3WMBA

Crystal structure of insect beta-n-acetyl-d-hexosaminidase ofhex1 complexed with naphthalimide derivative q1
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
572
structure length
572
Chain Sequence
EDVVWRWSCDNGKCVKLKNDPRSSEPALSLEACKMFCNEYGLLWPRPTGEADLGNFLSKINLNSIEVKILKKGATDDLMEAAAKRFKEQVSLAIPRGSTPKLTGKAVDVYLVNENPNEKAFSLEMDESYGLRVSPSGADRVNATITANSFFGMRHGLETLSQLFVFDDIRDHLLMVRDVNISDKPVYPYRGILLDTARNYYSIESIKRTIEAMAAVKLNTLHWHITDSQSFPFVTTKRPNLYKFGALSPQKVYTKAAIREVVRFGLERGVRVLPEFDAPAHVGEGWQDTDLTVCFKAEPWKSYCVEPPCGQLNPTKDELYQYLEDIYSDMAEVFDTTDIFHMGGDEVSEACWNSSDSIQNFMMQNRWDLDKESFLKLWNYFQQKAQDKAYKAFGKKLPLILWTSTLTNYKHIDDYLNKDDYIIQVWTTGVDPQIKGLLEKGYRLIMSNYDALYFDCGYGAWVGAGNNWCSPYIGWQKVYDNSPAVIALEHRDQVLGGEAALWSEQSDTSTLDGRLWPRAAALAERLWAEPATSWQDAEYRMLHIRERFVRMGIQAESLQPEWCYQNEGYCYS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Beta-hexosaminidase
publication title A crystal structure-guided rational design switching non-carbohydrate inhibitors' specificity between two beta-GlcNAcase homologs
pubmed doi rcsb
source organism Ostrinia furnacalis
total genus 190
structure length 572
sequence length 572
ec nomenclature ec 3.2.1.52: Beta-N-acetylhexosaminidase.
pdb deposition date 2013-11-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00728 Glyco_hydro_20 Glycosyl hydrolase family 20, catalytic domain
A PF14845 Glycohydro_20b2 beta-acetyl hexosaminidase like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wmbA02
3.30.379.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Chitobiase; domain 2 Chitobiase/beta-hexosaminidase domain 2-like 3wmbA01
2DSUA 3VIHA 1WAWA 1WPCA 1LG2A 2YA0A 1N82A 1ITCA 1KWKA 4CKQA 2BY0A 2CPUA 1UH4A 1LWJA 2BFGA 1JYVA 4Z2JA 3MUZ1 2J8GA 2XGBA 2XVGA 1ODUA 4TX6A 2PI6A 2RGMA 3F5JA 3WQVA 4F9DA 2EJ1A 1E1FA 3GH5A 2UY4A 3POHA 5A6JA 3WSUA 3T08A 1UR9A 3TTSA 5BCAA 4CN6A 4AEFA 4TUFA 1DHKA 3AIQA 1V6YA 4PN2A 3MSDA 1BSIA 2WANA 4OIFA 4ACZB 4HMDA 1JYXA 1GNXA 1V02A 3MKKA 3SUWA 1GHRA 5EFDA 5BWFA 2WHJA 