3WD1A

Serratia marcescens chitinase b complexed with syn-triazole inhibitor
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
497
structure length
497
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Chitinase B
publication title Observation of the controlled assembly of preclick components in the in situ click chemistry generation of a chitinase inhibitor
pubmed doi rcsb
source organism Serratia marcescens
total genus 162
structure length 497
sequence length 497
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 3wd1A03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3wd1A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wd1A01
4ACZA 3GXDA 1LL7A 5E0FA 1V3LA 2VO5A 4D6GA 3AMCA 1M53A 2Y24A 4JKMA 2V5CA 2ZX7A 5FL0A 1XCWA 4GO9A 4HU8A 2PWDA 2VRKA 4ACYA 3SUVA 3GNPA 1E4LA 1KWKA 2DSWA 1XH1A 3WD4A 5CLTA 3IANA 1UR0A 5E6ZA 3VIMA 1JD7A 2X0YA 3AS2A 1PEZA 1GJWA 1KB3A 3SCRA 5I77A 1HJQA 1HIZA 4CD7A 4GXPA 3WQ4A 4XB3A 2G4FA 5I23A 1BVNP 3SCWA 4PMXA 1FOBA 3TA9A 2Y5EA 5FCZA 4D1JA 1UD3A 1E40A 3IK2A 1UWRA 2XVPA 1BGAA 1FFRA 1ZS2A 2OSWA 4ATDA 2PBOA 2YBTA 3OGRA 2YL5A 4LYRA 1E5NA 1NP2A 4KRUA 5BXTA 4MDPA 1H1NA 3I3BA 3N11A 5A6MA 4M24A 3PZOA 4PUEA 5HPOA 1GHSA 2ZXAA 3JUGA 1V3KA 3OGSA 1EQCA 5D9PA 2Y8KA 1V6XA 4RL3A 4QLJA 1MFVA 4HU0A 4AZCA 3WSUA 4CD5A 1HP4A 2F8QA 4TVCA 1ZU8A 2WMJA 1L0PA 2E40A 3ZR6A 2JFEX 2WVTA 1QVBA 3TP4A 3CZKA 4W93A 2VNCA 4PTVA 3SCNA 1RH9A 4F8XA 1W9UA 4E8CA 4H8UA 1B3ZA 3VD3A 1UWUA 1C7SA 4JL1A 4AZHA 2BHUA 2QPUA 2EPMX 3WNMA 1JD9A 3AS3A 3W28A 1W91A 1XSKA 1H09A 5D9MA 4CU6A 5BROA 5I78A 4BZYA 3VMPA 4QFUA 4JFTA 2DSZA 5A8NA 4CCCA 2VCCA 5E6YA 4UFMA 4J3UA 4GZJA 3ZJKA 4J3WA 2WMIB 3BAXA 2VI0A 1KR1A 1OIFA 2VZOA 4IM4A 4KGLA 3AJ7A 3K4AA 3WIJA 2PF0A 4P7RA 4W8AA 1E43A 4UQAA 2UY4A 3RM4A 2JIEA 3UR7A 1V03A 1NOWA 1W2PA 4WSKA 1PZ2A 1E0XA 5JIWA 1NH6A 2QV4A 2ZWZA 4D6EA 3AHTA 1CLXA 3N17A 4H8HA 1E6SM 1V0NA 4PMZA 4D6CA 1AIWA 1PJ9A 2BY2A 3ZO9A 4TVUA 1UWQA 2WW5A 2OLHA 2OWXA 1Q4NX 1PAMA 5I3DA 1FP8A 4PSRA 