3CAJA

Crystal structure of the human carbonic anhydrase ii in complex with ethoxzolamide
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Carbonic anhydrase inhibitors: the X-ray crystal structure of ethoxzolamide complexed to human isoform II reveals the importance of thr200 and gln92 for obtaining tight-binding inhibitors
pubmed doi rcsb
total genus 76
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2008-02-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3cajA00
5CA2A 1KOPA 4N0XB 3NB5A 4QK2A 4KP8A 4YGFA 1ZE8A 4KUWA 2ZNCA 4RH2A 4R59A 4M2WA 1FSQA 1URTA 5E5UA 4HEYA 2HFWA 1UGAA 3Q31A 3KIGA 3ZNCA 5FNJA 1ZH9A 3N4BA 2AX2A 1FQRA 1THKA 4Q87A 4ZX0A 4ZWYA 3TVNX 1CAZA 3B4FA 4QY3A 5FDCA 1CANA 1RZDA 1YO2A 2X7UA 2CBDA 3M5EA 4K1QA 1YDCA 4HF3A 4E3DA 3DVDA 3M1KA 3MHOA 1G1DA 4RFDA 4YX4A 3RG4A 1ZGEA 5J8ZA 1MOOA 3IBNA 3P5LA 4JSSA 3DCSA 3T84A 2CABA 3S71B 1IF8A 2X7TA 1KWRA 4YGKA 5EZTX 5SZ6A 4Q49A 3S78B 1YDDA 2FNMA 5HPJA 2FOUA 3M96A 5CJFA 5DSLA 4Q90A 1OKLA 3PO6A 1G3ZA 2NNVA 1H9QA 3KLDB 4YXUA 1XEVA 3M98A 5SZ2A 4PYYA 4KAPA 3W6IA 4QJ0A 2WD2A 3UYNA 4COQA 3M1JA 1LG6A 1BNUA 4RIVA 5JESB 5JG3B 5E2SA 1EOUA 5SZ7A 2POUA 3M40A 3RYXB 1ZFQA 5AMGA 1BNTA 1TEQX 2GD8A 4PXXA 2GEHA 4Q07A 4QJXA 4GL1X 4MDLA 1FQNA 1HUGA 1IF6A 3P4VA 5EIJA 3SAXA 3EFIA 1BN3A 4CNRA 3MHCA 4FVOA 3RYZA 2NWPA 1HECA 4YYTA 1BNVA 4JSAA 1IF9A 5FLPA 4YXIA 2Q1BA 1HCBA 3JXHC 4QIZA 3S9TA 1YDBA 3RZ0B 3KOKA 1TTMA 5G0BA 3DAZA 1V9IC 1CRAA 4Q8YA 3T82A 1CALA 2NWZA 3MNHA 3OIMA 3R17B 3BETA 4Q9YA 3RLDA 5E2MA 1UGCA 3T83A 4CACA 1Z97A 3HKUA 1IF7A 1BN4A 3M3XA 5JQTA 2WEGA 3V3IB 1TEUX 3UYQA 4CNVA 3OY0A 4ZWIA 1ZFKA 5SZ3A 1TB0X 4ZWZA 1Z93A 1CCSA 3MNJA 4FIKA 5FL6A 3S97A 3D0NA 5FLQA 5FLTA 2NNGA 5JEGB 5LMDA 4QSJA 3DCCA 1G45A 1BV3A 3D9ZA 4RUZA 4WL4A 3T5ZA 3CA2A 2WEOA 3N3JA 4Q7VA 3U47A 4Y0JA 4CQ0A 1AM6A 5DVXA 1JCZA 2FOVA 1I9NA 5FLSA 2NXSA 1BNNA 1ZNCA 1I8ZA 3CYUA 5E5RA 1UGGA 2FOYA 4HU1A 4RFCA 1RAZA 1ZSBA 2WD3A 5G0CA 1CA2A 4HEWA 4R5BA 4KP5A 1BICA 2NN1A 2NN7A 1DCBA 2CBAA 4HEZA 1CNCA 4MTYA 1HVAA 2H4NA 5E2NA 5EOIA 4Z1NA 3M2NA 4JSZA 3ML5A 4ZWXA 1KOQA 4QK1A 3VBDA 4ZX1A 5DSJA 