3ZXDA

Wild-type lysenin
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
AEGYEQIEVDVVAVWKEGYVYENRGSTSVDQKITITKGMKNVNSETRTVTATHSIGSTISTGDAFEIGSVEVSYSHSHEESQVSMTETEVYESKVIEHTITIPPTSKFTRWQLNADVGGADIEYMYLIDEVTPIGGTQSIPQVITSRAKIIVGRQIILGKTEIRIKHAERKEYMTVVSRKSWPAATLGHSKLFKFVLYEDWGGFRIKTLNTMYSGYEYAYSSDQGGIYFDQGTDNPKQRWAINKSLPLRHGDVVTFMNKYFTRSGLCYDDGPATNVYCLDKREDKWILEVVGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Toxin
molecule keywords LYSENIN
publication title Structures of Lysenin Reveal a Shared Evolutionary Origin for Pore-Forming Proteins and its Mode of Sphingomyelin Recognition.
pubmed doi rcsb
source organism Eisenia fetida
total genus 55
structure length 293
sequence length 293
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.980 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3zxdA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3zxdA02
3H6QA 1EVTA 1DZDA 3FJIA 1M16A 3FUOA 3WINC 3CRHA 1WD4A 3HALA 1G9BA 4ZFWB 3IM7A 3AH1A 3TC2A 1MC9A 1ONKB 1AVWB 2D22A 4I0YA 3CAHA 1NZKA 1VCLA 2ZQOA 3WO4A 1I1EA 4ENDA 3LTQA 1V6UA 4OEGA 1IJTA 5F90A 1AVUA 3O5WB 5BXRA 1AVAC 3NBCA 3BAHA 1BFFA 4LO8B 1S0CA 2Q9XA 1RG8A 5DVHA 4G6MA 5HPZA 3BRFA 3V79C 2VXTI 5BQUA 2D7IA 3HN1A 2BFHA 3R4UA 3I29B 4JKXB 3Q7WA 3RTIB 1FMZA 4I4YA 2D44A 3UDAA 2K8RA 2HW9A 4I4QA 1OQLB 4L4IA 3WO3A 1JT3A 3BAGA 4D8HA 3NJ5A 4I4OA 3OBTA 3NBNA 3V0AB 3BB2A 2Q3NB 41BIA 1XHBA 1SZ6B 1WBAA 3IM6A 4F34A 3N7JA 4J23B 2FFVA 1BARA 5G00A 3AJ5A 4LO3A 2AQZA 3POKA 5DUYA 3MPPG 4IY9A 4X38A 2P23A 3HSMA 3E8LC 4QD2C 4QALA 1FGAA 1T4QA 2Y9WC 3D7WB 4KEJA 1RZOB 2ESUA 4OWKA 5BQUC 1W3FA 3FJHA 3O3QA 2FGFA 1V6XA 2AFGA 2Y9FA 5EHAA 1XG6A 2HWAA 4LO1A 3FJCA 4ZOTA 2IWTB 1Z0HA 1IRPA 1WBCA 1QQLA 3A23A 2K4AB 2MC2A 4ZKTB 2D43A 4TLPA 4LO7C 3ZXDA 3BAOA 3P6JA 5FNXA 4Q9PA 1G9DA 5JLVA 4KBBA 