3JXGA

Ca-like domain of mouse ptprg
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
Knots found
sequence length
263
structure length
257
Chain Sequence
PYWAYSGAYGPEHWVTSSVSCGGSHQSPIDILDHHARVGDEYQELQLDGFDNESSNKTWMKNTGKTVAILLKDDYFVSGAGLPGRFKAEKVEFHWGHSNGSAGSEHSVNGRRFPVEMQIFFYNPDDFDSFQTAISENRIIGAMAIFFQVSPRDNSALDPIIHGLKGVVHHEKETFLDPFILRDLLPASLGSYYRYTGSLTTPPCSEIVEWIVFRRPVPISYHQLEAFYSIFTTESVEYLRNNFRPQQALNDRVVSKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Cell adhesion
molecule keywords Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma
publication title The protein tyrosine phosphatases PTPRZ and PTPRG bind to distinct members of the contactin family of neural recognition molecules.
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
total genus 71
structure length 257
sequence length 263
chains with identical sequence B, C, D
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase.
pdb deposition date 2009-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3jxgA00
4KP5A 3MHMA 1CRAA 3T5ZA 1OKNA 1IF5A 5JQTA 3VBDA 4HBAA 1CVCA 2WD2A 2HNCA 4XZ5A 3DD0A 3IBLA 4MLTA 5E2MA 3RG3A 2NNVA 1AVNA 3U45X 1UGGA 4C3TA 4R5AA 3RG4A 3N4BA 5DSMA 3V2MA 3DCWA 2FOQA 5FNHA 1JCZA 4GL1X 1RAYA 2NMXA 1G48A 1XQ0A 4RFCA 3KOIA 1RZAA 1A42A 3V3FA 3F7UA 3RYJB 4RN4A 2FNMA 3P55A 1LG5A 3S8XA 1CAJA 5DSOA 5DSJA 5SZ5A 1ZGEA 2Q38A 3RZ7A 5E2KA 3MNAA 3LXEA 4Z0QA 1YO2A 5DSPA 2NXRA 4BCWA 1CIMA 3M2YA 3PJJA 1CVHA 4K0ZA 3HKQA 1F2WA 1FQLA 5SZ2A 2HKKA 3HKUA 5DSRA 4HEYA 3DVCA 1G52A 1ZSBA 1CAHA 5JEHB 1CRMA 3F8EA 1AZMA 4ILXA 4QIYA 1LUGA 3TVNX 4MDLA 5IPZA 5CLUA 3HKNA 4N16A 4BF6A 4IWZA 5SZ7A 3DVDA 5BRUA 3S78B 3D8WA 1KWQA 1FLJA 1G4JA 2ABEA 4KUVA 4MDMA 5EZTX 3EFIA 3ZNCA 1YDAA 5G03A 1LZVA 4HT2A 3P5LA 3RLDA 5DOGA 5FL5A 4QJWA 1BNTA 4QIZA 3RZ5A 3P3JA 1IF4A 2NN7A 1YDDA 5FL4A 4Q07A 1FSRA 1CNWA 3KWAA 4QSJA 3KLDB 3MNKA 4Q7SA 2OSMA 3DVBA 4JS6A 3V7XA 3P4VA 3IBUA 4RIUA 5DVXA 1TG9A 3GZ0A 3K2FA 4Q83A 5BYIA 3R16A 3CA2A 3RYZA 1CAIA 4M2UA 5L3OA 2NNSA 5L6KA 3FE4A 3NB5A 4FPTA 1BZMA 4YGFA 5JEGB 1BV3A 1G3ZA 4Q9YA 4WW8A 2POVA 3U47A 5AMDA 1G45A 3KS3A 2GD8A 5EHEA 2X7SA 3M2NA 1FR7A 1IF9A 5E28A 3ML5A 1YDBA 4DZ7A 4RUXA 4HU1A 3RGEA 4Q06A 1YO1A 5FLSA 5JG5B 2NXSA 3T83A 1UGAA 2NNGA 4PXXA 3S75B 3KKXA 3KONA 4JSSA 4Z1EA 5JESB 2NXTA 4RH2A 