3WIKA

Crystal structure of the ck2alpha/compound10 complex
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
334
structure length
334
Chain Sequence
SGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha
publication title Identification of protein kinase CK2 inhibitors using solvent dipole ordering virtual screening
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 116
structure length 334
sequence length 334
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2013-09-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3wikA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3wikA02
3KXNA 3LFFA 1YDSE 3FWQA 3CXWA 5K4JA 5C4LA 3C7QA 3QL8A 4FSUA 4LMNA 2FSOX 2XRUA 3V5PA 3UIXA 3Q4ZA 3QGYA 4YSMA 3LOKA 4TN6A 3C4EA 3N4TA 4GIHA 4AW5A 2VWYA 4BCFA 4XLIA 4D2RA 2HWOA 2J2IB 3RPSA 1H07A 4FKWA 4TWCA 4CZYB 4O7ZA 1OL1A 1U59A 3C9WA 3KMWA 3UODA 1FOTA 4NKSA 5HLPA 4A9TA 4BKYA 5HICA 3WIKA 4ZTSA 5IG1A 2XB7A 3EWHA 4U44A 5H9BA 5LQFA 4R77A 3EQCA 3I6UA 3UO5A 3F9NA 4FTKA 4BTMA 3QQHA 4H3BA 1SMHA 3COKA 4I24A 4F4PA 3P7BA 3TZ9A 4HYSA 4BR3A 4QMTA 5DOSA 5CEKA 4UMUA 3PSBA 4WA9A 4XP3A 3WILA 5HZNA 3JS2A 5LMKA 2J90A 3QTQA 5AX9A 4GUEA 1YQJA 2UZBA 3DAEA 1UNLA 1OPJA 2JIVA 5H3QA 4H05A 3BGZA 4CCUA 2V7AA 5AR8A 4ZSGA 4FKQA 4FL2A 2PTKA 2VO7A 3QQUA 4G16A 5D9HA 4BDAA 2C0OA 4AOJA 3PIZA 3F2RA 4ZMEA 3PIYA 4A06A 4EWQA 3MPAA 5IQIA 2QR8A 3EZVA 4ZSAA 4IJ9A 2WPAA 3V5LA 4YZNA 4IB1A 3PP0A 3A8XA 4XEYA 2IO6A 4D2TA 4U81A 4DTKA 1NXKA 3OCSA 4HPTE 4YNOA 2WOTA 3DJ6A 2ETRA 4Y5QA 4APPA 3EB0A 3P7AA 5A4CA 3HDNA 3PVUA 4U3ZA 3NW6A 2CKOA 2ITWA 4O7SA 3NUAA 5D10A 3O7LD 3CKWA 3QF9A 1IG1A 2QHMA 2ZV7A 3QRKA 4IWOA 4EHVA 4EKKA 4CT1A 2ZB0A 1MUOA 2YM4A 2VTJA 4A9SA 2PVFA 2HENA 3LJ0A 3NUYA 4IFGA 2QI8A 3NCGA 2VWBA 2PE0A 3LM0A 5ANEA 3TNHA 4F9CA 2IVVA 5DYJA 2UZWE 3ZLXA 2C6LA 4FKIA 2UW9A 2X2KA 5A54A 5CYIA 4EOKA 4FYOA 2RKUA 4ZZMA 3QC9A 4EZ3A 3F3VA 5AUUA 3V6RA 1JKLA 2VD5A 4NTTA 2X4FA 4M66A 4E4LA 3H30A 5BUEA 5BVDA 1WMKA 4GK2A 4F64A 3A2CA 3FKOA 1PW2A 3FAAA 4DGGA 