3DD0A

Use of carbonic anhydrase ii, ix active-site mimic, for the purpose of screening inhibitors for possible anti-cancer properties
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Design of a carbonic anhydrase IX active-site mimic to screen inhibitors for possible anticancer properties
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Lyase
total genus 75
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2008-06-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3dd0A00
1YDBA 2CBCA 2WD2A 4JSSA 3VBDA 1G1DA 1HEBA 3M2NA 4QIZA 1BZMA 1DMYA 4RH2A 4CNXA 4Q78A 3DBUA 2POUA 5FL6A 3F7BA 4XFWA 2CBDA 1BNMA 3FE4A 5DSJA 5JESB 4L5WA 1CANA 4YXUA 3NI5A 3D8WA 1IF4A 4ZWYA 4Q81A 3MMFA 4ZX0A 3S75B 3JXHC 4CNRA 1BNUA 1I9PA 3UYNA 1CVBA 1KOQA 3OKUA 3V5GA 3SAPA 1HCAA 1CILA 4KUWA 1Z93A 3M67A 5E28A 4WUQA 1H4NA 4K0ZA 1CNHA 4R5AA 5SZ3A 4QJXA 1IF7A 3S73B 4ZX1A 3CYUA 3KIGA 3RZ1B 2FOQA 1TB0X 4UOVA 2GEHA 5BYIA 4K0TA 4Z1JA 2NNVA 4HEYA 4KUVA 3RYXB 3P3JA 4CNWA 4E5QA 3M5EA 4HF3A 2AW1A 1Y7WA 5SZ1A 1DCAA 1V9IC 5E2RA 3QYKA 4CA2A 3MDZA 4ZWXA 3RZ0B 3V3FA 1YDDA 3S78B 2QO8A 2NWYA 5E2MA 3DD8A 4LU3A 3ZP9A 3M2XA 3F4XA 3D93A 3MHMA 2HKKA 5JQTA 4E3GA 4IWZA 4YYTA 1RAYA 4RIUA 5FLTA 1XQ0A 1ZSBA 2FOUA 3NB5A 3IBNA 1ZGEA 6CA2A 1CAYA 4FVOA 1KEQA 4L5UA 1TEQX 3DC3A 3PYKA 3DVDA 4PXXA 5DVXA 1CAIA 4YGLA 5FDCA 1IF8A 1FSRA 1TTMA 1CNKA 4YGFA 3S77B 3N4BA 3S76A 1HEAA 1ZNCA 2F14A 3DVCA 5FNKA 1LZVA 5SZ2A 3MNUA 3MNJA 5FLSA 1UGDA 1DCBA 3M5TA 1RJ6A 3KONA 5G0CA 1TG9A 3M1JA 3P5LA 1UGFA 3V3HB 1G4JA 3T82A 2OSMA 4QJWA 3B4FA 4Q87A 2WEGA 4Q9YA 3D9ZA 4RUZA 3D0NA 1ZFQA 1YDCA 4E3HA 4LHIA 4WR7A 1BN4A 3MNHA 3MHCA 1TEUX 2NNOA 1URTA 2POWA 1ZE8A 1ZSAA 5SZ7A 5DSMA 4Q49A 1CAKA 4GL1X 1YDAA 3OIMA 4XIXA 4E4AA 2ZNCA 2NNSA 4Q8XA 4Q83A 4YWPA 1RZCA 1FQRA 1FQNA 5EKHA 4Q99A 1TG3A 3FFPX 3HKNA 3TVNX 5BNLA 3S74B 3DD0A 3IBUA 3OILA 2NN7A 4QSBA 3ML2A 5DOHA 3RYVB 3M14A 1G6VA 4Q09A 5JEHB 1CCUA 3S8XA 4KNIA 3RYYA 4Q7WA 4KNNA 1LGDA 1FLJA 1HCBA 4X5SA 5L3OA 2HOCA 2EZ7A 3P55A 4QSJA 1BNTA 4Z1NA 1THKA 3V2MA 1I9QA 1FSQA 1CVHA 3HKTA 4DZ9A 3U47A 1I9MA 5DSPA 3ZNCA 4MTYA 1G52A 3HLJA 4Q8ZA 