1I9QA 1CNHA 1MUAA 3CYUA 3M67A 5FNJA 1G46A 4Q81A 1FQNA 3M1KA 4QSIA 4Q6EA 1CVDA 2HFWA 2GEHA 1CNJA 3BL0A 3JXHC 3MYQA 3JXGA 3BL1A 3NI5A 1IF8A 1XPZA 1HEDA 1HCBA 4YGKA 1UGCA 2HL4A 4YGNA 3HFPA 4PZHA 3P3HA 4PYYA 1CAMA 2FNNA 4QTLA 3T85A 2FOSA 2QOAA 3MNJA 5FLRA 4ZAOA 4RFDA 3DV7A 3V3IB 9CA2A 3NJ9A 1I8ZA 4M2RA 1I91A 4Q0LA 1FQMA 2AW1A 4RUYA 5E2RA 2FOUA 1LG6A 1Z9YA 3M14A 4G7AA 3D0NA 1J9WA 1ZFQA 2FNKA 4Q99A 3T82A 4FRCA 5EH7A 5SZ1A 4ZWXA 1UGBA 3S97A 3EFTA 3OILA 4E3FA 1HUHA 1THKA 4WR7A 4ZWZA 4E4AA 4X5SA 4IDRX 1CAOA 2CABA 3UYNA 2HOCA 2H15A 5EIJA 3IEOA 1JV0A 2WEJA 5E2NA 4G0CA 2QP6A 1CNBA 1RZBA 4QEFA 3M04A 4Z1JA 1BCDA 1CA2A 5EKJA 3DD8A 3RZ8A 4Q78A 3S72B 3B1BA 4MTYA 5JEPB 3B4FA 5DSQA 1UGDA 3M40A 5EHVA 1CNCA 1FSQA 4CNWA 1MOOA 3K7KA 2VVBX 1ZGFA 1CNIA 3PO6A 4Q08A 4E49A 1XEGA 4CACA 4R59A 5AMGA 5FNLA 1BICA 4MO8A 3TMJA 3RYXB 3SAPA 4Q7PA 4RUZA 3D93A 4K0TA 4LHIA 3PYKA 3MHOA 5EH5A 2POWA 3KIGA 3N2PA 5JGSB 1URTA 5DSIA 1CVBA 4E3GA 1G1DA 4Q90A 3S9TA 1I9OA 2FOVA 3OIMA 3SAXA 1TB0X 1IF7A 1HEAA 4L5VA 1ZFKA 4LU3A 3S74B 3FFPX 2OSFA 4KV0A 3IGPA 4QSAA 1CZMA 1TG3A 3D92A 4WW6A 3DCCA 4DZ9A 3IBIA 1ZE8A 1IF6A 1KOPA 1RJ5A 2FMZA 2FW4A 3F4XA 5DOHA 5FLPA 4Q7WA 4QK1A 1BNWA 5SZ6A 5EOIA 2Q1QA 1DMXA 4JSWA 4ETQC 4CA2A 5BRVA 3BETA 3CAJA 1HVAA 3OKVA 4E3HA 2FMGA 3V5GA 3U7CA 3M5EA 2VVAX 5AMLA 5E5UA 5FLTA 3D9ZA 5FLQA 3HLJA 3UYQA 1CNXA 4Q7VA 4KNMA 1CAKA 3P58A 1JD0A 3F7BA 1Y7WA 3M2ZA 1CILA 3N3JA 3OKUA 4ZWIA 3V2JA 4Q49A 1DCBA 1DMYA 4QJ0A 1CCSA 2WEGA 3RYVB 1G53A 4KUWA 4CNVA 3W6IA 2NWYA 4K0SA 4YX4A 1G0EA 5LMDA 1YO0A 5A25A 3HKTA 3OYQA 4PQ7A 4KNJA 3V3HB 3MMFA 1KOQA 4Q8YA 8CA2A 3W6HA 1CVFA 4K13A 4BF1A 3R17B 3S76A 4WUPA 4KP8A 1G54A 3RJ7A 2HD6A 4WL4A 4Y0JA 7CA2A 1FR4A 1HCAA 3M5SA 3FW3A 3DC3A 1AM6A 1I9LA 4R5BA 5CA2A 2W2JA 3V3GB 1BNNA 3S73B 4FU5A 4MLXA 3IAIA 4YGLA 1OKMA 1KWRA 4L5WA 1ZSCA 1I9NA 5FDIA 5FNGA 4QJMA 1BNQA 3Q31A 1H9QA 1V9IC 2EU2A 4FIKA 1G0FA 1BNVA 5G0CA 3M96A 1ZH9A 1CNGA 5BNLA 4CNXA 3S77B 4QJXA 4M2VA 1OKLA 4QJOA 3MHLA 2X7UA 3M5TA 4N0XB 3HS4A 4COQA 5SZ4A 5C8IA 2NNOA 3MZCA 3U3AX 5FNKA 4E5QA 2POUA 5DSLA 1KEQA 1CA3A 3N0NA 2WEOA 3P44A 3SBHA 1TE3X 1ZSAA 1BNUA 5SZ0A 5SZ3A 1CAYA 1LGDA 5BRWA 3RZ1B 4QK3A 4Q6DA 2CBBA 4YXIA 1OQ5A 3V3JA 2NWPA 1G6VA 2ZNCA 3MHIA 1RAZA 4HT0A 5G0BA 5DRSA 12CAA 4M2WA 1ZNCA 3M1QA 3ZP9A 1H9NA 1CANA 4XIWA 1TEQX 2IT4A 