3W85A

Structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with tt2-3-139
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
publication title Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with TT2-3-139
rcsb
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 104
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2013-03-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 3w85A02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3w85A01
4HKPA 4Y96A 1O94A 5TQLA 1A5AA 3A23A 3L68A 3GXTA 1TPH1 1LOQA 1W5OA 2Q3RA 3NQEA 1JQXA 4Z1CA 4JX4A 4D2JA 2DZUA 2JKPA 3IGXA 1ICPA 1VPXA 1VHNA 3O07A 2ZA1A 4Z1BA 4FX6M 5K3VA 4M6VA 1H1YA 5HUOA 1G69A 1TV5A 1V5XA 3EXTA 3T55A 3PB2A 2A6LA 1VHCA 1T8XA 1QWGA 2KZHA 4AWUA 2Y62A 1WBHA 3UXDA 5CPLA 3OEXA 3UNDA 3YPIA 1XDLA 1QFEA 3EEGA 2FIQA 1AW1A 1HG3A 3TJLA 2QR6A 4XBKA 1F76A 3CTLA 4A3UA 3S5YA 3S1WA 3L0KA 4JIPA 1B4KA 4N2YA 3VE9A 2WPBA 2TYSA 3UY7A 3PB0A 4DO6A 2BTMA 4FIQA 4MY9A 2QCFA 4A2RA 4K8HA 5AYXA 4ZQPA 4O14A 3SFKA 3G3MA 5BMWA 3NQGA 1EX5A 2RH9A 3C0JA 3S0CA 1EWDA 2QDGA 1HO1A 4OHQA 3W1PA 3HQ1A 1SSDA 3FKKA 4UNKA 4CNOA 1J2WA 3BLIA 3ABQA 3CT7A 3LCGA 3L5MA 1B9BA 1KV5A 1F05A 3M5XA 4LC8A 3A24A 1SR9A 3OBKA 1JUEA 3I7RA 1M7PA 3R2GA 2QCDB 4UIOA 2V8ZA 5L6UA 2CLEA 2ZZ5A 1SO5A 5CPNA 1G4SA 2ZTJA 3TUUA 5FF2A 1H50A 1RQBA 3KVLA 1ADOA 4GC4A 3HG2A 1YTEA 1TPUA 3UPBA 4PODA 3JS3A 3LTYA 3PR2A 5D09A 3S9YA 4XWUA 5U7SA 3ZS4A 3E0IA 1VR6A 2NX1A 1GYNA 3CEPA 3EWBX 2ABBA 3DGRA 3C4UA 1H61A 3TC7A 5AN7A 3VE7A 3G1HA 5EY5A 1HO4A 1W5PA 4K36A 3QQ0A 4MKNA 4LVFA 1T99A 5EBUA 3LBMA 5D37A 4UTKA 1OYAA 3TFXA 3FYPA 3O8AA 5DLCA 1V7YA 1XL9A 2CLIA 2X1TA 1LCOA 2JGQA 2PRMA 5K9DA 1Y0EA 4KWVA 5DY2A 3C2FA 3RFAA 1JCXA 1Z48A 1A53A 5TBOA 6TIMA 2QUVA 3O05A 3L0NA 1BTMA 1P5BA 4NX5A 5HMSA 3GDRA 2ZZ3A 4HHPA 4O1DA 