The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
55
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sequence length |
143
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structure length |
143
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Chain Sequence |
HLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Heme-binding protein
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha
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| publication title |
Crowning Proteins: Modulating the Protein Surface Properties using Crown Ethers.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
55
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| structure length |
143
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| sequence length |
143
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| chains with identical sequence |
F
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2013-08-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3UBC A; 3UGZ A; 3GDJ B; 1LH6 A; 1CH4 A; 4N7O B; 2OIF A; 2MGM A; 3MOU A; 1A9W A; 3UHQ A; 3NML A; 1HBA B; 2ZST A; 2QU0 A; 3WR1 B; 1DXV A; 5ILE A; 3WCW A; 1MNO A; 2ZT4 A; 1YHU C; 3PI3 A; 3WCV A; 4YU3 A; 1QI8 A; 1MLJ A; 2QLS A; 4MQH A; 3LB1 A; 1XQ5 A; 3FS4 B; 1UVY A; 1MNI A; 1WLA A; 1MYF A; 2HCO B; 4YU4 A; 1YOG A; 2G14 A; 4F69 A; 1GDI A; 2MGA A; 2DC3 A; 2ZT1 A; 2ZSS A; 1Y4P A; 1A00 B; 1NXF A; 3ZJJ A; 107M A; 1G9V B; 2R80 A; 1J3F A; 3PEL A; 2VYZ A; 2Z8A A; 4N7N A; 1NS9 B; 1ABS A; 5MBA A; 1GCV B; 1YGD A; 3ARK A; 4N7P B; 3K8B B; 1MBD A; 3PI2 A; 1MOA A; 3IXF A; 2GLN A; 1FCS A; 4TWV A; 4MQI B; 5JGG B; 1SDK B; 4DWT A; 2YRS A; 2DHB A; 1V4U B; 1WMU A; 1BAB B; 1ABW A; 3R5I B; 1SI4 B; 1CLS B; 3ZJI A; 2MGI A; 5EOH A; 1Y7D A; 3G4Q A; 1DTI A; 3BJ2 A; 2G11 A; 3UHW A; 3S1J A; 1UFP A; 4MQC B; 3PT7 A; 1UMO A; 3W4U A; 2MYA A; 3BJ1 B; 1JWN A; 1MYM A; 3VRE A; 1S0H B; 2EKT A; 2G3H A; 1RTX A; 3UI0 A; 1SPE A; 1BZZ A; 2BW9 M; 1IRD A; 3QJE B; 2GRZ A; 3GOU B; 1OUT B; 1MNJ A; 1O1N A; 1F5P A; 4O2G A; 3G4R A; 4QAU A; 1S61 A; 4F6J A; 1Y4G B; 1GZX A; 5C6E B; 5HLU A; 2H35 A; 2R1H B; 1HBB A; 1YDZ A; 3S65 B; 3UHN A; 4DC8 A; 2W6V B; 1XZU A; 1BIJ B; 3MJU B; 1YE0 B; 2O58 X; 3SZK B; 3HRW A; 2MGH A; 1IT2 A; 1NAZ A; 3ZH0 A; 2MYE A; 1XCH A; 4ILZ A; 2MB5 A; 2VHB A; 2FAL A; 3M3B A; 1YHE B; 1MBC A; 