3WIJA

Crystal structure of a plant class v chitinase mutant from cycas revoluta in complex with (glcnac)3
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
344
structure length
340
Chain Sequence
ALKVGFWPAYSVSEFPPSKINSRLFTHLYYAFAELNAPTFEVRVPPGSEKTAEDFTPTVRRLNPSVKTLISIGGGGSEVRDNFAKLNSDASARQRFVKSSIALARRYGFHGLDLDYQYPEPQLEMENFVKLVSELTAAIREEARTSGKPRLLLTEAVYFHQKLFPWEVVTEYPVQFIAAGLDWVNVMAYDFHGSWENFTGAPAALRDFTASVGIESFLAAGMPPEKLVLGIPLFGRSWLLKNNNEVGIGAPAVGAGPVDGALSFSEIQNFIRGGAREVFDTTTVSAYAYKDNVWVGYDNQQSVALKVQYAKEKRLGGYFFWSVNQDIDAILPKIASDTWG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Chitinase A
publication title Crystal structure of a plant class V chitinase mutant from Cycas revoluta in complex with (GlcNAc)3
rcsb
source organism Cycas revoluta
total genus 121
structure length 340
sequence length 344
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2013-09-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 3wijA02
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wijA01
3SUVA 3EYPA 3L2LA 1JNDA 5A6MA 1OGBA 1XSIA 2Y2WA 1CGTA 2F8QA 3AROA 4UOQA 5AYBA 1BYDA 1GOMA 1C92A 1G1YA 2PI6A 2DDXA 1TR1A 2DQXA 3CGTA 2DIJA 5GNXA 5A6BD 2GFTA 2V3DA 2CXGA 5GPRA 4HU8A 1E72M 1VBUA 3SUTA 4NRSA 2ZXDA 1WDPA 3ZMRA 1V02E 1MQRA 3N9KA 8A3HA 1JI1A 1NP2A 2YA1A 3BAKA 2WMIB 1PJ9A 3GH5A 1BHGA 1OM0A 3BCFA 3PTQA 3ZR5A 3VM7A 2HVMA 1M03A 2D3LA 3SUUA 3RMEA 1Q4NX 3W0KA 1H11A 2JEPA 3L4WA 5DEZA 3AHYA 4D6FA 1CWYA 3ZT6A 4AXNA 1GNXA 2ZIDA 4WKFA 2E40A 1W9XA 4UZSA 1SMDA 3OGVA 4AW7A 2XTKA 3VDCA 3G6MA 1EOKA 4MJ2A 2ZX5A 4PUEA 3T0BA 4RE2A 3K8MA 1LL6A 3VUPA 1V6WA 3CPUA 5CSUA 4XZBA 1J9YA 2DSKA 2PWGA 2J79A 4LPCA 2D20A 1GUVA 4AZIA 1DHKA 4NZCA 1SFSA 4CCCA 4K68A 1OCQA 3HN3A 3UCQA 2VVNA 2B31A 1CXKA 2ZX7A 1V08A 2J47A 2VRKA 1QHPA 2BY3A 1J0YA 4RL3A 5EB8A 1OT1A 2NT0A 3CUJA 3WELA 3CZ8A 2D0GA 2FHCA 4BQ5A 3PZOA 3AJ7A 2FHFA 5ABFB 1XCXA 1W3JA 3A4XA 1J0ZA 4GPNA 1AVAA 2YA0A 4P8WA 3VDHA 2J4GA 2BV9A 3PZ9A 5CZKA 3VD7A 2WW5A 3WDRA 4UOJA 2NW0A 3AHTA 2IXUA 3BMWA 2VQTA 2JF6A 1V0LA 3KL3A 1GOKA 4MNJA 