2ISVA 1TCDA 4DPPA 3PUOA 1A5BA 3ATYA 5AFDA 4FEZA 2V5LA 4NZJA 5G2IA 2E5CA 3P80A 3W7OA 3C52A 1KFEA 3B05A 2I9EA 4DXVA 4PL2A 3E02A 3LHVA 1I4NA 5D05A 2VFIA 3NDOA 3DFPA 2V2HA 2WNQA 4I7VA 3TCEA 1W3NA 2Q3OA 4E0CA 5I3GA 1ZCOA 1SUXA 1OFEA 3NA8A 4QNEA 1L6WA 3P84A 2ZBTA 3M41A 1TIMA 4MFDA 3TSBA 2FDSA 2GJLA 3W1QA 2XN2A 4O54A 1VGAA 1SW0A 2QAFA 3LCWA 4CNNA 4IMCA 3ABSA 3L0GA 3GZ3A 4Y90A 4LRTA 2WSYA 1DJNA 3IIZA 3UWUA 1EP3A 1LOSA 1S5VA 5F1UA 4LOCA 3STEA 4UR7A 1OX5A 3LV6A 3LXCA 2W79A 2NZLA 1HTIA 1W54A 5HWJA 1SFLA 1P1XA 3W7NA 4ORMA 3GLCA 2OT0A 1BKSA 2DZSA 1OABA 4UTHA 4H4IA 3W7JA 4DBDA 3ELFA 3KHJA 4KWWA 1ONRA 3G0SA 4K6AA 1SW7A 3MYOA 1O4UA 3SZ8A 1QMLA 3NQ7A 4POCA 2E5BA 3W2NA 4FXSA 4L4MA 3BW4A 2OT1A 1ME7A 4GUIA 4YMZA 3NO5A 4FNUA 3MYPA 1LZOA 1FY6A 1TREA 4U28A 1VCVA 1XKYA 2R91A 3WK1A 4MY1A 3M0ZA 2H90A 3N14A 4GNJA 2V9DA 3C8FA 3HPZA 4FIRA 4M19A 3EX2A 4FNTA 3DFSA 3ANYA 4O4VA 1OYBA 1X1OA 4DQWA 3PG8A 1VS1A 2CZFA 3FJ6A 2QEZA 2YYUA 2Y63A 2JBMA 2V5BA 1S5WA 3EWXA 1GVSA 5K9XA 3NG3A 4IQLA 3JRKA 5J5DA 2ATMA 2AAMA 4JTHA 7TIMA 3NQDA 4DELA 1YTKA 1D3GA 3W1TA 3IRDA 5C6MA 1VC4A 2WNZA 4YLWA 3LLFA 1K7XA 3DKJA 5G4EA 1SO6A 3DKLA 4TX9A 3M16A 4AHPA 1KTBA 4LWWA 4QSHA 2BWGA 3P62A 3M44A 4UTIA 4YL2A 4UFKA 3W1MA 3S6DA 5I3KA 5AC8A 4MJZA 1XBVA 4RXFA 1TPB1 1SQ7A 4HT3A 5D30A 1XM3A 1RZMA 2F84A 2H8ZA 4OV9A 1TMHA 1K8YA 1TPDA 2BLEA 2ZCGA 2Y70A 1O60A 3W9ZA 1DOSA 2E1DA 2GVGA 1FWRA 3OG3A 1WX0A 1LRQA 4HPXA 4QISA 5GVJA 4FNSA 2QCEA 1MEWA 3NZRA 1QAPA 1PCKA 2Z6JA 2A1YA 3QMSA 2CLHA 3IVSA 1KLYA 1D3HA 3MI3A 4LS0A 2QCMA 5DBTA 4A2SA 4B5NA 1MEIA 5MHBA 4NX0A 5C54A 3R8RA 4O10A 3QEZA 1SFJA 2P1FA 4O1BA 3PF3A 4QQ3A 1O5KA 3P67A 4JTUA 1N7KA 4PCFA 5CGQA 3BK0A 1H7XA 5C2XA 1RVGA 3HIJA 4N9EA 4OV4A 3M1ZA 3S42A 3S8HA 2G96A 4JYEA 4K8EA 2ZZ7A 5BW6A 2DP3A 3EWUA 5K7JA 1Z44A 1BWKA 5I3IA 