3HKUA

Human carbonic anhydrase ii in complex with topiramate
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title S-Glycosyl Primary Sulfonamides-A New Structural Class for Selective Inhibition of Cancer-Associated Carbonic Anhydrases
doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Lyase
total genus 75
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2009-05-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3hkuA00
4HEZA 5FLRA 3RYYA 1OKNA 3HKNA 1ZE8A 4Q6DA 5DSOA 1CILA 1I9PA 1KWQA 4Q06A 4E9OX 3UYQA 1RAZA 4QIZA 2OSMA 3M1QA 3U45X 4QSAA 3IBNA 5JGTB 3KIGA 1CAZA 1FQMA 4FL7A 3MZCA 3V5GA 1CVFA 2QP6A 1CRAA 1IF4A 3HLJA 1FQNA 1G0EA 3MMFA 3CAJA 4K1QA 4Q8YA 1F2WA 2IT4A 4JSWA 1TE3X 1G4OA 1G53A 4ZX1A 4ZWYA 4L5UA 5CLUA 3S76A 3S73B 4TWMA 1TG3A 2EU3A 2CBDA 2HD6A 3V3HB 4XE1A 1Z97A 5FDIA 2CBBA 2WEJA 4ITPA 4KP5A 3TVNX 3KLDB 1BNUA 3DAZA 1FR7A 4YXUA 3FE4A 3M2YA 3DVBA 2X7TA 4YGNA 3MNHA 5FLPA 3S77B 4BF6A 2NNSA 3PYKA 4RIVA 3MYQA 3SBIA 3MNAA 1T9NA 4KNNA 4Q99A 5FNGA 3KKXA 5AMGA 12CAA 3S71B 4L5WA 1J9WA 4LU3A 2CBCA 3U47A 3W6IA 4XFWA 2FW4A 4ZX0A 4MLTA 3HFPA 1OKMA 5EZTX 5FLTA 1UGEA 4ITOA 3V7XA 2CA2A 4E49A 2NWPA 4HEYA 1BICA 1RZEA 4RUXA 2NWYA 4K0ZA 2X7SA 5FLOA 4X5SA 1IF9A 4HU1A 3M5TA 5L6KA 4UOVA 1CNWA 3S97A 2QO8A 2HL4A 3IBUA 1CNHA 1ZSAA 4Z1EA 3MNKA 3DA2A 1CAIA 3RZ0B 5E2MA 3S8XA 5BRVA 9CA2A 5JQTA 3M5SA 2WD3A 4IWZA 2GD8A 3PO6A 4PZHA 1OQ5A 4MLXA 3U3AX 4R59A 2HNCA 3NB5A 4TWLA 4QSBA 5L3OA 2Q1BA 3OY0A 5EHWA 3T84A 3D0NA 4QK2A 3DCCA 1AM6A 4ZAOA 4JSSA 2H4NA 5EHVA 2FOSA 4YGJA 5FNIA 4Q7SA 1CNCA 3HKTA 1URTA 1DCBA 3OKVA 4KV0A 3R16A 4HBAA 3T82A 2CBEA 4QJWA 5SZ0A 1TBTX 4K0TA 5A6HA 2NWOA 4JS6A 4E3HA 3M3XA 2ILIA 1HEDA 3DC3A 4Q7VA 3TVOX 3UYNA 1RZCA 1HCBA 3DVCA 1CA2A 2HKKA 5AMDA 1CZMA 3MHLA 4Z0QA 5C8IA 5BRWA 3RZ7A 1HECA 2NXRA 4YXOA 4N16A 4HT2A 4HF3A 3LXEA 1I9MA 1TB0X 1CANA 5FNLA 4E3GA 5HPJA 1ZNCA 3V2JA 3RZ1B 1ZFQA 3P44A 1UGGA 2FMGA 1CVHA 2CABA 1ZFKA 4YXIA 1KEQA 4PYYA 3EFIA 4MDLA 4RFCA 4QIYA 5E2NA 3U7CA 2EZ7A 3OYSA 5CJFA 4N0XB 1ZGEA 3P3JA 3D92A 3P55A 1BNVA 4JSZA 4E4AA 1HUHA 3M5EA 5CACA 2ZNCA 1A42A 