1G46A 1FR4A 4IWZA 1CNIA 7CA2A 4KNNA 4Z1JA 1CAKA 4MLTA 4E3GA 1BNWA 1G6VA 2NNSA 1I9MA 3F7UA 4YVYA 1CINA 2ABEA 5JGSB 4M2UA 1DCAA 3MNAA 4WW6A 1Z9YA 3V5GA 1H4NA 3P5AA 3KONA 4K0ZA 1AZMA 2HL4A 2OSMA 4E5QA 4QJMA 5SZ5A 1AVNA 1OKNA 3LXEA 4K0SA 4TWLA 3D8WA 5FNHA 1CAJA 5E2RA 1UGEA 1CNBA 1CCUA 1BNQA 3ML2A 2X7SA 3MDZA 2EU2A 1T9NA 1RAYA 4Q8ZA 1OQ5A 5BYIA 1YO1A 3S77B 1V9EA 1YDAA 4WUQA 5IPZA 1CVDA 2CA2A 3DBUA 8CA2A 4RIUA 5BRVA 5DOHA 3P3HA 2NMXA 2F14A 3S8XA 5E28A 4QK3A 4Q8XA 4CNWA 4DZ7A 1ZSAA 1HCAA 4QSIA 1CVEA 4YGNA 3T85A 12CAA 1CVCA 1FQMA 1F2WA 1I91A 1RJ5A 3HKTA 3D92A 1I9QA 3DC3A 1RZAA 5FL4A 5JDVB 5G03A 4Q6DA 2CBCA 2HOCA 4Z0QA 3KNEA 2FOSA 2IT4A 1LGDA 2HNCA 4G7AA 4QJWA 1CVHA 1CVAA 3L14A 3P44A 4HBAA 3B1BA 3RG3A 1JD0A 1HUHA 1FSNA 4MDMA 5CACA 4Z1KA 4PYXA 9CA2A 4L5WA 3DD0A 5EHWA 3SAPA 4ITOA 3KS3A 3OYQA 4MO8A 1TG3A 4CA2A 4E3FA 3M2XA 3M5SA 4ILXA 1FR7A 4WW8A 5FNLA 2EU3A 4RUXA 3RYVB 4QTLA 3V3FA 5FL5A 1CAYA 1TBTX 4MDGA 3V2JA 3DV7A 3K2FA 4QSBA 3SBHA 2VVBX 5EKMA 1G4JA 3DD8A 4LP6A 1Y7WA 4XZ5A 5SZ1A 4FL7A 1BNMA 4PQ7A 3RZ8A 5SZ4A 5DSPA 3IGPA 3RYYA 3M2ZA 5DSQA 4QJPA 3V3JA 4Q83A 2W2JA 5L6KA 2EZ7A 4YXOA 2FMGA 3OILA 4UOVA 4XE1A 1HEBA 4LU3A 3OKUA 5BRWA 3M67A 1CNJA 2NXRA 4Z1EA 5SZ0A 3RZ1B 4FPTA 1DMYA 3HKQA 3P3JA 1FQLA 4IDRX 4L5VA 4Q09A 3DC9A 1BN1A 1CA3A 4N16A 4E3HA 1ZGFA 5C8IA 1CNXA 2FOQA 4M2RA 4MLXA 3KKXA 1KEQA 2CBEA 3OKVA 4YHAA 4CNXA 4E49A 2AW1A 3OYSA 1I90A 3V3HB 1CIMA 1BCDA 4DZ9A 2HD6A 1RZBA 1G54A 1TG9A 3MMFA 1CNWA 3IBIA 4Q7SA 1CRMA 3U45X 4KV0A 1BZMA 3C7PA 3CAJA 2QO8A 2NWYA 5JEHB 1G4OA 3JXFA 5AMDA 4QSAA 5DSKA 3S76A 2CBBA 5EHEA 1G52A 1CAMA 1DMXA 1FSRA 4BCWA 3V3GB 3IBLA 4X5SA 3MWOA 2WEHA 3QYKA 5EH5A 1CNGA 4TWMA 5DSRA 1CAOA 3S72B 4Q7PA 1J9WA 3BL1A 2H15A 4K0TA 3P58A 1CAIA 1RZCA 5E2KA 3HLJA 5FDIA 4Q78A 5JGTB 3HS4A 4FU5A 4LHIA 4QEFA 4E4AA 5EKHA 4FRCA 3DCWA 3HKNA 3D93A 5DRSA 3ZP9A 2Q1QA 4L5UA 5G01A 1CNKA 3R16A 4ITPA 4WR7A 5FNMA 4XIWA 5DOGA 1LZVA 4XFWA 3MZCA 1KWQA 3NJ9A 5DSIA 3PJJA 4G0CA 4JS6A 3U3AX 1I9PA 1TE3X 2QP6A 5JEPB 5A6HA 4Q6EA 3T5UA 3FFPX 4Q99A 5JQ0A 4KUVA 2Q38A 3NI5A 5BNLA 4XIXA 3MNIA 3N2PA 2FNNA 3IBUA 4PZHA 3RYJB 