3HFPA

Crystal structure of teh complex between ca ii and the activator mai
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Crystal structure of teh complex between CA II and the activator MAI
rcsb
molecule tags Lyase
total genus 73
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2009-05-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3hfpA00
1CA3A 5E5UA 3S73B 2NWZA 3W6HA 4ZX0A 4KV0A 5AMLA 4XZ5A 1OKNA 3DD8A 12CAA 5G0CA 1G0FA 2Q1QA 4Q8YA 2AX2A 2CBCA 4Q49A 1FQNA 4FU5A 1G3ZA 3B1BA 3SBHA 4QIYA 4RIVA 4WR7A 1CNWA 5E2MA 1I9QA 2WEHA 4HEWA 4G7AA 2H15A 3MNJA 3S9TA 3RJ7A 3BETA 4HT2A 2VVAX 5DOHA 4E3HA 5JESB 3P44A 1IF9A 4MDMA 4E49A 1BNUA 2F14A 4QJOA 3RYYA 1RJ6A 5EZTX 4ZWXA 1Y7WA 1CAIA 1YO1A 4N16A 1TEUX 3B4FA 1TE3X 2FOSA 2POWA 4Q8ZA 5BNLA 4X5SA 1XEGA 3V3IB 1ZSBA 5DSKA 5FNIA 3BL1A 4MO8A 8CA2A 3MNUA 1T9NA 1FLJA 2CA2A 3PO6A 1CNYA 5FNHA 2EU2A 5JEHB 4Q78A 4Q90A 3KKXA 3U45X 3KONA 3MDZA 3DCWA 5EOIA 3K7KA 3MYQA 4XIWA 4WUQA 4CNXA 5DSMA 4WL4A 1G6VA 4M2UA 3JXHC 3OKVA 5EHEA 3ML2A 3D9ZA 3MNKA 4DZ7A 4WW8A 3UYNA 3S72B 3RG4A 3M96A 3HFPA 1HECA 1G0EA 1MUAA 1URTA 4RUZA 3VBDA 4JS6A 1G4JA 3DA2A 4WUPA 1CNIA 1Z93A 3N0NA 2POVA 4TWLA 3N4BA 5BRWA 1JV0A 1RZBA 3FFPX 3M5SA 2FOVA 5L3OA 3U47A 2QP6A 1JD0A 5G01A 4M2WA 1BV3A 5DSIA 4JSSA 1ZSCA 4LU3A 5AMGA 3ZP9A 3DCCA 1TH9A 1OKMA 5EHVA 2WEJA 3EFTA 1HUHA 4FVOA 5EH8A 5JGTB 4R59A 4JSWA 3T5UA 5J8ZA 3DCSA 4L5UA 1H9NA 3SBIA 4G0CA 5CJFA 3DAZA 5JDVB 1A42A 3IBLA 1OQ5A 4Q6DA 4YX4A 3NJ9A 5FLQA 3V3GB 2FNMA 1ZGFA 4E3FA 1DCAA 3S8XA 5BRUA 1CAKA 5JGSB 4HEYA 5LMDA 4ZWZA 1ZFKA 3U3AX 4JSZA 4PYXA 1I91A 5AMDA 1RAZA 4Q08A 3V2MA 1IF5A 1KOQA 3MWOA 4Z1JA 4QSJA 3LXEA 2OSMA 1RAYA 4RFCA 3M04A 1CNXA 1XQ0A 5JG5B 1BNTA 4QY3A 3FW3A 1ZE8A 5HPJA 3HLJA 1BNQA 4QK3A 3M5TA 3RGEA 4QJMA 2NNGA 5JQTA 5FNLA 1KEQA 2WD2A 4HEZA 3C7PA 3RG3A 1BN1A 5FLPA 3T83A 3IAIA 4K0SA 3M1JA 4HF3A 1I8ZA 4Q7SA 1YDDA 4Z1NA 3QYKA 4ETQC 1KOPA 2POUA 4KAPA 4KP8A 4N0XB 4YXIA 3V3HB 4XE1A 4Y0JA 2FMGA 2X7UA 4ZWIA 4Q87A 1BICA 1UGAA 3L14A 4Q7WA 1UGDA 1G45A 4KNIA 3IBNA 1DMYA 1CVBA 5SZ2A 3R17B 4R5BA 