1I9QA 2OSFA 5DSLA 4M2WA 2POUA 4Q0LA 4COQA 3S74B 3RZ5A 2FOQA 1I9NA 4K0SA 3S72B 3M2XA 1ZGFA 1CCTA 4L5VA 3RYVB 1YDBA 4KNMA 4G0CA 1BV3A 3RGEA 4RIUA 2FOVA 1BNTA 5SZ3A 2WEOA 3OKUA 4ILXA 5JG5B 1FQLA 1H9NA 4WL4A 5DSQA 3KOIA 2NWZA 3P3HA 2NMXA 5G01A 4MDMA 1BN4A 4R5BA 4R5AA 3D8WA 1DMYA 5SZ4A 4FVNA 8CA2A 3HKUA 3N2PA 1FQRA 4FIKA 1BCDA 1CRMA 1UGDA 4QEFA 4CA2A 4Z1JA 3M1JA 1CAKA 2HFWA 1Z9YA 1RZDA 4KP8A 4QJOA 1FSNA 1I91A 4ZWZA 1CCUA 1RAYA 1HEBA 1YO0A 1TEUX 5DSKA 1UGFA 1CVDA 3CYUA 3D93A 3JXGA 3CA2A 1THKA 4Q90A 1CNIA 1IF6A 1CNXA 4GL1X 3ML2A 4QJMA 1KOQA 3ZNCA 1IF5A 4YYTA 3RZ8A 3MDZA 5SZ6A 1UGAA 1HEAA 1HCAA 4PQ7A 4E3FA 1MOOA 5G0BA 1BZMA 4Q87A 3V3JA 6CA2A 4FVOA 4Z1NA 2Q1QA 3M40A 3SBHA 1BN1A 3OYQA 3T5UA 1H4NA 2AX2A 4CNXA 1V9IC 3SAXA 2H15A 4RN4A 3F7BA 3OIMA 5JDVB 1Y7WA 3M2NA 4WUQA 4ZWXA 4FRCA 5JG3B 4CACA 2O4ZA 4KUWA 4DZ7A 4XIXA 5FDCA 3L14A 1LG6A 1XQ0A 1YO1A 2NN1A 1IF8A 4M2VA 5JQ0A 3HKQA 5DSRA 5DSNA 2NNVA 3P5AA 5BNLA 2FMZA 4M2UA 3M2ZA 3MHOA 4RFDA 3M96A 1CAOA 5JEGB 2WEHA 3BL0A 5EH7A 5EIJA 1BNNA 7CA2A 2AW1A 4Z1KA 1LGDA 1RJ5A 5DRSA 5E5UA 1G0FA 5SZ2A 3OIKA 1G1DA 5FNJA 5JGSB 1TH9A 3K7KA 1YDCA 4CNRA 3NJ9A 4PYXA 1G4JA 4YGFA 3OILA 3DD8A 4Q08A 4QJ0A 3MNUA 1MUAA 1CVCA 1Z93A 3IBIA 4QK3A 3PJJA 4Q09A 4MTYA 5EKHA 3TMJA 3V2MA 3RYZA 2NNOA 1CIMA 4ETQC 3W6HA 4QJPA 5DVXA 3T85A 3S75B 1ZSBA 2NN7A 1G48A 3M14A 4LHIA 3IGPA 3V3GB 5DSMA 1G3ZA 1CAYA 1JD0A 4Q83A 3BETA 1CVBA 4HT0A 4YVYA 1AZMA 4CNVA 4Q8XA 5JEHB 4YX4A 1KWRA 5FLQA 3T5ZA 4PXXA 4QK1A 1CAJA 4BCWA 3SAPA 1BNQA 4CNWA 1FSRA 3KONA 1RZBA 1HVAA 5EKJA 5JESB 1JV0A 3M04A 5EHEA 4Q49A 1FR4A 4YWPA 2VVAX 2WD2A 1BNWA 4Q81A 4KUVA 1ZH9A 3P5LA 3DCWA 3M1WA 1LG5A 3F7UA 3RG4A 1BN3A 1FSQA 3NI5A 4MDGA 2NNGA 4WUPA 5FNKA 1CNKA 3RLDA 2NXTA 3K2FA 4CQ0A 3S78B 1G46A 1YO2A 1AVNA 1CVAA 3Q31A 3V3FA 1CNBA 4Q07A 5SZ1A 3P4VA 1I9OA 1V9EA 1LUGA 1RJ6A 4K13A 1I90A 2GEHA 1CNYA 3M67A 3MHMA 2ABEA 1CINA 3M98A 1CNGA 2QOAA 4Q8ZA 5FL5A 5G03A 4YHAA 1IF7A 5E5RA 3IEOA 2Q38A 1TEQX 3BL1A 3B4FA 3M1KA 4QTLA 2VVBX 4FPTA 5DOGA 3KOKA 3S9TA 3DVDA 4JSAA 4KUYA 5EKMA 3T83A 4RUYA 3IBLA 3RJ7A 3R17B 4YGKA 5JEPB 3ML5A 5AMLA 