3ZIZA

Crystal structure of podospora anserina gh5 beta-(1,4)-mannanase
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
345
structure length
345
Chain Sequence
SAKVSGTRFVIDGKTGYFAGTNSYWIGFLTNNRDVDTTLDHIASSGLKILRVWGFNDVNNQPSGNTVWFQRLASSGSQINTGPNGLQRLDYLVRSAETRGIKLIIALVNYWDDFGGMKAYVNAFGGTKESWYTNARAQEQYKRYIQAVVSRYVNSPAIFAWELANEPRCKGCNTNVIFNWATQISDYIRSLDKDHLITLGDEGFGLPGQTTYPYQYGEGTDFVKNLQIKNLDFGTFHMYPGHWGVPTSFGPGWIKDHAAACRAAGKPCLLEEYGYESDRCNVQKGWQQASRELSRDGMSGDLFWQWGDQLSTGQTHNDGFTIYYGSSLATCLVTDHVRAINALPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords GH5 ENDO-BETA-1,4-MANNANASE
publication title Structural and Biochemical Analyses of Glycoside Hydrolase Families 5 and 26 Beta-(1,4)-Mannanases from Podospora Anserina Reveal Differences Upon Manno-Oligosaccharides Catalysis.
pubmed doi rcsb
source organism Podospora anserina
total genus 140
structure length 345
sequence length 345
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 2013-01-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3zizA00
1QNOA 3EDKA 5E09A 4M81A 3CHCA 4HOWA 1ZS2A 5GPRA 1GUVA 1JNDA 1VFOA 2VX7A 2W4XA 2VQUA 4JIEA 2FGZA 3AIVA 1TVNA 5EMYA 3RO8A 3CTTA 3ECQA 5A6SA 1UWIA 1XCXA 5KZ6A 2XVGA 3CMJA 4L4OA 5BRQA 2XWEA 3MO4A 5AYBA 3PZNA 4NZCA 2HISA 3F5JA 4PTMA 4D6CA 2V3EA 3VMPA 1XSKA 1B3YA 1MW1A 5A2AA 3POHA 1KR1A 2AAAA 1TFVA 3AMKA 4QCFA 3PZIA 1R86A 2BVDA 1OT1A 1QHOA 2XHYA 4UOQA 1TE1A 4U33A 4AEFA 4W7UA 1FFQA 2QLYA 3W6LA 1JZ4A 5GNZA 1VF8A 1VEMA 4F8XA 1M03A 3N9KA 3PZOA 1TVPA 3WNOA 3GDBA 5M5DA 3ZJ6A 1FHDA 2VRJA 4W8LA 3WELA 5AC5A 1SMDA 3WQ5A 1JYNA 2J8GA 1U33A 3AYRA 2VZSA 3VD7A 1PIGA 2WCAA 1ESWA 3CZKA 4NI3A 3CHFA 2V5DA 1B3VA 3GM8A 4MAZA 2OYMA 3VD5A 1E43A 1C91A 3EMQA 2JF6A 2YKKA 1GOKA 2PWFA 2WZHA 2VC9A 4MNMA 3VDBA 4BA0A 1UH4A 3WN6A 4HU8A 1E1EA 3W26A 5GQBA 4Q7NA 3J7HA 1EXPA 1C8QA 4GI9A 1H5VA 3L4YA 2UWFA 2VO5A 3SUUA 3CUIA 1KQYA 2F2HA 