOLA 4HSOA 5LHEA 3BLEA 3MBFA 4WUIA 3TJXA 2H8ZA 1C9DA 3I68A 4JTUA 2EF9A 1EWEA 2Z6IA 3FLUA 2DZWA 3HB9A 1LTDA 4AWSA 3IV3A 4O1DA 3SSJA 2NXHA 4Z1DA 1L6YA 4UMCA 3GR7A 4H3DA 4LW7A 2F7FA 3S5NA 4E2BA 5DBTA 3KHJA 1FQ0A 1M5WA 1ML1A 2C6QA 2QUTA 1AK5A 4YLWA 3FA5A 3CWOX 2VFHA 2QCEA 5F2LA 4JIPA 1JCYA 2FFCA 3W7CA 2G96A 3DFSA 4UTWC 3L66A 3S5OA 5EYWA 3I7QA 3C3NA 1V5XA 3UPWA 1IF2A 3R89A 4ZQRA 3PUDA 5HJLA 2JKPA 4LS1A 3MWAA 3IIPA 3LV5A 2GVJA 1W8SA 4CQAA 4CNOA 2J88A 5D2XA 4IUOA 3S6DA 1K7XA 2ZCGA 2OT0A 2B7OA 3AJXA 3T78A 3A23A 3R2GA 3NVTA 3RF9A 2C0AA 1W54A 3W1XA 3W76A 5FESA 1W37A 4ADSA 3TW6A 3OG3A 1LP6A 1KFCA 3V1PA 1OFPA 1CW2A 1WBJA 4NNAA 2YDAA 2YW3A 3N3MA 1X8FA 4JIQA 3N9RA 4NXKA 2NX3A 4N4QA 4S2CA 4ML9A 3GXTA 1X1ZA 3CPRA 2IQTA 3PWAA 1GVFA 4UMAA 1OYCA 1P1XA 2QAPA 3NQMA 1S5VA 1NF7A 3SY5A 1XUZA 3E0IA 1DHPA 1Z44A 3MP3A 5F1UA 2QCGA 3FIGA 3JS3A 4ORIA 1QAPA 2E09A 4IJBA 5BMWA 5AHFA 4UTLA 2FPVA 2CZFA 3W07A 4UTWA 4GC4A 3HGJA 3SZ8A 3H55A 1H51A 1K7EA 4HKPA 4FNQA 3BW4A 2YR1A 1GVQA 3GDRA 1C29A 2V30A 3V75A 1TPEA 1G67A 3KX6A 3IGXA 4LS0A 2V0TA 3STGA 3PS7A 3G1SA 4FHAA 3PG9A 2G97A 2HS6A 3RFAA 2JGQA 1FXPA 3OVRA 1ICSA 1VPXA 3W2JA 3W70A 4Q4KA 5HULA 3B8DA 3JR2A 5DCDA 1XCFA 5K3VA 4IMEA 5MHBA 3WJSA 4Z1AA 3LCIA 3PC0A 4OU1A 4EVZA 4PTNA 3DFTA 3HG3A 3KFTA 1HTIA 1RPXA 4XUGA 3QMRA 4RR4A 5C54A 1E51A 1LRNA 2CLKA 3LXAA 3QZEA 1GG1A 3L9CA 4FX8A 4Y6GA 5F2MA 3VKJA 1YDOA 4NNCA 3LBCA 1H5YA 3UWZA 4WZHA 1VZWA 3B03A 5G4WA 4MYAA 1WA3A 5DN1A 3S1UA 4JTTA 2A7NA 4G1KA 2YZRA 1Z41A 2I14A 3LLDA 2GJLA 1GYLA 4GRSA 3UZJA 2FDSA 3P74A 3W71A 3G1XA 3G24A 1TO3A 4MUZA 1H7XA 1XL9A 2ATMA 3M16A 4WQ6A 3YPIA 4MKNA 1LYXA 5E93A 1GPWA 4QNWA 3GX9A 3GK0A 2TRSA 4X22A 2Y7GA 3IGUA 5G2WA 4LRSA 4LVGA 1A5BA 2OX1A 4DO6A 3FYPA 3C2FA 2OT1A 3NQAA 3W9ZA 2QCCA 2DZPA 2Z2UA 2ZBTA 4X3ZA 3UXAA 2YYTA 3DGRA 1LROA 