3WD2A

Serratia marcescens chitinase b complexed with azide inhibitor
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
497
structure length
497
Chain Sequence
STRKAVIGYYFIPTNQINNYTETDTSVVPFPVSNITPAKAKQLTHINFSFLDINSNLECAWDPATNDAKARDVVNRLTALKAHNPSLRIMFSIGGWYYSNDLGVSHANYVNAVKTPAARTKFAQSCVRIMKDYGFDGVDIDWEYPQAAEVDGFIAALQEIRTLLNQQTIADGRQALPYQLTIAGAGGAFFLSRYYSKLAQIVAPLDYINLMTYDLAGPWEKITNHQAALFGDAAGPTFYNALREANLGWSWEELTRAFPSPFSLTVDAAVQQHLMMEGVPSAKIVMGVPFYGRAFKGVSGGNGGQYSSHSTPGEDPYPNADYWLVGCDECVRDKDPRIASYRQLEQMLQGNYGYQRLWNDKTKTPYLYHAQNGLFVTYDDAESFKYKAKYIKQQQLGGVMFWHLGQDNRNGDLLAALDRYFNAADYDDSQLDMGTGLRYTGVGPGNLPIMTAPAYVPGTTYAQGALVSYQGYVWQTKWGYITSAPGSDSAWLKVGRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords Chitinase B
publication title Observation of the controlled assembly of preclick components in the in situ click chemistry generation of a chitinase inhibitor
pubmed doi rcsb
source organism Serratia marcescens
total genus 165
structure length 497
sequence length 497
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-06-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.10.10.20 Mainly Beta Ribbon Seminal Fluid Protein PDC-109 (Domain B) Carbohydrate-binding module superfamily 5/12 3wd2A03
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3wd2A02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wd2A01
1GOIA 3FAXA 4MJ2A 4QP0A 4MB4A 3L4ZA 2WVSA 5EB8A 3WUEA 1KBKA 5CGMA 1E73M 4HPHA 3ARZA 2XUCA 1X6LA 3WNPA 2ZX8A 2ZUNA 1OGSA 4HPGA 3N17A 1ZBKA 2JFEX 1HX0A 1JAEA 4JFVA 2PWDA 4W5UA 4PMYA 3RIKA 2D22A 4JL2A 1B0IA 1BF2A 1W9VA 1BVZA 1W9XA 4MDPA 4MNMA 2DT2A 1W9BM 4KGLA 1DWJM 4D6FA 3CUJA 2V3EA 1IV8A 2BY0A 1W9DM 2EEXA 3AI0A 3VIFA 2D0HA 5A8OA 2EPKX 3NSNA 2GJXB 4KRTA 2XG9A 4CU6A 2BHYA 2DT1A 2G3JA 2XJ7A 2ZICA 1E1EA 1H4PA 1V0MA 4DWSA 