3WUHA

Qri7 and amp complex
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
376
structure length
344
Chain Sequence
KGYKVLAIETSCDDTCVSVLDRFSKSAAPNVLANLKDTLDKAHIHHQARIGPLTERALIESNAREGIDLICVTRGPGMPGSLSGGLDFAKGLAVAWNKPLIGVHHMLGHLLIPRMGTNGKVPQFPFVSLLVSGGHTTFVLSRAIDDHEILCDTIDIAVGDSLDKCGRELGFKGTMIAREMEKFINQDINDQDFALKLEMPRNMLSFSFSAFITALRTNLTKLGKTPEREIRSIAYQVQESVFDHIINKLKHVLKSQPEKFKNVREFVCSGGVSSNQRLRTKLETELFNFYYPPMDLCSDNSIMIGWAGIEIWESLRLVSDLDICPIRQWPLNDLLSVDGWRTDQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Metal binding protein
molecule keywords tRNA N6-adenosine threonylcarbamoyltransferase, mitochondria
publication title Structure of Saccharomyces cerevisiae mitochondrial Qri7 in complex with AMP
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 103
structure length 344
sequence length 376
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.234: N(6)-L-threonylcarbamoyladenine synthase.
pdb deposition date 2014-04-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00814 Peptidase_M22 Glycoprotease family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3wuhA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3wuhA01
3WQTA 3VGLA 2P9PB 3VEOA 2GUPA 3FZKA 3VGMA 3DXMB 3SMSA 2E20A 3I8BA 4IO8A 1Y64A 1GLFO 5LJWA 3UB5A 2VCPA 1Z6RA 5F2RA 2A3ZA 2FSKA 1ESVA 3A0IX 5AZJB 4BRPA 2EWSA 1NGGA 4PKGA 4FWSA 3BUZB 3ENOA 3LL3A 3VEZA 4IJAA 4BGAA 1HPMA 4BC3A 5BR9A 4H5NA 2WUSA 2CH6A 1Q18A 2V51B 1IG8A 5AQYA 5AQXA 1XC3A 3ZEUA 3H3OB 3KVGA 3SLCA 3QICA 3I33A 3J8AA 4M63C 4FOIA 2P9KB 2GELA 3DXKA 4A62A 1MWMA 3MDQA 4BQLA 3FZFA 1V4TA 3VEYA 4GY2B 2PBDA 3HI0A 1GLAG 1TYQB 5KPRA 2IVOA 1KAXA 4FWQA 4WYBA 1NBWA 1NGBA 3SJHA 1K8KA 3DXMA 1YXQA 1V4SA 3FFKB 3D7EO 3FZLA 1BWFO 1OKJA 2HF4A 2P9LB 4ISEA 4NO7A 5AQHA 5AZJA 2NRHA 4BQZA 1QQNA 1RDWX 3LM9A 4BC5A 4EHTA 4QS9A 5AQGA 3LDPA 5KPTA 1U2VB 4H0PA 4H0VB 3GG4A 4FWLA 4QS8A 4BRDA 4CZEA 3QB0A 1DKGD 4NB4A 1NGFA 1H1VA 1BUPA 3QDKA 4BRFA 3H1VX 4JHDB 3RSEB 5KQDA 3AAPA 3TPQA 2HOEA 3MN7A 3A5LC 3UKRB 3AARA 3GDQA 1E4FT 1TYQA 3HSCA 3U9ZA 5F0XA 1NGIA 4CZLA 5AQSA 4A2BA 2E1ZA 3DWLA 2ZWHA 5EOYA 2Q2RA 2GEMA 4FPAA 1NWKA 2NLXA 5AQKA 3QBXA 3BEXA 5B8HA 3WXJA 4O8KA 