1S5Y B; 110M A; 1Y4V B; 1C7B B; 1YHU D; 1Y0C A; 1NZ2 A; 4MQK A; 1LA6 B; 1LFZ A; 1MYG A; 4NI0 A; 1Y35 A; 1EMY A; 1U7R A; 1U7S A; 2OHA A; 1HBI A; 3OJ1 A; 3QJB B; 4HRT A; 3ZJN A; 4IRO B; 1Y4F A; 3EU1 B; 1Y45 A; 4HSW A; 3CIU B; 3G4Y A; 3HEO A; 1X46 A; 3GKV A; 2MGB A; 1AJG A; 1VXB A; 1SPG B; 1T1N B; 2GKM A; 1MKO A; 5HAV A; 2AUO A; 3P5Q B; 1CBL A; 3H58 A; 2FRF A; 1G0A B; 4JYQ A; 5CN5 A; 2MGJ A; 3GYS B; 1S6A A; 3E5O A; 3HF4 B; 5E83 A; 4B4Y A; 2EKU A; 3ODQ B; 3WTG B; 2G12 A; 1O1L B; 1XY0 A; 3DHT B; 4F6G A; 1YCA A; 5CN6 A; 1NIH B; 3ZJO A; 5IKS A; 1Y4R A; 1J7S A; 1QPW B; 2QSS A; 3FH9 B; 4BJA A; 4G51 A; 1YHU A; 3LR9 A; 1GCW B; 1V4X B; 1VXC A; 1IT3 A; 3GDJ A; 4N7O A; 3IA3 B; 4MQJ B; 3ZJR A; 2MHB A; 1XZV B; 3KUO A; 1EBT A; 1Y0D B; 3UHH A; 3D4X B; 1HBA A; 2H8D B; 3V2Z A; 2VM0 A; 3MBA A; 3WR1 A; 5JOM A; 1JEB A; 3G52 A; 1CO9 A; 1HV4 B; 1HHO A; 1A0Z A; 2ZLV B; 4UZV A; 3FS4 A; 1D8U A; 1I3E A; 1MBN A; 2HCO A; 112M A; 2V1I A; 5D1V A; 1HGC B; 5JDO E; 1LFV A; 1J40 B; 3MN0 A; 3WCP B; 5AB8 A; 3ASE A; 3WCT B; 5MBN A; 4ROL B; 1CH7 A; 2MBW A; 4NI1 B; 5CN7 A; 3AT5 B; 2CMM A; 1MNK A; 1G9V A; 1CH3 A; 2DXM B; 1Y0W B; 1FN3 B; 5EYS A; 1HBH A; 2LH7 A; 1GBU B; 2BWH A; 1NS9 A; 3EOK B; 1GCV A; 1LH5 A; 3PT8 B; 3GQP B; 3K8B A; 1MWB A; 2HHE B; 1JZM A; 5E29 A; 1R1X B; 1FSL A; 2VYW A; 1VRE A; 3HXN B; 1VRF A; 4MQI A; 5JGG A; 109M A; 2V1E A; 3O7N A; 2EVK A; 1L2K A; 1DXC A; 1YG5 A; 1NZ3 A; 1DTM A; 1V4U A; 1BAB A; 1ASH A; 3WCT C; 3R5I A; 1SI4 A; 3AT6 B; 1CLS A; 2MGE A; 1NS6 B; 4MQC A; 1LFQ B; 1HBS B; 2LH1 A; 4FWY A; 3BJ1 A; 1FSX A; 1Z8U B; 2BKM A; 2MGG A; 1BIN A; 1S0H A; 1ABY A; 3ZJQ A; 1G09 B; 1H1X A; 1Y4B B; 3PIA B; 1ITH A; 1O1I B; 1S5X B; 4HHB A; 1AJ9 B; 3DHR B; 3WFU A; 1DLW A; 3QJE A; 2ZSQ A; 2IN4 A; 1OUT A; 5HBI A; 3UHV A; 1Y22 B; 4M4B B; 2ZSN A; 1Y4G A; 2QMB B; 1MTJ A; 1G08 B; 5C6E A; 2GNV A; 2R1H A; 3S65 A; 2EF2 A; 3BCQ A; 1S69 A; 1BIJ A; 4HBI A; 3MJU A; 1MLH A; 1YOH A; 3SZK A; 1XZ2 B; 1GDK A; 3VAU A; 1Y85 A; 1JW8 A; 1DXT B; 1PBX B; 3ZJH A; 1S5Y A; 2O5L X; 3QM6 A; 1VXA A; 1Y4V A; 5CN4 A; 1JZL A; 1BZR A; 5JDO F; 1C7B A; 4HRR B; 3OZV A; 1MWD A; 3EDA A; 2ZSX A; 1HJT A; 1Y83 B; 1IRC A; 4M4A A; 1J3Z B; 4ESA B; 3MJP B; 1HGA A; 1NZ5 A; 2MYD A; 2NSS A; 4F4O B; 1JP6 A; 3QJB A; 3EU1 A; 1Y46 B; 3CIU A; 1DWT A; 2MGD A; 3UHD A; 1SPG A; 101M A; 5EQM A; 3UBV A; 1MDN A; 2D6C