1I8JA 3OHIA 2VEPA 4AF0B 4AWTA 2X1RA 4LVBA 3W7KA 1XUUA 4MPQA 4RLIA 3QMTA 1F73A 4TIMA 1KLZA 1KBJA 5DXYA 3UZ5A 5D02A 3TFCA 2AQWA 3NPVA 3FYOA 4XKYB 1UCWA 3W7CA 4O50A 2J9YA 2VFGA 3N9RA 1PS9A 2OJPA 3PG9A 3FIGA 3EKZA 1JQVA 3UPWA 1W5MA 4LV4A 5BMXA 4O19A 1OK6A 3OA3A 3FFSA 1K02A 1NEYA 3M7WA 1H7NA 2I1OA 1H63A 2IQTA 3DI1A 2AGKA 4MOZA 3PVFA 4K38A 2VEMA 1EPXA 4Q4KA 1YLVA 2VOMA 1GYLA 5D03A 3P74A 2J24A 4WZHA 3M9YA 2DZWA 5AYYA 2YCEA 5CKSA 5HINA 4O1AA 3NQAA 4IPJA 3C61A 5F2MA 3G1FA 4ML9A 3W7GA 1L9WA 5DCDA 4FO4A 1YPFA 1H7WA 2EF9A 4PH6A 4U4MA 5D04C 2YGYA 2X16A 4MJMA 3BO9A 1R2SA 5I3FA 4HNVA 2A6NA 4FX8A 3N73A 3NQVA 1DVJA 3LLDA 1DORA 2Z0IA 2EHHA 3JR2A 4MYXA 3K30A 1EUNA 2F7FA 3W2MA 2H8XA 3PBYA 4PTNA 2DZXA 3TW7A 1LTDA 2WSQA 4ZQNA 3LCIA 1FWWA 2LLEA 4OQVA 4FNQA 3DI0A 4H3DA 3LXBA 1KM6A 3LCFA 3C6CA 3L67A 3NYZA 2NUYA 1LROA 4JTEA 2Y7DA 3GKAA 5D38A 1YDVA 4ZMGA 2NLIA 2JKAA 4K37A 1P4CA 4WD0A 3SY5A 3A5FA 2UV8G 4UTUA 3W7PA 3A5VA 1UBSA 3DHDA 3W86A 3LCXA 4Z0SA 3VCRA 1LLZA 4M7TA 1YXYA 3TMQA 2B4GA 4DF0A 4AWSA 2R94A 2YXGA 4CCDA 1TYGA 2G97A 3DFOA 2QDHA 3DBPA 1FCBA 1K3UA 4IXXA 3HPSA 1F5ZA 5AHIA 4RR4A 5FF4A 1Q6LA 1F74A 4N6FA 1VYPX 3GAKA 4JD4A 2QKFA 3GNNA 3G8RA 2Y88A 1FDYA 3W70A 1ZNNA 4M5PA 3MJYA 2R8WA 4WOZA 3AJXA 3GR8A 4WUIA 2QAPA 5LNSA 3LTSA 5AC6A 1IIGA 3QJAA 4UXDA 4O0ZA 3ZWTA 2WQPA 2QCNA 5KZDA 3G0XA 2ZFAA 4HNTA 1VQTA 4Z0JA 2QCLA 2OMAA 3TQKA 3G0UA 1GPWA 3DU0A 4ONVA 2NX3A 5FEWA 3W1AA 4JTKA 1FQ0A 4WY0F 3GDKA 4K7YA 1Q6OA 4IOTA 4CNPA 4LVGA 1F2JA 1S3HA 3NQFA 4ADSA 1D9EA 1LORA 1JRBA 3TJXA 1SU5A 3BARA 3TDFA 4A21A 1W1ZA 3QSTA 4EWND 1RD5A 1X6UA 4GFSA 4Y6GA 4ZL1A 1NF7A 3I7SA 3IIVA 3D0CA 5LSMA 5G1YA 5HR6A 1TPWA 2VFHA 2ZZ4A 3KXQA 3U2OA 1NVMA 5CSRA 3NM1A 1LBFA 4FNRA 3RK8A 3NNTA 4GUFA 2DZPA 2GQ9A 2CZDA 1FCQA 1P0KA 3NXFA 1J5TA 3EX6A 1R46A 4LU0A 