3VBTA 4JAJA 4AGCA 4CLIA 5D7AA 1PRYA 4TT7A 3FQHA 2W1FA 4XOZA 4IB5A 2BFXA 3FBVA 3DQXA 3MH0A 3QYZA 2P2HA 5JQ5A 4EK5A 2JDTA 5IA5A 3I7BA 3NUNA 4FTOA 3D14A 3AD4A 4MF0A 3OWKA 3TWJA 4CEGA 4TWPA 3UC4A 3HVCA 5FBNC 2OJFE 5AMNA 4AOTA 1B39A 4X2FA 4DEDA 3BYOA 4FG7A 5HGIA 4IJPA 5EW9A 2ETKA 2XKDA 3U8WA 3NS9A 5EI6A 1IA9A 2OIBA 3V51A 1R39A 3NIEA 4GV1A 2R3LA 3D5UA 2ITYA 4FV9A 4IVBA 4PWNA 4IZ5A 1VZOA 3D15A 4KRDA 4RJ4A 5CZHA 3W8QA 4AGWA 4BDCA 4RLLA 3BHUA 4LUEA 2R0UA 1KOAA 3H3CA 5BVKA 2XNBA 5BYYA 2UW6A 4B0GA 4DT9A 2WNTA 4J52A 4FSZA 4D1XA 3GCVA 2F7ZE 3QUEA 3OY1A 2ACXA 4IDTA 5L4QA 3LQ8A 2Y7JA 3VULA 1AD5A 5HVJA 4RWJA 4YJRA 3HLLA 4MYGA 2XNPA 4BCOA 2HAKA 3KN5A 2EXEA 1KV2A 3QX4A 4U3YA 1H8FA 1XKKA 4YBKA 3CLYA 5ANJA 5AX3A 5IF1A 3KKVA 3O71A 4NW6A 3NNVA 2VV9A 1GOLA 1W83A 3KXXA 3UDBA 2EB2A 2H9VA 3NDMA 3A7JA 4NJDA 5DEWA 4PP7A 3CQUA 5B2MA 3BZ3A 4EORA 4RJ6A 2DUVA 2W1EA 2GDOA 5JSMA 5KKRC 1J7UA 2JKOA 4IBMA 5M09A 2GNLA 4V0GB 4BTKA 4O27B 5HTIA 3DPKA 4O6EA 2OIDA 2BMCA 2J0LA 4H58A 2I0EA 3K3JA 1OPLA 2YDIA 2JDSA 1QMZA 4KIPA 1PYXA 4C4IA 2UW3A 4UWCA 3NVKI 3PSCA 3C5UA 5IQAA 3RMFA 4OGRA 3NUUA 3JUHA 2XJ2A 1A9UA 1ZYLA 2XNGA 5E8SA 4N57A 3NYOA 3VNTA 3FI3A 3I6WA 5CI7A 4O7TA 4C02A 2JEDA 3DKOA 3G0EA 4FIIA 1YDRE 3FMJA 3G51A 4MTAA 4BTJA 2OZOA 5FP5A 1FVVA 4BIDA 3QRJA 3F66A 3LPBA 3W10A 4F7SA 2LAVA 2CKEA 5IA4A 3II5A 5D1JA 4KWPA 1JBPE 2OZAB 3KF4A 3PYYA 4HGSA 4KBKA 2X7GA 5EDPA 4ZSLA 5BVWA 4OW8A 5KUPA 3ZTXA 4RPVA 3FI2A 3OT8A 2BKKA 1FPUA 4G1WA 3EFLA 2ITTA 2W9ZB 3BBWA 3EFWA 3QYWA 1GY3A 4EK3A 3W2CA 3QCQA 3HV6A 1KE6A 2X7FA 5DNRA 4XBRA 2QO9A 3C1XA 1OMWA 3VUGA 4O86A 2B9IA 4M13A 2VNWA 3MFSA 4O96A 4OBOA 4B4LA 4GKHA 5GINE 3DB8A 4KIKA 3QA0A 5AAEA 5D12A 4W8EA 4C0TA 3G6HA 5IQBA 2YAKA 4K0YA 5KMJA 4FVRA 4CV9A 2RF9A 1YOLA 3QC4A 4FZAB 1LEWA 2WELA 3R63A 4AN9A 4XLVA 4UYAA 3UNJA 1U54A 4YO6A 2IVTA 4YTCA 1WBTA 1ZWSA 3FSKA 5DGZA 2E9VA 4CMOA 4MQ2A 4A07A 3LQ5A 4W4XA 3NUSA 4HPUE 4IHPA 1J7LA 3QBNA 2GHMA 2JDVA 3KRJA 4LL0A 1XH6A 2Q0NA 3R9NA 3QXOA 3ZSGA 4AW2A 4JL9A 3PDTA 4OBPA 