A; 3P5Q A; 1ECO A; 4ROM B; 1G0B B; 1G0A A; 1HBR A; 3GQR B; 5B85 A; 2XKG A; 3LQD B; 1Y7Z A; 4C44 A; 1M9P B; 2BLH A; 3VRG A; 5EUI A; 2W31 A; 3ODQ A; 4WJG A; 3WCU A; 3WTG A; 2G10 A; 2BLI A; 2DN2 B; 1FHJ B; 2WTG A; 3OK5 A; 2VEE A; 2OLP A; 3DHT A; 2WTH A; 5EV5 A; 1LFL A; 2W6X A; 1HAC B; 1XZ7 B; 1CMY B; 1MOC A; 3HHB A; 1JY7 B; 3WCT D; 1NIH A; 1NQP B; 1UVX A; 5ILR A; 3CY5 B; 4FH7 A; 5KDQ B; 2G0R A; 3FH9 A; 1QSI B; 1VXH A; 1FDH A; 4NS2 A; 2PEG B; 1A0U B; 1GCW A; 1HAB B; 1V4X A; 2NRL A; 5CNC A; 1UFJ A; 3RJN B; 1O1J B; 3E4N A; 3MYN A; 2R50 A; 5EE4 C; 4O4Z A; 3QJC B; 1KD2 B; 4MQJ A; 4FC3 A; 1XZV A; 3ORD A; 2HZ1 A; 4H2L B; 4N8T B; 1HDA B; 2MGF A; 3ZHW A; 2H8D A; 1MGN A; 2GL3 A; 1HGB B; 1H97 A; 3D7O B; 1IDR A; 1O1O B; 1J41 B; 1Q1F A; 3UHS A; 5CMV A; 1FAW A; 1HV4 A; 2HZ3 A; 3D1A B; 1NPF A; 4GZG A; 5HU6 B; 3LB3 A; 1LH3 A; 1A9W E; 4PNJ A; 3UHU A; 1J7W B; 3UHY A; 2RI4 A; 3ONZ A; 4O1T A; 1DUK A; 4NK1 A; 2ZS1 B; 1HGC A; 3PI9 B; 1DKE B; 1Y0T B; 1J40 A; 3WCP A; 3WCT A; 4ROL A; 4NI1 A; 1SHR B; 3AT5 A; 2W6Y A; 1YEN B; 1Y0W A; 1FN3 A; 1Y0A B; 1Y8I B; 2GRH A; 2BNL A; 1O1P B; 3ARL A; 3EOK A; 4VHB A; 2ZLX B; 3PT8 A; 3MKB B; 3EDB A; 3GQP A; 2W6W A; 2EB9 A; 1R1X A; 1AJH A; 2R4X A; 1THB A; 1DXD A; 3HXN A; 3B75 B; 2ZS1 C; 1O16 A; 5JDO C; 1MCY A; 1NS6 A; 1LFQ A; 3M3A A; 2W72 B; 5KKK A; 1AZI A; 1MBS A; 3ZJL A; 4MXL A; 2XKH A; 1B86 B; 1MWC A; 1Y4B A; 2ZFO B; 3PIA A; 3HEP A; 5CHR A; 1O1I A; 3ZJS A; 3LB4 A; 3LR7 A; 1AJ9 A; 2QSP B; 3RGK A; 1BZ0 B; 1V07 A; 4NK2 A; 3NG6 B; 1SDL B; 4LPI A; 1YH9 A; 3QJD B; 3OO5 B; 1Y22 A; 4M4B A; 1G08 A; 3RJ6 A; 2NX0 A; 1X3K A; 1Y8W B; 4WCH D; 1Y09 B; 5EE4 D; 1YIE A; 3AG0 A; 2W72 C; 1TES A; 2ZSP A; 2WY4 A; 5CNB A; 1K0Y B; 5M3S A; 1O1K B; 3G4W A; 1XZ2 A; 3MVC A; 2ZWJ A; 3PI1 A; 2ZFO C; 2D60 B; 1PBX A; 2DN1 B; 1XYE B; 1R1Y B; 1COH B; 2R4Y A; 4XS0 B; 4HRR A; 3M39 A; 1Y83 A; 2HHD B; 1MTI A; 4FWZ A; 2ZT0 A; 1CQ2 A; 1J3Z A; 1QSH B; 4ESA A; 3OVU C; 1HCO B; 3MJP A; 3NMM B; 1C7D B; 2G0S A; 2D2M B; 1Y5K B; 5AZQ A; 1MLS A; 4UUR A; 1LHS A; 1HDB B; 2MYC A; 1Y46 A; 2Z6N B; 1M6M A; 3HEN A; 4MBN A; 6HBW B; 1MYH A; 5F0B A; 1XZ4 B; 3BOM A; 1DXU A; 4ROM A; 3HYU A; 2ZS0 B; 1G0B A; 2G0X A; 3LQD A; 3QM9 A; 1M9P A; 1LJW A; 2HBE A; 1CG8 A; 2ZSZ A; 4JAC A; 1FHJ A; 2XYK A; 106M A; 1CG5 B; 2D2M C; 2ZS1 D; 5JDO D; 1HAC A; 1XZ7 A; 2V1G A; 1JY7 A; 102M A; 