4GP3A 3AKGA 4G1RA 1JLYA 2BEBA 3ZC8A 4EFRA 3S8KA 1L2HA 4I4UA 4GP0A 2ERMA 3CA0A 1DJSB 4AN6A 1AF9A 1DLLA 4IONA 3HBWA 1JT4A 7I1BA 3FJ9A 1N4KA 2NM1A 1EPWA 4HA2A 4J2KA 3RSJA 3OJ2A 3BADA 1DFCA 4CJMA 4FGFA 1S0LA 3OBRA 3N7MA 1G82A 4P0LA 1JT5A 2Z49A 5BOWA 4I3NA 4LO1C 4QC4A 3CRGA 4R6UB 3O4CA 2RSTA 1Q04A 2UUSA 1HWMB 3BA4A 3CA6A 3AKIA 3VSFA 1YBIA 1S0EA 1ISXA 1FV2A 1BA7A 1TP0A 4JP0A 1ITBA 2FDBM 5D63A 4ZGRB 3VEQA 4J2XA 5I1BA 3H6RB 3WMVA 2ZQNA 4IYBA 4XFSA 1J0SA 3CA3A 2XOAA 2R9KB 2NTDA 2QYIB 2NP0A 5FZZA 1Z2VA 2HZ9A 1BLDA 2KKIA 2GO2A 4GAFA 3CA4A 3C9ZA 2FFUA 3WMUA 1TWEA 3UJ4A 4LO0C 1AXMA 3IM5A 2WRYA 4I4PA 3AKHA 1S0BA 1TTUA 5BVPI 4FVVA 1P63A 2J3PA 3HMYA 4ISRA 5DSSB 3FFZA 2KI4A 4JRAA 2NVHA 5FZUA 4H04A 2AXMA 2ET2A 2VXRA 4OW4A 1W3GA 3CRIA 4QKRA 2D1ZA 1BASA 4QO3A 3HOMA 3Q7YA 1IOBA 4USOA 1YTOA 3F1RA 1HKNA 4OWJA 2P39A 1S0FA 3V0BA 1RY7A 3CU1B 1IRAX 5D61A 4XFTA 1YF8B 1CE7B 1PZZA 1MD6A 3BRGC 3FJBA 2VUAA 4XFUA 3FJFA 4QBVA 5BP5C 3O44A 2D20A 4PC4A 3B9UA 4D0ZA 1YXWA 4DENA 4IZXA 1V6VA 1TIEA 4KC3A 3EF2A 3BRDA 3BAVA 1T9FA 4OWLA 1XYFA 5DZUA 1R8NA 3R4SA 1RMLA 3SNVA 3VSZA 1FMMS 3UD8A 2VLCA 2F2FC 1FQ9A 3FGMA 4P6AA 1G9AA 4AN7B 5F8SA 2X2TA 1FV3A 1UPSA 2GZBA 3N7LA 4JAWA 3ZXGA 1QQKA 3Q7XA 3FJAA 1JLXA 5EG6C 1IT0A 2M49A 4QD2B 5B2HA 3S8JA 1TFMB 3O4BA 4Q91A 3F62B 1FWUA 4ZA3B 1ISZA 3BTAA 4I4VA 4L4HA 4P0KA 3UD7A 1KNMA 1ISYA 2VU9A 3OJVA 3AKFA 3PMEA 4Q9GA 3O4DA 2KI6B 1ILR1 4IZEA 3WO2A 4G6JA 4J2YA 1PWAA 4EB2B 4A7KA 4I1EA 1TWMA 3ZX7A 3RTJB 1D0HA 1S0DA 1EV2A 4A7YA 2DREA 3FJEA 4LO0A 1DIWA 3A21A 4F83A 4OEEA 3KMVA 3FJJA 4EFPA 3ILAA 2MLLB 4GOVA 4IHZA 2LIEA 3PHZA 8I1BA 1JTCA 4I96A 3UJ0A 1DQGA 1Z4SA 21BIA 2Y9GA 3JRRA 1FWVA 1ISVA 1BFCA 1TOOA 1EYLA 4G9NA 5F8YA 5BXPA 5BXSA 3FJDA 2DRZA 4ISQA 3O4OA 4DEPA 3V0AA 3CA5A 3FJKA 6I1BA 3AZVA 1JY0A 1HWNB 2DRYA 3AZWA 2HWMA 1PUUB 3O4AA 4QBCA 5BP5A 