3W7L | Genus

Total Genus 106

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	106
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-5-075 rcsb
source organism	Trypanosoma cruzi
total genus	106
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2013-03-02

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w7lA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w7lA01

2ZZ2A 1EPXA 4MJMA 1WDWA 5CPNA 2Z2UA 5AHLA 5K9XA 4FF7A 4K39A 3LLFA 3L66A 2YYUA 1F6PA 1W0MA 4PTNA 2VFHA 1B57A 4CQ9A 1H7RA 3IGUA 2A0NA 5LZLA 3DKJA 3W6YA 1L2UA 3ZWTA 1W5QA 3P60A 5F1VA 5FEWA 1K7EA 5KZEA 3BLEA 4GRSA 2NZLA 3MW7A 4CNPA 5C6MA 4P2VA 2H3DA 3FLUA 3IIPA 3RNDA 1TTIA 2X30A 3S5ZA 3T40A 1DL3A 3IRDA 3LCWA 4LNYA 2EHHA 5CPLA 2B7OA 3EWXA 3QEZA 3PBUA 5C5YA 2YZRA 4ZQOA 1V5XA 1X1ZA 3IV3A 1S5TA 4JDYA 4TX9A 3M6YA 1AW2A 1VYRA 3C2EA 2ZZ1A 4FX6M 4HNTA 1LROA 1U83A 3TSBA 3NM3A 1W5MA 3GYEA 1PHQA 3MYOA 1O95A 2ZTKA 4MKNA 4GUJA 1VC4A 4R7JA 1UUMA 2I1OA 5A5WA 3OG3A 1RZMA 2OT0A 2QEZA 3TC7A 1J2WA 5HNRA 2FIQA 3HPZA 4DF2A 1AW1A 1TPB1 2CLOA 4FHAA 4IX0A 3L5AA 3HO8A 3S1VA 3THQA 1I8JA 3OIXA 3LBMA 1W3NA 4JYFA 1O4UA 1SO5A 2BXVA 2GPTA 3U2OA 4JTHA 1YTDA 4XTIA 3TUUA 4AH7A 3ELFA 5BRBA 4NJHA 4Y96A 1GVSA 3M41A 4NUWA 2Q8LA 3MBFA 2CU0A 1Q6OA 4O14A 1QOPA 3E12A 3O6YX 1OABA 5FF2A 1H60A 3FOKA 1FXQA 4WY0B 5AYYA 1SW3A 2OJPA 3EXTA 4K7VA 4WY0F 3W1AA 1GVRA 4FEZA 4M7SA 1MEWA 4O15A 3QJAA 4RR4A 4TU1A 3F1QA 3NPVA 3N14A 3VE7A 3BO9A 4O53A 3OVPA 4LU0A 1WBHA 1DV7A 1QNVA 3DI1A 3H55A 3KRZA 3ABSA 2V2HA 1OFEA 3W9ZA 2H90A 1OYCA 2G5WA 3KVLA 1H61A 4TMBA 4RXGA 1TRIA 1K02A 4HT3A 2A6NA 1Z44A 1ZAIA 3O15A 2PC4A 3IIXA 4FIQA 2B7QA 4GUHA 4O11A 3U8GA 3LB0A 2ISVA 2VELA 3LBCA 1AMKA 2X1TA 4OBTA 3QM3A 3W1NA 5KSWA 1KFEA 1W1ZA 3GZ3A 3M9YA 4R33A 1TO3A 3Q2DA 4GXMA 4Y8FA 3A5VA 4O57A 3ABQA 3KVMA 4JTIA 4UIOA 5D32A 3R89A 4BWLA 4IMCA 5IM51 2WQPA 3CB8A 1SO6A 3B06A 3UXDA 3HPSA 1YPFA 3QH2A 4P61A 3TMQA 4A22A 2FPYA 1G7VA 3BW4A 5K3VA 1TV7A 3WFAA 1R2RA 3MI3A 1FQ0A 