3WTY | Genus

Total Genus 41

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	41
sequence length	118
structure length	118
Chain Sequence	PVIPAAALAGYTGSPPIQLWQFLLELLTDKSCQSFISWTGDGWEFKLSDPDEVARRWGKRKNKPKMNYEKLSRGLRYYYDKNIIHKTAGKRYVYRFVCDLQSLLGYTPEELHAMLDVK

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Transcription/dna
molecule keywords	Runt-related transcription factor 1
publication title	A novel allosteric mechanism on protein-DNA interactions underlying the phosphorylation-dependent regulation of Ets1 target gene expressions pubmed doi rcsb
source organism	Mus musculus
total genus	41
structure length	118
sequence length	118
chains with identical sequence	H
ec nomenclature
pdb deposition date	2014-04-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
C	PF00178	Ets	Ets-domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.10.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Arc Repressor Mutant, subunit A	Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain	3wtyC00

2AS5F 2DW4A 2R7DA 1HW5A 4A2UA 3GVAA 3LA3A 2DQRA 4M6XA 3WG9A 5ICCA 3WTVC 1TW3A 1R1TA 1BI1A 1XDSA 2LDUA 3GFLA 5D4RA 1S3JA 3WE2A 1KU3A 2WWYA 5KK1A 1RZ4A 3F72A 3HSEA 3JW4A 5ICEA 4P5OA 4AIJA 1U8RA 3FXUA 3JAMK 2GIVA 4M6YA 2IRFG 2E7XA 2DK8A 1KQ0A 3DPTA 5DUIA 1FNNA 4KNYA 3ELKA 3KCCA 2YX7A 1USSA 2COMA 2VT3A 3HRMA 1EH7A 1J0RA 4RGXA 1KU7A 2KKOA 2QZ8A 4IRHA 4EGZA 3G73A 1T39A 2K4BA 3TDZC 4I01A 2C6YA 4CHUA 2PMHA 4I02A 4ENJA 1QPMA 5D5WB 4KICA 4EJUA 4LG0A 3IHUA 5HLGA 4HZFA 4EJVA 1XCBA 4P96A 4GO1A 2BBYA 2EB7A 2LSOA 2EA4A 3T8TA 3DXJF 4HDVA 5E18F 1DUXC 4PGGA 3R0JA 2FRHA 5EEHA 3HIFA 4O3MA 2EV5A 4IPAA 2VBXA 5LRSA 5LHIA 1AOYA 3VFZA 2FQ3A 1SMTA 4AIKA 2OZ6A 1OYWA 3N97A 1FZPB 3RYPA 1JGSA 2EWNA 1IN7A 1L3LA 5J8CA 2F5EA 2ESNA 3ECOA 3ABTA 2HTSA 1KYWA 2W24A 4UVBA 5ED4A 