4E4AA 9CA2A 3T84A 3MHOA 1DCBA 1CINA 4Q06A 2FNKA 4L5WA 3RYXB 3IBIA 1BNWA 4FPTA 1YO0A 1FSQA 4ITOA 5FLOA 3P5LA 1TG3A 1THKA 5EHWA 1CAOA 1TB0X 3M5EA 5CA2A 4MLXA 3CAJA 4QJWA 3PYKA 1BNNA 1UGFA 4K1QA 5SZ5A 2OSFA 4FRCA 4HU1A 1FSNA 4BF1A 4K13A 2NNOA 4Q09A 1DMXA 3MNHA 4QTLA 5FNKA 4JSAA 1CCTA 1ZFQA 4R5AA 3F4XA 3S71B 4KNJA 3OYSA 3W6IA 4KUVA 4CNRA 3N2PA 1HEDA 2CABA 1HCBA 4IDRX 2CBAA 4LP6A 1RZDA 1IF6A 5BRVA 4CNWA 4QSAA 1CILA 5FLSA 1LG5A 3DD0A 3D93A 3K2FA 3F8EA 5FNGA 3RYJB 1CANA 5E2SA 2NMXA 5DSRA 3JXFA 1XEVA 1HEAA 1CAJA 4QSBA 4ZWYA 5L6KA 2FOYA 3S75B 1EOUA 3D0NA 1FR7A 4QJ0A 4KP5A 5FLRA 1MOOA 4YHAA 4MDGA 3T5ZA 2NNSA 4QIZA 4QK2A 4RFDA 3RYVB 3TVOX 4LHIA 4KUWA 5FLTA 1CAMA 4FVNA 3MHIA 3CA2A 4RUYA 3M40A 2O4ZA 3CYUA 3S78B 4RH2A 3BL0A 2Q38A 3IEOA 3HKUA 1CZMA 3F7BA 5SZ0A 1CNBA 4HBAA 2NWOA 5EKHA 5SZ7A 3M2ZA 1RJ5A 3HKNA 2Q1BA 2CBEA 2NNVA 3DVBA 4UOVA 3GZ0A 1ZGEA 3NB5A 2CBBA 1ZSAA 4Q81A 3V2JA 5EKMA 4HT0A 2GEHA 1UGBA 1CAZA 1YDBA 3MNIA 3DV7A 3RZ5A 3NI5A 5FDIA 4M2VA 3P5AA 4Q83A 4YGNA 2NN7A 5EH5A 3P3HA 5DRSA 3EFIA 1G52A 1CVFA 2HOCA 5EH7A 4MTYA 5E5RA 1G54A 4XIXA 3S76A 4L5VA 4PZHA 1HUGA 4E9OX 5BYIA 5JQ0A 1CRMA 1J9WA 2X7SA 1G46A 4BF6A 4CNVA 3R16A 3V3JA 1CA2A 5A25A 2X7TA 2NWPA 3M3XA 3P55A 3UYQA 3K34A 2FOUA 3M1WA 2WEOA 3MNAA 1HEBA 4KNNA 5EKJA 5A6HA 1CCUA 2WD3A 3JXGA 1BZMA 1G48A 3M1KA 1IF7A 3TVNX 3DVDA 3MHMA 4KUYA 3V7XA 4ILXA 1UGGA 5JG3B 5DVXA 1CVDA 1LUGA 1RZCA 1V9EA 1FR4A 1Z9YA 1TG9A 1LZVA 4ZX1A 3RZ1B 2NXRA 5C8IA 1AM6A 4YWPA 1KWRA 5E28A 4QK1A 4Q99A 4QEFA 1XPZA 1AZMA 3MHLA 5SZ4A 1YDAA 3DC9A 4YXUA 3S97A 3RZ7A 1BN3A 6CA2A 1CCSA 1FSRA 1BNMA 2QOAA 2NXTA 4QSIA 4Q0LA 4FL7A 3MZCA 1I9LA 2FMZA 1YO2A 2EZ7A 2ABEA 4Q7PA 1FQRA 4Q07A 4RN4A 1G4OA 5G03A 1CAHA 3V5GA 1KWQA 5SZ3A 3HS4A 1CNHA 3S74B 3M2NA 3P58A 5DSQA 1V9IC 3KOKA 3MHCA 1HCAA 3M2XA 4YYTA 1BNVA 3P3JA 3HKTA 3DVCA 3OIMA 4IWZA 2GD8A 1CNGA 5JEPB 4Q6EA 5SZ1A 1I9OA 5DOGA 2HNCA 4YGFA 4CQ0A 1LG6A 4Q7VA 1RZAA 4MDLA 3T85A 1F2WA 4MLTA 3F7UA 3OKUA 3M14A 3OILA 3KWAA 3N3JA 5E2NA 1H4NA 1ZH9A 1I9MA 2CBDA 4PXXA 1CVAA 3RZ0B 4Z1EA 2H4NA 4QJPA 5IPZA 4GL1X 3HKQA 