2V5BA 4O10A 1G69A 2E1DA 1MXSA 3E96A 4MJMA 1SU5A 3U2OA 1TPDA 3OHIA 2AAMA 1D3GA 1ZCOA 2ZA3A 2A21A 2GQ9A 4MVAA 4FXRA 4LS2A 3A5VA 3GNDA 3CHVA 4N4PA 3CU2A 5FF7A 4O19A 2A6NA 4N6FA 3I65A 2GPTA 2W0UA 1M7OA 3LERA 3QFEA 3G22A 4ORMA 1QDSA 1X7FA 3LM7A 4MZ1A 1B4KA 1H7RA 2J24A 4RX0A 3OEXA 3MYPA 4OT7A 1F76A 1EIXA 3IIOA 5LNSA 2ISSA 4UNLA 4O0ZA 1OYBA 3B0PA 3GDKA 5FF3A 3M44A 3CQ0A 3CEPA 3KRZA 3Q37A 2ISVA 3OA3A 2WKJA 2GQ8A 3QSRA 3G18A 1SPQA 2WSQA 3ZWTA 4TIMA 3P62A 2QKFA 4IXXA 4JYEA 1OG0A 3KVLA 3P8JA 1EPXA 3S42A 1QMLA 4LRTA 3W7LA 2QEZA 2G95A 4AHQA 4MOZA 5CSSA 3O63A 3BV4A 4ZQNA 3SIZA 2X1SA 5EY5A 3M43A 3NL6A 3OVQA 2X1RA 4NJGA 1ALDA 1LRTA 3LHVA 1O60A 1IXNA 3W75A 2BX7A 3TXVA 3QRHA 2B0MA 1G6CA 2X2GA 3W7RA 2FJKA 3GLCA 1BWLA 4K8EA 4KFPA 2QCMA 3CEUA 1XDLA 4UTIA 4JEQA 5F1VA 3USBA 2HSAA 4ALDA 2QCHA 1W3IA 1OABA 1TQXA 2WOQA 1TTQA 4JTIA 3PSWA 3L2IA 1W5OA 4YWIA 1KLZA 3LGEA 4JX6A 3G1FA 3S0CA 2E68A 1AW1A 4DF0A 4K7VA 1RZMA 3EEGA 3QPYA 3WJYA 4O1BA 3H53A 4AB4A 1GVOA 3GAKA 3VFLA 4UXDA 1W56A 5LNUA 1ZALA 3LTPA 2ABAA 3DBPA 1KLYA 2PRHA 1OFOA 2TPSA 2ZRZA 2R14A 3NAVA 3QSTA 1H62A 2FQIA 3W85A 1TPFA 1L9WA 2C15A 3HJZA 3IIVA 1RQEA 2RH9A 4K7YA 4A2SA 5HWJA 1GTHA 4Z0SA 4O17A 4JDYA 3SR7A 4FNPA 5KZDA 3DZ1A 5KMYA 1RQHA 4N9CA 4CQ8A 2YYUA 4FNSA 3QEZA 1KTCA 1ZAIA 2Z1BA 1H60A 3L5AA 3W7OA 4L4MA 4NT0A 3W3OA 3BW3A 1ONRA 1KBJA 1TPVA 2WO5A 3DKJA 2VEMA 1YLVA 5I3HA 4IMFA 2DZXA 3E49A 3MI3A 1DVJA 4MLJA 4WOQA 1XUUA 3QW4B 4NUWA 3ZFHA 2ALDA 3MMTA 1GTEA 4O12A 4GXMA 3IIXA 1QCWA 1KM1A 5EA9A 3Q94A 4N02A 3TJLA 1M7PA 3NQEA 4UNKA 5DBUA 3C2OA 2Y85A 5AC8A 4E38A 2DZUA 3R8RA 1SW0A 1U83A 4LUIA 4TU1A 1G7UA 1W1ZA 2H3DA 4BI5A 1WAUA 2JGYA 2RHGA 4HT3A 3BO9A 3IEBA 4K6AA 1FWTA 5CPNA 1TSIA 4BI6A 2Y6ZA 4ZVJA 4U4MA 3EX4A 3C52A 1WXJA 4B5NA 1K7FA 2C19A 4GWEA 3TQKA 1QPQA 3NL5A 3G1HA 1W0MA 4RZ4A 5FI8A 2GJNA 