4QK3A 4CQ0A 3UYQA 3T85A 1UGEA 4E49A 3T84A 3RGEA 2QOAA 5A25A 1Z97A 2EU3A 2HL4A 3V3JA 4Q0LA 5FNGA 1BICA 2CBEA 5A6HA 4BCWA 1OKNA 4HEWA 1CVCA 8CA2A 4L5VA 3IGPA 1IF5A 4WUPA 3C7PA 1BN1A 1MOOA 12CAA 2IT4A 5JQ0A 4WW8A 3S97A 5FNHA 3T5UA 2HNCA 3K2FA 2FNNA 5FL4A 3P58A 4MDGA 5FDIA 4COQA 3U7CA 4M2RA 3EFTA 2WEJA 1EOUA 3PJJA 1ZGFA 4QJOA 4ZWZA 1A42A 1LG5A 3M1KA 3MZCA 4RN4A 4WL4A 9CA2A 3R16A 4M2UA 1V9EA 4XE1A 5FNJA 1XEGA 1CNCA 5BRUA 1T9NA 2NWOA 3DCCA 4FL7A 3MWOA 2NXRA 3N3JA 5E2SA 1CVFA 5JEPB 4QJ0A 1RJ5A 4HBAA 5FL5A 4JSWA 3RZ8A 3W6HA 4N16A 1CINA 3IEOA 5FLQA 2OSFA 1IF9A 4M2VA 1RZDA 1MUAA 1HVAA 5AMDA 3DA2A 3RZ5A 3P44A 1BNQA 4YVYA 3RYZA 2CA2A 3N2PA 5E5RA 3SBHA 5AMLA 1CVDA 1LUGA 3ML5A 5SZ6A 1AVNA 3MYQA 3DC9A 2WEHA 2FNKA 4IDRX 2X7UA 3S71B 3RZ7A 3T83A 3M04A 4YX4A 3DV7A 5EH8A 4JS6A 5CACA 3KOIA 3R17B 4R59A 5EH7A 3EFIA 3DVBA 3L14A 4CNVA 1CAMA 3JXFA 3K34A 4Q08A 4BF1A 4QK1A 4YXIA 5CLUA 4E9OX 3GZ0A 1J9WA 5JDVB 4QSIA 2CBBA 3V3GB 3OY0A 4Q8YA 4TWMA 3KKXA 1UGBA 1G48A 1CAZA 1TH9A 4XIWA 1CA3A 5E2NA 5FNLA 3TMJA 4Q06A 3M98A 2X7SA 4R5BA 4Q07A 4HEZA 3OYSA 2H15A 4RUYA 1I9OA 4E3DA 5JG5B 4QY3A 1CA2A 5JG3B 4KNJA 4ZAOA 5FLRA 4KNMA 1BNWA 2W2JA 5DSQA 3IAIA 5DSNA 2EU2A 1G54A 4G0CA 1YO2A 3MHLA 4Q6EA 2NMXA 3B1BA 1H9NA 3T5ZA 4ILXA 1JCZA 2WEOA 2NN1A 2GD8A 1G45A 1UGGA 4QEFA 3S9TA 4Q6DA 5EH5A 3D92A 4ITOA 1OKLA 3CA2A 4LP6A 2O4ZA 3M2YA 1H9QA 4N0XB 3JXGA 1CAHA 4MO8A 4PYXA 4M2WA 2VVBX 1I91A 3KLDB 4JSAA 4Z0QA 3RJ7A 4MLTA 1RZEA 3K7KA 3RYJB 5BRWA 1CRAA 2VVAX 2NWPA 1RZBA 2CABA 5E5UA 2FW4A 2Q38A 3V2JA 1G0FA 4JSZA 1CRMA 3BL0A 4YGNA 4WW6A 2QP6A 4FU5A 4HT0A 5C8IA 4FPTA 1G53A 3MHIA 1FQMA 5G0BA 4PQ7A 1CNBA 2ILIA 2Q1BA 1CIMA 4YGKA 1OQ5A 3HKUA 1CNXA 4ITPA 3P5AA 4KAPA 3MHOA 1G4OA 2HD6A 5DSKA 5L6KA 3BETA 4YXOA 1FQLA 3U3AX 4KP5A 5AMGA 5SZ4A 1HUGA 4RFCA 3PO6A 2POVA 5CA2A 1YO0A 1CVAA 5G03A 1DMXA 1XPZA 1UGAA 3M5SA 1G46A 1XEVA 5DSOA 2HFWA 2NXSA 1CAOA 1ZSCA 3Q31A 4HU1A 5DRSA 3M3XA 4FIKA 1BNNA 5EKMA 4RIVA 1FSNA 2NWZA 3FW3A 4TWLA 4YHAA 3KWAA 3HS4A 1CAJA 3M2ZA 3SAXA 1I90A 3OKVA 4Q7VA 5HPJA 1HECA 3KNEA 4K1QA 4CACA 5FLOA 1F2WA 4KUYA 3SBIA 1BNVA 3TVOX 3M40A 3V3IB 