3KS3A

High resolution structure of human carbonic anhydrase ii at 0.9 a
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title A short, strong hydrogen bond in the active site of human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2009-11-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3ks3A00
4Q7SA 4JSZA 1LG5A 5EOIA 4FVNA 4E3GA 1UGDA 3T5UA 4QK2A 4RIVA 5E2RA 1RJ5A 1CZMA 4N0XB 4CACA 1BNQA 1RJ6A 3W6HA 4WW6A 2CBDA 2NXRA 5JQTA 5AMGA 2OSMA 1BNWA 5JDVB 5DSNA 4X5SA 1AM6A 4C3TA 4PZHA 3DCCA 1LG6A 1CCTA 3TVNX 1YO2A 3M1JA 4KNJA 1ZH9A 4FU5A 4L5VA 3W6IA 4E3FA 4N16A 3OIMA 4FIKA 4FPTA 3KWAA 1CVEA 2FNMA 2HL4A 4QTLA 4K0SA 3R16A 1FQLA 3UYQA 1ZSCA 2CBEA 4QJ0A 3V3HB 3M2NA 5DSKA 4Q0LA 5FNIA 4DZ7A 2HNCA 5A25A 1CNXA 3MNKA 3D92A 4UOVA 1ZFKA 1BNVA 3M1WA 9CA2A 4IWZA 3IEOA 3OIKA 2NNOA 4RIUA 3K7KA 1CAMA 3S71B 4KV0A 1TB0X 3V3IB 1CAZA 1CANA 4HU1A 4Q6EA 2CABA 4CNWA 1CRAA 4MLTA 5CACA 4BCWA 4K13A 2FOYA 4KNMA 1CNWA 1G45A 1CAJA 3DVDA 4JSAA 3P55A 4QIZA 4Q08A 1IF5A 4Q99A 5CJFA 1RZCA 2WD3A 3KNEA 3QYKA 3PO6A 5DOHA 4ZAOA 3V3FA 4BF1A 2H4NA 3M14A 1BNMA 4WUQA 1LGDA 3C7PA 4Q7WA 4RFDA 3P3JA 2QOAA 2POUA 1G1DA 1BZMA 2NN1A 4ZWXA 2ILIA 1RZBA 1OKNA 1YO0A 3B1BA 1HCBA 4QJMA 2AX2A 3FW3A 1OKMA 5L3OA 1CALA 4Q49A 5BYIA 1BNNA 5FLRA 2CBAA 1JCZA 5SZ2A 4PYYA 4TWLA 1I8ZA 3K2FA 2VVBX 3P5LA 1FR7A 2Q1BA 3M2YA 3V2JA 3P3HA 3DC3A 4Z1EA 2GEHA 2Q38A 5BRUA 5EHWA 3DVBA 4KUYA 1I9MA 3D8WA 3V3JA 3OILA 2NWPA 1H4NA 3S77B 2NXSA 1KWQA 5L6KA 3ML5A 3T84A 3U3AX 4Q9YA 2WEJA 2ZNCA 3P58A 4Q90A 1URTA 4YYTA 2HOCA 1DCAA 2NNVA 4HBAA 4Q6DA 1RZDA 4WR7A 4YVYA 1TEUX 4MLXA 2CA2A 4M2WA 1RAZA 3IAIA 5E5UA 3RGEA 3V7XA 3BL1A 5E2MA 4KP8A 3K34A 4QY3A 3S8XA 1TG3A 1G0EA 4Q8YA 3M3XA 3R17B 5EH5A 1G0FA 3M96A 1H9NA 4KP5A 4QJXA 2FNKA 5FDIA 3S74B 3ML2A 5SZ3A 2WD2A 3HLJA 3JXFA 3U47A 2NWZA 1F2WA 1I9NA 2HFWA 3RYYA 5SZ1A 3M1KA 4JS6A 4JSSA 5CLUA 4CA2A 3D0NA 3RYXB 4K1QA 4Q83A 1FSQA 3MNAA 1CAOA 4Q7PA 4RN4A 1UGEA 1BCDA 4YGKA 1IF4A 1HUHA 3T5ZA 4CNXA 3FFPX 2QO8A 4LU3A 1CVFA 5FLSA 2X7SA 4ILXA 1KOQA 3N0NA 1CVDA 2NN7A 3EFIA 3PYKA 