5JIWA 4Y7EA 3S6TA 1J0JA 3A6OA 4M56A 3GH4A 4PMDA 4OOUA 4Q22A 1V3JA 1C7TA 3A47A 2D0GA 1CIUA 4EANA 2BFGA 2GK1B 4D6GA 4W7WA 4PTMA 4XUYA 3PZIA 2XWEA 4MNLA 4WKAA 1BHGA 1GQIA 4JFWA 4AZHA 3I3BA 2NT0A 2WKGA 3CBWA 5BROA 4ZE4A 1CXEA 1VFUA 4J3WA 5DT5A 2J7BA 3WDPP 1O6IA 5JBEA 1JIBA 1UR2A 5KZ6A 3VDHA 3AS1A 4U2YA 3ARUA 2WB5A 4CD6A 4E2OA 4PMZA 1E6PA 4UFMA 4GI6A 4PMOA 3J7HA 1PX4A 7CGTA 4J3SA 2ZUWA 1O7AA 3QR3A 2JE8A 2VURA 2J47A 1WDRA 2W4XA 2X1IA 2DH3A 5A2CA 3L2LA 3VIOA 1R86A 3L2MA 2EPNA 3VO0A 3WELA 4CUCA 2IXVA 2V38A 2XVLA 5I79A 5A2BA 2J25A 2JEQA 3N1AA 3QOKA 4IPNB 5DEZA 4U5KA 4W88A 4JHZA 3AISA 5M17A 1EO5A 3AS3A 3EDJA 4J3VA 1BVNP 2V5CA 2YIHA 4HA1A 4OBRA 4YHGA 2VR5A 3N13A 3ZJKA 1VBRA 2ZWZA 1SMDA 3VUPA 1D3CA 3WNLA 3CPUA 1PEZA 1EQPA 1CWYA 3HU7A 1FOBA 1UD2A 5F7UA 1I1XA 2J7HA 4PSRA 3WIJA 3DHPA 3SUVA 3UERA 4TX8A 4GZIA 1QBBA 3UR8A 4UFLA 3MUIA 4CD4A 3GH7A 4XB3A 4XX6A 3SCUA 1JZ3A 1YHTA 2CXGA 2EXOA 3T09A 5E0CA 5CLTA 1SFSA 3OG2A 2V3FA 1CGWA 1BPLB 1TE1A 3DYMA 2XVKA 1ZL1A 4FLSA 4J3UA 4YN5A 3RCNA 1GOKA 4C7GA 1P6WA 1UWSA 3ZR6A 1H11A 2D20A 3NDZA 1SMAA 3QHNA 4JFUA 1B3ZA 2WNWA 2E8ZA 2BHUA 2D23A 2WANA 3VGEA 3AIQA 1HNYA 5HDRA 3D3AA 5A8NA 1KGXA 4PN2A 3UEQA 3DHUA 3VDBA 3WH5A 4AD4A 1WDPA 5AC5A 3RILA 4E4PA 1DWHM 2VZVA 3CUHA 3GYCA 1CYGA 1UG6A 1UKSA 2A3CA 3OGVA 3GDBA 4BCEA 1ZBWA 3MSDA 2ZUTA 1GQLA 3AIRA 4W93A 1KWKA 3AZTA 1W32A 1AVAA 1OD8A 1J9YA 3O9NA 3VD9A 2QMJA 1HKJA 3VIIA 4AD1A 1EO7A 2FDMA 1JD9A 1XRVA 1FH7A 4QLLA 1EOKA 2ZIDA 4TVUA 4TUFA 1WP6A 4MTVA 3T0AA 2WYSA 1M04A 3KE0A 3RM8A 2C0HA 1UD3A 3VD3A 3RM9A 1IZKA 4GKLA 1R7OA 4D71A 4HMDA 1E56A 4JFTA 1E72M 3T0DA 1GZJA 2WMIA 2YA0A 3CUGA 5HXMA 3G6LA 5FKYA 2V3DA 1XH1A 4PMXA 1UZ4A 4J27A 4Z2LA 3AHXA 3VX0A 5I77A 3W6LA 1PX3A 5A6BD 3ZR5A 4ZE5A 3GNPA 3VD4A 1KXQA 4M29A 4AIEA 4QCFA 4GO8A 1JFXA 3VGDA 4GINA 1CLVA 2WLZA 5FIPA 3OBAA 2WVVA 4AMCA 