1ZAJA 3IV3A 1AW2A 3BV4A 4N02A 3GK0A 3W1XA 1MZHA 3TV8A 5CPMA 1ICQA 1OG0A 4TU1A 1K7FA 3W22A 1LP6A 4Y9AA 1OF6A 5DXXA 1WBJA 3VI2A 3STGA 3E9AA 2A21A 4MLRA 3C2OA 2B7OA 4MYAA 2V30A 2C6QA 4JTTA 3DXIA 4PL1A 4WY0B 3W7MA 5D2WA 4CQ9A 1WAUA 3TIMA 2ZYFA 3NL2A 2ZA2A 1T96A 2C15A 1EIXA 3AO0A 1FDZA 4M6QA 1SZEA 5I3HA 3QPYA 2FB3A 1H7OA 5LNVA 3SGZA 3FS2A 1ZENA 4P61A 2R14A 3FEMA 2DU2A 3CHVA 3F4WA 3NR0A 4OBTA 3C3NA 1GT8A 2GPTA 4MZ8A 5E1QA 2WV8A 3W7LA 1OX4A 4LVAA 3PBVA 2CLLA 4JNMA 3MMTA 1WQ5A 2TPSA 1EA0A 3R12A 1EUAA 1IXNA 1WDWA 3EX4A 3DAQA 3Q37A 2GOUA 1GVOA 4BFAA 3QYQA 4UUIA 1Q6RA 2VC6A 3BGJA 3C2EA 3MHUA 1SZFA 1F7BA 4LW7A 3HF3A 4FB7A 1BEUA 2I14A 1PV8A 2QJHA 3BW2A 3WJWA 4ZQRA 1XBZA 4CCEA 4O13A 3O06A 3NAVA 4LUJA 1GQNA 2ZA3A 4LTSA 1ME9A 2Y6ZA 1LM1A 3O15A 3W84A 1TPC1 2VXNA 4QNWA 3CWOX 3O16A 2ZRVA 3NM3A 5C55A 1C29A 4ZVJA 2OX1A 4RZ4A 5HULA 3QW3A 4LNYA 3LTPA 3U8GA 3ZWSA 1GTHA 2ZZ2A 4OE7A 1H7PA 5E0KA 2WKJA 1MXSA 3GR7A 3UY8A 4BI7A 2NX9A 5AYZA 5LKYA 2C13A 2HS6A 4AVFA 1I2QA 3T4CA 5F4SA 1YDOA 4Y8FA 2DJXA 2Y85A 3TA6A 5F2GA 4UNLA 3W7RA 4NJJA 3QC3A 1KM2A 3TC6A 4MY8A 1JCLA 4FX7A 3TKFA 4IGHA 3M5YA 1JR1A 1TQJA 1WOBA 4UMBA 4BWLA 1TJPA 2RDWA 2PRHA 1IXQA 2C16A 3P61A 1KFKA 3MHFA 1MO0A 1EP2A 3ATZA 2WSRA 1DV7A 3NQ6A 1LBMA 1W5QA 4HSOA 2A7NA 1W3TA 1B57A 2C3ZA 5ABTA 1OFBA 2GQ8A 4UMCA 2CLKA 1UB3A 4NJHA 3LOTA 3S5NA 3L65A 5CZTA 1L6SA 1OX6A 2Y89A 5AB3A 1ZAHA 5LHFA 2ISWA 2PE4A 1X8FA 1G67A 4ALDA 1RQEA 5LGZA 4NVTA 3TH6A 1ZJIA 4LY8A 1W31A 1W8SA 4NJGA 1YYAA 3DZ1A 1H1ZA 5SWUA 4HPJA 3CB8A 3IEBA 1ALDA 1XBXA 3LHUA 3TXVA 3M43A 3W85A 3WK0A 1LDCA 2JKEA 4IUOA 5DCBA 1QOQA 4ORIA 3W7DA 2ATSA 3LBCA 3VKJA 3G1VA 1KTNA 2X1SA 3QH2A 1NAL1 5FEXA 1AW5A 3EKLA 4YWIA 4E38A 3EX1A 2OCZA 1QOPA 4BI5A 2J9XA 1W37A 1GEQA 1L2UA 3M5ZA 1KFCA 5AHFA 3KRZA 3B0PA 3MP4A 5CSSA 3W83A 3TR2A 