2DSWA 3SCPA 1V3KA 1HN1A 1KGWA 3OBAA 5FKYA 4UQ9A 3PZIA 1EO5A 1HJVA 1E4IA 4NI3A 2JALA 1CEOA 3LPGA 1BG4A 1UKTA 3QGVA 1E6QM 2V5CA 3VMPA 1ISYA 1D7FA 1CGVA 2Y8KA 4FLRA 2WHKA 4YPJA 4W5ZA 1CIUA 1DWGM 2J7FA 2FGLA 2X1IA 2Y5EA 1W91A 1LWJA 1UR2A 1WPCA 2ZUVA 2RGLA 3MKKA 1UWTA 3MUAA 1IT0A 3L4TA 1JZ4A 1KR0A 3AIUA 1Z32X 1OINA 2JIWA 3MO4A 3VMNA 5I78A 3L4VA 3B9EA 1OGSA 1KBBA 2EQDA 1QI2A 3GXFA 3ZSSA 2A3EA 2J78A 1K6AA 5E9AA 2PBOA 1J0IA 2VOTA 1UH2A 1CENA 2VTFA 4Q7NA 2X8RA 4MTVA 1JZ3A 3K4AA 4ATWA 1OWQA 2VJXA 4H2CA 2VZTA 2PC8A 2WMHA 5JIPA 4AISA 5IDIA 1XV8A 5CGTA 1KQYA 2VCAA 1KGUA 1V0MA 1U2YA 3RCNA 1DWJM 1BFNA 1M53A 1Q6CA 4RE3A 5A2BA 3U57A 3GBDA 1LLOA 3EMZA 4AZ7A 1V6UA 1O6IA 4B3KA 1CGXA 3WMSA 1E71M 2WVVB 1CGUA 4F79A 2XJ7A 2WKGA 2VZVA 4W85A 1C8QA 4AZCA 3VINA 2EO7A 3ZO9A 1JXJA 2GJRA 2XVNA 5EFDA 2CETA 2ZUMA 3PHAA 2QF8A 3EDEA 1C90A 4LYPA 4MNLA 1WZMA 1BF2A 1S46A 1JDCA 4QLJA 3LPFA 2OYLA 2BVDA 4CD8A 1E6SM 1QHZA 1VEPA 1E1EA 3KWXA 4TX8A 4HZ8A 3WH6A 3OLEA 2QPSA 3WNLA 1KGXA 2VZUA 4H41A 2ZX9A 3EMCA 1JZ6A 1HP5A 4UR9A 4PMVA 1DP0A 4HA1A 3U5UA 4D6EA 1ISXA 4QCEA 3WUFA 2J8FA 4PMZA 3JUGA 4TTGA 3WMCA 3PTKA 2J7BA 3WDJA 4NSBA 1KCKA 4J3WA 4Z2KA 3BLPX 2XSAA 3ZR6A 1JYWA 3PTMA 3AIBA 1JD7A 4W8BA 4WSKA 4M1RA 1H2JA 1EIBA 1X6NA 3II1A 4AIUA 4TUFA 3RDKA 1EHNA 1UR4A 1LL7A 3BCDA 3VNZA 3IJ8A 5DFAA 5C71A 4JCLA 3RPMA 3QHNA 4ZE5A 1LG1A 1E6PA 1ZBKA 3UR7A 1UR9A 3FXYA 4MPKA 1VF8A 3AMGA 4H8HA 1HJQA 3WH9A 1HJUA 2WK2A 2E3ZA 2ZWZA 4CD5A 1VBRA 1LQ0A 1F4HA 1J18A 1KBKA 1KXQA 4W93A 3W82A 4DM2A 1NWRA 2O9OA 2XSBA 2QHAA 3DYOA 5A2CA 1VAHA 1M7XA 3CIVA 6CGTA 2ZX8A 1ZJBA 2EJ1A 5EMYA 2JE8A 4DWSC 4UQBA 1MWOA 4UQEA 4EK7A 1EGZA 4J3XA 1QI4A 4LQ1A 4J3VA 3VIIA 5E0FA 1E55A 2XM1A 4B3LA 3WQWA 1C8YA 1G5AA 2W4XA 5ABEA 3T2OA 4ACYA 2BVTA 4JFWA 1IZJA 5IHRA 1E56A 3T0AA 5AC5A 1UA7A 3WUGA 3CHDA 1WO2A 2YOCA 3RM8A 2FH6A 3K8LA 3VKKA 4EAMA 3W53A 2GJXA 3UEQA 4E8CA 5CLWA 5HBFA 1E43A 2YIHA 1JZ5A 1E1FA 3FNDA 2XGIA 3I3EA 2VVSA 3ARRA 3THDA 3VM5A 4W89A 3UG3A 4PTVA 3CBWA 4WLCA 3VGBA 5JBDA 1KXVA 1EO7A 2J7GA 1M01A 3AHXA 4PCTA 3HMCA 1VFOA 2YDRA 5LA0A 