3DVCA

X-ray crystal structure of mutant n62t of human carbonic anhydrase ii
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNTGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Role of hydrophilic residues in proton transfer during catalysis by human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2008-07-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3dvcA00
3K34A 4BF6A 5EH8A 3U47A 2OSFA 4FIKA 3W6HA 4WW6A 1MUAA 4CNRA 1RAZA 3DCCA 4KNMA 1CINA 5DSQA 3KOIA 5SZ6A 4QJWA 4CNXA 5DSRA 4FVOA 3MNHA 1RZEA 5DOHA 1FSQA 4FU5A 1ZSBA 3RGEA 5EZTX 1CNJA 1G0EA 3M04A 4Q6EA 4ZAOA 3D8WA 3S97A 4HU1A 4FL7A 1G6VA 4KUYA 3MMFA 4YHAA 2CBCA 2FNNA 4RN4A 1CNGA 1G45A 5JG3B 5EH7A 2POUA 4KNIA 1RJ6A 3DA2A 5BRVA 1UGEA 4WUQA 3SBIA 1CA3A 5SZ2A 3IAIA 4E5QA 4R59A 5DSKA 4R5AA 3CA2A 1OKLA 1BN1A 3JXGA 5SZ5A 3M98A 2AW1A 3TVNX 4UOVA 5CJFA 2CBAA 5EIJA 3N2PA 3RZ1B 5E2SA 2GEHA 3KONA 4RFDA 5LMDA 4M2UA 4CNVA 3OY0A 2CBDA 4Q6DA 5DOGA 4QSJA 5FNGA 5SZ4A 1JV0A 3LXEA 5FL4A 5JQ0A 3M5SA 4ZWIA 3P5LA 4HEWA 3S8XA 3CAJA 4CACA 3S74B 1EOUA 3V2MA 3S75B 1HECA 2FNMA 5CA2A 1HUGA 3F8EA 1RZDA 3V7XA 4QJ0A 1CNKA 3OIMA 4Q8ZA 4C3TA 2X7UA 1KEQA 3VBDA 5SZ3A 4ZWXA 1YDDA 4Q06A 4X5SA 2FOUA 3HKTA 2AX2A 5DSPA 4G7AA 2HNCA 3M1JA 4QY3A 4K0ZA 4MLTA 3OKVA 3SBHA 3V3HB 3B4FA 5CLUA 3RZ0B 4Q90A 3K7KA 5E5UA 1CCUA 8CA2A 1FR7A 1UGGA 2HFWA 4COQA 1CNCA 2NXSA 3ZNCA 4KP5A 4XIXA 4JSAA 4XZ5A 4QIZA 5L3OA 4YGJA 3P58A 3V3FA 4LHIA 4MO8A 3U7CA 2HKKA 5G03A 1G4JA 4RUZA 1CILA 5FNHA 2IT4A 4Q0LA 5JGSB 2OSMA 2X7SA 3M14A 3OYSA 4Q78A 1CA2A 1G3ZA 5DSMA 3L14A 1CNYA 1TG3A 1CRMA 3T83A 3R17B 3P5AA 1CNHA 4YGNA 3MHOA 2WD2A 3P3HA 3P4VA 3MHLA 1HVAA 3EFIA 4QJPA 3V3GB 1G1DA 1BCDA 1CAMA 5EKJA 3JXHC 3S71B 3S78B 1F2WA 4M2WA 3U45X 1ZSAA 3T82A 1TG9A 3M2XA 4YYTA 4Z1KA 4WR7A 3V3IB 5JG5B 3MNAA 5DSNA 3MYQA 1AVNA 3RZ7A 1LG5A 1BNQA 4L5UA 3P3JA 1V9EA 3ML2A 4QSAA 5E2KA 3HFPA 4PXXA 3M96A 5FL6A 5G0CA 5A25A 4YWPA 4L5VA 3OKUA 3RZ8A 1BN4A 5FL5A 3DBUA 2NNGA 1CVFA 3M67A 1H9QA 9CA2A 5AMLA 5FLQA 3EFTA 3CZVA 4LU3A 4YXUA 2QP6A 1V9IC 5BRWA 3BL1A 4KP8A 3M40A 4YX4A 4FRCA 1JD0A 2H4NA 1IF5A 2POVA 1KWQA 1Z97A 3RYVB 3V2JA 4QJOA 3DC9A 3V5GA 3RJ7A 1CANA 3HKUA 3U3AX 3HS4A 4HF3A 4M2VA 3DCWA 1BZMA 3N0NA 2NXTA 1CAOA 3SAXA 3M5EA 1Z9YA 2WEOA 5E2MA 1FSRA 1UGBA 4HT2A 1XEVA 4N16A 4Q7SA 4TWMA 3MNIA 5J8ZA 3IBLA 5JEGB 5DSJA 3KKXA 4E3HA 5EKMA 3ML5A 1CAYA 5EOIA 4ZWYA 1CALA 3IBNA 3NJ9A 4HEYA 1CAHA 1YO0A 4YGFA 1JCZA 4E49A 5CACA 4YXOA 3FFPX 4MDLA 1ZSCA 4Z0QA 1FQNA 2CBEA 4LP6A 7CA2A 1CAJA 5G0BA 1H9NA 1XEGA 2Q38A 1Z93A 1BNNA 1CVEA 2POWA 5BYIA 1UGFA 3T85A 1I91A 5L6KA 4Q09A 1G52A 