3WJWA

Wild-type orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from m. thermoautotrophicus complexed with 6-methyl-ump
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
215
structure length
215
Chain Sequence
VMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSHPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
publication title Substrate distortion contributes to the catalysis of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase.
pubmed doi rcsb
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 86
structure length 215
sequence length 215
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2013-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3wjwA00
4IXHA 4RCXA 2PE4A 1AL8A 4UC5A 2QKFA 2FPYA 4JY8A 1JCYA 1TSIA 2V0TA 4OQVA 3W7MA 4RZ5A 3W1XA 3U8GA 1XBYA 1QWGA 4ZMGA 1TTIA 5FEPA 1X6UA 4NQ1A 5DXXA 3DFTA 4UFKA 2RH9A 3UXAA 2J6XA 1W56A 1SPQA 4UTWA 3PM6A 1XBVA 4N2YA 5H91A 4UMCA 1OFQA 5DXYA 4N9CA 4XKYA 3B05A 3DFPA 1W3TA 1YDVA 3TMLA 3W83A 2G97A 3A24A 4JY9A 1WAUA 1VYSX 3W7KA 3KVLA 1NFBA 3FOKA 4NZFA 5TBOA 3G24A 3AJXA 4Y6GA 2WV8A 3UWVA 3UY8A 4NT0A 3P67A 2FQIA 2C19A 3SECA 4FX8A 3L67A 4DF2A 1AL7A 1L2UA 3NNTA 3A21A 2ZA1A 3S6DA 5IBXC 1GYLA 3ZFHA 1GTEA 3NOEA 3DENA 3ZS4A 3EB2A 2TMDA 3NXFA 3F03K 3HIJA 4K38A 3N2XA 3QPZA 1F2JA 3USBA 1SO5A 1QCWA 4HPJA 3NDOA 5FF2A 1EX5A 3O63A 3C2EA 3LCFA 3CIWA 3LLFA 1JRBA 3TA6A 3EX1A 4O16A 3W7IA 3GR8A 1JCNA 1N8FA 5CKSA 1ZY9A 3PB2A 2A21A 3UD6A 2FIQA 3IGXA 3FIGA 4B5NA 4IGHA 3IIZA 3T7VA 1LRNA 3H53A 4IPIA 1G4SA 1SZNA 1XI3A 2QDGA 4GUHA 1ZENA 1OYAA 4AEOA 3BPWA 1G7VA 2ZZ7A 3F4NA 4ONVA 3BK0A 2HSAA 2VFFA 5KITA 3NR0A 1DJNA 1UB3A 3MBFA 5ABTA 1QO5A 2NXIA 1FDJA 1H50A 3NQFA 1P1XA 5LNSA 4Y8FA 5C2XA 2E1DA 3IIOA 2HS8A 2XFWA 1Q6RA 2IQTA 3O1NA 2BWGA 3OEXA 2VKZG 1OF8A 4LRTA 1EUAA 1S3HA 3TX9A 4NJKA 1F5ZA 1ZALA 2Y63A 3HG3A 2E77A 4R33A 3B0UX 1IXOA 2CLMA 3OA3A 4EF9A 5D30A 5BW6A 3TC7A 4YCPA 2CZDA 3HJZA 3E0IA 1LOLA 1I8JA 1OFDA 4JTIA 3CIXA 4O15A 2GVLA 5F1VA 1TREA 2Y7GA 3IGUA 3U6WA 1WBHA 1OHLA 