2Q8XA 3D5HA 1Q6FA 1XHGA 2WVUA 2X0HA 4XX6A 3WMBA 5BXPA 2FGZA 5JH8A 1LL4A 1ZS2A 4QLKA 1B2YA 1R7OA 2ZXBA 2CIPA 2VCCA 1JYXA 5A1AA 3VIGA 3A47A 1VRXA 2DGAA 4UFIA 2CCRA 3MANA 3CZKA 4TVDA 1ISZA 3IJ7A 4UFJA 1MFVA 4ZENA 4AY1A 1MW0A 1UZ4A 2J74A 1XSJA 5FCZA 2WMKA 4OBSA 1UOKA 1GPFA 1XSKA 3AI0A 2DSVA 3RM9A 3CH9A 3IAQA 5E70A 4AIOA 3W28A 4M82A 3GYCA 3RO8A 1MXDA 4CN6A 1YHTA 4KRTA 3N17A 2V3GA 3EDDA 4CVWA 3FW6A 3FHQA 3KZSA 3K4DA 3F5JA 2O9PA 4MNKA 3WEOA 2CESA 4DUVA 1RD6A 1KQZA 2OYKA 4TOQA 4HMEA 3S2CA 5A8PA 4CU8A 3GH7A 3VIJA 1ZU8A 4D1IA 5FL0A 3N11A 4OOZA 5ABHA 4F9JA 1FP9A 3AIRA 1JYNA 5AYIA 3PZMA 3D3AA 2YJQA 1WZKA 2WMFA 5BROA 5CG0A 4TX6A 1X6LA 2GK1A 3GXDA 5A8OA 4DUWA 3MV01 4MNMA 3WKZA 3LMYA 2ZUUA 1ZBWA 3NUKA 4A3HA 2Y24A 1H09A 2FHBA 3WF1A 2YL6A 1EOMA 3AZSA 4D6JA 5BYWA 4IPNB 5FOOA 1PX4A 3SCUA 4KGJA 3WQ5A 2ZXAA 1I1XA 1HJWA 2AMGA 3WDPP 4W87A 3APGA 3WNPA 2GVYA 3MSGA 5A8NA 2IXVA 4GQQA 1ECEA 3ARSA 2E9LA 3GM8A 7CGTA 1J0JA 5I0DA 5IXEA 4GQRA 1M04A 1CDGA 4YHGA 1WAWA 1AQ0A 3WF2A 5CJ5A 1V03A 3VGEA 1V3MA 1BLIA 4IM4A 3AISA 1ZB5A 1B3YA 2VMFA 2A3BA 4UQCA 3SUWA 1VENA 2OYMA 3WD3A 2UY5A 5I24A 3MV11 1GORA 2WZIA 3NIYA 3WBEA 1NOUA 1XC6A 4BS0A 1UWIA 4X0NA 1W1YA 3WFLA 4CU6A 1HL8A 4HA3A 3SCRA 4AWEA 4ZE4A 4EANA 3UG5A 1UH3A 4FF5A 1B1YA 1TVPA 3WH5A 1V6XA 3PBGA 2NT1A 1PIFA 3BAIA 1KR1A 1J0HA 4ACZA 4NF7A 3NDZA 2J77A 3WNKA 5LA1A 1E0XA 2WYSA 1TZ7A 2DH2A 1PX8A 1CZ1A 4PN2A 1K9FA 4PTMA 1W1TA 5BXSA 3AZTA 3AHZA 1TVNA 3SCVA 4OJYA 1QBBA 2QMJA 1JL8A 4JAWA 3M07A 4H8VA 5ECUA 3VGHA 1TCMA 1UG6A 3AFBA 1I1WA 5AY7A 5E09A 1NWUA 1C8XA 4D6IA 2G3JA 4CD7A 1BQCA 2WM0A 1QNSA 1XRVA 3N18A 4J3UA 2Z1SA 3PZUA 1HKIA 3CUIA 1JZ2A 1QW8A 3GH4A 4DWSA 2W67A 2EPMX 4V27A 2OSXA 1G0CA 2BY0A 1AQMA 1GCYA 2OSYA 2ZICA 1KFWA 5A95A 3NSMA 1GOOA 1D2KA 4ZXLA 4J3TA 1B90A 4UQDA 3VX1A 3T09A 3SCNA 4C7FA 2TAAA 2PWDA 4XZWA 1QNRA 3MSDA 3U7VA 5A8QA 2GJXB 3ZJKA 4JKLA 2OLHA 3G6LA 1UWRA 1GOWA 3GXMA 1OSEA 1HL9A 5HDRA 5C70A 5DMYA 2WMJA 2O92A 5EBAA 1EQPA 1BVNP 3E1F1 2CYGA 1SYTA 1GZJA 1HP4A 3QOKA 2V5DA 4AZGA 4IISA 2YL5A 4CD6A 3CHFA 4W7UA 5GNYA 2VI0A 