4FWKA 4YDUC 2YHWA 2I7NA 4PL8A 3QMLA 4MO5A 3OHRA 2P9LA 5TKYA 3F9MA 1X3NA 4EFHA 4PKHA 3QBWA 3U4LA 1LOTB 2HF3A 4BVOA 3UE5A 3ATUA 1MA9B 3SMPA 5EY4A 2D1KA 2QWRA 1HLUA 4FWPA 4BR2A 2V7YA 1U2VA 2GTDA 5BREA 3O1BA 2Q0RA 1LCUA 3FE1A 5AQFA 2CGJA 3A5OC 4B1XB 4B1VA 4ISGA 5BN8A 2GWJA 3LDLA 2Q31A 1JCGA 4JHDA 3RSEA 3UKRA 4BRHA 2E88A 2HMPA 4BRNA 1E4GT 4BRGA 2CGKA 3TU5A 2E2OA 1NGCA 2FLOA 4FL9A 4O5FA 4FWOA 3SK3A 5KPZA 5BN9A 2YI1A 4AM6A 2NZTA 3CJBA 3ULEB 4WQ5C 1K8KB 3VEWA 3A5MC 2E1YA 5E26A 1ATNA 5AQVA 2P9IB 2V7ZA 1NGAA 5AQOA 4B1ZA 4FWRA 3ZX2A 4FPBA 4GNIA 5AQMA 4RWTA 2Q97A 3P4IA 1NLVA 3LDOA 3W3DA 2BUPA 3L6QA 1HUXA 4IWVA 3U9DA 4BG8A 1RFQA 2IIRA 2Q0UA 2VYPA 2AA4A 4DB3A 3VEVA 3BF3A 1RGIA 3VF4A 5BRDA 5LY3A 4BC2A 3C0BA 3GE1A 4EIAA 5AQTA 4BRLA 3O5BA 5ADXH 4B1WB 2A40A 1NGJA 3EKSA 4EHUA 3M1FA 4IJNA 5FPDA 1C0GA 3CJCA 4H0OA 4FO0A 1BG3A 5JMVA 3O8MA 3O80A 4K42A 1JCEA 3H6EA 1NGHA 3ULEA 2FSJA 2D0OA 2PAVA 1KAYA 2W40A 1Z05A 3QFPA 5LJVA 2P9IA 1MWKA 3EL2A 1HKBA 1WOQA 3L0QA 2QWMA 3L4IA 3AY9A 2E2QA 1KAZA 1ZC6A 1S3XA 4BR5A 2D0PA 3FR0A 2QWPA 5ELZA 3MCPA 3CJ7A 3M3ZA 2Q1NA 2W41A 4CZHA 3WXKA 1BDGA 4BR7A 3GL1A 2F9WA 5FPNA 1HX1A 3CHWA 2UYTA 2CH5A 1QZ6A 3H1QA 3CI5A 3CIPA 3GBTA 4BG9A 2QM1A 3R6MA 3W0LA 2FF3B 3LDQA 2ASOA 3MN5A 2E2NA 4M7XA 4BR9A 4WQ4A 4Z94A 2QWNA 3D2FB 2GWKA 3EZWA 4PKIA 3GOIA 3O6WA 1MDUB 3A5NC 2D4WA 4CI6A 2Q36A 1GLCG 2VWBA 5AR0A 1D4XA 5EVZA 4CD3A 3MK6A 3WEEB 1BA0A 3IFRA 4FWMA 1ATRA 4A2AA 2A5XA 5EXWA 1GLLO 1G99A 5EX5A 4I6MB 1S22A 3CQYA 4BR0A 3H3NO 4QS7A 3VESA 4IZ9A 4A61A 4LC9B 3UKUB 4WQ5A 5KQ8A 4CZGA 4H5RA 4L3QA 3VETA 2YHYA 4C23A 3G25A 2YJEA 4MLEA 2J4RA 4BRQA 5AQPA 5BRFA 3WT0A 4CJ7A 2H3GX 1DGKN 3CETA 4XH1A 4CZIA 3JXUA 2FF6A 1JCFA 2F9TA 3VGKA 3D2FA 2OANA 1C0FA 2YCHA 4K41A 4K25A 5AZIB 3HZ6A 4CD1A 5BPLA 4FSVA 4RTFD 3VF2A 3KHYA 2QWQA 1IJJA 3DAWA 3ID8A 3VERA 3U8XA 5JLFA 3WXIA 5AQIA 3FGUA 4H5WA 3WEEA 3JS6A 4PL7A 1T6DA 1YUWA 3D2EB 3ENHA 1J6ZA 2FSNA 4J8FA 4H0YB 4MLHA 5AQLA 5ADXA 2AP1A 2BTFA 3A8YA 2ITMA 1T6CA 4I6MA 5CE3A 1GLJO 3KZBA 4FOEA 2IVPA 2KHOA 3LDNA 3UKUA 3ZX0A 4BROA 3ATVA 3M6GA 4H0TB 4EAHD 5BRHA 4BRMA 2QWOA 4H5TA 1GLDG 5AQUA 4CBUA 4BGBA 4JAXA 3CQXA 1QQOA 1YVNA 4KBOA 1TUYA 4JNEA 4K43A 2FXUA 5FPMA 