3WUEA

The wild type crystal structure of b-1,4-xylanase (xynas9) with xylobiose from streptomyces sp. 9
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
TATLGELAEAKGRYFGSATDNPELPDTQYTQILGSEFSQITVGNTMKWQYTEPSRGRFDYTAAEEIVDLAESNGQSVRGHTLVWHNQLPSWVDDVPAGELLGVMRDHITHEVDHFKGRLIHWDVVNEAFEEDGSRRQSVFQQKIGDSYIAEAFKAARAADPDVKLYYNDYNIEGIGPKSDAVYEMVKSFKAQGIPIDGVGMQAHLIAGQVPASLQENIRRFADLGVDVALTELDIRMTLPRTAAKDAQQATDYGAVVEACLVVSRCVGITVWDYTDKYSWVPSVFPGQGAALPWDEDFAKKPAYHAIAAALN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords Endo-1,4-beta-xylanase A
publication title Structural perspectives of an engineered beta-1,4-xylanase with enhanced thermostability.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces sp.
total genus 126
structure length 312
sequence length 312
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2014-04-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wueA00
3N04A 4W8BA 4AW7A 2VRQA 5EMYA 4NF7A 5EB8A 5DFAA 3NYDA 2JIEA 1VBRA 3AS0A 4AWEA 2VZVA 3T2QA 4B3KA 1UR1A 3N11A 4CD8A 4M29A 2VI0A 3AZTA 4XUYA 3SUWA 2WNWA 3ZM8A 1A47A 3K8MA 3M46A 5IXEA 1E4MM 2PWGA 1FFQA 3B9AA 2A3BA 3GH5A 3NDZA 4U3CA 3EDEA 4JKMA 4JFUA 4D72A 2DSKA 4AD0A 2YKKA 1V02E 4P7QA 2YBTA 1GHRA 1ODZA 3ARRA 3PZOA 3PHAA 1MXGA 1H0GA 4CU7A 2PC8A 1PX8A 1LG2A 4HU8A 4W7UA 5E70A 3UG3A 1BYAA 1QW9A 1CGWA 4PTWA 4AEEA 2BHZA 4MB5A 5CXPA 4HOWA 1XH2A 3MMDA 1E15A 2BVTA 3EMQA 4OOUA 2WCGA 4P8UA 3ARSA 2ZXBA 4PUDA 1E6RA 4OKDA 3GTNA 4YPJA 1VJZA 4U5KA 2YL5A 2PWEA 3GXFA 3FN9A 1ZB5A 2WSPA 3K46A 5D9PA 3OGRA 5AC4A 3AI0A 3THCA 3AMCA 1BPLB 5ABFA 3BMWA 4DUVA 2J7GA 2G3MA 1UH4A 5I24A 2BHYA 1XCWA 4N0RA 2XIBA 1OIMA 3W24A 3ECQA 2PBOA 3QOMA 3IJ7A 2XGIA 3T09A 3DC0A 3AIBA 2J7HA 1JD9A 2UY4A 2TAAA 1ZBKA 1US3A 1I1XA 1PIFA 1E73M 1W3LA 4XX6A 2X05A 2WVVB 4X0VA 1U2YA 5A6SA 1QOXA 2W4XA 4XV0A 4IM4A 3VGBA 1V0LA 2J75A 4AIOA 5A2CA 3BH4A 1SMAA 