2H15A 1BNUA 4K0ZA 1RZAA 1UGBA 1HEBA 1I90A 2FNNA 1YDDA 3F7BA 3HKTA 4YXUA 1G6VA 3U45X 3DVCA 3CYUA 3OYQA 4RUYA 5J8ZA 1EOUA 5JQ0A 3P4VA 3PJJA 4MO8A 5DSQA 1CA2A 3N3JA 1JD0A 5EKJA 3MMFA 3RYJB 1ZSBA 3B4FA 3MYQA 3M2ZA 4Z1KA 1I9PA 1FSRA 4JSWA 5EZTX 4L5WA 3T83A 5E2NA 1XEGA 1BNTA 4PQ7A 3OY0A 1CNIA 5LMDA 1CILA 2FOUA 1BV3A 3M98A 3SAXA 3NI5A 2NMXA 4ITOA 3CZVA 4Z0QA 1DCBA 3MHMA 3RG4A 5CA2A 5SZ5A 3M5TA 1CVHA 3MWOA 4TWMA 1Z97A 1AVNA 1CCSA 1CCUA 2VVAX 4LHIA 5EIJA 1BN3A 2HD6A 3DC9A 5FNMA 4CNRA 1CAYA 5DVXA 2X7UA 4L5UA 2CBBA 3NJ9A 5SZ4A 5DRSA 2FOSA 5C8IA 3D9ZA 1Z9YA 5DSRA 4KNNA 4G7AA 1ZGFA 3HS4A 1CAHA 4Q07A 3V3GB 1FQNA 5EHEA 1MUAA 1FR4A 4YGJA 1T9NA 3MHCA 3S78B 4E9OX 4Y0JA 5BRWA 1G48A 3DA2A 5DSIA 3HKNA 5E2KA 5JEGB 1CNGA 3M67A 4GL1X 1YDCA 3NB5A 1JV0A 5EKMA 4QJWA 4IDRX 4ZWYA 3RYVB 2O4ZA 1AZMA 1Z93A 4YGFA 5DOGA 4M2RA 4R5BA 3DD0A 1IF9A 1THKA 1OKLA 5E28A 4M2UA 3RLDA 1FQMA 2W2JA 5EH7A 3SBHA 1G46A 4CQ0A 3F8EA 3IBUA 4HEZA 1HUGA 3DD8A 1G54A 4Q09A 1TEQX 4HEWA 1TH9A 1KWRA 2FOVA 4R5AA 4QK1A 4E4AA 3KONA 5DSPA 5FL4A 5FNKA 1MOOA 3IBNA 5AMDA 5EHVA 4WW8A 2POVA 4E3DA 1DMYA 4FL7A 3OKVA 4HF3A 3RYZA 1OQ5A 4YGNA 4KUWA 3S75B 4YX4A 2NNGA 4QSJA 4YXIA 3RZ1B 4XFWA 1G3ZA 5EKHA 5A6HA 4QJPA 4RH2A 1CA3A 4RUXA 1H9QA 4Q7VA 4Q81A 3S97A 3DV7A 5SZ7A 4Q06A 4XZ5A 4COQA 2CBCA 3U7CA 3OKUA 4ETQC 3DCSA 4RFCA 4HEYA 4PYXA 1CVBA 1CNYA 4MTYA 3KOKA 2NNSA 1TBTX 2AW1A 1CIMA 4PXXA 3MNIA 2FMZA 3MDZA 3MNUA 2WEOA 1FLJA 4E5QA 1KEQA 1I9LA 4Q87A 5DSLA 3BL0A 3FE4A 3LXEA 4ZWIA 1UGCA 3M04A 4ZX1A 5JG5B 5G03A 4Z1NA 4R59A 5IPZA 3F4XA 1UGGA 1CNKA 5FDCA 3RG3A 7CA2A 1CAKA 3M5SA 1Y7WA 4Q8XA 12CAA 1G4JA 3GZ0A 5FL6A 4QSIA 5BNLA 3KIGA 4QEFA 4WUPA 4ITPA 1I91A 3HKQA 1FSNA 2POWA 1YO1A 5SZ0A 4Q8ZA 3P5AA 5FLQA 1RZEA 1DMXA 1FQRA 1IF8A 2NWYA 4QJOA 4E3HA 2F14A 3OYSA 4QSAA 4LP6A 4KNIA 3ZP9A 2X7TA 1BN4A 2OSFA 5FNJA 3HKUA 3T82A 1HEDA 4XE1A 3S76A 4M2VA 1G53A 5AMLA 3DBUA 3TVOX 1ZNCA 4Q78A 4YWPA 3S9TA 3S73B 5G01A 3V5GA 3JXGA 1BN1A 1XPZA 1CNBA 1ZFQA 1YDBA 1I9OA 2QP6A 3EFTA 1ZGEA 5FNGA 1XEVA 4MDGA 5DSMA 3DAZA 4YXOA 4WL4A 1TE3X 