3NEVA 3SJ3A 3N2XA 3GX9A 4RZ5A 5HUPA 1B3OA 3BG5A 3L9CA 4EVZA 3GDLA 5DELA 3W3OA 4R33A 5DBUA 5L9FA 3NOEA 2YW3A 5F4XA 1H60A 4UTWA 2HSAA 3GVGA 2J6XA 5CPOA 1H7RA 3KFTA 3L66A 1P0NA 3OVRA 3H55A 1TQXA 1MSSA 5FF7A 1TPFA 1Z42A 1RV8A 2ZZ6A 4X9SA 1KFBA 3SSJA 4O17A 3W76A 1TO3A 3NQ2A 3I68A 1JCYA 3HGSA 1L6YA 1GOXA 3B04A 1KTCA 4ZQOA 1CW2A 4UFHA 1LRTA 2GJNA 3TK7A 3O6YX 3LDVA 3NPUA 4XZ9A 1Q45A 3UXAA 1ZFJA 2H6RA 4TR9A 3L2IA 3QSRA 1VYRA 5KZEA 1W0MA 3STFA 2NV1A 4JGDA 1N8FA 1TTJA 2ZRXA 2P10A 2YSWA 2DORA 8TIMA 3N2MA 4JYDA 3KAOA 2A2IA 3ABRA 3V75A 3HBLA 3MHGA 2X1UA 3BVJA 1IGSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3EKG A;  2BV9 A;  3GXT A;  1BYA A;  4US5 A;  3KCO A;  3L4Y A;  2DGA A;  2Q71 A;  3NQE A;  4JX4 A;  3VIG A;  4D2J A;  3F4D A;  3IGX A;  2FZ9 A;  1VHN A;  5K3V A;  3UR8 A;  3DIP A;  4FA3 A;  1TZZ A;  2VHL A;  3EXT A;  1GVY A;  2J4G A;  3T55 A;  4QCF A;  3PB2 A;  1VHC A;  3WD0 A;  3WLN A;  3QKZ A;  2Y62 A;  3RM8 A;  3UXD A;  3OEX A;  4NAE B;  3UND A;  1TCM A;  3CV6 A;  2FIQ A;  2AL2 B;  4IJR A;  1TUX A;  2QR6 A;  5GNY A;  3LZ3 A;  5A8O A;  2CPU A;  3BL3 A;  1CDG A;  1X7I A;  4DWD A;  2R1P A;  5D9M A;  3FXG A;  3EOL A;  4FIQ A;  5FL0 A;  2YCI X;  4GVF A;  4K8H A;  4MTV A;  3CYV A;  5AYX A;  4Q8U A;  2PD9 A;  3NQG A;  1EQP A;  1EX5 A;  3C0J A;  4JFT A;  1EWD A;  3RPM A;  4NZ3 A;  3HQ1 A;  3FKK A;  1J2W A;  2PWH A;  1B9B A;  1ECQ A;  3M5X A;  3LEP A;  3AZT A;  3OBK A;  1JUE A;  3I7R A;  1EOK A;  1M7P A;  4UIO A;  4YN5 A;  3N29 A;  2V8Z A;  2CLE A;  4AXN A;  2C91 A;  2ZDS A;  3BQ5 A;  1H50 A;  1OC5 A;  1RQB A;  2OKO A;  3KVL A;  1TPU A;  1EC8 A;  1B2Y A;  4Z2L A;  2W3Z A;  2IS7 A;  3NFU A;  3CHE A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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