4E8DA 1KFWA 2G3IA 2ZXAA 2O9RA 1E5NA 1PZ3A 3CUFA 1OT2A 3SCNA 3PZGA 2VC9A 2DDXA 2VJXA 1J11A 3FN9A 1TMQA 3LPGA 5BRPA 1JZ4A 3PZUA 4AD0A 1J12A 1FHDA 3NUKA 2ZUUA 1CPUA 2DPEA 4M82A 3SCQA 1EQCA 2FGZA 2VNCA 2J62A 3RO8A 5ABHA 4HMEA 1E4MM 3WFZA 4JHOA 3RJYA 1V6YA 5D8ZA 4V2XA 2XGBA 4N0RA 5DFAA 2A3EA 2WVVB 3FHQA 1QI4A 3CHFA 5ABFB 1FP8A 1J0ZA 3L4VA 3EMZA 2VCBA 3NSMA 5D9PA 3VNYA 3WUFA 5IFPA 4BA0A 1CLXA 4AY1A 4X0NA 1G0CA 3ARVA 4D6CA 4UQEA 4MB1A 2WAGA 2F8QA 1CXHA 1GNXA 2PWFA 3BCFA 3WNNA 4Z2JA 1FH9A 4RL3A 5FL0A 3VPLA 4HU8A 3K4AA 1E6SM 3ZMRA 3ARXA 2DIEA 2OWCA 2J7CA 3GXMA 3WQ8A 4KGJA 3ZSTA 1KXVA 1Q6GA 3CHEA 4F79A 1HP5A 2W92A 3DYOA 4FMVA 1EDTA 3MUZ1 1ITCA 4C7DA 5AYIA 2QMKA 3L4UA 3S2CA 4IUGA 4D6DA 1UD4A 2O9TA 3VIHA 2XVNA 3VDAA 3L4YA 3WKZA 1KQYA 1GONA 2UY3A 3KWXA 3WMSA 3RJXA 2X0YA 3W24A 4CGTA 4DUVA 3SUSA 2YDSA 2NW0A 2BNJA 4OUEA 3AMCA 4A3HA 4B3LA 5HPCA 4P7OA 2GSJA 1J0IA 3CO4A 2WC4A 2XFFA 3JUGA 3BAYA 4PSPA 1CNVA 4PTVA 1D7FA 2WZIA 4E8CA 2F61A 1K9TA 3CMGA 1QI3A 3PTKA 5DO8A 3L4WA 4UQAA 3FW6A 3BAIA 2XTKA 3TP4A 5BXRA 3WH9A 5CG0A 2CESA 3VTRA 4W8BA 3VINA 2VZOA 2CBIA 3OZPA 3QOMA 1WAWA 1CGTA 4MJ4A 3WF2A 1N82A 2ZXDA 4CD5A 3VNZA 5E6ZA 3CZ8A 4AD3A 3KEHA 1DWAM 1HJVA 4HP5A 3TOPA 3WY1A 5A6SA 3NCOA 3B9DA 2AMGA 4DWSD 2FH6A 1XD0A 3CGTA 1JF5A 1NM9A 3IAQA 3LPPA 5I6SA 1OD0A 3HMCA 2BS9A 2Y24A 1R85A 3FY1A 1ITXA 3BCDA 2EBNA 3WQ6A 3WDHA 1JL8A 3WDRA 2YJQA 1CENA 1GQKA 2WZHA 5GQBA 1K6AA 1E3XA 1TUXA 2FHCA 4AZ5A 1ZB5A 2Y8VA 3WF3A 4WJXA 4IPLA 1BAGA 3K4DA 2YLAA 4CU7A 4LX4A 3VKKA 5HPOA 1AIWA 1QNRA 5E0FA 2WMGA 2HVMA 4UR9A 3CTTA 3M46A 1E4IA 3ARYA 3AHVA 2CYGA 1V3MA 2E9MA 3ZT5A 2BXZA 2VL4A 3NJ3A 3AHZA 4M1RA 2YL6A 5I3DA 1M01A 4NI3A 1DTUA 3U5YA 1FP9A 5BXTA 1MW2A 4QDMA 1H0GA 2GVYA 5GNXA 2ZOXA 2GJRA 2VI0A 4UFHA 1HKMA 2YL5A 1XH2A 2EJ1A 2WXDM 4JL1A 3A4XA 3AYSA 3ZOAA 4W5ZA 2GJPA 1VENA 3WD2A 