4QNWA 3N19B 1MO0A 3ANYA 3NPUA 4O53A 2VFHA 3DFQA 1TPB1 3LDVA 2W6RA 2WJZA 3VNDA 4UTUA 5I3IA 3GXTA 3LXBA 4LTSA 4MFDA 2CLHA 2X16A 3T78A 1JCLA 1G67A 5C54A 3NL6A 5CZSA 3PVFA 3C56A 3W7OA 4DQWA 5F2MA 4FNQA 1QNVA 3TE9A 4CCCA 5D2XA 5LNWA 3N2MA 1G4EA 1PCWA 3L5AA 1EEPA 3GAKA 4IXXA 1TV8A 3BLEA 1MZHA 4MYXA 1A5CA 5AB3A 2XN0A 2A85A 4DPQA 4MZ1A 2O7SA 1H5YA 3W7NA 1KFLA 5D37A 3BG3A 1KM2A 3QQ1A 4O12A 3M44A 1H7OA 3CM4A 3IVUA 4CNOA 4JICA 3M0ZA 1KLZA 4GJ1A 3WK3A 3O05A 4NJJA 1I45A 3Q58A 4OGZA 4LOCA 4JYFA 4FIQA 4AF0A 3P8JA 3LM7A 1KV5A 3SW6A 1AK5A 4POCA 3M47A 3MJYA 4UFIA 1OABA 4X2RA 2YX0A 1VLWA 2H8XA 3EXTA 3CEUA 2QUUA 4TR9A 3ABSA 1GVSA 3SY5A 4O57A 4MYAA 1B57A 3NQ7A 4N9DA 1R2TA 1GPWA 2Y7FA 4HT3A 4DPPA 3W1NA 3GAYA 5K9XA 1W0MA 4LRSA 1ZJIA 2NWRA 3TNOA 5AFDA 1M7OA 4ADTA 4JEQA 3UWYA 1OFOA 2EKCA 3BARA 2EHHA 2CLLA 4FNTA 4QISA 3LCWA 4G1KA 4CNNA 3DFSA 4BK9A 1KFBA 3NM1A 2AAMA 1YTDA 5L6UA 4AB4A 1BTMA 1Q3NA 3KRZA 5E0KA 3NPVA 1H7XA 2TYSA 5F4SA 3O16A 5AHMA 4OV4A 1XFBA 4LVBA 1TPVA 4LVFA 2Y7DA 3M5XA 4FXRA 2GJNA 4TIMA 2OT1A 2PC4A 1F6PA 1BWKA 2JBMA 3R8RA 1PVNA 5K9DA 5FF0A 5C6MA 3W85A 1ZNNA 2ZRZA 4EF8A 1B4KA 3OVQA 1C29A 1G69A 2Y62A 3L2IA 3VKJA 3IRDA 4AWTA 1FWTA 3W86A 3LRLA 3QMSA 1RVGA 3FEMA 1N7KA 2ZRXA 2HMCA 5CG7A 1WA3A 2GUUA 1D3HA 3S42A 6TIMA 3T44A 1OFBA 4WY0A 3L0GA 2ISWA 2XN2A 4R34A 3PR2A 3I65A 3N9RA 4OWGA 1RR2A 3QFEA 2YGYA 1ICSA 1W5NA 4UFJA 4U4MA 1LBFA 4KFOA 2YDAA 4A21A 1TYGA 2ZZ6A 3G0SA 1SZFA 1THFD 2FPVA 2X30A 3HOJA 4UTLA 4XBSA 3PC0A 1A50A 4Q32A 2NX3A 1T0OA 3GDLA 4K37A 4XZ9A 3G8EA 3KHJA 2YPIA 2ZTKA 4IPJA 2NX1A 2QUVA 2UV8G 5AHNA 3W9ZA 3H54A 3NQDA 3EWYA 4OU1A 1LLZA 5U4NA 5H2ZA 3QSRA 2ZZ4A 5LHFA 4Y9AA 3GDRA 4QITA 4A2RA 1KM5A 1H60A 2WNQA 2DJXA 2E6DA 3FS2A 3S5ZA 1SW3A 3C2RA 3BW3A 4XUGA 1F6KA 1ML1A 4JTTA 4E2BA 2G96A 1GVQA 1XDMA 3MP5A 4ZQPA 5AHEA 3S1XA 1L6WA 3QC3A 3R5EA 2KZHA 1JRCA 3BG9A 5AC8A 1F73A 2QAPA 3QH2A 3RMJA 1XL9A 4MZYA 4FB7A 2VC6A 1YTKA 3TQ0A 5IM51 3CWOX 4H4IA 4O19A 3M16A 5K4XA 3MBDA 1ADOA 2VFEA 1OYBA 1X1ZA 4IMGA 5LNUA 4XWUA 1MEWA 3C3NA 1SU5A 4C1LA 