3GEZA 3GLXA 2HEOA 3O3KA 4EJWA 5HVQC 3K1MA 2VT2A 1XSVA 2DLLA 1FP2A 3SXYA 2JTVA 3TGNA 3QPHA 3LQRA 3N4MA 2PQ8A 3LFKA 4M9SA 2GWRA 4KIBA 5IT3A 5D6EA 2P6TA 5AIPA 4NQWA 2GA2A 4YIFA 2JSCA 1O3TA 4LGWA 3WTSC 4AIHA 1XGSA 3P9CA 3E6BA 2A5YB 4M72A 1J5YA 2YU3A 4NB5A 4Q5SF 4H0EA 1IN6A 1R5GA 3GW2A 3IWFA 3K2ZA 1ZG3A 3CUQC 1XCVA 2RQPA 4R79A 2HFHA 1IN5A 3ZMSA 1KU9A 5FLXZ 3IRQA 2IJLA 1U2WA 1SMYF 3ML6A 5J8FA 3LAPA 3BJ6A 2OA4A 2ETHA 3IC7A 2XIGA 2WTEA 1XSXA 2Y48A 3L7WA 1IUYA 1E17A 1EV7A 3J7AO 2O61A 1AWCA 2VONA 1P6RA 1WWXA 4WK8F 2STWA 2JZYA 2VC1A 1Z9CA 5H6RA 4YFXF 5H6QA 2DFIA 2ZFWA 3GFIA 2UXXA 2Z3YA 2KIUA 3ZN0A 3QU6A 4E70A 2UXNA 1F5TA 4DQ2A 4FT8A 1Z1DA 3F8CA 5FLXK 3CLOA 3C3WA 5DD8A 3KETA 2ELHA 2OD5A 4ENMA 1HW1A 2XAFA 4BHBA 1HKQA 3CUQA 4UHTA 1RNLA 2WV0A 4TV7A 5DCMB 1BJAA 3EQLF 1IRGA 5TJJA 1IZ1A 2MC3A 2HWVA 1U3EM 3F8FA 1QZZA 4ENNA 1O7FA 1S8NA 4ESBA 5FO5A 4B09A 2DK5A 3PQJA 4ZZDA 3RPUA 4HF0A 2DAOA 1KU2A 2Y75A 3I53A 1U6GA 1TTYA 5BOXA 1ULYA 2XAQA 5HS8A 3J81Z 4A5MA 4N0BA 3D5LA 1J7KA 3U1DA 3BWGA 1LEBA 3CUOA 5K5RA 2A69F 2H94A 4WXHA 5L3GA 1IW7F 4G7HF 1CGPA 3L2CA 3DFGA 2FBIA 3WGHA 3S2WA 1YO5C 4MEYF 1OPCA 1ZN2A 4CYDA 1LDKB 1UHWA 1TQMA 1IN4A 2FBHA 2G7UA 4LK1F 4Q47A 3ZMDA 5LLQA 3BY6A 1ZARA 4AWXB 1G3YA 3MEXA 4BAYA 5E8IA 5DD4A 5D5UB 4G94A 2DTRA 2P4WA 4G6QA 3FHZA 1Z91A 2A68F 1U5TC 3KEQA 2H6BA 4CICA 3F22A 3HOTA 1K6OA 2B0LA 3G3ZA 2QENA 3DKWA 5E1WA 1XB4A 4RGRA 4ZYDA 4I09A 2NRAC 3T8RA 2ADUA 1LJ9A 2HR3A 2NNYA 2EJRA 3FMRA 3M8FA 4UV9A 2OBPA 1W5SA 2EFPA 2IW5A 3O6BB 2J5PA 1FY7A 1I6XA 3NEUA 2P8TA 3HRSA 1K79A 2A3SA 2HYGD 2JT1A 5D6FA 1BM9A 1O7LA 3GZ5A 3SHFA 4ON0A 2MD5A 4UNOA 3F6VA 2DQLA 2HTJA 3I54A 4WXDA 5BS6A 1L0OC 3GFMA 4CXFA 4U0WA 2Q2EA 1LQ1A 1USTA 5ERIA 4KDPA 4Y15A 2HQNA 4HYEA 3R60A 3C1DA 3ZMZA 2FE3A 1OMIA 2PG4A 5LGNA 1B59A 5K5QA 3FWEA 2KJCA 1B1BA 5IT9K 3WGIA 2QQAA 4Y17A 2RKHA 1D8KA 