1WZAA 2YLLA 1GJWA 3CZJA 3OB8A 2W5FA 1BYDA 1UD8A 2VQTA 2J7GA 3ZQ9A 1B3XA 2W67A 3UETA 2WZEA 5A6LA 1IZJA 1UH3A 2CHNA 1A47A 2GJXA 3VX1A 1JNEA 4GPNA 4P7QA 2D2OA 1CECA 3ZJ7A 1JYXA 1QOXA 4TTGA 4BQ4A 4EAMA 3MV11 1GW1A 1JNDA 5CSYA 3GNOA 5A6AA 1RD6A 2V5DA 3THDA 2PWGA 3OLEA 4N42A 2FH8A 4URIA 5LA1A 1X6NA 2GK1A 1WE5A 2OSYA 1LG2A 4JFSA 4EKJA 1FFQA 1JYWA 1Q6FA 1TVNA 3BAXA 1FH8A 1H2JA 3AZRA 1LWJA 2XIBA 2OYLA 1Q4NX 1M7XA 1W1VA 4B3KA 1WZKA 3WUGA 3WEOA 3OLIA 5FCZA 5GPRA 1KCLA 2J7FA 4DUXA 1GHSA 3W29A 1EA9C 1DEDA 4RE4A 1W1YA 3WMBA 5FD0A 5BXSA 3AIBA 1RP9A 1RH9A 2Y5EA 2GDUA 3SCSA 2VQUA 4JZ5A 4TVDA 4W7VA 1HP4A 2FHFA 3BSHA 2YA1A 1VF8A 1MFUA 1UWTA 1B31A 1PX8A 2WHMA 1PIGA 4MADA 4PTXA 3FAWA 4TOQA 1VFMA 2G3NA 2VOTA 5A1AA 4UTFA 3WDQA 5DMYA 2JF6A 1KB3A 1G94A 4ZXLA 2HISA 2WWCA 5E70A 3QGVA 1LQ0A 4AEEA 1HKKA 1MQPA 3II1A 1I75A 1DHKA 5FOOA 4U3AA 1TR1A 2ZUVA 4A4AA 4ACZB 1NH6A 1WDSA 2E9BA 1U33A 3O6AA 5EFDA 3APGA 4LXFA 1XHGA 5A8PA 4D6HA 4P8XA 1JAKA 4ZENA 1TVPA 4U2ZA 4PCTA 3OLGA 3AOFA 1W3LA 2VMFA 1C90A 4GO9A 7A3HA 3F5KA 2DIJA 1Z32X 3VIGA 1K9EA 3WQVA 5CJ5A 1DWGM 1C7SA 3GXFA 1UWRA 2EO7A 3AMKA 1U2YA 4ATWA 3CMJA 1W3HA 2VTFA 2WK2A 3WF0A 1UYQA 2CIPA 2VO5A 3PZ9A 4UNIA 1EH9A 2O9PA 1C3FA 1E1FA 5C8BB 1CGUA 1VFFA 4W87A 5LYRA 4W8AA 1E43A 5HOSA 1XGZA 1QI5A 3QHOA 1JZ5A 3SUTA 4U5IA 1QNQA 2A3AA 1OWQA 3TTQA 2WW5A 3W6MA 5A6MA 1LJYA 2JALA 4UQDA 4W85A 3ALFA 3N9KA 2XHYA 3CHDA 3FXYA 3TTYA 4D6IA 2OWWA 1YQ2A 3U5UA 4H2CA 2BVDA 2WLYA 4HA4A 1JG9A 4PCSA 1UR1A 4KRUA 3UR7A 1G1YA 3MUY1 4W7UA 1H49A 1TCMA 1UWUA 5EBAA 3TA9A 4HZ7A 2WCGA 1JI1A 4BF7A 1QNPA 4AC1X 3WMCA 2DSKA 1E6XM 1QI2A 1V0LA 2D0FA 3KL3A 3W53A 3WH8A 3L4XA 3TTOA 2D3LA 1BYAA 3SCVA 1B2YA 1E55A 3WNKA 1GHRA 3AZSA 5D9MA 4B15A 1CGYA 4MNKA 3M6DA 3QHMA 4QFUA 3AFBA 2ZE0A 1WKYA 1MVYA 1VIWA 3VGGA 3T0BA 3VMPA 3K1DA 1W9PA 2G41A 3SIMA 2XM2A 3O2LA 4V27A 