The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
|
sequence length |
82
|
structure length |
82
|
Chain Sequence |
NTQTVLPFTGLNTPSGVAVDSAGTVYVTDRGNNRVVKLAAGSNTQTVLPFTGLNTPSGVAVDSAGTVYVTDRGNNRVVKLAA
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
De novo protein
|
| molecule keywords |
pizza2sr-pb protein
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| publication title |
Computational design of a self-assembling symmetrical beta-propeller protein.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
10
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| structure length |
82
|
| sequence length |
82
|
| chains with identical sequence |
B, C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2014-06-17 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Beta Barrel | Thrombin, subunit H | Thrombin, subunit H |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3WWF A; 4ZCN A; 3WWB A; 3WW7 A; 5CHB A; 5F53 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3BEU A; 4ABG A; 1L1N A; 1C1W H; 1GJ7 B; 4OGY A; 2PP6 A; 1SR5 C; 2KCA A; 5EQQ A; 4K1T A; 2O8U A; 4FXG H; 1D3Q B; 4ACA A; 3BV9 B; 3TGI E; 1AN1 E; 5I25 A; 3A84 A; 2G00 A; 3TNS A; 5A0C A; 1FLE E; 2YMS D; 2ZPR A; 5F8Z A; 2R0K A; 1XUF A; 3RU4 T; 1XUG A; 1V2V T; 1GBL A; 4CR5 A; 1XKB C; 3MOC A; 1O2U A; 4O9V A; 2ZCK P; 5DP4 A; 2W6I D; 2BLQ A; 2PWX A; 3LJJ A; 1O2P A; 2R3U A; 1OYQ A; 1CBW B; 3V13 A; 3LOX A; 1O2S A; 1Z8J B; 1O5E H; 3LJO A; 4BAQ B; 4DT4 A; 3ATK A; 2A2X H; 1TRM A; 1G37 A; 2Z7F E; 2SGQ E; 2FEQ H; 3FP7 E; 3IWM A; 1GCD A; 3RXF A; 4UFG H; 4KKD A; 2FOF A; 5ABW A; 4FUF A; 4UE7 H; 1O2X A; 1MAX A; 1UW7 A; 2FO9 A; 5G4B A; 1GDU A; 3RXA A; 3GCN A; 3SJK A; 5JBA S; 1GJC B; 1QBN A; 1BTP A; 4ZUH A; 1MCV A; 1BA8 B; 1CT2 E; 1E1Q D; 1TMT H; 3D65 E; 3RMM H; 2UUK B; 1V2O T; 1P57 B; 1F5L A; 3GCT F; 3MU5 A; 1ZHP A; 4KGA A; 2PTN