2ZF5O 4BRIA 5AQJA 3HTVA 5AZIA 3WXLA 4BC4A 4BR4A 4DHYA 4JD2A 1QHAA 4ISFA 3WQUA 3S41A 3MN6A 3B8AX 4HTLA 1SQKA 1P8ZA 2YHXA 5AQRA 3D2EA 4M7YA 3O1WA 3CJ1A 2P9NB 5AQWA 3H46O 4IXCA 4Y0WA 1BOTO 2P9PA 3MN9A 1ATSA 2YJFA 3BP8A 1U6ZA 3CJAA 5I9EB 4B9QA 4BREA 3IDHA 1T44A 4CZFA 1QQMA 3C7NB 1BA1A 1HJOA 3EN9A 3FLCO 3FZMA 1X9JA 3EKUA 2ASMA 3ZETB 1GLBG 3BF1A 1X3MA 1ZXOA 4XH5A 3MMVA 1NM1A 4H5VA 4YDUA 4CZKA 3VENA 4CBXA 2P9UB 3HBTA 2P9SB 4DCHA 1NGDA 4H0XB 4XH4A 4CBWA 1XQSC 3FZHA 1NGEA 3R9PA 2ZGYA 2P9KA 1KXPA 2I7PA 4B1UB 3HM8A 1BU6O 1XUPO 3AAQA 1GLEG 5E84A 3IMXA 3VPZA 1TUUA 3CJ9A 3WUHA 4BRCA 5AQQA 2P9NA 4E1JA 1QZ5A 5JICA 4XEIA 1R59O 4BVPA 3O08A 4HWIA 3IUCA 1WUAA 3C7NA 1ZBSA 4RCHA 2QWLA 2DPNA 4BRAA 2CGLA 4MO4A 4CZJA 3ZETA 1NMDA 2ASPA 3LM2A 4WQ4C 5F1XA 1YAGA 3O4WA 2V52B 4FWNA 3DJCA 4B1YB 2P9UA 2P9SA 5AQZA 4JN4A 2A42A 1DEJA 5AQNA 5FPEA 4CZMA 4DQ8A 3H45C 2ZGZA 5AFUA 1BO5O 3ZEUB 4F9OA 4H03B 4BRKA 2E8AA 2QXLA 3ZX3A 4AM7A 1EQYA 2E2PA 1SAZA 5AFUH 2A41A 3DXKB 2IVNA 3R8EA 3VOVA 3VEXA 1SZ2A 4JD2B 3QFUA 1CZAN 2A6AA 3CERA 3EO3A 5BPNA 1HKGA 1HKCA 2QW9A 5JLHA 3VF6A 5BPMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YHBA 2P9PB 3VGMA 3SNNA 3ZSXA 2PY5A 3CC4N 3LAKA 4KTQA 1JLEA 3CM5A 3TAMA 5C25A 4CEOA 3K59A 4Z4IA 3A0IX 1LAVA 4NYFA 5AZJB 3OYDA 3SZ2A 4DTSA 2EWSA 4FWSA 4MDBA 4JKDA 3VEZA 1N34K 4ELUA 4NYNA 2WUSA 3V1QA 3IAYA 2O8EB 2V51B 2XY6A 1NJYA 4BDYA 5AQXA 1RNHA 4DMNA 3QICA 3PO5A 5JVGL 4FOIA 2P9KB 3DXKA 3TTDA 2WTUA 4A62A 1MWMA 1IH7A 1S1UA 4FLWA 3TI0A 2HMIA 3RR7A 2PBDA 1CLQA 5GAGP 4FWQA 1X9MA 1NGBA 4GKKK 5M1PA 1VQ8N 1VQ4N 3HSTB 1M90O 2EX3A 2JWKA 3T7ZA 1LWFA 4CJRA 3SUNA 1TKDA 3D7EO 4DR2K 2XY7A 1N36K 2HF4A 4L8RB 3NVKA 1FKPA 4BQZA 4F4KA 1RDWX 3ZCMA 1TL3A 4GW6A 1JLBA 1D9FA 1OH5A 1U2VB 4DV0K 2HBJA 4QS8A 4BRDA 4CZEA 2VG5A 3L2UA 3N4PA 3LP3A 2W6LA 3OS1A 4LH4A 4KB0A 4OO1J 3QEVA 2XY5A 3KK2A 4N5SA 2HVIA 5KQDA 3AAPA 3HVTA 3TARA 1YI2N 3VQAA 2KFZA 1YT3A 1E4FT 1CZ9A 4O0JA 5F0XA 4CZLA 2E1ZA 3H08A 1KCFA 3DWLA 4KTWA 4JRQA 2Q2RA 3K9JA 4FPAA 2XHBA 3QBXA 1TK0A 2HHHK 3CFOA 3TSPA 4O8KA 1I94K 3KLGA 4MO5A 1C1CA 4CJTA 1JL2A 2HF3A 2Q3SA 1W2BM 3UE5A 3JSMA 3AA3A 4NCGA 2D1KA 4CCHA 4CFCA 2KFNA 4BR2A 1TV6A 1KFSA 4FJXA 4DV2K 1N32K 