3NJ9A

Crystal structure of carbonic anhydrase ii in complex with a nir inhibitor
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Crystal structure of carbonic anhydrase II in complex with a Nir inhibitor
rcsb
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2010-06-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3nj9A00
3IBUA 5JEPB 4YX4A 5BYIA 3M5SA 4WL4A 1CAJA 4PZHA 4MO8A 1HUHA 1UGEA 2GEHA 1G3ZA 5FLRA 3HKQA 1CILA 1RZBA 2WEOA 2HD6A 1KEQA 2VVAX 4ILXA 4KV0A 4HF3A 4HT2A 3RZ5A 3U7CA 1DCAA 3HLJA 5DOGA 4WUQA 5FNHA 4Q7PA 2NWPA 3BETA 5DSNA 3T5ZA 2WEGA 3MHCA 1IF6A 7CA2A 4CNRA 3N0NA 4ETQC 3S74B 5L6KA 4ZX0A 1CVFA 4HEWA 1I90A 3M98A 1G46A 5FL5A 1XEVA 4Q9YA 2VVBX 4Q06A 3OKUA 4R59A 5DOHA 1HEDA 5LMDA 4DZ9A 5G01A 5HPJA 1V9EA 1FQMA 1RZDA 5SZ7A 3P5LA 2Q1QA 1FLJA 1MUAA 1ZSBA 3GZ0A 3S76A 4UOVA 4RN4A 2CBCA 4M2RA 1CNBA 5EKMA 4RUZA 1TEUX 3MNHA 4RUYA 4QK3A 3R17B 5FLSA 5JEHB 3S75B 1LZVA 5EHEA 1CANA 3B1BA 1YO1A 3P5AA 4ZWZA 1IF5A 3IGPA 3MHLA 4KUWA 2NWOA 4WW8A 3T83A 4G0CA 4YXUA 3PYKA 1I9OA 5SZ0A 1LG5A 3ML2A 3LXEA 1T9NA 3CA2A 1BCDA 1BZMA 4TWLA 2FOQA 1G53A 2FNNA 3P3HA 1CNJA 1RAZA 4Y0JA 5C8IA 5FLPA 3QYKA 1FSNA 3KNEA 3M2YA 3CYUA 3DCCA 4C3TA 3IAIA 1CAHA 2W2JA 3IEOA 1Z9YA 4M2VA 4ZWIA 9CA2A 3RZ0B 2FNKA 1BN4A 4KNJA 1THKA 4RFDA 1G52A 3IBIA 3RG4A 4CNVA 1OKMA 4CNWA 1CCUA 4IDRX 5DRSA 3D9ZA 3RGEA 4CA2A 1H9NA 3IBLA 3ML5A 3M5TA 5J8ZA 4FPTA 4E49A 3SAPA 4KP5A 2WEJA 2AW1A 3V5GA 1TG9A 4PYYA 3KLDB 3P44A 1BV3A 4Z1JA 3KIGA 3MDZA 4YHAA 2WD2A 3KKXA 4RUXA 1G6VA 4JS6A 5IPZA 4HEZA 3DCSA 3R16A 4QEFA 1BNUA 3OILA 3K7KA 3RZ8A 3S97A 4QY3A 2NMXA 1CNGA 5FLOA 4ZAOA 5JGSB 3CAJA 4E4AA 4Q8YA 3V2JA 3T84A 4KUYA 1RZAA 4Q7WA 1RJ5A 3FFPX 3U3AX 2EU3A 1YDDA 2HOCA 2FOUA 2H4NA 5DSPA 3MYQA 3S78B 3SBIA 2CA2A 3D92A 1Y7WA 1CNHA 4M2WA 1I9LA 1F2WA 4Q78A 5EH7A 4FIKA 4HU1A 5DSLA 1UGFA 3V3JA 4QJPA 1I91A 5E2MA 1CA3A 4FL7A 4QJ0A 5EHVA 2QO8A 3F8EA 5FNGA 2POWA 2WEHA 4Q99A 3F7BA 5E2KA 1CRMA 1BICA 1HCBA 1IF9A 1KWQA 5JDVB 1CVBA 1RAYA 3V7XA 5AMDA 1I9PA 1YDAA 1CVHA 1RJ6A 1TE3X 4E3GA 1IF7A 3EFIA 1CINA 1TEQX 3BL1A 