4PTMA 2YL9A 4JFUA 2ZIDA 4H8VA 3T0BA 1VRXA 1PBGA 3ZT6A 4W5UA 2QF8A 1PX8A 4AIEA 4YPJA 1E70M 1V3IA 1ZBWA 1VFMA 1JZ5A 3EMCA 3GXMA 2UY3A 3VU2A 1HKJA 4LYPA 4AMCA 2CKRA 3TTOA 3MS8A 4NI3A 5HDRA 2YDQA 2VURA 4X0VA 2PWGA 4AZ7A 1Q6DA 1UH4A 1TVPA 1H2JA 2J7GA 2XFYA 1E73M 4KWUA 3L4WA 4RE3A 3U7BA 3VUPA 3CZ8A 2MANA 2WMIA 1RP9A 4HOWA 4HZ8A 3EDJA 1ODUA 2WANA 1UD2A 2DSUA 1HJSA 1WZMA 3FY1A 1FH9A 1QNOA 2BHZA 4EAMA 3CMJA 1V6YA 4W5ZA 3M46A 4GQRA 1JI1A 1BLIA 1B9ZA 3GM8A 3MUAA 1CDGA 4UTFA 3II1A 3WUFA 2J7DA 3PHAA 1CENA 2HVMA 3CHDA 2IXUA 4CCDA 1WAWA 4P7NA 1PX4A 3ARZA 3BGAA 1QI2A 4CU8A 2VUYA 1CXEA 3G6LA 4OJYA 3DHUA 2XGIA 1C3FA 3CUGA 3FN9A 4MB3A 4J27A 1D2KA 1VB9A 1PIFA 3KL3A 3QOKA 1BYDA 2ZUMA 4U2YA 4GKLA 2A3EA 1ISVA 2E8ZA 1BAGA 1ZJBA 4DUWA 3PZTA 3L2LA 4W7WA 1F4HA 4XV0A 2BV9A 2GJXB 1NQ6A 4JZ5A 1GVIA 4OOUA 2NSXA 5LA2A 1E4MM 1FA2A 3PN8A 4RE2A 5C70A 1B90A 2VZVA 3NJ3A 3L2MA 2PWHA 2W63A 4QAWA 1UA3A 3AFBA 3ARSA 3SCSA 3VIPA 2G8ZA 2B31A 1NWUA 3MU7A 1BYBA 2CETA 3CTTA 3WQ5A 3B9EA 1LL6A 1CIUA 2BNJA 3WMCA 4U3AA 3K46A 5EBAA 3BSHA 1YQ2A 3VNYA 3WQVA 4ZENA 3U5UA 4TTGA 2DQXA 2J74A 3MMWA 8CGTA 3WQ8A 3WEZA 4CCEA 1JNEA 1XC6A 4DUXA 4XX6A 3WF1A 1EHAA 2JALA 4UOQA 1JGIA 3SUWA 3W27A 1EO5A 1MW0A 1HL8A 4QCFA 3BLPX 1TA3A 5A8PA 2DT2A 2WVVA 3FAWA 1XGZA 5ABHA 1M7XA 4YHGA 1CTNA 3K8LA 1I75A 1UKSA 1GOMA 2DH2A 2EPKX 2YDRA 1CGTA 3VIGA 4J3TA 1L8NA 5A6LA 4OBSA 3IAPA 1WNOA 2D24A 1VENA 4AEEA 3WH8A 3WEOA 1CXKA 1AQMA 1WB0A 2GJXA 5DT7A 1J0KA 1MW2A 1HKKA 4AEFA 1ODZA 2W91A 3EBVA 2VTFA 1Q6CA 1HJWA 4DWSA 2WMFA 1W3KA 1WPCA 1W9DM 4U5KA 3WD0A 1KXQA 3F5JA 1HVXA 4UZSA 2J62A 1VEMA 1C91A 1XH2A 3ZT5A 3FNDA 1V3MA 1H3GA 5DF0A 4GI8A 3ARXA 2TAAA 3AMDA 2WLYA 2BVYA 3A4XA 1OSEA 3ZJ8A 1PZ3A 1GQJA 4UZUA 4HTYA 4F9JA 2XIBA 2E0PA 1Y7VA 1W1TA 1W9XA 3SURA 2CKSA 3WDHA 2XVLA 4KGJA 3BAKA 3BMWA 5FOOA 2W5FA 2O92A 4PMQA 5TD4A 3N12A 1KWGA 2XSAA 2CBUA 4PTXA 4UFHA 2XWDA 3QOMA 4TX6A 4HOXA 1SFSA 4TTUA 4A3YA 1XRVA 1LF1A 4MAZA 4AD1A 2XM1A 2ZXQA 2ZUTA 2EO7A 2WLZA 1IT0A 2FH6A 1JAKA 4MADA 