3M98A 1CALA 1LGDA 2NXSA 2HD6A 2NN1A 1RZEA 3T82A 4YGJA 2VVBX 4PYYA 3IGPA 3PJJA 1ZNCA 3OIKA 1G1DA 1Z97A 3OYQA 2W2JA 4M2RA 2NWYA 7CA2A 1CAYA 3RLDA 4YVYA 4E3GA 1CRAA 2AW1A 3D8WA 5DSPA 3IBUA 2ILIA 3SAXA 5SZ6A 4K0TA 2HL4A 2FNNA 5FL6A 4YGKA 1CNKA 2HFWA 1I9PA 3P4VA 1HVAA 2IT4A 3ZNCA 1YDCA 4CA2A 4DZ9A 1OKLA 4BCWA 5FNMA 4COQA 4K0ZA 4E3DA 1CNCA 3FE4A 3KNEA 5CLUA 5G0BA 1H9QA 1FQMA 1G53A 1CVCA 3M2YA 5DSNA 2HKKA 3M1QA 3RYZA 1CIMA 4TWMA 3DBUA 4WW6A 3M67A 2EU3A 3CZVA 1CNJA 2ZNCA 1UGEA 3KLDB 5DSLA 2FOQA 3DC3A 3U7CA 3V3FA 2WEGA 1AVNA 5CACA 3OY0A 3MMFA 4ITPA 5FL4A 5FL5A 4ZAOA 1UGCA 5E2KA 1JCZA 1TTMA 2FW4A 5DSOA 4Z0QA 3Q31A 1FQLA 4YXOA 4PQ7A 4Z1KA 4FIKA 4Q9YA 1IF8A 1TEQX 3TMJA 1BN4A 3RZ8A 4QJXA 5DSJA 1I9NA 3KOIA 2QO8A 5EIJA 5JEGB 4XFWA 4Q8XA 4YGLA 4E5QA 5FNJA 1IF4A 4C3TA 4RIUA 4KNMA 4CACA 1BCDA 1CVHA 1CVEA 3D92A 3SAPA 1TBTX 3S77B 3ML5A 3KIGA 1I90A 4RUXA 3KS3A 5FDCA 5E2RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1CA3 A;  5E5U A;  3S73 B;  2NWZ A;  3W6H A;  4ZX0 A;  4KV0 A;  5AML A;  4XZ5 A;  1OKN A;  3DD8 A;  12CA A;  5G0C A;  1G0F A;  2Q1Q A;  4Q8Y A;  2AX2 A;  2CBC A;  4Q49 A;  1FQN A;  4FU5 A;  1G3Z A;  3B1B A;  3SBH A;  4QIY A;  4RIV A;  4WR7 A;  1CNW A;  5E2M A;  1I9Q A;  2WEH A;  4HEW A;  4G7A A;  2H15 A;  3MNJ A;  3S9T A;  3RJ7 A;  3BET A;  4HT2 A;  2VVA X;  5DOH A;  4E3H A;  5JES B;  3P44 A;  1IF9 A;  4MDM A;  4E49 A;  1BNU A;  2F14 A;  4QJO A;  3RYY A;  1RJ6 A;  5EZT X;  4ZWX A;  1Y7W A;  1CAI A;  1YO1 A;  4N16 A;  1TEU X;  3B4F A;  1TE3 X;  2FOS A;  2POW A;  4Q8Z A;  5BNL A;  4X5S A;  1XEG A;  3V3I B;  1ZSB A;  5DSK A;  5FNI A;  3BL1 A;  4MO8 A;  8CA2 A;  3MNU A;  1T9N A;  1FLJ A;  2CA2 A;  3PO6 A;  1CNY A;  5FNH A;  2EU2 A;  5JEH B;  4Q78 A;  4Q90 A;  3KKX A;  3U45 X;  3KON A;  3MDZ A;  3DCW A;  5EOI A;  3K7K A;  3MYQ A;  4XIW A;  4WUQ A;  4CNX A;  5DSM A;  4WL4 A;  1G6V A;  4M2U A;  3JXH C;  3OKV A;  5EHE A;  3ML2 A;  3D9Z A;  3MNK A;  4DZ7 A;  4WW8 A;  3UYN A;  3S72 B;  3RG4 A;  3M96 A; 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