3CA2A

Crystallographic studies of inhibitor binding sites in human carbonic anhydrase ii. a pentacoordinated binding of the scn-ion to the zinc at high p*h
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Crystallographic studies of inhibitor binding sites in human carbonic anhydrase II: a pentacoordinated binding of the SCN- ion to the zinc at high pH.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Lyase(oxo-acid)
total genus 78
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1989-10-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3ca2A00
3V5GA 2QO8A 4MTYA 1G0EA 1CA3A 1FR4A 2NWZA 3BL1A 5E2RA 2NXSA 2ABEA 2FNNA 3RZ0B 3FFPX 6CA2A 1CVHA 1UGCA 1Z93A 1TEQX 4Q7PA 4YYTA 2FNKA 3RYVB 1I9NA 1MUAA 1G0FA 3DA2A 2CBBA 4ILXA 4Q6DA 1CNJA 4QIZA 4Q7SA 4KNNA 1CNWA 1CAMA 1CAJA 4KP8A 1CAYA 3T83A 1XEVA 4JSZA 4RIVA 8CA2A 1BNTA 4RUYA 1BICA 1G46A 1FQNA 4QK1A 1CNBA 4XIWA 5CLUA 3PYKA 3MYQA 1TG9A 4KUYA 1BV3A 1IF4A 3M5TA 4G7AA 4E3HA 1CVCA 1ZFQA 5BRVA 3RZ7A 1KWQA 3KONA 1BNWA 3OKUA 3RJ7A 4UOVA 4Q83A 4JS6A 5E5UA 4YXOA 5FLSA 1CNIA 1EOUA 5SZ6A 4Q9YA 5DSMA 3RGEA 1CNGA 4PYXA 5EHWA 4E5QA 4QY3A 3RZ1B 3M5SA 5EH8A 3MHIA 2WEHA 5DOGA 1JCZA 3DD8A 2WD3A 3CYUA 1UGFA 3DC3A 3OYSA 1CRMA 5FDCA 4CNWA 4K0ZA 4WR7A 4YHAA 5E2NA 3IAIA 9CA2A 1YDDA 1YDCA 5FNKA 1ZNCA 3NJ9A 1HCBA 3MDZA 4RUZA 3K7KA 5FNJA 2NMXA 4KNJA 4CNXA 3EFIA 5A6HA 2CBEA 5JQ0A 4E3DA 3V3JA 3MNUA 5JGSB 3SAXA 1YO0A 1CRAA 3M2ZA 3P55A 3MHCA 1T9NA 4ZX0A 3D92A 3V3HB 2Q1BA 3L14A 3B1BA 4MDGA 1CAZA 3TVNX 3S73B 4PZHA 4QEFA 3RG4A 4FVNA 3C7PA 4Q07A 4ZWIA 2FOYA 3P5AA 1YDBA 2EU2A 5FLQA 5FNIA 1OQ5A 4E49A 4X5SA 3IBNA 2FMGA 5DSNA 5JEHB 1CCUA 5EKHA 1LGDA 1ZGFA 2HFWA 4YXIA 3M2XA 3M2YA 4Q81A 1CA2A 4PYYA 2NNVA 1ZGEA 4KUVA 5G01A 5FNGA 4HF3A 5DVXA 4CA2A 1BN3A 3M5EA 4L5WA 3V3FA 1DCBA 5BNLA 3SAPA 1RAZA 3DV7A 5DSIA 4XZ5A 4ZWYA 3F4XA 5E2SA 5SZ4A 2POVA 4ITPA 3VBDA 2NWOA 5DSRA 4Q08A 3DBUA 3N4BA 1CAHA 4Q90A 4YVYA 1BNVA 1A42A 4ZX1A 1G45A 2OSFA 1H9NA 1KEQA 4TWLA 3EFTA 1I9LA 4HBAA 3S75B 3MHLA 3MNAA 4E3GA 3T84A 3D93A 3RZ8A 3T5UA 3S97A 2H15A 4KAPA 1TG3A 5SZ3A 3KWAA 3HFPA 4GL1X 1RZAA 4XFWA 1FQMA 4YWPA 4MLTA 2AW1A 