3NXFA 3W7KA 1FY6A 1EP2A 1X8FA 2XFWA 3S42A 3S1XA 2E1DA 3MI2A 2WNQA 3W7PA 1KM2A 3USBA 4X9SA 3HG4A 4NX0A 2GJNA 2GVLA 1OYBA 1AL8A 4O1CA 4A21A 5FF4A 1KTBA 4CCCA 3MHFA 1C8VA 3ABRA 1O60A 2DP3A 3A9IA 3T78A 1VZWA 4Z1AA 1VYSX 1JR1A 1VCGA 1LP6A 1R2TA 4FXSA 3ZR4A 2ZBTA 2C15A 1NEYA 2QF7A 4O17A 4OV4A 4UR7A 1F05A 3NZ1A 4UFHA 1RQHA 4NNBA 1A5SA 2IQTA 2TYSA 3OBKA 4JEQA 1GQNA 1LBLA 3W83A 1GPWA 3LX9A 1EX5A 4AVFA 2CW6A 3LI0A 1LRQA 4NJKA 2YCEA 8TIMA 1LM1A 4FNPA 2Y7FA 1QWGA 4BK9A 3GKFA 2ZRVA 2CLLA 3FKKA 4ZQPA 3G1AA 1SZFA 1W31A 1TPH1 3KRUA 4U4MA 3SJ3A 1SSGA 1R46A 2C19A 5FI8A 5E93A 1N7KA 4UTWC 3YPIA 4U28A 2A7NA 1DHPA 1S5VA 4UTUA 3GLCA 4IWWA 3MP4A 1KBJA 2W6RA 2YW4A 4XKYB 3GAKA 1OF6A 2RDUA 3EX1A 2YYTA 5FF7A 1JJKA 3W22A 5LHEA 1NF7A 3BVJA 3STFA 4NXKA 1SZEA 3C3NA 4YLWA 1K7XA 1FUYA 3TFCA 2DORA 1FCBA 2ZA2A 2V8ZA 3W7JA 2DJLA 4O4VA 4IMFA 1KTCA 1WX0A 1Y0EA 1M6JA 4MLRA 3EX2A 4LWWA 3TR2A 3L0KA 4MZ8A 3INPA 4XZ9A 4DO4A 2QUTA 3HJZA 1QDSA 4UR8A 5LNUA 2EPHA 2VEKA 1X7FA 3L67A 4EF9A 2QCNA 1Q45A 3LRLA 3GR8A 2QJHA 3MWAA 5D03A 5HJLA 5G4EA 4JTEA 4Z1CA 4JXCA 1I2NA 5I3IA 5LNSA 3MI6A 5HWJA 1B4EA 2DZUA 5G2IA 3I7QA 3W73A 1DOSA 1ZAJA 1SZGA 2Z6JA 4DPPA 2NUYA 2VFFA 3G24A 1XM3A 2UV8G 4QJ1A 2QKFA 1WOAA 1VGAA 3BW3A 3GDLA 5EL1A 1H7PA 1VS1A 3LHVA 2DZXA 4HNUA 5DCDA 3IEBA 5HR6A 1ZFJA 2B7NA 3C2OA 3SY5A 5BMWA 1KM0A 2TMDA 4GFSA 4JTKA 4GJ1A 2FB2A 3O6CA 3W1MA 2A85A 3UWQA 1GVFA 2OZ0A 4HKPA 2B4GA 3DHDA 1ICQA 1SW0A 3H54A 1F6KA 5D2YA 5CZTA 2CLIA 4M7TA 2A5HA 3B03A 3MBDA 2B7PA 4ALDA 3HBLA 1N8FA 2WPBA 3EX4A 1JQVA 1G4TA 2QCCA 3RLVA 3LHZA 1Z41A 1TIMA 4AF0A 4WXZA 1QCWA 1YPIA 3UY7A 5AC7A 4GUIA 5D30A 5DY3A 4AEOA 2J27A 2ZCGA 3KFTA 5G1TA 4Z1BA 4MFDA 3HMJG 1GG1A 1GTHA 2DJXA 1FWRA 2KZHA 3LCGA 1YXYA 5G1YA 4ADSA 4O16A 3G1SA 4CCDA 1BKSA 3LTPA 1KM3A 1LBFA 2V30A 1GWJA 3EWWA 1VCFA 4I9AA 1NVMA 1VCVA 2VXNA 1S5WA 3L5LA 1XUUA 4A3UA 2BSLA 1GYLA 3O05A 3M47A 1P4CA 3KOFA 3P5ZA 2ZZ3A 2GQ8A 1G69A 4LUIA 2C16A 3G1FA 1TCDA 4O1DA 1SU5A 1PCKA 1KW1A 1A5AA 