A; 2QXI A; 2ZEB A; 1P2I A; 5HIY A; 3VGC B; 5HYO A; 4XBD A; 1N6Y A; 4GPG A; 1Z1J A; 5EU8 A; 3Q00 A; 1PQ8 A; 3ENS B; 3NWU A; 4ACB A; 3F6U H; 4TY6 A; 5EGM A; 1O2O A; 2RA0 A; 3VPK A; 3MI4 A; 1DPO A; 1W0Z U; 2SNV A; 2SGA A; 2OCV B; 1EAX A; 2ZU3 A; 1HAI H; 2BZ6 H; 1OWI A; 4ABH A; 3RXM A; 4X8S H; 1V2W T; 1E1R D; 1IQH A; 3RXO A; 4DGJ A; 2NU1 E; 3RXV A; 4JK6 A; 1A0L A; 4J1Y A; 1A46 H; 1A5G H; 1V2U T; 2PGB B; 1HB0 B; 1O3E A; 1Q3X A; 5CE1 A; 3B9F H; 3VB3 A; 1O2R A; 3AVZ A; 2BDY A; 2G51 A; 1AI8 H; 1A2C H; 3ODD A; 3QWC H; 1HUT H; 1HFD A; 4MPX A; 4MQA A; 1BJU A; 6EST A; 1HJA C; 5L2Y H; 5F6M A; 4JCN A; 3K65 B; 1CSO E; 2H9T H; 3ATM A; 2TGA A; 1ZGI A; 1EZX C; 3PWC A; 3BN9 A; 4H6S B; 3VB7 A; 1MBQ A; 1Y3X A; 1O3I A; 1O38 A; 1G32 B; 1GHB G; 2OC7 A; 2P16 A; 1OWD A; 3VXF H; 1NPM A; 1SGT A; 3RU4 D; 1T8O A; 1G9I E; 3URD A; 1YPJ H; 1Z1I A; 3PTB A; 2W5E A; 1GBC A; 1YPM H; 4PRO A; 2FYR A; 2HNT C; 1O5B B; 3F3B A; 2GZ9 A; 1H8H D; 4Y8Y A; 4KTS A; 5T3H A; 1TBR H; 3M5N A; 2R3Y A; 2WPM S; 3SO3 A; 1FN8 A; 1AE8 H; 3DHK H; 3SGA E; 1SHH B; 5DGJ A; 1UVP A; 5JYI A; 1F5K U; 3BEF B; 5JBC S; 1ZPC A; 4XSK U; 3TIT A; 1MAB B; 2J94 A; 1FN6 A; 1SGP E; 1XX9 A; 3UB0 A; 1AZZ A; 1JOU B; 4LK4 A; 1AUT C; 1H8D H; 3AAV A; 1O39 A; 2KR7 A; 2Q6F A; 2GCT C; 3ATW A; 1MTU A; 1RJX B; 1K28 D; 1AIX H; 2ANY A; 3CS7 A; 1C9T A; 1T4V H; 3E0P B; 1GJD B; 4OS1 A; 4BXW A; 1DLE A; 1TOM H; 1SBW A; 5C0T A; 3BTK E; 3GS9 A; 4VGC C; 1NT1 A; 1CBW C; 2EST E; 3LIW A; 3MNB A; 1IAU A; 3SNE A; 1EJN A; 1P05 A; 1OWH A; 1O2H A; 3RMO H; 4RKJ B; 2ZHW H; 1GI7 B; 1YCP K; 2BDA A; 4GAW A; 1Y5U T; 3KEE A; 1W3C A; 1HCG A; 3KHV A; 1ELF A; 1BHX F; 5HIZ A; 1QHR B; 1K0H A; 4X2V A; 1SMF E; 2VIP A; 1C5R A; 2FIR H; 1SGR E; 1ZSL A; 1Z8R A; 4YLU A; 5FPS A; 1AFQ C; 1EKB B; 2EI7 A; 1FY5 A; 1L1G A; 1QBV H; 1IHS H; 1SGD E; 3BTD E; 1QY6 A; 2ZGC A; 1XUK A; 2B7D H; 4MLF B; 3U8T H; 1UMA H; 1C5N