5DCFA 3MWMA 2O0YA 2Q8KA 2VE9A 3REOA 2DPUA 1YS7A 3GUDA 3HSRA 1PDNC 1A04A 3V8KA 1XSDA 2NS0A 2VE8A 3R61A 4UXNA 2ZMEB 4IJAA 3WTTC 3E6CC 4G7ZF 5HLHA 3FMSA 1YIOA 1ZLJA 2ZJ2A 2VBZA 4AD9A 1P92A 3KEOA 4LB5A 1GVJA 4JK1X 5LHHA 1U78A 3FMQA 4HF2A 4A0YA 4GGGA 1ZRFA 3IL2A 3DV8A 1QQIA 4KN7X 1XGOA 1P2FA 5CVIA 3NRVA 3VOEA 1GXQA 2O8XA 2HS5A 1KA8A 1KGSA 2HDCA 1H9GA 3U9GA 4LFUA 3M1EA 2VXZA 3HHGA 5CJ9A 1F4KA 1R7JA 3CDHA 5F64A 3KZZA 1ZREA 4LD5A 2K4JA 2EFWA 4HV6A 2XGXA 1TBXA 4O6JA 1SD4A 1XGMA 3E3VA 4L0ZB 3QOPA 3E5UA 1WSUA 1ZG1A 2DT5A 1S6LA 4EJTA 2ISYA 3TO9A 2K02A 5L3FA 1K78B 3L9FA 2V1DA 5J6XA 2YSRA 3HTUA 2TDXA 4KMFA 3QRFF 3KP5A 3KLOA 2ZNYA 3FXRA 3CTAA 2L4AA 1R22A 1SFUA 4L18B 4LB6B 2HKXA 4EV0A 4HOBA 4OIRF 2UZKA 1DPUA 1DP7P 4KIFA 4M9XA 5ICFA 3M7GA 2IT0A 2O3FA 2IVMA 2P7CB 2DI3A 3Q5FA 4I98B 4IRIA 2M8EA 2ZCWA 4CO8A 1YW9A 3SZPA 2F5CA 2NYXA 2Y0MA 2H09A 2QQBA 3BP8A 1FBQA 4LLLA 1ZYRF 2CYYA 2RGVA 1TW2A 3FM5A 2H27A 4BYYA 1BI3A 2ESHA 5DEQA 2OQGA 2XKOA 3K1NA 4HQEA 2L01A 3KZYA 1MD0A 2KIFA 2BE5F 1B9NA 2D1VA 4FHTA 1OR7A 1XMKA 3KP7A 1FT9A 2VC0A 2MLGA 4G7OF 5LRRA 2IA2A 2YX4A 4MHGA 4UV8A 2KIMA 2X0LA 3JTHA 1BOAA 1CF7A 2ZXJA 3PQKA 3EDPA 4RB2C 5HDKA 2CQKA 3AAFA 3T1BA 3F3XA 5BPIA 1SFEA 1QBJA 1FSEA 2V9VA 1VTNC 2PEXA 5CLSA 2FSWA 3V4GA 3KFWX 1R00A 1H0MA 2IP2A 1XN7A 3WU1B 3JSPA 2BYVE 3BDDA 4ZZLA 3HOSA 2PLYA 1LNWA 2MH2A 1KYZA 5HDNA 2FXAA 1ZGJA 5ILUA 4XRFA 1WI9A 4BHPA 2VOPA 1W4MA 1T6SA 5HOOA 2MBFA 1Z05A 2RV8A 4I7HA 3IRRA 3BPXA 3MZHA 2GZWA 4KIGA 1E2XA 4KA4A 4UUVA 3E5QA 4YIIA 2V6CA 2FNAA 1KQ8A 5FD6A 4OIPF 2W25A 2EA2A 2UWMA 3IKVA 1T38A 4WXCA 2L4MA 4L0YB 2LKPA 3KP6A 4B8XA 4XLNF 3SFZA 5H20A 1JE8A 2P6SA 4ZYEA 3J80Z 1MZBA 1R36A 3F8NA 2VODA 2AXLA 4N9HA 3GF2A 4G8XA 1HXDA 3ECHA 5D5VB 1BI0A 3FF5A 5JHUA 3H3UA 2XASA 4N9IA 4MQVA 3RPQA 2V79A 4A6EA 1QNTA 4KFCA 1XGNA 2ZO4A 1Y0UA 4UVCA 3WTXC 1R1VA 