3V75A 1J4EA 4WD0A 4QNEA 3W07A 3O6CA 3W76A 3HQ1A 3NQGA 2AQWA 1TCDA 2FTPA 2Y70A 1JQVA 4I7VA 1H7WA 1FDYA 3PBUA 3LV5A 3SGUA 4DO6A 3QF0A 5FEWA 3M5ZA 1NEYA 5FF4A 1KM0A 2A1YA 4WUIA 2VOMA 3EXRA 3NO5A 3SFKA 1RQHA 1I2NA 3A5FA 1D3GA 1DL3A 4JS3A 1OG0A 3KVMA 2E6FA 4M19A 4O0ZA 3SR7A 2J27A 4JTHA 2NLIA 1G4TA 3BGJA 1JQXA 3HGRA 3TSBA 2A7RA 5AOUA 2QCGA 2FJKA 3LCGA 3LLDA 3TW7A 1PV8A 5G4EA 3G3DA 1UCWA 1EP1A 4K8EA 5EKYA 1GEQA 1W1ZA 1JR1A 3EKLA 4H6KA 1AW1A 4W9TA 2NUYA 4GBUA 4X9SA 5KZEA 3E02A 1KFJA 3QSTA 1WOAA 2Q8ZA 2ZRYA 3G1YA 1JUBA 3FFSA 2VEPA 5LHEA 3TK7A 2J88A 3DU0A 2VFIA 4R7JA 1SO3A 1PHWA 1TPEA 4N4QA 3M1ZA 4JDBA 4HSNA 4RXFA 4Y90A 3EWZA 3B4UA 3S9YA 4LV4A 4AHQA 3ABQA 3M5VA 3DHFA 1D9EA 3TR2A 1C8VA 2TRSA 4HIBA 1FUYA 2ALDA 3DKLA 1GQNA 2CLIA 1GYNA 4LS1A 3CU2A 1XXXA 3F4WA 2BSLA 4RR4A 3DKJA 3CQ0A 4XBKA 1H1ZA 3G8RA 3W1RA 3LHVA 3NM3A 4AXKA 4LNYA 1H1YA 2GQ9A 4CCEA 3W7PA 3E12A 1Z41A 4LW7A 2X1UA 3IIVA 2QCEA 4RZ6A 1OX6A 3NQ8A 4K8HA 4LS2A 2D73A 1TPUA 3P60A 1FXPA 4MY9A 1TIMA 1TPC1 1EP3A 1Q6OA 3NYZA 4TU1A 2X1SA 3TW6A 3M41A 4ORIA 4PTNA 4YWIA 2X2GA 1TB3A 2I9EA 3S1WA 3QEZA 1H7NA 1P0NA 1VPXA 3DH7A 4LUJA 3KFTA 2V2DA 3W74A 1HO4A 1R30A 5AYYA 4N9EA 1CW2A 1QO2A 2F7FA 2WNNA 1TPH1 4L4LA 3GLCA 1OYCA 2ZTJA 1ALDA 3LBCA 3P5ZA 4WX2A 4M7TA 3TU9A 4WOZA 1O94A 1TTPA 1LROA 5FI8A 5D2YA 4JXCA 3W7JA 2E68A 1Z42A 1QPOA 3TFXA 3UPBA 2YR1A 1BKSA 3W70A 5K3VA 3PBWA 3TXVA 1LDCA 1L6YA 1R2RA 3UWUA 1W5PA 5HQEA 2QJIA 4XTIA 3THQA 1XBXA 4O4WA 4IMEA 3W7QA 3CB8A 4JX4A 1ZAIA 3LTSA 3ZWSA 4WOQA 3BW2A 3TQVA 1U5JA 4QSHA 4PEKA 1SZEA 2Y61A 3N14A 4O28A 4HKPA 2B7OA 1FCVA 2NXGA 1H51A 2XN1A 1K8XA 1W37A 5G4WA 5A8GA 1Q6LA 3QW3A 3STFA 1HL2A 3A23A 3T40A 5D02A 3NL2A 4IX0A 1IIGA 1K7XA 2CLEA 2ZZ3A 4FF7A 1KM6A 1RQEA 4NVTA 3FJ6A 2B7QA 3NGJA 5I3GA 2DORA 1F76A 4WY0F 3W2MA 3GNDA 4UFLA 5DCBA 3VE7A 2CZ5A 3UNDA 2WO5A 5LNRA 4UTTC 4WXYA 4LC8A 4LVGA 3KXQA 1IF2A 5HR6A 5FEXA 3INPA 3UZ5A 1G6CA 3CEPA 2FB3A 3RK8A 4KWVA 2ZZ2A 2CZFA 2RHGA 2WKJA 3L68A 2VFDA 4N9BA 3SI9A 1SO4A 1H62A 3LOTA 3E9AA 3FYOA 4CQ9A 1C9DA 1SSGA 3RFAA 