1FDYA 1MO0A 1OX6A 4IGHA 5CSRA 4PA8A 3S8HA 3S0CA 2NXGA 1S3HA 4XWUA 3I6RA 3E02A 3QFEA 1QFEA 3L68A 3WJWA 3CWOX 1I45A 3NQMA 4C1KA 5D04C 3KRSA 2QCDA 3R5EA 4TR9A 2A1YA 4AWTA 3DH7A 1T99A 1OF8A 5F2IA 3E49A 3NQDA 1RQEA 4GUGA 4UNKA 4ADTA 2OMAA 1SZNA 3CEPA 2DZPA 2EKCA 4MUZA 1OK4A 4MFEA 4AHOA 2DZTA 2ZA1A 1FBAA 2H6RA 3QPZA 4M6QA 1EUNA 3TXVA 3W1PA 1FCQA 4FNRA 4J9JA 1IIGA 4CCEA 2J24A 3P8IA 5CPMA 1THFD 1KLZA 3JR2A 4O19A 1W5NA 5KZDA 3C4UA 5I3FA 2CZFA 3S6DA 3DKLA 3CQ0A 5F2MA 3PB2A 3TH6A 3W7CA 1G4SA 3NL2A 3MUXA 2J9XA 3B4UA 1LLWA 3PUDA 2X16A 3GB6A 4AWSA 3PWAA 3SECA 1UCWA 3PULA 1D9EA 4EOUA 2E77A 1DQXA 4JDBA 1W8SA 2CZEA 1ZNNA 5LNWA 4JNMA 1IIHA 2PCQA 3W7GA 1ICSA 3T7VA 2GVJA 3PR2A 3W88A 3QSRA 1WXJA 1TPVA 3T55A 1QR7A 1RPXA 4ZQRA 5AHNA 1ZENA 3UWZA 4FXRA 4WOQA 2P10A 5F4SA 4AHPA 1XC4A 3IVUA 3VCRA 4A2SA 4LS2A 1H50A 1F5ZA 3LHYA 1XL9A 4ZQNA 1RR2A 2VC6A 4N9BA 3L0GA 2WV8A 3G1XA 4DBEA 3R13A 2OT1A 4Z08A 4IPIA 3VNDA 3C2FA 2WSYA 2E09A 3NQVA 5I3JA 3S9YA 1YTEA 4UUIA 2YW3A 4LY8A 3EKZA 3N9RA 3W1RA 4DQWA 1EWDA 4DBDA 1QPRA 3L2IA 2RDWA 1YDVA 1QMLA 5AHEA 4NVTA 5EYWA 4HPJA 5K9DA 1NAL1 3F03K 1D3HA 3W07A 1CI1A 1FCVA 3HQ1A 3DZ1A 1TPWA 1W5PA 3BLFA 3PG8A 3Q94A 3N19B 5KZMA 1GG0A 4JICA 4RXFA 1HL2A 4AMAA 5CG7A 3TJXA 1BTMA 3HG3A 1GJPA 1P1XA 4JYDA 3W76A 3C61A 1KFLA 5IBXC 5CZ0A 1JUBA 1KBIA 4M6PA 4RZ6A 3PF3A 3FJLA 1J5TA 1LRNA 4Q4KA 1FX6A 4KFNA 2ZDRA 3LM7A 2WSQA 5G4WA 3NA8A 1C29A 3E0IA 3TIMA 1ML1A 3VE9A 2JKAA 3KX6A 3LHUA 5HMSA 3QW3A 7TIMA 2Z0IA 3CIWA 4O0ZA 3W71A 2ZRYA 3BG3A 3SFKA 3W2NA 4R34A 3W85A 4DF0A 1WYIA 3LERA 2YGYA 5FESA 2V2CA 4JN6A 3W84A 1X6UA 4D2JA 5HWNA 5C54A 1AK5A 3W7IA 1FDJA 5EY5A 3ZS4A 2Z1BA 3LLDA 2GJLA 3QMSA 3NYZA 4B5NA 4FNTA 3EKLA 5K4XA 4XBSA 3H53A 4WXYA 4ZZ9A 2YDAA 3IGSA 4RCXA 3G1HA 4OT7A 3EWYA 1RD5A 3WK1A 3SSJA 4BFAA 4FIRA 5AOUA 1PS9A 2YXGA 1H1ZA 3P67A 1T96A 1SR9A 1XXXA 5FEXA 5U7SA 3DHFA 2QUVA 2JBMA 4E38A 2NX9A 3TW6A 1U5JA 2F7FA 2RH9A 4ICNA 5FEPA 1JCMP 4UTKA 1LRTA 2EAWA 4UNLA 1ME9A 4ONVA 2A7PA 