5JIPA 2J4GA 1C8QA 4M56A 1X1NA 4U33A 1J12A 3QOMA 4FK9A 4PMDA 1SMDA 1MW3A 1GQLA 3W38A 1I1WA 2J79A 3AYSA 3PZVA 7A3HA 5IFPA 1LF1A 5HOSA 2YL8A 3WF0A 3FNDA 3ARSA 5I3DA 1US2A 2MANA 2O92A 4AZIA 2JIEA 2ZX9A 2WSKA 4EANA 1KXHA 2WMGA 1UD3A 4UZSA 5FL0A 1K9TA 1Z32X 1QI0A 3ZQ9A 4U2YA 3B9DA 1C7TA 3B9EA 2VZTA 4CVWA 4AD5A 2G8ZA 5BROA 2GK1A 3AIRA 3MSGA 2YL9A 4TVCA 3W53A 1G5AA 2XWEA 1EIBA 3CUGA 1R87A 4QAWA 2VJXA 5CSYA 1ODZA 3AHVA 2HISA 4A3HA 4PUDA 3KWXA 3SEPA 4P7NA 4FMVA 1MXDA 1JZ4A 1BGGA 3KEHA 1PIFA 4DWSA 2JF6A 1E73M 4PTWA 4GQQA 2ZUMA 3CHEA 4GZIA 2OWWA 3BCFA 2WSPA 3GXMA 2JF7A 1XH1A 1MQQA 1B3YA 1PX4A 1S46A 2BHYA 1J0JA 1NQ6A 4OZOA 2V5CA 1B3WA 2E4TA 2BV9A 3GTNA 4DUXA 4D1IA 3AS1A 1BLIA 5CPQA 2UY3A 1KGWA 1OT1A 1PX3A 1BYBA 1VBRA 1VF8A 1R86A 4N0RA 2GDUA 3JUGA 3SCRA 1JFXA 2A3AA 3BXWA 3SCTA 4OUEA 1W2PA 1GOQA 1DWIM 1WDSA 1D2KA 2Y24A 4RE3A 4JFTA 3NCOA 3THCA 1E6QM 7TAAA 1BFNA 3CZGA 1J0KA 5AC5A 1U2YA 2PWHA 2E40A 4C91A 1ZL1A 2G3NA 2FH6A 3AHZA 3ZO9A 2YL6A 1XV8A 4B15A 2IUZA 2GSJA 3IAQA 4BQ5A 1JG9A 4M24A 3OIHA 4IUGA 4W8LA 1CXKA 1E15A 1UD2A 3BAYA 1WB0A 1SYTA 2OWXA 2XVKA 3N04A 2J77A 1ISYA 3TTQA 4L4PA 4BQ3A 1OIFA 4D71A 3UG5A 4AZBA 5IHRA 3RM9A 2B31A 4HA4A 1WO2A 4DWSD 3K8KA 1GVIA 3K4DA 1GUVA 5E9AA 4V28A 5A6SA 1B30A 1J18A 3OGSA 3WQ5A 3WMCA 2VOTA 3I3EA 2EEXA 5HPOA 1KCLA 2FHFA 4AIOA 1MXGA 4JAWA 4S3KA 1WKYA 4AD0A 8A3HA 1WZKA 2VR5A 4UQ9A 4C7DA 6A3HA 2YDRA 3W6MA 1J0IA 4P8XA 5IXEA 2VO5A 4AYSA 1V02E 4U5IA 4NZCA 2QPUA 4MTVA 1UD4A 5JBDA 3NIYA 3FY1A 1UUQA 2DEPA 3WD2A 4QLLA 2WMIB 3CZKA 1ZB5A 1NOWA 4PSRA 4PMNA 3CPUA 5KZ6A 1HT6A 4AEEA 3U5UA 2YDSA 3O6AA 1KB3A 3SCVA 2D0GA 3LPGA 2V3FA 3GBEA 1HL9A 4UR9A 2J75A 1XH2A 1W3LA 3M07A 2GJRA 1XD0A 2ZUSA 1EO5A 2O9PA 4AXNA 1H4PA 4AZ7A 4B9YA 1BVNP 4R5EA 1DP0A 1QI3A 4MAVA 4D6GA 1WDRA 1GJUA 4C90A 5A94A 5EB8A 1HF6A 2UY5A 3AXHA 2BNJA 4W86A 4F9JA 3QHMA 1FP9A 1QBAA 3WF2A 1E56A 4D6FA 1R7AA 1E6SM 4AZ6A 2VR4A 4PUEA 1J11A 2PWGA 1GOIA 1E3ZA 3ZR5A 2YBTA 1OD8A 4HMEA 3CUJA 1HJWA 3RM4A 3SCSA 1J0ZA 1L0PA 1B90A 3BAKA 1V3MA 5IHSA 1PPIA 4CD7A 6CGTA 