1CNYA 1CIMA 3W6HA 2CBCA 5CA2A 3RYZA 1CALA 1RJ5A 4K0SA 4MLXA 5JDVB 3HKNA 1DMYA 4XIXA 4K0TA 3W6IA 3BL0A 2Q38A 2WEJA 5AMDA 4CQ0A 5FLOA 5BRWA 1G54A 1RZBA 5G03A 1CAIA 4RFDA 1UGEA 5E5RA 3IBIA 3SBHA 3QYKA 3UYNA 5DOHA 2NXRA 2NNGA 3M2NA 1DCAA 3RLDA 2NXTA 3V2JA 2CBAA 4PQ7A 2POUA 1G53A 1ZSAA 3R17B 4MDMA 2HOCA 1UGGA 1G4OA 5FDIA 4M2RA 4HEWA 4KUWA 3OY0A 4Z1NA 1CAKA 1CVBA 4LU3A 1G52A 4FRCA 3TMJA 1RZCA 3Q31A 3DC9A 1RZDA 1HEDA 1TB0X 3DVDA 2QOAA 3S74B 3T85A 1AM6A 4Q06A 1V9IC 4Q09A 2CABA 1OKNA 1THKA 3KKXA 1IF6A 1V9EA 5EIJA 4E3FA 1CVFA 3HLJA 1ZE8A 2HL4A 3D8WA 5J8ZA 2O4ZA 3DVBA 5JEPB 1BNQA 1FSQA 4L5UA 4CNRA 3CZVA 3NI5A 3DVCA 4QSJA 5FNHA 4G0CA 5JEGB 4HU1A 3M96A 4WW6A 2AX2A 4RUXA 2GD8A 4QTLA 4KP5A 1DMXA 4ZAOA 3V3GB 4KNIA 4QJPA 3F7BA 4JSAA 1UGAA 1RZEA 4C3TA 3F8EA 3OILA 1FR7A 3CAJA 1Z97A 4LHIA 1BN1A 1KOPA 1LUGA 4Q87A 1LZVA 1XPZA 4FIKA 2FNMA 2HNCA 1HVAA 3S77B 5DSJA 3IBLA 4QSIA 4N0XB 1F2WA 1CAOA 1IF7A 12CAA 1XQ0A 1LG5A 3M1QA 3HKQA 4K13A 1I9OA 3ZP9A 1JV0A 3HKUA 3MNIA 1CVEA 1BCDA 4E4AA 4ETQC 3M1KA 2FOUA 2X7TA 5EKJA 3U3AX 2NWYA 1G3ZA 1I8ZA 3B4FA 5DSKA 4RFCA 2HD6A 4Z1JA 3S72B 4Y0JA 4R59A 5FL5A 2FOSA 5FNLA 2POWA 3P44A 2ZNCA 4FL7A 3OIKA 5L6KA 5L3OA 5BYIA 4YGKA 2FMZA 2NNSA 2WEOA 5E28A 4QK2A 4WUPA 3U7CA 1ZSBA 2HKKA 1H4NA 1CILA 3P3JA 5LMDA 4E9OX 1G48A 2ILIA 3M40A 4Q7VA 1FQRA 4WL4A 4Z1KA 1OKLA 4MO8A 4M2UA 4MDLA 1BNMA 4FU5A 5EKMA 5JG3B 3M1WA 1ZSCA 4Q7WA 3P58A 1BN4A 1IF8A 4FVOA 5EOIA 4Z1EA 2GEHA 4IDRX 3T5ZA 2CBDA 5HPJA 5C8IA 1RAYA 1FLJA 2IT4A 4JSSA 4PXXA 3GZ0A 3MHMA 4COQA 1HEAA 4N16A 4DZ9A 5CACA 1H9QA 5SZ2A 5JG5B 1Z9YA 4RN4A 3DAZA 3D9ZA 3DCWA 1Y7WA 5DSLA 5AMGA 1HUGA 4Q0LA 3M98A 4BCWA 3MHOA 2NWPA 2Q1QA 4LP6A 2NNOA 3DCSA 1CNXA 3OIMA 1CNKA 1YDAA 3KLDB 2NN7A 5SZ5A 4L5VA 5DSQA 1RJ6A 1IF5A 4HEYA 4YGNA 4BF1A 2WD2A 3OKVA 1TEUX 3ML2A 3D0NA 3RYXB 5JESB 1FSRA 3OYQA 5FLRA 5A25A 3V7XA 3KOIA 3PJJA 2WEGA 5E2KA 3NB5A 1CVDA 4FPTA 1JD0A 1I91A 4Q8XA 4BF6A 4CNVA 4QJWA 5DSOA 3JXFA 3RZ5A 3S76A 1OKMA 5CJFA 5JGTB 1CCTA 3IEOA 5AMLA 3F7UA 1LG6A 3U45X 3ML5A 1FQLA 4YGLA 4QJ0A 3CA2A 1HECA 1HUHA 1TH9A 1CNHA 2VVAX 3S9TA 2H4NA 5BRUA 4YGFA 3JXGA 3MNKA 5DSPA 3DD0A 3MMFA 3N3JA 3V3IB 