3CHDA 1J0IA 3CPUA 1JAEA 4EANA 5BRPA 1TR1A 1QW8A 2ZX5A 3CUFA 3AHTA 2DT1A 2GK1A 1WZAA 2V5CA 1QI5A 3WH6A 1WZMA 3UR7A 5A6AA 3VMPA 4CN6A 4D6IA 2JFEX 1KR0A 3G6LA 4AZHA 4JL1A 2ZWYA 4J27A 1W9XA 2CPUA 1L8NA 3AZRA 1W3JA 5HDRA 1K9EA 3VGGA 3K8KA 2JEQA 2CHNA 5E9AA 2WLZA 1JIBA 4HZ8A 3GYCA 3CHEA 3AIQA 2RGMA 3WQ6A 5A3HA 4HA1A 1KGXA 2Z1SA 2WMHA 1G9HA 4QDMA 1YHTA 1CZ1A 4HZ7A 2XGBA 1JZ2A 1CNVA 4QLKA 3CTTA 1JDAA 3BAWA 3N17A 3ARUA 4WF7A 1UWUA 1WDSA 3WNPA 5I79A 2BNJA 1E72M 4Z2KA 3B9EA 1X6LA 4JHZA 2V3GA 3RJXA 1ISYA 2CEQA 4L4PA 2OWXA 3QOKA 1W1TA 1GOMA 2V38A 4K68A 3WF2A 2QPSA 5CSYA 1KCKA 4AMCA 1DWJM 5BXSA 1KBBA 4FK9A 1LL7A 4GQQA 3VGEA 3VVGA 2FDMA 2ESCA 5BROA 4MNMA 1MFVA 4WJXA 2JIWA 2W63A 1H09A 1E1EA 4PUEA 3VIJA 4WIWA 1B3ZA 3WQ8A 1QI4A 5EFDA 3O6AA 3SUUA 1FP9A 5AYBA 3UR8A 1M04A 1HJUA 2CHOA 2J8FA 5BXRA 3N13A 3AMGA 1UZ1A 4BS0A 1KFWA 2DT2A 4CVUA 1UOKA 4TXEA 3VILA 5DEZA 3GNOA 3EBVA 4D1IA 1GVIA 1DTUA 1BVZA 5FKYA 3F5KA 3GM8A 4IUGA 2QPUA 5EBAA 2CKRA 3AOFA 1BGGA 4MNKA 3L2MA 2E0PA 4GI8A 4GI6A 2XWEA 2XHYA 3EDDA 4R5EA 2WCSA 2X2YA 3CIVA 3ZJKA 3KWXA 1WAWA 3BAXA 1QNQA 3RJYA 2E9BA 8CGTA 2YL8A 2WMFA 4M81A 2BXZA 4BF7A 4UFIA 1QI0A 5A8NA 4U3AA 4L4OA 4PMUA 2W5FA 2WVUA 3QR3A 3T0BA 1GPFA 1LJYA 1KXVA 2DGAA 4RE2A 2UY5A 1ESWA 1K6AA 3AS3A 1QNRA 2OSWA 1CECA 1NOWA 1SR0A 3T08A 2E8ZA 2WYSA 1OT2A 1BSIA 1KXTA 3UCQA 3THDA 5CZKA 1OCQA 4UQEA 5IFPA 4D6JA 2XVPA 3DHPA 2EPLX 4V27A 1KQYA 2CKSA 3CUHA 1K9FA 2OWCA 1CLXA 5BYWA 4P8XA 1OGBA 3ALFA 3WF4A 4UZUA 1EXPA 3SCRA 1IT0A 1UR0A 3RILA 2J77A 2OYLA 4CU6A 3WD0A 1DP0A 3W6MA 1KXHA 3VMOA 3WD1A 2IXUA 4AIUA 1LG1A 1XHGA 3L4VA 4UZSA 5A6JA 2CXGA 1J01A 5A6MA 3DYPA 1R7AA 2VQUA 3OG2A 3SUVA 3L4UA 4LYRA 2HISA 1CPUA 1MYRA 2J4GA 1B3XA 2MANA 3ZIZA 1S46A 2BVDA 6CGTA 2GK1B 2GJRA 3CBWA 3LPPA 3AHVA 3OZPA 1QI2A 3QHNA 1DEDA 2VCBA 3OA5A 3VGFA 4LX4A 3N18A 1HJSA 2B31A 3SCNA 2FH8A 4W84A 4MTVA 3SCQA 1E5JA 1JZ8A 1BHGA 3GH4A 