1HIBA 1Q1UA 4WBCA 1DZCA 2NZ9A 1I1BA 4D0TA 3T8SA 2KLLA 3I2AA 4I8MA 3WA1A 4GOYA 2KH2A 4H9WA 4I4SA 1SR4C 3CA1A 4JQ0A 3BA7A 4A7ZA 3K1XA 2YUGA 3MALA 1YYNA 1HWPB 4I6IA 4JPZA 2F2FA 3AH2A 1HCDA 1G9CA 4X39A 1BFGA 2Y9XE 3QR5A 2E4MA 4IQPA 4P0JA 2VSAA 1IHKA 2ZR1B 4J2SA 3VT1A 1JT7A 1K5UA 4Z9WB 3BX1C 3A07A 2QN4A 4ZLBB 1DQOA 5FZYA 4LO2C 3OGGA 3AH4A 3NBDA 2DS0A 1IILA 1AVXB 1FN0A 1DFQA 3UD9A 4JKQA 3RMYA 1XZZA 1NUNA 1E0OA 5EC5A 1F31A 2D23A 2NYYA 9ILBA 3IAGC 3ZC9A 2LIQA 2D7RA 3BA5A 1CVSA 4HJJA 4EEEB 1ABRB 1WD3A 2FO1A 5JMCA 3CQAA 1S0GA 3H6SE 4Z8SB 4ZFYB 4YOLA 1HCEA 2VSEA 4IY8A 2AAIB 4KEIA 2BEAA 2E4MC 4ZBVB 2MIBA 3P53A 1BLAA 4X37A 3OJMA 1A8DA 2F8XC 1V6WA 1BFBA 4I7IA 4XKIA 3AJ6A 1PUMB 2K43A 4I4RA 2D24A 4OEFA 5GAQA 1M2TB 1PC8B 1QXMA 5F8WA 4EKXB 3IIRA 4I37A 5FNWA 1R8OA 5E24E 4II0A 2IHOA 4QKSA 3P6IA 3VWCA 3H6RA 1II4A 4I2SA 3PUBA 2WBCA 2L5XA 5D62A 3QYDA 3W9TA 3WINA 4G9MA 3VT2A 4USPA 2Z48A 5BXTA 3JUTA 2RQ9A 1SR4A 4GAIA 3V0BB 4HR6C 4OUJA 31BIA 1AFCA 4LO7B 3FJ8A 1ISWA 2I1BA 3N7KA 4ZFUB 1Q03A 4DCKC 3I2XA 2RG9B 4LO3C 3BAQA 1GGPB 2X2SA 3FUQA 3NBEA 3O49A 4I4XA 3VT0A 3OGFA 3LLPA 1K5VA 1JQZA 3VUOA 4I1BA 3N0KA 3A22A 1W3AA 4KEKA 1HWOB 3BAUA 4EFQA 4LO2A 4X3AA 3PG0A 3RMXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3H6QA 5JSPA 3AXDA 5JXIA 1POV0 4JZRA 3RDIA 1CONA 1WBLA 3POEA 3RVHA 3FJIA 3PVBB 3WCRA 4Y33A 4CU7A 3PVEA 3BIWE 4Y20A 4YSFA 5A3NA 1WW6A 3T0DA 1UX7A 2B8MA 1B35C 3UL2A 1CWPA 1H2LA 4Y3OA 3KCYA 3MO4A 4CPBA 3LPFA 2L9LA 4E8CA 4EN7B 4NIDA 1WD4A 2YUEA 3WNNA 3IM7A 4XXPA 3Q8AA 1MC9A 4QQ2A 4W65A 1UYPA 1CAXB 5DG1A 3WO4A 2EAKA 1JOJA 2VTXA 2Q8DA 1V6UA 4RGKA 1IKPA 4PDWB 5T50A 2RS32 2QQKA 2VMFA 1AVUA 4AGVA 4AL9A 1O5UA 4NRMA 5F8PA 2DCJA 3BAHA 1R8OA 4UOJA 2Q9XA 1MS5A 1RG8A 1STMA 4XHXA 5D8AC 1LENA 3MIGA 4IEQA 4AOCA 4EQVA 2QZ2A 5LA2A 5HPZA 2JDYA 1VBC2 1QQP1 