4M15A 2X2MA 2UW7A 2QHNA 5EK7A 4BDEA 2BDFA 4BCPA 5I9XA 3WZEA 4EOOA 3HRFA 1A48A 3UGCA 4NIFA 4MD8E 4A9UA 3VBVA 2WXVA 2WIPA 2R3HA 3SOCA 4QMMA 4H1JA 3ORIA 5HIBA 4I92A 4GFOA 3RNIA 3ZM4A 5JFSA 4XS2A 3AC5A 4Z9LA 5FXRA 5BVOA 4FOCA 3BWFA 2JLDA 4FT0A 4QQ5A 3WF8A 2BIYA 2F9GA 3DA6A 3JY0A 3O2MA 3ZUUA 5AUTA 5CSPA 3Q4TA 5J7BA 4QYYA 5DH3A 3IW5A 5H8BA 4U43A 4JX7A 4YC3A 1DI8A 4MXCA 4F7NA 2UZNA 3WARA 3F3WA 3KRXA 3DZOA 2YITA 3LFQA 5JH6A 5HG5A 3EN4A 4EH9A 4I21A 5AUVA 3UMWA 3I79A 3F3ZA 2RFSA 4PPAA 1X8BA 3RM7A 5DE2A 4YLKA 3EQPA 4F99A 5CEMA 3IOKA 2GHLA 4O0UA 4E8AA 3LE6A 3LFDA 2HW6A 4IAZA 1GNGA 1NY3A 3OP5A 3BV2A 4TTHB 4CTBA 4D5HA 5JGDA 5M53A 2O64A 3FHIA 4HVSA 4BGHA 3GB2A 2XM8A 3Q04A 5CANA 1U4DA 1XBCA 3P0MA 3EN6A 4LM5A 2E2BA 2HW7A 1DM2A 2JITA 3D7TA 3FPMA 5KKRB 3PVWA 2XCKA 2HOGA 2YABA 4LGDA 5HCYA 4GG7A 4FZDB 4IEBA 4WO5A 4YTIA 5ANKA 4AA0A 3BPRA 5C1QB 4K18A 2B0QA 3CGOA 3IDPA 3VS0A 5FGKA 2CN8A 4GG5A 3M2WA 3SX9A 4E6DA 2BRNA 3QLGA 4MD7E 5FEDA 5E9EA 3AD5A 3I4BA 2BFYA 3SXRA 3A7GA 1U5QA 2OF4A 2QOLA 3SXSA 4IVDA 4EHZA 5BUIA 2XA4A 3OT3A 4D0XA 1E1XA 2PVRA 4EOLA 1OGUA 4BIEA 2GQSA 1KE7A 2DQ7X 5ETFA 2BHEA 4E4NA 1IRKA 3E5AA 4BYJA 2B53A 4I6BA 2BILB 1OIYA 3FSFA 2C6OA 2W17A 3PA4A 4JDIA 4CZTA 4YR8A 4K2RA 4ZTRA 5BMSA 1WFCA 3ENMA 4FTNA 3RKBA 3QD4A 4MBIA 2ITOA 4E1ZA 1Q4LA 3W8LA 5DFPA 4ENXA 2PL0A 4ZZOA 3MA6A 4J98A 4NM0A 3UBDA 4HVHA 3E8CA 3WBLA 4QTBA 2JBOA 3OOMA 4X3FB 2WU6A 3LHJA 3QD0A 4FE2A 2VWUA 3BE2A 3FZPA 2C47A 4NM7A 1UWHA 4DITA 3Q5ZA 3L1SA 2FSMX 1J91A 3KFAA 3MH3A 1TVOA 4G6NA 4U80A 3DT1A 4XG8A 3KRRA 5DWRA 3TV6A 1BYGA 3RTPA 4BB4A 2X2LA 1OZ1A 5LMBA 1HCLA 2P4IA 1V0OA 3Q9YA 1CTPE 1JSVA 4CXAA 1YKRA 4J97A 3QTUA 5DR6A 3ZCLA 4JQ7A 1ZY5A 3NVMB 4G31A 2Z2WA 3LXLA 2X39A 1FGIA 4B9DA 3ERKA 3DJ7A 5CVFA 3R9HA 3RK7A 1H00A 3VUKA 3EH9A 4IX5A 4Z16A 1GZNA 3UIBA 3ATSA 4E6AA 1XHAA 2YM8A 5M08A 3S95A 3E3BX 4II5A 1Z5MA 4CKIA 4JR3A 3DZQA 3BV3A 3OCTA 4NWMA 4YZDA 5E8ZA 3GEQA 3Q9XA 4L3PA 4F1OA 1YXXA 1YI4A 1SM2A 2XMYA 4MD9E 4O2ZA 4U9AA 2WTCA 3D0EA 5CAVA 2C1BA 4YZCA 