2VT0A 2VZUA 2XJ7A 1UUQA 1BG4A 4J7RA 4LYQA 1L0PA 1W3HA 2GDUA 2GFTA 4J3XA 1V0MA 3AIWA 1G94A 2ZICA 3WIJA 4W86A 2O9TA 3PZGA 1E71M 2WWCA 2HVMA 1B9ZA 3EMZA 2ZWZA 3AISA 4J3SA 3UETA 1HKKA 1JZ4A 3SURA 1M53A 4XB3A 5HPCA 3VDAA 5ABHA 4S3KA 4AC1X 2UY3A 3VIPA 3ARQA 1X1NA 3QHOA 2VTFA 1V6UA 3WDPP 1LWHA 3UG4A 1CLVA 2XUCA 2YOCA 4PMZA 3OLDA 1J9YA 1JFHA 2AMGA 2NT0A 4MPKA 4H8UA 4Q7NA 4F79A 4QCFA 2W62A 1VRXA 4TVUA 3VD7A 1W2VA 7CGTA 5HOSA 3WEZA 3U5UA 2WHMA 3VIMA 2DSZA 3VPLA 2FGZA 1E5NA 4ZENA 4LQ1A 3VDBA 1RPKA 1ITCA 3PZIA 4HP5A 4Z2HA 4E2OA 4UTFA 1XGZA 1JG9A 2A3AA 4DWSD 1HP4A 4GZIA 4MDOA 3EDKA 4TUFA 3CZLA 4MJ4A 2JALA 2A3EA 5CJ5A 1EDTA 4M82A 5JUVA 3BLKA 1ISXA 1NP2A 3WUFA 4PRWA 4QLLA 1B3VA 3SCVA 3ARZA 1UR8A 3SEPA 3B9DA 2VZSA 2G3NA 3TTSA 1R7OA 1KWGA 1CEOA 1VJSA 1PIGA 4ACZA 3SIMA 2WZHA 3ALGA 2O9RA 3SCWA 1UD6A 2YL6A 1M7XA 5F7UA 3OB8A 3L4ZA 1H3GA 1H2JA 1KWKA 2XVGA 4KRTA 3K4DA 3RM8A 1E56A 3WH5A 3NDYA 2EBNA 3VX1A 2AOSA 4CCCA 2CETA 2CCRA 5A6KA 4GIAA 3KL5A 1JI1A 1UKPA 1V6XA 1DWGM 2Y24A 5CSUA 2CBUA 5CG0A 3AXXA 2VR4A 2WB5A 1TMQA 1WO2A 2X1IA 1EQCA 3BCDA 5IDIA 4F8XA 3GBEA 1OSEA 1O7AA 3AZSA 4NSBA 3PZUA 1WZKA 3N9KA 2J47A 4NRSA 3W27A 1HX0A 3W81A 3HN3A 3GNRA 3FY1A 2OYMA 3E1F1 5FIPA 4ATDA 3RCNA 3MMUA 1GONA 2D0GA 3VO0A 1D2KA 4OOZA 4JKLA 3BMVA 2XSAA 2WPGA 3TTYA 2DH2A 3WKZA 4IPNB 2BVYA 3RDKA 2F61A 4PTXA 5LA2A 1FHDA 3K1DA 2O9PA 2Z1KA 4UQCA 5I6SA 4JZ5A 4PMYA 1NWTA 1WZLA 2OSXA 1W32A 3VIGA 1ISZA 1BYCA 2OSYA 1VF8A 1CXHA 5I3DA 4CUCA 1H4PA 1ZS2A 2FHFA 2ZOXA 1V3JA 1RH9A 3AFBA 5HPOA 2VNCA 1U30A 1Q6DA 4BQ4A 1TA3A 4BCEA 1AQMA 4W88A 1C91A 3VIOA 3UERA 1E3XA 1HKIA 3PTKA 3AICA 4EK7A 4E4PA 1HP5A 1C92A 1HF6A 1AVAA 2EEXA 4JCMA 2W61A 3HMCA 1PEZA 3ARYA 3MV11 3CUIA 1I75A 2D22A 2ZXAA 1QI3A 2BXYA 2YIHA 3EDJA 4JKKA 2J7CA 3EYPA 4B9ZA 2DIJA 1H1NA 2WKLA 1E3ZA 2VX7A 2QV4A 1MFUA 1V03A 5M3WA 4A3HA 2X8RA 4TVDA 3GXMA 1AQ0A 1UA3A 3WMCA 5CQ1A 3CH9A 3T0DA 