4Q83A 2F14A 4LP6A 5AMGA 1BNVA 3V2MA 3ZNCA 3S71B 4QSAA 1CCTA 4WW6A 1ZH9A 2CBDA 4CQ0A 3MZCA 4R5BA 4R5AA 1G0FA 4N16A 1CNYA 4KUVA 3KWAA 4L5WA 5DSJA 5CLUA 5G0BA 1CZMA 4K0TA 1ZSAA 4YGFA 3RYJB 4BF6A 2NN7A 3K2FA 3NB5A 3OIKA 3NJ9A 4ITOA 4KNIA 2AX2A 3FE4A 5JQ0A 2NXSA 3M2XA 5E5UA 3F4XA 4GL1X 4QIZA 5FL6A 5SZ3A 5SZ4A 4FRCA 3L14A 3CZVA 1CNWA 3M3XA 4QJWA 1I9QA 1G0EA 5EH8A 3W6IA 1AVNA 1CAOA 1IF4A 3DC3A 3RJ7A 3RYXB 5BRWA 1HUGA 3HKTA 4JSWA 3DBUA 1URTA 1ZFQA 2O4ZA 4HT0A 2OSMA 1G54A 5EZTX 3RLDA 5FLTA 3KOIA 1CAYA 4Q8XA 5JEGB 5JQTA 4XE1A 4MLTA 3MNUA 1Z97A 1EOUA 4Q09A 5FNLA 3NI5A 3M04A 3DCWA 3P55A 1BNTA 4XFWA 5JGTB 4WUPA 1ZE8A 4MTYA 5BNLA 3TVNX 1UGGA 3S9TA 3MNJA 2CBEA 5E2SA 1ZNCA 1FQRA 3MHIA 4ITPA 4QTLA 1TBTX 5JG5B 5EIJA 4Q81A 1OQ5A 2WD3A 3M96A 2CBBA 5JESB 5A6HA 3MHMA 1IF8A 4QSIA 3M67A 4QSBA 3UYNA 3MWOA 4MDGA 2NXTA 3HS4A 5EH5A 2EU2A 4Q6DA 4ZWYA 1JV0A 4Q7SA 3VBDA 3RZ1B 1H9QA 4L5UA 5L3OA 5FNMA 1HEAA 3PJJA 1Z93A 4L5VA 2CABA 4KAPA 5BRUA 4E3FA 4HEYA 4XIWA 4COQA 1AZMA 1LGDA 4Q08A 2X7SA 4ZX1A 4YGJA 3V3FA 2QOAA 2IT4A 4CACA 2NNSA 2X7UA 1CRAA 4BCWA 3S73B 2CBAA 1MOOA 5DSQA 1CNKA 4YGLA 2OSFA 3Q31A 4QK2A 5G03A 3SBHA 3U45X 4RIUA 4G7AA 3C7PA 4KP8A 1OKNA 5A25A 5BRVA 1HVAA 5DSIA 5DSRA 5G0CA 1I9MA 3F7UA 1YDCA 4Z1KA 1BNNA 1UGBA 4Q07A 2ZNCA 3M40A 4N0XB 5FDCA 5CACA 3JXFA 2POUA 1LG6A 1CNCA 3T82A 6CA2A 1I9NA 3M1QA 1YDBA 5E2RA 1ZFKA 5SZ2A 3RYZA 1A42A 4RH2A 3OKVA 2NNVA 1CNIA 1CAIA 3IBNA 1DCBA 3OY0A 3P3JA 4LU3A 4PYXA 1BN3A 2FW4A 1UGCA 4IWZA 1TG3A 1ZSCA 3N3JA 1RZEA 3DC9A 2NNOA 5DSKA 3DV7A 4JSSA 1DMXA 4K0ZA 4MLXA 1LUGA 5FLQA 1XPZA 3KOKA 5FDIA 5FNIA 5EOIA 3SAXA 1UGAA 4YGKA 2QP6A 1CVEA 5SZ1A 3OYQA 4Q49A 3MHOA 3P58A 5E5RA 3M2NA 1AM6A 4MDLA 5E28A 1TH9A 5FNKA 2NWZA 4KNNA 1G48A 4Q7VA 1FR7A 2Q38A 4PQ7A 1BNQA 1I8ZA 5CA2A 5EKHA 12CAA 2FNMA 3N4BA 2ILIA 3JXHC 2FOYA 1FSRA 5FL4A 3U47A 1OKLA 4YXIA 3MNAA 4M2UA 5JG3B 4LHIA 4QSJA 3M5EA 3JXGA 3RYVB 4PXXA 4JSZA 2HL4A 1CVCA 4K0SA 3V3GB 4BF1A 4E5QA 3HKNA 3S77B 5SZ5A 3TVOX 4TWMA 1J9WA 3K34A 3D0NA 1DMYA 2NXRA 4HBAA 3M14A 1CVDA 4KNMA 1KWRA 3HKUA 1FR4A 1V9IC 