3RYXB

Fluoroalkyl and alkyl chains have similar hydrophobicities in binding to the hydrophobic wall of carbonic anhydrase
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Fluoroalkyl and alkyl chains have similar hydrophobicities in binding to the "hydrophobic wall" of carbonic anhydrase.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 74
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2011-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3ryxB00
3JXHC 4MDLA 4WW6A 5DSNA 5FDIA 3BETA 3DV7A 3HFPA 4RFCA 5G01A 4QJMA 3KNEA 3P4VA 2ABEA 4HEWA 3M67A 4RUYA 3V3HB 4HF3A 1UGBA 2NWOA 4ZWZA 3BL1A 4JSZA 1HEAA 3B1BA 5FNMA 4Z1KA 5BYIA 1LG6A 1TEQX 1IF5A 4L5WA 5J8ZA 3KOKA 1Z93A 1G3ZA 4HEYA 1I9QA 4QEFA 12CAA 1JD0A 3D93A 1RJ5A 3S77B 1CNIA 3DCWA 4RIUA 1G6VA 3KOIA 1XQ0A 4ZAOA 5BRUA 3V3FA 3DC9A 1XEGA 4IWZA 1CILA 1LUGA 5SZ6A 1CVEA 1G4JA 1ZFQA 1CAHA 1CNJA 1DMYA 4Z1JA 5DVXA 3M2ZA 1FSNA 4ILXA 3DAZA 4Q7VA 3MHLA 4CQ0A 2AW1A 2IT4A 3F7BA 1UGGA 4QJWA 4HEZA 3M14A 1CAZA 4PZHA 4QSIA 2EZ7A 1FQMA 5EHVA 3IGPA 1JV0A 3VBDA 1HUGA 4K0TA 3SAPA 3Q31A 2EU2A 1G4OA 3TVOX 1I91A 4YXIA 2FMZA 1TB0X 3S78B 5L3OA 5IPZA 1YDAA 4Q7PA 3IEOA 1FQRA 1LG5A 5FNJA 5SZ1A 3ZNCA 2CBAA 3DCSA 3ZP9A 4YXUA 4C3TA 5DRSA 5HPJA 3N3JA 3V2MA 4QSBA 3N4BA 3P55A 4CACA 2NNOA 4DZ9A 1TTMA 2FOUA 2NWYA 3MNJA 3CZVA 5E2NA 2FW4A 5EH8A 4LU3A 2ILIA 2GD8A 1I8ZA 5SZ0A 5JESB 5SZ5A 1IF8A 3KLDB 3V3JA 4G7AA 1LZVA 5FLOA 1BN3A 1OQ5A 4FPTA 4M2UA 5FL6A 4KAPA 1DCBA 3MNAA 5DSKA 4YVYA 1G46A 3PO6A 4HU1A 2NNGA 3W6HA 2VVAX 5EKJA 4IDRX 1BNVA 3DBUA 3CAJA 5DSJA 2EU3A 4QJXA 3S97A 1KOPA 3EFTA 2ZNCA 4PYXA 1ZGFA 4M2VA 1MOOA 5JG5B 4E4AA 3M2NA 3D92A 3MZCA 5FNIA 7CA2A 5DOHA 3D9ZA 3F4XA 1FR7A 5EIJA 1G52A 1I9NA 4FU5A 4Z1EA 1V9EA 1A42A 4RFDA 4CA2A 2NWPA 1CRAA 1RZCA 3RZ5A 1HECA 1ZFKA 3MWOA 3KIGA 3S9TA 3P5AA 4KUYA 1G45A 5FLQA 4QTLA 1I90A 1KWRA 3M98A 3TMJA 1CA3A 4KUVA 1HCBA 1YO1A 4CNRA 4E5QA 3D0NA 1YO0A 4Q99A 3M1QA 4YGLA 1G53A 3HLJA 4WR7A 4Q0LA 2X7UA 3RGEA 5DSQA 3ML2A 4N0XB 1MUAA 5E28A 4ETQC 4HT0A 1IF6A 2F14A 5E5RA 4MLTA 1ZNCA 5E2KA 3OYQA 3MHOA 4K1QA 4QK2A 4KNIA 4Q8XA 1XEVA 3L14A 1V9IC 3OY0A 3N0NA 