2WCSA 4UOJA 3DYPA 2WKLA 1TCMA 4GIAA 2VX4A 1WDSA 1CNVA 1VBUA 4NRSA 4UOZA 2XUCA 4MJ4A 1E4IA 3RJYA 1UKPA 1Z32X 2XG9A 1IV8A 1B30A 2J77A 3OBAA 1SR0A 2QMJA 2PI6A 3NIYA 2C7FA 4P8XA 1GVYA 3N9KA 3O6AA 4W87A 3ARTA 1GOQA 1EDQA 2XVNA 2G41A 2PBGA 3PZGA 4S3JA 3CLWA 3VINA 3WH9A 1X6NA 5D9OA 1J0IA 2WBKA 1FP9A 2WM0A 4D1IA 4W86A 3VDHA 1QBBA 1J0ZA 3RIKA 2V3EA 2YBUA 3AS0A 1B3YA 1QW8A 2ZX8A 3GH7A 4P7QA 2OSYA 3BCDA 4CVUA 3VD9A 1QI0A 1EOKA 1R7AA 4MJ2A 5IHRA 2CITA 2YL6A 3SCQA 2E9BA 1GQIA 4EK7A 3ZSTA 1CGXA 3AIUA 4U31A 5IXEA 3N15A 1QHPA 1MFUA 1HVQA 2XWEA 2UWFA 1DP0A 2JE8A 4FLQA 3QGVA 4PEEA 4OOZA 3VIJA 4WKAA 2XGBA 3UG3A 4TUFA 1OT2A 5GPRA 1H4PA 4LQ1A 4UFIA 1KXVA 2YJQA 3T2QA 3ARVA 4R5EA 2WHKA 4GI6A 5JBDA 1TG7A 3GDBA 3WEMA 3AHXA 1E0VA 2WPGA 3AI0A 2WMGA 5JBEA 2JF6A 1UR4A 1JI2A 2NT1A 3ALGA 5IHSA 2DPEA 1KQZA 2X1IA 5HBFA 4CD6A 2YIHA 3WDRA 1E6QM 4P7LA 1J9YA 1J18A 4MTVA 3LPPA 3AISA 2A3CA 2EPOA 1CXHA 3NDYA 4ZE5A 4B9YA 5AYBA 1GCYA 2WK2A 2E3ZA 4ATWA 1CEOA 3MUIA 3W0KA 7TAAA 1X6LA 1UQZA 4MPKA 3FW6A 4TXEA 3WDQA 1VFUA 2XFFA 4R27A 5ABFB 4AZ6A 4FLRA 2VOTA 3GH5A 3VIIA 3WDPP 4PSPA 4W84A 2X09A 3VOCA 4PMNA 3PZVA 5A8MA 4WF7A 2J79A 2DT1A 3VGDA 1E55A 1XCXA 1GOIA 3N1AA 2BXZA 3RM9A 2F2HA 1H41A 1J0JA 3PZQA 3HN3A 1CYGA 3GNRA 2WVUA 5GNXA 4LYQA 1AMYA 2EJ1A 2J4GA 1LLOA 2WNWA 1UKOA 1WDRA 2CHOA 1OT1A 5CJ5A 1TR1A 1UKQA 3VIOA 3CUHA 1G01A 4HPGA 2J8GA 1LQ0A 5LA0A 1UD6A 4P7OA 3MO4A 5BRQA 1KBBA 6TAAA 1F4AA 5A6JA 4Z2JA 3BAJA 3WKZA 4PYSA 2XJ7A 5EMYA 3AMGA 1ECEA 5DT5A 4U33A 2FHBA 3AXIA 5F7UA 1JZ3A 1HT6A 1V0LA 2WZHA 3OLEA 3ARWA 2XTKA 2CBJA 4BA0A 2W92A 3F5KA 2V3FA 3EDKA 1E1EA 4HMEA 2VX5A 1X1NA 1JYWA 4C7FA 2WYSA 3SIMA 1VF8A 4OUEA 3F4VA 4BQ2A 5GNYA 1VFOA 3A47A 4RE4A 2QMKA 1V08A 2GK1B 1XYFA 1GOKA 3MSDA 1WZLA 1ISWA 3ZR5A 1O6IA 3DYMA 4H7VA 1BGGA 3B9DA 1UA7A 2J47A 3CHCA 3W81A 3GZAA 4LPCA 2WC4A 4ZFMA 3WMSA 2GJPA 4J3VA 4J7RA 3QHNA 3UG5A 1J0YA 1AQ0A 1D7FA 3W25A 1GNXA 2EQDA 3GTNA 4MB4A 1U30A 2D22A 1CZ1A 3WH6A 3ZIZA 1J11A 2UY2A 3A3HA 3WF2A 1JDDA 4LGXA 2D0GA 4W89A 