3BETA

Crystal structure of the human carbonic anhydrase ii in complex with stx 641 at 1.85 angstroms resolution
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Structure-activity relationships of C-17 cyano-substituted estratrienes as anticancer agents
pubmed doi rcsb
total genus 74
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2007-11-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3betA00
4M2RA 3V5GA 1H9NA 5EHEA 1RZDA 1JD0A 3B1BA 3S78B 2FW4A 2OSMA 2FNKA 5BYIA 5FL4A 1CAIA 4Q6DA 1CZMA 3RZ7A 5CA2A 3MNJA 3KIGA 4FIKA 2FNNA 4L5VA 3OY0A 1YDCA 2NWPA 4YYTA 3FW3A 2FOQA 5JDVB 4QEFA 3M2XA 4KNIA 3RLDA 4XE1A 1G0EA 3P58A 5SZ0A 4E9OX 4RFDA 3CYUA 4FL7A 2AW1A 4RIVA 1UGFA 5G0BA 5DSPA 3V2JA 2NNGA 5FDCA 1LGDA 1IF5A 1I9OA 3MYQA 2Q1BA 1LZVA 3MNHA 1YO2A 1OQ5A 2ABEA 4QJXA 3W6IA 5BNLA 5DSIA 2WEHA 3T5ZA 1OKNA 1ZE8A 4Q8XA 3KWAA 4K0TA 1BNUA 4MTYA 4KNJA 1BNTA 3DA2A 1BZMA 5JQ0A 5JGTB 5E28A 4Q81A 1AZMA 4FRCA 3P5LA 2H4NA 3M2NA 3MHLA 4Q90A 4QJOA 4FVNA 1DMYA 5BRUA 4Q07A 9CA2A 4Q83A 4HEYA 1THKA 6CA2A 4QSIA 5IPZA 4Q78A 1LG5A 5FL5A 5FNIA 2EZ7A 1DCBA 1IF8A 1F2WA 3ZP9A 4YX4A 4FU5A 3DC9A 3V3IB 4KP8A 1CAZA 1FQRA 2CA2A 1ZFQA 3LXEA 4QK3A 5CJFA 3MNIA 4Z1KA 3S73B 3ML5A 4L5UA 3MMFA 3RZ5A 1XEVA 3SBHA 3EFIA 4Q9YA 2NXSA 4KAPA 3D0NA 2NWOA 1I9QA 1G4JA 1CA2A 3MHCA 4RN4A 3ZNCA 4Z1EA 1RZBA 1KOQA 3C7PA 2CBDA 4QJ0A 4YHAA 2EU3A 3QYKA 3RYZA 4QJPA 1HUGA 3D92A 1H9QA 1RZCA 3DVDA 4QY3A 4TWLA 3IBIA 2AX2A 3P3JA 3P44A 4PQ7A 4Q6EA 3KS3A 1TBTX 2POWA 4Q7VA 1CNKA 3U47A 1ZH9A 2POVA 1AVNA 2NMXA 4K0SA 3TVNX 3EFTA 4RIUA 3P55A 2W2JA 12CAA 1CNWA 1FQMA 3SAPA 2NWYA 3M67A 3OKUA 3DVCA 3RG3A 4K0ZA 3OILA 1G4OA 3R17B 4JS6A 1H4NA 4HU1A 3U7CA 2HFWA 5FDIA 2OSFA 3RZ1B 4E3FA 4YGKA 1YDAA 1BN1A 3JXHC 3TMJA 3M1KA 3DV7A 4MDMA 4JSZA 4PXXA 2FOSA 3DD0A 5DSNA 5JG3B 1CNBA 3MHMA 3PYKA 1CA3A 3M04A 5FNMA 1CAOA 4RUZA 3DAZA 3S76A 1HVAA 4E3HA 1TEQX 5C8IA 3KOKA 4CQ0A 1FQLA 5EKMA 3RYXB 3MHIA 4HEZA 1XEGA 3BETA 4M2VA 5EIJA 2FOVA 2HL4A 5E5UA 5EHVA 1CVDA 5BRVA 1JV0A 1CALA 4RUYA 4XIWA 5E5RA 3BL1A 5L3OA 4MLXA 4R5AA 4G7AA 1G3ZA 1TTMA 1CNIA 3S8XA 3KNEA 