2VGDA 3FHIB 2YU1A 1HXS3 1R1A3 3HN1A 3LZZA 2BFHA 2UWCA 2PFWA 5K7PA 1IKQA 1GOHA 4CPBD 2VOVA 3USUB 1QNWA 2BWCA 2WZR1 3O12A 3VBHB 4FFFA 5J48A 1TME1 4KWLA 1OLME 3AMNA 1TE1B 4NUBA 3RTIB 1F4AA 2ZAHA 4N90A 2OKXA 1UKRA 5FWJA 4I2OA 1VBE2 3UDAA 4COWA 1YQCA 2IVJA 1XBFA 2BU9A 4LHLA 4FFIA 2MEV1 5EWSA 3FWEA 4DZGA 1CQ9A 1JT3A 4D8HA 3NJ5A 4CSWA 1KJLA 1X9PA 2Z79A 3WP6A 5GZCA 3NW4A 3LKJA 2P17A 4LNVA 1GNZA 2RJ2A 1AL23 4QM9A 2W9XA 4N43C 2JG8C 3BALA 1APNA 5JMOA 3RYRA 3S6PA 3ILRA 3VKNA 1XHBA 3H9AA 5JXJA 1J1LA 3U14A 1GMMA 5LK5A 3BU7A 3NL1A 5FZBA 4XIKA 5DUYA 4FPYA 4HXCA 4QHOA 2P23A 1FT9A 3B69A 3BPZA 1RVF3 1HB2A 1NAEA 3ETQA 4QD2C 4DUXA 1COV2 1AHSA 1SPPB 1FGAA 2VZVA 2P4EA 2VCMA 5LEKA 1LGCA 1N3QA 4OWKA 4M4RA 1VPHA 5BNNA 5BQUC 1GZCA 1Z7S3 4AI1A 3KHCA 1X36A 1ZRIA 1WW5A 3LE0A 1VBB1 2GMPA 2XJVA 4JGYB 2DTWA 4G9SB 5EHAA 1A6CA 2DTYA 1RUE3 1U12A 2TEPA 5IK4A 1XG6A 4YM2A 1YQ5A 3FJCA 1Q43A 2A5ZA 1WLDA 1W9FA 2R061 3JZVA 4GOVA 3OGJA 4MGQA 2C9KA 4BLIA 2VUJA 2JIGA 4YW4A 3RI9A 1WBCA 4NE9A 1PHMA 5FY8A 5A7OA 4N53A 4WBBA 4Y4RA 5BV6A 5FYZA 4BCUA 2FZ1A 2PAKA 1LHOA 3RWNA 5FYSA 2WT0A 4JGZA 1PK6C 4AQSA 5C3QA 2VNRA 3H6RA 4KU8A 3KQ4B 4XJUA 5CU1A 3ZFEA 4SLIA 4DO0A 4XFBA 3AKGA 5KHHA 1R1A1 1W6MA 4G1RA 1NCQB 3ZC8A 1MPXA 4EFRA 3ZFGA 1VBD3 4YYOA 4I4UA 4LO5B 2AACA 4GP0A 1RIRA 3LOIA 1ZBA3 4XCBA 1LOFA 1DQ5A 1WMXA 3VBOC 2ERMA 3CO2A 3K3NA 3WDYA 3GJBA 1VE0A 4EWDA 1UX6A 2DVGA 1GZTA 4IEWA 1LJ7A 2R073 4QU2A 3HBWA 1NQJA 3FJ9A 2NM1A 4WM7B 2VOKA 5F5QA 2HEVF 4EWAA 4HA2A 3NKTA 5CYYA 3OPZA 1UXXX 2RVAA 3NNJA 5GLTA 4D7SA 3BADA 3OJ2A 4CJMA 2RHPA 2VMIA 4YLZA 4PJYA 4Q0QA 4SBVA 1VJ2A 3MZHA 2YZ4A 1AL21 1AR62 4LA3A 1JT5A 3WF3A 3HBKA 3KB5A 3MEPA 3OEBA 5KC5A 2YG0A 3OOXA 4LO1C 4QC4A 1EAH3 2UWBA 3WP5A 4CCNA 4C0BA 1HJGA 1ZRDA 2YY1A 3NAPC 1Q04A 2ZGPA 5FZ8A 1GZWB 5CAZA 3CA6A 1H9WA 3O1MA 3AKPA 2A6XA 5KR7A 1RVF1 