3OIHA 3CMGA 1GNXA 2QLYA 3L2LA 3U7BA 1Q6FA 2DSWA 1WCGA 1E43A 1WPCA 4OJYA 2E9MA 4PMDA 1VBUA 2Y4SA 1HVQA 1R8LA 4JFWA 1JAKA 5CPTA 2YJQA 2D23A 3APGA 4GKLA 1W1VA 3VNZA 2VZOA 2D3NA 2JF7A 1CXKA 1HKJA 2NT1A 2WSKA 5D9MA 4C7GA 4AZ6A 1GUVA 4QFUA 3MO4A 3RMEA 3ZT7A 4AISA 4DUXA 2ZUNA 5A94A 2EPNA 4GXPA 2ZXQA 1UR9A 2O9OA 1UR4A 1JNDA 4E8CA 2DSVA 4F66A 1UQZA 3VNYA 3VOCA 3WDRA 1QHPA 2Y2WA 1GQKA 4GINA 4AXNA 1C8YA 2YDSA 1UG6A 4Y7EA 2V5DA 3CUJA 3AIRA 1DWHM 4MAZA 4X0NA 1OIFA 2ZUTA 4ZE4A 1X6NA 2BV9A 5D8WA 2BY3A 4QCEA 5BXTA 2EPOA 1NWSA 1E6SM 2WK2A 3IANA 3OZOA 3LPFA 2CESA 3SCTA 2QHAA 1DWAM 4KH2A 1EOMA 3WELA 4ACZB 2J7FA 5DT7A 1LF1A 4UFKA 1TE1A 2E40A 4D6CA 4AZBA 4PEEA 4W7VA 4M80A 1XSJA 3NJ3A 3GH7A 4W5ZA 1DWIM 2WAGA 2VUYA 5A6LA 2E9LA 4JIEA 1KR1A 3WMBA 3A4AA 4D6FA 3LPOA 1JYXA 3OBAA 5A8MA 2ZX9A 1MW3A 1W9PA 3AXHA 1ISWA 1JI2A 4W93A 4X9YA 1HIZA 1UKQA 1HL9A 2ZX6A 3MV01 3VD9A 4J3UA 3VD3A 2WWDA 4FLOA 4H8HA 3ZMRA 2VOTA 3S6TA 3UESA 1GHSA 2WC3A 2G8ZA 3WH8A 5FL0A 3WH7A 1J0ZA 4KWUA 2CBJA 3AHZA 5DO8A 1V3LA 2PB1A 4LXFA 1ZBCA 3DHUA 1E1FA 3ZR6A 2OLHA 7A3HA 4UOJA 3OLGA 1UWQA 5GQBA 2WBKA 3AXIA 2VZTA 3FHQA 3I3DA 1EIBA 1H49A 1QNPA 2XFFA 1QBBA 3WNKA 1W91A 1MW1A 2XWDA 3L4YA 2VL4A 1JZ6A 1E6ZA 1AMYA 4W5UA 3VM5A 1J11A 3L4XA 3W29A 3VMNA 1TVPA 2XM1A 1CGTA 1I1WA 1OINA 1V6YA 4H2CA 3WD2A 1EQPA 1XH0A 2G41A 4CU8A 1RD6A 1TCMA 1JDDA 5AC5A 1Q4NX 3NSNA 4V28A 2ZXDA 5CPQA 2W67A 3PZTA 1CYGA 3WEOA 1JGIA 2YA2A 4NZCA 1VEMA 3ZJ7A 2WCAA 4YHEA 5LA1A 4GO8A 2BFGA 4H8VA 5DT5A 4D6HA 3PZMA 3WD4A 1VIWA 1TA3B 2CYGA 2C8NA 3GXIA 4RL3A 5I5RA 3POHA 4MB3A 1HJWA 3TTQA 2D20A 1TG7A 5E6ZA 3VGHA 1B0IA 1CXEA 2IUZA 3SCUA 3F5LA 2D1ZA 1O6IA 1JXJA 2WW5A 3W26A 3WQVA 4PCSA 3F5JA 1Q6CA 1Q6EA 3ZSTA 1B90A 3T0AA 1J12A 5E0FA 4FF5A 3OGSA 3RPMA 3WFZA 4CCEA 5AYIA 5I2UA 1EO7A 3GDBA 1HNYA 4KMQA 1CTNA 1VAHA 1CGYA 4AY1A 1J0KA 3WDJA 3WDHA 2V3EA 4P7OA 2XSBA 2DEPA 2YLLA 1JD7A 2G4FA 4UNIA 3MU7A 