1NOUA 3WUEA 4HU0A 5D9NA 4ACZB 1H0IA 3CH9A 3EMZA 3VU2A 2GJPA 2WHJA 1J12A 1CWYA 5FOOA 2EQDA 1VIWA 3CMGA 4GPNA 2CBVA 4YHGA 2DSKA 1RP9A 3WUFA 3VGDA 2DSVA 3WD2A 2D22A 4JKKA 1UA3A 5CPQA 1E56A 1EQCA 2DH2A 3VIJA 4BQ5A 1DWHM 1B3ZA 2FDMA 3A47A 1HL8A 1OIFA 4PUDA 2IUZA 1JG9A 2WVSA 4RE3A 5IFTA 1LLOA 1IT0A 1MXGA 1OIMA 3NSMA 4GQRA 4CD5A 1QBBA 2YIHA 4MB4A 1B31A 3VX1A 1HJSA 1ZU8A 1C93A 3M46A 1UD4A 3SCQA 1G5AA 2BXYA 1VEPA 2DSZA 4TX8A 4DWSA 1J18A 1GW1A 2XGBA 3U57A 3L2MA 1EA9C 2X1IA 2BS9A 2CITA 2PB1A 3AHZA 2V3DA 1V6WA 1AVAA 4FLRA 3BGAA 1JF6A 1V3KA 4H7VA 3CZ8A 4F79A 1NOFA 5BXRA 3CUHA 4MB5A 3AIQA 1M01A 1EOKA 1HP5A 5AYIA 8A3HA 3WEMA 2AMGA 4OJYA 5ABHA 4PMYA 3BMWA 1V3LA 1UR8A 2DPEA 1PX3A 3DC0A 1V0LA 1FOBA 1EQPA 2CNCA 3N18A 1W9DM 4FLQA 1Z32X 3RJYA 3VGEA 4ZXOA 1GOMA 2ZXDA 1Q6GA 4OUEA 3GXIA 1FHLA 4RE4A 1F4HA 4N0RA 3A4AA 3GZAA 5IFPA 5CGTA 4CCEA 3OIHA 3OLDA 4H2CA 4CU7A 1GQKA 2YL9A 4HOZA 3OA5A 1CTNA 1QVBA 4ZENA 2HVMA 1UKSA 1CXKA 3MANA 1J0IA 3BC9A 4TVUA 1TA3A 2BFGA 2DSUA 1NWRA 3W0KA 4PN2A 4XB3A 3RM8A 3GH4A 3AIEA 2XVNA 2EPMX 3CBWA 3ZO9A 4NRRA 1K9DA 2IXUA 4YHEA 1G01A 4W7WA 4A4AA 1DTUA 3CO4A 1FFRA 2VMFA 3L2LA 3ARZA 1X6LA 4GZEA 4CCDA 1BYCA 3CZGA 3NYDA 3GBDA 3FAWA 3BXWA 2PWGA 3VPLA 3WH5A 2YL6A 1E6PA 2J7CA 2G3MA 3WUGA 3I3EA 1GQJA 1VFFA 5I79A 2JFEX 5BXPA 3FHAA 7TAAA 3IJ8A 3W37A 1KBKA 3QHNA 4WK9A 4QLKA 5EB8A 1QW9A 3NUKA 4ACYA 3ZR5A 4AZHA 1UR2A 4AEEA 1E72M 2YBTA 1TR1A 2EPOA 1B3WA 4DUVA 3GNOA 1MWOA 3B8SA 4KGLA 2ZWYA 3ALFA 5E9AA 4OBSA 1QHPA 2XG9A 3PZVA 3WIJA 1Y7VA 1LL4A 1W1VA 2XIBA 1BPLB 5CSUA 1V6XA 4UQBA 1C90A 1AQ0A 5CG0A 1GJWA 4GXPA 2PWEA 3LMYA 4CVUA 4XX6A 3AMDA 1CXLA 2WYSA 2ZX5A 4W93A 3NIYA 2YDSA 4BQ3A 2BNJA 3GXDA 1LQ0A 3L4ZA 3U5YA 3W24A 1JZ6A 1GCYA 2GUYA 3CUGA 1NM9A 3ARRA 2OWXA 1KB3A 3VDAA 4PMDA 1UWSA 3FY1A 1SR0A 1XH0A 3F5KA 4PCSA 2GSJA 5I2UA 1VB9A 2CKRA 1UQYA 4D6HA 3TTQA 3GTNA 3WF2A 4JZ5A 1QNRA 4MADA 2J7FA 1PIFA 5HOSA 3N1AA 3EDEA 3DHPA 1HF6A 