2FDKA 1T6GC 1ZRRA 3T09A 4JP0A 4NJ4A 1LULA 4AI2A 4MGYE 4CXWA 1AX2A 4FP3A 4QQPA 1REEA 3VEQA 2WABA 4CU9A 1Q8PA 3ROUA 1Y7BA 3AM2A 1SDDB 4ZZ5A 5LCWL 1Z7S1 2ZQNA 4IYBA 3PHMA 5IJRA 3FN9A 4LBQA 1W0NA 1PMJX 3DYPA 2MPFA 1WWYA 3BYWA 5FZZA 1J1TA 2W95A 3LQCA 1RUE1 3I2GA 4M3CA 2WFF1 5A6YA 5KXCA 2FDIA 1AR72 2GO2A 4JKQA 1SLBA 2XWJB 2OZJA 3K4AA 5EHDA 4XJ9A 3VBSC 1OA3A 4OLLA 2DDUA 4Q4X1 5C70A 1PNGA 5IK5A 3UJ4A 3APBA 4Y5TA 4J1XA 2WINB 5FYUA 3RQ0A 3EHKA 4PCRA 2WRYA 5A7SA 2XPJA 3OGVA 1S0BA 2DV9A 3DN7A 5BVPI 3HMYA 4RHV3 3ZR6A 5DSSB 2RS53 3FFZA 4XJ8A 1VBA2 4YGEA 4N7IA 3KLSA 3T30A 1NOVA 2QZ3A 4H04A 4OW4A 2VVDA 1YUDA 2TNFA 2ZX4A 3VZMA 4XAEA 1OHFA 4IL7A 4UI9L 5IATA 2GH2A 1JYWA 1VMJA 4Q0PA 4QO3A 1VBD1 2RR12 3KT7A 3I3EA 4XETA 5CZKA 4BYYA 1BLDA 1VAKA 1ZBA1 1ALYA 1IOBA 4USOA 3DEMA 3ZN5A 3POBA 1IS6A 2BWAA 2R071 1AL0G 4W6WA 2OVUA 4LHNA 3ZIWA 5FPLA 2RJLA 3ZYPA 3CNAA 1IRAX 3OUJA 3WHTA 3VDCA 3H7YA 2ZGUA 3P5BA 4XFTA 3BRGC 1DGWX 1Z78A 2XLFA 4LXLA 5CG8A 3QH6A 5CKMA 3H1YA 1A3KA 4YGCA 4QBVA 2FMDA 5BP5C 1UIJA 1OF3A 1QJX1 2SBAA 2J1AA 4MLOA 4J1WA 3OUIA 4DXTA 2D20A 4BIOA 1ENRA 5A6XA 3ZFFC 1C1FA 2QQPA 1EAH1 3CJIB 3J7NA 4UWDA 5C8CB 4CDQB 4XUNA 5FBJA 5JOWA 3AVRA 4Q4Y2 1HRV2 2WR9A 1SLTA 4CEYB 4DENA 4LEJA 1D7PM 4IEOA 5ABJB 3AMHA 4AK3A 3N36A 1LAJA 2P37A 1H2KA 1XYFA 5DZUA 3N3HA 4BM8A 2ZHMA 4IESA 5E6HA 4Q1RA 1MR5A 3MW4A 4P02B 1YNAA 4CEWB 5CADA 5C7GA 3SNVA 2A6YA 1W9SA 2MHFA 1FMMS 4XILA 2VLCA 5LASA 3MLKA 4UYBA 5I8TA 1W2NA 3FGMA 5F5CA 1QJU2 1G9AA 4GMP3 2PQSA 4AGGA 1UPSA 5AFBA 3D82A 4Q8KA 4CUAA 1S2EA 1CAWB 3ZXGA 5FTTC 1W2OA 2VNOA 1TFMB 3KT4A 1UMZA 2DVBA 3MBWA 4NIGA 5LRSA 4DUVA 5HV0A 2J1TA 4H2AA 2QQJA 3HEIA 3F62B 3PUHA 3NNFA 4Q4W2 3KQRA 4P00B 2R1DA 4TN7A 1DQ0A 4P0KA 1JYNA 4IE5A 1R083 5DN2A 5FZDA 3WQBA 3AKTA 3VBFA 1V6LA 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