3JXFA 4E3DA 1CNKA 4UOVA 2Q1BA 1I9PA 5JG3B 1HEBA 4Z1KA 2H4NA 1RZCA 3DC9A 4K1QA 4Q09A 1RZEA 1CINA 1CVAA 1UGFA 2CA2A 3OIKA 3QYKA 2WD3A 4ZWYA 3M3XA 2WEHA 5FDCA 1CNYA 4QY3A 2ILIA 3CZVA 1TEUX 1BN4A 5HPJA 1EOUA 5JGTB 4QK2A 4MDGA 4L5UA 4KNIA 1V9EA 4KNNA 2X7TA 1HUGA 4JSAA 1T9NA 4Q87A 3SBIA 4XIXA 4Q8ZA 3T84A 2CBCA 1CAZA 5E2SA 1I90A 4FVOA 3DA2A 1TBTX 3M1WA 4FL7A 4CQ0A 5J8ZA 3MNHA 5EH8A 1YDCA 3C7PA 4XFWA 1Z97A 2NWOA 3M1JA 3RYYA 1RJ6A 4QJPA 2FOYA 3TVOX 1HECA 4ZX0A 3OYSA 4HEZA 5FNIA 4KUYA 2F14A 3KOKA 1BN3A 1FSNA 1CCTA 1UGEA 2EZ7A 5JDVB 3OY0A 4YVYA 1FQRA 2AX2A 4LP6A 4HEWA 4Q8XA 1CVEA 2O4ZA 1RZDA 3DBUA 2NN1A 3MWOA 4YWPA 5CACA 1CCUA 4YXUA 1I9MA 3DCSA 5DSNA 2QO8A 4FVNA 5E5RA 2CBDA 3RZ0B 1CALA 3MHCA 4WUQA 5FNMA 3K34A 4QSBA 4YGJA 4YYTA 1BNMA 1TH9A 4ZX1A 1Z93A 2NWZA 4Z1NA 1DCAA 2CBEA 5FLOA 5G01A 3ML2A 3MDZA 5EKMA 4YHAA 3KNEA 4HF3A 1BN1A 1TTMA 1H4NA 3DAZA 3M2XA 4JSZA 4PYXA 4TWMA 3T5UA 5DSKA 4E9OX 5EKHA 4ITPA 2CBAA 5JQ0A 3MNUA 5EHWA 2EU3A 3L14A 1XEVA 4RIVA 6CA2A 4TWLA 3MNIA 3P5AA 5A6HA 3S71B 3M98A 5CJFA 4XE1A 4KAPA 4ITOA 4YXOA 5FL6A 4CNRA 3IBNA 1G4OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4KP5 A;  3MHM A;  1CRA A;  3T5Z A;  1OKN A;  1IF5 A;  5JQT A;  3VBD A;  4HBA A;  1CVC A;  2WD2 A;  2HNC A;  4XZ5 A;  3DD0 A;  3IBL A;  4MLT A;  5E2M A;  3RG3 A;  2NNV A;  1AVN A;  3U45 X;  1UGG A;  4C3T A;  4R5A A;  3RG4 A;  3N4B A;  5DSM A;  3V2M A;  3DCW A;  2FOQ A;  5FNH A;  1JCZ A;  4GL1 X;  1RAY A;  2NMX A;  1G48 A;  1XQ0 A;  4RFC A;  3KOI A;  1RZA A;  1A42 A;  3V3F A;  3F7U A;  3RYJ B;  4RN4 A;  2FNM A;  3P55 A;  1LG5 A;  3S8X A;  1CAJ A;  5DSO A;  5DSJ A;  5SZ5 A;  1ZGE A;  2Q38 A;  3RZ7 A;  5E2K A;  3MNA A;  3LXE A;  4Z0Q A;  1YO2 A;  5DSP A;  2NXR A;  4BCW A;  1CIM A;  3M2Y A;  3PJJ A;  1CVH A;  4K0Z A;  3HKQ A;  1F2W A;  1FQL A;  5SZ2 A;  2HKK A;  3HKU A;  5DSR A;  4HEY A;  3DVC A;  1G52 A;  1ZSB A;  1CAH A;  5JEH B;  1CRM A;  3F8E A;  1AZM A;  4ILX A;  4QIY A;  1LUG A;  3TVN X;  4MDL A;  5IPZ A;  5CLU A;  3HKN A;  4N16 A;  4BF6 A;  4IWZ A;  5SZ7 A;  3DVD A;  5BRU A;  3S78 B;  3D8W A;  1KWQ A;  1FLJ A;  1G4J A;  2ABE A;  4KUV A;  4MDM A;  5EZT X;  3EFI A;  3ZNC A;  1YDA A;  5G03 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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