2ZUTA 1WE5A 4B16A 1CXHA 3G6LA 2EXOA 2VRQA 2ZXQA 3WEZA 4JL2A 1UKTA 1PX4A 1MW0A 4ATLA 2Z1SA 4U2YA 3SUVA 1FH8A 1WKYA 1BGAA 2YLLA 1VENA 3VOCA 4LPCA 4B15A 3ARWA 5DFAA 5TD4A 4S3JA 3QHMA 1GQLA 5FCZA 4F9DA 5CJ5A 3SIMA 3UG5A 2MANA 4KRUA 4FF5A 4DUXA 1KGWA 1V02E 1EHAA 4J3TA 3THCA 4W84A 1JYXA 4D6GA 3MSDA 1ZBWA 4Z2GA 1JYVA 4PMQA 4CUCA 3PN8A 1UQZA 2J77A 4L4PA 2WHLA 2GFTA 3I3DA 4KWUA 4CGTA 4W88A 3WH8A 2XM2A 4PYSA 4TTUA 2DDXA 4MNLA 1JXJA 3UESA 1XC6A 5A6MA 5DMYA 5BYWA 2J78A 3KZSA 2J25A 5BRPA 3VGHA 4PMOA 2AOSA 3W25A 1DWJM 3AHVA 2VCAA 1BLIA 3APGA 2D2OA 3L4TA 3VKKA 4QFUA 4OOUA 4MJ2A 4Z2LA 2WVUA 1CGTA 4ZXLA 2CPUA 1TA3B 4ACZA 1BG9A 2BY2A 1JZ2A 1E4NA 4GKLA 1CXIA 1GZJA 1J0JA 2VZOA 4W5ZA 4PMUA 2JEPA 2IXVA 1V6VA 5LYRA 4QLJA 2XVKA 2O9RA 1HJVA 2E9LA 3CZLA 2J79A 4FLSA 4KMQA 2WCSA 4M56A 5A2CA 3DYOA 4HMEA 1WB0A 1UKOA 2XVPA 4UFJA 3PTKA 3AS3A 2ZUMA 2ZOXA 4KGJA 3WDJA 3UR8A 2BHYA 3WMBA 1CLXA 1XH1A 3E1F1 4LGXA 1J9YA 1HX0A 2E9MA 3KL5A 3CHDA 2WCGA 2VQTA 1UR0A 1E9LA 4LYPA 3ZOAA 1KR0A 2J7BA 1RD6A 1ODUA 1GOIA 4H41A 3ZR6A 5D9PA 4D6EA 1G1YA 5LA1A 1GONA 1XSJA 2VR4A 4UCFA 3VNZA 2OSYA 1WZMA 3D5HA 1XHGA 4P7RA 1CGYA 1KWGA 2XWDA 1UZ1A 2VUYA 1LWJA 4B3LA 1BHGA 3ZJ8A 1Q6DA 4D71A 1H3GA 1E4MM 2QPUA 3WKZA 2ZWZA 5LA2A 2J4GA 4GO9A 3AICA 4HP5A 4Z2IA 1V0KA 2OWCA 3UERA 3PTQA 1QOXA 3VILA 4DM1A 4AIUA 1HP4A 4ZE4A 1EIBA 1TG7A 1HNYA 3MMWA 5DEZA 5AC4A 1E70M 2NT0A 4LXFA 2YL5A 5HBFA 5D4YA 2X0HA 2XUCA 3II1A 3G6MA 4GIAA 2V5CA 3MUZ1 1WZLA 1C7TA 1OBAA 2EEXA 1V08A 3WFLA 4HZ8A 2Q8XA 3JUGA 4F66A 4UQ9A 4ZFMA 1JI2A 1V02A 3ZT5A 1W3LA 2Y4SA 4MJ4A 1ZB5A 4P8UA 5A8MA 1W1YA 2NT1A 3WNMA 4Z2JA 1D7FA 3BCFA 3MUY1 4X9YA 3MV11 1ISZA 4P8WA 1E6QM 2ZX7A 1I1WA 4U31A 1R8LA 4U5KA 1DWFM 3WDQA 5FIPA 4D6DA 1MW2A 3ARXA 4D1JA 3K4DA 4Q22A 3D3AA 1WO2A 4AIOA 3UEQA 3EMCA 1BGGA 1W1TA 4UFMA 1IV8A 2W63A 3KE0A 1HVXA 5JBFA 2YBUA 4AD2A 1OT2A 1XV8A 3KL3A 5HXMA 2VX6A 1XD1A 4UZSA 3AYSA 5ABFB 1XYFA 3AZSA 1RH9A 