H; 1P09 A; 5BRR E; 1W14 U; 2AH4 X; 3MFJ A; 1HAV B; 2QGR A; 3H7T A; 3BTM E; 1K1L A; 1NFY A; 5DPA A; 3UPE A; 4AOQ A; 1TGC A; 1HAG E; 1C2M A; 5E0J A; 1DE7 H; 4XDE A; 3PRB A; 3OTJ E; 1SG8 B; 2P95 A; 4IC6 A; 2QE7 D; 2IJO B; 1BUI A; 3FKS D; 2OIN A; 2XWB I; 1DM4 B; 3RC4 A; 4LZ1 H; 1WTH D; 3UNS A; 3GDU A; 2O8L A; 2O9Q A; 1K1P A; 1O2L A; 1TWX B; 2NU2 E; 2VU8 E; 1AGJ A; 1WTG H; 1B5G H; 2VWN A; 1DXP A; 1FY1 A; 1YBW A; 2QCY A; 4MG3 A; 3U9A H; 3HGN A; 3BSQ A; 2GP9 B; 1P06 A; 1XVO A; 1S6H A; 1TNH A; 2ZHD A; 3E0N B; 3DSP A; 3FAO A; 1O5F H; 1WAY B; 3RP2 A; 3TK6 A; 4FUG A; 1W2K H; 3GCT G; 2H2Z A; 3UR6 A; 2Z6B D; 3AAU A; 1VIT H; 2F4L A; 4FUJ A; 4BOH A; 1E79 D; 4NWL A; 1C2F A; 3GDV A; 1P2K A; 1ZRB A; 2ZGH A; 1MKX K; 3WWF A; 4ZXX H; 4A1T A; 2XTT B; 1YPL H; 4P02 A; 2PKS C; 5C5N A; 1KMH B; 4I32 A; 1N8O B; 1NU9 A; 1GHW H; 2PLX A; 3L6P A; 2HLD D; 4TYD A; 2FOD A; 2BX4 A; 2GMT C; 2VVC A; 1AKS B; 1CT4 E; 3FO8 D; 1O5D H; 4BTI B; 1SQR A; 1TGN A; 1NFW A; 2YMS B; 1O3P B; 4UDW H; 3GY7 A; 2P3F H; 2D1J A; 1TAB E; 3TH2 H; 1UTQ A; 2AIQ A; 3L33 A; 3FZZ A; 4CBO A; 5DP7 A; 5C94 A; 4Y10 E; 3PLP A; 2L6O A; 1C1Q A; 2O8W A; 3NPS A; 1KTS B; 1HXF H; 3L3T A; 4JYU H; 4RKO B; 2F9U A; 4B75 A; 4ISI H; 4A1X A; 1BIO A; 3DCL A; 1C2H A; 1SFQ B; 1H8I H; 4RT1 A; 1B0E A; 1F0T A; 4AFQ A; 2KAI A; 1UTM A; 3RXK A; 3F1S B; 3BTW E; 1W0J D; 1HYL A; 2HVY B; 4FVD A; 3A89 A; 3IIT A; 1TNG A; 1BMF D; 1KDQ B; 5HXF A; 3SV8 A; 2ALV A; 3CS0 A; 2KCY A; 3M7T A; 3T27 A; 5AHG H; 1H9L B; 2WZQ A; 1VCP A; 3OU0 A; 1H9I E; 4CRD A; 3ZZB A; 1KYN A; 1C5W B; 1O37 A; 1W13 U; 4UFD H; 4IGD A; 1THR H; 2R9P A; 3F9F A; 4JZF H; 4FUE A; 2QF4 A; 5JDU B; 1HAP H; 2BQW B; 4Y6D A; 3EA9 A; 3ZZ6 A; 1C2K A; 3RXG A; 2BD9 A; 3S7H B; 3KQ5 A; 3SJO A; 5F8X A; 1UTO A; 1C2L A; 3KQC A; 4K8B A; 3F0O A; 3VEQ B; 1SFI A; 2F43 B; 2QF0 A; 3CP7 A; 1IQI A; 1GI3 A; 5DJ7 A; 3ZVE A; 3A8C A; 4CHA C; 2OTV