3PYKA 3T5ZA 3P3JA 4ITPA 4R5AA 4K13A 3V3GB 2X7TA 3TVNX 5SZ3A 1J9WA 4MLXA 4R5BA 4E49A 4E3HA 2FOYA 4RUXA 1RJ6A 1FSQA 3M2XA 2X7SA 4YGJA 6CA2A 3OYSA 4KNNA 4QIYA 3W6IA 1CNXA 3RZ0B 3FW3A 3NB5A 5AMGA 3RZ7A 5DOGA 3IBNA 4RH2A 4RUZA 5LMDA 1TBTX 2HOCA 5FL5A 2QOAA 4Q09A 3OIKA 4XIWA 3SAXA 1RZDA 5JGTB 2Q38A 4XIXA 4JSWA 5G03A 5FNHA 4JS6A 3RZ8A 3S73B 3V3IB 2CABA 4XE1A 3BL0A 2QO8A 1EOUA 3U7CA 1T9NA 4MDMA 5JQ0A 1BNWA 4JSSA 4CNVA 4RN4A 4Q07A 1CNGA 5BRVA 1LGDA 5JQTA 3RYYA 3UYQA 1ZSAA 3RYJB 3JXFA 4PXXA 4UOVA 5G0CA 4HT2A 3V2JA 3HKTA 5E2SA 5SZ2A 1CALA 1RZEA 1UGFA 1CAIA 5DSLA 3K2FA 3S72B 5A6HA 5AMLA 3IBLA 1CIMA 5CJFA 4XZ5A 1TEUX 8CA2A 3M5TA 5L6KA 3IAIA 3NJ9A 5JDVB 4E9OX 3M04A 2NWZA 1UGCA 5FLTA 1BNUA 4QY3A 4E3DA 3N2PA 2FNMA 2CBDA 4RIVA 1CNCA 1F2WA 4BF6A 5JGSB 3FFPX 1G0EA 4LHIA 5EH7A 2HKKA 4QK1A 3D8WA 2GEHA 3OIMA 2WD2A 4FVOA 5FLPA 3RJ7A 1G54A 2Q1BA 2QP6A 4Q7SA 5E2MA 3U3AX 1G1DA 5EKHA 2VVBX 4E3FA 3HKQA 1CCUA 4Q06A 1BNNA 5SZ7A 4ZWXA 5CACA 5FNKA 3S76A 4CNWA 1JCZA 3C7PA 1CAKA 3MMFA 4YWPA 1I9MA 3SBHA 3RG3A 3M3XA 4Q49A 4K0ZA 5BRWA 3U45X 4Z0QA 4X5SA 3RYZA 1AZMA 2FOQA 1CNWA 2CBCA 3HKUA 3M96A 3HS4A 3MHCA 3F8EA 5DSPA 3MNIA 5DSRA 4QJOA 4Q90A 1OKNA 3CYUA 3T84A 3P5LA 5JG3B 1THKA 2POUA 1H9QA 3P44A 1G0FA 4FIKA 4ZWIA 4ZWYA 3P58A 3K7KA 1CAOA 4Q9YA 3S71B 3DA2A 5CLUA 3SBIA 1HUHA 1RAZA 5EKMA 3T85A 3LXEA 1CVHA 1OKMA 1BCDA 3MNHA 2NXSA 2O4ZA 5JEHB 4Q78A 5G0BA 3QYKA 1BV3A 2H4NA 2CBBA 2NN7A 3MDZA 4FVNA 5DSIA 5SZ4A 1BNTA 2FOSA 3OKVA 4YHAA 5EHEA 2FMGA 1Y7WA 3DD8A 3RZ1B 2WEHA 4M2RA 4Q87A 4M2WA 1FQLA 3M1KA 2FNNA 3DVCA 4KUWA 1HCAA 2FNKA 5FLSA 5FNLA 1UGEA 3IBIA 5EOIA 2HL4A 4ITOA 5EZTX 1TE3X 4HBAA 3OILA 1UGDA 2NNSA 1YO2A 4MDGA 4TWMA 2HD6A 1BZMA 3ML5A 3RG4A 1ZGEA 5AMDA 4BCWA 5JEPB 2FOVA 3S75B 3R16A 1RAYA 5FDCA 1YDBA 4MO8A 2OSMA 1OKLA 1YDDA 3F7UA 1BN4A 3IBUA 5DSMA 3S74B 4DZ7A 5BNLA 1HVAA 1ZSBA 3K34A 4YXOA 1CVCA 1FR4A 1BNMA 5FLRA 1I9OA 5DSOA 4KNJA 1IF9A 4GL1X 1CNHA 2NN1A 3P3HA 1AM6A 1I9PA 2WEOA 4Q6EA 1FSRA 4QJPA 5A25A 1XPZA 3MYQA 3RYVB 5E2RA 2CA2A 4Q08A 3M5SA 1HEBA 1KWQA 3M1WA 3T83A 5CA2A 3OKUA 4YYTA 1RZAA 4K0SA 2POWA 3MNUA 3U47A 4Q7WA 4G0CA 4QJ0A 4QIZA 