1V6UA 2UY2A 3W82A 5A94A 4CD6A 3IAPA 1PEZA 3GNPA 3ZSTA 5D8WA 1ZL1A 4HMCA 3HJEA 3N12A 3N15A 1HKKA 4AZIA 1JDDA 1E5NA 3CGTA 3VIOA 4J3WA 1M04A 3WF0A 2QV4A 2BVTA 3U7BA 1TMQA 5C71A 1PAMA 3RMEA 1MQRA 2ZUVA 4BQ2A 1CXFA 2YA0A 4MDPA 4EK7A 4B9ZA 3VGFA 1H4PA 3OB8A 4ATWA 3AS1A 1LF1A 4UTFA 3PZMA 2CEQA 4M80A 1UYQA 4AD0A 1J0ZA 1K9TA 1QNSA 2DEPA 3SUSA 2OYKA 2F61A 3PTMA 1M53A 1CPUA 3K8KA 4J27A 1P6WA 3WL1A 4HA3A 5M3WA 3W6MA 2WZEA 1PPIA 1X6NA 3GH5A 1WP6A 1HN1A 5BWFA 2D3NA 1VBUA 2FH6A 1CIUA 5JUVA 3OGRA 3FW6A 3K4AA 4GO8A 1H49A 2CHOA 4CU6A 4RL3A 3W4RA 2C0HA 3AISA 1R7OA 1DP0A 1W1PA 2WBKA 4FMVA 1EO5A 4UQDA 2XFRA 1JZ5A 1CDGA 1UR1A 1N82A 2CETA 2D1ZA 2YDRA 3VD3A 1JZ8A 1KGXA 3VUPA 3A3HA 4UZUA 5A1AA 2GJXA 3DYPA 9CGTA 2CESA 2J62A 4UR9A 1LL6A 4C7DA 3BSGA 4AD5A 3RILA 2DGAA 2EPKX 1V3JA 4DUWA 1XGZA 1UWQA 5ECUA 1KCKA 3N11A 5A6KA 3VTRA 3AI0A 4UQEA 2VR5A 1NWSA 3NSNA 2F8QA 1SFSA 1J11A 2VT0A 2DT0A 1UWUA 3T09A 1B0IA 5I77A 3WNNA 2WKGA 4GI8A 1MQQA 1ISYA 2PF0A 2NW0A 3TA9A 3S6TA 5A3HA 1W2PA 1G94A 3AS2A 1LG1A 3WH6A 2D0GA 1DHKA 5CPSA 1XRVA 1VRXA 2WMKA 4WSKA 3EYPA 4OZOA 1Q6EA 4W8AA 1GNXA 2ZE0A 3LPOA 4MDOA 3AHTA 4QLLA 4CD4A 4CN6A 6TAAA 1VJSA 4ML4A 4PCTA 3ZIZA 3PBGA 3AOFA 3KEHA 1WAWA 2GJRA 4TX6A 2VJXA 1E55A 2DIEA 5E6ZA 4LYQA 1EH9A 4HPHA 4JHZA 3SCNA 5JBEA 1OGSA 4DWSD 2W62A 2A3BA 1MFVA 3WNLA 2A3HA 5FKYA 1CGUA 1BG4A 5C8BB 1EDQA 4JFTA 1CECA 1GOWA 3KL0A 4W85A 5IDIA 1K6AA 1E6NA 5FL0A 1K9FA 1W3HA 2VZTA 3TP4A 2WZIA 2DIJA 3HN3A 3WENA 3M7SA 3L4XA 3MV01 2FHCA 3DHUA 1D2KA 4S3KA 4U2ZA 3ZJ7A 4E8DA 1BYAA 4M8UA 3WBAA 2PBOA 4E2OA 3CIVA 2D3LA 3OLEA 3AHYA 3ARPA 3FNDA 4PTXA 3UR7A 4AISA 1LG2A 1CGVA 2VX4A 2W61A 1UR4A 4AZCA 4UOZA 2XM1A 3VIPA 3B9EA 1ISXA 5D8ZA 1KXTA 4NRSA 2E4TA 3PHAA 4LX4A 1E0WA 4QP0A 2QHAA 3OLIA 3EDDA 2EBNA 5M03A 1E73M 2D0FA 3I3BA 4HZ6A 4J28A 4JAWA 1BSIA 1WPCA 4R27A 1UKQA 3SCWA 1BAGA 5JBDA 5FD0A 2DT1A 5I6SA 2UY5A 1CENA 2QPSA 4AXNA 3T2QA 4W5UA 1HJUA 3QOMA 