1JNEA 2WCAA 2J7EA 4IPLA 3MUY1 4PBGA 4MB5A 4IM4A 1NP0A 3L4ZA 3QOKA 3WH9A 1E6XM 2XVLA 4QFUA 3IJ8A 3WNOA 3WEOA 5CZKA 5E09A 3BMVA 3ZMRA 2IXUA 4PEEA 2WYSA 1FFRA 1OWQA 1E1EA 1JL8A 4B16A 2VZUA 2ZXQA 1YQ2A 2ESCA 2DIJA 1J0YA 2VMFA 5TD4A 2JFEX 4KRUA 3U5YA 1F4AA 3BAXA 3UR8A 3ZJ7A 3WDJA 5FOOA 2VRJA 2WWCA 1GONA 4S3JA 1CGXA 3AMDA 3CUHA 5CXPA 4CCCA 1UKQA 4KRTA 2G3MA 1CDGA 1DWJM 1HP4A 4NF7A 2ZUNA 4WSJA 5JUVA 1GJWA 3WF3A 4W84A 3W37A 3GXFA 1B3VA 1MW2A 2QMJA 1BYDA 1B3ZA 4LX4A 3ARWA 1W9PA 5GQBA 3AIEA 5JBFA 3CBWA 1M7XA 1C8YA 4URIA 3MO4A 1VEPA 2J7BA 4AD4A 2D0HA 3VM5A 3EMCA 5DT7A 1JZ3A 4UCFA 4Q22A 1SMAA 4TOQA 1L8NA 1ISXA 2D20A 3POCA 2QPSA 5ECUA 2WLYA 3W6LA 1E5NA 1EDTA 3MMWA 1ZBKA 3AFBA 1K6AA 5BXTA 2C7FA 2WHLA 4M82A 2QLYA 1VIWA 3A6OA 4LYPA 4Q7NA 5DEZA 5IFTA 5A6LA 4BA0A 4IISA 3QHOA 3NJ3A 1IZKA 3WIJA 5ABEA 3WQWA 3AI0A 1CLVA 4QP0A 1DWFM 3LPFA 1QNSA 4YN5A 5ABGA 2D3NA 2Z1SA 3VILA 1UH3A 2A3EA 1W9BM 3W27A 4HZ6A 1W3JA 2W61A 2GFTA 1HJQA 3PZTA 3VIIA 1G1YA 4DM1A 1GZJA 3KL3A 2D23A 5A6BA 5A8NA 2XGIA 3GDBA 1XYFA 2OSWA 2YBUA 1MQRA 5CLTA 5EBAA 2XPKA 2CHOA 2F61A 1V0NA 1H11A 2DT1A 1E71M 3W24A 5I5RA 1QVBA 4WJXA 4WIWA 3WDPP 3DYMA 1MVYA 4LYRA 1D3CA 3IJ7A 1JAEA 3AMCA 2WVVB 4H2CA 1IT0A 4J28A 3CZJA 1QI5A 3GM8A 1HP5A 3K1DA 4C7FA 2BY3A 1Q6GA 4UOQA 1FA2A 5BYWA 7CGTA 3WNKA 5CSUA 4D6CA 1GHSA 2X1IA 2JEPA 2CXGA 1UR0A 1V3KA 2WKGA 3WELA 4W93A 4ACZA 1E6RA 2CITA 2ZXBA 5A2BA 2ZUWA 1W1PA 1SFSA 1HX0A 1QNQA 3CMJA 1UR2A 5CJ5A 2OYKA 1KGUA 3HJEA 4ZENA 4Z2IA 4AISA 5ABFA 5CGTA 2J7FA 4PMOA 1AQHA 1TMQA 5A6BD 1PZ3A 2XVPA 3K8LA 4NRRA 1UKTA 1M03A 2W91A 1J9YA 1GOOA 4KMQA 5HBFA 2VURA 2ZWYA 4UQDA 4U3CA 2J62A 4W85A 4W8AA 4ML4A 1H2JA 5GNXA 2G4FA 2Y8VA 1ZBWA 1LJYA 2WZEA 3VIKA 3VOCA 3KZSA 2EPOA 2E9MA 3WH7A 1GQKA 3VDAA 4WF7A 1E43A 3T0BA 2J7CA 3UERA 4UOZA 1VRXA 3VKKA 1UHVA 1UOKA 4PTXA 3VVGA 1CGUA 3GXDA 4UFLA 3NSMA 4EKJA 4LQ1A 2XUCA 3N1AA 2E9BA 4P7OA 3ZJKA 3CH9A 1Q4NX 4XX6A 4F79A 4AZCB 4GZJA 2BVTA 5A6AA 4MNMA 1TVPA 3EDDA 2DT3A 2W62A 3MANA 1NWRA 3SCWA 4Y7EA 2YA1A 4PRWA 2FH8A 1K9DA 4J3TA 