1GDJ A; 2ZLT B; 1Y5F A; 1Y8K A; 3A0G A; 3HC9 A; 1RQA B; 2MGL A; 2Z6S A; 3CY5 A; 5KDQ A; 2D5X B; 1QSI A; 1MZ0 A; 3AQ6 A; 1C40 B; 2PEG A; 4G1V A; 1A0U A; 1BZP A; 2ZS0 C; 2HBG A; 3ED9 A; 1J7Y B; 2G0V A; 4ODC B; 2ZLW B; 1O1J A; 1KR7 A; 1UC3 A; 1S56 A; 1A01 A; 4U8U B; 3S66 B; 3QJC A; 1KD2 A; 2D5Z B; 4H2L A; 3LB2 A; 3OZU A; 2FRI X; 4FH6 A; 1JPB A; 1YHR B; 4O4T A; 1J41 A; 1CO8 A; 1V75 B; 1YZI B; 1I3D A; 1VHB A; 2AUP A; 1MLQ A; 5HLX A; 3D1A A; 5HU6 A; 1MNH A; 1JDO A; 1DO3 A; 2ZFO D; 4FWX A; 1HLM A; 4L2M A; 1OBM A; 3WHM B; 4TYX A; 1YE2 B; 4U8U C; 2QU0 B; 5SW7 B; 2SPO A; 3PI9 A; 3AQ7 A; 1Y0T A; 3WCW B; 1SHR A; 1GVH A; 1A00 A; 4B3W A; 1YEN A; 1CIK A; 1CH1 A; 1O1P A; 3QM8 A; 1XQ5 B; 2LH5 A; 1MLO A; 2ZLX A; 4L7Y B; 2HBC B; 3BA2 A; 1MTK A; 4IT8 A; 3MKB A; 4YU4 B; 2ZT3 A; 2GDM A; 5HY8 B; 4N7P A; 2V1H A; 1XZ5 B; 5KER B; 1CP0 A; 1YIH B; 1BVD A; 1MBO A; 1YEV B; 2XKI A; 3B75 A; 3UH7 A; 2R80 B; 1SDK A; 5B84 A; 2HBD B; 3G4U A; 3WCW C; 1OR4 A; 1Y5J B; 1BJE A; 2OHB A; 3AQ8 A; 4H0B A; 1LH2 A; 1YGD B; 2FRJ X; 105M A; 1CH9 A; 2W72 A; 2BK9 A; 2D2M D; 1RPS B; 1UX8 A; 4MQG B; 3QMA A; 1A6K A; 2ZFO A; 3VRF B; 1ECA A; 2PGH B; 1F63 A; 2QSP A; 1BZ0 A; 5C6Y A; 2SPN A; 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1RVW B; 3S66 A; 1NPG A; 5CHQ A; 3A5A A; 1OR6 A; 2D5Z A; 1Y4R B; 1J7S B; 4NZI A; 3QZZ A; 1QXE B; 1HLB A; 1KFR A; 1Y0D A; 5CN8 A; 3D4X A; 2D2N B; 1YZI A; 1B0B A; 103M A; 2VRY A; 1MBI A; 2DN3 B; 2MHB B; 1YCB A; 1V4W B; 3UHE A; 1V9Q A; 3UHX A; 3H57 A; 2ZLV A; 3WHM A; 1YE2 A; 4TWU A; 1DO4 A; 3D17 B; 5SW7 A; 1URY A; 4MAX A; 1GLI B; 1JEB B; 2AV3 A; 1DO7 A; 2QFN A; 2O5T X; 4WJG 1; 2D2N C; 1HHO B; 1A0Z B; 2DXM A; 2AA1 B; 1Y7G B; 1QXD B; 1K1K B; 1M6C A; 1GBU A; 2MGC A; 4L7Y A; 2HBC A; 2HBF B; 5HY8 A; 1LFV B; 1UIW B; 4XDI A; 1XZ5 A; 5KER A; 1MBA A; 1YIH A; 2HHE A; 2LH2 A; 1YEV A; 1C7C B; 3IC0 B; 4F6B A; 3VHB A; 3NL7 B; 1UX9 A; 2LHB A; 2HBD A; 1HBH B; 4ZVA A; 1Y5J A; 2GTL B; 3AT6 A; 2VYY A; 1RSE A; 7HBI A; 2RAO B; 3BJ3 B; 1XXT B; 5E29 B; 1RPS A; 4MQG A; 2O5B X; 1Y31 B; 1YMC A; 1HBS A; 1BBB B; 1RQ3 B; 1RTE A; 1LUE A; 2M6Z B; 1YG5 B; 3VRF A; 1G09 A; 2PGH A; 5EET A; 4KMV A; 1S5X A; 3DHR A; 4G1B A; 4X0L A; 1MLG A; 1MLN A; 3LHB A; 5D5R A; 5AZR A; 2B7H B; 3ECZ A; 2GTL C; 2QMB A; 4MXK A; 1FSX B; 3AQ9 A; 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