A; 1SSX A; 1QQU A; 4DY7 B; 1QUR H; 2Y5F A; 3SJ8 A; 3UR9 A; 2GT8 A; 3S69 A; 1TX6 A; 2ZPS A; 2AGI X; 1GJA B; 3KQD A; 1LVM A; 1GVK B; 1Z8G A; 1N6X A; 2J5U A; 3ZZ4 A; 3UNQ A; 5IK2 D; 1GBF A; 2BY8 X; 1BTW A; 2HGT H; 1C5Q A; 3SYJ A; 3R0F A; 1TBQ H; 3FN8 A; 5GDS H; 3N7D A; 1X7A C; 1GDQ A; 1YLD A; 2FOG A; 5DP5 A; 5DP9 A; 5C0U A; 5EPY A; 1FMG A; 1V2R T; 4AC9 A; 2VWL A; 1HDT H; 4FVB A; 2VBC A; 1NRN H; 4GHQ A; 1HJ8 A; 3NZI A; 4MDS A; 1A0H B; 2PTC E; 5EOD A; 1OXG A; 3DSG A; 1DOJ A; 1ZSK A; 4XRN A; 4OS6 A; 2STA E; 1LHD H; 1YC0 A; 1EST A; 2ZEC A; 5DG6 A; 1ZTK A; 1UTL M; 3TVJ B; 2THF B; 4K5Z A; 3WW7 A; 3SU6 A; 4JYV H; 2GCH G; 3KL6 A; 3P8G A; 2M2A A; 3LDX H; 4IN2 A; 1TPO A; 5L6N H; 4LZ4 B; 4DII H; 1OP0 A; 1P0S H; 4I8G A; 3VB6 A; 4I8K A; 2F3C E; 3UOU A; 3B8J A; 3BTE E; 5T6F A; 4X2X A; 4E05 H; 2A7H A; 3QK1 A; 6CHA B; 1O2Y A; 4THN H; 3BIU H; 3GOV B; 2F9N A; 1TFX A; 3SV6 A; 4U01 A; 4X6P A; 1SGF A; 3KN2 A; 1TMB H; 4DUR A; 1QCP A; 1IOE A; 1D3D B; 1UVO A; 2VH0 A; 3GY4 A; 4JMY A; 4DCD A; 4HTC H; 3ZZ7 A; 1LQD B; 3A7V A; 3P17 H; 1E0F D; 4YT6 H; 1IQG A; 1EP5 A; 1XVM A; 2ZFT A; 3SNC A; 4TWY A; 2OD3 B; 3S0N A; 1ELG A; 2V7Q D; 1Y59 T; 3S7K B; 3ZVC A; 1FAX A; 1V2P T; 5E2O A; 1MUE B; 1VIT F; 1O2Z A; 1PQA A; 4Q63 A; 1G2M A; 2XBY A; 3FP8 E; 5ETX A; 5EQS A; 2A31 A; 1KDQ A; 2ZGX H; 1TGB A; 2VIQ A; 2Q1J A; 3LC3 A; 1EZQ A; 1ZTL A; 3PV4 A; 3STI A; 1XXD A; 1ELT A; 1TYN A; 1TBZ H; 3S9A A; 4U2W A; 4DVA U; 3SNA A; 3F68 H; 4INH A; 5FPY A; 3N99 A; 1AVW A; 3M61 U; 1O35 A; 1EOJ A; 1SVP A; 1J14 A; 1YPH C; 2BOH B; 1O3N A; 2ZDK A; 1EJM A; 2UUF B; 1MD7 A; 1QGF A; 1SC8 U; 2HNT E; 1GBJ A; 1MBM A; 4IC5 A; 1FAK H; 1E36 B; 2FZZ A; 4K60 A; 1VJA U; 1MCT A; 1C1U H; 1D3P B; 1NRS H; 2QXJ A; 5FAH A; 1V2L T; 1MZA A; 1TRN A; 1G3B A; 1DAN H; 1KTT B; 1IHT H; 2P3U B; 1NFU A; 3PM3 A; 2UWP A; 1PQ5 A; 2BM2 A; 3BG4 C; 3M3S A; 3RLY H; 1RTK A; 3MMG A; 3OAA