3ZQ9A 4D72A 1Q6GA 5BCAA 3WL0A 2X2YA 3ARRA 3ZMRA 4QLKA 2V3DA 4UQCA 1H49A 1BQCA 4XZBA 1UD5A 4ML4A 1TFVA 4OKDA 5A2CA 1VJZA 2WHLA 2C8NA 1EOMA 4M8UA 1G1YA 2YA1A 3APGA 2GSJA 1JZ7A 1G9HA 1VAHA 1QNPA 2AOSA 2GK1A 1JDCA 1HXJA 1WO2A 3ZOAA 1QHZA 2V5DA 5BXRA 5I5RA 2CYGA 3AZSA 3M7SA 1ZJAA 1GORA 2ZX9A 1CWYA 1R85A 1C8YA 4P8VA 3AXXA 2NT0A 7A3HA 3VPLA 1UR8A 4UFLA 1ESWA 4JL2A 1XH0A 1BVZA 3L4ZA 1JZ6A 3MMUA 3ZJ6A 3L4XA 3FAXA 3TTQA 4AIOA 3CZGA 2A3AA 4JKKA 3VKKA 2EBNA 4W85A 1NP0A 5GQBA 5A3HA 3HMCA 4LXFA 3AHVA 1OB0A 4QP0A 1E3ZA 2CCRA 2WC7A 3VO0A 2E8YA 2NW0A 1H11A 5BXPA 2VT0A 4PMOA 5LYRA 2XM2A 3B9AA 3VM7A 1Q6EA 1G5AA 4BCEA 1UG6A 1AVAA 2D1ZA 3VM5A 4JCMA 1HKIA 4P8WA 3SUTA 5A69A 4V2XA 1LG2A 4NSBA 1QW9A 4OBRA 4X9YA 2A3BA 4NZCA 3AHYA 1SMDA 3LMYA 4PMVA 4AY1A 1OD8A 4CUCA 1CGVA 3WH5A 1I1WA 3DC0A 4M81A 3WF3A 4V28A 3SUUA 3AZRA 3WNPA 1SMAA 5CGMA 2J25A 1BG9A 1VIWA 2W61A 3POHA 1CGWA 3CO4A 1BF2A 1W3LA 3WNKA 2VQUA 1W9PA 2XHYA 3VILA 1OIMA 3I3DA 4MB1A 3VMOA 2OSXA 4W7UA 1E3XA 2WZEA 3EDDA 1DWFM 2CPUA 3SCUA 3WUEA 5EFFA 4PCTA 1WZAA 4FLSA 1V3HA 4HP5A 1NWTA 2D49A 4MNMA 1K9EA 4AD5A 4CN6A 4BQ3A 2XVGA 5JBFA 3L4TA 4URIA 1HF6A 3MUZ1 3VX0A 5IFPA 1WP6A 3LPFA 4KH2A 3S2CA 4J3XA 2VCBA 2ZWYA 3THDA 4ZEPA 5CZKA 4AZIA 2OWCA 3VVGA 3THCA 1NOUA 4M1RA 2XFRA 1JYVA 2FGZA 2OYMA 1DWHM 4K68A 3VGBA 1OWQA 2WWCA 3PZNA 1GHRA 2AAAA 1OGGA 4X0NA 3SCOA 1R8LA 1WE5A 2BY1A 2YKKA 2O9PA 4UNIA 3WUBA 4EANA 3UERA 1K9FA 1CGYA 2D23A 1JXJA 5BXSA 5JUVA 4GZIA 2J8FA 2ZE0A 1E56A 4PMYA 1WDPA 4AD4A 1MW1A 5A6SA 2ZX6A 4LX4A 3ZJ7A 2QHAA 5AYIA 4AISA 4IPLA 3N18A 1JDAA 4M29A 4U5IA 2ZUNA 2WSKA 1S46A 2XIIA 1CGUA 2XSBA 1BTCA 3W82A 3VDAA 2ZICA 3M6DA 2DEPA 3AZTA 1HKMA 1KQYA 1U2YA 3VD5A 3VGHA 4HA3A 1FH8A 3IJ7A 3ECQA 4U2ZA 3WBAA 3IJ8A 2VVSA 2D3LA 3SCPA 3A4WA 1J12A 3OB8A 5CGTA 3VTRA 2G3JA 4UQEA 4B9ZA 1JG9A 3W38A 4AWEA 1K9TA 4PN2A 3BLKA 1UR1A 1GJUA 4CKQA 2J7CA 1JF6A 2ZOXA 4BQ4A 3AIVA 3L4YA 1U33A 3WNNA 1XYZA 3VDCA 1LWJA 2WXDM 2W62A 1W3HA 2VR5A 4D6FA 3OLIA 4D6IA 2VMFA 