2ZXBA 2XVLA 4CVWA 8CGTA 4JHOA 5HDRA 2QMJA 2JE8A 3PZ9A 3W38A 2VRKA 4J3VA 4AZ6A 3ARYA 5I5RA 3CHEA 3MMUA 1BVZA 3IANA 4JFUA 2DT3A 1E3XA 5ABGA 3TTSA 5A95A 1W9UA 1UD8A 3MUIA 2UY4A 5A8OA 1B9ZA 2WHKA 1EGZA 1IZJA 1DWIM 3BAJA 3LPPA 1KBBA 2WSKA 4J3UA 1J0KA 1WDQA 3AS0A 3POCA 1QI0A 2ZX8A 1J01A 2Y8VA 1ZJBA 4XUYA 3MS8A 3RM9A 4CCCA 3AIUA 1GQIA 1C8XA 1VEOA 2YL8A 3TTOA 2OYLA 3W81A 2XPKA 4JCMA 4MAVA 3OLGA 2A3CA 3BLPX 3DECA 3WUBA 2GJXB 1BYBA 2VL4A 4PTWA 1GHRA 1B2YA 3ZQ9A 3UCQA 2ZUSA 3GYCA 5ABFA 5ABEA 3AFBA 4EANA 1ITCA 4W8BA 4IISA 5CGMA 2J7HA 1Q6CA 4D6IA 1Q6FA 2EJ1A 1W9VA 4TTGA 4P8XA 2BXZA 3ARUA 1JD9A 2J8FA 2EO7A 1MW3A 1PZ3A 1WDRA 3VMOA 1I75A 3WNPA 1ODZA 5E0CA 1R7AA 1VBRA 4K68A 3GNRA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1QNO A;  3EDK A;  5E09 A;  4M81 A;  3CHC A;  4HOW A;  1ZS2 A;  5GPR A;  1GUV A;  1JND A;  1VFO A;  2VX7 A;  2W4X A;  2VQU A;  4JIE A;  2FGZ A;  3AIV A;  1TVN A;  5EMY A;  3RO8 A;  3CTT A;  3ECQ A;  5A6S A;  1UWI A;  1XCX A;  5KZ6 A;  2XVG A;  3CMJ A;  4L4O A;  5BRQ A;  2XWE A;  3MO4 A;  5AYB A;  3PZN A;  4NZC A;  2HIS A;  3F5J A;  4PTM A;  4D6C A;  2V3E A;  3VMP A;  1XSK A;  1B3Y A;  1MW1 A;  5A2A A;  3POH A;  1KR1 A;  2AAA A;  1TFV A;  3AMK A;  4QCF A;  3PZI A;  1R86 A;  2BVD A;  1OT1 A;  1QHO A;  2XHY A;  4UOQ A;  1TE1 A;  4U33 A;  4AEF A;  4W7U A;  1FFQ A;  2QLY A;  3W6L A;  1JZ4 A;  5GNZ A;  1VF8 A;  1VEM A;  4F8X A;  1M03 A;  3N9K A;  3PZO A;  1TVP A;  3WNO A;  3GDB A;  5M5D A;  3ZJ6 A;  1FHD A;  2VRJ A;  4W8L A;  3WEL A;  5AC5 A;  1SMD A;  3WQ5 A;  1JYN A;  2J8G A;  1U33 A;  3AYR A;  2VZS A;  3VD7 A;  1PIG A;  2WCA A;  1ESW A;  3CZK A;  4NI3 A;  3CHF A;  2V5D A;  1B3V A;  3GM8 A;  4MAZ A;  2OYM A;  3VD5 A;  1E43 A;  1C91 A;  3EMQ A;  2JF6 A;  2YKK A;  1GOK A;  2PWF A;  2WZH A;  2VC9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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