2F14A 4WW8A 3MZCA 3V3FA 2CBAA 4QJWA 4COQA 4RFCA 1ZSAA 5JEPB 5FNHA 4XFWA 1CVHA 3DC3A 2QO8A 1G0FA 4YGFA 3DBUA 4YGLA 1KWQA 1FLJA 2NWZA 5SZ6A 4C3TA 5DSOA 3S77B 1RJ6A 2Q38A 1IF6A 5FLOA 4UOVA 1A42A 3K2FA 1FR4A 1FSRA 3FE4A 2ZNCA 1CNYA 1I91A 4PYYA 4JSSA 1EOUA 1FR7A 1CAMA 3RJ7A 1V9IC 5EHWA 1YO0A 5FNKA 5DSLA 5SZ4A 4YGNA 3K7KA 5FL6A 2X7TA 4QSAA 4Q87A 2VVBX 3HKUA 5FLPA 2NXTA 1RJ5A 5J8ZA 3OIKA 2HD6A 3RGEA 2WEJA 4Q09A 3T5UA 1KOPA 4HF3A 3U45X 4Z0QA 1G45A 4WUQA 4RH2A 1DCAA 4G0CA 4E3GA 1ZSBA 1G52A 1BN3A 4QK1A 3NJ9A 1LUGA 1DMXA 4KV0A 3UYNA 1ZNCA 3HS4A 3V3GB 1CINA 1IF4A 3N0NA 5CACA 4WW6A 1Z9YA 4YWPA 1HEBA 4QIZA 1CVEA 4LHIA 4ZX1A 3DVBA 4KNMA 1FSNA 4YXOA 3M5EA 5FLQA 5LMDA 3BL0A 1TB0X 5SZ7A 1BNNA 2VVAX 1IF7A 3F7BA 1TG3A 1BNVA 4GL1X 2ILIA 1BNMA 2NN7A 4JSAA 1I9MA 1HEAA 3P4VA 5EKJA 3S74B 3SBIA 3W6HA 4BCWA 1J9WA 1G48A 1IF9A 1G6VA 3R16A 5EOIA 1MOOA 5DOGA 5JGSB 4KUVA 3MHOA 5L6KA 5BRWA 3V7XA 1G53A 1CAJA 8CA2A 4HT0A 4ZWIA 2Q1QA 5EH7A 1LG6A 4Q08A 3JXFA 4KNNA 1UGGA 4WR7A 4QTLA 1HUHA 3S97A 5DSQA 1I9PA 2QP6A 1CANA 4MDLA 7CA2A 4DZ7A 1HCAA 4K1QA 4E4AA 4Y0JA 1CAHA 2WEGA 5E2KA 4HBAA 4QK2A 3JXGA 3CZVA 1RZAA 3GZ0A 3M98A 4ZX0A 5FLRA 5JEHB 1CNHA 4CNRA 3IAIA 4ILXA 1CCTA 5G03A 3DCWA 1HEDA 5E2SA 3D9ZA 3K34A 5AMDA 2X7SA 1CVAA 1G46A 5JEGB 1CRAA 1CNGA 3M1JA 3M2ZA 2POUA 2NXRA 4WUPA 1HCBA 5E2NA 3T82A 4Q7PA 5G01A 3UYQA 3HKNA 1CNCA 4PZHA 2CBBA 4QSBA 3KLDB 4RUXA 4L5WA 4R59A 4QJMA 1XPZA 1UGBA 3F7UA 4Q8YA 1CRMA 2FOYA 3KKXA 4N0XB 2NNVA 1YO1A 3D93A 3OKVA 1I9LA 3OYQA 3M14A 5G0CA 4M2WA 3M1QA 4M2UA 3KONA 1G1DA 1CAKA 3D8WA 4MDGA 2FNMA 4FPTA 1UGEA 1JCZA 4KP5A 2CABA 4MLTA 4CNVA 3NB5A 4DZ9A 1I90A 3V3JA 4E49A 3M96A 4YXUA 2HNCA 1Z97A 4Q7WA 4KUYA 5A6HA 4XIXA 1RAZA 1OKLA 4YVYA 2GD8A 1FQNA 4Q8ZA 1UGAA 3MNKA 5A25A 5DSJA 4CNWA 3ML2A 1ZGEA 4MO8A 4YGJA 4PYXA 5FNJA 3VBDA 3RYVB 3S75B 3MNUA 3HKQA 1CCSA 2FMZA 2NN1A 3U3AX 4ITPA 3IBLA 2WEOA 1BNQA 1G54A 4Q7SA 4E5QA 1T9NA 2H15A 4XZ5A 5FNGA 4E3DA 3DCCA 5JESB 2IT4A 3OIMA 2FOUA 1MUAA 2QOAA 4HT2A 1RZEA 5SZ5A 2NNOA 3N2PA 1CNXA 3DD8A 4QIYA 2HOCA 3S72B 5DSKA 3RZ8A 4R5BA 3P3HA 3M40A 4Z1JA 1FSQA 