3IBIA 1FR4A 1CALA 3CAJA 1G3ZA 4RUXA 4YGJA 2AX2A 5J8ZA 1JD0A 3NJ9A 4BF6A 5JGTB 1IF6A 1HUHA 3BL1A 5LMDA 1CNJA 3IBLA 1KWQA 4KV0A 5JGSB 1AZMA 3MNAA 5SZ5A 4QIYA 2X7TA 3KS3A 1G0EA 2FMGA 4QJPA 2H4NA 1CCTA 3OIKA 5CJFA 5EHVA 5G01A 1OKMA 4Q90A 7CA2A 5EIJA 4C3TA 4QSAA 1JV0A 1CNGA 5DOGA 3DAZA 3RG4A 2FNMA 1FR7A 1CZMA 2Q1QA 4Y0JA 4FRCA 3M96A 3P4VA 4QK2A 1I9LA 2WD3A 4K0SA 1KWRA 1KOPA 5FLPA 4KP8A 1ZFKA 3P3HA 5DSIA 4QJMA 3KOKA 1CNIA 1Z9YA 2FOVA 3RG3A 4ETQC 2ABEA 2FOYA 3W6IA 5EHEA 3RLDA 2CBAA 5BRVA 1HEDA 4QTLA 1TBTX 5EKJA 1BN3A 3OYQA 5SZ0A 1RZAA 4RFDA 2NNGA 3HKQA 1YO1A 2NXTA 3N0NA 1I8ZA 1CCSA 3DCWA 4HT2A 1LG6A 1RAZA 3U45X 2FMZA 3F8EA 5EZTX 3LXEA 5IPZA 4XZ5A 4Z1EA 4PZHA 1CVEA 3M1WA 3M1QA 5EHWA 3MNKA 5JEGB 4G7AA 3S72B 5DSLA 2FOSA 3CZVA 4DZ7A 4MDLA 4Q7PA 1UGCA 1AM6A 5FNMA 3MNIA 3F7UA 4K13A 4E3FA 3DCSA 5EOIA 4PYYA 1BCDA 1CNYA 1I9NA 4Q7SA 4ZWIA 3V7XA 5DSRA 4MLXA 1BV3A 1CNWA 5E2KA 4Z1KA 1TE3X 4MDMA 3HFPA 4FVNA 1ZH9A 5FNIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1YDB A;  2CBC A;  2WD2 A;  4JSS A;  3VBD A;  1G1D A;  1HEB A;  3M2N A;  4QIZ A;  1BZM A;  1DMY A;  4RH2 A;  4CNX A;  4Q78 A;  3DBU A;  2POU A;  5FL6 A;  3F7B A;  4XFW A;  2CBD A;  1BNM A;  3FE4 A;  5DSJ A;  5JES B;  4L5W A;  1CAN A;  4YXU A;  3NI5 A;  3D8W A;  1IF4 A;  4ZWY A;  4Q81 A;  3MMF A;  4ZX0 A;  3S75 B;  3JXH C;  4CNR A;  1BNU A;  1I9P A;  3UYN A;  1CVB A;  1KOQ A;  3OKU A;  3V5G A;  3SAP A;  1HCA A;  1CIL A;  4KUW A;  1Z93 A;  3M67 A;  5E28 A;  4WUQ A;  1H4N A;  4K0Z A;  1CNH A;  4R5A A;  5SZ3 A;  4QJX A;  1IF7 A;  3S73 B;  4ZX1 A;  3CYU A;  3KIG A;  3RZ1 B;  2FOQ A;  1TB0 X;  4UOV A;  2GEH A;  5BYI A;  4K0T A;  4Z1J A;  2NNV A;  4HEY A;  4KUV A;  3RYX B;  3P3J A;  4CNW A;  4E5Q A;  3M5E A;  4HF3 A;  2AW1 A;  1Y7W A;  5SZ1 A;  1DCA A;  1V9I C;  5E2R A;  3QYK A;  4CA2 A;  3MDZ A;  4ZWX A;  3RZ0 B;  3V3F A;  1YDD A;  3S78 B;  2QO8 A;  2NWY A;  5E2M A;  3DD8 A;  4LU3 A;  3ZP9 A;  3M2X A;  3F4X A;  3D93 A;  3MHM A;  2HKK A;  5JQT A;  4E3G A;  4IWZ A;  4YYT A;  1RAY A;  4RIU A;  5FLT A; 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