3UYNA 1I9QA 2FMGA 1KOPA 3M40A 4CNVA 5FNLA 4YGLA 3M1QA 1YDAA 3MHIA 5BRVA 5DSJA 4G0CA 1J9WA 2Q1QA 1TTMA 2FOQA 4DZ9A 3SBIA 2ABEA 3MHOA 1CAIA 4K0TA 5E2SA 5FNHA 5JGTB 3N4BA 1CRMA 5JESB 3TMJA 1RAYA 1ZSAA 1V9EA 1V9IC 3L14A 5FLTA 1HCAA 3JXHC 2IT4A 3MZCA 2WEGA 4FVOA 1XQ0A 4MDMA 3KOIA 1CNHA 3ZNCA 3CAJA 3MNHA 5FLPA 3F7UA 3IBLA 1UGFA 3MNJA 1IF6A 1LUGA 4MDLA 4XIWA 1HVAA 3KKXA 4FRCA 3IGPA 5JG3B 4E49A 5JEHB 5E5RA 1CNCA 5G0BA 4ZX0A 1ZE8A 4QSBA 1CVCA 2NXTA 5JGSB 5SZ6A 3KS3A 3RZ5A 3MHLA 3SAPA 5DSOA 5FLOA 4ZWZA 1G4OA 2EU2A 1A42A 6CA2A 1IF7A 3BETA 4YHAA 1G52A 4QK3A 3IBIA 3P44A 4Z1JA 3M2XA 3RZ8A 5HPJA 3D93A 4KAPA 1HECA 1HEAA 4RUZA 3VBDA 4QIYA 1BICA 2EU3A 3M5EA 3RJ7A 2NWOA 3S72B 3CA2A 1LZVA 3RZ0B 4BF6A 3RZ7A 4KUVA 3HFPA 1CVAA 1CNJA 2FW4A 3Q31A 4HT0A 3DCWA 4HT2A 5EH8A 2WEHA 5G0CA 1CINA 5FL5A 3N2PA 2EZ7A 2HKKA 3V2MA 2GD8A 1UGAA 5JEPB 3KLDB 8CA2A 1TG9A 3T85A 4XIXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4Q7S A;  4JSZ A;  1LG5 A;  5EOI A;  4FVN A;  4E3G A;  1UGD A;  3T5U A;  4QK2 A;  4RIV A;  5E2R A;  1RJ5 A;  1CZM A;  4N0X B;  4CAC A;  1BNQ A;  1RJ6 A;  3W6H A;  4WW6 A;  2CBD A;  2NXR A;  5JQT A;  5AMG A;  2OSM A;  1BNW A;  5JDV B;  5DSN A;  4X5S A;  1AM6 A;  4C3T A;  4PZH A;  3DCC A;  1LG6 A;  1CCT A;  3TVN X;  1YO2 A;  3M1J A;  4KNJ A;  1ZH9 A;  4FU5 A;  4L5V A;  3W6I A;  4E3F A;  4N16 A;  3OIM A;  4FIK A;  4FPT A;  3KWA A;  1CVE A;  2FNM A;  2HL4 A;  4QTL A;  4K0S A;  3R16 A;  1FQL A;  3UYQ A;  1ZSC A;  2CBE A;  4QJ0 A;  3V3H B;  3M2N A;  5DSK A;  4Q0L A;  5FNI A;  4DZ7 A;  2HNC A;  5A25 A;  1CNX A;  3MNK A;  3D92 A;  4UOV A;  1ZFK A;  1BNV A;  3M1W A;  9CA2 A;  4IWZ A;  3IEO A;  3OIK A;  2NNO A;  4RIU A;  3K7K A;  1CAM A;  3S71 B;  4KV0 A;  1TB0 X;  3V3I B;  1CAZ A;  1CAN A;  4HU1 A;  4Q6E A;  2CAB A;  4CNW A;  1CRA A;  4MLT A;  5CAC A;  4BCW A;  4K13 A;  2FOY A;  4KNM A;  1CNW A;  1G45 A;  1CAJ A;  3DVD A;  4JSA A;  3P55 A;  4QIZ A;  4Q08 A;  1IF5 A;  4Q99 A;  5CJF A;  1RZC A;  2WD3 A; 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