1G5AA 2J75A 5M5DA 4CVWA 4OOZA 1E4LA 2IXUA 2VRKA 2WHJA 2O92A 3AJ7A 1DP0A 4AEFA 1UH2A 3MMDA 1VEPA 2MANA 3U57A 1MW1A 3OLDA 2AOSA 1XD1A 3EDDA 4W8LA 2JF7A 4WLCA 2G3MA 3TTSA 3FHAA 2D24A 1TZ7A 1VAHA 1ISVA 3ALGA 4PBGA 1OBAA 1UR8A 4LQ1A 4R5EA 2PF0A 2YA2A 2ZXQA 3PHAA 2Y2WA 1V0KA 2J77A 1MQQA 5CSUA 1BFNA 4WK9A 5ABFA 1KQZA 3WD3A 1CZ1A 1UD6A 2FHBA 4AW7A 2DSUA 1QVBA 1HL8A 4XV0A 3PZNA 3IJ8A 2GDVA 1W91A 3OIHA 2AAAA 4PMRA 4GZJA 1JZ6A 3WD0A 2EPLX 4D1JA 4FLQA 4UQBA 2Q8XA 3BLPX 1NP0A 3GM8A 4TX6A 1C91A 1ODUA 4ACYA 4BS0A 4MNJA 3N15A 4Z2HA 3HN3A 1XV8A 3AQUA 1GOWA 3UESA 3PTQA 3BC9A 1V6XA 4PEEA 1VEOA 2X05A 3AYRA 3ZM8A 5IDIA 3WL1A 2Y8KA 3A4AA 3VVGA 4EE9A 5I24A 1US3A 4MPKA 1UA3A 2ZXBA 4W89A 1VRXA 2VRJA 1E15A 3UG3A 4AIOA 3CHCA 6TAAA 1XCXA 1XC6A 1C8YA 1MFVA 3DECA 2V3GA 1QHPA 1XSKA 4H8UA 4J7RA 2JIEA 3W4RA 1CTNA 1NP2A 1GPFA 5HBFA 2ZUMA 3SCOA 4OKDA 4YPJA 1HXJA 4WSKA 4OJYA 1NWSA 4OBSA 1BTCA 3MO4A 2PC8A 5M3WA 1OGGA 1A3HA 4Z2IA 1EHNA 1LF1A 5M03A 4TXEA 3IJ9A 1W2VA 3VM5A 5CQ1A 2BV9A 3KL0A 1H0IA 1MXDA 4F66A 4CD8A 5I5RA 2WMJA 1BLIA 1ZU8A 4UFIA 5GNYA 1UKQA 1KR0A 2WPGA 1H41A 1E40A 2CKRA 5CGTA 4J3TA 1M03A 2YKKA 2FGLA 3WFLA 2WCAA 3N04A 3ZT7A 2J78A 2WHKA 3AMDA 1PBGA 1K9FA 3RM4A 2BY2A 2QV4A 5LA0A 3MUAA 3DC0A 1SYTA 3CZKA 3PN8A 2CPUA 1B3VA 1QBAA 1E3ZA 1UOKA 1QHZA 4OZOA 3MANA 5E09A 3CH9A 4LYPA 5IHSA 2Z1SA 4PMQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2XSB A;  1VZW A;  3PB2 A;  2CLL A;  4XBS A;  3JYJ A;  1R38 A;  1GCY A;  3K46 A;  3NI6 A;  3C3N A;  4L4L A;  2WMK A;  4I9A A;  3EB4 A;  3DFP A;  1A7X A;  1WCG A;  3I3E A;  2C18 A;  4QG6 A;  4X2P A;  1BTM A;  4DRS A;  1XR2 A;  4H7V A;  1E70 M;  3AML A;  5DRI A;  1NFP A;  4ZFC A;  3SEP A;  1OAD A;  3U4F A;  5A8M A;  2MLZ A;  4EAC A;  4GK8 A;  1FWC C;  4YHE A;  4GH3 A;  4H9Y A;  5LA2 A;  4AXN A;  1GOQ A;  3RN6 A;  3W71 A;  