4UOZA 4WF7A 2EXOA 3AOFA 4GO8A 3WNNA 3HJEA 2X2YA 1NQ6A 4JKKA 2WC7A 4D6CA 3WUEA 1WB0A 1CXLA 4J27A 9CGTA 2BHYA 3NSNA 1JF6A 1JZ7A 5I77A 2QPUA 2GUYA 3UG4A 4HU0A 4WSJA 5M3WA 5M17A 3NSXA 3HU7A 4UZUA 2EBNA 4D6DA 2ZUSA 1E6NA 1C91A 5CPTA 5CQ1A 4HP5A 3MMDA 1EDGA 2DH3A 2XIIA 3OLDA 5A6AA 1LJYA 4P8XA 1P6WA 1ITCA 1JDDA 3WQ6A 1GHSA 4J28A 2XYLA 2CERA 4JFTA 5BWFA 2ESCA 1FP8A 2UY2A 1JYVA 4ATLA 1QPKA 1AMYA 2XHYA 1CLVA 4P7LA 1UQYA 2BNJA 1C3FA 4BZYA 5ABGA 4HZ6A 4PMNA 4N42A 1PPIA 1H3GA 1GJWA 3W6MA 3MUY1 4LXFA 2JF7A 3BSHA 4M8UA 2VCBA 3UR8A 3OLGA 3TTSA 2RGMA 3THCA 2GDVA 4PEEA 4L4OA 4P7QA 1E4LA 3SURA 1JDAA 3VVGA 2J7CA 3WNOA 4LGXA 2WHJA 2OSWA 1FHLA 3AMLA 3ZOAA 4V28A 3BAXA 3OIHA 2G3NA 1SMAA 5BRQA 1U33A 8CGTA 3IK2A 4P8VA 3A4WA 3J7HA 4ZEPA 3KE0A 3CMGA 4CD4A 3SCSA 4AMCA 4C7DA 3VDAA 1W9BM 1HX0A 4FLQA 5IFTA 1NH6A 5CLTA 4LX4A 1J0KA 1G94A 1HKMA 3ARWA 1QW9A 2WSPA 3ARPA 1V6VA 1UKQA 2IUZA 1UD8A 1PIGA 1H4PA 4AD2A 4IUGA 4PCSA 4OZOA 4V2XA 1HNYA 3B8SA 2ZUTA 2DT3A 2J7HA 2VT0A 3CZEA 4R27A 1K9TA 3GNPA 2J25A 1E15A 3WY1A 4AZ6A 1TG7A 1YQ2A 5A6KA 1JAKA 4MB5A 4Z2IA 1NOFA 1TMQA 3WDQA 3M7SA 4JZ5A 1PX3A 2VX4A 1R87A 1NOWA 5A3HA 1C7TA 4HPHA 3RJXA 4ATDA 3RJYA 3CUFA 1E40A 3ZT5A 2GDUA 2OWXA 1C93A 4L4PA 2O9TA 6A3HA 3AMKA 1FFRA 4QCFA 1JG9A 4CVUA 2VL4A 1W32A 4E2OA 2CBUA 2CBVA 2VX6A 4AIEA 3VGDA 4CCEA 4ACZB 3VD9A 4WK9A 2PWFA 2XFRA 3S6TA 5D4YA 5I5RA 2WKLA 1PZ3A 2J8GA 1PEZA 4KRUA 5D9OA 3K46A 4WJXA 1VFFA 2BS9A 3TP4A 2D1ZA 3UERA 1GQKA 3CUGA 2VX7A 4PTWA 4ZFMA 2WVSA 3MMWA 2YLLA 3AXXA 1GQLA 2WNWA 1KCLA 2UY3A 2NSXA 1V6YA 4OOUA 1K9DA 4UTFA 4BQ3A 1UKPA 2D0FA 1VJZA 4GXPA 1JAEA 1ZJAA 4R5EA 2XG9A 4H7VA 3WQ4A 3N12A 3L4XA 3A6OA 1HXJA 5JIWA 2XVLA 2QV4A 4F66A 5KEZA 1JF5A 1R8LA 2WHLA 1MW1A 1CTNA 4CKQA 4HZ7A 3BC9A 3GNOA 3SCQA 1UR0A 1GJUA 2XFFA 4AD3A 3EDFA 3AIVA 1HJXA 4J7RA 4W7WA 2W91A 3OZPA 3PN8A 3PZGA 3BH4A 1UD5A 5E6ZA 1HF6A 1BYBA 3ARZA 4U5IA 5D9MA 1W2PA 1Y7VA 3W81A 2XVGA 4NRRA 3F5KA 2YL9A 4X9YA 2EPOA 2WWCA 3VIMA 1UUQA 3NYDA 3WF3A 1MFUA 2G3IA 4AZHA 5GNZA 3WL1A 5BRPA 3TTQA 5ABFA 1WDRA 4M29A 3T2QA 3A3HA 3FHAA 3DHPA 3TA9A 