1OX5A 1OVDA 3B03A 5IBXA 4JGDA 4TMBA 1PL9A 5HWJA 5BOOA 2PRHA 1KBJA 2DZXA 3L21A 2QCDB 3DGRA 1XC4A 3QJAA 4ZQNA 4M6PA 1KTBA 3RU6A 3RLVA 5AHIA 1FDZA 1TRDA 4TX9A 2ZRWA 2C0AA 1XCFA 2WPBA 4O8RA 1VCGA 1JCXA 4NXKA 1ME9A 2OX1A 2V5BA 3JRKA 1OK6A 1BEUA 3MYPA 3OVRA 1QR7A 3P7YA 4ADUA 1OFRA 2ZRVA 5D03A 3C52A 3N9SA 3OVPA 2H3DA 3W2UA 1EPXA 3HG2A 2A6NA 3TQKA 2FLIA 1TQXA 2ZYFA 4BI7A 1KFCA 1MEHA 1EP2A 3QM3A 2W0UA 3QZEA 5I3JA 1FWSA 3GDMA 2DZVA 4LS0A 1K8YA 2YSWA 3W7DA 3K30A 4JN6A 5CZTA 4O1BA 3TJXA 1TTJA 3CT7A 3MW7A 1F7BA 4FNSA 4XTDA 3BVJA 4O13A 5BMWA 2GQ8A 3KAOA 4ICNA 2G5WA 3LRMA 5HR7A 1VH7A 4IMCA 3UWWA 1TO3A 4PFMA 1KW1A 4NZJA 1VGAA 3MHUA 2PRLA 5D09A 2QDHA 1Y0EA 3T4CA 1A5BA 5EY5A 2CWNA 2NV1A 1IIHA 1J5TA 2RDWA 3PB0A 5LSMA 5DN1A 3EWBX 4MY1A 4M6QA 1DBTA 1F05A 1YPFA 1KM3A 1NSJA 2VENA 3LX9A 3L5LA 4AMAA 1V7YA 3N34A 2HS6A 2QUTA 4FNRA 1VC4A 3B06A 1QMLA 4MLRA 5DCEA 3IGSA 3S5NA 2CLOA 4ZZ9A 3L0NA 4LWWA 3UWZA 3W75A 1AW5A 4RKAA 3W71A 1I2RA 1EB3A 3TXZA 5D2VA 1GVFA 3GVGA 1PS9A 2CFFA 3WJSA 5U7SA 3G22A 2WOQA 4NJIA 3SZ8A 2E6AA 5AC7A 3GK0A 2ZZ5A 5CZ0A 1KLYA 2V9DA 3HMJG 3ABOA 4I9AA 4RJEA 4Z1CA 5LGZA 5FEZA 2C15A 3G0UA 4GUGA 1S5VA 1R46A 1X7FA 5KSWA 3LERA 3KX6A 2NZLA 1DKWA 3EX6A 3DBPA 3PAJA 3NVTA 1QFEA 4JTLA 4JTSA 5E1QA 4WJEA 1QDSA 1HTIA 3G18A 3MO7A 1OX4B 5EMUA 3NEVA 2NUWA 5FF7A 3PUDA 4P61A 4IJBA 5K7JA 3LHWA 5EA9A 1NAL1 2ISSA 5DY2A 4JDYA 4M7SA 1K7EA 4YL2A 4JIQA 4JTUA 4WZHA 1I2PA 1I2OA 1HG3A 2LLEA 4XQ6A 2ZZ1A 3I7QA 3EEGA 1KM1A 2H90A 1QPNA 3NQ2A 4GWEA 4ADSA 5F2LA 3Q2DA 4MFEA 5LKYA 4OV9A 1NVMA 5HWNA 5EYWA 1CX9A 5HUPA 2NV2A 2NXHA 5HINA 1IXQA 3MYOA 1YXDA 3MI3A 4JTGA 1RPXA 5CPOA 4DEFA 4Z1DA 3IIPA 4AH7A 3NQMA 2TSYA 1XUUA 4UTMA 3P8IA 3P82A 2B4GA 1LRQA 4AHOA 3D0CA 3MUXA 1GT8A 1YPIA 3PSVA 1PHQA 5E93A 5D38A 3TMQA 3WJYA 4Z1AA 5KINA 3OHIA 4BR1A 1KFEA 1VS1A 2QCMA 2NX9A 3NQ6A 7TIMA 1SR9A 2DZSA 4M6VA 4O18A 4I7UA 4A2SA 3EKZA 3CC1A 1K7FA 3LRKA 5CZJA 5D33A 3UPWA 3G1XA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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