4Z2JA 1EHAA 1EOKA 3IJ9A 1UD5A 1XC6A 1B31A 1CDGA 1PX3A 1XYFA 4GPNA 1EA9C 1UD2A 1FOBA 4TX6A 1Y7VA 1G5AA 6TAAA 1E4NA 4PMXA 3M6DA 2WMGA 3ZQ9A 1GOOA 2WMIA 3SUTA 4R27A 3B8SA 1M03A 1OGGA 4U31A 1V0KA 2XFYA 1V3MA 4TX8A 4TVCA 1E4IA 3ZT5A 4OUEA 1K9DA 4U5IA 1C7TA 1UZ4A 1J18A 3CZJA 4CN4A 3AHXA 3AIEA 3BSGA 2A3CA 2ZUVA 4MDPA 4QLJA 1EHNA 4EAMA 2WXDM 3AIVA 3WY1A 3N1AA 3BGAA 3WEMA 3CHFA 3A6OA 1BG9A 4M24A 4H04A 5FL1A 3FXYA 1V6VA 3BCFA 4ZXOA 3SCOA 5CGMA 1TFVA 4UQ9A 4HOZA 3ARTA 2GVYA 3GXDA 3HJEA 2EJ1A 3CZGA 3G6MA 1NWUA 5FD0A 4XZBA 3O2LA 3GZAA 4UR9A 1D3CA 5C71A 1XV8A 3WF0A 2VVNA 2D24A 3ZOAA 1BF2A 5C70A 1H5VA 3FAWA 3D5HA 4TOQA 5A69A 4CCDA 1F4HA 3EDFA 4U2ZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3N04 A;  4W8B A;  4AW7 A;  2VRQ A;  5EMY A;  4NF7 A;  5EB8 A;  5DFA A;  3NYD A;  2JIE A;  1VBR A;  3AS0 A;  4AWE A;  2VZV A;  3T2Q A;  4B3K A;  1UR1 A;  3N11 A;  4CD8 A;  4M29 A;  2VI0 A;  3AZT A;  4XUY A;  3SUW A;  2WNW A;  3ZM8 A;  1A47 A;  3K8M A;  3M46 A;  5IXE A;  1E4M M;  2PWG A;  1FFQ A;  3B9A A;  2A3B A;  3GH5 A;  3NDZ A;  4U3C A;  3EDE A;  4JKM A;  4JFU A;  4D72 A;  2DSK A;  4AD0 A;  2YKK A;  1V02 E;  4P7Q A;  2YBT A;  1GHR A;  1ODZ A;  3ARR A;  3PZO A;  3PHA A;  1MXG A;  1H0G A;  4CU7 A;  2PC8 A;  1PX8 A;  1LG2 A;  4HU8 A;  4W7U A;  5E70 A;  3UG3 A;  1BYA A;  1QW9 A;  1CGW A;  4PTW A;  4AEE A;  2BHZ A;  4MB5 A;  5CXP A;  4HOW A;  1XH2 A;  3MMD A;  1E15 A;  2BVT A;  3EMQ A;  4OOU A;  2WCG A;  4P8U A;  3ARS A;  2ZXB A;  4PUD A;  1E6R A;  4OKD A;  3GTN A;  4YPJ A;  1VJZ A;  4U5K A;  2YL5 A;  2PWE A;  3GXF A;  3FN9 A;  1ZB5 A;  2WSP A;  3K46 A;  5D9P A;  3OGR A;  5AC4 A;  3AI0 A;  3THC A;  3AMC A;  1BPL B;  5ABF A;  3BMW A;  4DUV A;  2J7G A;  2G3M A;  1UH4 A;  5I24 A;  2BHY A;  1XCW A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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