4MTEA 3LQQA 4F7ZA 4EM1A 3MFKA 4YFKF 1FPQA 3U2RA 4GXOA 1OYIA 1R23A 2K86A 2XKPA 1BI2A 4GCVA 4R8HA 3QP6A 4A0ZA 4OMYA 1YFHA 4EM2A 2H6CA 5A2QZ 3E6DA 1T2KA 2HZTA 3FXQA 3LWFA 4ETSA 2F2EA 4EM0B 3SQNA 2EV0A 4IXAA 2PN6A 3E5XA 1PP8F 1H9TA 5AIQA 4HA8A 2EFOA 2KJBA 5L3EA 2M5WA 5D5XB 1Z6TA 1HW2A 1EH6A 5BQTA 1RI7A 4EJOA 5LGUA 4LLGF 3RIRA 3VB2A 1LDDA 1SFXA 4U7BA 2LF7A 2PJPA 2Z9OA 3HRUA 3I59B 1Q1HA 2YPRA 3J81K 2R7FA 1FYMA 3T5XA 1O3RA 5K1YA 4MTDA 2BGCA 4S04A 1FBSA 3BJOA 3L09A 4L9NA 1IF1A 1MDMA 4HF1A 2KRFA 3CJNA 2P5KA 3H3ZA 5E8GA 1W7PB 4FX0A 2NAZA 1FWZA 4I0BA 3F8BA 4WCGA 4HV5A 2EV6A 3OV8A 4L5JA 2L3DA 4KYWA 2HGCA 1XD7A 1V3FA 2L54A 1B9MA 3I71A 4PDKA 4G6DA 2W57A 1FSHA 2Z5UA 3TQNA 1RUNA 5LGTA 4S05A 2M30A 3F6OA 1QGPA 1F9NA 2HOEA 3B02A 1D8JA 1UFMA 1J2XA 1G3WA 4MGRA 1ON1A 2FEZA 3WU0A 1U5TA 2P7VB 2VOOA 1YS6A 3KLNA 1REPC 3WTYC 2GA1A 1TNSA 3ZPLA 3ZMTA 1Z6RA 2PMUA 1OYYA 3MCZA 5LEKA 1D5VA 4L9TA 1DDNA 3RKXA 4WWCA 5ICGA 5BMZA 1MKMA 1FLIA 3BROA 1OKRA 3PFIA 2VBWA 4MQ9F 5L3CA 1XMAA 1UB9A 4ESJA 3JSOA 1O3QA 1ZLKA 2STTA 3M9AA 3H92A 2GXGA 2CG4A 3GX4X 4KT5C 1FYLA 5L3DA 4Z2YA 1NHAA 1TLHB 1WRJA 3ERED 2XAHA 2XVCA 4BQAA 5DYMA 2F5DA 3F8MA 2XV4S 3SZTA 2E1CA 4P9UA 2XAJA 1J75A 3V8JA 2A6HF 3WTWC 3EYIA 4KN4X 5E17F 4KMUX 3EUHA 3KP3A 4MNUA 2MH9A 4ESFA 2V1XA 3W6KB 4EQQA 3BPVA 2QWWA 2OU2A 1PP7U 3DPLC 1HKSA 4HAMA 3LSTA 1I5ZA 2W85A 3ZQ7A 2MLKA 3W6JB 4U88A 2LF8A 5TRDA 5FGMA 4HW0A 4M9ZA 2K27A 1RIOH 2QBYA 3HHHA 3IKTA 2HKOA 2G9WA 3T0YA 1BIBA 1IXRC 4JQFA 2ZMEA 4RB1A 2CGPA 5JR3A 4XBFA 1HKTA 5JI6A 3TO7A 2ZNZA 4YFNF 3RKWA 1IXSB 5HS9A 4ZH4F 2ISZA 2O03A 4LLNA 3K9TA 1S29A 3GZ6A 4FX4A 4WF2A 2J5OA 3TOAA 5FB2A 1HQCA 3L00A 1XDUA 4LG0B 3FM3A 5LHGA 1JXSA 2IPQX 2QM3A 1HBXG 2FA5A 3C18A 4HLXA 3O2PE 3KE2A 3RDIA 2OZUA 3B73A 1G3SA 5JFRA 3V8LA 5F1RA 2K7LA 1ONVA 2PFBA 4CZZA 2P5LC 2QLZA 3QP5A 2IA1A 3EYYA 2HYFA 4R1HA 