1AQ0A 4W7VA 4QLKA 5C71A 2WWDA 1JDDA 1C93A 3ARQA 4R27A 4CN4A 1ZU8A 5CLWA 2YLAA 1QNPA 1UH2A 1XHGA 1HJXA 3WH6A 1EO7A 3OZPA 2VZOA 1E55A 3OGVA 3WH5A 5I0DA 5A1AA 4UFIA 1QNOA 3VGEA 1QBBA 2VTFA 3WNLA 5A8QA 3AXIA 1QNRA 3L2LA 4TTUA 3G6LA 1JXKA 5ABFB 1GQIA 3AOFA 2ZXDA 4PYSA 4CN1A 2VVSA 1VFMA 4PTVA 3VD7A 3WKZA 3GNRA 3ARXA 3ZT7A 4M29A 2XFYA 4AMCA 3L4WA 5FIPA 3ZT6A 4HMCA 2DT2A 2OLHA 5D9NA 1DTUA 4ZE4A 4GI9A 4CD4A 1HN1A 2TAAA 1G9HA 3WF4A 3RMEA 1E4IA 3TTYA 2Z1KA 3N11A 4AY1A 4CD5A 2ZX8A 1FH9A 2EPMX 4J3UA 1FP8A 3EDFA 1V3JA 4BQ2A 3SCQA 4KWUA 5A8PA 3F4VA 3L4VA 1EHNA 5FL1A 1NP2A 2BY1A 3SCNA 2W66A 4MAZA 3SCPA 2CCRA 3RPMA 4C7GA 3S6TA 3PTQA 3QR3A 1HJVA 3ARYA 3VDBA 2F8QA 4MJ4A 1H0GA 2EBNA 2DH3A 2WCSA 4MB3A 3O9NA 1AVAA 2WMIA 4OBRA 1UR1A 2JIWA 1CIUA 1ITXA 3RCNA 4CU6A 1HJUA 1KCKA 3ZSTA 3WDQA 1E4MM 1V0MA 4DWSC 1E4NA 3MV11 1K9EA 1KXVA 1ESWA 2VVNA 1M04A 5GNZA 5ABHA 4V2XA 4ZFMA 3ARTA 3W29A 3WNMA 2XYLA 1KR1A 1JGIA 1UWQA 2EXOA 1W2VA 1EOKA 3VUPA 4RL3A 4AD2A 2E8ZA 2A3HA 3OLDA 1MFUA 5DF0A 3WBEA 4PSPA 3AIWA 1JXJA 2EPNA 1PBGA 2DGAA 4BQ4A 4WKFA 1QI4A 5D8WA 2VQTA 3UCQA 2VC9A 3AQUA 3QHNA 3W4RA 1W1TA 1TE1A 5M03A 2VL4A 1JI1A 1G01A 3KE0A 4EAMA 2PWEA 2O9RA 2D22A 1JFHA 3WUFA 1W91A 2V3EA 3FAXA 4JFWA 1E5JA 3FN9A 3VDHA 3I3BA 2NW0A 3ARZA 4D6HA 5D9PA 3IANA 3BLKA 1V6WA 1HVQA 2J25A 2VRKA 5JIWA 1JZ7A 1NM9A 1JZ8A 1Q6EA 1Q6DA 4H8HA 4W87A 1PIGA 1HKJA 3PTMA 3CUIA 5AC4A 3DYOA 2GVYA 1C8XA 3W81A 3E1F1 4D6IA 4PTMA 3CTTA 4JFUA 2C0HA 4UOJA 4FLSA 3WENA 4XB3A 3BC9A 3W26A 5DO8A 4HZ7A 3FHQA 3WD4A 3CZ8A 3FXYA 4UZUA 4GQRA 2XFRA 1TVNA 3WD1A 2GUYA 3VMPA 2CIPA 1NWUA 3D3AA 3CHDA 1VENA 1PEZA 1CXFA 3WFLA 4EK7A 4HOXA 3A47A 1TUXA 2DT0A 2DSZA 2HVMA 1H0IA 2WHMA 1TA3B 3VMNA 3AHYA 3NDYA 2CKRA 3GBDA 2BXZA 1FHDA 3U7BA 2UWFA 2V5DA 1D7FA 3CMGA 1LWHA 1OBAA 1UQYA 1QOXA 1NARA 1UG6A 6TAAA 1V0KA 3U7VA 1XCWA 2Y5EA 4TTGA 2WPGA 1HKIA 1HXJA 5LA1A 1NOUA 4TVDA 4LPCA 1GVYA 1UYQA 1CECA 3WDHA 4UQAA 1MQPA 4PMVA 3T2OA 5M17A 4Z2HA 1TFVA 3F5KA 4AIUA 1E6ZA 4E8CA 3ZSSA 4UQCA 1BGAA 2CERA 4WKHA 2E8YA 1UD6A 3PTKA 1CWYA 