5A69A 2G4FA 1GOQA 4TTUA 3M6DA 3DHUA 4FK9A 1UKSA 4PTXA 1GVYA 4WIWA 2O9RA 2PB1A 3L2MA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3O2L A;  1TFV A;  1ODZ A;  5F7U A;  1WP6 A;  3DC0 A;  2BVY A;  3VNY A;  3AS2 A;  3AYS A;  1E0W A;  2Z1K A;  5M03 A;  1QOX A;  2BHU A;  3VMO A;  1RH9 A;  2WBK A;  4JFV A;  2XWD A;  5CGM A;  3AXI A;  2VZO A;  2YBU A;  4JFS A;  1K9E A;  2BFG A;  1ITX A;  3UET A;  1UHV A;  2VX5 A;  3TOP A;  1WDQ A;  3N1A A;  1H0G A;  1QNO A;  4U3A A;  2ZUN A;  4OBR A;  1W9U A;  1XH2 A;  1N82 A;  2HIS A;  3DYP A;  4MDP A;  2VC9 A;  3BXW A;  4B9Z A;  1UA3 A;  4MB4 A;  2DT1 A;  1TE1 A;  4WKH A;  1CXI A;  2WWD A;  2D23 A;  2XGB A;  4PBG A;  3WUB A;  3W38 A;  5D8W A;  3T0D A;  4AYS A;  2Y8V A;  4UQA A;  1RPK A;  1UD2 A;  3CZJ A;  2JFE X;  1V3L A;  1W1P A;  1XH1 A;  4OKD A;  2ZUW A;  1MVY A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2DZB A;  3SUV A;  4Q6J A;  3L2L A;  1JND A;  3TN6 A;  1FQ0 A;  4O19 A;  4DJE D;  2MUC A;  1BYD A;  1C92 A;  1W1A 1;  5A6B D;  2NUX A;  2GFT A;  2CXG A;  2OVL A;  3BK0 A;  4J5N A;  3ZR4 A;  4Q7B A;  1L6Y A;  2ZXD A;  4ZTX A;  5FJO A;  3IIV A;  2ZZ3 A;  3MDY B;  8A3H A;  1JI1 A;  3E2R A;  5L6U A;  3BAK A;  1GYM A;  1OM0 A;  3BCF A;  3PTQ A;  1W17 A;  3VM7 A;  3V7P A;  4IFO A;  2F7F A;  2XH2 A;  4WUI A;  1FWI C;  3MHG A;  4OU1 A;  2JEP A;  2Z2U A;  1DIK A;  1VGA A;  3AXK A;  4D6F A;  3C2F A;  1CWY A;  2ZID A;  4J4K A;  3PBM A;  3WJY A;  2QVH A;  3TZF A;  1P0B A;  2TOD A;  1SMD A;  3UF9 A;  3OGV A;  1MRA A;  3O0K A;  4DI9 A;  3G6M A;  5CSR A;  3W1U A;  1R5Y A;  4IX0 A;  3PG8 A;  3S1U A;  5EMM A;  4EPB C;  1LL6 A;  3CPU A;  4L56 A;  3TXV A;  5LIX X;  3SO7 A;  4CNP A;  1MRQ A;  3C0J A;  2PWG A;  4LPC A;  5CH9 A;  3BW4 A;  4S23 A;  1DHK A;  4XIM A;  4NZC A;  1SFS A;  4XZH A;  3K4W A;  4K68 A;  3R43 A;  3W2M A;  2RUR A;  5BW6 A;  2J47 A;  2VRK A;  3GDM A;  1I9C B;  1QJW A;  2BY3 A;  4RL3 A;  1J0Y A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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