1CINA 4WW8A 2VVBX 4R5AA 1ZFKA 1KWRA 3M3XA 4Q78A 3LXEA 3R16A 4R5BA 1IF9A 3DCCA 4Q49A 2OSMA 4CACA 5SZ0A 4Q8ZA 5JQTA 3P4VA 1AVNA 3HKTA 2X7SA 3S71B 1BZMA 5SZ7A 1BNNA 5G0BA 3M04A 1I9PA 4JSWA 3JXHC 4QJXA 3KS3A 3RYJB 1TTMA 2F14A 3MNJA 4RH2A 5FLPA 1BNUA 4KV0A 2FW4A 3V2MA 3S8XA 3KIGA 2NN1A 1FSNA 2W2JA 4Q6EA 1J9WA 1I9MA 3ZNCA 4QJMA 5EHVA 2FOVA 3T82A 1AZMA 3K34A 3KOKA 1I90A 3PO6A 1CZMA 1UGBA 1XEGA 4Z0QA 3N2PA 4HT2A 5SZ1A 5EZTX 3S78B 4YGJA 3UYQA 3HS4A 3M1JA 2FOQA 1URTA 5IPZA 5E2MA 1G4JA 2EU3A 1HCAA 4IWZA 4M2VA 1KOQA 1UGDA 4ITOA 5EH5A 3IGPA 4Q99A 3M14A 4M2WA 5DRSA 4XE1A 3U47A 5G0CA 1CCSA 4WUQA 3TVOX 3P5LA 2EZ7A 4YX4A 3KNEA 4QJOA 4TWMA 3MNHA 1ZH9A 2QP6A 5FL6A 3MZCA 4QSBA 1G1DA 3BETA 5FNMA 2X7UA 4YXUA 1CNCA 3M67A 3RG3A 5FLTA 4HEZA 4KNMA 1CVAA 2CA2A 4QIYA 4DZ7A 4Q8YA 1YO2A 4QK3A 4K1QA 3K2FA 3SBIA 1HEBA 1YO1A 3RYYA 1I9QA 1TBTX 4RIUA 4HT0A 1MOOA 3MWOA 1G6VA 3P3HA 3FE4A 3IBUA 5FL4A 3N0NA 7CA2A 1TE3X 4QSAA 1CANA 3FW3A 5EHEA 4ZWZA 4ZWXA 5EH7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3V5G A;  2QO8 A;  4MTY A;  1G0E A;  1CA3 A;  1FR4 A;  2NWZ A;  3BL1 A;  5E2R A;  2NXS A;  2ABE A;  2FNN A;  3RZ0 B;  3FFP X;  6CA2 A;  1CVH A;  1UGC A;  1Z93 A;  1TEQ X;  4Q7P A;  4YYT A;  2FNK A;  3RYV B;  1I9N A;  1MUA A;  1G0F A;  3DA2 A;  2CBB A;  4ILX A;  4Q6D A;  1CNJ A;  4QIZ A;  4Q7S A;  4KNN A;  1CNW A;  1CAM A;  1CAJ A;  4KP8 A;  1CAY A;  3T83 A;  1XEV A;  4JSZ A;  4RIV A;  8CA2 A;  1BNT A;  4RUY A;  1BIC A;  1G46 A;  1FQN A;  4QK1 A;  1CNB A;  4XIW A;  5CLU A;  3PYK A;  3MYQ A;  1TG9 A;  4KUY A;  1BV3 A;  1IF4 A;  3M5T A;  4G7A A;  4E3H A;  1CVC A;  1ZFQ A;  5BRV A;  3RZ7 A;  1KWQ A;  3KON A;  1BNW A;  3OKU A;  3RJ7 A;  4UOV A;  4Q83 A;  4JS6 A;  5E5U A;  4YXO A;  5FLS A;  1CNI A;  1EOU A;  5SZ6 A;  4Q9Y A;  5DSM A;  3RGE A;  1CNG A;  4PYX A;  5EHW A;  4E5Q A;  4QY3 A;  3RZ1 B;  3M5S A;  5EH8 A;  3MHI A;  2WEH A;  5DOG A;  1JCZ A;  3DD8 A;  2WD3 A;  3CYU A;  1UGF A;  3DC3 A;  3OYS A;  1CRM A;  5FDC A;  4CNW A;  4K0Z A;  4WR7 A;  4YHA A;  5E2N A;  3IAI A;  9CA2 A;  1YDD A;  1YDC A; 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