2W84A 3WTUC 1G4DA 2CWEA 3V7RA 1O3SA 4L9JA 1IN8A 1P4AA 2FOKA 4HLYA 4Q48A 2RVCA 4IHTA 3WE3A 2EFQA 3MQ0A 3HTSB 3P9IA 2Z99A 1K78A 3WODF 2FF4A 3P7NA 3TOBA 3HYIA 3KP4A 4A12A 1K7AA 3M8EA 5F6FA 1RUOA 5DUKA 4GYIA 2DBBA 1CF7B 2O6GE 4M71A 1ZRDA 1FC3A 1J9IA 5LBQA 2D2WA 4LK0F 4OU0A 1SD6A 1ZRCA 5DV5A 1D3YA 1SD5A 2CFXA 4RGUA 2PBIA 2HQRA 5D8LB 5HS7A 4RAYA 1W7PD 3HUGA 2CSOA 1SAXA 3GFJA 3GO5A 3Q9VA 2XRNA 1FX7A 3GXOA 3GYHX 4MEXF 3I58A 1IXCA 3V7SA 1IAWA 1G6NA 1LDJA 3LA7A 4U7DA 4U0VA 1R1UA 1BBYA 1T98A 2PI0A 4P55A 1YYVA 2ACJA 4ENKA 3RJPA 5E1XA 2JPBA 3HSFA 2Z33A 4XSXF 3F23A 2E1NA 3IWZA 4RGSA 3I0TA 2RDPA 3EETA 2ZBKA 3VODA 1LB2A 4IF4A 2BV6A 1JHFA 5CVJA 1TQIA 1QZYA 1ODDA 3BZ6A 4L5IA 2A07F 3E6MA 2VBYA 2GQQA 1MJ9A 2X4HA 3ZMVA 4GYGA 4I0AA 3HRTA 2NNNA 3Q9SA 4Q4ZF 1ZH5A 1YTYA 1ZHFA 1JHHA 3CO6C 2D45A 5KVRA 2IA0A 1F1ZA 3CUQB 3TKYA 1P4WA 4OOIA 1FP1D 3C7JA 3V7CA 4WX9A 4PZJA 4OMZA 4PGHA 1YG2A 1TQPA 4D0PA 4OINF 4OIQF 3FZVA 4HX7A 1LEAA 4Y13A 4EVIA 1SD7A 1KQ9A 1YW8A 3ULQB 3MAJA 4A6DA 3LAJA 4LJZF 5L3BA 4BNCA 1MGTA 3I5UA 2MA3A 2ZKZA 2CO5A 2FNPA 1X3UA 3I4PA 4AVPA 1YQAA 1C0WA 5CVUA 2G7HA 3VEPA 2E7WA 1I1SA 2GXBA 2D1HA 4PCQA 2VN2A 3ISPA 4DNCA 4CDGA 3WTZA 1GHCA 2WC2A 4M74A 3ABUA 1ON2A 1V4RA 1PUEE 5E20A 4BH9A 4RAZA 5HLIA 4QWQA 4QLCU 3DF8A 1R5HA 3J80K 4HBLA 4EMSA 3D0SA 1S7OA 1UHMA 5DCMA 1MJAA 1LVAA 3WGGA 1P4XA 4IVNA 3GWZA 1MDMB 5JVTA 3BOQA 4U0YA 3R4KA 5CVRA 3RI4A 5ILVA 5CVVA 3TDUC 2BEOA 3P9KA 3RYRA 4K2EA 5FD5A 2QQ9A 1QO0D 3ZMUA 3QPTA 4G9YA 4A0XA 2P5VA 2EFNA 1WQ2A 1BIAA 1BN5A 3RKYA 3K69A 4LMYA 5DDGA 5A2QK 1HSTA 2DPDA 4P9FA 2QYOA 3NQOA 4ASNA 2DO7A 1Z7UA 2YR2A 2R3SA 4RB3C 1G3TA 4JBAA 2CW0F 1FYKA 3QU3A 1U5TB 2GAUA 2A6EF 1B4AA 3K0LA 3F21A 1O57A 3FX3A 5D4SA 1EH8A 1BC8C 2XUBA 4UVAA 3I59A 4HQMA 5HDGA 1YW7A 4HDUA 3MZYA 2DU9A 2M1BA 5AONA 1ZAOA 3OOPA 2A61A 5IT9Z 3JTGA 2FMYA 3K1PA 2XROA 