1H4NA 3HKQA 1CVAA 2NNSA 1XPZA 5E2NA 4HBAA 3ZP9A 1TTMA 4R5BA 5EH5A 5FNLA 5FDCA 4G0CA 3D0NA 4Q7PA 4JSSA 4PZHA 5SZ0A 1G0FA 1YO2A 2FOVA 3M1QA 1CVDA 4ETQC 2FW4A 5JGTB 3RG3A 2ZNCA 2NNOA 4KAPA 1YDAA 3T5ZA 1DMYA 5JEPB 3B1BA 1CZMA 2NWOA 2O4ZA 5JESB 4QSIA 5C8IA 3IBIA 1HEAA 3MHIA 4Q87A 1I8ZA 2CABA 1CAKA 3MNKA 3OYQA 1ZH9A 5EHWA 1I9MA 1KOQA 4CNWA 1UGDA 3MHMA 4Q7WA 1RAYA 5BNLA 4Q81A 2GD8A 3RLDA 2CA2A 2NN1A 4BCWA 1OQ5A 3SAPA 4CA2A 1FR4A 1I9PA 1KWRA 2NWYA 3PYKA 5AMGA 3BL0A 1HUHA 1I9NA 4WL4A 3PO6A 5DVXA 1HCBA 4Q08A 5FLPA 4K13A 2X7TA 1HCAA 4KNNA 3DD8A 1TEUX 1J9WA 1IF4A 3UYNA 1BNTA 2EU3A 2NWZA 4Q8YA 4YGKA 1ZGEA 4ZX1A 1FQRA 2HD6A 3R16A 5SZ1A 3D93A 2CBBA 3HLJA 1DCBA 5SZ7A 1AZMA 2FOSA 3KLDB 3F7BA 4GL1X 4RIUA 1ZFQA 3TMJA 4Z1JA 2VVAX 1BICA 3IBUA 5BRUA 3M2NA 1FSNA 5EHEA 4Q49A 3M5TA 2WEJA 2ILIA 1OKMA 3P55A 1DCAA 4QTLA 1THKA 5FLTA 2NWPA 3S76A 3F7UA 1RJ5A 4QK2A 1HEBA 3BETA 4ZX0A 3RYYA 3S77B 1CVCA 2FOYA 2FMZA 4QIYA 3FE4A 5JEHB 2NXRA 1G46A 3N4BA 4N0XB 1CAIA 4JSZA 5HPJA 1RZCA 1BNMA 1YDCA 2FMGA 1CVHA 12CAA 1TEQX 3KS3A 3PJJA 3M1KA 4E9OX 1I9LA 5DSLA 1HEDA 1BN3A 4WUPA 1CIMA 3Q31A 4RFCA 3T84A 4M2RA 4K1QA 1I90A 1LUGA 4Y0JA 3MZCA 4BF1A 1RZBA 3OILA 4E3FA 3C7PA 3MNJA 3KNEA 3F4XA 3KOKA 2NMXA 4FPTA 4Q83A 4YXIA 4YGLA 1T9NA 2VVBX 3RG4A 5IPZA 4RIVA 4RUYA 5FLOA 3V3JA 3S9TA 5JDVB 3MDZA 3N3JA 4MTYA 1G48A 3RYJB 5FNIA 2NN7A 1LZVA 1BV3A 4QJXA 4ITPA 5E2RA 4IDRX 4E4AA 4DZ7A 1UGCA 3MHCA 1XQ0A 1TBTX 4L5WA 3DVCA 4QK1A 2WEGA 1IF7A 3IEOA 3KWAA 4TWLA 3W6IA 4FVNA 3GZ0A 3MWOA 1LGDA 4DZ9A 4Z1NA 3TVOX 3K2FA 4Q8XA 4KUWA 3S73B 1I9QA 3M2YA 5A6HA 4JS6A 5E28A 1FLJA 2W2JA 4RH2A 3DVBA 5EHVA 2QO8A 3HKNA 1FQLA 1KOPA 5EKHA 4MDMA 2WD3A 4RUXA 3IGPA 1RZAA 3QYKA 1BNWA 4XFWA 3JXFA 1TE3X 3DD0A 4KV0A 3NB5A 3RYZA 2NNVA 4Q7VA 3CYUA 4Q9YA 5G01A 2QOAA 1CAZA 5JQTA 4HEZA 4Q07A 1CNWA 1CNXA 1IF8A 2Q1QA 3FW3A 1G4OA 4E3DA 2FNKA 5FLRA 2FOQA 4MLXA 1G54A 3DCSA 4PQ7A 4E3GA 2ABEA 4MDGA 4QK3A 3S72B 5AMDA 5FDIA 1OKNA 2H15A 4QEFA 3DC3A 4JSWA 4ZWZA 2WEHA 3NI5A 4KUVA 3M1WA 2HOCA 3DVDA 5FNJA 4IWZA 5E5RA 3DAZA 1CNBA 2EU2A 4QSBA 1ZE8A 2EZ7A 3M2ZA 3RYXB 5FLSA 1IF9A 1ZNCA 4XE1A 1TB0X 2F14A 1IF6A 5DRSA 1CVBA 2HL4A 3M3XA 4K0TA 1G53A 1FQMA 1BNUA 1MOOA 1I9OA 1TH9A 1ZGFA 4HT0A 1LG6A 2Q1BA 4PYXA 4PYYA 5FNMA 3MNUA 3D9ZA 4YVYA 3DV7A 4KNJA 1CRAA 1CCSA 4Q99A 5DSIA 3UYQA 4K0SA 3T5UA 1BNVA 1A42A 1Y7WA 3P44A 1UGAA 3OIKA 4CQ0A 4XIWA 4Z1EA 1URTA 4WW8A 5FNKA 1YDBA 4ILXA 3RZ5A 1ZFKA 5DSOA 4ITOA 1CCTA 1YO1A 1CNIA 1DMXA 1AM6A 3D92A 4QJMA 6CA2A 3KIGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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