1Q24A 3Q5IA 4BDKA 2HIWA 4FX3A 4ARKA 5BVNA 4O7YA 3W32A 5CF6A 3RVGA 4NM3A 4FODA 3MJ2A 3S4QA 1PXNA 1P4FA 5IZFA 3GU5A 4UXLA 3UO4A 2ESMA 5CU4A 4YLLA 4RIXA 3ZDIA 1DS5A 3CY3A 1JPAA 4HZRA 4IAIA 3AC2A 4KBAA 5A4TA 5DA3A 1T45A 2ZM1A 3RK9A 4ALVA 4FNYA 4AS0A 4BZDA 5LVPA 1Q61A 3R7EA 3KEXA 3MH1A 4GFMA 4L3JA 5AP3A 4NSTA 3UOJA 2C69A 4FV7A 5BPYA 3DTWA 3EZRA 3GU6A 3D83A 4ZY4A 4DE4A 3R73A 5CASA 3LFCA 2JFMA 4EJ7A 2PU8A 3OG7A 3TACA 1YHWA 2BVAA 5JZNA 2XCHA 3KVXA 5AV3A 3POOA 2OI4X 4WNMA 5CF8A 1Q8TA 2XS0A 3OOGA 5HE2A 3R8ZA 3E7OA 3U6JA 1JKSA 4FSYA 5BNJA 4O0RA 1KUTA 2C5XA 4MXZA 2Y8OA 2BRMA 3RP9A 3OMVA 1PXKA 5CS6A 4ANMA 4LQMA 2CMWA 4EOPA 2NO3A 2QG5A 3D5WA 4QP9A 1W84A 3QRIA 4RJ5A 2REIA 3S00A 1RJBA 1YVJA 2VTNA 4JI9A 3UZTA 5CU3A 4EL9A 2EWAA 2PWLA 1ZYSA 1GAGA 5CEPA 2UW5A 3Q6UA 1TQPA 2C6KA 3GU8A 4WG3A 4WUAA 5HVYA 4BCQA 4E5AX 1Q5KA 4F6SA 4Z7GA 3LLAA 3O17A 4K33A 2I7QA 3QHWA 2F7XE 3FC1X 3NCZA 4QP4A 4CTCA 5J1WA 3F2AA 5M56A 4BCKA 5GJFA 4F63A 3HMOA 3E87A 4XRLA 4DGNA 5HX8A 5K5XA 5JRQA 3P7CA 2C5YA 4FMQA 4RWKA 5CLPA 3LZBA 3ZUVA 4DINA 4WD5A 1PHKA 2G1TA 4EONA 5LVOA 2FSLX 1Y57A 3M42A 2R0IA 4OTFA 1IA8A 3FPQA 4XV1A 1ZARA 1R3CA 2YIYA 3SD0A 3QCSA 1F3MC 4R6VA 3R22A 4FNZA 4UEUA 5FBOA 2ONLC 4X3JA 3NRMA 2V55A 1ZYDA 4AGUA 3F82A 1JSTA 1Q41A 3G90X 3MFTA 4ZY5A 3FKNA 1SZMA 4MK0A 4XH6A 4XV3A 5AP5A 3R8VA 4QP8A 3FMNA 1CM8A 4ACDA 3G2FA 2BRHA 4FKTA 3A7FA 4O0YA 2VTSA 3K54A 4FV0A 2FYSA 4B8LA 1BKXA 4U79A 1XQZA 4ZJVA 4O0VA 3BYSA 3VS4A 5IQFA 2VTPA 4HGLA 1CSNA 4O91A 5LJJA 4NK9A 4P4CA 5F1ZA 3O50A 5KBQA 1Q8UA 4Y46A 5FWKK 4YC6A 4R5YA 4PPBA 1PMEA 3QWKA 5E92A 1YW2A 3HAVA 3TV4A 2B7AA 3WF5A 4D4YA 4JS8A 2ITXA 1AQ1A 1Y6BA 2GFCA 3COIA 2QG7A 3POZA 3QZHA 2VGPA 3UZRA 4XHKB 3PXYA 4Y8DA 5IQHA 2Q0BA 1S9JA 5BVEA 3GCSA 5EHYA 3VVHA 1OL2A 3W2PA 5EHOA 5DRDA 5AUXA 3PA3A 3WZJA 4ZJIA 3SW4A 2OFVA 1H08A 2JKMA 5KZ0A 3NLBA 3R04A 3R8UA 3EQDA 1Y6AA 3TV7A 3A61A 3QTIA 2G9XA 3WE4A 4G34A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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