1H4NA 3RYXB 2WD3A 1CNYA 1FQNA 1KEQA 3DCCA 2NXTA 3DD0A 4Z1NA 1CCSA 1I9LA 1CANA 2CBEA 4CNXA 4XFWA 2OSFA 1CVAA 2H15A 3M2YA 1CZMA 4Y0JA 3M1JA 1UGAA 1YDCA 1CRMA 1IF7A 4KP8A 2NXRA 3M5EA 4WW8A 4QSJA 1Z97A 2HNCA 3MHIA 3B4FA 4WL4A 9CA2A 3PJJA 2WEJA 4Q81A 4KNMA 4JSAA 3KWAA 3M40A 4YGKA 3RLDA 1TG9A 4WUPA 1G48A 4Q83A 3T82A 3EFIA 3MNKA 3R17B 4ZX0A 4YGFA 1Z9YA 3KKXA 1TH9A 3GZ0A 4YGNA 4Q6DA 3S8XA 4R59A 1KOQA 3UYNA 4YX4A 3KS3A 1CAYA 4KV0A 5EHWA 2NMXA 1TG3A 4PQ7A 1BN1A 4L5UA 3V7XA 1CVDA 1CVFA 5C8IA 2POVA 4FL7A 5JEGB 1H9NA 5FNGA 1CAJA 1CCTA 1CNBA 4PYYA 1FLJA 3JXGA 2WEGA 4Q8YA 1BNQA 3V5GA 1URTA 2Q1QA 1BICA 4FRCA 1DCAA 3DC3A 4COQA 4QK3A 3FE4A 5FL4A 1CNKA 3MHMA 4LP6A 5EH5A 3KONA 4BF1A 1ZH9A 4TWLA 4MTYA 2W2JA 1ZSCA 3NI5A 1CA2A 4KP5A 1CVBA 3T5UA 1IF4A 4WUQA 2AX2A 3CA2A 1HEDA 4Q8ZA 5E5UA 4E3GA 1ZE8A 3DVBA 1RZBA 1CINA 1CAMA 3HKNA 2HFWA 4N16A 3DVDA 1DMXA 2NNVA 1AVNA 4ZX1A 4L5VA 4QSAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3JXH C;  4MDL A;  4WW6 A;  5DSN A;  5FDI A;  3BET A;  3DV7 A;  3HFP A;  4RFC A;  5G01 A;  4QJM A;  3KNE A;  3P4V A;  2ABE A;  4HEW A;  3M67 A;  4RUY A;  3V3H B;  4HF3 A;  1UGB A;  2NWO A;  4ZWZ A;  3BL1 A;  4JSZ A;  1HEA A;  3B1B A;  5FNM A;  4Z1K A;  5BYI A;  1LG6 A;  1TEQ X;  1IF5 A;  4L5W A;  5J8Z A;  3KOK A;  1Z93 A;  1G3Z A;  4HEY A;  1I9Q A;  4QEF A;  12CA A;  1JD0 A;  3D93 A;  1RJ5 A;  3S77 B;  1CNI A;  3DCW A;  4RIU A;  1G6V A;  3KOI A;  1XQ0 A;  4ZAO A;  5BRU A;  3V3F A;  3DC9 A;  1XEG A;  4IWZ A;  1CIL A;  1LUG A;  5SZ6 A;  1CVE A;  1G4J A;  1ZFQ A;  1CAH A;  1CNJ A;  1DMY A;  4Z1J A;  5DVX A;  3M2Z A;  1FSN A;  4ILX A;  3DAZ A;  4Q7V A;  3MHL A;  4CQ0 A;  2AW1 A;  2IT4 A;  3F7B A;  1UGG A;  4QJW A;  4HEZ A;  3M14 A;  1CAZ A;  4PZH A;  4QSI A;  2EZ7 A;  1FQM A;  5EHV A;  3IGP A;  1JV0 A;  3VBD A;  1HUG A;  4K0T A;  3SAP A;  3Q31 A;  2EU2 A;  1G4O A;  3TVO X;  1I91 A;  4YXI A;  2FMZ A;  1TB0 X;  3S78 B;  5L3O A;  5IPZ A;  1YDA A;  4Q7P A;  3IEO A;  1FQR A;  1LG5 A;  5FNJ A;  5SZ1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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