5FNGA 1G53A 4KUYA 3FE4A 3M1WA 3IEOA 5EH8A 5DSNA 3S75B 1OKMA 4YWPA 4ZAOA 3SBIA 1CZMA 5BRUA 1IF5A 2NXTA 3RJ7A 3BL0A 3V7XA 5A25A 1UGDA 3MHLA 4E9OX 1RZEA 1IF4A 2FNKA 1G0FA 4QIYA 6CA2A 3P55A 3PYKA 1CVBA 1RJ6A 4C3TA 2OSFA 2VVAX 4KNIA 2NNOA 3DVBA 1UGBA 4YGLA 1G48A 2POWA 3K7KA 2QOAA 1CVFA 4KNMA 4R5AA 3IAIA 3S73B 1LG5A 4BF1A 3DVCA 1XPZA 1HEDA 1MUAA 4WUPA 3M5TA 2FMZA 3N0NA 1XEGA 3MHMA 1TH9A 1XQ0A 3F4XA 5FNKA 1CNYA 1CNHA 5DSOA 4JSWA 4Q0LA 5FLOA 4RUYA 5FLRA 1CILA 3DA2A 1I9OA 4Q08A 1I9LA 3M14A 3V2MA 4HT0A 2O4ZA 3EFTA 1A42A 2FW4A 3GZ0A 4Q81A 5EH7A 5FNIA 1FLJA 2WEJA 1HEAA 3M2YA 3M04A 1JV0A 2POVA 4HT2A 3MYQA 4YGJA 4QJOA 3F8EA 3MHIA 5EHVA 4ETQC 3KWAA 3KOIA 4FVNA 1G0EA 5AMLA 3HFPA 3U7CA 1CAHA 3CZVA 3TVOX 1YO0A 3S74B 3MNUA 4Q7WA 3JXGA 1CCTA 1UGFA 4RN4A 4KNJA 4BF6A 3OIKA 3M1QA 2NWOA 5JG5B 3K34A 1H9NA 4K13A 4Q06A 5DSMA 3TMJA 3W6HA 3RZ5A 1LUGA 1ZSCA 2HKKA 2ILIA 4M2VA 3RZ7A 3FW3A 5L3OA 5EKJA 3RGEA 5CLUA 3F7BA 3MNKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5CA2 A;  1KOP A;  4N0X B;  3NB5 A;  4QK2 A;  4KP8 A;  4YGF A;  1ZE8 A;  4KUW A;  2ZNC A;  4RH2 A;  4R59 A;  4M2W A;  1FSQ A;  1URT A;  5E5U A;  4HEY A;  2HFW A;  1UGA A;  3Q31 A;  3KIG A;  3ZNC A;  5FNJ A;  1ZH9 A;  3N4B A;  2AX2 A;  1FQR A;  1THK A;  4Q87 A;  4ZX0 A;  4ZWY A;  3TVN X;  1CAZ A;  3B4F A;  4QY3 A;  5FDC A;  1CAN A;  1RZD A;  1YO2 A;  2X7U A;  2CBD A;  3M5E A;  4K1Q A;  1YDC A;  4HF3 A;  4E3D A;  3DVD A;  3M1K A;  3MHO A;  1G1D A;  4RFD A;  4YX4 A;  3RG4 A;  1ZGE A;  5J8Z A;  1MOO A;  3IBN A;  3P5L A;  4JSS A;  3DCS A;  3T84 A;  2CAB A;  3S71 B;  1IF8 A;  2X7T A;  1KWR A;  4YGK A;  5EZT X;  5SZ6 A;  4Q49 A;  3S78 B;  1YDD A;  2FNM A;  5HPJ A;  2FOU A;  3M96 A;  5CJF A;  5DSL A;  4Q90 A;  1OKL A;  3PO6 A;  1G3Z A;  2NNV A;  1H9Q A;  3KLD B;  4YXU A;  1XEV A;  3M98 A;  5SZ2 A;  4PYY A;  4KAP A;  3W6I A;  4QJ0 A;  2WD2 A;  3UYN A;  4COQ A;  3M1J A;  1LG6 A;  1BNU A;  4RIV A;  5JES B;  5JG3 B;  5E2S A;  1EOU A;  5SZ7 A;  2POU A;  3M40 A;  3RYX B;  1ZFQ A;  5AMG A;  1BNT A;  1TEQ X; 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