D; 4J2Y B; 2BY6 X; 7GCH G; 3ITI A; 2W26 A; 1W0Y H; 2DE8 A; 3RML H; 1RD3 B; 1N1L A; 1TGT A; 1HAY B; 1ZRK A; 2ODY B; 3RXQ A; 1ANE A; 1FXY A; 5F03 A; 2ZI2 H; 3SQH E; 2BDG A; 3LGT A; 1AO5 A; 1KLJ H; 2GKV E; 1G3D A; 3SGB E; 7KME H; 5AFY H; 4JZD H; 2IN2 A; 1A3E H; 2ZKS A; 3PYH A; 2ZP0 H; 1O2W A; 3GIC B; 2A4Q A; 2GZ7 A; 1Y3W A; 2VWM A; 4Y0Z E; 3FZD A; 1HJA B; 2KFW A; 1ELD E; 1AVX A; 2FWW A; 1K1O A; 2FOH A; 4K2Y A; 4FUD A; 1AMH A; 1KXA A; 1GI9 B; 1FIZ A; 1MKW K; 1NBM E; 1S0Q A; 3OEH D; 2F9B H; 1QJ6 B; 4X0W U; 1OP2 A; 2IJD 1; 1KY9 A; 2FP7 B; 1AND A; 1K21 H; 4ABE A; 3F9G A; 1FIW A; 1NN6 A; 3SI4 H; 3F2G A; 1S6L A; 1JWT A; 2BHG A; 4ABJ A; 1GMC F; 1TON A; 5GPI B; 1C5O H; 1A4W H; 2ZGJ A; 2BZA A; 3UTU H; 2UWO A; 3UIR A; 4WME A; 4XFQ A; 3SHC H; 4B2C A; 3VB4 A; 5LPE A; 4Q80 A; 2EA3 A; 2BX3 A; 5DN6 D; 2BD3 A; 3SUD A; 2GCT B; 2J98 A; 1G36 A; 3ZVA A; 4YXW D; 1SGQ E; 1PPH E; 3A8D A; 3UQV A; 2OP9 A; 4A6L A; 1D9I A; 4GHT A; 4AG1 A; 2CXV A; 2O8M A; 4BAH B; 4D8N A; 3ZV8 A; 2BY9 X; 4VGC B; 4WH8 A; 4ABF A; 1D4P B; 1HLT H; 1C1R A; 2CF8 H; 3SV7 A; 1UCY K; 9LPR A; 3LON A; 5GWZ A; 4Q7Z A; 2P59 A; 4FU9 A; 3RM0 H; 3DFJ A; 3TK9 A; 3P8N A; 1A3B H; 3RXB A; 3N7E A; 1SGE E; 1V2N T; 5GCH F; 3SN8 A; 2G8T A; 3NCL A; 1PQ7 A; 2WV5 A; 2WUB A; 3WWB A; 3F9H A; 4Y76 A; 1AFQ B; 1NRQ H; 2I6Q A; 4Q7Y A; 1MQ5 A; 1PPF E; 2Q6G A; 1NS3 A; 3OE7 D; 4ZHL U; 4WXI A; 3QUM P; 1KXF A; 5FXL A; 1T8N A; 1DFP A; 2FES H; 4I8L A; 2NU4 E; 3OX7 U; 3MH7 A; 1VIT G; 3FP6 E; 3Q3K A; 3EGK H; 5C1U A; 1CHO F; 3UOP A; 1ESB A; 1EAU A; 4JZ1 A; 1UHB A; 1INC A; 1GHZ A; 3RXS A; 2WYJ A; 1SPJ A; 5SGA E; 1P9U A; 2FS9 A; 6GCH G; 1O2K A; 4AYV B; 2FX4 A; 3MNS A; 5GXP A; 3OFN D; 1K1I A; 1J17 T; 3PRO A; 3SJI A; 3PO1 C; 2LNC A; 3KID U; 1SB1 H; 3D23 A; 2ANK H; 4NA7 A; 1H9H E; 2HOB A; 1SGI B; 2PW8 H; 5EJL A; 3LH3 A; 1ZJK A; 4ZHM U; 1EPT C; 3K6Z A; 3M37 A; 1V2S T; 2BVR H; 3RXI