1J0HA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3WD1 A;  1RPK A;  2DSK A;  1TZ7 A;  2D0H A;  4AD2 A;  3OLD A;  4QDM A;  2D0F A;  2WCG A;  4B16 A;  5I0D A;  3GH4 A;  3PZU A;  3AOF A;  5C71 A;  4TOQ A;  2WAG A;  3ALF A;  1XV8 A;  1LWH A;  4UCF A;  4OZO A;  1J10 A;  2ZUV A;  3ARU A;  3NSX A;  1DWG M;  1EH9 A;  4Z2H A;  1UZ1 A;  2GDU A;  5HPC A;  1BHG A;  3KE0 A;  4WIW A;  1UYQ A;  3UG4 A;  1M03 A;  4KMQ A;  3O9N A;  3EMQ A;  4HA1 A;  3DHP A;  4DUV A;  2DIJ A;  1XSI A;  1CBG A;  4JAW A;  1KFW A;  3WEN A;  3TTY A;  4F66 A;  1QPK A;  1QI3 A;  4OIF A;  5IDI A;  1BSI A;  2EXO A;  1JYN A;  1HNY A;  4AIU A;  3BMV A;  3RME A;  4F79 A;  1UR9 A;  3CBW A;  1C93 A;  3OIH A;  2OWW A;  1UWT A;  3RCN A;  1TUX A;  2CES A;  1NOF A;  5BYW A;  1EIB A;  5A1A A;  1GQK A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2VNC A;  4F8X A;  3HPX A;  1JCJ A;  4F2T A;  4E6M A;  5EU9 A;  1PHW A;  1U5H A;  1XYB A;  1UWU A;  5HA7 A;  1FQ0 A;  4ZS6 A;  4AZH A;  2BHU A;  4L80 A;  3CV7 A;  4QR6 A;  3UYI A;  2XIM A;  1GPW A;  4XZM X;  3LCF A;  5D9M A;  3VZX A;  5I78 A;  2E5C A;  5BW6 A;  1JUK A;  3IIX A;  3A5V A;  4CNP A;  4QFU A;  1IQ8 A;  1H7W A;  3U2C A;  1J6P A;  3R6I A;  3WLN A;  5A8N A;  2ZC1 A;  3IVT A;  5T26 A;  2HJP A;  3TJX A;  1FCU A;  1YDO A;  4HPJ A;  1QML A;  3B0X A;  2IPF A;  2WMI B;  4HTB A;  3KDN A;  3TSM A;  5IBX C;  4FX6 M;  2CZV A;  3K4A A;  4XZL X;  2PF0 A;  2Z6I A;  2HNE A;  2O4M A;  2WKJ A;  1E43 A;  2DZB A;  4YYC A;  3UU0 A;  1NOW A;  1EKO A;  5EA9 A;  1W2P A;  4KR0 B;  2PUZ A;  4L61 A;  4DJE D;  4WSK A;  1R3R A;  1X1Z A;  1XI3 A;  3G5E A;  2YCL A;  4QJ4 B;  1NH6 A;  3BIC A;  3PPG A;  4D6E A;  1EZW A;  3M6Y A;  5FJI A;  2JBM A;  1E6S M;  1V0N A;  2KX9 A;  3R13 A;  2I5G A;  2EAW A;  4TVU A;  4XIA A;  2WO5 A;  1Q4N X;  1PAM A;  5I3D A;  3GW0 A;  2F2D A;  2YL9 A;  3T0B A;  3ZT6 A;  4FOJ A;  1KM3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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