3LRMA 4YL2A 3CC1A 1HUVA 1ZJIA 3KVMA 4NNBA 3NO5A 2V2HA 3GKAA 4A29A 4FNUA 3QQ1A 1HFBA 3TH6A 4QNEA 4FIQA 4HSNA 1IXOA 1KM5A 3ANYA 4Q32A 3THAA 5BMXA 2QCNA 4LVAA 3KRSA 4PL1A 2CZEA 3W74A 4FX7A 1UUMA 3G8RA 3L21A 4E2DA 1DKWA 3P80A 1AG1O 3G0SA 1B9BA 3MHUA 2E6YA 1I4NA 1OX6A 4Z0JA 4OV9A 3NM1A 3M47A 4TR9A 2C18A 3PSVA 1NEYA 3LXCA 1LLZA 3DFNA 3TU9A 2ZZ5A 4HNNA 3E12A 1K03A 4IXHA 2C13A 4EF8A 3LTYA 3E02A 1FCQA 3RMJA 4DBEA 3GXNA 1FWSA 1SO4A 3W73A 2CLMA 4WY0B 1ZHAA 1SW3A 3L5MA 3LCGA 2NX1A 2WV8A 3HGRA 1WDWA 4BFAA 1T0OA 5LSMA 2TMDA 4NX0A 2W6RA 4HHPA 2Z0IA 2GVLA 3R13A 1Y0EA 1KM4A 3W2KA 3M0ZA 4IGHA 3PB2A 3VI2A 3O16A 2QUVA 1SO6A 3TSMA 3BK0A 1U5JA 4LOCA 1SZEA 4NXSA 5C2XA 2TYSA 3LCXA 5D30A 3DI0A 2BLEA 2AGKA 5D02A 4YCOA 2A7PA 2ABBA 4QQ3A 3W23A 3LTSA 4FIRA 1TTIA 3TFCA 2DU2A 1HO1A 2PURA 1OK4A 4Z1CA 1R30A 2A5HA 4EIVA 3QMTA 3N34A 1KFKA 1SFLA 3MJYA 3PAJA 1XI3A 1GT8A 2VFGA 3GNNA 1F73A 4ZQPA 3L65A 4K8HA 3TA6A 5HINA 4IWWA 2CLIA 4RCXA 5CZJA 2DORA 3LB0A 4XTIA 5DXYA 2CU0A 3C2VA 1TPWA 3LLFA 5IBXC 2QJHA 3PF3A 2WSRA 1NFBA 4M5PA 1P0NA 4O4WA 1VC4A 1YXYA 3NQ8A 5C5YA 2R8WA 1EB3A 2Y70A 4JTFA 5LZLA 1QPRA 3W7KA 2YSWA 1XBVA 2VEKA 3BARA 3PM6A 5FF0A 3PG8A 4NVTA 2I1OA 3DH7A 3HPZA 4O1AA 2CLEA 3EWUA 4PA8A 3LOTA 2V2CA 3LDVA 5TIMA 4O11A 5AC7A 4FNRA 4M7SA 5CZSA 1FCUA 1BTMA 1ZFJA 4IMGA 4UFJA 1XBXA 3NGJA 4OGZA 3A9IA 1OX4A 1JCLA 1PE1A 2A7RA 3TR2A 3W7JA 5J5DA 1B4EA 3B06A 4MZYA 1Q6LA 3I6RA 4XKYB 3T44A 2QR6A 4UC5A 5FF4A 2WSYA 3LCHA 3NOEA 3TKFA 2NLIA 1Q6OA 3EX6A 4CCDA 3QPZA 3IGSA 2QDGA 1ME7A 1VLWA 2EKCA 6ALDA 1W5QA 2CLHA 5AHEA 4NJJA 4HNUA 2OZ0A 2E5CA 3DXIA 3NPWA 3B0VC 1LBMA 3PULA 1H63A 5AFDA 1WBHA 3LCWA 1FY6A 1F6KA 1S5TA 2CZDA 3EX2A 4TX9A 3P7YA 1K02A 2ZRYA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3W7GA

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