3M3XA 4LP6A 5FLSA 3F8EA 3IBNA 3HLJA 3NI5A 4TWMA 5DRSA 1KWRA 1TE3X 1BV3A 5FNLA 3MWOA 3M5SA 4LU3A 4CACA 5DSRA 1CVCA 3V3HB 5DVXA 5EH8A 1CVBA 4Q06A 3N4BA 1CCUA 2CBCA 4JSWA 1UGCA 1ZSCA 3MDZA 5E2MA 3M1WA 3RYJB 3RG4A 3FFPX 4ETQC 1BCDA 4ZWZA 1ZGFA 1YDDA 2NNSA 3L14A 3IEOA 4FVOA 5JQTA 1TEUX 5EKHA 2X7UA 4YXIA 3CA2A 3PJJA 3M2YA 3S71B 1Y7WA 3N3JA 5SZ3A 4ZWYA 3M5TA 5FLTA 1HECA 1CNJA 5CLUA 3IBUA 1V9EA 4Z1NA 1AM6A 4Q99A 1URTA 4BF6A 4Q0LA 3OYSA 5AMGA 2FMGA 1CIMA 5DOHA 4QSJA 4K13A 1I9NA 4X5SA 3RYYA 5EH5A 1BN4A 3HKTA 4N16A 4Q49A 4CNXA 4ITOA 5SZ2A 3P5AA 4IDRX 1BNWA 2WD2A 5SZ1A 1KEQA 3T84A 3T85A 4ZAOA 2EU2A 1CILA 5DSMA 4CA2A 3KOIA 4WL4A 5E2RA 1TH9A 4HEWA 5HPJA 4KUWA 5JG5B 1RAYA 3RZ0B 3T83A 4IWZA 3Q31A 4BF1A 1YDBA 4ZWXA 3PO6A 1TG9A 1UGDA 2WD3A 2CBEA 1I8ZA 2GEHA 1XQ0A 3CAJA 3HFPA 1OKMA 3DCSA 5AMLA 5EZTX 3MNAA 3IGPA 3SAXA 3V2MA 3F4XA 2O4ZA 1CAYA 3B4FA 1ZFKA 3TVOX 1CVFA 3S9TA 1Z93A 2HKKA 1BICA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4M2R A;  3V5G A;  1H9N A;  5EHE A;  1RZD A;  1JD0 A;  3B1B A;  3S78 B;  2FW4 A;  2OSM A;  2FNK A;  5BYI A;  5FL4 A;  1CAI A;  4Q6D A;  1CZM A;  3RZ7 A;  5CA2 A;  3MNJ A;  3KIG A;  4FIK A;  2FNN A;  4L5V A;  3OY0 A;  1YDC A;  2NWP A;  4YYT A;  3FW3 A;  2FOQ A;  5JDV B;  4QEF A;  3M2X A;  4KNI A;  3RLD A;  4XE1 A;  1G0E A;  3P58 A;  5SZ0 A;  4E9O X;  4RFD A;  3CYU A;  4FL7 A;  2AW1 A;  4RIV A;  1UGF A;  5G0B A;  5DSP A;  3V2J A;  2NNG A;  5FDC A;  1LGD A;  1IF5 A;  1I9O A;  3MYQ A;  2Q1B A;  1LZV A;  3MNH A;  1YO2 A;  1OQ5 A;  2ABE A;  4QJX A;  3W6I A;  5BNL A;  5DSI A;  2WEH A;  3T5Z A;  1OKN A;  1ZE8 A;  4Q8X A;  3KWA A;  4K0T A;  1BNU A;  4MTY A;  4KNJ A;  1BNT A;  3DA2 A;  1BZM A;  5JQ0 A;  5JGT B;  5E28 A;  4Q81 A;  1AZM A;  4FRC A;  3P5L A;  2H4N A;  3M2N A;  3MHL A;  4Q90 A;  4QJO A;  4FVN A;  1DMY A;  5BRU A;  4Q07 A;  9CA2 A;  4Q83 A;  4HEY A;  1THK A;  6CA2 A;  4QSI A;  5IPZ A;  4Q78 A;  1LG5 A;  5FL5 A;  5FNI A;  2EZ7 A;  1DCB A;  1IF8 A;  1F2W A;  3ZP9 A;  4YX4 A;  4FU5 A;  3DC9 A; 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