2POVA 3ZP9A 2HOCA 1G54A 5FL6A 4FU5A 1UGBA 2FOYA 2POWA 3FW3A 1XEGA 4DZ9A 4QJXA 4E3DA 3RYXB 2W2JA 5DSIA 3N4BA 3N0NA 5FLSA 4LP6A 3VBDA 1UGCA 5IPZA 1CA3A 3MHCA 1G52A 5E2RA 1CAMA 3JXFA 4YGLA 1XEVA 3MHIA 5SZ5A 5E28A 1OKLA 4XZ5A 1CALA 5J8ZA 3IAIA 5DSPA 1CNJA 3HS4A 3DC9A 4KNIA 4C3TA 4Q7WA 2FNKA 5G0CA 3N3JA 3QYKA 4KAPA 1EOUA 3DCSA 3EFTA 3KWAA 4Q7PA 2X7UA 4Q78A 3GZ0A 1I9LA 3K34A 1ZSCA 5FNHA 4G7AA 3F8EA 4Y0JA 1I8ZA 4Q9YA 5A25A 4QSJA 1BNMA 2FOUA 1HUGA 4QSIA 3DBUA 2FNNA 3MWOA 4IDRX 4KNJA 3RG3A 1KOPA 1CCSA 3D9ZA 5E2KA 1XPZA 1TG9A 1RZAA 5E2SA 5SZ7A 4M2RA 3JXHC 5EH5A 4XIWA 5FL4A 1G6VA 1YDAA 1DCAA 5CA2A 2F14A 3CZVA 4MO8A 2NXSA 4Q6EA 4E5QA 4RH2A 1JCZA 5EOIA 4ZWIA 3RYJB 3DV7A 1YDDA 3KNEA 3FFPX 3B1BA 1G45A 2CBAA 1TTMA 3C7PA 3KS3A 3MNIA 3P58A 3DD0A 1CAHA 1H9QA 4WW6A 4WR7A 5FNMA 5BYIA 2FNMA 5LMDA 5DSJA 1LZVA 4RUZA 5EH8A 1DMXA 3V3IB 4BF1A 3MNJA 3F4XA 4QY3A 4WW8A 5DOHA 5BRUA 2WEGA 1FLJA 4HEWA 2EU2A 1CVEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4HEZ A;  5FLR A;  3RYY A;  1OKN A;  3HKN A;  1ZE8 A;  4Q6D A;  5DSO A;  1CIL A;  1I9P A;  1KWQ A;  4Q06 A;  4E9O X;  3UYQ A;  1RAZ A;  4QIZ A;  2OSM A;  3M1Q A;  3U45 X;  4QSA A;  3IBN A;  5JGT B;  3KIG A;  1CAZ A;  1FQM A;  4FL7 A;  3MZC A;  3V5G A;  1CVF A;  2QP6 A;  1CRA A;  1IF4 A;  3HLJ A;  1FQN A;  1G0E A;  3MMF A;  3CAJ A;  4K1Q A;  4Q8Y A;  1F2W A;  2IT4 A;  4JSW A;  1TE3 X;  1G4O A;  1G53 A;  4ZX1 A;  4ZWY A;  4L5U A;  5CLU A;  3S76 A;  3S73 B;  4TWM A;  1TG3 A;  2EU3 A;  2CBD A;  2HD6 A;  3V3H B;  4XE1 A;  1Z97 A;  5FDI A;  2CBB A;  2WEJ A;  4ITP A;  4KP5 A;  3TVN X;  3KLD B;  1BNU A;  3DAZ A;  1FR7 A;  4YXU A;  3FE4 A;  3M2Y A;  3DVB A;  2X7T A;  4YGN A;  3MNH A;  5FLP A;  3S77 B;  4BF6 A;  2NNS A;  3PYK A;  4RIV A;  3MYQ A;  3SBI A;  3MNA A;  1T9N A;  4KNN A;  4Q99 A;  5FNG A;  3KKX A;  5AMG A;  12CA A;  3S71 B;  4L5W A;  1J9W A;  4LU3 A;  2CBC A;  3U47 A;  3W6I A;  4XFW A;  2FW4 A;  4ZX0 A;  4MLT A;  3HFP A;  1OKM A;  5EZT X;  5FLT A;  1UGE A;  4ITO A;  3V7X A;  2CA2 A;  4E49 A; 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