A; 1ZYO A; 2FLB H; 3P70 B; 4D7G A; 1BTZ A; 1ANB A; 2VH6 A; 1EP6 A; 3KGP A; 3QZR A; 5C67 A; 1OWK A; 3PV2 A; 4GCH F; 3A80 A; 4H42 U; 3BEI B; 2JH6 D; 3A87 A; 3UUZ A; 2JJ2 D; 2KX4 A; 2PKS B; 1S6F A; 1T7C A; 1KXE A; 3K2U A; 4RT0 A; 2SGF E; 4YOG A; 3Q3Y A; 3ZYE A; 1HIA B; 1MMJ N; 2GMT B; 2ZF0 H; 2AGG X; 2VGC C; 1O2M A; 4ZAE A; 2RG3 A; 1QA7 A; 1YP9 A; 2SGD E; 3RXT A; 3SHA H; 5PTP A; 3TJN A; 1DIC A; 4B6E A; 2J2U A; 3FFG A; 1G30 B; 1K1N A; 1SOT A; 2TPI Z; 3E90 B; 1TAW A; 1TNJ A; 2BLO A; 1M9U A; 2Y80 A; 1TGS Z; 4AX9 H; 5CHA C; 4OS4 A; 1O3B A; 4MPW A; 3SUE A; 4HG6 A; 1ARB A; 1SLU B; 2XCN A; 5L2Z H; 3KYF A; 3TNT A; 2VIW A; 2ZTZ A; 1O3H A; 1P8V C; 2P94 A; 3SGQ E; 1W12 U; 1QBO A; 2GD4 B; 1QNJ A; 4RSP A; 4I33 A; 3VG8 A; 1TPP A; 1TLD A; 4X6N A; 1SLW B; 4WMD A; 1EZU C; 3A86 A; 2C8Y B; 2BMG B; 2XCF A; 2ZU5 A; 1YCP H; 4MPV A; 4D7F A; 1FI8 A; 2FTL E; 1Y8T A; 2ZA5 A; 4JYT A; 1TNK A; 2SNW A; 3EAJ A; 4NGA H; 3UQO A; 3TPI Z; 8EST E; 1GMC G; 4UFF H; 5K0H A; 4ABI A; 1O34 A; 5JPM H; 2QN5 T; 2ZHQ H; 2V3M A; 4HZH A; 1ZML A; 3T62 A; 3T2N A; 3V3M A; 4CH8 B; 5LH8 A; 2QXH A; 4OS2 A; 1A1R A; 1TQ7 B; 4X1R U; 5EIY A; 1JRS A; 3I29 A; 1GVL A; 4KTC A; 3F2H A; 3PLB A; 1GI8 B; 2LP6 A; 3SV2 H; 2ZCH P; 3URE A; 3T29 A; 4X2W A; 1O3M A; 1H4W A; 2K1Q A; 2D8W A; 3LH1 A; 4Y8Z A; 3EQ0 H; 3ZZ8 A; 4CHA B; 2RDL A; 1BTX A; 2P93 A; 4U32 A; 2ALP A; 1L4D A; 2VNT A; 1IQJ A; 3E1X B; 2P8O C; 3ZYD A; 3A85 A; 3A7W A; 2GT7 A; 1O3C A; 2ZC9 H; 3U1J B; 2G5V A; 4DJZ B; 2ZO3 H; 1C1V H; 4A92 A; 2VIN A; 1V6D A; 2CHA C; 1O5A B; 2FS8 A; 1FPC H; 5GCH G; 4X6O A; 1FY3 A; 1NZQ H; 4NIV A; 2C8X B; 3MH6 A; 3TH4 H; 1ACB E; 5HM2 A; 4NZQ A; 4ZH8 A; 3UNR A; 3A8B A; 4Q4L A; 3GCH C; 1DVA H; 3STJ A; 1VGC C; 3SZN A; 4HI3 A; 1NRR H; 4X8T H; 4CRG A; 1MKX H; 4MNV A; 1EQ9 A; 1GBA A; 2XC5 A; 5LGO A; 1TNL A; 2CJI A; 1DWD H; 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