1TE6 A;  3VMO A;  3T2O A;  3MKV A;  1XFC A;  4HSO A;  2QAP A;  4Z2K A;  2JK2 A;  3G6M A;  4LUJ A;  5HNN A;  1JCL A;  4HU0 A;  4GXP A;  2JBM A;  3HJE A;  4J2P A;  3S9Z A;  1QPR A;  3UYI A;  4FP1 A;  5AY7 A;  4Q8T A;  4ZSU A;  3CEU A;  3MA8 A;  3BH4 A;  4HCD A;  1Y5W A;  3P8I A;  2ZQV A;  4UBP C;  4QS5 A;  5DX7 A;  4YS1 A;  3ZJ6 A;  3T07 A;  4H6E A;  1LBL A;  3KTC A;  2W61 A;  1XF0 A;  1W5O A;  1PTA A;  2F21 A;  1PZ1 A;  3U48 A;  4UFJ A;  3GR4 A;  3KRS A;  4NI8 A;  3DFS A;  1GT8 A;  1XLA A;  2PSN A;  4MMW A;  3MV0 1;  4Q7N A;  3IKG A;  4BZY A;  1XIN A;  4IMC A;  1JCH B;  4PFM A;  4GIE A;  4AIB A;  1JJK A;  2HXU A;  3WEN A;  1QJW A;  3KBV A;  3GDL A;  1Q6E A;  1G69 A;  3IV8 A;  4YTQ A;  3AIW A;  4AZC A;  1R30 A;  4AZ7 A;  2C7F A;  2Q3R A;  4C6F A;  2Y4S A;  3GB6 A;  2NZL A;  1YLV A;  4ATL A;  1FWF C;  3ARQ A;  4JYF A;  4WY0 F;  4AXK A;  4MPQ A;  4MIM A;  2PS2 A;  5I07 A;  5CPO A;  4LUT B;  4ROP A;  1EGM A;  3ANU A;  1OIM A;  2JIW A;  2XU2 A;  2WSP A;  1DPM A;  1A5U A;  2F7F A;  1EWE A;  2BOG X;  1BG9 A;  3DZ1 A;  3THC A;  3JVA A;  1UQZ A;  2HXT A;  4KMQ A;  5FJR A;  3SFK A;  3UG4 A;  1XCF A;  4OT7 A;  1I0B A;  3FEQ A;  4XAF A;  1TTP A;  1ZJA A;  3ZVI A;  1LRN A;  4NZF A;  3EWB X;  1NJJ A;  5M2F X;  5CZK A;  3TSM A;  4OIF A;  4JQ3 A;  4XAY A;  4R33 A;  2ICS A;  1IGS A;  1JXK A;  3DXI A;  1CBG A;  2OEK A;  4GXW A;  1UHV A;  2WC7 A;  4DBW A;  4AQL A;  1OCB A;  2G0W A;  3H4W A;  1IWP A;  5D9O A;  3W84 A;  2X7V A;  4IM4 A;  1PV8 A;  4DRK A;  2HZG A;  3GY1 A;  2NSX A;  2VZU A;  3DER A;  4GIA A;  1UR9 A;  3CGN A;  4C6E A;  5HKG A;  2Z1W A;  1EJV C;  1UCW A;  4UTT C;  1V5X A;  2QJG A;  4RKA A;  5I3F A;  3U7V A;  2VKZ G;  3HG3 A;  1EXB A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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