2QDHA 1FWSA 1V7YA 4AB4A 2QAFA 1K03A 4N2YA 4NJGA 1JULA 2ZZ4A 4LT9A 3G3DA 5DBUA 3MO7A 3BARA 5I3GA 3W7EA 5D2TA 4L4LA 5DELA 3NL3A 2X1RA 4UCGA 2NLIA 4NNCA 2TRSA 2ZTJA 4O8RA 1JRCA 2ZRXA 3P84A 5D2WA 2Y85A 3O6DA 1L9WA 4QITA 1P5BA 3LXBA 1AG1O 4LOCA 3N73A 3G1VA 3L9CA 4IPJA 3DFPA 3T44A 5G5IA 4UMCA 1DJNA 2XN0A 5AHFA 3BV4A 5CZSA 1I4NA 1PIIA 4DXVA 5FF0A 4WD0A 5KTLA 2E6AA 3CTLA 4DEFA 3NL5A 1FXPA 3MJYA 3NAVA 1PHWA 4X22A 2BZNA 2XN2A 1JCJA 4UFIA 2CWNA 3STEA 3L0NA 3NQ7A 1Q6RA 4UMAA 3DXIA 5DBTA 4HPXA 4N6EA 2HSAA 3FYOA 1GEQA 1VRDA 2QJIA 4G1KA 4Z0JA 3FJ6A 3PB0A 1EP3A 3N34A 3N9SA 1YDNA 2EF9A 2ZYFA 1L6YA 5HULA 3PG9A 3A24A 3W2LA 1SQ7A 1VHCA 2YPIA 5HWMA 3TAOA 3CHVA 4MIMA 4K38A 1IXPA 3UY8A 1F73A 3LRMA 1WAUA 3PBYA 3NQ8A 3TSMA 1DORA 3P8JA 2C3ZA 1VLWA 1W5OA 4KFPA 5AYXA 2Y63A 1H7XA 4TMCA 4FB7A 3O1NA 4LV4A 4MYAA 3NNTA 3P82A 4UFLA 3M5ZA 2E6FA 4LVDA 4LV9A 1XDMA 2Y7EA 3W7HA 3NQGA 4LVAA 4NJIA 5FF3A 4MVAA 2G96A 5CPOA 3E96A 3B04A 3B8DA 4RLIA 1XFBA 5AC8A 2VOMA 2ALDA 2TSYA 1Q3NA 5D09A 1YXDA 2JKPA 3GR7A 4O13A 1HO1A 2VEMA 3L65A 4UFMA 4N9EA 4PL2A 1FWTA 1M5WA 3SZ8A 3ZFHA 2E5DA 3PY2A 1QPOA 5LGZA 3VI2A 4GBUA 1SFLA 1RQBA 4IX2A 1VHNA 3G0XA 1KM5A 4LC8A 1JUKA 3TMLA 4OE7A 1JRBA 4HN4A 4RV8A 4A2RA 3AJXA 2ZZ5A 5AC6A 4ML9A 5E0KA 1UJPA 3QYQA 3WK2A 4EF8A 3GVGA 4AXKA 3N3MA 3HGJA 1SSDA 2FQIA 3R2GA 3W7LA 1EB3A 4LC6A 2HS6A 1PE1A 3RFAA 1F7BA 1A5CA 3M0ZA 1HUVA 3P7YA 5CKSA 4HSOA 1K8ZA 2NX3A 3CEUA 5AN7A 1SPQA 2DU2A 3M43A 4RJEA 1ICPA 3WJZA 1OVDA 3ATZA 4JYEA 3UPWA 2PURA 3GKAA 1G7UA 3NM1A 3G0SA 5DXXA 4CQAA 3G1DA 1OX4A 4GUFA 2ZA3A 2GQ9A 3OEXA 5F2LA 3B0UX 1W54A 4Y90A 4LTSA 4X2RA 3BG9A 4H3DA 3NQFA 3UWYA 2P0OA 3D0CA 2W0UA 4ORIA 4UTTC 1BWKA 1OFRA 2FJKA 2HTMA 3NPUA 1SW7A 6ALDA 4O1BA 3HPXA 3EWUA 3W74A 5F2GA 3GDMA 3E9AA 1VYPX 2O7QA 4UTWA 4KWVA 1K3UA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3W7LA

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Chord Diagram

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