1RZCA 3TMJA 1TB0X 3T5UA 1BNMA 3DD0A 4QK1A 4Q0LA 1BNWA 1H4NA 1CVAA 1G1DA 2POVA 3M1JA 4QJMA 1FSQA 1HEBA 4YXOA 5AMLA 2FMGA 3B4FA 3KONA 1CA2A 1UGDA 4FU5A 4X5SA 1XEGA 3HFPA 1YO0A 1ZGFA 2ABEA 2HKKA 4Q87A 3V3IB 5DVXA 4JSAA 1FQNA 4WR7A 4QJOA 3PO6A 1BN1A 3DD8A 1CCSA 5EHWA 3OIMA 3P4VA 3V3HB 3BL0A 5FNJA 3RG3A 5SZ6A 4MDMA 4Z0QA 1CAZA 1HCAA 1CIMA 5DSOA 3OYSA 4YYTA 3M1WA 4RFCA 2EZ7A 3DVCA 1CALA 1KOPA 4YWPA 2GD8A 4YGNA 3N2PA 3DAZA 3RZ7A 1CAMA 5EKJA 3MNIA 1FQLA 4Q6EA 5DSMA 3FW3A 4XZ5A 3S8XA 3M2ZA 2H15A 4CNXA 4Q90A 3ZP9A 1JD0A 3MMFA 1CAKA 2FOSA 3M1KA 1TTMA 1KOQA 3T85A 3UYQA 1ZGEA 3D8WA 4Q8ZA 4XIXA 1G4JA 3KS3A 3S72B 3W6HA 3D93A 3MNKA 4QJXA 3DA2A 1HECA 4E3DA 5E2NA 3RYYA 4E9OX 4RIVA 1G45A 1JCZA 2HFWA 1XQ0A 2X7TA 2NN1A 3DVDA 1G4OA 8CA2A 1YO2A 4QIYA 4Z1NA 2NWYA 3DVBA 4Z1EA 5CJFA 2NNGA 4ZWXA 4E3HA 2HNCA 2FMZA 2FOVA 4FVNA 4K13A 3EFTA 4K1QA 2Q1BA 4YVYA 4DZ7A 1CNXA 4FVOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3IBU A;  5JEP B;  4YX4 A;  5BYI A;  3M5S A;  4WL4 A;  1CAJ A;  4PZH A;  4MO8 A;  1HUH A;  1UGE A;  2GEH A;  1G3Z A;  5FLR A;  3HKQ A;  1CIL A;  1RZB A;  2WEO A;  2HD6 A;  1KEQ A;  2VVA X;  4ILX A;  4KV0 A;  4HF3 A;  4HT2 A;  3RZ5 A;  3U7C A;  1DCA A;  3HLJ A;  5DOG A;  4WUQ A;  5FNH A;  4Q7P A;  2NWP A;  3BET A;  5DSN A;  3T5Z A;  2WEG A;  3MHC A;  1IF6 A;  7CA2 A;  4CNR A;  3N0N A;  4ETQ C;  3S74 B;  5L6K A;  4ZX0 A;  1CVF A;  4HEW A;  1I90 A;  3M98 A;  1G46 A;  5FL5 A;  1XEV A;  4Q9Y A;  2VVB X;  4Q06 A;  3OKU A;  4R59 A;  5DOH A;  1HED A;  5LMD A;  4DZ9 A;  5G01 A;  5HPJ A;  1V9E A;  1FQM A;  1RZD A;  5SZ7 A;  3P5L A;  2Q1Q A;  1FLJ A;  1MUA A;  1ZSB A;  3GZ0 A;  3S76 A;  4UOV A;  4RN4 A;  2CBC A;  4M2R A;  1CNB A;  5EKM A;  4RUZ A;  1TEU X;  3MNH A;  4RUY A;  4QK3 A;  3R17 B;  5FLS A;  5JEH B;  3S75 B;  1LZV A;  5EHE A;  1CAN A;  3B1B A;  1YO1 A;  3P5A A;  4ZWZ A;  1IF5 A;  3IGP A;  3MHL A;  4KUW A;  2NWO A;  4WW8 A;  3T83 A;  4G0C A;  4YXU A;  3PYK A;  1I9O A;  5SZ0 A;  1LG5 A;  3ML2 A; 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