4ZYHA 2JRTA 1ZG5A 1I1GA 2QUFA 4ZYGA 4NHJA 5K5OA 1S7AA 1DPRA 2OQRA 1TNTA 5E1ZB 3COAC 4XLPF 3DP7A 5D8KB 1W7PA 1FOKA 5ILSA 2F5FA 4M73A 2XAGA 4KUMA 1R58A 3CO7C 2OAZA 4A5NA 5LEJA 6PAXA 4OIOF 3R0AA 2FU4A 4CGZA 1ZGAA 4RS8A 2LNBA 4O5VA 3ROUA 4IRGA 1WKMA 4XSZF 3TO6A 3BJAA 4BXUA 3R6SA 1B6AA 4HX4A 1UCRA 2RC4A 4L9VA 4IHSA 1I27A 2EK5A 3DQVC 3ZP5A 2M87A 2QVOA 2XHKA 4YG2F 2FMLA 1BC7C 2JPCA 1J59A 2FBKA 3E97A 1YLFA 1W5TA 2Q0OA 3KP2A 1HSJA 3QAHA 2QBYB 3RTRA 2RN7A 4I2OA 1T0FA 2V1UA 4HX8A 5BPDA 3DEUA 1STZA 3LA2A 1GXPA 2L02A 2M45A 2RNJA 5CYVA 3I64A 1FBUA 1IRFA 5FFZA 4BHCA 3ZN1A 1MJBA 4EGYA 5FFXA 5EEGA 3JAMZ 4RB0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2AS5 F;  2DW4 A;  2R7D A;  1HW5 A;  4A2U A;  3GVA A;  3LA3 A;  2DQR A;  4M6X A;  3WG9 A;  5ICC A;  3WTV C;  1TW3 A;  1R1T A;  1BI1 A;  1XDS A;  2LDU A;  3GFL A;  5D4R A;  1S3J A;  3WE2 A;  1KU3 A;  2WWY A;  5KK1 A;  1RZ4 A;  3F72 A;  3HSE A;  3JW4 A;  5ICE A;  4P5O A;  4AIJ A;  1U8R A;  3FXU A;  3JAM K;  2GIV A;  4M6Y A;  2IRF G;  2E7X A;  2DK8 A;  1KQ0 A;  3DPT A;  5DUI A;  1FNN A;  4KNY A;  3ELK A;  3KCC A;  2YX7 A;  1USS A;  2COM A;  2VT3 A;  3HRM A;  1EH7 A;  1J0R A;  4RGX A;  1KU7 A;  2KKO A;  2QZ8 A;  4IRH A;  4EGZ A;  3G73 A;  1T39 A;  2K4B A;  3TDZ C;  4I01 A;  2C6Y A;  4CHU A;  2PMH A;  4I02 A;  4ENJ A;  1QPM A;  5D5W B;  4KIC A;  4EJU A;  4LG0 A;  3IHU A;  5HLG A;  4HZF A;  4EJV A;  1XCB A;  4P96 A;  4GO1 A;  2BBY A;  2EB7 A;  2LSO A;  2EA4 A;  3T8T A;  3DXJ F;  4HDV A;  5E18 F;  1DUX C;  4PGG A;  3R0J A;  2FRH A;  5EEH A;  3HIF A;  4O3M A;  2EV5 A;  4IPA A;  2VBX A;  5LRS A;  5LHI A;  1AOY A;  3VFZ A;  2FQ3 A;  1SMT A;  4AIK A;  2OZ6 A;  1OYW A;  3N97 A;  1FZP B;  3RYP A;  1JGS A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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