2BE2A 2Q0RA 5KTQA 1LCUA 1RDAA 1RBTA 3THVA 2CGJA 3AVKA 1JLAA 2QK9A 4ISGA 4DR3K 4IFVA 5J2QA 2HSTA 3AVAA 5GAEP 3UKRA 4BRHA 1LWCA 4BRNA 2HMPA 1E4GT 4CIFA 5HRNA 2CGKA 1BIZA 1NGCA 4JK7A 3SK3A 5KPZA 4FJMA 3NMUA 5BN9A 3O3HA 4WQ5C 3VEWA 5AQVA 1NGAA 4I9QA 2G8KA 4FWRA 3ZX2A 5HRPA 4GNIA 3WNFA 3P4IA 4KI4A 4CFDA 3K0SA 3DLRA 4IWVA 3U9DA 1RFQA 2IIRA 2Q0UA 2VYPA 3ASMA 4DFMA 2D0AA 4K0KK 3BF3A 5BRDA 3OYIA 4JK9A 4BC2A 3CFRA 4CEFA 3AGRA 4BRLA 3O5BA 1TVRA 5ADXH 4JI7K 3PLAA 4ILHA 3NH0A 1BHLA 4W5NA 3I0RA 4B08A 5CY4A 4KO0A 4AHRA 2PFUA 1NJWA 4CFBA 3QIOA 1X9WA 1JCEA 3H6EA 2O8CA 2X6NA 2Y1IA 4M45A 4F2RA 4E3SA 1LV5A 1WOQA 3L0QA 4LSNA 3HOSA 4KHQA 3C65A 4KI6A 1ZC6A 1Y97A 4O4GA 2QI2A 5M1NA 2D0PA 2QWPA 1SUQA 5IWAK 1IO2A 4CIGA 2O8DA 3S3NA 4F3OA 2W41A 1NK4A 3VA3A 3GL1A 2WOMA 3VTHA 4B3MK 2KLAA 3O3GA 3DLKA 1HX1A 1ASWA 2UYTA 4HCCA 1VSDA 3CCRN 3H1QA 3CIPA 3GBTA 2HHVA 1OH7A 4CEAA 2UXBK 4U7BA 3ULDA 2FF3B 4WF9L 1WSJA 4DG1A 3KK3A 3MN5A 2E2NA 4C8NA 4IOCL 2QWNA 3F73A 1VQMN 1VHXA 1KTQA 2I5JA 4B9MA 4R5PA 3Q7CA 4GV6A 4YY3K 3GOIA 1MDUB 2E6LA 1U47A 1GLCG 2FBYA 2VWBA 1NK6A 3WEEB 3C6HA 2YNHA 3IFRA 2A5XA 2P51A 2G8VA 3VQEA 5EX5A 1ZBLA 3VN5A 3CQYA 3VESA 3WNGA 3UKUB 1XHXA 1T05A 4C23A 3VA0A 2YJEA 5AQPA 4CECA 2H3GX 1DGKN 2FF6A 1HYVA 4FJNA 3LWLA 5KRTA 4DSEA 4KFBA 4DSFA 4CJEA 2OANA 1VQ7N 1C0FA 1YHQN 4I7FA 1SKRA 1EX4A 3E66A 2DY4A 4CD1A 1HNIA 3NFAA 3KHYA 3DAWA 5JLFA 5AQIA 3FGUA 1S9GA 2X74A 3D2EB 4CGHA 1NG9A 4ICLA 1GOBA 4MLHA 5ADXA 1QVFM 2AP1A 3CCMN 1T6CA 3PO4A 5GIPA 1BCMA 4F2SA 4E1MA 2Z1HA 4DTXA 3O9QA 1R0AA 1EETA 4E7LA 2P5OA 4JS5A 3V9SA 1MU2A 3T69A 2A1SA 4BRMA 4H5TA 3P31A 1J53A 4JKGB 3CQXA 1QQOA 3PIOL 1YVNA 3HPGA 4DV7K 1OH8A 4K8ZA 4FYDA 4E7KA 1YF5L 5HOOA 3EY1A 3CQ8A 4F8RA 2FXUA 5FPMA 3NGIA 4UY8O 3C6AA 1FW6A 4JEPA 3TWHA 3P83D 1EP4A 4BC4A 4DHYA 3AVLA 4KV8A 4IDHA 1QHAA 4ISFA 1VQ6N 4FW2A 4F3TA 4HTLA 1LW0A 5DK5A 5AQRA 3KKRA 1WAFA 2P9NB 4Y0WA 1BOTO 3MN9A 1NJZA 3E01A 3HVRA 5CZ2A 1U6ZA 3MAQA 4DSIA 1T44A 4ZTJA 3FLCO 2QKKA 3P1GA 2ASMA 1VSLA 3ZETB 4B9SA 2IDOA 3BF1A 1X3MA 3CMEN 1NJIO 3RWUA 2OPQA 3HBTA 2P9SB 4DCHA 3CCQN 4CJSA 2G8WA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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