1E0VA 3AZRA 4BZYA 4HA1A 2GJXB 1OGGA 3WUGA 2D3LA 2XIBA 3OLEA 2DPEA 3WL1A 3HMCA 3ZJ8A 4P7RA 3VIGA 2ZXAA 3WUBA 1B9ZA 1KBKA 5E0CA 2W92A 1XSKA 2D1ZA 3SCUA 1LG1A 4YPJA 3M6DA 5CPTA 4CUCA 4RE2A 4RE4A 4XUYA 3WQ8A 2VNCA 4HPGA 2WK2A 2WXDM 3RO8A 1UR8A 3W28A 3PZIA 2PB1A 4P8VA 3WD0A 1EOMA 4D72A 4FLRA 3GXIA 4HZ8A 2WZHA 3AROA 1VBUA 3AMLA 2E3ZA 2DQXA 1KBBA 4HP5A 3GZAA 1TZ7A 1QHPA 2BHZA 4BF7A 1J01A 5CQ1A 1CXLA 1WDQA 4J3VA 3ARRA 1FHLA 1GOWA 4PMUA 1C3FA 4A4AA 4GPNA 2WVVA 4V27A 2XJ7A 4GINA 3W0KA 2QMKA 1VFOA 3AIVA 3OA5A 4U3AA 3NDZA 1H09A 1Q6CA 1OCQA 3BLPX 1HIZA 2AAAA 4U2ZA 3DECA 4AW7A 4DUVA 1BYAA 3GNPA 3W25A 3MUIA 5A8OA 2Q8XA 2WC4A 1A47A 2W4XA 2A3CA 2OSXA 2XM1A 4JCMA 1V3IA 1OIMA 1H41A 3FW6A 4F8XA 3U57A 3LPOA 3SUVA 4PMZA 3CZEA 1UWTA 5JBEA 1MWOA 2DIEA 4GKLA 1CPUA 5I2UA 4W8BA 1WZMA 3LPPA 1GOKA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2DSU A;  3VIH A;  1WAW A;  1WPC A;  1LG2 A;  2YA0 A;  1N82 A;  1ITC A;  1KWK A;  4CKQ A;  2BY0 A;  2CPU A;  1UH4 A;  1LWJ A;  2BFG A;  1JYV A;  4Z2J A;  3MUZ 1;  2J8G A;  2XGB A;  2XVG A;  1ODU A;  4TX6 A;  2PI6 A;  2RGM A;  3F5J A;  3WQV A;  4F9D A;  2EJ1 A;  1E1F A;  3GH5 A;  2UY4 A;  3POH A;  5A6J A;  3WSU A;  3T08 A;  1UR9 A;  3TTS A;  5BCA A;  4CN6 A;  4AEF A;  4TUF A;  1DHK A;  3AIQ A;  1V6Y A;  4PN2 A;  3MSD A;  1BSI A;  2WAN A;  4OIF A;  4ACZ B;  4HMD A;  1JYX A;  1GNX A;  1V02 A;  3MKK A;  3SUW A;  1GHR A;  5EFD A;  5BWF A;  2WHJ A;  5JIP A;  2J4G A;  1C8Q A;  4M56 A;  1X1N A;  4U33 A;  1J12 A;  3QOM A;  4FK9 A;  4PMD A;  1SMD A;  1MW3 A;  1GQL A;  3W38 A;  1I1W A;  2J79 A;  3AYS A;  3PZV A;  7A3H A;  5IFP A;  1LF1 A;  5HOS A;  2YL8 A;  3WF0 A;  3FND A;  3ARS A;  5I3D A;  1US2 A;  2MAN A;  2O92 A;  4AZI A;  2JIE A;  2ZX9 A;  2WSK A;  4EAN A;  1KXH A;  2WMG A;  1UD3 A;  4UZS A;  5FL0 A;  1K9T A;  1Z32 X;  1QI0 A;  3ZQ9 A;  4U2Y A;  3B9D A;  1C7T A;  3B9E A;  2VZT A;  4CVW A;  4AD5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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